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一種用于房顫易感基因檢測的SNP分型試劑盒及其應(yīng)用的制作方法

文檔序號:11470393閱讀:384來源:國知局
一種用于房顫易感基因檢測的SNP分型試劑盒及其應(yīng)用的制造方法與工藝

本發(fā)明涉及一種用于房顫易感基因檢測的snp分型試劑盒及其應(yīng)用,屬于生物學(xué)領(lǐng)域。



背景技術(shù):

心房顫動(atrialfibrillation,af,簡稱房顫)是指規(guī)則有序的心房電活動喪失,代之以快速無序的顫動波,是當(dāng)今最常見的持續(xù)性心律失常,在人群中的發(fā)病率約為1%~2%。目前,全球房顫患病人數(shù)達(dá)3350萬,我國現(xiàn)患病人數(shù)已達(dá)1000萬以上,預(yù)計到2060年將增加2倍。房顫嚴(yán)重危害人類健康,有較高的致殘率和致死率,可引起腦卒中、心力衰竭、心動過速性心肌病、室性心律失常、血栓栓塞、死亡等嚴(yán)重后果,是二十一世紀(jì)亟待解決的心臟疾病領(lǐng)域重大課題之一。

自房顫被發(fā)現(xiàn)以來,關(guān)于房顫的研究就從未停止過,近十年來,科學(xué)界則將研究重心轉(zhuǎn)移到對房顫的遺傳學(xué)發(fā)病機(jī)制上來,這些研究為證明房顫為遺傳疾病提供了重要的依據(jù),尤其是以大樣本研究為依據(jù)的全基因組關(guān)聯(lián)分析(gwas)為心房顫動的遺傳機(jī)制提供了新的思路。在關(guān)聯(lián)分析方面,各研究中心發(fā)表了很多與房顫相關(guān)的位點,其中與房顫顯著相關(guān)的主要有染色體4q25上的rs2200733和rs10033464兩個位點、kcnn3基因上的rs13376333位點、zfhx3基因上的rs7193343位點、cav1基因上的rs3807989位點、tbx5基因上的rs3825214位點等。

單核苷酸多態(tài)性(singlenucleotidepolynorphism,snp)是人類基因組dna序列變異的主要形式,是決定人類疾病(尤其是多基因疾病)易感性和藥物反應(yīng)性差異的核心信息。arms-pcr是newton等首先建立用來檢測已知突變的方法。其原理是在dna序列一端的突變處設(shè)計兩個引物,突變位點位于引物的3'末端,一個相應(yīng)于正常等位基因序列引物,一個相應(yīng)于突變基因序列引物,再在dna另一端設(shè)計一個共用引物,從而用pcr對突變基因進(jìn)行檢測。目前,用于房顫易感基因檢測的方法主要有測序法以及基因芯片法,存在操作復(fù)雜、耗時長、成本高等缺點。例如:申請?zhí)枮?01210184474.7,名稱為房顫易感基因基因無創(chuàng)檢測試劑盒的中國專利,具體涉及dna測序技術(shù),該方法操作步驟繁瑣、耗時長、不利于批量檢測;申請?zhí)枮?01110338262.5,名稱為用于預(yù)測迷宮手術(shù)治療房顫療效的基因芯片的中國專利,具體涉及基因芯片技術(shù),該方法雖能檢測多個房顫相關(guān)snp位點,但涉及dna提取及多次pcr擴(kuò)增,操作步驟較多。

房顫,尤其是孤立性房顫的發(fā)病存在明顯的家族聚集性。除了家族性房顫外,人群中散發(fā)的房顫患者存在一定的遺傳易感性。因此,深入了解房顫的分子遺傳學(xué)機(jī)制將有助于對這一疾病的預(yù)防和診治。房顫給患者和社會帶來的巨大健康和經(jīng)濟(jì)負(fù)擔(dān),使得我們越來越意識到對房顫前期篩查、早期預(yù)防和有效治療的重要性和迫切性;越來越意識到只有從發(fā)生機(jī)制上深入認(rèn)識房顫,才能更好地防治房顫。



技術(shù)實現(xiàn)要素:

本發(fā)明提供一種用于房顫易感基因檢測的snp分型試劑盒及其應(yīng)用,該試劑盒具有特異性強(qiáng)、靈敏度高、操作簡單、耗時短、通量高可實現(xiàn)批量檢測等諸多優(yōu)點;該試劑盒不僅可以快速檢測出待測者的房顫易感基因型,還可以從基因水平上評估待測者的房顫遺傳易感性,為房顫的預(yù)防提供一定的指導(dǎo)意見。

為解決上述技術(shù)問題,本發(fā)明所采用的技術(shù)方案如下:

一種用于房顫易感基因檢測的snp分型試劑盒,包括如下易感基因的6個snp位點的引物:kcnn3基因上的rs13376333位點、zfhx3基因上的rs7193343位點、cav1基因上的rs3807989位點、tbx5基因上的rs3825214位點、4q25上的rs2200733和rs10033464兩個位點。

該試劑盒在基因水平上評估待測人群對于房顫的易感性,可用于評估健康人群患房顫的風(fēng)險,并為房顫患者的診斷和治療提供一定的指導(dǎo)意見。

為了簡化操作,同時保證檢測的準(zhǔn)確性,所有的引物是作為一組進(jìn)行標(biāo)記的。

上述引物中每個位點都包含兩條非標(biāo)記引物和一條共用引物,其中共用引物是有熒光標(biāo)記的。

為了提高檢測的靈敏度,6個snp位點的引物序列是:

rs13376333,非標(biāo)記引物seqidno.1-2,共用引物,seqidno.3;

rs7193343,非標(biāo)記引物seqidno.4-5,共用引物,seqidno.6;

rs2200733,非標(biāo)記引物seqidno.7-8,共用引物,seqidno.9;

rs3807989,非標(biāo)記引物seqidno.10-11,共用引物,seqidno.12;

rs3825214,非標(biāo)記引物seqidno.13-14,共用引物,seqidno.15;

rs10033464,非標(biāo)記引物seqidno.16-17,共用引物,seqidno.18;

seqidno.1引物序列為:atatgagaacttaaatggcattgtcatata;

seqidno.2引物序列為:agaacttaaatggcattgtcagagg;

seqidno.3引物序列為:gctgagtgtgtgcagatgg;

seqidno.4引物序列為:atatggaaagtttgaacagcttgttga;

seqidno.5引物序列為:ggaaagtttgaacagcttgtgtg;

seqidno.6引物序列為:agtccagagtccagggca;

seqidno.7引物序列為:ggtacttgggttttgattttgagc;

seqidno.8引物序列為:atatggtacttgggttttgattttgctt;

seqidno.9引物序列為:attcacaggcttccctctacca;

seqidno.10引物序列為:gtttggtaacactcaacatccaca;

seqidno.11引物序列為:atatatttggtaacactcaacatcatcg;

seqidno.12引物序列為:ccatctctcgcgtccaca;

seqidno.13引物序列為:ggctaacaccaccagtcca;

seqidno.14引物序列為:atatgggctaacaccaccagtaag;

seqidno.15引物序列為:tagaaagagacagaaagatgaggaaaga;

seqidno.16引物序列為:tctttttttacattgttagagtcaagaagg;

seqidno.17引物序列為:atattctttttttacattgttagagtcaaggaat;

seqidno.18引物序列為:tttttgttgtgcttttttatacaagggtta。

為了簡化操作,同時保證檢測的準(zhǔn)確性和效率,所有的共用引物是有熒光標(biāo)記的。

上述引物中,共用引物均采用同色(fam、hex、tamra或rox)熒光素進(jìn)行標(biāo)記,且熒光標(biāo)記的引物之間留有14個堿基以上的間隔,避免未知大小等位基因造成的擴(kuò)增越界。

進(jìn)一步優(yōu)選,共用引物的熒光標(biāo)記為fam色標(biāo)記、hex色標(biāo)記、rox色標(biāo)記或tamra色標(biāo)記。

為了保證檢測的靈敏度,引物在擴(kuò)增體系中的終濃度分別為:seqidno.1為0.25μm,seqidno.2為0.28μm,seqidno.3為0.3μm,seqidno.4為0.5μm,seqidno.5為0.6μm,seqidno.6為0.55μm,seqidno.7為0.35μm,seqidno.8為0.45μm,seqidno.9為0.4μm,seqidno.10為0.8μm,seqidno.11為0.75μm,seqidno.12為0.9μm,seqidno.13為0.3μm,seqidno.14為0.35μm,seqidno.15為0.5μm,seqidno.16為0.55μm,seqidno.17為0.35μm,seqidno.1為0.5μm。

上述用于房顫易感基因檢測的snp分型試劑盒的應(yīng)用,包括如下步驟:

(1)從生物檢材提取基因組dna,作為dna模板;或直接以血濾紙或唾液卡為模板,無需提??;

(2)配制pcr反應(yīng)液,加入反應(yīng)混合物、熱啟動taq酶、引物混合物、dna模板和超純水,采用三步擴(kuò)增法,對待檢測的多態(tài)性snp位點進(jìn)行pcr擴(kuò)增;

(3)對擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行熒光凝膠電泳檢測和基因分型。

上述將arms-pcr與毛細(xì)管電泳技術(shù)相結(jié)合運用于房顫易感基因的檢測,具有特異性強(qiáng)、靈敏度高、操作簡單快速、通量高、可進(jìn)行批量檢測等諸多優(yōu)點。

為了進(jìn)一步提高檢測的靈敏性和準(zhǔn)確性,步驟(2)中,pcr的擴(kuò)增包括:(1)預(yù)變性:95℃,3min;(2)熱循環(huán):94℃,15s,60℃,1min,共30個循環(huán);(3)終延伸:72℃,10min;(4)保溫4℃。

上述步驟(1)中,基因組dna的提取方法可以為磁珠法或chelex-100法。

步驟(1)中,提取后的dna溶液經(jīng)簡單定量后稀釋到合適的濃度;步驟(1)中,生物檢材為血液、毛發(fā)、唾液或脫落細(xì)胞;步驟(2)中,采用將6個snp位點的引物混合物混于一管中進(jìn)行pcr擴(kuò)增。

上述步驟(3)中,可以在管中加入去離子甲酰胺、分子量內(nèi)標(biāo);內(nèi)標(biāo)的作用是用于電泳過程中的內(nèi)標(biāo)指示。

本發(fā)明未提及的技術(shù)均參照現(xiàn)有技術(shù)。

本發(fā)明的用于房顫易感基因檢測的snp分型試劑盒,首次將多個房顫易感基因進(jìn)行集中檢測,且初次將arms-pcr技術(shù)和熒光凝膠電泳技術(shù)相結(jié)合運用該檢測中,檢測結(jié)果即是房顫易感基因的分型結(jié)果;一次實驗即可同時檢測6個房顫相關(guān)的snp位點,并同時得到分型結(jié)果;操作方法簡單、準(zhǔn)確性強(qiáng)、靈敏度高,可將非特異性擴(kuò)增產(chǎn)物、引物二聚體等產(chǎn)物分離,最大程度降低假陽性;可將樣本檢測時間縮短至2.5個小時以內(nèi),且利于大批量檢測;應(yīng)用本發(fā)明的試劑盒對相關(guān)人群進(jìn)行房顫易感基因的檢測,檢測結(jié)果不僅可以評估待測者的房顫易感性,而且可以為房顫的預(yù)防提供一定的指導(dǎo)意見。

附圖說明

圖1:基因分型標(biāo)準(zhǔn)物的電泳圖譜;

圖2:多態(tài)性位點對應(yīng)引物設(shè)計示意圖(f-primer1:正向引物1;f-primer2:正向引物2;codingstrand:編碼鏈;non-codingstrand非編碼鏈);

圖3:實施例中患者1、患者2和患者3的電泳圖;

圖4:實施例中患者4、患者5和患者6的電泳圖。

具體實施方式

為了更好地理解本發(fā)明,下面結(jié)合實施例進(jìn)一步闡明本發(fā)明的內(nèi)容,但本發(fā)明的內(nèi)容不僅僅局限于下面的實施例。

實施例1:

引物的設(shè)計、濃度的優(yōu)化以及反應(yīng)體系的建立:

1.引物的設(shè)計及篩選

1.1序列下載

本發(fā)明所述的6個snp位點的基因序列均下載自ncbigenebank,具體的序列信息見下表(表1)。其中rs13376333位點的等位基因t為野生型,等位基因c為突變型(易感型);rs7193343位點的等位基因t為野生型,等位基因c為突變型(易感型);rs2200733位點的等位基因c為野生型,等位基因t為突變型(易感型);rs3807989位點的等位基因a為野生型,等位基因g為突變型(易感型);rs3825214位點的等位基因a為野生型,g為突變型(易感型);rs10033464位點的等位基因g為野生型,等位基因t為突變型(易感型)。

表1snp序列信息

1.2引物設(shè)計

確定好各snp位點的基因序列和等位基因類型后,利用oligo6.0進(jìn)行引物的設(shè)計。每個snp共設(shè)計三條引物,pcr產(chǎn)物大小均在270bp以內(nèi),其中一條共用引物的5’端用熒光素標(biāo)記(實施例中選用的是fam色熒光素),另外兩條非標(biāo)記引物的3’端最后一個堿基對等位基因模板進(jìn)行特異識別,兩條非標(biāo)記引物的其中任一條5’端引入4~6個和模板不配對核苷酸(實施例中使用atat或atatat,對引物tm值影響較小)用于指示等位基因,由于兩條非標(biāo)記引物長度不同導(dǎo)致擴(kuò)增產(chǎn)物長度不同,電泳遷移率不同,最終達(dá)到檢測的目的。

引物設(shè)計的原理如圖2所示,除遵循普通引物的設(shè)計原則外,為增加兩條非標(biāo)記引物的特異性,在距離引物3’端2~5個堿基處人為地引入錯配堿基,引入錯配的原則為:若3’端為弱錯配(a-c,g-t),則引入強(qiáng)錯配(a-g,c-t);若3’端為中錯配(a-a,g-g,c-c,t-t),則引入中錯配;若3’端為強(qiáng)錯配,則引入弱錯配。本發(fā)明所用引物均按此規(guī)則進(jìn)行設(shè)計,為了后續(xù)引物濃度的優(yōu)化,在此設(shè)計的引物tm值均在58~62℃之間。

1.3引物篩選

實施例中所有引物均由生工生物工程(上海)有限公司合成,篩選引物所用的模板均為經(jīng)子淵司法鑒定所醫(yī)學(xué)檢驗部測序成功并確定基因型的個體。

在篩選引物的過程中發(fā)現(xiàn):若嚴(yán)格按照引物的設(shè)計原則來引入錯配堿基,引物的擴(kuò)增效果并一定如愿,甚至?xí)霈F(xiàn)特異性過強(qiáng)而得不到擴(kuò)增結(jié)果的情況,例如,rs3807989位點的易感型引物在3’端的第三位引入強(qiáng)錯配時會出現(xiàn)特異性過強(qiáng)而擴(kuò)增不出模板的情況,而將3’端第二位的強(qiáng)錯配堿基改為中錯配時擴(kuò)增效果卻很好。另外,本發(fā)明經(jīng)過多次實驗反復(fù)摸索還發(fā)現(xiàn):人為引入錯配堿基距離3'端的位置不同引物的特異性也不同,所以人為引入錯配堿基的類型和位置要視具體情況而定,不能完全按照引入錯配原則,且必須經(jīng)過多次試驗驗證才行。

本發(fā)明引物篩選的具體方法如下:

(1)引物的單基因座擴(kuò)增

將合成好的每對引物(一條標(biāo)記引物和兩條非標(biāo)記引物)稀釋成1μm進(jìn)行擴(kuò)增試驗,觀察有無非特異性擴(kuò)增峰,以及擴(kuò)增效率如何。若有非特異性擴(kuò)增峰則進(jìn)行缺失排查實驗,找出產(chǎn)生非特異性擴(kuò)增峰的引物并更改。

(2)引物的單色復(fù)合擴(kuò)增

將確定好的單基因座引物組成復(fù)合引物進(jìn)行擴(kuò)增實驗,觀察有無非特異性擴(kuò)增峰,以及引物混合后擴(kuò)增效率如何。若有非特異性擴(kuò)增峰則進(jìn)行缺失排查實驗,找出產(chǎn)生非特異性擴(kuò)增峰的引物并更改。

實施中引物單基因座擴(kuò)增測試結(jié)果較好,均無非特異性擴(kuò)增峰出現(xiàn)。而在引物單色復(fù)合擴(kuò)增測試時發(fā)現(xiàn):當(dāng)6個snp位點的引物組成引物混合物時擴(kuò)增會出現(xiàn)一條非特異性峰,大小為150bp左右,故對fam色的引物依次進(jìn)行去缺失實驗。結(jié)果表明:當(dāng)fam色所有引物均加而缺失rs10033464位點的標(biāo)記引物時,非特異性擴(kuò)增峰消失,故更改了rs10033464位點的標(biāo)記引物,后測試發(fā)現(xiàn)非特異性擴(kuò)增峰消失。

本發(fā)明對這6組引物進(jìn)行了多次更改和反復(fù)測試,在保證引物的特異性和擴(kuò)增效率的情況下最終確定了各snp位點的引物序列,具體的引物信息見表2。

表2各snp位點引物序列

表2中“f1-primer”均指等位基因特異性引物擴(kuò)增時相應(yīng)位點的野生型,“f2-primer”均指等位基因特異性引物擴(kuò)增時具體位點的突變型(易感型),“r-primer”均指相應(yīng)位點5’末端熒光素標(biāo)記的共用引物。在上述引物中,每個snp位點均有兩條等位基因特異性非標(biāo)記引物(非標(biāo)記引物近3'端的小寫字母為人為引入的錯配堿基),分別用于擴(kuò)增野生型和突變型(易感型)堿基序列,而每個位點的共用引物,用于和等位基因特異性非標(biāo)記引物形成配對,使目標(biāo)堿基序列能夠得到擴(kuò)增。

在確定兩色熒光組合方案的基礎(chǔ)上,通過大量試驗,確定了上述6個snp位點的組合方式和熒光標(biāo)記類型。結(jié)合生產(chǎn)成本、熒光效率以及產(chǎn)物擴(kuò)增百分比等因素后,將6個snp位點的引物組成一組,各位點的共用引物均用fam熒光素進(jìn)行標(biāo)記,分子量內(nèi)標(biāo)使用橙色的熒光染料(美國應(yīng)用生物系統(tǒng)公司生產(chǎn)的liz500)進(jìn)行標(biāo)記。

1.4引物濃度的優(yōu)化

為了使各snp位點在擴(kuò)增時達(dá)到基本一致的擴(kuò)增峰值,在確定各位點的引物序列后,對引物的濃度進(jìn)行了優(yōu)化。具體方法如下:(1)首先將所有的引物組成引物混合物使其在擴(kuò)增體系中的終濃度為0.2μm,然后對人基因組dna進(jìn)行pcr擴(kuò)增;(2)將步驟(1)中的擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行熒光凝膠電泳檢測,根據(jù)檢測的峰高比例調(diào)整各引物的加量,選擇峰高在2000rfu左右的引物濃度做為優(yōu)選。經(jīng)過多次引物濃度微調(diào)實驗,最終確定了各位點引物在復(fù)合擴(kuò)增體系中的最適濃度,具體的引物濃度見表3:

表3各snp位點引物在擴(kuò)增體系中的終濃度

1.5擴(kuò)增及產(chǎn)物檢測的實驗過程

(1)擴(kuò)增體系

首先在冰上完成除模板外的pcr反應(yīng)體系的配制,最后加入擴(kuò)增模板;提取基因組dna時,先用紫外分光光度計nanodrop(美國熱電公司)測量濃度,再稀釋使其終濃度在0.5~1ng/μl左右,在實際操作中,一般取1~2μl的dna模板進(jìn)行擴(kuò)增。體系中各組分的加樣量如下表所示。

表4試劑盒擴(kuò)增體系

其中所述的反應(yīng)混合物(reactionmix)為mgcl27.5mm,tris-hclbuffer125mm,kcl125mm,dntps7.5mm,bsa2mg/ml,熱啟動taq酶為寶生物工程(大連)有限公司的hstaqdna聚合酶。

(2)擴(kuò)增程序

上述體系配制好后立即用掌式離心機(jī)離心,后將其置于熱循環(huán)儀上,選擇表5的程序進(jìn)行擴(kuò)增,擴(kuò)增后的產(chǎn)物應(yīng)立即進(jìn)行熒光凝膠電泳檢測或是避光保存。

表5試劑盒擴(kuò)增程序

(3)擴(kuò)增產(chǎn)物在遺傳分析儀上熒光檢測

由去離子甲酰胺與試劑盒中分子量內(nèi)標(biāo)liz-500(美國應(yīng)用生物系統(tǒng)公司)組成上樣混合物(按體積比9.5:0.5混合)。將10μl上樣混合物與1μl擴(kuò)增產(chǎn)物混合,離心,避免產(chǎn)生氣泡。95℃變性3分鐘,冰浴3分鐘,用遺傳分析儀3100(美國應(yīng)用生物系統(tǒng)公司)檢測分析。

實施例2:

等位基因分型標(biāo)準(zhǔn)物的制備:

本實施例中選取經(jīng)子淵司法鑒定所醫(yī)學(xué)檢驗部測序成功并確定基因型的患者,選出各snp位點不同基因型的個體,分別用rs13376333、rs7193343、rs2200733、rs3807989、rs3825214和rs10033464位點的引物進(jìn)行擴(kuò)增,其中,野生型的個體用野生型的引物,突變型的個體用突變型的引物進(jìn)行擴(kuò)增。引物序列見表2。

(1)擴(kuò)增體系

首先完成除模板外的pcr反應(yīng)體系的配制,最后加入擴(kuò)增模板;提取基因組dna時,先用紫外分光光度計測量濃度,再稀釋使其終濃度在0.5~1ng/μl左右,在實際操作中,一般取1~2μl的dna模板進(jìn)行擴(kuò)增。體系中各組分的加樣量如表4所示。

(2)擴(kuò)增程序

上述體系配置好后立即用掌式離心機(jī)離心,后將pcr管置于熱循環(huán)儀上,選擇表5的程序進(jìn)行擴(kuò)增,擴(kuò)增后的產(chǎn)物應(yīng)立即進(jìn)行熒光凝膠電泳檢測或是避光保存。

(3)擴(kuò)增產(chǎn)物在遺傳分析儀上熒光檢測

由去離子甲酰胺與試劑盒中分子量內(nèi)標(biāo)liz-500(美國應(yīng)用生物系統(tǒng)公司)組成上樣混合物(按體積比9.5:0.5混合)。將10μl上樣混合物與1μl擴(kuò)增產(chǎn)物混合,離心,避免產(chǎn)生氣泡。95℃變性3分鐘,冰浴3分鐘,用遺傳分析儀3100(美國應(yīng)用生物系統(tǒng)公司)檢測分析。

(4)分型分析

用片段分析軟件idx分析步驟(3)中遺傳分析儀檢測收集的數(shù)據(jù)。

(5)等位基因分型標(biāo)準(zhǔn)物的組配

根據(jù)各snp位點的等位基因擴(kuò)增峰高比例,峰高的少加,峰低的多加,把各等位基因擴(kuò)增產(chǎn)物混合,組成等位基因分型標(biāo)準(zhǔn)物。再次電泳檢測,檢測圖如附圖1。各snp位點的等位基因組成見下表。

表6各snp位點等位基因的組成

實施例3:

試劑盒的使用及驗證

本實施例選取6例經(jīng)子淵司法鑒定所醫(yī)學(xué)檢驗部測序成功并確定基因型的患者。運用本發(fā)明的試劑盒對上述6例患者進(jìn)行snp基因型的檢測。6例患者的編號分別為c1、c2、c3、c4、c5和c6,具體的檢測方法如下:

(1)擴(kuò)增體系

首先完成除模板外的pcr反應(yīng)體系的配制,最后加入擴(kuò)增模板;提取基因組dna時,先用紫外分光光度計測量濃度,再稀釋使其終濃度在0.5~1ng/μl左右,在實際操作中,一般取1~2μl的dna模板進(jìn)行擴(kuò)增。體系中各組分的加樣量如表4所示。

(2)擴(kuò)增程序

上述體系配置好后立即用掌式離心機(jī)離心,后將pcr管置于熱循環(huán)儀上,選擇表5的程序進(jìn)行擴(kuò)增,擴(kuò)增后的產(chǎn)物應(yīng)立即進(jìn)行熒光凝膠電泳檢測或是避光保存。

(3)擴(kuò)增產(chǎn)物在遺傳分析儀上熒光檢測

由去離子甲酰胺與試劑盒中分子量內(nèi)標(biāo)liz-500(美國應(yīng)用生物系統(tǒng)公司)組成上樣混合物(按體積比9.5:0.5混合)。將10μl上樣混合物與1μl擴(kuò)增產(chǎn)物混合,離心,避免產(chǎn)生氣泡。95℃變性3分鐘,冰浴3分鐘,用遺傳分析儀3100(美國應(yīng)用生物系統(tǒng)公司)檢測分析。

(4)分型分析

用片段分析軟件idx分析步驟(3)中遺傳分析儀檢測收集的數(shù)據(jù),具體的檢測結(jié)果見表7。通過比對分析可知,利用本發(fā)明的試劑盒的檢測結(jié)果與子淵司法鑒定所醫(yī)學(xué)檢驗部的測序結(jié)果完全一致。

表7本試劑盒對6例患者檢測的基因型

根據(jù)上述實施例的結(jié)果,我們可以看出運用本發(fā)明的試劑盒可以準(zhǔn)確的檢測出患者的房顫易感基因型,且檢測結(jié)果準(zhǔn)確可靠、操作方法簡單、一次實驗即可完成6個snp位點的檢測,同時得到相應(yīng)位點的基因型。目前,國內(nèi)外對于房顫治療藥物方面的研究較多,鮮少有從基因水平上去探討房顫的產(chǎn)生機(jī)制及致病機(jī)理的,本發(fā)明從基因水平上去分析房顫的遺傳易感性,檢測結(jié)果不僅可以評估健康人群患房顫的風(fēng)險,還可以為房顫患者的治療提供一定的指導(dǎo)意見。

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