技術(shù)領(lǐng)域:
本發(fā)明屬于微生物學(xué)領(lǐng)域,涉及一種單核細(xì)胞增生李斯特氏菌,具體來(lái)說(shuō)是一種基因敲除減毒單核細(xì)胞增生李斯特氏菌及其制備方法。
背景技術(shù):
:
單核細(xì)胞增生李斯特氏菌(listeriamonocytogenes,lm)是一種營(yíng)細(xì)胞內(nèi)寄生的人畜共患的食源性致病菌,廣泛存在于生鮮或即食食品中。lm可穿透人體的三大屏障——腸道屏障、血腦屏障和胎盤(pán)屏障,導(dǎo)致腸炎、腦膜炎、流產(chǎn),因此是研究胞內(nèi)寄生菌與宿主之間的相互作用的重要模式菌。在寄生及繁殖的不同階段中,lm有多個(gè)毒力因子來(lái)協(xié)助其進(jìn)行機(jī)體的感染繼而發(fā)揮致病作用,目前已發(fā)現(xiàn)多個(gè)與lm致病性與毒力相關(guān)因子其中多是表面蛋白或者是分泌蛋白。編碼這些蛋白的毒力基因(hly,plca,plcb,mpl,acta,inla和inlb)主要位于細(xì)菌染色體上的兩個(gè)毒力島上。其中hly基因編碼的溶菌素(listeriolysiono,llo)是一個(gè)主要毒力因子。
llo是一種由529個(gè)氨基酸組成具有溶血活性的成孔蛋白,屬膽固醇依賴(lài)性溶細(xì)胞素家族的成員。它在lm從初級(jí)和次級(jí)吞噬體逃逸中以及在宿主細(xì)胞質(zhì)中的增殖中都起到關(guān)鍵的作用?;趆ly基因在lm致病性中起到的重要作用,構(gòu)建lm的hly缺失減毒菌株不僅對(duì)于研究開(kāi)發(fā)lm減毒疫苗研究等有重要意義。而且,對(duì)于研究llo在細(xì)胞內(nèi)囊泡逃逸過(guò)程及其在lm在細(xì)胞與細(xì)胞間的感染機(jī)理具有一定指導(dǎo)意義。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
針對(duì)現(xiàn)有技術(shù)中的上述技術(shù)問(wèn)題,本發(fā)明提供了一種基因敲除減毒單核細(xì)胞增生李斯特氏菌及其制備方法,所述的這種基因敲除減毒單核細(xì)胞增生李斯特氏菌及其制備方法要解決現(xiàn)有技術(shù)中的沒(méi)有合適的單核細(xì)胞增生李斯特氏菌用于減毒疫苗的技術(shù)問(wèn)題。
本發(fā)明提供了一種基因敲除減毒單核細(xì)胞增生李斯特氏菌,所述的這種基因敲除減毒單核細(xì)胞增生李斯特氏菌缺失hly基因。
進(jìn)一步的,所述的基因敲除減毒單核細(xì)胞增生李斯特氏菌的保藏編號(hào)為:cctccm2016523。
本發(fā)明還提供了一種疫苗,含有上述的一種基因敲除減毒單核細(xì)胞增生李斯特氏菌。
本發(fā)明還提供了一種抗體,由上述的一種基因敲除減毒單核細(xì)胞增生李斯特氏菌免疫產(chǎn)生。
本發(fā)明還提供了上述基因敲除減毒單核細(xì)胞增生李斯特氏菌的制備方法,包括如下步驟:
1)分別使用hly5′f、hly5′r、hly3′f和hly3′r引物以egd-e基因組為模板擴(kuò)增hly基因的上游片段p1/p2、下游片段p3/p4;
2)得到的pcr片段電泳后割膠回收,使用酶xbali對(duì)片段進(jìn)行單酶切,并電泳割膠回收,產(chǎn)物使用t4dna連接酶連接,得到的上下游連接產(chǎn)物與pmd19-tvector連接并轉(zhuǎn)化至dh5α感受態(tài)細(xì)胞中,得到的菌懸液涂布于含100μl/mlamp平板上,37℃培養(yǎng),挑取單菌落擴(kuò)大培養(yǎng)后進(jìn)行pcr鑒定,對(duì)應(yīng)的陽(yáng)性克隆菌液使用質(zhì)粒抽提試劑盒抽提質(zhì)粒;
3)將連有同源臂的pmd19-tvector與pksv7質(zhì)粒使用相同的限制性?xún)?nèi)切酶smai和sali進(jìn)行雙酶切,產(chǎn)物使用t4dna連接酶連接并導(dǎo)入lm感受態(tài)細(xì)胞,將陽(yáng)性克隆的質(zhì)粒抽提后進(jìn)行smai和sali限制性?xún)?nèi)切酶雙酶切,獲得hly基因缺失的lm減毒菌株。
本發(fā)明在構(gòu)建單核細(xì)胞增生李斯特氏菌減毒菌株菌株的過(guò)程中,首先利用同源重組技術(shù)對(duì)標(biāo)準(zhǔn)菌株egd-e進(jìn)行減毒得到李斯特減毒菌株egd-e△hly。然后并從生長(zhǎng)狀態(tài)、溶血、毒力基因轉(zhuǎn)錄水平、宿主致死率等方面研究hly基因缺失菌株的生物特性,為食源性致病菌lm致病機(jī)理研究提供基礎(chǔ)。
上述構(gòu)建的基因敲除減毒單核細(xì)胞增生李斯特氏菌的保藏編號(hào)為:cctccno:m2016523;菌株名稱(chēng)為:?jiǎn)魏思?xì)胞增生李斯特氏菌egd-e(hly基因缺失)listeriamonocytogenesegd-e(hly基因缺失),保藏日期:2016年9月26日,保藏單位:中國(guó)典型培養(yǎng)物保藏中心(cctcc),地址為:中國(guó)武漢武漢大學(xué),郵編:430072。
本發(fā)明和已有技術(shù)相比,其技術(shù)進(jìn)步是顯著的。本發(fā)明構(gòu)建的hly基因缺失菌株生長(zhǎng)速率與egd-e無(wú)差異;hly基因缺失后,該缺失菌株與egd-e有顯著性差異,溶血性降低。hly基因敲除還導(dǎo)致inlc和prfa基因轉(zhuǎn)錄水平的下調(diào),基因plcb,vip的上調(diào)。同時(shí),通過(guò)實(shí)驗(yàn)證明,hly基因敲除后的突變菌株毒性下降。
附圖說(shuō)明
圖1顯示了egd-e△hly的構(gòu)建原理。
圖2顯示了hly上下游片段的克隆圖,其中a為hly5′片段和3′片段的pcr擴(kuò)增結(jié)果;b為5′片段與3′片段連接到pmd-19t后的菌落pcr鑒定結(jié)果。
圖3顯示了pksv7重組質(zhì)粒鑒定結(jié)果(m:marker)。
圖4顯示了egd-e△hly的鑒定結(jié)果(m:marker;1-9為鑒定菌株,10為陽(yáng)性對(duì)照)。
圖5為egd-e△hly的生長(zhǎng)曲線測(cè)定結(jié)果。
圖6為溶血實(shí)驗(yàn)結(jié)果(nc為陰性對(duì)照,pc為陽(yáng)性對(duì)照pc)。
圖7為毒力基因realtime-pcr測(cè)定結(jié)果。
圖8為egd-e△hly與egd-e的毒力測(cè)定結(jié)果,其中a為細(xì)胞侵襲效率;b為小鼠存活率(其中pbs組小鼠存活率始終為100%)。
具體實(shí)施方式
各個(gè)實(shí)驗(yàn)采用的試劑盒用量如下:
反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)
1.基因組dna的去除
2.反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)
realtime-pcr反應(yīng)
實(shí)施例1一種基因敲除減毒單核細(xì)胞增生李斯特氏菌的構(gòu)建
挑取egd-e(atccbaa-679)單菌落過(guò)夜搖床培養(yǎng),使用天根生化科技(北京)有限公司細(xì)菌基因組提取試劑盒(no:dp302-02)獲得egd-e基因組,分別使用hly5′f、hly5′r、hly3′f和hly3′r引物以egd-e基因組為模板擴(kuò)增hly基因的上游片段p1/p2(seqidno.27)、下游片段p3/p4(seqidno.28)。得到的pcr片段電泳后割膠回收,使用酶xbali對(duì)片段進(jìn)行單酶切,并電泳割膠回收。產(chǎn)物使用t4dna連接酶連接,得到的上下游連接產(chǎn)物與pmd19-tvector連接并轉(zhuǎn)化至dh5α感受態(tài)細(xì)胞中,得到的菌懸液涂布于含100μl/mlamp平板上,37℃培養(yǎng)。挑取單菌落擴(kuò)大培養(yǎng)后進(jìn)行pcr鑒定,對(duì)應(yīng)的陽(yáng)性克隆菌液使用質(zhì)粒抽提試劑盒抽提質(zhì)粒。
將上述連有同源臂的pmd19-tvector與pksv7質(zhì)粒使用相應(yīng)的限制性?xún)?nèi)切酶smai和sali進(jìn)行雙酶切,產(chǎn)物使用t4dna連接酶連接并導(dǎo)入lm感受態(tài)細(xì)胞。將陽(yáng)性克隆的質(zhì)粒抽提后進(jìn)行smai和sali限制性?xún)?nèi)切酶雙酶切鑒定并測(cè)序,測(cè)序過(guò)程由華大基因公司完成,將序列比對(duì)正確的脫鹽質(zhì)粒與lm感受態(tài)混勻,每200μllm(1×1011cfu/ml)感受態(tài)的質(zhì)粒用量約1μg,電轉(zhuǎn)化條件2.25kv/cm,4ms。
電轉(zhuǎn)后將感受態(tài)細(xì)胞轉(zhuǎn)入3-5ml的bhi培養(yǎng)基中振蕩培養(yǎng)約2h,離心收集菌體后涂布于含10μg/mlcam的bhi平板于30℃培養(yǎng),挑取菌落進(jìn)行鑒定,將含有重組質(zhì)粒的陽(yáng)性克隆轉(zhuǎn)接到bhi(含10μg/mlcam)液體培養(yǎng)基中41℃按1:100連續(xù)轉(zhuǎn)接10次,將末代細(xì)菌培養(yǎng)物劃線于bhi(含10μg/mlcam)平板上41℃過(guò)夜培養(yǎng);挑取bhi(含10μg/mlcam)平板上的單菌落于bhi液體培養(yǎng)基中30℃連續(xù)培養(yǎng)并按1:100轉(zhuǎn)接8次,取末代培養(yǎng)物劃線于bhi平板,30℃過(guò)夜培養(yǎng);挑取單菌落進(jìn)行pcr鑒定將疑似突變株分別劃線于抗性平板和非抗性平板,含cam的抗性bhi平板上不生長(zhǎng),無(wú)抗性bhi平板上可生長(zhǎng)的為疑似突變株,對(duì)疑似變株使用引物hlykof、hlykor進(jìn)行鑒定以確定突變株。減毒株egd-e△hly的構(gòu)建原理如圖1所示。
表1引物序列
注:hly5′f和hly5′r為hly基因上游片段引物,hly3′f和hly′r為hly基因下游片段引物;下劃線標(biāo)注酶切位點(diǎn)序列。
對(duì)上述構(gòu)建的基因敲除減毒單核細(xì)胞增生李斯特氏菌進(jìn)行了保藏,保藏編號(hào)為:cctccno:m2016523;菌株名稱(chēng)為:?jiǎn)魏思?xì)胞增生李斯特氏菌egd-e(hly基因缺失)listeriamonocytogenesegd-e(hly基因缺失),保藏日期:2016年9月26日,保藏單位:中國(guó)典型培養(yǎng)物保藏中心(cctcc)。
實(shí)施例2對(duì)菌株的鑒定
使用hly5′f、hly5′r、hly3′f、hly3′r(表1)引物擴(kuò)增同源臂p1/p2、p3/p4(序列見(jiàn)seqidno.27和seqidno.28),連接pmd-19t,pcr鑒定hly(p1/p4)片段與質(zhì)粒pmd-19t的連接;使用smai和sali對(duì)擴(kuò)增得到pmd-19t以及pksv7質(zhì)粒進(jìn)行雙酶切,得到的hly(p1/p4)與酶切后的pksv7連接、鑒定,鑒定為陽(yáng)性的克隆由上海華大基因科技有限公司測(cè)序,將測(cè)序正確的陽(yáng)性克隆命名為pksv7-hly(p1/p4)。電轉(zhuǎn)化后利用引物hlykof與hlykor(表1)及涂布無(wú)抗性平板對(duì)突變株進(jìn)行鑒定,鑒定結(jié)果為陽(yáng)性的菌株命名為egd-e△hly。
實(shí)施例3本發(fā)明菌株的鑒定結(jié)果如下:
1.上下游同源臂的擴(kuò)增及連接pmd-19t鑒定結(jié)果:
使用hly5′和hly3′引物擴(kuò)增同源臂pcr凝膠電泳結(jié)果如圖2a,hly5′片段條帶位置在900bp左右,hly3′片段條帶位置在700左右。按照ncbi上提供的序列,兩個(gè)條帶應(yīng)分別為880bp,724bp,結(jié)果符合預(yù)期。圖2b為hly5′和hly3′片段連接到pmd-19t后導(dǎo)入大腸桿菌的菌落pcr鑒定結(jié)果,共挑取6個(gè)菌落,其中4、5泳道出現(xiàn)陽(yáng)性條帶,條帶位置與預(yù)期目標(biāo)條帶1604bp相符,說(shuō)明連接成功。
2.重組質(zhì)粒的鑒定結(jié)果:
鑒定實(shí)驗(yàn)使用引物hly5′f和hly3′r,鑒定結(jié)果如圖3,1-4泳道以及6、7泳道有明顯擴(kuò)增條帶,條帶位置在1600bp左右,與理論值為1604bp相符,說(shuō)明hly上下游連接片段hly(p1/p4)已經(jīng)成功插入質(zhì)粒pksv7中。質(zhì)粒測(cè)序結(jié)果也表明重組質(zhì)粒構(gòu)建成功。
3.減毒菌株egd-e△hly的鑒定結(jié)果
使用hly基因上引物hlykof與hlykor,經(jīng)pcr擴(kuò)增、鑒定,hly基因缺失菌株無(wú)擴(kuò)增條帶,而沒(méi)有發(fā)生重組的菌株經(jīng)擴(kuò)增、凝膠電泳會(huì)出現(xiàn)對(duì)應(yīng)的理論值為535bp的條帶。如圖4所示,1、5、9泳道無(wú)擴(kuò)增條帶,其對(duì)應(yīng)的菌株為陽(yáng)性轉(zhuǎn)化子,其中10泳道為陽(yáng)性對(duì)照。陽(yáng)性轉(zhuǎn)化子分別涂布于抗性平板和非抗性平板,在含氯霉素的抗性平板上無(wú)菌落生長(zhǎng),在無(wú)氯霉素抗性的bhi平板上有菌落生長(zhǎng)。
綜合以上鑒定結(jié)果說(shuō)明質(zhì)粒攜帶的外源基因已經(jīng)與自身基因組完成基因重組,且質(zhì)粒已經(jīng)丟失,將陽(yáng)性轉(zhuǎn)化子命名為egd-e△hly。
實(shí)施例4
本發(fā)明為考察egd-e△hly基因缺失菌株的生長(zhǎng)狀況變化,以egd-e為對(duì)照測(cè)定了egd-e△hly的生長(zhǎng)曲線。具體方法如下:挑取egd-e與egd-e△hly單菌落于bhi液體培養(yǎng)基中搖床過(guò)夜培養(yǎng),按1:100轉(zhuǎn)接至裝100ml新鮮bhi培養(yǎng)基的錐形瓶中,37℃、200r/min培養(yǎng),每1h取200μl于酶標(biāo)板中測(cè)定od600光密度值,共記錄12h,得到的數(shù)據(jù)繪制生長(zhǎng)曲線。
測(cè)定結(jié)果如下:如圖5,egd-e△hly突變菌株與egd-e生長(zhǎng)曲線基本重合,前3小時(shí)為生長(zhǎng)初期,后經(jīng)歷對(duì)數(shù)期,并在第10小時(shí)到達(dá)穩(wěn)定期各時(shí)期的生長(zhǎng)速率無(wú)差異。說(shuō)明hly基因的缺失對(duì)egd-e的生長(zhǎng)不造成影響。
實(shí)施例5
本發(fā)明為考察egd-e△hly缺失菌株的溶血活性變化,對(duì)溶血活性進(jìn)行測(cè)定。具體方法如下:挑取egd-e、egd-e△hly、英諾克李斯特菌(listeriainnocua,li)的單菌落于bhi中培養(yǎng)至穩(wěn)定生長(zhǎng)早期(od600≈0.6)。將lm培養(yǎng)物5500rmp4℃離心10min。取0.1ml上清液樣品加入到1ml溶血素緩沖液(0.145mol/lnacl,0.02mol/lcacl2)中,并加入0.025ml脫纖維羊血。設(shè)置陰性對(duì)照(negativecontrol,nc)和陽(yáng)性對(duì)照(positivecontrol,pc),其中將0.1ml培養(yǎng)基用作陰性對(duì)照,0.1ml1%triton-100x作為陽(yáng)性對(duì)照。將混合物于37℃培養(yǎng)箱孵育30分鐘,5500r/min離心10min。使用分光光度計(jì)測(cè)定上清液的od540值。
如圖6所示,測(cè)定結(jié)果如下:如圖egd-e△hly與egd-e有顯著性差異,溶血性降低。
實(shí)施例6
本發(fā)明為考察hly基因缺失后對(duì)其他毒力基因的影響,使用realtime-pcr方法在轉(zhuǎn)錄表達(dá)水平對(duì)其他毒力基因進(jìn)行了測(cè)定。具體方法如下:取5ml過(guò)夜培養(yǎng)的egd-e、egd-e△hly菌液中加入1ml預(yù)冷的苯酚乙醇混合液(苯酚:乙醇=1:9),冰浴30min;離心收集菌體后加入50μl變?nèi)芫?250u/ml)和50μl溶菌酶(25mg/ml)37℃水浴30min;然后加入1mltrizol,離心后轉(zhuǎn)移上清并加入200μl三氯甲烷,手搖震蕩15s呈乳濁液后室溫放置2min;離心轉(zhuǎn)移上層水相并加入等體積異丙醇后緩慢搖動(dòng),室溫放置5-10min;離心棄上清后加入1ml75%乙醇清洗沉淀,晾干乙醇,用30-60μldepc水溶解沉淀。獲得的rna根據(jù)takara反轉(zhuǎn)錄試劑盒(takaracode:drr047a)進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄成cdna(其中包括基因組dna的去除反應(yīng)),以cdna為模板進(jìn)行sybrgreen熒光染料法realtime-pcr。各毒力基因轉(zhuǎn)錄水平變化計(jì)算方法為:以lm的16s核糖體rna為內(nèi)參基因,假設(shè)擴(kuò)增效率統(tǒng)一為100%,各毒力基因的ct值減去內(nèi)參基因16s的ct得到△ct,突變菌株的△ct減去野生型菌株△ct得到△△ct,則各基因相對(duì)表達(dá)量增高了2-△△ct倍?;蛎Q(chēng)及引物詳細(xì)序列見(jiàn)表2。
表2realtime-pcr引物序列
測(cè)定結(jié)果如下:如圖7,其中hly基因信號(hào)值較低,與對(duì)照組有顯著差異(p<0.001),驗(yàn)證hly基因成功敲除,同時(shí)hly敲除還導(dǎo)致inlc和prfa基因的下調(diào),數(shù)值分別降為0.19和0.24,下降了4.2倍和3倍。相反的,基因plcb,vip表現(xiàn)上調(diào),與對(duì)照組有顯著性差異(p<0.001),表達(dá)量分別是對(duì)照組的2.8倍和4倍。
實(shí)施例7
本發(fā)明為考察hly基因缺失后毒力變化對(duì)egd-e△hly進(jìn)行了caco-2細(xì)胞侵襲實(shí)驗(yàn)以及小鼠致死率測(cè)定。具體方法如下:1)caco-2細(xì)胞侵襲實(shí)驗(yàn)胰酶消化下的caco-2細(xì)胞,使用含20%fbs的dmem重懸,準(zhǔn)確計(jì)數(shù)后均勻平鋪12孔板底部,2.0×105cells/孔,放置于細(xì)胞培養(yǎng)箱(37℃,2.5%co2)過(guò)夜。取對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期的細(xì)菌,按moi=100:1接種于孔板中共培養(yǎng)2h。每孔更換0.5ml200μg/ml含20%fbs的dmem配置的的慶大霉素溶液,于37℃培養(yǎng)箱中30min以清除胞外菌。吸出慶大霉素溶液,使用pbs洗2次,每孔加入1ml1%tritontmx-100充分吹打,收集于1.5ml無(wú)菌離心管中,稀釋后取100μl涂布于bhi固體培養(yǎng)板中,37℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng)24h后計(jì)數(shù)統(tǒng)計(jì)。2)小鼠致死率測(cè)定取對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期的egd-e、egd-e△hly離心收集,使用無(wú)菌pbs重懸配置成濃度為107cells/ml菌懸液。3組6-8周齡balb/c小鼠,每組8只,每只腹腔注射200μl菌懸液,其中對(duì)照組注射200μlpbs,每天記錄小鼠死亡狀況。
測(cè)定結(jié)果如下:egd-e△hly缺失菌株細(xì)胞侵襲實(shí)驗(yàn)結(jié)果如圖8a所示,egd-e△hly小鼠致死結(jié)果如圖8b,hly基因敲除后,細(xì)胞實(shí)驗(yàn)檢測(cè)到的菌落顯著降低,小鼠致死結(jié)果與對(duì)照組(pbs注射組)一致,均未出現(xiàn)小鼠死亡現(xiàn)象。說(shuō)明hly基因敲除后,egd-e的毒性下降。
實(shí)施例8
毒力因子李斯特菌溶素o(llo)缺失使得lm的菌株毒性降低,安全性提高。使用單核增生性李斯特氏菌hly基因缺失菌株免疫小鼠,2×105cell/只,靜脈注射。感染后7天,檢測(cè)小鼠體內(nèi)的ifn-γ和cd8+t細(xì)胞,結(jié)果顯示ifn-γ量增加,cd8+t細(xì)胞數(shù)量大量增加,說(shuō)明小鼠體內(nèi)的細(xì)胞免疫被激發(fā)。同時(shí)使用野生型egde菌株感染小鼠,小鼠的死亡率降低,說(shuō)明lmδhly可以用于毒性lm引發(fā)的小鼠感染,對(duì)lm具有抗性?;趌mδhly的保護(hù)性免疫,可開(kāi)發(fā)lmδhly用于疫苗載體。
序列表
<110>上海理工大學(xué)
<120>一種基因敲除減毒單增李斯特菌及其制備方法
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<213>prfa正向引物
<400>9
ggctctatttgcggtcaact20
<210>10
<211>19
<212>dna
<213>prfa反向引物
<400>10
gctatgtgcgatgccactt19
<210>11
<211>21
<212>dna
<213>hly正向引物
<400>11
cagcattgatttgccaggtat21
<210>12
<211>21
<212>dna
<213>hly反向引物
<400>12
tcactgtaagccatttcgtca21
<210>13
<211>19
<212>dna
<213>inla正向引物
<400>13
tgtggacggcaaagaaaca19
<210>14
<211>21
<212>dna
<213>inla反向引物
<400>14
ccaaccaacaaatgtgtgacc21
<210>15
<211>21
<212>dna
<213>inlb正向引物
<400>15
gcaggcatctacaaacttcca21
<210>16
<211>19
<212>dna
<213>inlb反向引物
<400>16
gccatttcgggcttctcta19
<210>17
<211>22
<212>dna
<213>plca正向引物
<400>17
actacaatggtccgagtgtgaa22
<210>18
<211>21
<212>dna
<213>plca反向引物
<400>18
cagcatactgacgaggtgtga21
<210>19
<211>19
<212>dna
<213>plcb正向引物
<400>19
gcaaatgcctgttgtgatg19
<210>20
<211>22
<212>dna
<213>plcb反向引物
<400>20
cgtcagtatttgtcgggttatc22
<210>21
<211>20
<212>dna
<213>acta正向引物
<400>21
aggcggtagaccaacatctg20
<210>22
<211>20
<212>dna
<213>acta反向引物
<400>22
cccgcatttcttgagtgttt20
<210>23
<211>20
<212>dna
<213>srta正向引物
<400>23
cgcagttccatctgtagacg20
<210>24
<211>20
<212>dna
<213>srta反向引物
<400>24
aacgcatagttgttgctcca20
<210>25
<211>18
<212>dna
<213>sigb正向引物
<400>25
tttggattgccgcttacc18
<210>26
<211>20
<212>dna
<213>sigb反向引物
<400>26
tcgggcgatggactctacta20
<210>27
<211>880
<212>dna
<213>p1/p2序列
<400>27
ccgcggacatcttttaatgtagggattttattgctcgtgtcagttctgggagtagtgtaa60
aaataatctttataaatgttgattagtggttggatccgataatcaaaactatcgttgctg120
ttttgctcgtcttttaaacgcataataatggtttcttttggatttttctttaaaaattga180
gtaatcgtttctaatacacctgaaagtgatgcatttaaaaaaattggcccatggtaaatg240
ttgagattgtcttttgctctaatatcgatgtaccgtattcctgcttctagttgttggtac300
aatgacatcgtttgtgtttgagctagtggtttggttaatgtccatgttatgtctccgtta360
tagctcatcgtatcatgtgtacctggtatagagagcgctgctaggtttgttgtgtcaggt420
agagcggacatccattgttttgtagttacagagttctttattggcttattccagttatta480
agcgaatatgcttttccgcctaatgggaaagtaaaaaagtataaaataaaacagagtaat540
aaaactaatgtgcgttgcaaataattcttatacaaaatggccccctcctttgattagtat600
attcctatcttaaagtgacttttatgttgaggcattaacatttgttaacgacgataaagg660
gacagcaggactagaataaagctataaagcaagcatataatattgcgtttcatctttaga720
agcgaatttcgccaatattataattatcaaaagagaggggtggcaaacggtatttggcat780
tattaggttaaaaaatgtagaaggagagtgaaacccatgaaaaaaataatgctagttttt840
attacacttatattagttagtctaccaattgcgcaacaaa880
<210>28
<211>724
<212>dna
<213>p3/p4序列
<400>28
caccacgctttatccgaaatatagtaataaagtagataatccaatcgaataattgtaaaa60
gtaataaaaaattaagaataaaaccgcttaacacacacgaaaaaataagcttgttttgca120
ctcttcgtaaattattttgtgaagaatgtagaaacaggcttattttttaatttttttaga180
agaattaacaaatgtaaaagaatatctgactgtttatccatataatataagcatatccca240
aagtttaagccacctatagtttctactgcaaaacgtataatttagttcccacatatacta300
aaaaacgtgtccttaactctctctgtcagattagttgtaggtggcttaaacttagtttta360
cgaattaaaaaggagcggtgaaatgaaaagtaaacttatttgtatcatcatggtaatagc420
ttttcaggctcatttcactatgacggtaaaagcagattctgtcggggaagaaaaacttca480
aaataatacacaagccaaaaagacccctgctgatttaaaagctttgccagattcctgcga540
agcaaaagatttttataaaaattttaaaattcttgatatgacaaaagataagctaggcgt600
tacgcattatacgctcgcgctaagttctggtggttacttgaccgataatgatgaaatcaa660
ggtccacgtcacaccggataataaaatcactttcataaatggagatttgcagcaaggaca720
gctt724