本發(fā)明涉及楔天牛鑒定技術(shù)領(lǐng)域,具體為進(jìn)境植物檢疫性有害生物八點(diǎn)楔天牛的快速鑒定方法。
背景技術(shù):
八點(diǎn)楔天牛Saperda octopunctata Scopoli,1772屬昆蟲綱、鞘翅目、天???、溝脛天牛亞科、楔天牛屬。楔天牛屬非中國(guó)種(Saperda spp.)為我國(guó)進(jìn)境植物檢疫性有害生物,八點(diǎn)楔天牛Saperda octopuntata Scopoli是我國(guó)未有分布的楔天牛屬的非中國(guó)種。寄主:闊葉樹,主要為害椴木(Tilia),也對(duì)楊樹(Populus)和榆樹(Ulmus)造成為害。地理分布:奧地利、斯洛文尼亞、俄羅斯、瑞士、克羅地亞、波黑、捷克、斯洛伐克、馬達(dá)維、法國(guó)、烏克蘭、阿爾巴尼亞、波蘭、羅馬尼亞、南斯拉夫、意大利、匈牙利、德國(guó)、希臘、比利時(shí)、西班牙。生物學(xué)習(xí)性:八點(diǎn)楔天牛是蛀干害蟲,主要在幼蟲期為害樹木。為害狀主要為侵入孔、蛀屑、蟲糞、羽化孔、幼蟲的排糞孔、膨大的蟲瘤、刻槽或空洞眼等。成蟲出孔后補(bǔ)充營(yíng)養(yǎng),取食葉片和嫩梢造成掉葉斷梢,影響樹木景觀和生長(zhǎng),并在枝條嫩梢和樹干上咬食形成產(chǎn)卵刻槽。幼蟲先在樹皮下取食,后鉆入木質(zhì)部,在樹干內(nèi)部形成縱橫交錯(cuò)的蟲道。成蟲和幼蟲為害造成的刻槽、排糞孔、羽化孔在樹干表面形成蟲瘤或空洞眼,受害樹干極易風(fēng)折,引起幼樹死亡,老樹折斷或斷枝。
傳統(tǒng)檢疫鑒定方法為根據(jù)昆蟲的外部形態(tài)特征鑒定和判別是否為禁止入境的檢疫性有害生物;現(xiàn)有技術(shù)主要注重的是八點(diǎn)楔天牛的外部形態(tài)特征鑒別,當(dāng)蟲態(tài)不是適合形態(tài)鑒定的成蟲或蟲體不完整時(shí),就無法鑒定準(zhǔn)確到種。針對(duì)現(xiàn)有技術(shù)的缺點(diǎn),本發(fā)明的分子生物學(xué)方法有效解決了非成蟲蟲態(tài)或蟲體不完整時(shí)的檢測(cè)鑒定問題。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
本發(fā)明的目的在于提供一種進(jìn)境植物檢疫性有害生物八點(diǎn)楔天牛的快速鑒定方法,以解決上述背景技術(shù)中提出的問題。
為實(shí)現(xiàn)上述目的,本發(fā)明提供如下技術(shù)方案:進(jìn)境植物檢疫性有害生物八點(diǎn)楔天牛的快速鑒定方法,包括以下步驟:
A、提取八點(diǎn)楔天牛及楔天牛屬DNA;
B、對(duì)八點(diǎn)楔天牛及楔天牛屬DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增;
C、PCR產(chǎn)物保存一段時(shí)間后測(cè)序;
D、序列比對(duì),確定楔天牛種類。
優(yōu)選的,所述步驟B中PCR擴(kuò)增方法包括以下步驟:
A、將對(duì)象PCR加入模版DNA2ul以及秋水仙素溶液中,并將混合物搖勻;
B、將秋水仙素溶液升溫至85℃-95℃,使混合物變性,反應(yīng)時(shí)間為50s-80s;之后對(duì)其進(jìn)行鏈霉親和素修飾;
C、對(duì)步驟B修飾后的混合液快速冷卻至50℃-60℃進(jìn)行退火處理;退火時(shí)間為30s-60s;
D、對(duì)步驟C退火后的混合液再次升溫至80℃-90℃,時(shí)間為30s-60s,進(jìn)行二次變性;
E、最后在磁富集單重PCR的基礎(chǔ)之上,對(duì)以上三個(gè)個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行磁富集多重PCR擴(kuò)增。
優(yōu)選的,所述步驟C中保存液包括乙酸鈉、乙二胺四乙酸二鈉和糖原;所述保存液中乙酸鈉的濃度為1mol/L-2mol/L,乙二胺四乙酸二鈉的濃度為0.02mol/L-0.06mol/L,糖原的濃度為2g/L-6g/L。
優(yōu)選的,所述步驟C中保存時(shí)間為30min-90min。
與現(xiàn)有技術(shù)相比,本發(fā)明的有益效果是:本發(fā)明有效解決了非成蟲蟲態(tài)或蟲體不完整時(shí)的檢測(cè)鑒定問題,能快速識(shí)別和鑒定出八點(diǎn)楔天牛及其楔天牛屬部分近似種,防止有害生物傳入中國(guó),以免對(duì)中國(guó)的農(nóng)林生產(chǎn)和生態(tài)環(huán)境造成破壞,并能顯著提高八點(diǎn)楔天牛的疫情截獲率;本發(fā)明采用的PCR擴(kuò)增方法操作簡(jiǎn)單,有效避免蛋白氨基酸丟失,且穩(wěn)定性好,表達(dá)量高;另外本發(fā)明中采用的保存液能夠提高PCR測(cè)序中間產(chǎn)物在保存后的測(cè)序成功率,進(jìn)一步提高了鑒定效率。
具體實(shí)施方式
下面對(duì)本發(fā)明實(shí)施例中的技術(shù)方案進(jìn)行清楚、完整地描述,顯然,所描述的實(shí)施例僅僅是本發(fā)明一部分實(shí)施例,而不是全部的實(shí)施例?;诒景l(fā)明中的實(shí)施例,本領(lǐng)域普通技術(shù)人員在沒有做出創(chuàng)造性勞動(dòng)前提下所獲得的所有其他實(shí)施例,都屬于本發(fā)明保護(hù)的范圍。
實(shí)施例一:
進(jìn)境植物檢疫性有害生物八點(diǎn)楔天牛的快速鑒定方法,包括以下步驟:
A、提取八點(diǎn)楔天牛及楔天牛屬DNA;
B、對(duì)八點(diǎn)楔天牛及楔天牛屬DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增;
C、PCR產(chǎn)物保存一段時(shí)間后測(cè)序;
D、序列比對(duì),確定楔天牛種類。
本實(shí)施例中,步驟B中PCR擴(kuò)增方法包括以下步驟:
A、將對(duì)象PCR加入模版DNA2ul以及秋水仙素溶液中,并將混合物搖勻;
B、將秋水仙素溶液升溫至85℃,使混合物變性,反應(yīng)時(shí)間為50s;之后對(duì)其進(jìn)行鏈霉親和素修飾;
C、對(duì)步驟B修飾后的混合液快速冷卻至50℃進(jìn)行退火處理;退火時(shí)間為30s;
D、對(duì)步驟C退火后的混合液再次升溫至80℃,時(shí)間為30s,進(jìn)行二次變性;
E、最后在磁富集單重PCR的基礎(chǔ)之上,對(duì)以上三個(gè)個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行磁富集多重PCR擴(kuò)增。
本實(shí)施例中,步驟C中保存液包括乙酸鈉、乙二胺四乙酸二鈉和糖原;所述保存液中乙酸鈉的濃度為1mol/L,乙二胺四乙酸二鈉的濃度為0.02mol/L,糖原的濃度為2g/L;保存時(shí)間為30min。
實(shí)施例二:
進(jìn)境植物檢疫性有害生物八點(diǎn)楔天牛的快速鑒定方法,包括以下步驟:
A、提取八點(diǎn)楔天牛及楔天牛屬DNA;
B、對(duì)八點(diǎn)楔天牛及楔天牛屬DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增;
C、PCR產(chǎn)物保存一段時(shí)間后測(cè)序;
D、序列比對(duì),確定楔天牛種類。
本實(shí)施例中,步驟B中PCR擴(kuò)增方法包括以下步驟:
A、將對(duì)象PCR加入模版DNA2ul以及秋水仙素溶液中,并將混合物搖勻;
B、將秋水仙素溶液升溫至95℃,使混合物變性,反應(yīng)時(shí)間為80s;之后對(duì)其進(jìn)行鏈霉親和素修飾;
C、對(duì)步驟B修飾后的混合液快速冷卻至60℃進(jìn)行退火處理;退火時(shí)間為60s;
D、對(duì)步驟C退火后的混合液再次升溫至90℃,時(shí)間為60s,進(jìn)行二次變性;
E、最后在磁富集單重PCR的基礎(chǔ)之上,對(duì)以上三個(gè)個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行磁富集多重PCR擴(kuò)增。
本實(shí)施例中,步驟C中保存液包括乙酸鈉、乙二胺四乙酸二鈉和糖原;所述保存液中乙酸鈉的濃度為2mol/L,乙二胺四乙酸二鈉的濃度為0.06mol/L,糖原的濃度為6g/L;保存時(shí)間為90min。
實(shí)施例三:
進(jìn)境植物檢疫性有害生物八點(diǎn)楔天牛的快速鑒定方法,包括以下步驟:
A、提取八點(diǎn)楔天牛及楔天牛屬DNA;
B、對(duì)八點(diǎn)楔天牛及楔天牛屬DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增;
C、PCR產(chǎn)物保存一段時(shí)間后測(cè)序;
D、序列比對(duì),確定楔天牛種類。
本實(shí)施例中,步驟B中PCR擴(kuò)增方法包括以下步驟:
A、將對(duì)象PCR加入模版DNA2ul以及秋水仙素溶液中,并將混合物搖勻;
B、將秋水仙素溶液升溫至88℃,使混合物變性,反應(yīng)時(shí)間為60s;之后對(duì)其進(jìn)行鏈霉親和素修飾;
C、對(duì)步驟B修飾后的混合液快速冷卻至52℃進(jìn)行退火處理;退火時(shí)間為35s;
D、對(duì)步驟C退火后的混合液再次升溫至82℃,時(shí)間為35s,進(jìn)行二次變性;
E、最后在磁富集單重PCR的基礎(chǔ)之上,對(duì)以上三個(gè)個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行磁富集多重PCR擴(kuò)增。
本實(shí)施例中,步驟C中保存液包括乙酸鈉、乙二胺四乙酸二鈉和糖原;所述保存液中乙酸鈉的濃度為1.2mol/L,乙二胺四乙酸二鈉的濃度為0.03mol/L,糖原的濃度為3g/L;保存時(shí)間為40min。
實(shí)施例四:
進(jìn)境植物檢疫性有害生物八點(diǎn)楔天牛的快速鑒定方法,包括以下步驟:
A、提取八點(diǎn)楔天牛及楔天牛屬DNA;
B、對(duì)八點(diǎn)楔天牛及楔天牛屬DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增;
C、PCR產(chǎn)物保存一段時(shí)間后測(cè)序;
D、序列比對(duì),確定楔天牛種類。
本實(shí)施例中,步驟B中PCR擴(kuò)增方法包括以下步驟:
A、將對(duì)象PCR加入模版DNA2ul以及秋水仙素溶液中,并將混合物搖勻;
B、將秋水仙素溶液升溫至92℃,使混合物變性,反應(yīng)時(shí)間為70s;之后對(duì)其進(jìn)行鏈霉親和素修飾;
C、對(duì)步驟B修飾后的混合液快速冷卻至58℃進(jìn)行退火處理;退火時(shí)間為50s;
D、對(duì)步驟C退火后的混合液再次升溫至88℃,時(shí)間為50s,進(jìn)行二次變性;
E、最后在磁富集單重PCR的基礎(chǔ)之上,對(duì)以上三個(gè)個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行磁富集多重PCR擴(kuò)增。
本實(shí)施例中,步驟C中保存液包括乙酸鈉、乙二胺四乙酸二鈉和糖原;所述保存液中乙酸鈉的濃度為1.8mol/L,乙二胺四乙酸二鈉的濃度為0.05mol/L,糖原的濃度為5g/L;保存時(shí)間為80min。
實(shí)施例五:
進(jìn)境植物檢疫性有害生物八點(diǎn)楔天牛的快速鑒定方法,包括以下步驟:
A、提取八點(diǎn)楔天牛及楔天牛屬DNA;
B、對(duì)八點(diǎn)楔天牛及楔天牛屬DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增;
C、PCR產(chǎn)物保存一段時(shí)間后測(cè)序;
D、序列比對(duì),確定楔天牛種類。
本實(shí)施例中,步驟B中PCR擴(kuò)增方法包括以下步驟:
A、將對(duì)象PCR加入模版DNA2ul以及秋水仙素溶液中,并將混合物搖勻;
B、將秋水仙素溶液升溫至90℃,使混合物變性,反應(yīng)時(shí)間為65s;之后對(duì)其進(jìn)行鏈霉親和素修飾;
C、對(duì)步驟B修飾后的混合液快速冷卻至55℃進(jìn)行退火處理;退火時(shí)間為45s;
D、對(duì)步驟C退火后的混合液再次升溫至85℃,時(shí)間為45s,進(jìn)行二次變性;
E、最后在磁富集單重PCR的基礎(chǔ)之上,對(duì)以上三個(gè)個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行磁富集多重PCR擴(kuò)增。
本實(shí)施例中,步驟C中保存液包括乙酸鈉、乙二胺四乙酸二鈉和糖原;所述保存液中乙酸鈉的濃度為1.5mol/L,乙二胺四乙酸二鈉的濃度為0.04mol/L,糖原的濃度為4g/L;保存時(shí)間為60min。
本發(fā)明有效解決了非成蟲蟲態(tài)或蟲體不完整時(shí)的檢測(cè)鑒定問題,能快速識(shí)別和鑒定出八點(diǎn)楔天牛及其楔天牛屬部分近似種,防止有害生物傳入中國(guó),以免對(duì)中國(guó)的農(nóng)林生產(chǎn)和生態(tài)環(huán)境造成破壞,并能顯著提高八點(diǎn)楔天牛的疫情截獲率;本發(fā)明采用的PCR擴(kuò)增方法操作簡(jiǎn)單,有效避免蛋白氨基酸丟失,且穩(wěn)定性好,表達(dá)量高;另外本發(fā)明中采用的保存液能夠提高PCR測(cè)序中間產(chǎn)物在保存后的測(cè)序成功率,進(jìn)一步提高了鑒定效率。
盡管已經(jīng)示出和描述了本發(fā)明的實(shí)施例,對(duì)于本領(lǐng)域的普通技術(shù)人員而言,可以理解在不脫離本發(fā)明的原理和精神的情況下可以對(duì)這些實(shí)施例進(jìn)行多種變化、修改、替換和變型,本發(fā)明的范圍由所附權(quán)利要求及其等同物限定。