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一種基于數(shù)字PCR絕對(duì)定量檢測(cè)弓形蟲(chóng)的試劑盒及其檢測(cè)方法與流程

文檔序號(hào):12249966閱讀:731來(lái)源:國(guó)知局

本發(fā)明涉及一種基于數(shù)字PCR絕對(duì)定量檢測(cè)弓形蟲(chóng)的試劑盒及其檢測(cè)方法,

屬于生物檢測(cè)技術(shù)領(lǐng)域,適用于在動(dòng)物弓形蟲(chóng)病早期診斷和防疫中的應(yīng)用。



背景技術(shù):

弓形蟲(chóng)病(Toxoplasmosis)是由弓形蟲(chóng)(Toxoplasma gondii)引起的一種人獸共患寄生蟲(chóng)病。該病呈全球性分布。犬、貓、豬、牛、羊、兔等家畜感染弓形蟲(chóng)非常普遍,其感染率高達(dá)10%~47.3%,不僅造成家畜流產(chǎn),影響畜牧業(yè)生產(chǎn),而且成為人類(lèi)弓形蟲(chóng)病的主要傳染源。人類(lèi)弓形蟲(chóng)感染率一般為20%~50%,最高達(dá)94%,全球約有1/3的人感染弓形蟲(chóng),我國(guó)人群弓形蟲(chóng)感染率為5%~20%。弓形蟲(chóng)在某些情況下可引起嚴(yán)重的疾病,如孕婦感染弓形蟲(chóng)可影響胎兒的發(fā)育,產(chǎn)畸形胎、木乃伊胎甚至死胎等,同時(shí)可使孕婦流產(chǎn)或早產(chǎn);對(duì)于艾滋病等免疫抑制或免疫缺陷的病人,弓形蟲(chóng)更是一個(gè)主要的機(jī)會(huì)性致病因素。據(jù)報(bào)道,孕婦感染弓形蟲(chóng)后有30%~46%的機(jī)率從母親傳播給胎兒,引起胎兒先天性感染,造成流產(chǎn)、死胎或先天性弓形蟲(chóng)病;有6%~10%的艾滋病患者并發(fā)弓形蟲(chóng)病,而艾滋病病人所患腦炎中有50%是由弓形蟲(chóng)感染所引起的。據(jù)調(diào)查,孕產(chǎn)婦和腫瘤患者弓形蟲(chóng)抗體陽(yáng)性率高達(dá)10%~60%。因此,弓形蟲(chóng)病已成為我國(guó)亟待解決的重要公共衛(wèi)生問(wèn)題之一。

由于弓形蟲(chóng)病臨床上缺乏特異性表現(xiàn),導(dǎo)致特異性檢測(cè)方法的建立對(duì)于弓形蟲(chóng)病的防控起重要作用,弓形蟲(chóng)檢測(cè)的一般方法可分為病原學(xué)檢測(cè)方法、分子生物學(xué)檢測(cè)方法和血清學(xué)檢測(cè)方法。病原學(xué)檢測(cè)方法應(yīng)用簡(jiǎn)單,但費(fèi)時(shí)、費(fèi)力,檢出率低,敏感和特異性不高,易漏診。分子生物學(xué)技術(shù)具有靈敏度高、特異性好的特點(diǎn),其中,聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)是一項(xiàng)高效、敏感、特異的快速診斷技術(shù),已被應(yīng)用于弓形蟲(chóng)病的檢測(cè),近年來(lái)還發(fā)展了巢式PCR、多重PCR等,但此類(lèi)檢測(cè)方法屬于定性檢測(cè)方法,且易因污染導(dǎo)致假陽(yáng)性。血清學(xué)檢測(cè)方法是診斷弓形蟲(chóng)感染普遍的方法,主要有染色試驗(yàn)(DT)、凝集試驗(yàn)(AT)、酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn)(ELISA)、免疫膠體金技術(shù)(Immune colloidal gold technique)等。其中,染色試驗(yàn)對(duì)于實(shí)驗(yàn)人員危險(xiǎn)性很大,應(yīng)用范圍存在限制性;凝集試驗(yàn)測(cè)試方法簡(jiǎn)單,具有較高的特異性、靈敏度和重現(xiàn)性,尤其是間接免疫熒光抗體試驗(yàn)(IFAT)與改良凝集試驗(yàn)(MAT)效果最佳,但是檢測(cè)費(fèi)時(shí)且費(fèi)用較高;膠體金快速診斷技術(shù)雖然具有簡(jiǎn)便、準(zhǔn)確、高度特異性和敏感性,但目前只適用于弓形蟲(chóng)早期的檢測(cè)和診斷,且價(jià)格較高;酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn)(ELISA)具有特異性強(qiáng)、靈敏度高等的優(yōu)點(diǎn),目前已有多種試劑盒應(yīng)用于弓形蟲(chóng)病的診斷,但因不同試劑盒采取的抗原不同且抗原純度不高而導(dǎo)致檢測(cè)的敏感性、特異性和重復(fù)性仍不夠理想,價(jià)格也較高。

數(shù)字PCR(digital PCR, dPCR)是近年來(lái)引起重視并迅速發(fā)展起來(lái)的一種突破性的定量分析技術(shù)。1992年Sykes等利用樣品的有限稀釋獲得單個(gè)模板分子,通過(guò)計(jì)算PCR后的擴(kuò)增信號(hào),以期準(zhǔn)確地確定起始分子的數(shù)量,雖沒(méi)有明確提出“數(shù)字PCR”概念,但已經(jīng)建立了數(shù)字PCR的基本實(shí)驗(yàn)流程,這是數(shù)字PCR的雛形。Bio-Rad公司的QX200系統(tǒng)核心的微滴化技術(shù)能夠?qū)⒁环輼悠贩殖?0 ,000個(gè)納升級(jí)的微滴,本質(zhì)上將傳統(tǒng)定量PCR的一個(gè)test變成20 ,000個(gè)test,大大提高了核酸序列檢測(cè)的靈敏度和精準(zhǔn)度,是對(duì)“無(wú)限稀釋”這一概念的完美演繹,其方法原理可稱(chēng)為微滴式數(shù)字化P CR( Droplet Digital PCR,ddPCR )。該技術(shù)先將核酸模板進(jìn)行稀釋,分配到大量獨(dú)立的反應(yīng)單元中,使每個(gè)反應(yīng)單元中只有單個(gè)模板分子,然后進(jìn)行PCR擴(kuò)增反應(yīng),擴(kuò)增結(jié)束后對(duì)每個(gè)反應(yīng)室的熒光信號(hào)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,來(lái)定量DNA 拷貝數(shù)。數(shù)字PCR 采用先擴(kuò)增后定量,因此不依賴(lài)擴(kuò)增曲線的循環(huán)閾值(Ct),也無(wú)需采用內(nèi)參基因和標(biāo)準(zhǔn)曲線,準(zhǔn)確度高、重現(xiàn)性好,可以實(shí)現(xiàn)絕對(duì)定量分析。實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)都因受到背景DNA或雜質(zhì)的干擾,使得檢測(cè)靈敏度及精確性都達(dá)不到精準(zhǔn)定量的要求,而數(shù)字PCR檢測(cè)系統(tǒng)通過(guò)微滴化處理,使得稀有檢測(cè)片段從大量的復(fù)雜背景中分離出來(lái),從而提高檢測(cè)的靈敏度和精確性。由于其獨(dú)特的技術(shù)優(yōu)勢(shì),已經(jīng)在臨床診斷、轉(zhuǎn)基因成分定量、單細(xì)胞基因表達(dá)分析、環(huán)境微生物檢測(cè)和下一代測(cè)序等研究領(lǐng)域顯示出巨大的優(yōu)勢(shì)和應(yīng)用前景。



技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:

本發(fā)明的目的在于提供一種基于數(shù)字PCR絕對(duì)定量檢測(cè)弓形蟲(chóng)的試劑盒及其檢測(cè)方法,其具有靈敏度高、特異性強(qiáng)、高準(zhǔn)確度和精確度,可實(shí)現(xiàn)精確定量的數(shù)字PCR 檢測(cè)方法和數(shù)字PCR 檢測(cè)試劑盒,用于弓形蟲(chóng)的快速精確檢測(cè)。

本發(fā)明的技術(shù)方案是這樣實(shí)現(xiàn)的:一種基于數(shù)字PCR絕對(duì)定量檢測(cè)弓形蟲(chóng)的試劑盒,由微滴數(shù)字PCR檢測(cè)試劑和若干個(gè)微滴發(fā)生卡組裝而成,其特征在于:微滴數(shù)字PCR檢測(cè)試劑包括以下試劑 :

溶液A:ddPCR預(yù)混液一支,0.9mL,其中包含500μL的2×ddPCR Supermix for Probes,上/下游引物分別為90μL(濃度為10μM),特異性探針為30μL(濃度為10μM),ddH2O 190μL ;

溶液B:微滴發(fā)生油一支,7mL;

溶液C:質(zhì)控液一支,3.5mL;

溶液D:陽(yáng)性對(duì)照模板一支,40μL;

溶液F:ddH2O一支,1mL;

使用基因組DNA為陽(yáng)性模板,使用0.01MpH8.0的Tris-EDTA緩沖液稀釋后冷凍保存;陽(yáng)性對(duì)照制劑按400μL定量分裝;使用ddH2O為陰性對(duì)照;

所述上、下游引物的序列分別如SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示 ;特異探針的序列如 SEQ ID NO:3 所示。

在此基礎(chǔ)上,本發(fā)明繼續(xù)提供一種弓形蟲(chóng)微滴數(shù)字PCR絕對(duì)定量檢測(cè)試劑盒,采用所述的試劑盒進(jìn)行微滴數(shù)字 PCR 定量檢測(cè);具體包括步驟 :

(1)制備ddPCR反應(yīng)液,總體積20μL,向擴(kuò)增管中加入下列反應(yīng)物:溶液A:18μL;模板:2μL;陰性對(duì)照:以ddH2O代替模板,同樣條件下擴(kuò)增;

(2)取微滴發(fā)生卡置于卡托中固定,用8道可調(diào)移液器將20μL反應(yīng)液加入到微滴發(fā)生卡中間一排的8個(gè)孔內(nèi),不足8個(gè)樣品時(shí)用20μL溶液C補(bǔ)足;

(3)在微滴發(fā)生卡最底下一排8個(gè)孔中各加入70μL溶液B,不能有空著的孔;蓋上膠墊密封;

(4)將帶有卡托的微滴發(fā)生卡輕且平穩(wěn)的放置于微滴生成儀中,開(kāi)始生成微滴;

(5)微滴生成于微滴發(fā)生卡最上面一排孔內(nèi),緩慢吸取40μL,再打入96孔板相應(yīng)位置孔內(nèi);

(6)在96孔PCR儀內(nèi)進(jìn)行PCR擴(kuò)增反應(yīng),升降溫速度為2.5℃/sec;

(7)將完成PCR的96孔板放入plate holder中組裝好,之后輕且平穩(wěn)的放入微滴讀取儀中;

(8)打開(kāi)QuantaSoft軟件進(jìn)行檢測(cè)和定量分析。

所述程序(2)中使用8道可調(diào)移液器加樣時(shí),槍頭接近孔一側(cè)底部,與側(cè)壁呈大約15°角,緩慢打出液體,打出一部分后慢慢提升槍頭再打出剩余液體,不要將槍按至超過(guò)第一檔位置以免引入氣泡。所述程序(5)中使用8道可調(diào)移液器加樣時(shí),槍頭接近微滴發(fā)生卡底部,緩慢吸出液體,轉(zhuǎn)移至96孔板時(shí),不貼壁,緩慢打入孔內(nèi),避免破壞生成的微滴。

上述檢測(cè)方法,優(yōu)選的,所述步驟 (6) 中的 PCR 反應(yīng)條件為 :

本發(fā)明的積極效果是具有更高的靈敏度、準(zhǔn)確度、精確性、重復(fù)性,可直接定量,無(wú)需標(biāo)準(zhǔn)曲線;對(duì)感染弓形蟲(chóng)樣品能有效檢測(cè),是一種快速、敏感、準(zhǔn)確的檢測(cè)用試劑盒和檢測(cè)方法,便于在早期內(nèi)確定感染情況,做好預(yù)防工作。

具體實(shí)施方式

下面結(jié)合實(shí)施例對(duì)本發(fā)明做進(jìn)一步的描述:需要說(shuō)明的是,在不沖突的情況下,本申請(qǐng)中的實(shí)施例及實(shí)施例中的特征可以相互任意組合;一種基于數(shù)字PCR絕對(duì)定量檢測(cè)弓形蟲(chóng)的試劑盒,其特征在于:包括1對(duì)特異性引物和1條與引物對(duì)配合使用的特異探針,其核苷酸序列分別為:

一種基于數(shù)字PCR絕對(duì)定量檢測(cè)弓形蟲(chóng)的試劑盒在制備弓形蟲(chóng)檢測(cè)試劑中的應(yīng)用。

一種基于數(shù)字PCR絕對(duì)定量檢測(cè)弓形蟲(chóng)的試劑盒,由微滴數(shù)字PCR檢測(cè)試劑和若干個(gè)微滴發(fā)生卡組裝而成,其特征在于:微滴數(shù)字PCR絕對(duì)定量檢測(cè)試劑盒,包含弓形蟲(chóng)檢測(cè)試劑;包括:溶液A:ddPCR預(yù)混液一支,0.9mL,其中包含500μL的2×ddPCR Supermix for Probes,上/下游引物分別為90μL(濃度為10μM),特異性探針為30μL(濃度為10μM),ddH2O 190μL ;

溶液B:微滴發(fā)生油一支,7mL;

溶液C:質(zhì)控液一支,3.5mL;

溶液D:陽(yáng)性對(duì)照模板一支,40μL;

溶液F:ddH2O一支,1mL;

使用基因組DNA為陽(yáng)性模板,使用0.01M pH8.0的Tris-EDTA緩沖液稀釋后冷凍保存;陽(yáng)性對(duì)照制劑按400μL定量分裝;使用ddH2O為陰性對(duì)照;

所述試劑盒的檢測(cè)方法程序?yàn)椋?/p>

1)制備ddPCR反應(yīng)液,總體積20μL,向擴(kuò)增管中加入下列反應(yīng)物:溶液A:18μL;模板:2μL;陰性對(duì)照:以ddH2O代替模板,同樣條件下擴(kuò)增;

2)取微滴發(fā)生卡置于卡托中固定,用8道可調(diào)移液器將20μL反應(yīng)液加入到微滴發(fā)生卡中間一排的8個(gè)孔內(nèi),不足8個(gè)樣品時(shí)用20μL溶液C補(bǔ)足;

3)在微滴發(fā)生卡最底下一排8個(gè)孔中各加入70μL溶液B,不能有空孔,蓋上膠墊密封;

4)將帶有卡托的微滴發(fā)生卡輕且平穩(wěn)的放置于微滴生成儀中,開(kāi)始生成微滴;

5)微滴生成于微滴發(fā)生卡最上面一排孔內(nèi),緩慢吸取40μL,再打入96孔板相應(yīng)位置孔內(nèi);

6)在96孔PCR儀內(nèi)進(jìn)行PCR擴(kuò)增反應(yīng),升降溫速度為2.5℃/sec;

7)將完成PCR的96孔板放入plate holder中組裝好,之后輕且平穩(wěn)的放入微滴讀取儀中;

8)打開(kāi)QuantaSoft軟件進(jìn)行檢測(cè)和定量分析。

所述檢測(cè)程序2)中使用8道可調(diào)移液器加樣時(shí),槍頭接近孔一側(cè)底部,與側(cè)壁呈大約15°角,緩慢打出液體,打出一部分后慢慢提升槍頭位置再打出余下液體,不要將槍按至超過(guò)第一檔位置以免引入氣泡。

所述檢測(cè)所述程序5)中微滴發(fā)生卡最底下一排8個(gè)孔中用8道可調(diào)移液器加樣時(shí),槍頭接近微滴發(fā)生卡底部,緩慢吸出液體,轉(zhuǎn)移至96孔板時(shí),不貼壁,緩慢打入孔內(nèi),避免破壞生成的微滴。

所述程序6)中的PCR反應(yīng)條件為:

(1) 預(yù)變性:溫度94℃,10min;

(2) 變性:溫度94℃,15s,退火:溫度60℃,1min,共40個(gè)循環(huán);

(3)結(jié)束反應(yīng):溫度98℃,10min。

實(shí)施例 1 引物及探針的設(shè)計(jì)與篩選

1、本發(fā)明引物、探針設(shè)計(jì) :根據(jù)Genbank已發(fā)表的弓形蟲(chóng)基因序列 (GenBank: AF179871.1 ) 為靶基因,進(jìn)行適用于ddPCR的特異性引物和的設(shè)計(jì)。

本實(shí)施例給出了篩選最佳引物的過(guò)程,選擇用軟件設(shè)計(jì)出的其中幾對(duì)備選引物進(jìn)行篩選,備選引物如下,見(jiàn)表 1。

2、引物的篩選

(1)引物隨機(jī)配為四對(duì):F1R1、F1R2、F2R1、F2R2;

(2)然后用染料法做熒光定量PCR,PCR體系配方:2×SYBR Green Supermix 10μL,上游引物,下游引物分別為1μL,ddH2O 3μL,陽(yáng)性模板5μL。PCR的擴(kuò)增程序?yàn)?4℃預(yù)變性10min;94℃變性15sec,58℃退火1min,共40個(gè)循環(huán);65℃—95℃每5秒升高0.5℃溶解曲線,結(jié)束反應(yīng)。

(3)結(jié)果分析,選擇沒(méi)有非特異性擴(kuò)增的引物對(duì)F1R1。

3、探針的篩選

(1)引物探針的組合為:1、F1R1+P1,2、F1R1+P2

(2)然后在ddPCR平臺(tái)上,ddPCR體系配方:2×ddPCR Supermix for probes 10μL,上游引物,下游引物分別為1μL,探針0 .5μL,ddH2O 3.5μL,陽(yáng)性模板4μL,總體積20μL(引物和探針的濃度均為10μM)。然后生成微滴。

(3)上PCR儀擴(kuò)增,PCR的擴(kuò)增程序?yàn)?4℃預(yù)變性10min;94℃變性30sec,58℃退火1min,共35個(gè)循環(huán);98℃10min結(jié)束反應(yīng)。上微滴數(shù)字PCR檢測(cè)儀檢測(cè)。

(4)分析結(jié)果:根據(jù)實(shí)驗(yàn)結(jié)果選擇F1R1+P1引物探針組合。

實(shí)施例2在ddPCR平臺(tái)上檢測(cè)弓形蟲(chóng)的PCR方法退火溫度的優(yōu)化。

1、選擇引物探針的組合為:F1R1+P1。

2、然后在ddPCR平臺(tái)上,ddPCR體系配方:2×ddPCR Supermix for probes 10μL,上游引物,下游引物分別為1μL,探針0 .5μL,ddH2O 3.5μL,陽(yáng)性模板4μL,總體積20μL(引物和探針的濃度均為10μM)。做8個(gè)復(fù)孔,然后生成微滴。

3、上PCR儀擴(kuò)增,PCR的擴(kuò)增程序?yàn)?4℃預(yù)變性10min;94℃變性15sec,55~62℃(儀器設(shè)置8個(gè)溫度梯度)退火1min,共40個(gè)循環(huán);98℃10min結(jié)束反應(yīng)。上微滴數(shù)字PCR檢測(cè)儀檢測(cè)。

4、分析結(jié)果:根據(jù)實(shí)驗(yàn)結(jié)果選擇57~60℃的退火溫度。

實(shí)施例3引物、探針濃度的優(yōu)化實(shí)驗(yàn)

1、設(shè)計(jì)引物探針濃度均為10μM ,組合為F1R1+P1,體系配置方法見(jiàn)表2。

2、在ddPCR平臺(tái)上生成微滴,轉(zhuǎn)移到96孔板內(nèi),封鋁膜。

3、上PCR儀擴(kuò)增,PCR的擴(kuò)增程序?yàn)?4℃預(yù)變性10min;94℃變性15sec,60℃退火1min,共40個(gè)循環(huán);98℃10min結(jié)束反應(yīng)。上微滴數(shù)字PCR檢測(cè)儀檢測(cè)。

4、分析結(jié)果:根據(jù)實(shí)驗(yàn)結(jié)果選擇F1R1+P1引物探針配方:引物分別為1.8μL,探針為0.6μL。

實(shí)施例4 PCR擴(kuò)增升降溫速度的優(yōu)化實(shí)驗(yàn)

1、然后在ddPCR平臺(tái)上,引物探針組合F1R1+P1 (濃度為10μM),用ddPCR體系配方:2×ddPCR Supermix for probes 10μL,上游、下游引物分別為1.8μL,探針為0.6μL,ddH2O 3.8μL,陽(yáng)性模板2μL,總體積20μL。每臺(tái)儀器做4個(gè)復(fù)孔,生成微滴,轉(zhuǎn)移到PCR管內(nèi)。

2、在兩臺(tái)同樣的PCR儀平臺(tái)上擴(kuò)增,PCR的擴(kuò)增程序?yàn)?4℃預(yù)變性10min;94℃變性15sec,60℃退火1min,共40個(gè)循環(huán);98℃10min結(jié)束反應(yīng),一臺(tái)設(shè)置升降溫速度設(shè)置為5℃/sec,另一臺(tái)上設(shè)置升降溫速度設(shè)置為2.5℃/sec,擴(kuò)增結(jié)束后,把PCR管內(nèi)的擴(kuò)增產(chǎn)物轉(zhuǎn)移到同一塊96孔板內(nèi),封鋁膜,上微滴數(shù)字PCR檢測(cè)儀檢測(cè)。

3、分析結(jié)果:根據(jù)實(shí)驗(yàn)結(jié)果分析發(fā)現(xiàn),升降溫速度慢的最后檢測(cè)的微滴數(shù)比升降溫速度快的多,擴(kuò)增效率高,升降溫速度慢的陰性微滴和陽(yáng)性微粒之間的距離分的很開(kāi),很容易區(qū)分,升降溫速度快的陰性微滴和陽(yáng)性微粒之間的距離分的不開(kāi),不容易區(qū)分,故選擇2.5℃/sec升降溫速度。

實(shí)施例5總DNA提取

1、取200mg研磨后的樣品于1 .5mL離心管中。

2、加入350μL的組織裂解液,10μL蛋白酶K混合均勻,56℃水浴1h-3h。

3、加入700μL飽和酚強(qiáng)烈振蕩,12000r/min離心10min,取上清。

4、重復(fù)步驟3,加入等體積苯酚:氯仿:異戊醇(25: 24: 1)混勻后12000r/min離心10min ,取上清液,加等體積酚:氯仿:異戊醇(25: 24: 1)再抽提一次。

4、用2倍體積的無(wú)水乙醇,0.1倍體積的 3 mol/L NaAC于-20℃沉淀30 min,12000 r/min離心10 min,棄上清。

5、沉淀用無(wú)水乙醇洗一次,自然干。

6、用50-200μL TE(pH值8.0)溶解DNA沉淀,-20℃保存。

實(shí)施例6檢測(cè)弓形蟲(chóng)的ddPCR方法的建立

1、微滴數(shù)字PCR絕對(duì)定量檢測(cè)試劑盒的組裝

將試劑盒分為微滴數(shù)字PCR檢測(cè)試劑,方便保存和運(yùn)輸。用合適的外包裝盒包裝以下試劑,貼標(biāo)簽(標(biāo)示名稱(chēng)、批號(hào)、生產(chǎn)日期、有效期等)。

溶液A(ddPCR預(yù)混液),一支,0.9mL;溶液B(微滴發(fā)生油),一支,7mL;溶液C(質(zhì)控液),一支,3.5mL;溶液D(陽(yáng)性對(duì)照模板),一支,35μL;溶液F(ddH2O),一支,1mL。

使用基因組DNA為陽(yáng)性模板,使用0.01MpH8.0的Tris-EDTA緩沖液稀釋后冷凍保存;陽(yáng)性對(duì)照制劑按400μL定量分裝;使用ddH2O為陰性對(duì)照。

上述溶液A其900μL的配方包含500μL的2×ddPCR Supermix for Probes,上/下游引物分別為90μL(濃度為10μM),特異性探針為30μL(濃度為10μM),ddH2O 190μL 。

使用時(shí),在18μL的ddPCR探針?lè)A(yù)混液中加入2μL的DNA模板,得到20μL的ddPCR反應(yīng)液,用于制備微滴。

2、ddPCR方法的建立

(1)制備ddPCR反應(yīng)液,總體積20μL。向擴(kuò)增管中加入下列反應(yīng)物:

空白對(duì)照:以ddH2O代替模板,同樣條件下擴(kuò)增。

(2)取微滴發(fā)生卡置于卡托中固定,將20μL反應(yīng)液加入到微滴發(fā)生卡中間一排的8個(gè)孔內(nèi),不足8個(gè)樣品時(shí)用20μL 1×溶液C補(bǔ)足,建議使用8道可調(diào)移液器加樣時(shí),槍頭接近孔一側(cè)底部,與側(cè)壁呈大約15°角,緩慢打出液體,打出一部分后慢慢提升槍頭再打出剩余液體,不要將槍按至超過(guò)第一檔位置以免引入氣泡。

(3)在微滴發(fā)生卡最底下一排8個(gè)孔中各加入70μL微滴生成油,同樣不能有空孔。

(4)蓋上膠墊,注意兩邊的小孔都要鉤牢。

(5)將以上卡托輕輕地平穩(wěn)放置于微滴生成儀中,開(kāi)始生成微滴,注意儀器上指示燈狀態(tài),一般2分鐘之內(nèi)完成。

(6)微滴生成于微滴發(fā)生卡最上面一排孔內(nèi),建議使用8道可調(diào)移液器小心緩慢吸取,調(diào)整吸取體積為40μL,將卡托放平,槍頭以與孔壁呈30~45°角放入,輕觸孔底,約5秒吸取40ul,再同樣緩慢地打入96孔板相應(yīng)位置孔內(nèi)(約5秒),槍頭貼近孔壁接近孔底,注意封上蓋以防油揮發(fā),每次棄去已使用過(guò)的微滴發(fā)生卡和膠墊。

(7)封好膜之后應(yīng)該在30min內(nèi)進(jìn)行PCR反應(yīng),或者放于4℃冰箱4h之內(nèi)進(jìn)行PCR,可在任意一臺(tái)96孔PCR儀上完成,升降溫速度為2.5℃/sec。反應(yīng)條件為:94℃預(yù)變性10min;94℃變性15sec,60℃退火1min,共40個(gè)循環(huán);98℃10min結(jié)束反應(yīng)。

(8)將之前完成PCR的96孔板放入plate holder中組裝好,注意板斜角方位,組裝好之后輕輕地平穩(wěn)放入微滴讀取儀中。

(9)打開(kāi)QuantaSoft軟件,建議每次實(shí)驗(yàn)之前做一次系統(tǒng)清洗,若一周以上未使用建議先做一次填充油路再做系統(tǒng)清洗。之后對(duì)96孔板中樣品信息進(jìn)行設(shè)置,主要是提供實(shí)驗(yàn)名稱(chēng)、實(shí)驗(yàn)類(lèi)型以及探針信息等,完成后即可運(yùn)行儀器,結(jié)束后結(jié)果會(huì)被自動(dòng)分析,人工核實(shí)后保存結(jié)果。

4、結(jié)果分析和判定

本發(fā)明試劑盒檢測(cè)結(jié)果的判定方法為:(1)陽(yáng)性對(duì)照:20±5個(gè)拷貝;(2)陰性對(duì)照:<1個(gè)拷貝;待測(cè)樣本結(jié)果判定:(1)陽(yáng)性:標(biāo)本檢測(cè)結(jié)果≥ 1個(gè)拷貝。(2)陰性:標(biāo)本檢測(cè)結(jié)果<1拷貝。

實(shí)施例7特異性檢驗(yàn)

用制備的試劑盒分別檢測(cè)犬新孢子蟲(chóng)、旋毛蟲(chóng)、球蟲(chóng)、賈第蟲(chóng)和隱孢子蟲(chóng)樣本各10份,結(jié)果全為陰性;檢測(cè)弓形蟲(chóng)樣本各10份,結(jié)果全為陽(yáng)性。

以上檢測(cè)結(jié)果證明了本發(fā)明的試劑盒特異性好、靈敏度高、可直接定量,檢測(cè)方便快捷、結(jié)果準(zhǔn)確可靠。

本發(fā)明根據(jù)弓形蟲(chóng)B1基因序列設(shè)計(jì)特異性引物,成功建立了弓形蟲(chóng)的數(shù)字PCR檢測(cè)方法,填補(bǔ)了弓形蟲(chóng)數(shù)字PCR檢測(cè)方法的空白。

以上所述僅為本發(fā)明的優(yōu)選實(shí)施例而已,并不用于限制本發(fā)明,對(duì)于本領(lǐng)域的技術(shù)人員來(lái)說(shuō),本發(fā)明可以有各種更改和變化。凡在本發(fā)明的精神和原則之內(nèi),所作的任何修改、等同替換、改進(jìn)等,均應(yīng)包含在本發(fā)明的保護(hù)范圍之內(nèi)。

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