本發(fā)明屬于篩選生物菌株用于改良鹽漬化土壤的技術(shù)領(lǐng)域,尤其涉及一種耐高鹽固氮菌株篩選的方法以及相關(guān)培養(yǎng)基。
背景技術(shù):
我國設(shè)施栽培的蔬菜主要密集于經(jīng)濟(jì)效益相對較高的果菜類作物。果菜類生產(chǎn)要求較高的水肥投入,隨著栽培年限的增加,會導(dǎo)致土壤次生鹽漬化、微生物區(qū)系失衡等問題。其中土壤鹽漬化鹽堿是制約農(nóng)作物產(chǎn)量、品質(zhì)和可持續(xù)發(fā)展的重要影響因素之一。鹽漬化土壤在全世界廣為分布,全世界鹽堿地面積約9.5億hm2,約占陸地總面積的7.6%。中國鹽堿地面積約占全國耕地面積的20%。近年來,土壤鹽漬化的問題日趨嚴(yán)峻。
利用生物學(xué)技術(shù),如應(yīng)用耐鹽生物菌株改善鹽漬化土壤的質(zhì)量是目前亟待解決的熱點問題。土壤微生物具有較強的恢復(fù)性,并且恢復(fù)鹽漬化土壤中的微生物多樣性是發(fā)揮和改良土壤功能的保證。因而獲得良好的且能夠適應(yīng)于、存活于鹽漬化土壤中的生物菌株則顯得十分必要。但是,目前的耐鹽菌株篩選方法的篩選效率低、篩選的菌株耐鹽度低、且種類有限,難以滿足鹽漬化土壤治理需求。
鑒于現(xiàn)有技術(shù)的上述技術(shù)缺陷,迫切需要研制一種篩選用于改良鹽漬化土壤的生物菌株的方法。
技術(shù)實現(xiàn)要素:
本發(fā)明的目的在于克服現(xiàn)有技術(shù)中存在的缺點,提供一種從冰菜(Mesembryanthemum crystallinum L.)中篩選耐高鹽固氮菌株的方法及其相關(guān)培養(yǎng)基,其能提高耐鹽菌株篩選的效率,不僅能夠獲得數(shù)量多且耐高鹽的固氮菌株,而且增加了耐鹽固氮菌株的種類,為鹽漬化的土壤治理提供了良好的固定氮元素的生物菌株資源。
為了實現(xiàn)上述目的,本發(fā)明提供如下技術(shù)方案:一種從冰菜中篩選耐高鹽固氮菌株的方法,其特征在于,包括以下步驟:
(1)、制備細(xì)菌斜面固體培養(yǎng)基
按以下配方配制固氮培養(yǎng)基,并將配制的固氮培養(yǎng)基的pH值調(diào)整為7.0~7.2,之后,在壓力為0.3Mpa、溫度為115.0℃下對配制的固氮培養(yǎng)基滅菌25分鐘,得到細(xì)菌斜面固體培養(yǎng)基,所述固氮培養(yǎng)基的成分為:葡萄糖10.0g、甘露醇3.0g、磷酸二氫鉀0.5g、磷酸氫二鉀0.6g、硫酸鈣0.2g、七水硫酸鎂0.01g、混合溶液10ml、氯化鈉10.0g、瓊脂15.0~20.0g和蒸餾水1000ml;
(2)、制備冰菜植物樣品
a)取新鮮的冰菜樣品,進(jìn)行表面消毒,具體步驟如下:采用75%乙醇處理3~5min,之后用無菌水清洗3~5次,再用0.5%次氯酸鈉處理5min,再使用無菌水清洗3~5次;
b)稱取5g表面消毒后的冰菜樣品,加入滅菌研缽中,并加入10ml無菌生理鹽水,研磨成勻漿溶液A;
c)吸取所述勻漿溶液A 1ml,加入9ml無菌生理鹽水,振蕩1分鐘,得到10-1的稀釋勻漿溶液B;
d)吸取所述稀釋勻漿溶液B 1ml,加入9ml無菌生理鹽水,得到10-2的稀釋勻漿溶液C;
e)吸取所述稀釋勻漿溶液C 1ml,加入9ml無菌生理鹽水,得到10-3的稀釋勻漿溶液D;
f)吸取所述稀釋勻漿溶液D 1ml,加入9ml無菌生理鹽水,得到10-4的稀釋勻漿溶液E;
g)吸取所述稀釋勻漿溶液E 1ml,加入9ml無菌生理鹽水,得到10-5的稀釋勻漿溶液F;
(3)、分別吸取所述稀釋勻漿溶液D、稀釋勻漿溶液E和稀釋勻漿溶液F各0.2ml,加入到所述細(xì)菌斜面固體培養(yǎng)基中進(jìn)行平板涂布培養(yǎng),并在25~28℃下培養(yǎng)4~5天;
(4)、從步驟(3)的培養(yǎng)結(jié)果中挑取菌落,選擇20~200菌落數(shù)的培養(yǎng)皿在所述細(xì)菌斜面固體培養(yǎng)基中進(jìn)行斜面培養(yǎng),并在25~28℃下培養(yǎng)4~5天;
(5)、對步驟(4)的培養(yǎng)結(jié)果進(jìn)行分離,得到耐高鹽固氮菌株。
進(jìn)一步地,其中,所述從冰菜中篩選耐高鹽固氮菌株的方法進(jìn)一步包括:
(6)、耐高鹽固氮菌株的穩(wěn)定生長
a)制備生長固氮培養(yǎng)基:按以下配方配制生長固氮培養(yǎng)基,并將配制的生長固氮培養(yǎng)基的pH值調(diào)整為7.0~7.2,之后,在壓力為0.3Mpa、溫度為115.0℃下對配制的生長固氮培養(yǎng)基滅菌25分鐘,所述生長固氮培養(yǎng)基成分為:酵母浸提物0.1g、甘露醇15.0g、磷酸二氫鉀0.2g、磷酸氫二鉀0.6g、硫酸鈣0.2g、七水硫酸鎂0.2g、氯化鈉、混合溶液10ml、瓊脂15.0~20.0g和蒸餾水1000ml,并且,依據(jù)所述氯化鈉的含量分別為10g、12g、15g、18g和21g而配制成多種不同的生長固氮培養(yǎng)基;
b)將所述步驟(5)得到的耐高鹽固氮菌株依次在含有10g、12g、15g、18g和21g氯化鈉的不同生長固氮培養(yǎng)基中進(jìn)行培養(yǎng),在每種生長固氮培養(yǎng)基中在25~28℃條件下培養(yǎng)4~5天,最終純化獲得的菌株即為耐高鹽固氮菌株。
更進(jìn)一步地,其中,所述固氮培養(yǎng)基和所述生長固氮培養(yǎng)基中的混合溶液的組分都為:鉬酸鈉0.025g、硫酸亞鐵0.001g、鉬酸鈉0.025g、三氯化鐵0.05g、生物素0.05g,硫酸錳0.02g、硫酸銅0.008g,用蒸餾水定容至100ml,并且,定容后要用0.22μm濾膜過濾除菌才得所述混合溶液。
此外,本發(fā)明還提供一種培養(yǎng)耐高鹽固氮菌株的細(xì)菌斜面固體培養(yǎng)基,其特征在于,按以下配方配制固氮培養(yǎng)基,并將配制的固氮培養(yǎng)基的pH值調(diào)整為7.0~7.2,之后,在壓力為0.3Mpa、溫度為115.0℃下對配制的固氮培養(yǎng)基滅菌25分鐘,得到細(xì)菌斜面固體培養(yǎng)基,所述固氮培養(yǎng)基的成分為:葡萄糖10.0g、甘露醇3.0g、磷酸二氫鉀0.5g、磷酸氫二鉀0.6g、硫酸鈣0.2g、七水硫酸鎂0.01g、混合溶液10ml、氯化鈉10.0g、瓊脂15.0~20.0g和蒸餾水1000ml;其中,所述混合溶液的組分為:鉬酸鈉0.025g、硫酸亞鐵0.001g、鉬酸鈉0.025g、三氯化鐵0.05g、生物素0.05g,硫酸錳0.02g、硫酸銅0.008g,用蒸餾水定容至100ml,并且,定容后要用0.22μm濾膜過濾除菌才得所述混合溶液。
再次,本發(fā)明還提供一種耐高鹽固氮菌株穩(wěn)定生長用生長固氮培養(yǎng)基,其特征在于,按以下配方配制生長固氮培養(yǎng)基,并將配制的生長固氮培養(yǎng)基的pH值調(diào)整為7.0~7.2,之后,在壓力為0.3Mpa、溫度為115.0℃下對配制的生長固氮培養(yǎng)基滅菌25分鐘,所述生長固氮培養(yǎng)基成分為:酵母浸提物0.1g、甘露醇15.0g、磷酸二氫鉀0.2g、磷酸氫二鉀0.6g、硫酸鈣0.2g、七水硫酸鎂0.2g、氯化鈉10~21g、混合溶液10ml、瓊脂15.0~20.0g和蒸餾水1000ml,其中,所述混合溶液的組分為:鉬酸鈉0.025g、硫酸亞鐵0.001g、鉬酸鈉0.025g、三氯化鐵0.05g、生物素0.05g,硫酸錳0.02g、硫酸銅0.008g,用蒸餾水定容至100ml,并且,定容后要用0.22μm濾膜過濾除菌才得所述混合溶液。
與現(xiàn)有技術(shù)相比,本發(fā)明具有如下有益技術(shù)效果:
一、針對我國設(shè)施蔬菜栽培土壤次生鹽漬化問題,篩選出了適合于鹽漬化土壤施用的菌株。
二、通過本發(fā)明的培養(yǎng)基能夠提高耐鹽菌株的獲得率,且通過本發(fā)明可顯著提高菌株的耐鹽能力,具體地:通過本發(fā)明,可分離獲得的菌株最高耐鹽濃度達(dá)到18~21%,篩選的菌株數(shù)量占可培養(yǎng)菌落的30~35%,經(jīng)鑒別顯示細(xì)菌的種類保持在5~6類。
三、本發(fā)明為鹽漬化土壤質(zhì)量的治理提供了良好的生物菌株資源。
具體實施方式
下面結(jié)合實施例對本發(fā)明進(jìn)一步說明,實施例的內(nèi)容不作為對本發(fā)明的保護(hù)范圍的限制。
本發(fā)明涉及從冰菜中篩選耐高鹽固氮菌株的方法,其包括以下步驟:
首先,制備細(xì)菌斜面固體培養(yǎng)基。具體方法如下:
按以下配方配制固氮培養(yǎng)基,并將配制的固氮培養(yǎng)基的pH值調(diào)整為7.0~7.2,之后,在壓力為0.3Mpa、溫度為115.0℃下對配制的固氮培養(yǎng)基滅菌25分鐘,得到細(xì)菌斜面固體培養(yǎng)基。其中,所述固氮培養(yǎng)基的成分為:葡萄糖10.0g、甘露醇3.0g、磷酸二氫鉀0.5g、磷酸氫二鉀0.6g、硫酸鈣0.2g、七水硫酸鎂0.01g、混合溶液10ml、氯化鈉10.0g、瓊脂15.0~20.0g和蒸餾水1000ml。
優(yōu)選地,所述混合溶液的組分為:鉬酸鈉0.025g、硫酸亞鐵0.001g、鉬酸鈉0.025g、三氯化鐵0.05g、生物素0.05g,硫酸錳0.02g、硫酸銅0.008g,用蒸餾水定容至100ml,并且,定容后要用0.22μm濾膜過濾除菌才得所述混合溶液。
其次、制備冰菜植物樣品。具體方法如下:
a)取新鮮的冰菜樣品,進(jìn)行表面消毒。具體步驟如下:采用75%乙醇處理3~5min,之后用無菌水清洗3~5次,再用0.5%次氯酸鈉處理5min,再使用無菌水清洗3~5次。
其中,所述冰菜樣品可以為從安徽合肥、阜南等不同地區(qū)采集的冰菜樣品。為了更好地證明本發(fā)明的效果,優(yōu)選地,可以從上述不同地區(qū)采集10種不同的冰菜樣品,分別采用本發(fā)明的方法進(jìn)行試驗。
b)稱取5g表面消毒后的冰菜樣品,加入滅菌研缽中,并加入10ml無菌生理鹽水,研磨成勻漿溶液A。
c)吸取所述勻漿溶液A 1ml,加入9ml無菌生理鹽水,振蕩1分鐘,得到10-1的稀釋勻漿溶液B。
d)吸取所述稀釋勻漿溶液B 1ml,加入9ml無菌生理鹽水,得到10-2的稀釋勻漿溶液C。
e)吸取所述稀釋勻漿溶液C 1ml,加入9ml無菌生理鹽水,得到10-3的稀釋勻漿溶液D。
f)吸取所述稀釋勻漿溶液D 1ml,加入9ml無菌生理鹽水,得到10-4的稀釋勻漿溶液E。
g)吸取所述稀釋勻漿溶液E 1ml,加入9ml無菌生理鹽水,得到10-5的稀釋勻漿溶液F。
再次、進(jìn)行菌株平板涂布培養(yǎng)。具體方法如下:
分別吸取所述稀釋勻漿溶液D、稀釋勻漿溶液E和稀釋勻漿溶液F各0.2ml,加入到所述細(xì)菌斜面固體培養(yǎng)基中進(jìn)行平板涂布培養(yǎng),并在25~28℃下培養(yǎng)4~5天。
然后、進(jìn)行菌株斜面培養(yǎng)。具體方法如下:
從上述的培養(yǎng)結(jié)果中挑取菌落,選擇20~200菌落數(shù)的培養(yǎng)皿在所述細(xì)菌斜面固體培養(yǎng)基中進(jìn)行斜面培養(yǎng),并在25~28℃下培養(yǎng)4~5天。
之后,進(jìn)行菌株分離。具體地,對上述的培養(yǎng)結(jié)果進(jìn)行分離,得到耐高鹽固氮菌株。
此外,為了提高菌株的質(zhì)量,所述從冰菜中篩選耐高鹽固氮菌株的方法可以進(jìn)行包括耐高鹽固氮菌株的穩(wěn)定生長。其具體方法如下:
a)制備生長固氮培養(yǎng)基。具體方法如下:
按以下配方配制生長固氮培養(yǎng)基,并將配制的生長固氮培養(yǎng)基的pH值調(diào)整為7.0~7.2,之后,在壓力為0.3Mpa、溫度為115.0℃下對配制的生長固氮培養(yǎng)基滅菌25分鐘。所述生長固氮培養(yǎng)基成分為:酵母浸提物0.1g、甘露醇15.0g、磷酸二氫鉀0.2g、磷酸氫二鉀0.6g、硫酸鈣0.2g、七水硫酸鎂0.2g、氯化鈉、混合溶液10ml、瓊脂15.0~20.0g和蒸餾水1000ml。并且,依據(jù)所述氯化鈉的含量分別為10g、12g、15g、18g和21g而配制成多種不同的生長固氮培養(yǎng)基。
優(yōu)選地,所述混合溶液的組分為:鉬酸鈉0.025g、硫酸亞鐵0.001g、鉬酸鈉0.025g、三氯化鐵0.05g、生物素0.05g,硫酸錳0.02g、硫酸銅0.008g,用蒸餾水定容至100ml,并且,定容后要用0.22μm濾膜過濾除菌才得所述混合溶液。
b)將上面得到的耐高鹽固氮菌株依次在含有10g、12g、15g、18g和21g氯化鈉的不同生長固氮培養(yǎng)基中進(jìn)行培養(yǎng),在每種生長固氮培養(yǎng)基中在25~28℃條件下培養(yǎng)4~5天,最終純化獲得的菌株即為耐高鹽固氮菌株。
為了鑒定所培養(yǎng)的耐高鹽固氮菌株的性質(zhì),需要對耐高鹽固氮菌株進(jìn)行鑒定。在本發(fā)明中,進(jìn)行如下兩種鑒定:
(1)、生理生化鑒定:將培養(yǎng)的菌株依次進(jìn)行革蘭氏染色等指標(biāo)檢測,其包括以下步驟(具體方法參見伯杰氏鑒定手冊細(xì)菌部分Holt,J.G.,Kreig,N.R.,Sneath,P.H.A.,Staley,J.T.,Williams,S.T.,1994,Bergey's manual of systematic bacteriology.Vol.1,9th Edn(Baltimore,MD:Williams&Wilkins),1935-2045):
在無菌操作臺內(nèi),挑取生長的菌落,涂片固定。草酸銨結(jié)晶紫染溶液染色1分鐘,洗瓶水洗;加碘液覆蓋涂面染約1分鐘,水洗,用吸水紙吸去水分;加95%酒精數(shù)滴,并輕輕搖動進(jìn)行脫色,30秒后水洗,吸去水分;蕃紅染色液染1分鐘后,洗瓶水洗。自然干燥,顯微鏡下鏡檢,記錄結(jié)果。結(jié)果顯示,篩選獲得的耐鹽菌株均為革蘭氏陽性菌。
(2)、耐高鹽菌株的固氮基因的PCR擴增,其包括以下步驟(具體方法參見Mirza,B.,Welsh,A.,Rasul,G.,Rieder,J.,Paschke,M.,Hahn,D.,2009,Variation in Frankia Populations of the Elaeagnus Host Infection Group in Nodules of Six Host Plant Species after Inoculation with Soil.Microb Ecol 58,384-393和Tan,J.W.,Thong,K.L.,Arumugam,N.D.,Cheah,W.L.,Lai,Y.W.,Chua,K.H.,Rahim,R.A.,Vikineswary,S.,2009,Development of a PCR assay for the detection of nifH and nifD genes in indigenous photosynthetic bacteria.Int.J.Hydrogen Energy 34,7538-7541。
a、液體培養(yǎng)基制備
按以下配方配制液體培養(yǎng)基,并將配制的液體培養(yǎng)基的pH值調(diào)整為7.0~7.2,之后,在壓力為0.3Mpa、溫度為115.0℃下對配制的生長培養(yǎng)基滅菌25分鐘。所述液體培養(yǎng)基成分為:酵母浸提物0.1g、甘露醇15.0g、磷酸二氫鉀0.2g、磷酸氫二鉀0.6g、硫酸鈣0.2g、七水硫酸鎂0.2g、氯化鈉10~21g、混合溶液10ml和蒸餾水1000ml。
優(yōu)選地,所述混合溶液的組分為:鉬酸鈉0.025g、硫酸亞鐵0.001g、鉬酸鈉0.025g、三氯化鐵0.05g、生物素0.05g,硫酸錳0.02g、硫酸銅0.008g,用蒸餾水定容至100ml。
將制備好的液體培養(yǎng)基按照30ml體積,分裝于250ml的三角瓶中,滅菌備用。
b、菌株培養(yǎng)
將活化的耐鹽菌在操凈臺中,接入液體培養(yǎng)基中進(jìn)行搖瓶培養(yǎng),培養(yǎng)條件為:25~28℃、200轉(zhuǎn)/分、培養(yǎng)2~3天,備用。
c、細(xì)菌DNA提取
采用SDS-蛋白酶K法,提取DNA,具體步驟如下:3500r/min離心10min,收集菌體,加入100μl溶菌酶懸浮細(xì)胞,室溫30min;加入10%SDS 150μl,蛋白酶K 10μl,37℃水浴30min,加入300ul 5mol/L醋酸鈉混勻,冰浴5min;10000r/min離心10min,取上清,加入雙倍體積預(yù)冷無水乙醇,離心,干燥沉淀,溶于100μl TE緩沖液,備用或-20℃保存。
d、固氮基因擴增
取上述細(xì)菌DNA,作為PCR模板。具體方法參見:((Mirza,B.,Welsh,A.,Rasul,G.,Rieder,J.,Paschke,M.,Hahn,D.,2009,Variation in Frankia Populations of the Elaeagnus Host Infection Group in Nodules of Six Host Plant Species after Inoculation with Soil.Microb Ecol 58,384-393和Tan,J.W.,Thong,K.L.,Arumugam,N.D.,Cheah,W.L.,Lai,Y.W.,Chua,K.H.,Rahim,R.A.,Vikineswary,S.,2009,Development of a PCR assay for the detection of nifH and nifD genes in indigenous photosynthetic bacteria.Int.J.Hydrogen Energy 34,7538-7541)等報道的方法。PCR產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖電泳,檢測PCR產(chǎn)物。結(jié)果顯示,篩選獲得菌株具有固氮酶基因,說明篩選的菌株具有固氮能力。
本發(fā)明針對我國設(shè)施蔬菜栽培土壤次生鹽漬化問題,篩選適合于鹽漬化土壤施用的菌株。通過使用本發(fā)明的方法,可分離獲得的菌株最高耐鹽濃度達(dá)到18~21%,篩選的菌株數(shù)量占可培養(yǎng)固氮菌落的30~35%,經(jīng)鑒別顯示細(xì)菌的種類保持在5~6類。本發(fā)明的方法提高了目前對于耐鹽菌株篩選的效率,不僅能夠獲得數(shù)量多且耐高鹽的固氮菌株,而且增加了耐鹽固氮菌株的種類,為鹽漬化的土壤治理提供了良好的固定氮元素的生物菌株資源。
本發(fā)明的上述實施例僅僅是為清楚地說明本發(fā)明所作的舉例,而并非是對本發(fā)明的實施方式的限定。對于所屬領(lǐng)域的普通技術(shù)人員來說,在上述說明的基礎(chǔ)上還可以做出其它不同形式的變化或變動。這里無法對所有的實施方式予以窮舉。凡是屬于本發(fā)明的技術(shù)方案所引伸出的顯而易見的變化或變動仍處于本發(fā)明的保護(hù)范圍之列。