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新型澳洲堅(jiān)果過(guò)敏原的制作方法

文檔序號(hào):11625777閱讀:540來(lái)源:國(guó)知局
新型澳洲堅(jiān)果過(guò)敏原的制造方法與工藝

本發(fā)明涉及一種多肽,其包括選自包含下列蛋白質(zhì)的組的澳洲堅(jiān)果蛋白:在ph6.3至8.7于2dsdspage中電泳的53至67kda的蛋白質(zhì)和在ph6.5至7.9于2dsdspage中電泳的20至25kda的蛋白質(zhì)或其抗原變體,優(yōu)選在ph6.3至8.7電泳的53至67kda的蛋白質(zhì)或其抗原變體。

對(duì)樹(shù)堅(jiān)果的過(guò)敏反應(yīng)可以是嚴(yán)重的和危及生命的。這適用于常見(jiàn)的品種,例如榛子,花生,核桃,也適用于澳洲堅(jiān)果,其為澳大利亞常青樹(shù)(四葉澳洲堅(jiān)果(macadamiatetraphylla)和澳洲堅(jiān)果(m.integrifolia))的果實(shí)。

澳洲堅(jiān)果(就植物學(xué)而言,其是種子)不像許多其它樹(shù)堅(jiān)果一樣是常見(jiàn)的食物,但其越來(lái)越頻繁地被生吃或烘焙食用,并且常常被添加至各種食物例如小吃棒、谷物和混合堅(jiān)果。碎澳洲堅(jiān)果膳食正在成為烘焙食品中日益流行的成分,冷壓澳洲堅(jiān)果油亦如此。絕非少數(shù)情況的是,澳洲堅(jiān)果常常可用作堅(jiān)果混合物的一部分,并因此在先前不進(jìn)口其的國(guó)家中銷(xiāo)售。

在敏化個(gè)體中因暴露于澳洲堅(jiān)果而引起的過(guò)敏反應(yīng)可包括嚴(yán)重的癥狀(pallares,d.e.(2000):allergytomacadamianut.annallergyasthmaimmunol2000;85(5):385-6)。因此,患有過(guò)敏的受試者知曉過(guò)敏原的來(lái)源是至關(guān)重要的,因?yàn)樗麄冃枰苊饨佑|含有任何過(guò)敏原或已接觸過(guò)任何過(guò)敏原的食品、化妝品和其它產(chǎn)品。

過(guò)敏可以使用常規(guī)皮膚點(diǎn)刺試驗(yàn)來(lái)診斷,所述試驗(yàn)涉及將懷疑患有過(guò)敏的受試者的皮膚暴露于潛在致敏性果實(shí)的提取物,并用合適的對(duì)照進(jìn)行補(bǔ)充。然而,假陰性結(jié)果經(jīng)常發(fā)生,因?yàn)槟承┻^(guò)敏原可能以不足夠低的濃度存在于這些提取物中(sicherer,s.h.,teuber,s.s.(2004):currentapproachtothediagnosisandmanagementofadversereactionstofoods.journalofallergyandclinicalimmunology2004;114.5,1146–50)。另外,特定的過(guò)敏原可以在提取物中進(jìn)行蛋白水解(rancé,f.,juchet,a.,brémont,f.,dutau,g.(1997):correlationbetweenskinpricktestsusingcommercialextractsandfreshfoods,specificigeandfoodchallenges.allergy1997;52.10,1031–5)。此外,基于全提取物的測(cè)定由于交叉反應(yīng)性而不夠特異。

因此,期望基于針對(duì)特異性過(guò)敏原的抗體例如ige或igg的檢測(cè)來(lái)設(shè)計(jì)測(cè)定。這樣的測(cè)定涉及將包含抗體的患者樣品暴露于固定化的過(guò)敏原,隨后進(jìn)行檢測(cè),任選地定量結(jié)合至固定化的過(guò)敏原的ige抗體(volcheck,g.w.(2009):clinicalallergy,diagnosisandmanagement)。

主要過(guò)敏原已在一系列堅(jiān)果中被鑒定。例如,花生過(guò)敏的絕大多數(shù)病例與對(duì)儲(chǔ)存蛋白arah2、arah7和arah6的敏感性相關(guān)。因此,已經(jīng)設(shè)計(jì)了基于針對(duì)這些過(guò)敏原的ige抗體的檢測(cè)的合理可靠的測(cè)定(codreanu,f.,collignon,o.,roitel,o.,thouvenot,b.,sauvage,c.,vilain,a.c.,cousin,m.o.,decoster,a.,renaudin,j.m.,astier,c.,monnez,j.m.,vallois,p.,morisset,m.,moneret-vautrin,d.a.,brulliard,m.,ogier,v.,castelain,m.c.,kanny,g.,bihain,b.e.,jacquenet,s.(2011):anovelimmunoassayusingrecombinantallergenssimplifiespeanutallergydiagnosis.intarchallergyimmunol2011;154(3):216-26;ep15075033.9)。

相比之下,關(guān)于澳洲堅(jiān)果過(guò)敏原的身份的信息非常少。迄今為止,描述用于診斷澳洲堅(jiān)果過(guò)敏的免疫測(cè)定的現(xiàn)有技術(shù)文獻(xiàn)的作者必須依賴(lài)于全堅(jiān)果提取物或部分純化的提取物。例如,ghorbani等人進(jìn)行了基于檢測(cè)食品中殘留的澳洲堅(jiān)果蛋白質(zhì)的免疫測(cè)定(ghorbani,m.,morgan,m.r.a.(2010):proteincharacterisationandimmunochemicalmeasurementsofresidualmacadamianutproteinsinfoodstuffs.foodagrimmunol2010;21:347-360)。

herbst等人使用來(lái)自引起患者顯示過(guò)敏癥狀的單一批次的澳洲堅(jiān)果的全堅(jiān)果提取物(herbst,r.a.,wahl,r.,frosch,p.j.(2010):specificigereactivityandidentificationofpotentialallergensinmacadamiaallergy.jeuracaddermatolvenereol2010;24(11):1361-3)。

sathe等人報(bào)道了從包括澳洲堅(jiān)果的各種樹(shù)堅(jiān)果制備的全提取物的溶解并將其用于western印跡中(sathe,s.k.,venkatachalam,m.,sharma,g.m.,kshirsagar,h.h.,teuber,s.s.,roux,k.h.(2009):solubilizationandelectrophoreticcharacterizationofselectediblenutseedproteins.jagricfoodchem2009;57(17):7846-56)。

在缺乏特異性過(guò)敏原的情況下,提供足夠可靠的診斷是不可行的。全堅(jiān)果提取物或部分純化的提取物與類(lèi)似于皮膚點(diǎn)刺試驗(yàn)的缺點(diǎn)的限制(例如不穩(wěn)定性和不足的特異性,更具體地說(shuō)是假陰性結(jié)果)有關(guān)。

因此,本發(fā)明涉及的問(wèn)題是提供一種用于診斷過(guò)敏,優(yōu)選堅(jiān)果過(guò)敏,更優(yōu)選澳洲堅(jiān)果過(guò)敏的方法,以及用于這樣的方法的試劑,相較于現(xiàn)有技術(shù)測(cè)定,所述方法具有改善的診斷可靠性(特別是靈敏度)。

本發(fā)明涉及的另一個(gè)問(wèn)題是提供用于鑒別診斷過(guò)敏,優(yōu)選堅(jiān)果過(guò)敏例如樹(shù)堅(jiān)果過(guò)敏的測(cè)定,更優(yōu)選用于區(qū)分對(duì)澳洲堅(jiān)果的過(guò)敏與對(duì)非澳洲堅(jiān)果的堅(jiān)果的過(guò)敏的測(cè)定,和/或用于監(jiān)測(cè)患有這種過(guò)敏的個(gè)體的治療。

本發(fā)明涉及的另一個(gè)問(wèn)題是提供可用于這樣的測(cè)定的試劑,用于制備這樣的試劑的方法和用于這樣的診斷的方法。本發(fā)明涉及的另一個(gè)問(wèn)題是提供用于治療患有對(duì)澳洲堅(jiān)果的過(guò)敏的患者的治療方法和藥物組合物。

本發(fā)明涉及的問(wèn)題通過(guò)所附的獨(dú)立和從屬權(quán)利要求的主題來(lái)解決。

在第一方面,本發(fā)明涉及的問(wèn)題通過(guò)一種多肽來(lái)解決,所述多肽包括選自包含下列蛋白質(zhì)的組的澳洲堅(jiān)果蛋白:在ph6.3至8.7于2dsdspage中電泳的53至67kda的蛋白質(zhì)和在ph6.5至7.9于2dsdspage中電泳的20至25kda的蛋白質(zhì)或其變體,優(yōu)選在ph6.3至8.7電泳的53至67kda的蛋白質(zhì)或其變體。所述多肽是來(lái)自四葉澳洲堅(jiān)果(macadamiatetraphylla)和澳洲堅(jiān)果(m.integrifolia)優(yōu)選澳洲堅(jiān)果的多肽。

在優(yōu)選的實(shí)施方案中,多肽是分離的和/或重組的多肽。

在另一個(gè)優(yōu)選的實(shí)施方案中,多肽是融合多肽,其優(yōu)選包含用于檢測(cè)或純化的標(biāo)簽。

在第二方面,該問(wèn)題通過(guò)一種核酸來(lái)解決,所述核酸編碼根據(jù)本發(fā)明的多肽,其優(yōu)選在載體中,更優(yōu)選在細(xì)胞中的載體中。

在另一個(gè)優(yōu)選的實(shí)施方案中,多肽是固定化的。

在第三方面,該問(wèn)題通過(guò)一種醫(yī)療器械來(lái)解決,所述醫(yī)療器械包含根據(jù)本發(fā)明的多肽,其中所述醫(yī)療器械優(yōu)選是診斷上有用的載體,更優(yōu)選選自包含珠子、測(cè)試條、微量滴定板、印跡的組,優(yōu)選選自包含蛋白質(zhì)印跡、線(xiàn)印跡和斑點(diǎn)印跡、玻璃表面、載玻片、生物芯片、膜、微陣列、電泳凝膠和微量滴定板的組。

在第四方面,該問(wèn)題通過(guò)包括以下步驟的方法來(lái)解決:在樣品,優(yōu)選來(lái)自哺乳動(dòng)物,更優(yōu)選來(lái)自人的樣品中檢測(cè)與根據(jù)本發(fā)明的多肽結(jié)合的抗體,所述方法優(yōu)選用于診斷堅(jiān)果過(guò)敏,更優(yōu)選用于診斷澳洲堅(jiān)果過(guò)敏。

在第五方面,該問(wèn)題通過(guò)包括下列步驟的治療疾病的方法來(lái)解決:向受試者施用或使來(lái)自受試者的樣品接觸根據(jù)本發(fā)明的多肽,

其中所述疾病優(yōu)選是堅(jiān)果過(guò)敏,更優(yōu)選是樹(shù)堅(jiān)果過(guò)敏,最優(yōu)選是澳洲堅(jiān)果過(guò)敏。

在第六方面,該問(wèn)題通過(guò)一種抗體來(lái)解決,所述抗體結(jié)合選自包含下列蛋白質(zhì)的組的澳洲堅(jiān)果蛋白:在ph6.3至8.7于2dsdspage中電泳的53至67kda的蛋白質(zhì)和在ph6.5至7.9于2dsdspage中電泳的20至25kda的蛋白質(zhì)或其變體,

優(yōu)選在ph6.3至8.7電泳的53至67kda的蛋白質(zhì),

其中任選地所述抗體處于與所述澳洲堅(jiān)果蛋白或其變體的復(fù)合物中。在優(yōu)選的實(shí)施方案中,結(jié)合澳洲堅(jiān)果蛋白的抗體是分離的抗體。

在第七方面,該問(wèn)題通過(guò)用于診斷疾病的測(cè)試試劑盒來(lái)解決,所述試劑盒包含根據(jù)本發(fā)明的多肽和任選地用于檢測(cè)包含所述多肽和根據(jù)本發(fā)明的抗體的復(fù)合物的工具。

在第八方面,該問(wèn)題通過(guò)用于分離抗體的方法來(lái)解決,所述抗體結(jié)合選自包含下列蛋白質(zhì)的組的澳洲堅(jiān)果蛋白:在ph6.3至8.7于2dsdspage中電泳的53至67kda的蛋白質(zhì)和在ph6.5至7.9于2dsdspage中電泳的20至25kda的蛋白質(zhì)或其抗原性片段,所述方法包括下列步驟:

a)在適于形成復(fù)合物的條件下,使包含所述抗體的樣品與澳洲堅(jiān)果蛋白或其變體接觸,

b)分離在步驟a)中形成的復(fù)合物,

c)解離在步驟b)中分離的復(fù)合物,和

d)使澳洲堅(jiān)果蛋白與所述抗體分離。

在第九方面,該問(wèn)題通過(guò)一種藥物組合物或疫苗來(lái)解決,所述藥物組合物或疫苗包含根據(jù)本發(fā)明的多肽,任選地另外包含藥學(xué)上可接受的載物。

在優(yōu)選的實(shí)施方案中,所述樣品是包含抗體的體液,所述體液優(yōu)選選自包含全血、血清、腦脊液和唾液的組,更優(yōu)選為全血。

在優(yōu)選的實(shí)施方案中,所述抗體是ige或igg,例如igg4,優(yōu)選ige抗體。

在第十面,該問(wèn)題通過(guò)根據(jù)本發(fā)明的多肽用于診斷過(guò)敏,優(yōu)選堅(jiān)果過(guò)敏,更優(yōu)選樹(shù)堅(jiān)果過(guò)敏,最優(yōu)選澳洲堅(jiān)果過(guò)敏的用途來(lái)解決。

本發(fā)明基于本發(fā)明人的令人驚訝的發(fā)現(xiàn):在澳洲堅(jiān)果中存在一系列特異性過(guò)敏原,其顯示針對(duì)來(lái)自患有堅(jiān)果過(guò)敏的患者的血清的反應(yīng)性,并且可用于診斷和治療堅(jiān)果過(guò)敏,特別是澳洲堅(jiān)果過(guò)敏。此外,這些過(guò)敏原可用于區(qū)分堅(jiān)果過(guò)敏,特別是區(qū)分對(duì)澳洲堅(jiān)果的過(guò)敏與對(duì)非澳洲堅(jiān)果的堅(jiān)果的過(guò)敏。就發(fā)明人所知,這些抗原在本領(lǐng)域的現(xiàn)有技術(shù)中還沒(méi)有被描述。

在優(yōu)選的實(shí)施方案中,本文所用的術(shù)語(yǔ)“樹(shù)堅(jiān)果”是選自包含以下的組的堅(jiān)果:澳洲堅(jiān)果,榛子,花生,核桃,杏仁,美洲山核桃,腰果,巴西堅(jiān)果,栗子,松子,開(kāi)心果,mongongoyeheb堅(jiān)果,石栗和智利榛子。

本發(fā)明涉及診斷上有用的載體,優(yōu)選為固相載體,用于使特異性捕獲抗體的工具(所述工具與所述載體締合)與來(lái)自受試者,優(yōu)選哺乳動(dòng)物受試者,更優(yōu)選人受試者的體液樣品接觸。載體可以直接與樣品接觸,并且允許用于特異性捕獲抗體的工具暴露于樣品中的任何抗體。在優(yōu)選的實(shí)施方案中,固相載體是診斷裝置,更優(yōu)選選自包含珠子、測(cè)試條、微量滴定板、印跡的組,優(yōu)選選自包含蛋白質(zhì)印跡、線(xiàn)印跡和斑點(diǎn)印跡、玻璃表面、載玻片、生物芯片、膜、微陣列、電泳凝膠和微量滴定板的組。

在最優(yōu)選的實(shí)施方案中,診斷上有用的載體是線(xiàn)印跡(raoult,d.,anddasch,g.a.(1989),thelineblot:animmunoassayformonoclonalandotherantibodies.itsapplicationtotheserotypingofgram-negativebacteria.j.immunol.methods,125(1-2),57-65;wo2013041540)。在優(yōu)選的實(shí)施方案中,本文所用的術(shù)語(yǔ)“線(xiàn)印跡”是指已用一種或多種用于捕獲抗體的工具(優(yōu)選各自為多肽)包被的測(cè)試條,更優(yōu)選是基于膜的。如果使用兩種或更多種工具,則它們優(yōu)選在載體上是在空間上分離的。優(yōu)選地,帶的寬度為測(cè)試條的寬度的至少30%,更優(yōu)選地40%,50%,60%,70%或80%。測(cè)試條可以包含一個(gè)或多個(gè)對(duì)照帶,用于確認(rèn)其已在適當(dāng)?shù)臈l件下,特別是在存在人血清、抗體綴合物或兩者的情況下,與樣品接觸足夠長(zhǎng)的時(shí)間。許多線(xiàn)印跡可商購(gòu)獲得,例如獲自euroimmunag,lübeck,germany。

必要的是,用于實(shí)施本發(fā)明的樣品包含抗體,也稱(chēng)為免疫球蛋白。通常,樣品是包含受試者的全部免疫球蛋白的代表性集合的體液。然而,在提供樣品后,樣品可以經(jīng)歷進(jìn)一步的處理,這可包括分級(jí)分離、離心、富集或分離受試者的全部免疫球蛋白或任何免疫球蛋白類(lèi)別,優(yōu)選ige和/或igg4,這可影響各種類(lèi)型的免疫球蛋白的相對(duì)分布。樣品可以選自全血、血清、腦脊液和唾液,優(yōu)選血清。在最優(yōu)選的實(shí)施方案中,樣品包含ige類(lèi)抗體。

必要的是,診斷上有用的載體包含用于特異性捕獲針對(duì)在ph6.3至8.7于2dsdspage中電泳的53至67kda的澳洲堅(jiān)果蛋白或在ph6.5至7.9于2dsdspage中電泳的20至25kda的澳洲堅(jiān)果蛋白(優(yōu)選在ph6.3至8.7電泳的53至67kda的澳洲堅(jiān)果蛋白)的抗體的工具,所述澳洲堅(jiān)果蛋白已被本發(fā)明人鑒定為澳洲堅(jiān)果豌豆球蛋白樣蛋白(macadamiavicilin-likeprotein)(多肽的數(shù)據(jù)庫(kù)登錄碼:q9spl3;編碼所述蛋白質(zhì)的核酸的數(shù)據(jù)庫(kù)登錄碼:af161885)。本申請(qǐng)通篇中提及的任何數(shù)據(jù)庫(kù)代碼是指在本申請(qǐng)的優(yōu)先權(quán)日時(shí)可通過(guò)ncbi數(shù)據(jù)庫(kù)在線(xiàn)獲得的多肽序列。

優(yōu)選地,用于特異性捕獲這樣的抗體的這樣的工具是一種多肽,其包括選自包含下列蛋白質(zhì)的組的澳洲堅(jiān)果蛋白:在ph6.3至8.7于2dsdspage中電泳的53至67kda的蛋白質(zhì)或在ph6.5至7.9于2dsdspage中電泳的20至25kda的蛋白質(zhì)或其變體,優(yōu)選在ph6.3至8.7電泳的53至67kda的蛋白質(zhì)或其變體。

根據(jù)本發(fā)明,載體包括用于特異性捕獲抗體的一種或多種工具,優(yōu)選一種或多種,更優(yōu)選兩種或更多種,更優(yōu)選三種或更多種,更優(yōu)選四種或更多種這樣的工具,它們中的每一種能夠特異性捕獲不同的抗體。除了用于捕獲澳洲堅(jiān)果蛋白(優(yōu)選澳洲堅(jiān)果豌豆球蛋白樣蛋白(q9spl3))的工具以外,所述載體還可包括用于捕獲針對(duì)一種或多于一種來(lái)自包含下列蛋白質(zhì)的組的蛋白質(zhì)的抗體的工具:seqidno3(來(lái)自榛子的cora11),seqidno4(來(lái)自芝麻(sesam)的sesi3),seqidno5(來(lái)自花生的arah1),seqidno6(來(lái)自開(kāi)心果的pisv3),seqidno7(來(lái)自腰果的anao1),seqidno8(來(lái)自美洲山核桃的cari2),seqidno9(來(lái)自核桃的jugr2);例如用于捕獲針對(duì)seqidno3的抗體的工具和用于捕獲針對(duì)seqidno4的抗體的工具。所述工具優(yōu)選固定在所述載體上。在優(yōu)選的實(shí)施方案中,用于特異性捕獲抗體的工具是與待捕獲的抗體結(jié)合的多肽或其變體,例如根據(jù)本發(fā)明的多肽或seqidno3(來(lái)自榛子的cora11),seqidno4(來(lái)自芝麻的sesi3),seqidno5(來(lái)自花生的arah1),seqidno6(來(lái)自開(kāi)心果的pisv3),seqidno7(來(lái)自腰果的anao1),seqidno8(來(lái)自美洲山核桃的cari2),seqidno9(來(lái)自核桃的jugr2),例如用于捕獲針對(duì)seqidno3的抗體的工具和用于捕獲針對(duì)seqidno4的抗體的工具。所述工具與其附著至的不溶性載體一起可以以直接方式例如通過(guò)過(guò)濾、離心或傾析從反應(yīng)混合物中分離。所述工具可以以可逆或不可逆的方式固定。例如,如果分子經(jīng)由可以通過(guò)加入高濃度的鹽掩蔽的離子相互作用與載體相互作用,或者如果分子通過(guò)可切割的共價(jià)鍵結(jié)合,則固定是可逆的。相比之下,如果分子通過(guò)不能在水溶液中裂解的共價(jià)鍵連接到載體上,則固定是不可逆的。所述工具(優(yōu)選多肽)可以是間接固定的,例如通過(guò)固定對(duì)多肽具有親和力的抗體或其它實(shí)體,然后加入多肽并形成多肽-抗體復(fù)合物。

然而,本發(fā)明的教導(dǎo)不僅可以使用具有本申請(qǐng)中明確或隱含提及(例如通過(guò)功能、名稱(chēng)、序列或登錄號(hào))的精確序列的多肽或野生型序列來(lái)執(zhí)行,還可以使用這樣的多肽的變體來(lái)執(zhí)行。

在優(yōu)選的實(shí)施方案中,如本文所用的術(shù)語(yǔ)“變體”可以指所提及的全長(zhǎng)序列的至少一個(gè)片段,更具體地,相對(duì)于全長(zhǎng)序列而言在一個(gè)或兩個(gè)末端上截短一個(gè)或多個(gè)氨基酸的氨基酸或核酸序列。這樣的片段包含或編碼具有原始序列的至少10、15、25、50、75、100、150、200、300、400或500個(gè)連續(xù)氨基酸的肽或其變體。變體的總長(zhǎng)度可以是25、30、40、50、60、70、80、90、100個(gè)或更多個(gè)氨基酸。優(yōu)選的片段是seqidno:1或其變體。

變體可以與所提及的參考氨基酸序列或其片段具有至少40、50、60、70、75、80、85、90、92、94、95、96、97、98或99%的同一性,其中除了對(duì)生物活性必需的那些氨基酸之外的氨基酸被缺失或取代和/或一個(gè)或多個(gè)這樣的必需氨基酸以保守方式被替換和/或氨基酸被添加或缺失以使得多肽的生物活性至少被部分保留?,F(xiàn)有技術(shù)包括可用于比對(duì)兩個(gè)給定的核酸或氨基酸序列和計(jì)算同一性程度的各種方法,參見(jiàn)例如arthurlesk(2008),introductiontobioinformatics,oxforduniversitypress,2008,第三版。在優(yōu)選的實(shí)施方案中,使用clustalw軟件(larkin,m.a.,blackshields,g.,brown,n.p.,chenna,r.,mcgettigan,p.a.,mcwilliam,h.,valentin,f.,wallace,i.m.,wilm,a.,lopez,r.,thompson,j.d.,gibson,t.j.,higgins,d.g.(2007):clustalwandclustalxversion2.0.bioinformatics,23,2947-2948),應(yīng)用默認(rèn)設(shè)置。

在優(yōu)選的實(shí)施方案中,變體可以另外包含化學(xué)修飾,例如同位素標(biāo)記或共價(jià)修飾,例如糖基化,磷酸化,乙?;擊然?,瓜氨酸化,羥基化等。本領(lǐng)域技術(shù)人員熟悉用于修飾多肽的方法。此外,還可以通過(guò)與其它已知多肽或其變體融合來(lái)產(chǎn)生變體。

必要的是,多肽的變體具有生物活性。在優(yōu)選的實(shí)施方案中,這樣的生物活性是結(jié)合來(lái)自患者,優(yōu)選患有過(guò)敏,更優(yōu)選對(duì)堅(jiān)果的過(guò)敏,最優(yōu)選對(duì)澳洲堅(jiān)果的過(guò)敏的患者的過(guò)敏特異性ige抗體的能力。在另一個(gè)優(yōu)選的實(shí)施方案中,這樣的生物活性是在對(duì)堅(jiān)果,優(yōu)選樹(shù)堅(jiān)果,更優(yōu)選澳洲堅(jiān)果過(guò)敏的受試者中引發(fā)過(guò)敏反應(yīng)的能力。

本領(lǐng)域技術(shù)人員能夠通過(guò)從原始澳洲堅(jiān)果蛋白質(zhì)開(kāi)始,引入修飾點(diǎn)突變、截短等來(lái)設(shè)計(jì)變體,隨后通過(guò)測(cè)試所述變體是否結(jié)合獲自對(duì)澳洲堅(jiān)果過(guò)敏的受試者的樣品中的抗體來(lái)確認(rèn)該變體仍然具有生物活性。

變體可以使用遺傳工程方法或化學(xué)合成法制備。

可以通過(guò)蛋白質(zhì)印跡,使用來(lái)自對(duì)澳洲堅(jiān)果過(guò)敏的患者的血清(優(yōu)選如實(shí)施例中所述的)作為抗體來(lái)源來(lái)確定結(jié)合活性。

根據(jù)本發(fā)明的多肽或其變體可以是融合蛋白,即任選通過(guò)接頭與其它序列融合(優(yōu)選在n末端或c末端上)的多肽。該其它序列可以是用于檢測(cè)的標(biāo)簽,例如flag標(biāo)簽,或用于純化的標(biāo)簽,例如選自包含gst、his或mbp標(biāo)簽的組。根據(jù)本發(fā)明的示例性融合多肽顯示于seqidno:2中。

根據(jù)本發(fā)明的多肽可以以任何形式和以任何純化程度提供,從以?xún)?nèi)源形式包含所述多肽的組織、果實(shí)或細(xì)胞、更優(yōu)選過(guò)表達(dá)所述多肽的細(xì)胞、這樣的細(xì)胞的粗制或富集的裂解物到純化和/或分離的多肽(其基本上是純的)。在優(yōu)選的實(shí)施方案中,多肽是天然多肽,其中本文所用的術(shù)語(yǔ)“天然多肽”是指折疊的多肽,更優(yōu)選從組織或細(xì)胞,更優(yōu)選從哺乳動(dòng)物細(xì)胞或組織,任選地從非重組組織或細(xì)胞純化的折疊多肽。如果使用天然多肽,與其天然狀態(tài)相比,優(yōu)選是富集的。

根據(jù)本發(fā)明,多肽可以是重組蛋白,其中本文使用的術(shù)語(yǔ)“重組”是指在生產(chǎn)過(guò)程的任何階段使用遺傳工程方法產(chǎn)生的多肽,例如通過(guò)融合編碼多肽的核酸至用于在細(xì)胞或組織中過(guò)表達(dá)的強(qiáng)啟動(dòng)子或通過(guò)工程改造多肽本身的序列和/或使用用于通過(guò)遺傳工程修飾的細(xì)胞的表達(dá)。本領(lǐng)域技術(shù)人員熟悉用于工程改造核酸和編碼的多肽的方法(例如,在sambrook,j.,fritsch,e.f.andmaniatis,t.(1989),molecularcloning,csh或brownt.a.(1986),genecloning–anintroduction,chapman&hall中描述的)以及用于產(chǎn)生和純化天然或重組多肽的方法(例如由gehealthcarelifesciences出版的handbooks“strategiesforproteinpurification”,“antibodypurification”,以及在burgess,r.r.,deutscher,m.p.(2009):guidetoproteinpurification中描述的)。

在優(yōu)選的實(shí)施方案中,術(shù)語(yǔ)“分離的”意指多肽相對(duì)于在整個(gè)堅(jiān)果或從整個(gè)堅(jiān)果獲得的全堅(jiān)果提取物中的全部澳洲堅(jiān)果蛋白,優(yōu)選澳洲堅(jiān)果過(guò)敏原,已被富集。在另一個(gè)更優(yōu)選的實(shí)施方案中,多肽是分離的多肽,其中術(shù)語(yǔ)“分離的”意指該多肽相較于其在使用生物技術(shù)或合成方法產(chǎn)生后的狀態(tài)已被富集并且優(yōu)選是純的,即所使用的多肽的至少10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、95%或99%由所述多肽組成,如通過(guò)sds聚丙烯酰胺凝膠電泳隨后考馬斯藍(lán)染色和目視檢查所判斷的。

根據(jù)本發(fā)明的受試者是產(chǎn)生抗體,優(yōu)選ige類(lèi)別或等同的過(guò)敏相關(guān)抗體,更優(yōu)選來(lái)自哺乳動(dòng)物,最優(yōu)選人的抗體的動(dòng)物,包括人。

根據(jù)本發(fā)明的方法考慮了在樣品中檢測(cè)與根據(jù)本發(fā)明的多肽結(jié)合的抗體,所述方法優(yōu)選用于診斷堅(jiān)果過(guò)敏,更優(yōu)選用于診斷澳洲堅(jiān)果過(guò)敏。本領(lǐng)域技術(shù)人員熟悉可用于檢測(cè)樣品中的抗體的各種方法,例如選自包括免疫擴(kuò)散技術(shù)、通過(guò)ige抗體的嗜堿性粒細(xì)胞活化、免疫電泳技術(shù)、光散射免疫測(cè)定、凝集技術(shù)、標(biāo)記的免疫測(cè)定例如放射性標(biāo)記的免疫測(cè)定、酶免疫測(cè)定例如比色測(cè)定、化學(xué)發(fā)光免疫測(cè)定和免疫熒光技術(shù)的組。

在許多情況下,檢測(cè)樣品中的抗體的不存在或存在(任選地意指確定抗體的濃度是否超過(guò)某些閾值,常常通過(guò)檢測(cè)限度顯示)足以用于診斷。如果可以檢測(cè)抗體,則這將是對(duì)臨床醫(yī)生的診斷有用的信息,并且表明患者患有過(guò)敏的可能性增加。在優(yōu)選的實(shí)施方案中,可以測(cè)定血清中的抗體相對(duì)于可能在平均健康受試者中發(fā)現(xiàn)的水平的相對(duì)濃度。在優(yōu)選的實(shí)施方案中,如本文所使用的術(shù)語(yǔ)“檢測(cè)存在或不存在”意指足以核查是否可以使用合適的復(fù)合物檢測(cè)方法檢測(cè)足夠超過(guò)任何背景水平的信號(hào),所述復(fù)合物檢測(cè)方法指示目標(biāo)抗體存在或存在比在健康受試者中所存在的更多的目標(biāo)抗體。在更優(yōu)選的實(shí)施方案中,這可以包括確定濃度是否超過(guò)對(duì)照中的濃度或超過(guò)閾值,優(yōu)選至少0.1,優(yōu)選0.2、0.5、1、2、5、10、20、25、50、100,200、500、1000、10000或100000倍高于在平均健康受試者中發(fā)現(xiàn)的目標(biāo)抗體的濃度。

簡(jiǎn)言之,檢測(cè)抗體可以包括步驟a)在適于形成復(fù)合物的條件下,使包含抗體的樣品與根據(jù)本發(fā)明的多肽或其變體接觸。這可以通過(guò)使液體樣品與固定化形式(例如被固定在膜上,例如在蛋白質(zhì)印跡或線(xiàn)印跡中所使用的)的多肽接觸來(lái)實(shí)現(xiàn)。當(dāng)樣品和多肽接觸時(shí),樣品中存在的能夠特異性結(jié)合多肽的任何抗體將進(jìn)行這樣的結(jié)合達(dá)到使包含多肽和抗體的復(fù)合物存在的效果。

隨后,進(jìn)行步驟b),其包括分離在步驟a)中形成的所述復(fù)合物,例如通過(guò)除去樣品和任選地使用洗滌緩沖液洗滌被固定的多肽來(lái)進(jìn)行分離。

最后的步驟c)包括檢測(cè)復(fù)合物,例如通過(guò)添加可結(jié)合來(lái)自樣品的抗體的第二抗體來(lái)檢測(cè)。第二抗體可以包含標(biāo)記,例如酶或放射性同位素。或者,可以使用方法諸如化學(xué)交聯(lián)隨后sdspage或使用質(zhì)譜法來(lái)直接檢測(cè)復(fù)合物。

針對(duì)根據(jù)本發(fā)明的多肽的抗體的檢測(cè)表明,供給樣品的受試者對(duì)澳洲堅(jiān)果過(guò)敏。在受試者表現(xiàn)出過(guò)敏反應(yīng),但這樣的樣品不含有針對(duì)本發(fā)明受試者的抗體的情況下,受試者可能患有過(guò)敏,例如堅(jiān)果過(guò)敏,但對(duì)澳洲堅(jiān)果不過(guò)敏。

在本發(fā)明的范圍內(nèi)的是診斷上有用的載體,其包含用于特異性捕獲針對(duì)本發(fā)明多肽的抗體的工具。在優(yōu)選的實(shí)施方案中,如本文所用的術(shù)語(yǔ)“特異性捕獲抗體”是指特異性結(jié)合目標(biāo)抗體達(dá)到從樣品中結(jié)合和去除其而其它抗體基本上不結(jié)合并保留在樣品中的效果的能力。

根據(jù)本發(fā)明,提供了用于特異性檢測(cè)捕獲的抗體的工具,任選地作為試劑盒的一部分。在優(yōu)選的實(shí)施方案中,如本文所使用的術(shù)語(yǔ)“特異性檢測(cè)捕獲的抗體”意指在捕獲后檢測(cè)到特異性結(jié)合至特異性捕獲抗體(其結(jié)合根據(jù)本發(fā)明的多肽)的工具的抗體,而不是樣品中存在的任何其它抗體。在優(yōu)選的實(shí)施方案中,如本文所用的術(shù)語(yǔ)“特異性結(jié)合”意指該結(jié)合比其特征在于下述解離常數(shù)的結(jié)合反應(yīng)更強(qiáng):1×10-5m,更優(yōu)選1×10-7m,更優(yōu)選1×10-8m,更優(yōu)選1×10-9m,更優(yōu)選1×10-10m,更優(yōu)選1×10-11m,更優(yōu)選1×10-12m,如通過(guò)表面等振子體共振使用biacore設(shè)備在25℃下在ph7的pbs緩沖液中測(cè)定的。

本發(fā)明的教導(dǎo)內(nèi)容提供了試劑盒,其優(yōu)選用于診斷過(guò)敏,更優(yōu)選用于診斷澳洲堅(jiān)果過(guò)敏。這樣的試劑盒是包含實(shí)施本發(fā)明方法所需的特定試劑(特別是根據(jù)本發(fā)明的診斷上有用的載體,任選地除了實(shí)施本發(fā)明方法所需的一種或多種溶液之外,該溶液優(yōu)選選自或全部選自包括樣品稀釋緩沖液、洗滌緩沖液和包含用于檢測(cè)任何特異性捕獲的抗體例如第二抗體的工具和任選地用于檢測(cè)后者的工具的緩沖液的組)的容器。此外,其可以包括詳述如何使用試劑盒和本發(fā)明的用于使本發(fā)明的多肽與來(lái)自受試者優(yōu)選人受試者的體液樣品接觸的診斷上有用的載體(例如線(xiàn)印跡,其中將用于特異性捕獲抗體至根據(jù)本發(fā)明的多肽的工具固定在線(xiàn)印跡上)的說(shuō)明書(shū)。此外,試劑盒可以包含陽(yáng)性對(duì)照,例如已知結(jié)合根據(jù)本發(fā)明的多肽的重組抗體,和陰性對(duì)照,例如對(duì)根據(jù)本發(fā)明的多肽沒(méi)有可檢測(cè)的親和力的蛋白質(zhì)。最后,這樣的試劑盒可以包含含有用于制備校準(zhǔn)曲線(xiàn)的抗體的標(biāo)準(zhǔn)溶液。

根據(jù)本發(fā)明,需要用于檢測(cè)一種或多種捕獲的抗體的工具。本領(lǐng)域技術(shù)人員知道可以使用的許多方法,所述方法也被描述在現(xiàn)有技術(shù)中,例如在zane,h.d.(2001),immunology–theoretical&practicalconceptsinlaboratorymedicine,w.b.saunderscompany中,特別是在第14章中描述的。在優(yōu)選的實(shí)施方案中,使用結(jié)合一種或多種捕獲的抗體(其是相應(yīng)的第一抗體)的恒定區(qū)的第二抗體,所述第二抗體可以與直接檢測(cè)例如熒光、放射性或酶活性標(biāo)記(后者可以催化化學(xué)發(fā)光反應(yīng)或可使用比色法或光譜或其它分析方法檢測(cè)的分子的產(chǎn)生)的標(biāo)記相關(guān)聯(lián)。

或者,生物功能測(cè)定可用作檢測(cè)一種或多種捕獲的抗體的工具,條件是抗體是ige類(lèi)抗體,優(yōu)選基于通過(guò)ige抗體的嗜堿性粒細(xì)胞活化的測(cè)定。這樣的測(cè)定法已經(jīng)在現(xiàn)有技術(shù)中描述,例如hausmann,o.v.,gentinetta,t.,bridts,c.h.,andebo,e.g.(2009):thebasophilactivationtestinimmediate-typedrugallergy,immunol.allergyclin.n.am.29,555-566。

在優(yōu)選的實(shí)施方案中,如本文所使用的術(shù)語(yǔ)“診斷”是指旨在獲得在評(píng)估患者是否患有或可能或比平均或比較受試者(后者優(yōu)選地具有相似的癥狀)更可能在診斷時(shí)或在未來(lái)患有某種疾病或病癥的過(guò)程中有用的信息以發(fā)現(xiàn)疾病如何進(jìn)展或在未來(lái)可能進(jìn)展或評(píng)估患者對(duì)于某種治療(例如施用合適的藥物,例如用于使過(guò)敏患者脫敏的藥物)的反應(yīng)性的任何種類(lèi)的程序。換句話(huà)說(shuō),術(shù)語(yǔ)“診斷”不僅包括診斷,而且包括預(yù)測(cè)和/或監(jiān)測(cè)疾病或病癥的過(guò)程或治療的成功。優(yōu)選檢測(cè)igg(更優(yōu)選igg4)類(lèi)別的自身抗體用于監(jiān)測(cè)疾病的進(jìn)展和/或治療的成功。

因此,術(shù)語(yǔ)“診斷”優(yōu)選地不意味著根據(jù)本發(fā)明的診斷方法或試劑將是結(jié)論性的并且足以基于單一測(cè)試(更不用說(shuō)參數(shù))來(lái)完成診斷,而是可以指對(duì)被稱(chēng)為“鑒別診斷”(即基于一系列診斷參數(shù)考慮一系列可能條件的可能性的系統(tǒng)診斷程序)的貢獻(xiàn)。術(shù)語(yǔ)“診斷”還可以指用于為患者選擇最有希望的治療方案的方法或試劑。換句話(huà)說(shuō),所述方法或藥劑可涉及選擇用于受試者的治療方案。

本發(fā)明提供了包含根據(jù)本發(fā)明的多肽的藥物組合物,優(yōu)選疫苗,所述組合物優(yōu)選適于施用至受試者,優(yōu)選哺乳動(dòng)物受試者,更優(yōu)選施用至人。這樣的藥物組合物可以包含藥學(xué)上可接受的載體。藥物組合物可以例如經(jīng)口、腸胃外、通過(guò)吸入噴霧、局部地、通過(guò)滴眼劑、經(jīng)直腸、經(jīng)鼻、經(jīng)口腔、經(jīng)陰道或經(jīng)由植入的儲(chǔ)庫(kù)施用,其中本文所用的術(shù)語(yǔ)“腸胃外”包括皮下、皮內(nèi)、靜脈內(nèi)、肌內(nèi)、關(guān)節(jié)內(nèi)、滑膜內(nèi)、胸骨內(nèi)、鞘內(nèi)、病灶內(nèi)和顱內(nèi)注射或輸注技術(shù)。藥物組合物可以以合適的劑型提供,例如膠囊、片劑和水性懸浮液和溶液,優(yōu)選為無(wú)菌形式。其可用于治療疾病優(yōu)選過(guò)敏的方法,所述方法包括向受試者施用有效量的本發(fā)明的多肽。可以使用根據(jù)本發(fā)明的多肽的低過(guò)敏原性變體。本領(lǐng)域技術(shù)人員熟悉用于產(chǎn)生已知過(guò)敏原的低過(guò)敏原性變體的方法。

本發(fā)明提供了用于通過(guò)向受試者施用本發(fā)明的藥物組合物治療、預(yù)防或改善過(guò)敏,優(yōu)選堅(jiān)果過(guò)敏,更優(yōu)選澳洲堅(jiān)果過(guò)敏的方法。

通過(guò)以下附圖和非限制性序列和實(shí)施例進(jìn)一步說(shuō)明本發(fā)明,從中可以獲得本發(fā)明的其它特征、實(shí)施方案、方面和優(yōu)點(diǎn)。

附圖描述

圖1顯示了澳洲堅(jiān)果提取物的2d凝膠電泳分離的結(jié)果。在ph3-10非線(xiàn)性ipg條上在第一維中分離,隨后在還原條件下通過(guò)sdspage分離蛋白質(zhì),通過(guò)考馬斯染色進(jìn)行染色并從凝膠中切出。數(shù)字標(biāo)記隨后進(jìn)行maldi-tof分析的點(diǎn)。箭頭標(biāo)記代表后續(xù)被鑒定為澳洲堅(jiān)果豌豆球蛋白樣蛋白的蛋白質(zhì)的條帶。

圖2顯示了澳洲堅(jiān)果提取物的蛋白質(zhì)印跡分析和通過(guò)2d凝膠電泳分離的蛋白質(zhì)的蛋白質(zhì)印跡的結(jié)果。分子量標(biāo)記與圖1所示相同。

圖3顯示了使用涂覆有來(lái)自澳洲堅(jiān)果的豌豆球蛋白樣蛋白的euroline品系測(cè)定法對(duì)來(lái)自澳洲堅(jiān)果致敏患者(n=20)和健康獻(xiàn)血者(n=17)的人血清的分析?;趀ast參考系統(tǒng)進(jìn)行來(lái)自人血清的結(jié)合抗體的評(píng)價(jià)。

圖4a至4g顯示了比較數(shù)據(jù),其指示如使用線(xiàn)印跡測(cè)定的來(lái)自所述患者的血清中以east類(lèi)別形式表達(dá)的ige濃度。這些圖顯示了針對(duì)來(lái)自非澳洲堅(jiān)果的樹(shù)堅(jiān)果的一種樹(shù)堅(jiān)果或核7s豌豆球蛋白樣蛋白的ige與針對(duì)來(lái)自澳洲堅(jiān)果的maci豌豆球蛋白的ige之間的相關(guān)性(如果有的話(huà))。

本申請(qǐng)包括多個(gè)氨基酸序列,更具體地,包括:

seqidno1(優(yōu)選澳洲堅(jiān)果豌豆球蛋白樣蛋白(q9spl3)的片段)

seqidno2(包含澳洲堅(jiān)果豌豆球蛋白樣蛋白的融合蛋白)

seqidno3(來(lái)自榛子的cora11),

seqidno4(來(lái)自芝麻的sesi3),

seqidno5(來(lái)自花生的arah1),

seqidno6(來(lái)自開(kāi)心果的pisv3)

seqidno7(來(lái)自腰果的anao1)

seqidno8(來(lái)自美洲山核桃的cari2)

seqidno9(來(lái)自核桃的jugr2)

seqidno10(來(lái)自澳洲堅(jiān)果的maci豌豆球蛋白)

通過(guò)以下非限制性實(shí)施例進(jìn)一步說(shuō)明本發(fā)明,從中可以獲得本發(fā)明的其它特征、實(shí)施方案、方面和優(yōu)點(diǎn)。

實(shí)施例:

實(shí)施例1:

澳洲堅(jiān)果提取物的制備

將烘焙和鹽腌的市售澳洲堅(jiān)果仁研磨,然后用丙酮脫脂3次。將脫脂的堅(jiān)果碎片在折疊的過(guò)濾器上干燥。將干燥的材料重懸于緩沖液例如磷酸緩沖鹽水(pbs,50mm磷酸鈉,150mmnacl,ph7.4)中,在孵育振蕩器中在4℃孵育3小時(shí),隨后過(guò)濾并在臺(tái)式離心機(jī)中在4℃以4000rpm離心30分鐘。

使用100%硫酸銨沉淀上清液,并將所得沉淀針對(duì)pbs透析。如生產(chǎn)商的說(shuō)明書(shū)中所述,通過(guò)bio-rad蛋白測(cè)定(bio-radlaboratories,inc.,hercules,usa)進(jìn)行蛋白濃度的估計(jì)。

制備凝膠電泳

將粗制的澳洲堅(jiān)果提取物用冷的丙酮沉淀,并且在-20℃孵育2小時(shí)且在4℃以20000xg離心30分鐘后,將沉淀物重懸在樣品緩沖液中用于等電聚焦(2.5%磺基甜菜堿3-10,4m尿素,2m硫脲,0.5%(v/v)載體兩性電解質(zhì)(carrierampholyte)ph3-10、40mmdtt和0.003%溴酚藍(lán))。在室溫下用樣品再次水化ipg條(readystripipg條7cmph3至10(bio-rad),固定的ph梯度)過(guò)夜。

隨后,使用proteani12ief系統(tǒng)(bio-rad)聚焦蛋白質(zhì),并且通過(guò)用于在凝膠上產(chǎn)生純蛋白點(diǎn)的聚丙烯酰胺凝膠電泳(4至12%bis-tris蛋白質(zhì)凝膠,1.0mmx2d孔,thermofisherscientific),基于其表觀(guān)分子量在第二維進(jìn)行分離。對(duì)于2d凝膠中的點(diǎn)的尺寸估計(jì),如制造商的說(shuō)明書(shū)中所述使用spectramulticolorbroadrange(thermofisherscientific)進(jìn)行估計(jì)。

通過(guò)blue-銀染色(candiano等人,electrophoresis.2004may;25(9):1327-33.bluesilver:averysensitivecolloidalcoomassieg-250stainingforproteomeanalysis)對(duì)所得2d凝膠的蛋白質(zhì)進(jìn)行染色。染色的凝膠如圖1所示。

蛋白質(zhì)印跡

如制造商的說(shuō)明書(shū)中所述,將堅(jiān)果提取物的2d凝膠通過(guò)te22miniblotter(hoeferinc.,holliston,ma,usa)轉(zhuǎn)移至硝酸纖維素膜。通過(guò)用ponceaus染色檢測(cè)轉(zhuǎn)移的蛋白質(zhì)。將所得蛋白質(zhì)印跡在洗滌緩沖液(euroimmunag,lübeck,germany)中孵育15分鐘,隨后用在洗滌緩沖液中1:10稀釋的來(lái)自澳洲堅(jiān)果致敏的患者的血清孵育1小時(shí)。

在用洗滌緩沖液(產(chǎn)品號(hào)zd1100,由euroimmunag提供用于euroline線(xiàn)印跡,lübeck,germany)洗滌3次,每次5分鐘后,將膜與抗ige-ap綴合物(euroimmunag,lübeck,germany)孵育并再次用洗滌緩沖液洗滌3次,每次5分鐘。如制造商的說(shuō)明書(shū)中推薦的,通過(guò)與bcip/nbt底物(euroimmunag,lübeck,germany)孵育來(lái)檢測(cè)結(jié)合的抗體。

獲得的印跡示于圖2中。主要的目標(biāo)蛋白質(zhì)包括在ph6.3至8.7于2dsdspage中電泳的53至67kda的蛋白質(zhì)和在ph6.5至7.9于2dsdspage中電泳的20至25kda的蛋白質(zhì)。

maldi

切下用blue銀染色染色的2d凝膠的選定點(diǎn)并用胰蛋白酶消化。如制造商的說(shuō)明書(shū)中所述,使用maldi-tof/tofautoflexiii(brukercorporation,billerica,ma,usa)進(jìn)行肽質(zhì)量指紋分析(pmf)和msms。就方便的序列篩選針對(duì)綠色植物的ncbi數(shù)據(jù)庫(kù),導(dǎo)致作為在ph6.3至8.7電泳的53至67kda的蛋白質(zhì)的澳洲堅(jiān)果豌豆球蛋白樣蛋白(數(shù)據(jù)庫(kù)登錄碼:q9spl3)的鑒定。

澳洲堅(jiān)果豌豆球蛋白樣蛋白的克隆、重組表達(dá)和純化

通過(guò)基因合成(eurofinsgenomicsgmbh)生成澳洲堅(jiān)果豌豆球蛋白樣蛋白的編碼區(qū),更具體地等同于如seqidno:2所示的通過(guò)接頭與his標(biāo)簽融合的af161885中的核苷酸序列的編碼dna,通過(guò)聚合酶鏈反應(yīng)擴(kuò)增并使用thiofusiontm表達(dá)試劑盒(invitrogen)亞克隆到重組載體中。如制造商所述,在大腸桿菌中表達(dá)融合蛋白,并通過(guò)在鎳基質(zhì)(imac)上的親和層析分離。

線(xiàn)印跡(euroline)的制備

通過(guò)使用精密分配器(可從zetacorporation商購(gòu)獲得)將融合蛋白涂覆在硝酸纖維素膜(可從schleicher&schüll商購(gòu)獲得)上來(lái)產(chǎn)生euroline線(xiàn)印跡。根據(jù)制造商的說(shuō)明書(shū)的推薦封閉和洗滌后,將膜切成3mm的條。

使用euroline線(xiàn)測(cè)定法評(píng)價(jià)樣品

根據(jù)制造商(euroimmunag,lübeck,germany)說(shuō)明書(shū)的推薦孵育euroline條。具體來(lái)說(shuō),在室溫下,用1ml在洗滌緩沖液中1/11(v/v)稀釋的患者樣品(20個(gè)澳洲堅(jiān)果致敏的患者和17個(gè)健康血液供體)孵育所述條16小時(shí)。棄去患者樣品后,將所述條洗滌3次,每次用每條1ml洗滌緩沖液洗滌5分鐘,隨后用1ml與ap綴合的抗人ige抗體孵育1小時(shí)。然后,將所述條再次用洗滌緩沖液洗滌5次,然后用bcip/nbt底物孵育10分鐘。

通過(guò)掃描儀和程序(euroimmunag,lübeck,germany)對(duì)結(jié)果進(jìn)行評(píng)價(jià)??梢酝ㄟ^(guò)使用who標(biāo)準(zhǔn)(75/502)的ige校準(zhǔn)曲線(xiàn)實(shí)現(xiàn)半定量分析。ige濃度以國(guó)際單位ku/l(千ige單位/升)表示。結(jié)果可以例如使用pharmacia公司(現(xiàn)在為thermoscientific)開(kāi)發(fā)的rast系統(tǒng)(放射-過(guò)敏-吸附劑測(cè)試)作為參考系統(tǒng)來(lái)解釋(volcheck,clinicalallergy,diagnosisandmanagement,2009,isbn978-1-59745-315-8)。程序?qū)uroline的條帶的強(qiáng)度自動(dòng)計(jì)算進(jìn)入east類(lèi)別(酶-過(guò)敏-吸附劑測(cè)試),其與rast系統(tǒng)的濃度水平相關(guān)。east類(lèi)別的分類(lèi)顯示在表1中。

表1:east類(lèi)別

實(shí)施例2:

來(lái)自榛子(seqidno3)、芝麻(seqidno4)、花生(seqidno5)、開(kāi)心果(seqidno6)、腰果(seqidno7)、美洲山核桃(seqidno8)、核桃(seqidno9)和澳大利亞堅(jiān)果(seqidno10)的豌豆球蛋白樣蛋白根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)方法表達(dá)為his標(biāo)簽融合蛋白,并如實(shí)施例1所述純化。

制備線(xiàn)印跡,將其與患者樣品接觸,并如ep15001277的實(shí)施例2和3中所述進(jìn)行評(píng)價(jià)。測(cè)試了來(lái)自對(duì)樹(shù)堅(jiān)果過(guò)敏的29個(gè)患者和9個(gè)健康獻(xiàn)血者的血清。

測(cè)試來(lái)自健康獻(xiàn)血者的對(duì)照血清,并且發(fā)現(xiàn)其均為陰性(east類(lèi)別0)。

圖4a至4g顯示了比較數(shù)據(jù),其指示如使用線(xiàn)印跡測(cè)定的來(lái)自所述患者的血清中以east類(lèi)別形式表達(dá)的ige濃度。這些圖顯示了針對(duì)來(lái)自非澳洲堅(jiān)果的樹(shù)堅(jiān)果的一種樹(shù)堅(jiān)果或核7s豌豆球蛋白樣蛋白的ige與針對(duì)來(lái)自澳洲堅(jiān)果的maci豌豆球蛋白的ige之間的相關(guān)性(如果有的話(huà))。

例如,圖4g顯示,對(duì)于maci豌豆球蛋白,一個(gè)患者顯示出east類(lèi)別1ige反應(yīng),幾個(gè)患者顯示east類(lèi)別2ige反應(yīng),并且一個(gè)患者顯示east類(lèi)別5ige反應(yīng),但是對(duì)于anao1(腰果)沒(méi)有反應(yīng),如通過(guò)他們?cè)趯?duì)應(yīng)于anao1的0east類(lèi)別的那一排中所顯示的情況所指示的。

這些結(jié)果顯示,在每個(gè)比較實(shí)驗(yàn)中,顯著數(shù)量的過(guò)敏性患者(圖4a至4g中的暗視野)對(duì)maci豌豆球蛋白反應(yīng),但不對(duì)來(lái)自另一樹(shù)堅(jiān)果的相應(yīng)豌豆球蛋白樣蛋白反應(yīng),更具體地,該數(shù)量為29個(gè)患者中的13個(gè)(cora11相比于maci),29個(gè)患者中的9個(gè)(sesi3),29個(gè)患者中的10個(gè)(jugr2),29個(gè)患者中的9個(gè)(pisv3),29個(gè)患者中的8個(gè)(cari2),29個(gè)患者中的4個(gè)(arah1)和29個(gè)患者中的4個(gè)(anao1)。這些患者之一不能通過(guò)檢測(cè)針對(duì)來(lái)自其它樹(shù)堅(jiān)果的豌豆球蛋白而非maci豌豆球蛋白的ige類(lèi)別抗體來(lái)診斷,因?yàn)槠溲逯械膇ge抗體僅對(duì)maci豌豆球蛋白反應(yīng)。

maci豌豆球蛋白與來(lái)自其它堅(jiān)果和核的7s豌豆球蛋白樣蛋白沒(méi)有east類(lèi)別相關(guān)性。一些患者對(duì)maci豌豆球蛋白的反應(yīng)比對(duì)各自的其它樹(shù)堅(jiān)果過(guò)敏原的反應(yīng)強(qiáng)得多,表明各患者主要對(duì)澳洲堅(jiān)果過(guò)敏而不是對(duì)另一種樹(shù)堅(jiān)果過(guò)敏。例如,圖4a顯示4名患者具有對(duì)maci豌豆球蛋白的6(強(qiáng)反應(yīng))的east類(lèi)別,但對(duì)于cora11沒(méi)有或僅有輕微反應(yīng)(east類(lèi)別0或1)。這表明,maci豌豆球蛋白具有不與任何其它豌豆球蛋白共有的獨(dú)特的ige表位。

序列表

<110>euroimmunmedizinischelabordiagnostikaag

<120>新型澳洲堅(jiān)果過(guò)敏原

<130>15pp017ep2

<160>10

<170>patentinversion3.5

<210>1

<211>177

<212>prt

<213>人工序列

<220>

<223>人工序列

<400>1

glncysmetglnleugluthrserglyglnmetargargcysvalser

151015

glncysasplysargpheglugluaspileasptrpserlystyrasp

202530

asnglngluaspproglnthrglucysglnglncysglnargargcys

354045

argglnglngluseraspproargglnglnglntyrcysglnargarg

505560

cyslysgluilecysglugluglugluglutyrasnargglnargasp

65707580

proglnglnglntyrgluglncysglnlysargcysglnargargglu

859095

thrgluproarghismetglnilecysglnglnargcysgluargarg

100105110

tyrglulysglulysarglysglnglnlysargtyrglugluglngln

115120125

arggluaspgluglulystyrglugluargmetlysgluglyaspasn

130135140

lysargaspproglnglnargglutyrgluaspcysargarghiscys

145150155160

gluglnglngluproargleuglntyrglncysglnargargcysgln

165170175

glu

<210>2

<211>645

<212>prt

<213>人工序列

<220>

<223>人工序列

<400>2

metserhishishishishishishishisleugluvalleuphegln

151015

glyprosermetglncysmetglnleugluthrserglyglnmetarg

202530

argcysvalserglncysasplysargpheglugluaspileasptrp

354045

serlystyraspasnglngluaspproglnthrglucysglnglncys

505560

glnargargcysargglnglngluseraspproargglnglnglntyr

65707580

cysglnargargcyslysgluilecysglugluglugluglutyrasn

859095

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100105110

glnargarggluthrgluproarghismetglnilecysglnglnarg

115120125

cysgluargargtyrglulysglulysarglysglnglnlysargtyr

130135140

glugluglnglnarggluaspgluglulystyrglugluargmetlys

145150155160

gluglyaspasnlysargaspproglnglnargglutyrgluaspcys

165170175

argarghiscysgluglnglngluproargleuglntyrglncysgln

180185190

argargcysglngluglnglnargglnhisglyargglyglyaspleu

195200205

metasnproglnargglyglyserglyargtyrglugluglygluglu

210215220

lysglnseraspasnprotyrtyrpheaspgluargserleuserthr

225230235240

argpheargthrglugluglyhisileservalleugluasnphetyr

245250255

glyargserlysleuleuargalaleulysasntyrargleuvalleu

260265270

leuglualaasnproasnalaphevalleuprothrhisleuaspala

275280285

aspalaileleuleuvalileglyglyargglyalaleulysmetile

290295300

hisargaspasnargglusertyrasnleuglucysglyaspvalile

305310315320

argileproalaglythrthrphetyrleuileasnargaspasnasn

325330335

gluargleuhisilealalyspheleuglnthrileserthrprogly

340345350

glntyrlysgluphepheproalaglyglyglnasnprogluprotyr

355360365

leuserthrpheserlysgluileleuglualaalaleuasnthrgln

370375380

thrgluargleuargglyvalleuglyglnglnarggluglyvalile

385390395400

ileargalaserglngluglnilearggluleuthrargaspaspser

405410415

gluserargargtrphisileargargglyglygluserserarggly

420425430

protyrasnleupheasnlysargproleutyrserasnlystyrgly

435440445

glnalatyrgluvallysprogluasptyrargglnleuglnaspmet

450455460

aspvalservalpheilealaasnilethrglnglysermetmetgly

465470475480

prophepheasnthrargserthrlysvalvalvalvalalasergly

485490495

glualaaspvalglumetalacysprohisleuserglyarghisgly

500505510

glyargglyglyglylysarghisgluglugluglugluvalhistyr

515520525

gluglnvalargalaargleuserlysargglualailevalvalleu

530535540

alaglyhisprovalvalphevalserserglyasngluasnleuleu

545550555560

leuphealapheglyileasnalaglnasnasnhisgluasnpheleu

565570575

alaglyarggluargasnvalleuglnglnilegluproglnalamet

580585590

gluleualaphealaalaserarglysgluvalglugluleupheasn

595600605

serglnaspgluserilephepheproglyproargglnhisglngln

610615620

glnserproargserthrlysglnglnglnproleuvalserileleu

625630635640

aspphevalglyphe

645

<210>3

<211>448

<212>prt

<213>榛子

<400>3

metleuprolysgluaspprogluleulyslyscyslyshislyscys

151015

argaspgluargglnpheaspgluglnglnargargaspglylysgln

202530

ilecysgluglulysalaarggluargglnglnglugluglyasnser

354045

sergluglusertyrglylysgluglnglugluasnprotyrvalphe

505560

glnaspgluhisphegluserargvallysthrglugluglyargval

65707580

glnvalleugluasnphethrlysargserargleuleuserglyile

859095

gluasnpheargleualaileleuglualaasnprohisthrpheile

100105110

serproalahispheaspalagluleuvalleuphevalalalysgly

115120125

argalathrilethrmetvalarggluglulysarggluserpheasn

130135140

valgluhisglyaspileileargileproalaglythrprovaltyr

145150155160

metileasnargaspgluasnglulysleupheilevallysileleu

165170175

glnprovalseralaproglyhispheglualaphetyrglyalagly

180185190

glygluaspprogluserphetyrargalaphesertrpgluvalleu

195200205

glualaalaleulysvalargarggluglnleuglulysvalphegly

210215220

gluglnserlysglyserilevallysalaserargglulysilearg

225230235240

alaleuserglnhisglugluglyproproargiletrpprophegly

245250255

glygluserserglyproileasnleuleuhislyshisprosergln

260265270

serasnglnpheglyargleutyrglualahisproaspasphislys

275280285

glnleuglnaspleuaspleumetvalserphealaasnilethrlys

290295300

glysermetalaglyprotyrtyrasnserargalathrlysileser

305310315320

valvalvalgluglygluglyphepheglumetalacysprohisleu

325330335

serserserserglysertyrglnlysileseralaargleuargarg

340345350

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355360365

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405410415

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420425430

proasnlysglnglnglugluglyglyargglyglyargalapheglu

435440445

<210>4

<211>562

<212>prt

<213>芝麻

<400>4

gluserlysaspprogluleulysglncyslyshisglncyslysala

151015

glnglnglnileserlysgluglnlysglualacysileglnalacys

202530

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354045

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65707580

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165170175

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195200205

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210215220

proasnhistrpaspalagluservalvalphevalalalysglyarg

225230235240

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245250255

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260265270

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275280285

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545550555560

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<213>開(kāi)心果

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