1.用于對(duì)I型和II型牛病毒性腹瀉-粘膜病病毒進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)的引物或TaqMan探針,依據(jù)牛病毒性腹瀉粘膜病病毒I型和II型的5’UTR區(qū)域基因的特異性保守序列作為檢測(cè)序列設(shè)計(jì)得到,該檢測(cè)序列的堿基如序列表中SED ID NO:6所示。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的用于對(duì)I型和II型牛病毒性腹瀉-粘膜病病毒進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)的引物,其特征在于,上游引物(BVDV-F)的核苷酸序列如序列表中SED ID NO:1所示,下游引物(BVDV-R)的核苷酸序列如序列表中SEQ ID NO:2所示。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的用于對(duì)I型和II型牛病毒性腹瀉-粘膜病病毒進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)的TaqMan探針,該TaqMan探針(BVDV-P)的核苷酸序列如序列表中SED ID NO:3所示;所述探針為經(jīng)過(guò)熒光標(biāo)記的,其5’端標(biāo)記有報(bào)告熒光基團(tuán),3’端標(biāo)記有淬滅熒光基團(tuán)。
4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的TaqMan探針,其特征在于:所述報(bào)告熒光基團(tuán)為ROX,熒光淬滅基團(tuán)為BHQ2。
5.用于對(duì)I型和II型牛病毒性腹瀉-粘膜病病毒進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)的試劑盒,包括權(quán)利要求1或2所述的引物和權(quán)利要求1或3或4所述的TaqMan探針。
6.根據(jù)權(quán)利要求5所述的試劑盒,其特征在于:所述試劑盒包括以下用于25μL實(shí)時(shí)熒光定量PCR反應(yīng)體系的試劑:實(shí)時(shí)熒光定量一步法PCR反應(yīng)液2×One Step RT-PCR Buffer III 12.5μL(購(gòu)于TakaRa公司),TaKaRa Ex Taq HS 0.5μL(購(gòu)于TakaRa公司),PrimeScript RT Enzyme Mix II 0.5μL(購(gòu)于TakaRa公司),BVDV-F(20μM)0.5μL,BVDV-R(20μM)0.5μL,BVDV-P(10μM)1μL,RNA-free H2O 7.5μL。
7.根據(jù)權(quán)利要求4或5所述的試劑盒,其特征在于:所述試劑盒中還可包括標(biāo)準(zhǔn)品、陽(yáng)性對(duì)照和陰性對(duì)照,所述標(biāo)準(zhǔn)品為含I型和II型牛病毒性腹瀉-粘膜病病毒PCR擴(kuò)增產(chǎn)物片段的質(zhì)粒轉(zhuǎn)錄RNA產(chǎn)物,所述陽(yáng)性對(duì)照為I型和II型牛病毒性腹瀉-粘膜病病毒基因組RNA,所述陰性對(duì)照為不含牛病毒性腹瀉-粘膜病病毒I型和II型的反應(yīng)體系,如H2O(雙蒸水、無(wú)菌去離子水等)。
8.一種用權(quán)利要求5-7任一所述的實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)試劑盒對(duì)I型和II型牛病毒性腹瀉-粘膜病病毒(BVDV)進(jìn)行非疾病診斷目的定性、定量檢測(cè)的方法,包括以下步驟:
1)建立標(biāo)準(zhǔn)曲線:構(gòu)建攜帶所述檢測(cè)基因的重組質(zhì)粒pCR TOPO-BVDV standard plasmid,對(duì)鑒定正確的重組質(zhì)粒進(jìn)行轉(zhuǎn)錄,制備得到RNA標(biāo)準(zhǔn)品,將標(biāo)準(zhǔn)品稀釋成1×108、1×107、1×106、1×105、1×104、1×103、1×102、1×101拷貝(copies)/μL,以不同濃度的標(biāo)準(zhǔn)品作為模板,在權(quán)利要求1或2所述引物和權(quán)利要求1或3或4所述TaqMan探針的引導(dǎo)下進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè),檢測(cè)結(jié)束后,以各標(biāo)準(zhǔn)品的濃度Log值(X軸)對(duì)其相應(yīng)Ct值(Y軸)作圖,繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線;
2)提取待測(cè)樣品的基因組RNA,以提取的基因組RNA為模板,在權(quán)利要求1或2所述引物和權(quán)利要求1或3或4所述TaqMan探針的引導(dǎo)下進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè);
3)用得到的CT值或熒光信號(hào)的變化對(duì)I型和II型牛病毒性腹瀉-粘膜病病毒(BVDV)進(jìn)行定性檢測(cè),出現(xiàn)“S”型擴(kuò)增曲線表明待測(cè)樣品中含有牛病毒性腹瀉-粘膜病病毒(BVDV)I型或II型;再根據(jù)熒光信號(hào)的強(qiáng)度和步驟1)中的標(biāo)準(zhǔn)曲線,得出待測(cè)樣品中所含I型或II型牛病毒性腹瀉-粘膜病病毒(BVDV)的拷貝數(shù),實(shí)現(xiàn)定量檢測(cè);
所述步驟1)和步驟2)中的25μL實(shí)時(shí)熒光定量PCR反應(yīng)體系可包括:模板2μL,實(shí)時(shí)熒光定量一步法PCR反應(yīng)液2×One Step RT-PCR Buffer III 12.5μL(購(gòu)于TakaRa公司),TaKaRa Ex Taq HS 0.5μL(購(gòu)于TakaRa公司),PrimeScript RT Enzyme Mix II 0.5μL(購(gòu)于TakaRa公司),BVDV-F(20μM)0.5μL,BVDV-R(20μM)0.5μL,BVDV-P(10μM)1μL,RNA-free H2O 7.5μL;所述步驟1)和步驟2)中的實(shí)時(shí)熒光定量PCR反應(yīng)條件可為:先52℃15min,95℃2min;然后94℃5s,58℃30s,45個(gè)循環(huán)。
9.一種鑒別I型和II型牛病毒性腹瀉-粘膜病病毒(BVDV)與豬瘟病毒(CSFV)的方法,在權(quán)利要求8步驟后還包括:
4)結(jié)果判定:
35個(gè)循環(huán)內(nèi)若出現(xiàn)“S”型擴(kuò)增曲線,則確認(rèn)為BVDV陽(yáng)性(樣品中含有I型或II型牛病毒性腹瀉-粘膜病病毒),38個(gè)循環(huán)以上未出現(xiàn)“S”型擴(kuò)增曲線,則確認(rèn)為BVDV陰性(樣品中不含有I型和II型牛病毒性腹瀉-粘膜病病毒),35-38個(gè)循環(huán)之間判定為可疑,需重檢。
10.根據(jù)權(quán)利要求8或9所述的方法,其特征在于:所述步驟2)中的待測(cè)樣品包括作為疫苗生產(chǎn)原料的血清樣品、半成品疫苗樣品或奶牛場(chǎng)牛奶樣品。