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利用枯草芽孢桿菌高效表達(dá)PI?PLC基因的方法與流程

文檔序號:12577449閱讀:2453來源:國知局
利用枯草芽孢桿菌高效表達(dá)PI?PLC基因的方法與流程

本發(fā)明涉及利用枯草芽孢桿菌高效表達(dá)磷脂酰肌醇特異性磷脂酶C(PI-PLC)基因的方法。

(二)

背景技術(shù):

磷脂酰肌醇特異性磷脂酶C(PI-PLC)的種類很多,在細(xì)菌、原生動(dòng)物、酵母、霉菌、植物、昆蟲和哺乳動(dòng)物中均存在。在各個(gè)領(lǐng)域均有應(yīng)用:醫(yī)藥領(lǐng)域,主要作為疫苗用于預(yù)防各種病原菌的感染;食品領(lǐng)域,多用于面包烘培、奶制品加工、保健食品等;工業(yè)領(lǐng)域,主要用于油脂精煉、磷脂改性、動(dòng)物飼料添加劑等。

雞球蟲病發(fā)病率高(50~70%),致死率高(50~80%),嚴(yán)重危害養(yǎng)殖業(yè),每年因球蟲病造成的損失高達(dá)數(shù)十億美元。現(xiàn)有雞球蟲病防治,主要依靠化學(xué)藥物,但存在耐藥性、藥物殘留等不足,若采用接種疫苗方式進(jìn)行防治,又存在風(fēng)險(xiǎn)較大、且研發(fā)困難的不足,而采用抗生素或中草藥,也存在耐藥性的問題,且效果一般。因此,亟需尋找一種新的抗球蟲藥物替代化學(xué)藥物來有效控制雞球蟲病。

細(xì)菌PI-PLC可裂解細(xì)胞膜表面糖基錨定蛋白,從而影響細(xì)胞膜表面上糖蛋白及碳水化合物的釋放,而球蟲等大多數(shù)致病性寄生蟲細(xì)胞膜表面抗原都是通過糖基錨定在細(xì)胞上的,PI-PLC能切斷錨定蛋白中肌醇磷脂與細(xì)胞膜的連接,使寄生蟲喪失入侵宿主細(xì)胞和在宿主細(xì)胞內(nèi)增殖的能力,因此PI-PLC顯示出顯著的抗球蟲感染特性。

PI-PLC的抗球蟲機(jī)理為新型抗球蟲藥的開發(fā)提供了理論基礎(chǔ)。PI-PLC降低了球蟲因耐藥性加劇而爆發(fā)的風(fēng)險(xiǎn),避免養(yǎng)殖業(yè)因球蟲病復(fù) 發(fā)而造成的重大損失。PI-PLC廣泛分布于動(dòng)植物以及微生物的體內(nèi),本身就參與機(jī)體細(xì)胞的代謝和信息交流,不存在產(chǎn)生耐藥性及藥物殘留等問題。具有安全、無毒害作用。通過微生物異源表達(dá),可以大量生產(chǎn)PI-PLC,降低抗球蟲藥的使用成本。

(三)

技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:

本發(fā)明目的是提供利用枯草芽孢桿菌高效表達(dá)磷脂酰肌醇特異性磷脂酶C(PI-PLC)基因的方法。

本發(fā)明采用的技術(shù)方案是:

一種利用枯草芽孢桿菌高效表達(dá)磷脂酰肌醇特異性磷脂酶C(PI-PLC)基因的方法,所述方法包括:將SEQ ID No:1所示序列與pBE980a質(zhì)粒連接,構(gòu)建得到重組表達(dá)載體轉(zhuǎn)化至大腸桿菌EPI400中,篩選陽性克隆轉(zhuǎn)化至枯草芽孢桿菌中,獲得重組基因工程菌進(jìn)行誘導(dǎo)培養(yǎng),于培養(yǎng)液中獲得轉(zhuǎn)化后的磷脂酰肌醇特異性磷脂酶C。

SEQ ID No:1序列如下:

5’-gcgtcaagcgtgaacgaactggaaaattggagcaaatggatgcaaccgattcctgattcaatcccgcttgcgcgtattagcatccctggcacgcatgactctggaacatttaaattgcaaaacccgatcaaacaggtttggggcatgacacaagaatacgattttcgttatcagatggaccatggtgctcggatttttgatatcagaggccgcttaacggatgacaatacaatcgttttgcatcatggaccgttgtacttgtacgtgacgttgcatgaatttatcaacgaagcgaaacagtttttgaaagataacccttcagaaacaatcatcatgagcttgaaaaaagaatacgaagatatgaaaggcgctgaagactctttttcttccacgtttgagaaaaaatactttgtcgatcctatctttctgaaaacagaaggaaacatcaaacttggagacgccagaggtaaaattgtactgcttaaacgctattctggttccaacgaaccgggcggatacaacaacttttactggcctgataacgaaacgtttacaacgacagtgaatcaaaacgcaaatgttacagtgcaggataaatacaaagtctcctacgacgaaaaagtaaaaagcatcaaagatacgatggacgaaacaatgaataactctgaagatctgaaccatctttacatcaactttacgtcactttcaagcggtggcacagcttggaattctccgtattactatgcct cctacatcaaccctgaaatcgcaaactacatcaaacagaaaaatccggcacgcgtcggatgggtaatccaggattatattaatgaaaaatggagcccgttactgtatcaagaagtcatcagagcaaataaatccttaatcaaagaataa-3’。

最終表達(dá)的序列如下:

gcgtcaagcgtgaacgaactggaaaattggagcaaatggatgcaaccgattcctgattcaatcccgcttgcgcgtattagcatccctggcacgcatgactctggaacatttaaattgcaaaacccgatcaaacaggtttggggcatgacacaagaatacgattttcgttatcagatggaccatggtgctcggatttttgatatcagaggccgcttaacggatgacaatacaatcgttttgcatcatggaccgttgtacttgtacgtgacgttgcatgaatttatcaacgaagcgaaacagtttttgaaagataacccttcagaaacaatcatcatgagcttgaaaaaagaatacgaagatatgaaaggcgctgaagactctttttcttccacgtttgagaaaaaatactttgtcgatcctatctttctgaaaacagaaggaaacatcaaacttggagacgccagaggtaaaattgtactgcttaaacgctattctggttccaacgaaccgggcggatacaacaacttttactggcctgataacgaaacgtttacaacgacagtgaatcaaaacgcaaatgttacagtgcaggataaatacaaagtctcctacgacgaaaaagtaaaaagcatcaaagatacgatggacgaaacaatgaataactctgaagatctgaaccatctttacatcaactttacgtcactttcaagcggtggcacagcttggaattctccgtattactatgcctcctacatcaaccctgaaatcgcaaactacatcaaacagaaaaatccggcacgcgtcggatgggtaatccaggattatattaatgaaaaatggagcccgttactgtatcaagaagtcatcagagcaaataaatccttaatcaaagaataa

其編碼的氨基酸序列為:

assvnelenwskwmqpipdsiplarisipgthdsgtfklqnpikqvwgmtqeydfryqmdhgarifdirgrltddntivlhhgplylyvtlhefineakqflkdnpsetiimslkkeyedmkgaedsfsstfekkyfvdpiflktegniklgdargkivllkrysgsnepggynnfywpdnetftttvnqnanvtvqdkykvsydekvksikdtmdetmnnsedlnhlyinftslssggtawnspyyyasyinpeianyikqknparvgwviqdyinekwspllyqevirankslike(其中下劃線所示為載體上的信號肽)

具體的,所述方法如下:

(1)表達(dá)載體構(gòu)建:以SEQ ID No:2所示PI-PLC基因?yàn)槟0?,以P1/P2為引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增:

引物P1:5’-GCCAAGCTTGCGTCAAGCGTGAAC GAACTGGAAAATTGG-3’;

引物P2:5’-GCCGGATCCTTACCCATCCGACGCGTGCCGGATTTTTCTGTT-3’;

(2)步驟(1)酶切、回收的目的基因與pBE980a質(zhì)粒連接,得到重組表達(dá)載體pBE980a PI-PLC;

(3)重組表達(dá)載體pBE980a PI-PLC轉(zhuǎn)入大腸桿菌EPI400感受態(tài)細(xì)胞,篩選獲得陽性克?。籈PI400電轉(zhuǎn)感受態(tài)細(xì)胞可以顯著降低各種常見的載體的拷貝數(shù),這樣就可以更容易地克隆不穩(wěn)定的DNA序列。EPI400感受態(tài)細(xì)胞在制備質(zhì)粒時(shí)需要加入L-阿拉伯糖進(jìn)行誘導(dǎo),接菌培養(yǎng)時(shí)按照2mmol/L的濃度加入L-阿拉伯糖。

(4)步驟(3)陽性克隆電轉(zhuǎn)化至枯草芽孢桿菌感受態(tài)細(xì)胞,篩選陽性克隆,獲得重組基因工程菌;

(5)重組基因工程菌在含有10ug/ml卡那霉素的LB液體培養(yǎng)基中培養(yǎng)48h以上,于培養(yǎng)基上清液獲得PI-PLC。

所述枯草芽孢桿菌為枯草芽孢桿菌WB600或枯草芽孢桿菌WB800。

SEQ ID No.2序列如下:

5’-ATGTCTAACAAAAAACTTATCCTGAAATTATTTATCTGCTCCACAATCTTTATTACATTTGTCTTTGCTCTGCATGACAAACGGGTGGTTGCAGCGTCAAGCGTGAACGAACTGGAAAATTGGAGCAAATGGATGC AACCGATTCCTGATTCAATCCCGCTTGCGCGTATTAGCATCCCTGGCACGCATGACTCTGGAACATTTAAATTGCAAAACCCGATCAAACAGGTTTGGGGCATGACACAAGAATACGATTTTCGTTATCAGATGGACCATGGTGCTCGGATTTTTGATATCAGAGGCCGCTTAACGGATGACAATACAATCGTTTTGCATCATGGACCGTTGTACTTGTACGTGACGTTGCATGAATTTATCAACGAAGCGAAACAGTTTTTGAAAGATAACCCTTCAGAAACAATCATCATGAGCTTGAAAAAAGAATACGAAGATATGAAAGGCGCTGAAGACTCTTTTTCTTCCACGTTTGAGAAAAAATACTTTGTCGATCCTATCTTTCTGAAAACAGAAGGAAACATCAAACTTGGAGACGCCAGAGGTAAAATTGTACTGCTTAAACGCTATTCTGGTTCCAACGAACCGGGCGGATACAACAACTTTTACTGGCCTGATAACGAAACGTTTACAACGACAGTGAATCAAAACGCAAATGTTACAGTGCAGGATAAATACAAAGTCTCCTACGACGAAAAAGTAAAAAGCATCAAAGATACGATGGACGAAACAATGAATAACTCTGAAGATCTGAACCATCTTTACATCAACTTTACGTCACTTTCAAGCGGTGGCACAGCTTGGAATTCTCCGTATTACTATGCCTCCTACATCAACCCTGAAATCGCAAACTACATCAAACAGAAAAATCCGGCACGCGTCGGATGGGTAATCCAGGATTATATTAATGAAAAATGGAGCCCGTTACTGTATCAAGAAGTCATCAGAGCAAATAAATCCTTAATCAAAGAATAA-3’。

其編碼的氨基酸序列:

assvnelenwskwmqpipdsiplarisipgthdsgtfklqnpikqvwgmtqeydfryqmdhgarifdirgrltddntivlhhgplylyvtlhefineakqflkdnpsetiimslkkeyedmkgaedsfsstfekkyfvdpiflktegniklgdargkivllkrysgsnepggynnfywpdnetftttvnqnanvtvqdkykvsydekvksikdtmdetmnnsedlnhlyinftslssggtawnspyyyasyi npeianyikqknparvgwviqdyinekwspllyqevirankslike(下劃線部分為去除的31個(gè)前導(dǎo)肽)

上述基因?yàn)閺腘CBI數(shù)據(jù)庫中得到的一段蠟狀芽胞桿菌PI-PLC基因(Genbank:M30809.1),根據(jù)大腸桿菌密碼子的偏好性,在保證氨基酸序列不變的前提下,優(yōu)化設(shè)計(jì)并合成的PI-PLC目的基因,該基因可在大腸桿菌中的異源高表達(dá),且重組蛋白顯示磷脂酶活性較高,由于條件致病菌大腸桿菌可能會導(dǎo)致動(dòng)物感染治病,不是一種安全的表達(dá)宿主菌,不能直接喂養(yǎng)動(dòng)物,未批注用于飼料,無法產(chǎn)業(yè)化生產(chǎn),因此有必要建立起的能夠產(chǎn)業(yè)化生產(chǎn)的表達(dá)系統(tǒng)。

在基因工程中,枯草芽孢桿菌是廣泛使用的表達(dá)系統(tǒng),它沒有致病性、是國家批準(zhǔn)可以使用的宿主菌,并且具有很強(qiáng)的向胞外分泌蛋白能力,但異源蛋白的表達(dá)往往很低,為實(shí)現(xiàn)PI-PLC基因在枯草芽孢桿菌中的異源高表達(dá),發(fā)明人進(jìn)行了多次嘗試,前后歷時(shí)一年多,最終發(fā)現(xiàn)采用大腸桿菌EPI400(其他大腸桿菌表達(dá)不了),且去掉PI-PLC基因的31個(gè)前導(dǎo)肽,利用特定載體pBE980a上(為穿梭質(zhì)粒,可以在大腸桿菌和芽孢桿菌中復(fù)制)的序列進(jìn)行胞外分泌表達(dá),才能獲得正確的克隆。

本發(fā)明的有益效果主要體現(xiàn)在:本發(fā)明構(gòu)建了磷脂酰肌醇特異性磷脂酶C(PI-PLC)的枯草芽孢桿菌穩(wěn)定表達(dá)系統(tǒng),成功實(shí)現(xiàn)了PI-PLC基因在枯草芽孢桿菌中的異源高表達(dá),為后續(xù)PI-PLC的批量生產(chǎn)奠定了基礎(chǔ)。

(四)附圖說明

圖1為質(zhì)粒pBE980a圖譜;

圖2為重組質(zhì)粒pBE980a PI-PLC圖譜;

圖3為PI-PLC酶活性檢測結(jié)果。

(五)具體實(shí)施方式

下面結(jié)合具體實(shí)施例對本發(fā)明進(jìn)行進(jìn)一步描述,但本發(fā)明的保護(hù)范圍并不僅限于此:

實(shí)施例1:

1、PI-PLC基因的優(yōu)化與合成

從NCBI數(shù)據(jù)庫中得到的一段蠟狀芽胞桿菌PI-PLC基因(Genbank:M30809.1),根據(jù)大腸桿菌密碼子的偏好性,在保證氨基酸序列不變的前提下,優(yōu)化設(shè)計(jì)并合成的PI-PLC目的基因(SEQ ID No.2),由杭州擎科梓熙生物技術(shù)有限公司合成。

2、目的基因片段的獲得與鑒定

具體步驟:以SEQ ID No:2所示PI-PLC基因?yàn)槟0?,以P1/P2為引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增:

引物P1:5’-GCCAAGCTTGCGTCAAGCGTGAAC GAACTGGAAAATTGG-3’;

引物P2:5’-GCCGGATCCTTACCCATCCGACGCGTGCCGGATTTTTCTGTT-3’;以合成基因PI-PLC為模板,以p1/p2為引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增。

PCR擴(kuò)增體系為:模板1μL,上下游引物各1μL,2×super HIFI-MIXⅡ25μL,滅菌的雙蒸水20μL。

PCR擴(kuò)增條件為:94℃預(yù)變性5min;94℃變性30s,54℃退火30s,72℃延伸60s,32個(gè)循環(huán)后72℃延伸10min。

PCR產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳分析鑒定。

3、重組質(zhì)粒pBE980a PI-PLC的構(gòu)建

具體步驟:基因PI-PLC經(jīng)過PCR獲得了含有HindIII和BamHI粘性 末端的產(chǎn)物(SEQ ID No.1),通過與含有相同粘性末端的載體質(zhì)粒pBE980a(由中科院天津生物技術(shù)研究所宋詼老師饋贈(zèng),質(zhì)粒圖譜見圖1)連接,獲得重組質(zhì)粒pBE980a PI-PLC(圖譜參見圖2)。

4、重組質(zhì)粒pBE980a PI-PLC在大腸桿菌中的克隆

具體步驟:提取正確的重組質(zhì)粒pBE980a PI-PLC,轉(zhuǎn)到表達(dá)宿主菌大腸桿菌EPI400電轉(zhuǎn)感受態(tài)細(xì)胞(F-mcrAΔ(mrr-hsdRMS-mcrBC)Φ80dlacZΔM15ΔlacX74recA1endA1araD139Δ(ara,leu)7697galU galKλ-rpsL(StrR)nupG trfA tonA pcnB4dhfr,購自Epicentre Biotechnologies公司),挑選單克隆,進(jìn)行測序分析,測序結(jié)果顯示為陽性克隆。

5、轉(zhuǎn)化到枯草芽孢桿菌

感受態(tài)細(xì)胞制備:分別取枯草芽孢桿菌WB600(購于BioVector質(zhì)粒載體菌種細(xì)胞基因保藏中心)和枯草芽孢桿菌WB800(購于BioVector質(zhì)粒載體菌種細(xì)胞基因保藏中心)單菌落接種于5mL LB培養(yǎng)基中200rpm/min振蕩培養(yǎng)過夜。將活化好的單菌落接種于生長培養(yǎng)基中(LB+0.5M山梨醇)中,過夜培養(yǎng)。將菌種按1/16的接種量接種于生長培養(yǎng)基(LB+0.5M山梨醇),37℃搖床振蕩培養(yǎng)至OD600nm在0.85~0.95左右。用冰水浴冷卻培養(yǎng)物10min,于4℃,5000rpm,離心5min收集菌體。反復(fù)用冰冷的電擊緩沖液(0.5M山梨醇,0.5M甘露醇,10%甘油)洗滌細(xì)胞收集物4次。用原培養(yǎng)液1/40體積的電擊緩沖液重新懸浮細(xì)胞收集物,40微升的分裝一個(gè)EP管中,放入-80℃保存。

分別取枯草芽孢桿菌WB600和枯草芽孢桿菌WB800感受態(tài)細(xì)胞40ulmL,加入1~2μL重組質(zhì)粒,進(jìn)行電轉(zhuǎn)化:電擊條件2.0KV,1mm,電擊1次。電擊完畢后取出杯子立即加入1ml RM(LB+0.5M山梨醇+0.38M甘露醇),37℃,200rpm,復(fù)蘇3h后,涂板。37℃,過夜培養(yǎng)。 挑選陽性克隆進(jìn)行質(zhì)粒提取,測序正確,獲得重組基因工程菌。

6、誘導(dǎo)培養(yǎng):

重組基因工程菌在含有10ug/ml卡那霉素的LB液體培養(yǎng)基中,37℃,200rpm,振蕩培養(yǎng)48h,于培養(yǎng)基上清液獲得PI-PLC。

7、PI-PLC酶活性檢測:

PI-PLC水解磷酸肌醇磷酸二酯鍵,產(chǎn)生的不溶于水的二酰基甘油,在平板上顯示乳白色暈圈。取10mL含有PIPLC表達(dá)載體的重組菌菌液,在PI-李斯特氏菌顯色平板點(diǎn)樣,并以同樣方法取枯草芽孢桿菌WB600和WB800作為對照,37℃溫育12h。觀察結(jié)果,如果重組蛋白有酶活性,會在PI-李斯特氏菌顯色平板顯示乳白色暈圈,反之沒有活性。結(jié)果參見圖3。

8、酶聯(lián)反應(yīng)定量測定菌液中PI-PLC的含量

具體步驟:

①待測樣品的處理:將誘導(dǎo)表達(dá)后的重組菌菌液,置于冰上超聲波破碎至澄清8000r/min離心10min,收集上清;

②標(biāo)準(zhǔn)品的稀釋:試劑盒提供原倍PI-PLC標(biāo)準(zhǔn)品一支,按照下列圖表在1.5mL離心管中進(jìn)行稀釋。

③加樣:分別設(shè)空白孔(空白對照孔不加樣品及酶標(biāo)試劑,其余各步操作相同)、標(biāo)準(zhǔn)孔、待測樣品孔。在酶標(biāo)包被板上標(biāo)準(zhǔn)品準(zhǔn)確加樣50μL, 待測樣品孔中先加樣品稀釋液40μL,然后再加待測樣品10μL(樣品最終稀釋度為5倍)。加樣將樣品加于酶標(biāo)板孔底部,盡量不觸及孔壁,輕輕晃動(dòng)混勻。

④溫育:用封板膜封板后置37℃溫育30min。

⑤配液:將30倍濃縮洗滌液用蒸餾水30倍稀釋后備用。

⑥洗滌:小心揭掉封板膜,棄去液體,甩干,每孔加滿洗滌液,靜置30s后棄去,如此重復(fù)5次,拍干。

⑦加酶:每孔加入酶標(biāo)試劑50μL,空白孔除外。

⑧溫育:操作同3。

⑨洗滌:操作同5。

⑩顯色:每孔先加入顯色劑A 50μL,再加入顯色劑B 50μL,輕輕震蕩混勻,37℃避光顯色15min。

終止:每孔加終止液50μL,終止反應(yīng)(此時(shí)藍(lán)色立轉(zhuǎn)黃色)。

測定:以空白空調(diào)零,450nm波長依序測量各孔的吸光度(OD值)。測定應(yīng)在加終止液后15min以內(nèi)進(jìn)行。

計(jì)算以標(biāo)準(zhǔn)物的濃度為橫坐標(biāo),OD值為縱坐標(biāo),在坐標(biāo)紙上繪出標(biāo)準(zhǔn)曲線,根據(jù)樣品的OD值由標(biāo)準(zhǔn)曲線查出相應(yīng)的濃度;再乘以稀釋倍數(shù);或用標(biāo)準(zhǔn)物的濃度與OD值計(jì)算出標(biāo)準(zhǔn)曲線的直線回歸方程式,將樣品的OD值代入方程式,計(jì)算出樣品濃度,再乘以稀釋倍數(shù),即為樣品的實(shí)際濃度。

結(jié)果參見圖3,顯示按上述方法誘導(dǎo)枯草芽孢桿菌表達(dá)PI-PLC,最終測得誘導(dǎo)后培養(yǎng)液(上清液)中PI-PLC的濃度為9.4mg/L。

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