技術(shù)特征:
1.一種對大菱鲆隨機(jī)群體進(jìn)行個體育種值評估的方法,其特征在于,所述的方法包括如下步驟:1)首先利用要檢測的隨機(jī)群體中來構(gòu)建大菱鲆家系;2)個體表型數(shù)據(jù)采集和基因組DNA提?。簩τ谒鶚?gòu)建家系群體,在12月齡時,挑選體重排名靠前的個體,測量個體表型數(shù)據(jù),同時在不影響個體生長的情況下提取DNA;3)微衛(wèi)星位點(diǎn)基因分型;利用20個SSR位點(diǎn)進(jìn)行SSR-PCR擴(kuò)增,20對引物正相序列5′端分別標(biāo)記6-FAM,HEX,TAMRA及ROX熒光標(biāo)記;利用ABI3130型全自動基因分析儀進(jìn)行20個位點(diǎn)的微衛(wèi)星位點(diǎn)基因分型;4)數(shù)據(jù)處理計算將獲得的SSR位點(diǎn)數(shù)據(jù)按照Coancestry軟件的要求輸入到軟件中處理,得到分型個體兩兩之間的分子遺傳相關(guān)度rXY;再利用R-project軟件將得到的分子遺傳相關(guān)度rXY結(jié)果轉(zhuǎn)化為遺傳相關(guān)矩陣NumeratorMatrix的形式;再利用R-project軟件中matrix程序包的nearPD函數(shù)將遺傳相關(guān)矩陣進(jìn)行正定Bending,使其特征值均大于零,正定后再用is.positive.definite函數(shù)驗(yàn)證,獲得遺傳相關(guān)矩陣;將正定過的遺傳相關(guān)矩陣轉(zhuǎn)化為ASReml軟件認(rèn)可的三列式“.grm”文件;將“.grm”文件連同記錄個體的編號、表型值、固定效應(yīng)分組的表型數(shù)據(jù)文件一起輸入到ASReml軟件,使用AI-REML算法,利用動物模型估計育種值;y=Xb+Zu+e其中y為表型值向量,即研究群體內(nèi)個體的表型數(shù)據(jù);X和Z分別為b和u的設(shè)計矩陣,b,u和e分別為固定效應(yīng),隨機(jī)效應(yīng)及殘差的向;按照如下混合方程組求解動物模型;其中X’和Z’分別為X和Z矩陣的轉(zhuǎn)置;A-1是A矩陣的逆矩陣,A矩陣為加性遺傳矩陣,即“.grm”文件;和分別是固定效應(yīng)和隨機(jī)效應(yīng)的估計值;所述的SSR位點(diǎn)的擴(kuò)增引物信息如下:2.如權(quán)利要求1所述的方法,其特征在于,所述的不影響個體生長的情況下提取DNA,是剪取其鰭條末端組織來提取DNA。3.如權(quán)利要求1所述的方法,其特征在于,所述的表型數(shù)據(jù)為體長、體重數(shù)據(jù)。