專利名稱:3’硫代-次黃嘌呤脫氧核苷亞磷酸酰胺單體及其應(yīng)用的制作方法
技術(shù)領(lǐng)域:
本發(fā)明屬于生物技術(shù)領(lǐng)域,涉及到化學(xué)基團(tuán)修飾的3’硫代-次黃嘌呤脫氧核苷亞磷酸酰胺,3’硫代-脫氧核糖次黃嘌呤亞磷酸酰胺分子可以用于固相核酸合成的單體原料,其固相合成寡核苷酸產(chǎn)物除了具有傳統(tǒng)寡核苷酸的生物學(xué)性能外,還具有被化學(xué)切割的性能,可以用于核酸、蛋白質(zhì)等生物大分子的檢測。
背景技術(shù):
在分子生物學(xué)研究中,DNA的序列分析是進(jìn)一步研究和改造目的基因的基礎(chǔ),對生命科學(xué)至關(guān)重要。隨著人類基因組計(jì)劃和各種模式生物基因組計(jì)劃的開展和完成,使人類步入了后基因時(shí)代,分子生物學(xué)相關(guān)學(xué)科得到了迅猛的發(fā)展。從基因水平上認(rèn)識生命的差異,疾病發(fā)生、發(fā)展的規(guī)律,以及藥物與生命體的相互作用將成為可能。在基礎(chǔ)研究方面,研究疾病基因的遺傳規(guī)律,克隆致病基因;在應(yīng)用方面,直接尋找疾病的易感基因突變位點(diǎn), 可以獲得有關(guān)與該疾病相關(guān)基因型的信息。通過DNA序列信息的分析可以為理解生命的起源、疾病發(fā)生、以及個(gè)體化醫(yī)療等提供有用的相關(guān)核酸序列信息。對DNA序列的分析包括位點(diǎn)(如單堿基多態(tài)性、甲基化、突變等),片段序列(如片段重復(fù)、缺失等)、全基因組序列分析和DNA蛋白質(zhì)相互作用。針對這些不同的分析對象,目前已有各種不同的方法相應(yīng)方法被廣泛應(yīng)用,而這些方法中有許多涉及到核酸需要被切割的手段。如在橋式PCR擴(kuò)增中需要對一條鏈進(jìn)行切除,以獲得單鏈DNA模板用來進(jìn)行核酸分析;在DNA與蛋白質(zhì)的序列特異性識別和相互作用檢測中,需要借助核酸片段是否能夠切割來判斷雙鏈DNA是否與蛋白質(zhì)發(fā)生了結(jié)合,從而達(dá)到非標(biāo)記檢測蛋白的目的;在基于標(biāo)記熒光的高通量測序過程中,需要將每次測序中的標(biāo)識熒光分子切除,以便順利進(jìn)行下一個(gè)位置堿基的序列測定等。要實(shí)現(xiàn)這些不同的切割的手段,目前需要針對核酸片段進(jìn)行特殊的修飾,或者采用特定的酶切或者化學(xué)切割方法,這些方法中要么合成難度大,或者難于找到合適的切割試劑而給研究工作帶來困難。本發(fā)明制備的是3’硫代-次黃嘌呤脫氧核苷亞磷酸酰胺分子可以作為固相核酸合成的基本原料,通過廣泛使用的核酸合成儀在合成的序列片段中很方便的引入3’硫代-次黃嘌呤脫氧核苷(或者稱為入3’硫代肌苷)來實(shí)現(xiàn)核酸序列分析中切割方法的實(shí)現(xiàn)。由于引入的3’硫代-次黃嘌呤脫氧核苷具有次黃嘌呤脫氧核苷通用堿基的性能,能很好的和 4種堿基配對(Martin. F. H.,et al. Nucleic Acids Research,1985,13,8927-8938 ; Ohtsuka, Ε. , et al.The Journal of Biological Chemistry,1985,260,2605—2608 ; Kawase. Y. , et al. NucleicAcids Research,1986,14,7727-7736)。因此在任何位置均能滿足與四個(gè)堿基的雜交效果、準(zhǔn)確性(St印hen C. , et al. Nucleic Acids Research, 1994,22, 131-136),能夠在核酸分析中得到廣泛的應(yīng)用。
發(fā)明內(nèi)容
技術(shù)問題本發(fā)明的目的是提供為新的核酸序列分析技術(shù)所能利用的試劑,為新核酸序列分析技術(shù)的低成本、高速度和高通量奠定基礎(chǔ)。技術(shù)方案本發(fā)明以3’硫代-次黃嘌呤脫氧核苷亞磷酸酰胺單體為基本原料,并用該基本原料合成寡核苷酸序列及其探針用于核酸新測序技術(shù)以及相關(guān)技術(shù)領(lǐng)域,所述3’ 硫代-次黃嘌呤脫氧核苷亞磷酸酰胺單體,結(jié)構(gòu)為
權(quán)利要求
1. 3’硫代-次黃嘌呤脫氧核苷亞磷酸酰胺單體,其特征在于結(jié)構(gòu)為
2.上述3’硫代-次黃嘌呤脫氧核苷亞磷酸酰胺單體在核酸固相合成中的應(yīng)用。
全文摘要
3’硫代-次黃嘌呤脫氧核苷亞磷酸酰胺單體及其應(yīng)用,本發(fā)明化合物合成的寡核苷酸測序及其探針的硫-磷橋鍵在包括無機(jī)重金屬離子(如銀離子、汞離子等),非金屬單質(zhì)(溴、碘等)及其它氧化試劑作用下可以被斷裂,這個(gè)特性可廣泛應(yīng)用于多種核酸檢測方法,而這些檢測方法可以在醫(yī)藥、醫(yī)療、農(nóng)業(yè)生產(chǎn)以及生命科學(xué)研究等多個(gè)方面應(yīng)用。
文檔編號C07H21/04GK102180926SQ20111010815
公開日2011年9月14日 申請日期2011年4月28日 優(yōu)先權(quán)日2011年4月28日
發(fā)明者白云飛, 肖鵬峰, 陸祖宏, 陳婧 申請人:東南大學(xué)