專利名稱:煙堿生物合成odc基因啟動子及其應用的制作方法
技術領域:
本發(fā)明涉及生物基因工程技術領域,具體涉及ー種煙堿生物合成ODC基因啟動子及其應用。
背景技術:
煙堿(Nicotin),又稱尼古丁,化學名稱為I-甲基-2_(2_吡啶基)吡咯烷,分子式為CltlH4N2,是ー種天然存在于煙草中的生物堿,是煙草中特有的。煙堿能夠?qū)θ水a(chǎn)生一定的生理刺激作用,是使煙草具有商品價值的主要因素。隨著煙堿的生物活性越來越受到人們的重視,其應用也越來越廣泛,對它們的開發(fā)已經(jīng)逐漸深入到食品、保健、醫(yī)藥和日用用化エ等多個領域,應用前景非常廣闊。如煙草替代品生產(chǎn)需要大量的煙堿目前對煙草依賴的治療方法包括藥物治療、心理治療、針灸和中藥治療等,經(jīng)美國FDA批準的治療方案和藥物主要有煙堿替代療法如煙堿貼劑、ロ膠、鼻噴霧劑和吸入劑等,采用nAChR抑制劑藥物治療,如安非他酮和注射劑如酒石酸瓦倫尼克林,還有美卡拉、去甲替林、可樂定和抗焦慮藥等,這些煙堿替代物的生產(chǎn)需要大量提取煙堿作為原料;另外,煙堿還廣泛應用于環(huán)保農(nóng)藥的開發(fā)以及特種疾患藥物的生產(chǎn)煙堿系列農(nóng)藥屬植物殺蟲劑,因其具有蒸薰、胃毒、觸殺功能及迅速降解無殘留等特點廣泛用于糧食、油料、蔬菜、水果、牧草等農(nóng)作物的殺蟲劑,是生產(chǎn)綠色食品的理想的高效殺蟲劑和生物性農(nóng)藥,它還廣泛應用在醫(yī)藥エ業(yè)上,是研制治療心血管、皮膚病、蛇毒等疾患藥物的特種原料。還可用其所制得的檸檬酸煙堿應用于高級香煙的品種改良劑組分等,而且隨著煙草エ業(yè)、精細化工、制藥、有機合成、國防、農(nóng)藥等的迅速發(fā)展。市場對煙堿的需求與日俱增,特別是高純煙堿的需求更大。煙堿分子包含一個吡咯烷環(huán)和吡啶環(huán),而吡啶環(huán)是由NAD途徑合成的,吡咯烷環(huán)是由基本氨基酸經(jīng)過中間產(chǎn)物腐胺形成的。參與煙堿生物合成的蛋白包括鳥氨酸脫羧酶(ornithine decarboxylase, ODC),喹啉酸合成酶(quinolinatesynthase, QS),天冬氨酸氧化酶(aspartate oxidase, AO),喹啉酸磷酸核糖基轉(zhuǎn)移酶(quinolinate phospho-ribosyltransferase, QPT),腐胺 N-甲基轉(zhuǎn)移酶(putrescineN-methytransferase, PMT) (Katoh et al. , 2005; Cane et al. , 2OO5), ニ胺氧化酶(diamine oxidase,DAO),編碼這些蛋白的基因都可以在Λ 51ァJVe1Siri1S中找到。其中腐胺N-甲基轉(zhuǎn)移酶由三個基因編碼(PMTI,ΡΜΤ2, ΡΜΤ3) (Shoji et al.,2000)。如果要通過編碼這些酶類的基因來調(diào)控煙堿的合成,則首先應當找到其對應的啟動子。
發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明要解決的技術問題是提供ー種可對煙堿生物合成起調(diào)控作用的ODC基因啟動子及其嵌合基因。為解決上述技術問題,本發(fā)明采用的技術方案是
一種煙堿生物合成ODC基因啟動子,其核苷酸序列為
(I)SEQ ID NO. I所示的核苷酸序列;或(2)SEQ ID NO. I所示的核苷酸序列經(jīng)重復、缺失、替換或移位等常規(guī)技術手段改造而形成的具有同等功能的核苷酸序列。擴增上述ODC基因啟動子的引物對,具有SEQ ID NO. 2和SEQ ID NO. 3所示的核
苷酸序列?!N嵌合基因,其中包含上述煙堿生物合成ODC基因啟動子以及與之可操作連接的、編碼目的基因的序列。ー種植物轉(zhuǎn)化載體,其中包含上所述嵌合基因。ー種轉(zhuǎn)基因植物細胞,其中包含上述嵌合基因。ー種轉(zhuǎn)基因植物組織,其中包含上述嵌合基因。上述煙堿生物合成ODC基因啟動子或上述嵌合基因在調(diào)控煙堿生物合成中的應用。本發(fā)明具有積極有益的效果
1.找到并提取出了煙堿生物合成ODC基因啟動子;
2.煙堿ODC基因啟動子區(qū)域產(chǎn)生基礎水平的轉(zhuǎn)錄,調(diào)控區(qū)域能夠?qū)Σ煌沫h(huán)境條件作出應答,對煙堿合成基因的表達水平做出相應的調(diào)節(jié)(根據(jù)需要進行上調(diào)或下調(diào)),進而對煙草種植生產(chǎn)出適量煙堿含量的煙葉以及生產(chǎn)出高品質(zhì)的煙堿提取原料有著重要的現(xiàn)實
意義。
圖I為PCR擴增煙堿基因啟動子電泳圖,其中左圖以N. tabacum基因組DNA為模板,右圖以N. sylvestris基因組DNA為模板;
圖2為ODC,QPT, AO, QS等基因啟動子中含有的保守的轉(zhuǎn)錄結合位點框架圖;通過使用Genomatix公司的FrameWorker軟件分析單個的轉(zhuǎn)錄結合位點構建的框架圖;轉(zhuǎn)錄結合位點的的組織(包括DNA鏈的特異性,相對順序)都是保守的;不同基因啟動子中轉(zhuǎn)錄結合位點的距離變化非常??;不同顔色代表不同轉(zhuǎn)錄因子的結合位點;單線上面的符合代表轉(zhuǎn)錄結合位點位于有義鏈,而單線下面的符合代表轉(zhuǎn)錄結合位點位于反義鏈;
圖3為ODC,QPT,A0, QS等基因啟動子中發(fā)現(xiàn)的轉(zhuǎn)錄因子示意模式圖;該模式圖由Genomatix公司的Fast軟件分析得到;模式圖中變化距離反應了三個基因啟動子序列中不同的轉(zhuǎn)錄因子結合位點之間的距離。
具體實施例方式以下結合具體實施例進ー步闡述本發(fā)明。下述實施例中所涉及的試驗方法或分析方法,如無特別說明,均為常規(guī)方法,所用試劑如無特別說明,均為市售。實施例I煙堿合成基因的分離、鑒定
煙堿合成基因ODC, DAO, AO, QS, QPT, PMTI, PMT2和PMT3啟動子序列均從N.sylvestris基因組序列中提取得到,這些基因在基因組中的位置如下表I所示。其中煙堿合成基因ODC啟動子序列的如SEQ ID NO. I所示。表I各啟動子在Λ基因組中的位置
權利要求
1.一種煙堿生物合成ODC基因啟動子,其核苷酸序列為 (1)SEQ ID NO. I所示的核苷酸序列;或 (2)SEQ ID NO. I所示的核苷酸序列經(jīng)重復、缺失、替換或移位改造修飾而成的具有同等功能的核苷酸序列。
2.擴增權利要求I所述ODC基因啟動子的引物對,其特征在于,具有SEQID NO. 2和SEQ ID NO. 3所示的核苷酸序列。
3.一種嵌合基因,其中包含權利要求I所述煙堿生物合成ODC基因啟動子以及與之可操作連接的、編碼目的基因的序列。
4.ー種植物轉(zhuǎn)化載體,其中包含權利要求3所述的嵌合基因。
5.ー種轉(zhuǎn)基因植物細胞,其中包含權利要求3所述的嵌合基因。
6.ー種轉(zhuǎn)基因植物組織,其中包含權利要求3所述的嵌合基因。
7.權利要求I所述煙堿生物合成ODC基因啟動子或權利要求3所述嵌合基因在調(diào)控煙堿生物合成中的應用。
全文摘要
本發(fā)明涉及煙堿生物合成ODC基因啟動子及其應用。該煙堿生物合成ODC基因啟動子從N.sylvestris基因組序列中提取得到,具有SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列。煙堿ODC基因啟動子區(qū)域產(chǎn)生基礎水平的轉(zhuǎn)錄,調(diào)控區(qū)域能夠?qū)Σ煌沫h(huán)境條件作出應答,對煙堿合成基因的表達水平做出相應的調(diào)節(jié)(根據(jù)需要進行上調(diào)或下調(diào)),進而對生產(chǎn)出高品質(zhì)的煙堿提取原料有著重要的現(xiàn)實意義。
文檔編號C12N15/11GK102851290SQ20121022140
公開日2013年1月2日 申請日期2012年6月30日 優(yōu)先權日2012年6月30日
發(fā)明者劉國順, 趙銘欽, 楊惠娟, 崔紅, 張松濤, 王景 申請人:河南農(nóng)業(yè)大學