載體設計方法及載體設計裝置的制造方法
【技術領域】
[0001]本發(fā)明涉及生物工程及計算機領域，特別是涉及一種載體設計方法及載體設計裝置。
【背景技術】
[0002]載體，指在基因工程重組DNA(Deoxyribonucleic acid，脫氧核糖核酸，一種分子，可組成遺傳指令，以引導生物發(fā)育與生命機能運作)技術中，將DNA片段(目的基因)轉移至受體細胞的一種能自我復制的DNA分子。依賴限制性核酸內(nèi)切酶、DNA連接酶和其他修飾酶的作用，將適當切割和修飾后的目的基因添加到載體骨架上，構成載體，再導入受體細胞，可實現(xiàn)目的基因在受體細胞內(nèi)的正確表達。載體被廣泛應用于生物醫(yī)學研究領域，其作用之一是作為運載工具，之二是被用于受體細胞內(nèi)對目的基因進行大量復制。
[0003]目前市面上各生物科技公司、研究室及高校產(chǎn)出的載體骨架眾多，多達數(shù)百種，選擇何種載體骨架才能滿足切身需要，是廣大實驗人員困惑不已卻又不得不面對的難題。同時，還會面臨如下問題:
[0004]需要花費大量時間進行調(diào)研和比較，才能選擇出合適的載體骨架；
[0005]載體構成元件多種多樣，也需花費大量時間進行調(diào)研和比較，才能選擇合適的元件，并需將元件按照其屬性一一拼接成為載體；
[0006]載體元件選擇及拼接過程中要么憑空想象元件排列組合進行拼接，要么通過實驗指導載體拼接進程，前者容易導致拼接結果出現(xiàn)偏差，而后者則往往需要花費大量的人力、物力和時間；
[0007]載體構建步驟復雜，對于新手來說無疑是一項無比艱巨的任務。

【發(fā)明內(nèi)容】

[0008]基于此，本發(fā)明實施例的目的在于提供一種載體設計方法，本發(fā)明實施例的另一目的在于提供一種載體設計裝置，其可以大大提高載體設計的效率，且可以提高載體產(chǎn)出數(shù)量及產(chǎn)出的質(zhì)量。
[0009]為達到上述目的，本發(fā)明實施例采用以下技術方案:
[0010]一種載體設計方法，包括步驟:
[0011 ]接收載體骨架選擇指令，所述載體骨架選擇指令中包括載體骨架類型標識；
[0012]根據(jù)所述載體骨架選擇指令獲取與所述載體骨架類型標識對應的各元件以及各元件的元件屬性，所述元件屬性包括長度屬性，所述元件包括基礎元件；
[0013]對各元件的元件屬性進行解析，將各元件的元件屬性解析為適用于顯示元件屬性的元件屬性結構數(shù)據(jù)；
[0014]根據(jù)與所述載體骨架類型標識對應的拼接規(guī)則、各元件的元件屬性，將與所述載體骨架類型標識對應的載體骨架、各元件拼接為完整的載體，得到拼接后載體；
[0015]將拼接后載體按照各元件的長度屬性、元件屬性結構數(shù)據(jù)進行可視化顯示。
[0016]一種載體設計裝置，包括:
[0017]指令接收模塊，用于接收載體骨架選擇指令，所述載體骨架選擇指令中包括載體骨架類型標識；
[0018]元件獲取模塊，用于根據(jù)所述載體骨架選擇指令獲取與所述載體骨架類型標識對應的各元件以及各元件的元件屬性，所述元件屬性包括長度屬性，所述元件包括基礎元件；
[0019]元件屬性解析模塊，用于對各元件的元件屬性進行解析，將各元件的元件屬性解析為適用于顯示元件屬性的元件屬性結構數(shù)據(jù)；
[0020]拼接模塊，用于根據(jù)與所述載體骨架類型標識對應的拼接規(guī)則、各元件的元件屬性，將與所述載體骨架類型標識對應的載體骨架、各元件拼接為完整的載體，得到拼接后載體；
[0021 ]載體顯示模塊，用于將所述拼接后載體按照各元件的元件屬性結構數(shù)據(jù)進行可視化顯示。
[0022]根據(jù)如上所述的本發(fā)明實施例的方案，其將范圍寬廣、雜亂無章的載體數(shù)據(jù)按照統(tǒng)一標準進行分類，將載體骨架類型標識與該載體骨架的元件及元件屬性進行關聯(lián)，在需要設計載體時，基于選取的載體骨架類型標識就可以自動獲得對應的元件及元件屬性，并據(jù)此進行拼接得到完整的拼接后載體進行可視化顯示，實現(xiàn)了基因載體的自動化拼裝和工業(yè)化輸出，徹底顛覆了生物技術領域的傳統(tǒng)格局，大大提高了載體設計的效率，提高了載體產(chǎn)出數(shù)量及產(chǎn)出的質(zhì)量。
【附圖說明】
[0023]圖1是一個實施例中的本發(fā)明方案的工作環(huán)境示意圖；
[0024]圖2是一個實施例中用戶終端的組成結構示意圖；
[0025]圖3是一個實施例中本發(fā)明的的載體設計方法的流程示意圖；
[0026]圖4是另一個實施例中的載體設計方法的流程示意圖；
[0027]圖5是另一個實施例中的載體設計方法的流程示意圖；
[0028]圖6是一個具體示例中的載體設計方法的流程示意圖；
[0029]圖7是一個具體示例中的拼接后載體的可視化示意圖；
[0030]圖8是一個具體示例中酶切分析結果的示意圖；
[0031]圖9是一個實施例中本發(fā)明的載體設計裝置的結構示意圖。
【具體實施方式】
[0032]為使本發(fā)明的目的、技術方案及優(yōu)點更加清楚明白，以下結合附圖及實施例，對本發(fā)明進行進一步的詳細說明。應當理解，此處所描述的【具體實施方式】僅僅用以解釋本發(fā)明，并不限定本發(fā)明的保護范圍。
[0033]圖1示出了本發(fā)明一個實施例中的工作環(huán)境示意圖。如圖1所示，本發(fā)明實施例的方案涉及服務器100以及用戶終端101，用戶終端101可以通過各種網(wǎng)絡通信方式與服務器100進行通信，服務器100上設置有數(shù)據(jù)庫，用以存儲歸納得到的各載體骨架體系以及各載體骨架體系下的載體骨架信息，還存儲各載體的元件以及元件屬性的信息，用戶終端101可以從服務器100獲得所需求的載體骨架以及該載體骨架的元件、元件屬性，并將該載體骨架、該載體骨架的元件拼接為載體進行展示。
[0034]在一些實現(xiàn)方式中，在用戶終端101的存儲空間允許的情況下，用戶終端101也可以從服務器100獲得相關信息后，例如載體骨架體系、載體骨架信息、以及載體骨架的元件以及元件屬性后，可以直接存儲在用戶終端本地，在后續(xù)需要設計載體時，直接從用戶終端本地就可以查詢獲得相應的載體骨架、元件、元件屬性等信息，無需每次設計都連接網(wǎng)絡。
[0035]用戶終端101在一個實施例中的結構示意圖如圖2所示。該用戶終端包括通過系統(tǒng)總線連接的處理器、供電模塊、存儲介質(zhì)、通信接口和內(nèi)存。其中，用戶終端101的存儲介質(zhì)存儲有操作系統(tǒng)和一種載體設計裝置，該裝置用于實現(xiàn)一種載體設計方法。用戶終端的通信接口用于與服務器100通信，該用戶終端101可以采用任何可能的方式來實現(xiàn)，例如PC(personal computer，個人計算機)、筆記本電腦、智能平板、智能手機等等。
[0036]圖3中示出了一個實施例中的載體設計方法的流程示意圖。如圖3所示，本實施例中的載體設計方法包括步驟:
[0037]步驟S301:接收載體骨架選擇指令，所述載體骨架選擇指令中包括載體骨架類型標識；
[0038]步驟S302:根據(jù)所述載體骨架選擇指令獲取與所述載體骨架類型標識對應的各元件以及各元件的元件屬性，所述元件屬性包括長度屬性，所述元件包括基礎元件；
[0039]步驟S303:對各元件的元件屬性進行解析，將各元件的元件屬性解析為適用于顯示元件屬性的元件屬性結構數(shù)據(jù)；
[0040]步驟S304:根據(jù)與所述載體骨架類型標識對應的拼接規(guī)則、各元件的元件屬性，將與所述載體骨架類型標識對應的載體骨架、各元件拼接為完整的載體，得到拼接后載體；
[0041]步驟S305:將拼接后載體根據(jù)各元件的元件屬性結構數(shù)據(jù)進行可視化顯示。其中，在一個具體示例中，可以是將拼接后載體按照各元件的長度屬性模擬成環(huán)圖后，根據(jù)各元件屬性結構數(shù)據(jù)進行可視化顯示。
[0042]根據(jù)如上所述的本發(fā)明實施例的方案，其將范圍寬廣、雜亂無章的載體數(shù)據(jù)按照統(tǒng)一標準進行分類，將載體骨架類型標識與該載體骨架的元件及元件屬性進行關聯(lián)，在需要設計載體時，基于選取的載體骨架類型標識就可以自動獲得對應的元件及元件屬性，并據(jù)此進行拼接得到完整的拼接后載體進行可視化顯示，實現(xiàn)了基因載體的自動化拼裝和工業(yè)化輸出，徹底顛覆了生物技術領域的傳統(tǒng)格局，大大提高了載體設計的效率，提高了載體產(chǎn)出數(shù)量及產(chǎn)出的質(zhì)量。
[0043]結合如上說明，用戶終端可以直接從服務器獲得相關信息，也可以是在獲得相關信息后存儲在本地以供后續(xù)使用，因此，在上述步驟S302中獲取與所述載體骨架類型標識對應的各元件以及各元件的元件屬性時，可以有不同的獲取方式。
[0044]其中一種獲取方式，可以是根據(jù)所述載體骨架選擇指令向服務器發(fā)送載體骨架請求，所述載體骨架請求包括所述載體骨架類型標識;接收服務器根據(jù)所述載體骨架請求返回的載體骨架請求響應，所述載體骨架請求響應包括與所述載體骨架類型標識對應的載體骨架的各元件以及各元件的元件屬性。
[0045]另外一種獲取方式，可以是根據(jù)所述載體骨架選擇指令，從本地數(shù)據(jù)庫獲取與所述載體骨架類型標識對應的載體骨架的各元件以及各元件的元件屬性。
[0046]另一種獲取方式，還可以是在根據(jù)所述載體骨架選擇指令，在本地數(shù)據(jù)庫沒有獲得與所述載體骨架類型標識對應的載體骨架的各元件以及各元件的元件屬性時，再根據(jù)所述載體骨架選擇指令向服務器發(fā)送載體骨架請求。
[0047]在上述步驟S301接收載體骨架選擇指令之前，需要能夠查看載體骨架的相關信息，以便能從中選擇合適的載體骨架，因此，如圖4所示，在另一個實施例中，在上述步驟S301之前，還可以包括步驟:
[0048]步驟S3001:向服務器發(fā)送載體骨架信息獲取請求；
[0049]步驟S3002:接收服務器根據(jù)所述載體骨架信息獲取請求返回的載體骨架信息獲取響應，所述載體骨架信息獲取響應中包括各載體骨架體系的載體骨架信息；
[0050]步驟S3003:對各載體骨架信息進行解析，將各載體骨架信息解析為適合于顯示載體骨架信息的載體骨架結構數(shù)據(jù)；
[0051]步驟S3004:根據(jù)解析后得到的各載體骨架結構數(shù)據(jù)將各