本發(fā)明涉及醫(yī)學(xué)細(xì)胞圖像處理領(lǐng)域,具體涉及一種宮頸細(xì)胞液基涂片人工智能輔助閱片系統(tǒng)。
背景技術(shù):
宮頸癌是發(fā)生于子宮頸部的惡性腫瘤,它與高危型hpv感染存在著密切的關(guān)系。宮頸癌前病變的早期發(fā)現(xiàn)、診斷及治療是降低子宮頸癌發(fā)病率、死亡率的策略之一。宮頸癌篩查方法簡(jiǎn)便經(jīng)濟(jì),很多國(guó)家采用篩查手段控制子宮頸癌發(fā)病率、死亡率,降低其疾病負(fù)擔(dān)。
2008年至2016年,北京市共完成宮頸癌免費(fèi)篩查200余萬人,檢出宮頸癌及癌前病變4000余例,宮頸細(xì)胞學(xué)陽性檢出率2.3%,根據(jù)國(guó)外資料結(jié)合我國(guó)部分地區(qū)的研究數(shù)據(jù),專家推測(cè)我國(guó)正常人群中宮頸細(xì)胞學(xué)的陽性檢出率大致在5-7%之間,而目前北京的檢出率與這一標(biāo)準(zhǔn)差距較大。
宮頸細(xì)胞液基涂片人工智能輔助閱片本身對(duì)于減輕閱片工作者的勞動(dòng)強(qiáng)度、提升閱片準(zhǔn)確率和工作效率、應(yīng)用于大批量的宮頸癌細(xì)胞學(xué)普查等方面將產(chǎn)生積極的作用,其遵循醫(yī)療市場(chǎng)的發(fā)展規(guī)律與需要,符合國(guó)家健康醫(yī)療大數(shù)據(jù)的研究布局,影像信息化和影像智能診斷在醫(yī)療大數(shù)據(jù)產(chǎn)業(yè)中具有重要地位。
美國(guó)和歐洲一些著名的研究機(jī)構(gòu)已經(jīng)開始進(jìn)行宮頸細(xì)胞定量分析和輔助診斷的相關(guān)研究,例如美國(guó)豪洛捷公司的玻片掃描影像分析系統(tǒng),其能判讀宮頸細(xì)胞液基涂片,一方面系統(tǒng)不能給出最終的分級(jí)診斷結(jié)果,其功能是從涂片中選擇22個(gè)視野供醫(yī)師判讀,醫(yī)師可以不對(duì)其他視野進(jìn)行判讀,以提高閱片的效率;另一方面系統(tǒng)只能判斷該公司自己生產(chǎn)的液基涂片,針對(duì)其它公司的液基涂片不能進(jìn)行判斷,這樣就造成了閱片系統(tǒng)的通用性。國(guó)內(nèi)的武漢蘭丁醫(yī)學(xué)專注于宮頸癌篩查,開發(fā)出基于圖像的dna定量分析的自動(dòng)宮頸癌細(xì)胞檢測(cè)系統(tǒng),但其在數(shù)據(jù)分析方面缺乏各異細(xì)胞的特征提取,也未能給出判斷結(jié)果的可解釋性。
現(xiàn)有的宮頸細(xì)胞定量分析和輔助診斷方法仍存在明顯缺陷,宮頸細(xì)胞分析技術(shù)的研究尚處于起步階段,為進(jìn)一步深化宮頸細(xì)胞學(xué)領(lǐng)域的臨床及研究需要,需充分利用宮頸細(xì)胞形態(tài)結(jié)構(gòu)信息、空間鄰域信息和顏色分布信息建立準(zhǔn)確的細(xì)胞圖像分割,充分利用宮頸細(xì)胞數(shù)據(jù)庫和宮頸細(xì)胞臨床診斷規(guī)律建立宮頸細(xì)胞定量分析和智能輔助診斷框架,為基于宮頸細(xì)胞液基涂片人工智能輔助閱片系統(tǒng)提供軟件平臺(tái)。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
本發(fā)明的目的在于,克服目前宮頸細(xì)胞定量分析和輔助診斷存在的上述問題;基于現(xiàn)有宮頸細(xì)胞學(xué)領(lǐng)域知識(shí),通過深度學(xué)習(xí)技術(shù)學(xué)習(xí)并提取宮頸細(xì)胞的關(guān)鍵特征、自動(dòng)分割和識(shí)別液基涂片上細(xì)胞的癌變區(qū)域和類型,最終達(dá)到縮短閱片時(shí)間、降低漏診誤診率的目的,為宮頸細(xì)胞液基涂片人工智能輔助閱片技術(shù)提供解決方案,最終實(shí)現(xiàn)宮頸細(xì)胞定量化評(píng)價(jià)和輔助智能診斷的方法學(xué)突破。
為了實(shí)現(xiàn)上述目的,本發(fā)明提出了一種宮頸細(xì)胞液基涂片人工智能輔助閱片系統(tǒng),所述系統(tǒng)包括:
細(xì)胞圖像采集模塊,用于使用涂片自動(dòng)掃描儀重疊式地進(jìn)行掃描保存細(xì)胞圖像;
細(xì)胞圖像預(yù)處理模塊,用于對(duì)細(xì)胞圖像進(jìn)行預(yù)處理;
細(xì)胞圖像檢測(cè)分割模塊,用于對(duì)圖像細(xì)胞的不同細(xì)胞成分進(jìn)行自動(dòng)檢測(cè),同時(shí)對(duì)同一細(xì)胞成分中細(xì)胞核、細(xì)胞質(zhì)、背景進(jìn)行自動(dòng)分割;采用改進(jìn)的活動(dòng)輪廓模型和快速區(qū)域卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)檢測(cè),又輔以細(xì)胞特征和多尺度水平等算法對(duì)分割結(jié)果進(jìn)行微調(diào)與優(yōu)化;
細(xì)胞快速分級(jí)識(shí)別模塊,用于對(duì)分割后的圖像進(jìn)行識(shí)別,區(qū)分為單個(gè)細(xì)胞或細(xì)胞團(tuán)簇;采用附加知識(shí)領(lǐng)域的雙流卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)和構(gòu)建的細(xì)胞知識(shí)圖譜對(duì)單個(gè)細(xì)胞進(jìn)行分別進(jìn)行分級(jí)識(shí)別,分別得到第一種分級(jí)結(jié)果和第二種分級(jí)結(jié)果;采用細(xì)胞團(tuán)簇的雙流卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型實(shí)現(xiàn)不可分細(xì)胞團(tuán)簇的識(shí)別;和
判讀和后處理模塊,用于對(duì)單個(gè)細(xì)胞的第一種分級(jí)結(jié)果和第二種分級(jí)結(jié)果進(jìn)行聯(lián)合判讀,進(jìn)行沖突處理,得到單個(gè)細(xì)胞的分級(jí)結(jié)果;所述沖突處理用于解決各種特征指向不同的判讀結(jié)果時(shí),綜合各種因素,消除沖突,做出明確可靠的判讀;然后利用知識(shí)圖譜和類活動(dòng)映射實(shí)現(xiàn)宮頸細(xì)胞識(shí)別過程的可讀性、宮頸細(xì)胞識(shí)別結(jié)果的可解釋性。
上述技術(shù)方案中,所述細(xì)胞圖像采集模塊的實(shí)現(xiàn)過程為:采用目鏡四十倍放大,掃描路徑為矩形,掃描方式為重疊式掃描,使得掃描范圍與液基涂片細(xì)胞所在范圍全部覆蓋。
上述技術(shù)方案中,所述預(yù)處理包括:采用雙邊濾波器對(duì)圖像進(jìn)行去噪,該濾波器是由兩個(gè)函數(shù)構(gòu)成:一個(gè)函數(shù)是由幾何空間距離決定濾波器系數(shù),另一個(gè)由像素差值決定濾波器系數(shù);然后使用形態(tài)學(xué)處理對(duì)圖像的邊緣進(jìn)行修補(bǔ),填充空洞并去除細(xì)的連接,最后使用直方圖均衡化來增加細(xì)胞核與細(xì)胞質(zhì)的對(duì)比度。
上述技術(shù)方案中,所述細(xì)胞圖像檢測(cè)分割模塊的具體實(shí)現(xiàn)步驟為:
步驟s1)對(duì)預(yù)處理后的細(xì)胞圖像進(jìn)行前背景粗分割,提取細(xì)胞所屬的區(qū)域;
步驟s2)對(duì)粗分割后的細(xì)胞圖像進(jìn)行細(xì)胞成分的檢測(cè)分割,使用快速區(qū)域卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)分割出不同類型的細(xì)胞;
步驟s3)檢測(cè)并分割宮頸細(xì)胞細(xì)胞核;
步驟s4)根據(jù)細(xì)胞核的特征參數(shù)篩選細(xì)胞核,得到最終的候選細(xì)胞核;
步驟s5)判斷步驟s2)中得到的細(xì)胞類型是否為細(xì)胞團(tuán)簇,如果不是,則使用活動(dòng)輪廓模型以及先驗(yàn)?zāi)0暹M(jìn)行細(xì)胞質(zhì)區(qū)域的分割;否則,轉(zhuǎn)入步驟s6);
步驟s6)綜合細(xì)胞核與細(xì)胞質(zhì)的分割結(jié)果與領(lǐng)域知識(shí)進(jìn)行后處理,完成整個(gè)宮頸細(xì)胞的有效分割。
上述技術(shù)方案中,所述快速區(qū)域卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)選用卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的vgg16的網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu),輸入圖像的大小為515*512,最終細(xì)胞成分的檢測(cè)類別分為5類:鱗細(xì)胞、腺細(xì)胞、頸管細(xì)胞、化生細(xì)胞以及背景素質(zhì),除鱗細(xì)胞和背景素質(zhì)外的細(xì)胞成分都定義為不可分的細(xì)胞團(tuán)簇。
上述技術(shù)方案中,所述步驟s5)中的使用活動(dòng)輪廓模型以及先驗(yàn)?zāi)0暹M(jìn)行細(xì)胞質(zhì)區(qū)域的分割的具體過程為:
采用了改進(jìn)的活動(dòng)輪廓模型,加上能量函數(shù)以及形狀先驗(yàn)信息,迭代地進(jìn)行輪廓的優(yōu)化,得到細(xì)胞質(zhì)的精確邊界;
能量函數(shù)e(u)為:
e(u)=λ1es(u)+r(u)
其中es(u)是形狀先驗(yàn),r(u)是正則項(xiàng),用于保證分割邊界的平滑性,λ1為可學(xué)習(xí)的參數(shù);形狀先驗(yàn)es(u)為:
其中,h為黑塞矩陣。
上述技術(shù)方案中,所述細(xì)胞圖像檢測(cè)分割模塊的具體實(shí)現(xiàn)步驟為:
步驟1)對(duì)分割后的宮頸細(xì)胞圖像進(jìn)行預(yù)處理操作;
步驟2)判斷預(yù)處理后的細(xì)胞圖像是否為單個(gè)細(xì)胞,如果是,轉(zhuǎn)入步驟3),否則,該圖像為不可分的細(xì)胞團(tuán)簇,轉(zhuǎn)入步驟6);
步驟3)確定可計(jì)算的細(xì)胞參數(shù),然后計(jì)算細(xì)胞參數(shù)特征;
步驟4)建立細(xì)胞知識(shí)圖譜推理判斷模型,并將細(xì)胞參數(shù)特征輸入該模型,得到單個(gè)細(xì)胞的第一種分級(jí)結(jié)果;
步驟5)構(gòu)建附加領(lǐng)域知識(shí)的雙流卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型,將細(xì)胞參數(shù)特征和細(xì)胞圖像輸入雙流卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型,得到單個(gè)細(xì)胞的第二種分級(jí)結(jié)果;
步驟6)構(gòu)建細(xì)胞團(tuán)簇的雙流卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型,并使用該模型對(duì)不可分細(xì)胞團(tuán)簇進(jìn)行細(xì)胞團(tuán)簇的分級(jí)識(shí)別,得到細(xì)胞團(tuán)簇的分級(jí)結(jié)果。
上述技術(shù)方案中,所述附加領(lǐng)域知識(shí)的雙流卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的一路輸入為步驟3)得到的細(xì)胞參數(shù)特征,另外一路輸入為單個(gè)細(xì)胞圖像,大小統(tǒng)一歸一化為256*256像素值,經(jīng)過5個(gè)級(jí)聯(lián)的卷積池化組合模塊隱式地提取到細(xì)胞圖像的特征;其中最重要的卷積操作的卷積核大小采用7*7大小,步長(zhǎng)選擇大小為1,特征圖個(gè)數(shù)選取為96個(gè),該卷積操作為:
上式中,m表示選擇的輸入特征圖的集合,wij表示權(quán)重,bj為每一個(gè)特征圖輸出加上的一個(gè)額外偏置,然后將提取的1096維特征加上細(xì)胞領(lǐng)域知識(shí)可計(jì)算的20維特征拼接到一起,輸入到雙流卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的全連接層和分類層。
上述技術(shù)方案中,所述細(xì)胞團(tuán)簇的雙流卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的一路輸入為:細(xì)胞核之間的排列規(guī)則的特征,另外一路輸入是與該細(xì)胞參數(shù)對(duì)應(yīng)的細(xì)胞團(tuán)簇的宮頸細(xì)胞,宮頸細(xì)胞輸入大小統(tǒng)一歸一化為512*512像素值,經(jīng)過8個(gè)級(jí)聯(lián)的卷積池化組合模塊隱式地提取到細(xì)胞圖像的特征;其中最重要的卷積操作的卷積核大小采用5*5大小,步長(zhǎng)選擇大小為2,特征圖個(gè)數(shù)選取為108個(gè)。
本發(fā)明的有益效果是:
1、本發(fā)明的系統(tǒng)針對(duì)病變宮頸細(xì)胞系統(tǒng)具有高敏感性,針對(duì)正常宮頸細(xì)胞具有高特異性,整個(gè)輔助閱片系統(tǒng)無需人工參與,大大減輕閱片工作者的勞動(dòng)強(qiáng)度。
附圖說明
圖1為本發(fā)明的宮頸細(xì)胞液基涂片人工智能輔助閱片系統(tǒng)的組成圖;
圖2為本發(fā)明的宮頸細(xì)胞圖像檢測(cè)分割模塊的示意圖;
圖3為本發(fā)明的宮頸細(xì)胞快速分級(jí)識(shí)別模塊的示意圖。
具體實(shí)施方式
下面結(jié)合附圖對(duì)本發(fā)明的較佳實(shí)施例進(jìn)行詳細(xì)闡述,以使本發(fā)明的優(yōu)點(diǎn)和特征能更易于被本領(lǐng)域技術(shù)人員理解,從而對(duì)本發(fā)明的保護(hù)范圍做出更為清楚明確的界定。
如圖1所示,一種宮頸細(xì)胞液基涂片人工智能輔助閱片系統(tǒng),所述系統(tǒng)包括:
細(xì)胞圖像采集模塊,用于使用涂片自動(dòng)掃描儀重疊式地進(jìn)行掃描保存細(xì)胞圖像;其中,采用目鏡四十倍放大,掃描路徑為矩形,掃描方式為重疊式掃描,使得掃描范圍與液基涂片細(xì)胞所在范圍可以全部覆蓋;
例如,針對(duì)一幅2萬*2萬像素的圖像可以得到20張掃描后的宮頸細(xì)胞圖像。
細(xì)胞圖像預(yù)處理模塊,用于對(duì)細(xì)胞圖像進(jìn)行預(yù)處理,包括:采用雙邊濾波器對(duì)圖像進(jìn)行去噪,該濾波器是由兩個(gè)函數(shù)構(gòu)成:一個(gè)函數(shù)是由幾何空間距離決定濾波器系數(shù),另一個(gè)由像素差值決定濾波器系數(shù);然后使用形態(tài)學(xué)處理對(duì)圖像的邊緣進(jìn)行修補(bǔ),填充空洞并去除細(xì)的連接,最后使用直方圖均衡化來增加細(xì)胞核與細(xì)胞質(zhì)的對(duì)比度。
細(xì)胞圖像檢測(cè)分割模塊,用于對(duì)圖像細(xì)胞的不同細(xì)胞成分進(jìn)行自動(dòng)檢測(cè),同時(shí)對(duì)同一細(xì)胞成分中細(xì)胞核、細(xì)胞質(zhì)、背景進(jìn)行自動(dòng)分割;采用改進(jìn)的活動(dòng)輪廓模型和快速區(qū)域卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)檢測(cè),又輔以細(xì)胞特征和多尺度水平等算法對(duì)分割結(jié)果進(jìn)行微調(diào)與優(yōu)化;
如圖2所示,具體實(shí)現(xiàn)步驟為:
步驟s1)對(duì)預(yù)處理后的細(xì)胞圖像進(jìn)行前背景粗分割,提取細(xì)胞所屬的區(qū)域;
采用9個(gè)閾值進(jìn)行整個(gè)細(xì)胞圖像的噪聲的去除;然后采用sift邊緣檢測(cè)和多尺度分水嶺算法得到前景區(qū)域,sift對(duì)旋轉(zhuǎn)、尺度縮放、亮度變化保持不變性,對(duì)視角變化、仿射變換、噪聲也保持一定程度的穩(wěn)定性;最后針對(duì)分割出的區(qū)域進(jìn)行優(yōu)化微調(diào),采用k均值聚類算法將鄰近的像素合并,本發(fā)明聚類算法的團(tuán)簇?cái)?shù)選擇為3,即分為細(xì)胞質(zhì)、細(xì)胞核和背景三個(gè)類別。
步驟s2)對(duì)粗分割后的細(xì)胞圖像進(jìn)行細(xì)胞成分的檢測(cè)分割,使用快速區(qū)域卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)分割出不同類別的細(xì)胞及背景素質(zhì);
首先針對(duì)訓(xùn)練樣本進(jìn)行數(shù)據(jù)的清洗整理,再采用深度學(xué)習(xí)算法中的快速區(qū)域卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行細(xì)胞成分的檢測(cè)分割。其訓(xùn)練階段選擇端到端的訓(xùn)練方式,模型選用了卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的vgg16的網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu),輸入圖像的大小為515*512,最終細(xì)胞成分的檢測(cè)類別分為5類:鱗細(xì)胞、腺細(xì)胞、頸管細(xì)胞、化生細(xì)胞以及背景素質(zhì),本發(fā)明中將除鱗細(xì)胞外的四種類別的細(xì)胞成分都定義為不可分的細(xì)胞團(tuán)簇??紤]到人工智能輔助閱片后續(xù)的分級(jí)識(shí)別步驟,此處將不可分的細(xì)胞團(tuán)簇區(qū)域詳細(xì)分為腺細(xì)胞、頸管細(xì)胞、化生細(xì)胞以及背景素質(zhì)四類,其中背景素質(zhì)不屬于細(xì)胞范疇,不參與后續(xù)的分級(jí)識(shí)別。
步驟s3)檢測(cè)并分割宮頸細(xì)胞細(xì)胞核;
采用了改進(jìn)的隨機(jī)森林的算法,通過提取細(xì)胞核的5種特征進(jìn)行細(xì)胞核區(qū)域的分割,森林中樹的個(gè)數(shù)選擇20,每次選擇最優(yōu)特征時(shí)的特征個(gè)數(shù)選擇為logn,葉子節(jié)點(diǎn)的最小個(gè)數(shù)選擇為3;
為了防止漏掉細(xì)胞核區(qū)域又輔以多尺度分水嶺算法進(jìn)行細(xì)胞核的檢測(cè),通過選取5種不同的參數(shù)進(jìn)行合并,將待分割圖像分為合并程度高和合并程度低的不同尺度的細(xì)胞圖像,再將兩者的檢測(cè)到的結(jié)果結(jié)合起來,作為細(xì)胞核的候選區(qū)域。
步驟s4)根據(jù)細(xì)胞核的特征參數(shù)篩選細(xì)胞核,得到最終的候選細(xì)胞核;
依據(jù)了細(xì)胞核的特征參數(shù),包含細(xì)胞核大小,細(xì)胞核的圓形度,細(xì)胞核的深度可計(jì)算特征。例如細(xì)胞核的大小的參數(shù)是通過直接計(jì)算細(xì)胞核區(qū)域邊界內(nèi)的像素的總和來表示,具體做法如式1。
其中f(x,y)為二值圖像上某點(diǎn)(x,y)的像素值,取值為1時(shí)表示該像素點(diǎn)屬于目標(biāo)區(qū)域,取值為0時(shí)表示該像素點(diǎn)屬于背景區(qū)域,其面積就是統(tǒng)計(jì)f(x,y)為1的像素個(gè)數(shù)。
步驟s5)判斷步驟s2)中得到的細(xì)胞類型是否為細(xì)胞團(tuán)簇,如果不是,則使用活動(dòng)輪廓模型以及先驗(yàn)?zāi)0暹M(jìn)行細(xì)胞質(zhì)區(qū)域的分割;否則,轉(zhuǎn)入步驟s6);
采用了改進(jìn)的活動(dòng)輪廓模型,加上能量函數(shù)以及形狀先驗(yàn)信息,迭代的進(jìn)行輪廓的優(yōu)化,得到細(xì)胞質(zhì)的精確邊界;
能量函數(shù)e(u)為:
e(u)=λ1es(u)+r(u)
其中es(u)是本發(fā)明提出使用的形狀先驗(yàn),r(u)是正則項(xiàng),保證分割邊界的平滑性,λ1為可學(xué)習(xí)的參數(shù);形狀先驗(yàn)es(u)為:
其中h為黑塞矩陣(hessianmatrix)。
步驟s6)綜合細(xì)胞核與細(xì)胞質(zhì)的分割結(jié)果與領(lǐng)域知識(shí)進(jìn)行后處理,完成整個(gè)宮頸細(xì)胞的有效分割。
針對(duì)上述步驟的分割結(jié)果進(jìn)行后處理,主要使用醫(yī)學(xué)圖像處理中的形態(tài)學(xué)操作對(duì)圖像的邊緣進(jìn)行修補(bǔ),填充空洞并去除細(xì)的連接,主要采用開操作和閉操作,其中模板的參數(shù)設(shè)置為[33]的大小,以及濾波去噪等方法進(jìn)行邊界的平滑,其中參數(shù)的設(shè)置w為2,方差sigma采用[20.1],從而得到最終的精準(zhǔn)邊界信息。
細(xì)胞快速分級(jí)識(shí)別模塊,用于對(duì)分割后的圖像進(jìn)行識(shí)別,區(qū)分為單個(gè)細(xì)胞或細(xì)胞團(tuán)簇;采用附加知識(shí)領(lǐng)域的雙流卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)和構(gòu)建的細(xì)胞知識(shí)圖譜對(duì)單個(gè)細(xì)胞進(jìn)行分級(jí)識(shí)別;采用細(xì)胞團(tuán)簇的雙流卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型實(shí)現(xiàn)不可分細(xì)胞團(tuán)簇的識(shí)別;
如圖3所示,具體實(shí)現(xiàn)步驟為:
步驟1)對(duì)分割后的宮頸細(xì)胞圖像進(jìn)行預(yù)處理操作;
掃描分割后的宮頸細(xì)胞區(qū)域,并進(jìn)行細(xì)胞邊界像素值填充,將細(xì)胞邊界外的像素值填充為0,然后將填充像素值后的細(xì)胞圖像統(tǒng)一歸一化至256*256的像素值大小。
步驟2)判斷預(yù)處理后的細(xì)胞圖像是否為單個(gè)細(xì)胞,如果是,轉(zhuǎn)入步驟3),否則,該圖像為不可分的細(xì)胞團(tuán)簇,轉(zhuǎn)入步驟7);
采用圖像處理中的分水嶺算法實(shí)現(xiàn),若細(xì)胞圖像中的細(xì)胞核數(shù)目為1,則判斷是單個(gè)細(xì)胞。
步驟3)確定可計(jì)算的細(xì)胞參數(shù),包括細(xì)胞核的大小、深度、形狀,細(xì)胞質(zhì)的大小、形狀和核漿比,然后計(jì)算細(xì)胞參數(shù)特征;
以細(xì)胞核的大小為例,細(xì)胞核的大小參數(shù)是通過直接計(jì)算細(xì)胞核區(qū)域邊界內(nèi)的像素的總和來表示:
其中f(x,y)為二值圖像上某點(diǎn)(x,y)的像素值,取值為1時(shí)表示該像素點(diǎn)屬于目標(biāo)區(qū)域,取值為0時(shí)表示該像素點(diǎn)屬于背景區(qū)域,其面積就是統(tǒng)計(jì)f(x,y)為1的像素個(gè)數(shù)。
步驟4)建立細(xì)胞知識(shí)圖譜推理判斷模型,并將細(xì)胞參數(shù)特征輸入該模型,得到細(xì)胞的第一種分級(jí)結(jié)果;
步驟5)構(gòu)建附加領(lǐng)域知識(shí)的雙流卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型,將細(xì)胞參數(shù)特征和細(xì)胞圖像輸入雙流卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型,得到細(xì)胞的第二種分級(jí)結(jié)果;
如圖2所示,雙流卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的一路輸入為步驟3)得到的細(xì)胞參數(shù)特征,另外一路輸入為單個(gè)細(xì)胞圖像,大小統(tǒng)一歸一化為256*256像素值,經(jīng)過5個(gè)級(jí)聯(lián)的卷積池化組合模塊隱式地提取到細(xì)胞圖像的特征。其中最重要的卷積操作的卷積核大小采用7*7大小,步長(zhǎng)選擇大小為1,特征圖個(gè)數(shù)選取為96個(gè),該卷積操作為:
m表示選擇的輸入特征圖的集合,wij表示權(quán)重,bj為每一個(gè)特征圖輸出加上的一個(gè)額外偏置,然后將提取的1096維特征加上細(xì)胞領(lǐng)域知識(shí)可計(jì)算的20維特征拼接到一起,輸入到雙流卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的全連接層和分類層。根據(jù)tbs標(biāo)準(zhǔn)診斷,將不同細(xì)胞的分級(jí)識(shí)別結(jié)合在一起,一共分為9類。
如圖3所示,細(xì)胞學(xué)特征完全根據(jù)tbs判斷標(biāo)準(zhǔn),抽取是采用判斷標(biāo)準(zhǔn)的語言。細(xì)胞可以在不同抽象層次上進(jìn)行多種分類,從是否存在病變的層次上,細(xì)胞主要分為正常細(xì)胞和異常細(xì)胞兩大類,正常細(xì)胞,包括柱狀細(xì)胞、中層細(xì)胞、表層細(xì)胞;異常細(xì)胞包括輕度鱗狀上皮內(nèi)病變細(xì)胞、中度鱗狀上皮內(nèi)病變細(xì)胞、重度鱗狀上皮內(nèi)病變細(xì)胞、鱗狀細(xì)胞癌細(xì)胞。
判讀規(guī)則庫也完全依據(jù)閱片醫(yī)生的判讀過程與思想,例如細(xì)胞質(zhì)的顏色特征映射,對(duì)于宮頸病變有判讀意義的顏色有藍(lán)色、粉紅色、橘黃色,細(xì)胞學(xué)術(shù)語通常稱為嗜堿性、嗜酸性、嗜橘黃色,即嗜堿性的細(xì)胞細(xì)胞質(zhì)表現(xiàn)為藍(lán)色、嗜酸性細(xì)胞細(xì)胞質(zhì)表現(xiàn)為粉紅色、嗜橘黃色細(xì)胞細(xì)胞質(zhì)表現(xiàn)為橘黃色。
步驟6)構(gòu)建細(xì)胞團(tuán)簇的雙流卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型,并使用該模型對(duì)不可分細(xì)胞團(tuán)簇進(jìn)行團(tuán)簇細(xì)胞的分級(jí)識(shí)別;
細(xì)胞團(tuán)簇的雙流卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的一路輸入為:細(xì)胞核之間的排列規(guī)則的特征,另外一路輸入是與該細(xì)胞參數(shù)對(duì)應(yīng)的細(xì)胞團(tuán)簇的宮頸細(xì)胞,本發(fā)明將宮頸細(xì)胞輸入大小統(tǒng)一歸一化為512*512像素值,經(jīng)過8個(gè)級(jí)聯(lián)的卷積池化組合模塊隱式地提取到細(xì)胞圖像的特征。其中最重要的卷積操作的卷積核大小采用5*5大小,步長(zhǎng)選擇大小為2,特征圖個(gè)數(shù)選取為108個(gè)。
判讀和后處理模塊,用于對(duì)單個(gè)細(xì)胞的第一種分級(jí)結(jié)果和第二種分級(jí)結(jié)果進(jìn)行聯(lián)合判讀,進(jìn)行沖突處理,得到單個(gè)細(xì)胞的分級(jí)結(jié)果;利用知識(shí)圖譜和了cam(classactivationmapping,類活動(dòng)映射)的方法實(shí)現(xiàn)宮頸細(xì)胞識(shí)別過程的可讀性、宮頸細(xì)胞識(shí)別結(jié)果的可解釋性。
例如某個(gè)細(xì)胞的第一種分級(jí)結(jié)果和第二種分級(jí)結(jié)果都為鱗狀細(xì)胞癌的結(jié)果,那么則判讀該細(xì)胞為鱗狀細(xì)胞癌。
沖突處理主要解決各種特征指向不同的判讀結(jié)果時(shí),綜合各種因素,消除沖突,做出明確可靠的判讀。例如某個(gè)細(xì)胞經(jīng)過第一分級(jí)(雙流卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型)得到的結(jié)果為鱗狀細(xì)胞癌,而經(jīng)過第二分級(jí)(知識(shí)圖譜模型)得到的結(jié)果為低級(jí)別鱗狀上皮內(nèi)病變,此種情況屬于結(jié)果沖突,針對(duì)沖突的處理本發(fā)明采用的方式是將該細(xì)胞標(biāo)注出來,最終的結(jié)果可由閱片醫(yī)師來決定。
以上所述的具體實(shí)施方式,對(duì)本發(fā)明的目的、技術(shù)方案和有益效果進(jìn)行了進(jìn)一步詳細(xì)說明,所應(yīng)理解的是,以上所述僅為本發(fā)明的具體實(shí)施方式而已,并不用于限定本發(fā)明的保護(hù)范圍,凡在本發(fā)明的精神和原則之內(nèi),所做的任何修改、等同替換、改進(jìn)等,均應(yīng)包含在本發(fā)明的保護(hù)范圍之內(nèi)。