專利名稱：用于測量生物標(biāo)記概況的系統(tǒng)和方法
用于測量生物標(biāo)記概況的系統(tǒng)和方法本申請含有2009年8月25日創(chuàng)建、大小148，658字節(jié)、以電子形式作為文件名 71021-W0-PCT_SequenceListing_ST25. txt提交的序列表。序列表在此整體引入作為參考。
1發(fā)明領(lǐng)域本發(fā)明提供了通過概況分析且比較相對于患病受試者的在對照受試者中基因的 mRNA表達水平，鑒定在患有病癥的受試者中的轉(zhuǎn)錄概況的方法和組合物。本發(fā)明進一步提供了通過測定與此類受試者中的生物標(biāo)記相關(guān)的轉(zhuǎn)錄概況，用于預(yù)測和診斷受試者中的病癥例如情感障礙的方法和組合物。背景技術(shù)：
本申請自始至終通過在括號內(nèi)引用提及各種出版物。這些出版物的公開內(nèi)容整體在此引入本申請內(nèi)作為參考，以便更全面地描述本發(fā)明所屬領(lǐng)域狀態(tài)。目前精神病診斷分類，特別是用于情感障礙的那些，缺乏獨特的臨床描述，并且不包括生物學(xué)特征以描繪一種診斷實體與另一種。盡管今天的分類法允許進一步指定情感障礙例如主要性抑郁障礙的臨床特征，但標(biāo)準(zhǔn)仍是主要討論的問題且不一定遵循生物學(xué)原理 (Parker，等人 Am. J. Psychiatry 2000,157(8) :1195-1203)。在情感障礙中，存在許多臨床分割，例如雙相型障礙I和II、精神抑郁癥和主要性抑郁障礙，包括精神病性抑郁癥、重度與輕度或中度抑郁癥比較、憂郁癥與非典型抑郁癥比較等。像這樣，對于這些分割沒有描述獨特的生物學(xué)標(biāo)記或生物標(biāo)記。此外，缺乏關(guān)于特定病癥的分割可以具有治療牽涉。此外，共病對于無法描繪2種病癥存在的醫(yī)生是成問題的?？偟膩碚f，精神病學(xué)中的臨床評估和非特異性臨床診斷標(biāo)準(zhǔn)突出了關(guān)于生物學(xué)標(biāo)記的需要，以便識別共享類似生物學(xué)的需要。這看起來是關(guān)于情感障礙的特定困境，因為存在關(guān)于顯示臨床差異和獨特生物學(xué)特征的亞型的新出現(xiàn)證據(jù)(Gold和Chrousos，Mol. Psychiatry 2002,7(3) :254-275) 0然而，迄今為止，沒有生物學(xué)標(biāo)記一致地顯示描繪就情感障礙而言的患者群體的分割。先前研究已探索了測量具有抑郁癥的受試者與對照受試者比較，或在治療前和后的受試者中的生物學(xué)改變的測試，例如地塞米松/促腎上腺皮質(zhì)素釋放激素(DEX/CRH)測試。然而，此類測試已在少量患者中進行檢查，仍未再現(xiàn)，和/或仍未使生物學(xué)讀數(shù)與特
(Ising， Μ.等)κ, Biol. Psychiatry, 2006 Nov 20, e-pub ahead of print ； Kunugi, H.等人，Neuropsychopharm. 2006,31 (1) :212-20)。這是適當(dāng)?shù)模驗榕R床上相關(guān)的生物標(biāo)記必須與特定生物學(xué)和特定表型相關(guān)，并且理想地，應(yīng)通過治療回到正常水平。對于糖尿病、阿爾茨海默氏病和癌癥已鑒定了蛋白質(zhì)生物標(biāo)記(參見例如，美國專利號7，125，663 ；7, 097，989 ；7, 074，576 ；和6，925，389。)然而，用于檢測蛋白質(zhì)生物標(biāo)記的方法，例如質(zhì)譜法和與抗體特異性結(jié)合，通常獲得不能再現(xiàn)的數(shù)據(jù)，并且這些方法不利于高流通量使用。使用微陣列的高流通量表達分析方法已用于評估基因表達改變，具有混合結(jié)果或無關(guān)結(jié)果(Brenner，S.等人 Nat Biotechnol. 2000,18(6) 597-8 ；Schena 等人Science. 1995,270(5235) :467-70 ；Velculescu, V. Ε.等人，Science. 1995,270(5235) 484-7)。由于測量的基因表達與受試者數(shù)目的大量比，并且考慮到抑郁性病癥的異質(zhì)性，對于微陣列數(shù)據(jù)預(yù)期大量假陽性。(關(guān)于綜述，參見Iwamoto K和Kato T.， Neuroscientist 2006,12(4) :349-61 ；Bunney WE, ^A, Am J Psychiatry2003,160(4) 657-66 ；和 Iga J, Ueno S 和 Ohmori T.，Ann Med 2008,40(5) :336_42。)Sibille 等人 (Neuropsychopharm. 2004,29(2) :351-61)執(zhí)行了大規(guī)?；蚪M分析，然而，未發(fā)現(xiàn)關(guān)于與抑郁癥和自殺相關(guān)的分子差異證據(jù)，并且無法再現(xiàn)關(guān)于先前發(fā)現(xiàn)與抑郁癥相關(guān)的基因在表達水平中的改變。因為此類困難，一致概況仍未得到鑒定。關(guān)于多重相關(guān)基因的聚焦陣列和qPCR已用于鑒定應(yīng)激相關(guān)基因，但這些研究仍未鑒定與抑郁癥相關(guān)的診斷概況(Rokutan等人，J.Med. Invest. 2005，52 (3-4) :137-44; Ohmori等人，J. Med. Invest. 2005, 52 (Suppl) :266-71)。在大鼠腦區(qū)域中，特定基因的轉(zhuǎn)錄改變已牽涉情緒和焦慮的控制，然而，這些改變與人血樣無關(guān)(W02007106685A2)。3發(fā)明概述本發(fā)明提供了診斷測試受試者中的情感障礙的方法，該方法包括評估測試受試者的生物標(biāo)記概況中的多個生物標(biāo)記的多個特征是否滿足值集合，其中滿足該值集合預(yù)測測試受試者具有所述情感障礙，并且其中多個特征是多個生物標(biāo)記的可測量方面，多個生物標(biāo)記包含表IA中列出的至少2個生物標(biāo)記。本發(fā)明還提供了計算機程序產(chǎn)品，其中所述計算機程序產(chǎn)品包含計算機可讀存儲介質(zhì)和其中嵌入的計算機程序機制，所述計算機程序機制包含用于執(zhí)行診斷方法的指令。本發(fā)明的一個方面提供了計算機，所述計算機包含一個或多個處理器和與一個或多個處理器連接的存儲器，所述存儲器存儲用于執(zhí)行診斷方法的指令。本發(fā)明的另一個方面提供了測定測試受試者顯示出情感障礙癥狀的可能性的方法，該方法包括評估測試受試者的生物標(biāo)記概況中的多個生物標(biāo)記的多個特征是否滿足值集合，其中滿足該值集合提供了測試受試者顯示出情感障礙癥狀的所述可能性，并且其中多個特征是多個生物標(biāo)記的可測量方面，所述多個生物標(biāo)記包含表IA中列出的至少2個生物標(biāo)記。在另一個方面，本發(fā)明提供了其為關(guān)于從多個對照受試者中收集的每種生物樣品的轉(zhuǎn)錄分析測量的轉(zhuǎn)錄概況。例如，本發(fā)明提供了其為關(guān)于從多個抑郁、嚴(yán)重抑郁或雙相型受試者中收集的每種生物樣品的轉(zhuǎn)錄分析測量的轉(zhuǎn)錄概況。本發(fā)明進一步提供了其為關(guān)于從多個邊緣型人格障礙受試者中收集的每種生物樣品的轉(zhuǎn)錄分析測量的轉(zhuǎn)錄概況。本發(fā)明還提供了其為關(guān)于從多個PTSD受試者中收集的每種生物樣品的轉(zhuǎn)錄分析測量的轉(zhuǎn)錄概況。本發(fā)明還提供了包含存儲在例如數(shù)據(jù)庫中的第一批多個對照受試者的集體測量的轉(zhuǎn)錄概況。使用分類算法使包含第二批多個受試者例如患病受試者的集體測量的轉(zhuǎn)錄概況與第一批多個對照受試者的轉(zhuǎn)錄概況比較。分類算法提供了使受試者各自分類的輸出。本發(fā)明提供了用于診斷情感障礙的方法，通過鑒定患者中的轉(zhuǎn)錄概況，使此類轉(zhuǎn)錄概況與對照受試者或?qū)φ帐茉囌呓M的概況比較，從而基于轉(zhuǎn)錄概況中改變的存在或不存在診斷患者的情感障礙。本發(fā)明的一個方面提供了用于診斷具有情感障礙的受試者的方法，其包括
(a)從多個對照受試者和多個患病受試者中獲得生物樣品；(b)測量在多個對照受試者和多個患病受試者樣品中基因的mRNA表達水平，其中所述基因選自 ADA、ARRB1、ARRB2、CD8a、CD8b、CREB1、CREB2、DPP4、ERK1、ERK2、Gi2、Gs、GR、 IL1 b、IL6、IL8、INDO、MAPK14、MAPK8、MKP1、MR、ODC1、P2X7、PBR、PREP、RGS2、S1OOA10、SERT 禾口 VMAT2 ；(c)收集關(guān)于來自多個對照受試者和多個患病受試者的每種基因的mRNA表達水平且將其作為mRNA數(shù)據(jù)存儲在計算機介質(zhì)中；(d)借助于分類算法加工此類mRNA數(shù)據(jù)；和(e)提供使受試者分類的輸出數(shù)據(jù)，從而診斷受試者具有情感障礙。本發(fā)明進一步提供了用于預(yù)測受試者對情感障礙的易感性的方法，通過使受試者選自下述的基因轉(zhuǎn)錄概況與多個對照受試者的基因轉(zhuǎn)錄概況比較來進行ADA、ARRBU ARRB2、CD8a、CD8b、CREBl、CREB2、DPP4、ERKl、ERK2、Gi2、Gs、GR、ILlb、IL6、IL8、INDO、 MAPK14、MAPK8、MKP1、MR、0DC1、P2X7、PBR、PREP、RGS2, S100A10、SERT 和 VMAT2。本發(fā)明的一個方面提供了用于預(yù)測受試者顯示出情感障礙癥狀的可能性的方法， 其包括(a)從多個對照受試者和多個患病受試者中獲得生物樣品；(b)測量在多個對照受試者和多個患病受試者樣品中基因的mRNA表達水平，其中所述基因選自 ADA、ARRB1、ARRB2、CD8a、CD8b、CREB1、CREB2、DPP4、ERK1、ERK2、Gi2、Gs、GR、 IL1 b、IL6、IL8、INDO、MAPK14、MAPK8、MKP1、MR、ODC1、P2X7、PBR、PREP、RGS2、S1OOA10、SERT 禾口 VMAT2 ；(c)收集關(guān)于來自多個對照受試者和多個患病受試者的每種基因的mRNA表達水平且將其作為mRNA數(shù)據(jù)存儲在計算機介質(zhì)中；(d)借助于分類算法加工此類mRNA數(shù)據(jù)；和(e)提供使受試者分類的輸出數(shù)據(jù)，從而預(yù)測受試者顯示出情感障礙癥狀的可能性。4附圖簡述

圖1是依照本發(fā)明的一個實施方案的計算機系統(tǒng)舉例說明。圖2A和2B。如通過qPCR方法經(jīng)由拷貝/ng⑶R測量的(ρ < 0. 001 ；曼-懷二氏 (Mann Whitney)檢驗)，分別顯示在對照受試者與抑郁受試者比較中ARRBl ( β -抑制蛋白 1)和Gi2(鳥嘌呤核苷酸結(jié)合蛋白ai2)的相對mRNA水平的散點圖。圖3A和;3B。如通過qPCR方法經(jīng)由拷貝/ng CDR測量的(ρ < 0. 001 ；曼-懷二氏檢驗)，分別顯示在對照受試者與抑郁受試者比較中ΜΑΡΚ14(ρ38絲裂原活化蛋白激酶14) 和ODCl (鳥氨酸脫羧酶1)的相對mRNA水平的散點圖。圖4A、4B和4C。如通過qPCR方法經(jīng)由拷貝/ng CDR測量的(ρ < 0. 001 ；曼-懷二氏檢驗)，分別顯示在對照受試者與嚴(yán)重抑郁受試者比較中ERKl (細胞外信號調(diào)節(jié)激酶1)、 Gi2(鳥嘌呤核苷酸結(jié)合蛋白ai2)和MAPK14(p38絲裂原活化蛋白激酶14)的相對mRNA水平的散點圖。圖5A、5B和5C。如通過qPCR方法經(jīng)由拷貝/ng CDR測量的(ρ < 0. 001 ；曼-懷二氏檢驗)，分別顯示在對照受試者與嚴(yán)重抑郁/雙相型受試者比較中Gi2 (鳥嘌呤核苷酸結(jié)合蛋白ai2)、GR(a-糖皮質(zhì)激素受體)和MAPK14 (p38絲裂原活化蛋白激酶14)的相對 mRNA水平的散點圖。圖6A、6B和6C。如通過qPCR方法經(jīng)由拷貝/ng CDR測量的(ρ < 0. 001 ；曼-懷二氏檢驗)，分別顯示在對照受試者與邊緣型人格障礙受試者比較中Gi2(鳥嘌呤核苷酸結(jié)合蛋白ai2)、MAPK14(p38絲裂原活化蛋白激酶14)和MR(鹽皮質(zhì)激素受體)的相對mRNA 水平的散點圖。圖7A、7B和7C。如通過qPCR方法經(jīng)由拷貝/ng CDR測量的(ρ < 0. 001 ；曼-懷二氏檢驗)，分別顯示在196個對照受試者與66個急性PTSD受試者比較中ARRB2 ( β -抑制蛋白2)、ERK2 (細胞外信號調(diào)節(jié)激酶2)和RGS2 (G蛋白信號調(diào)節(jié)劑2)的相對mRNA水平的散點圖。圖8A和8B。圖8A是執(zhí)行SLR算法的舉例說明，所述SLR算法執(zhí)行基因選擇和訓(xùn)練，在抑郁受試者與對照比較的分類中評分為93%的準(zhǔn)確度、PPV = 93%和NPV = 94%。 在RF基因選擇前，支持向量機(Support Vector Machine) (SVM)分類器在抑郁受試者與對照比較的分類中評分為88%的準(zhǔn)確度、PPV = 89%和NPV = 88%。圖8B顯示基于在抑郁受試者與對照比較的分類中每種方法的統(tǒng)計參數(shù)，隨機森林(Random Forest) (RF)從表IA 中選擇14種基因，并且逐步邏輯回歸(St印wise Logistic Regression) (SLR)選擇17種基因。在分類過程的選擇步驟時通過RF和SLR方法選擇的重疊基因以灰色顯示。圖9。圖9描述了關(guān)于其平均表達水平(轉(zhuǎn)錄值)在嚴(yán)重抑郁患者和對照之間顯著不同(P < 0. 05)的基因。這些基因根據(jù)計算的-Log(P)值量級進行排序，如表5A中可見的。圖10。圖10表示對于每個受試者根據(jù)由ERKl和MAPK14組成的轉(zhuǎn)錄概況的嚴(yán)重抑郁受試者和對照受試者分布。嚴(yán)重抑郁受試者由空心圓圈(〇)表示，并且對照受試者由實心三角(▲)表示。X和Y軸分別描述了關(guān)于ERKl和MAPK14的轉(zhuǎn)錄值(拷貝/ng cDNA)。圖11。圖11表示對于每個受試者根據(jù)由Gi2和ILlb組成的轉(zhuǎn)錄概況的嚴(yán)重抑郁受試者和對照受試者分布。嚴(yán)重抑郁受試者由空心圓圈(〇)表示，并且對照受試者由實心三角(▲)表示。X和Y軸分別描述了關(guān)于Gi2和ILlb的轉(zhuǎn)錄值(拷貝/ng cDNA)。圖12。圖12表示對于每個受試者根據(jù)由ERKl和ILlb組成的轉(zhuǎn)錄概況的嚴(yán)重抑郁受試者和對照受試者分布。嚴(yán)重抑郁受試者由空心圓圈(〇)表示，并且對照受試者由實心三角(▲)表示。X和Y軸分別描述了關(guān)于ERKl和ILlb的轉(zhuǎn)錄值(拷貝/ng cDNA)。圖13。圖13表示對于每個受試者根據(jù)由ARRBl和MAPK14組成的轉(zhuǎn)錄概況的嚴(yán)重抑郁受試者和對照受試者分布。嚴(yán)重抑郁受試者由空心圓圈(〇)表示，并且對照受試者由實心三角(▲)表示。X和Y軸分別描述了關(guān)于ARRBl和MAPK14的轉(zhuǎn)錄值(拷貝/ng cDNA)。5發(fā)明詳述本發(fā)明允許通過評估生物標(biāo)記概況中的生物標(biāo)記特征快速且準(zhǔn)確診斷情感障礙。 這些生物標(biāo)記概況從受試者的生物樣品構(gòu)建。5.1 定義
如本文使用的，“情感障礙”應(yīng)意指特征在于一致、普遍的情緒改變且影響思維、情緒和行為的精神障礙。情感障礙的例子包括但不限于抑郁性障礙、焦慮癥、雙相型障礙、精神抑郁癥和分裂情感性障礙。焦慮癥包括但不限于廣泛性焦慮癥、驚恐障礙、強迫性障礙、 恐怖癥和創(chuàng)傷后應(yīng)激障礙。抑郁性障礙包括但不限于主要性抑郁障礙(MDD)、緊張性抑郁癥、憂郁性抑郁癥、非典型抑郁癥、精神病性抑郁癥、產(chǎn)后憂抑郁癥、雙相型抑郁癥和輕度、 中度或重度抑郁癥。人格障礙包括但不限于偏執(zhí)型、反社會型和邊緣型人格障礙。“生物標(biāo)記”是事實上任何可檢測的化合物，例如蛋白質(zhì)、肽、蛋白聚糖、糖蛋白、脂蛋白、碳水化合物、脂質(zhì)、核酸(例如DNA，例如cDNA或擴增的DNA，或RNA例如mRNA)、有機或無機化學(xué)制品、天然或合成聚合物、小分子(例如代謝產(chǎn)物)，或前述任何的區(qū)別分子或區(qū)別片段，其存在于或衍生自生物樣品，或客觀測量且評估為正常生物學(xué)過程、致病性過程或?qū)τ谥委煾深A(yù)的藥理學(xué)應(yīng)答指示劑，或其指示的任何其他特征。參見Atkinson，A.J.， ^A Biomarkers and Surrogate Endpoints :Preferred Definitions and Conceptual Framework, Clinical Pharm. &Therapeutics，2001 March ；69 (3) :89_95。如這個內(nèi)容中使用的“衍生自”指當(dāng)檢測時指示存在于生物樣品中的特定分子的化合物。例如，特定cDNA的檢測可以指示特定RNA轉(zhuǎn)錄物在生物樣品中的存在。作為另一個例子，與特定抗體結(jié)合的檢測可以指示生物樣品中特定抗原(例如，蛋白質(zhì))的存在。此處，區(qū)別分子或片段是當(dāng)檢測時指示上文鑒定化合物的存在或豐度的分子或片段。生物標(biāo)記可以例如從生物樣品中分離，在生物樣品中直接測量，或在生物樣品中檢測或在生物樣品中待測定。生物標(biāo)記可以例如是功能的、部分功能的或無功能的。在一個實施方案中，分離且使用生物標(biāo)記，例如以產(chǎn)生可以促進各種診斷測定中的生物標(biāo)記檢測的特異性結(jié)合抗體。任何免疫測定可以使用能夠結(jié)合生物標(biāo)記分子(例如，F(xiàn)ab、F(ab' )2、 Fv或scFv片段)的任何抗體、抗體片段或其衍生物。此類免疫測定是本領(lǐng)域眾所周知的。 此外，如果生物標(biāo)記是蛋白質(zhì)或其片段，那么它可以進行測序，并且可以使用充分確定的技術(shù)克隆其編碼基因。如本文使用的，術(shù)語“生物標(biāo)記種類”指本文描述的生物標(biāo)記的任何區(qū)別部分或區(qū)別片段，例如本文描述的特定基因的剪接變體(例如，下文表IA中列出的基因)。此處，區(qū)別部分或區(qū)別片段是當(dāng)檢測時指示上文鑒定的轉(zhuǎn)錄物、cDNA、擴增核酸或蛋白質(zhì)的存在或豐度的分子部分或片段?！吧飿?biāo)記概況”包含多個一種或多種類型的生物標(biāo)記(例如，mRNA分子、cDNA分子、蛋白質(zhì)和/或碳水化合物或其指示等)，連同生物標(biāo)記的特征例如可測量方面(例如豐度)。生物標(biāo)記概況包含至少2個此類生物標(biāo)記，其中生物標(biāo)記可以在相同或不同類別中， 例如核酸和碳水化合物。生物標(biāo)記概況還可以包含至少2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、 14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95 或100個或更多個生物標(biāo)記。在一個實施方案中，生物標(biāo)記概況包含數(shù)百個或甚至數(shù)千個生物標(biāo)記。生物標(biāo)記概況可以進一步包含一種或多種對照或內(nèi)部標(biāo)準(zhǔn)。在一個實施方案中， 生物標(biāo)記概況包含充當(dāng)內(nèi)部標(biāo)準(zhǔn)的至少一個生物標(biāo)記。如本文在這個內(nèi)容中使用的，術(shù)語 “指示”僅指其中生物標(biāo)記概況含有關(guān)于核酸、mRNA分子、cDNA分子、蛋白質(zhì)和/或碳水化合物、或任何其他形式的生物標(biāo)記，而不是生物標(biāo)記分子實體其自身的標(biāo)志、數(shù)據(jù)、縮寫或其他相似標(biāo)記的情況。例如，本發(fā)明的示例性生物標(biāo)記概況包含表IA中的基因名稱。
生物標(biāo)記概況中的每個生物標(biāo)記包括相應(yīng)“特征”。如本文使用的，“特征”指生物標(biāo)記的可測量方面。特征可以包括例如如示例性生物標(biāo)記概況1中舉例說明的，來自受試者的生物樣品中生物標(biāo)記的存在或不存在示例性生物標(biāo)記概況權(quán)利要求
1.一種診斷測試受試者中的情感障礙的方法，所述方法包括評估所述測試受試者的生物標(biāo)記概況中的多個生物標(biāo)記的多個特征是否滿足值集合， 其中滿足所述值集合預(yù)測所述測試受試者具有所述情感障礙，并且其中所述多個特征是所述多個生物標(biāo)記的可測量方面，所述多個生物標(biāo)記包含表IA中列出的至少2個生物標(biāo)記。
2.權(quán)利要求1的方法，所述方法進一步包括將所述測試受試者是否具有所述情感障礙的診斷輸出至用戶界面裝置、監(jiān)測器、可觸摸計算機可讀存儲介質(zhì)、或局部或遠程計算機系統(tǒng)；或以用戶可讀形式顯示所述測試受試者是否具有所述情感障礙的診斷。
3.權(quán)利要求1的方法，其中所述多個生物標(biāo)記由表IA中列出的2- 個生物標(biāo)記組成。
4.權(quán)利要求1的方法，其中所述多個生物標(biāo)記由表IA中列出的3-20個生物標(biāo)記組成。
5.權(quán)利要求1的方法，其中所述多個生物標(biāo)記包含表IA中列出的至少2個生物標(biāo)記。
6.權(quán)利要求1的方法，其中所述多個生物標(biāo)記包含表IA中列出的至少3個生物標(biāo)記。
7.權(quán)利要求1的方法，其中所述多個生物標(biāo)記包含表IA中列出的至少4個生物標(biāo)記。
8.權(quán)利要求1的方法，其中所述多個特征由對應(yīng)于表IA中列出的2- 個生物標(biāo)記的2-29個特征組成。
9.權(quán)利要求1的方法，其中所述多個特征由對應(yīng)于表IA中列出的3-15個生物標(biāo)記的3-15個特征組成。
10.權(quán)利要求1的方法，其中所述多個生物標(biāo)記包含對應(yīng)于表IA中列出的至少2個生物標(biāo)記的至少2個特征。
11.權(quán)利要求1的方法，其中所述多個生物標(biāo)記包含ERKl和MAPK14。
12.權(quán)利要求1的方法，其中所述多個生物標(biāo)記包含Gi2和IL-lb。
13.權(quán)利要求1的方法，其中所述多個生物標(biāo)記包含ARRBl和MAPK14。
14.權(quán)利要求1的方法，其中所述多個生物標(biāo)記包含ERKl和ILlb。
15.權(quán)利要求1的方法，其中所述多個生物標(biāo)記包含ARRBl、IL6和⑶8a。
16.權(quán)利要求1的方法，其中所述多個生物標(biāo)記包含ARRB1、ODCl和P2X7。
17.權(quán)利要求1的方法，其中所述多個生物標(biāo)記中的每個生物標(biāo)記是核酸。
18.權(quán)利要求1的方法，其中所述多個生物標(biāo)記中的每個生物標(biāo)記是DNA、cDNA、擴增的 DNA、RNA 或 mRNA。
19.權(quán)利要求1的方法，其中所述測試受試者的生物標(biāo)記概況中的所述多個生物特征中的特征是所述多個生物標(biāo)記中的生物標(biāo)記的可測量方面，并且關(guān)于所述特征的特征值使用 得自所述測試受試者的生物樣品進行測定。
20.權(quán)利要求19的方法，其中所述特征是所述生物標(biāo)記在生物樣品中的豐度，并且所述生物樣品是全血。
21.權(quán)利要求1的方法，所述方法進一步包括在評估步驟前構(gòu)建所述第一個值集合。
22.權(quán)利要求21的方法，其中所述構(gòu)建步驟包含將數(shù)據(jù)分析算法應(yīng)用于得自群體成員的特征。
23.權(quán)利要求22的方法，其中所述群體包含來自不具有情感障礙的第一批多個對照受試者的第一批多個生物樣品，和來自具有情感障礙的第二批多個受試者的第二批多個生物樣品。
24.權(quán)利要求22的方法，其中所述數(shù)據(jù)分析算法是決策樹、微陣列預(yù)測分析、多重累計回歸樹、神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)、聚類算法、主成分分析、最近鄰分析、線性判別分析、二次判別分析、支持向量機、進化法、相關(guān)向量機、遺傳算法、投影追蹤或加權(quán)表決。
25.權(quán)利要求21的方法，其中所述構(gòu)建步驟生成決策規(guī)則，并且其中所述評估步驟包含將所述決策規(guī)則應(yīng)用于所述多個特征，以便測定它們是否滿足所述第一個值集合。
26.權(quán)利要求25的方法，其中所述決策規(guī)則將所述群體中的受試者分類為(i)不具有情感障礙的受試者和(ii)的確具有情感障礙的受試者，其準(zhǔn)確度70%或更大。
27.權(quán)利要求25的方法，其中所述決策規(guī)則將所述群體中的受試者分類為(i)不具有情感障礙的受試者和(ii)的確具有情感障礙的受試者，其準(zhǔn)確度90%或更大。
28.權(quán)利要求1的方法，其中所述情感障礙是雙相型障礙I、雙相型障礙II、心境惡劣障礙或抑郁障礙。
29.權(quán)利要求1的方法，其中所述情感障礙是輕度抑郁癥、中度抑郁癥、重度抑郁癥、非典型抑郁癥、憂郁抑郁癥或邊緣型人格障礙。
30.一種計算機程序產(chǎn)品，其中所述計算機程序產(chǎn)品包含計算機可讀存儲介質(zhì)和其中嵌入的計算機程序機制，所述計算機程序機制包含用于執(zhí)行權(quán)利要求1的方法的指令。
31.權(quán)利要求30的計算機程序產(chǎn)品，其中所述計算機程序機制進一步包含指令用于將所述測試受試者是否具有所述情感障礙的診斷輸出至用戶界面裝置、監(jiān)測器、可觸摸計算機可讀存儲介質(zhì)、或局部或遠程計算機系統(tǒng)；或以用戶可讀形式顯示所述測試受試者是否具有所述情感障礙的診斷。
32.—種計算機，其包含一個或多個處理器；與所述一個或多個處理器連接的存儲器，所述存儲器存儲用于執(zhí)行權(quán)利要求1的方法的指令。
33.權(quán)利要求32的計算機，其中所述存儲器進一步包含指令用于將所述測試受試者是否具有所述情感障礙的診斷輸出至用戶界面裝置、監(jiān)測器、可觸摸計算機可讀存儲介質(zhì)、或局部或遠程計算機系統(tǒng)；或以用戶可讀形式顯示所述測試受試者是否具有所述情感障礙的診斷。
34.一種測定測試受試者顯示出情感障礙癥狀的可能性的方法，所述方法包括評估所述測試受試者的生物標(biāo)記概況中的多個生物標(biāo)記的多個特征是否滿足值集合， 其中滿足所述值集合提供了所述測試受試者顯示出情感障礙癥狀的所述可能性，并且其中所述多個特征是所述多個生物標(biāo)記的可測量方面，所述多個生物標(biāo)記包含表IA中列出的至少2個生物標(biāo)記。
35.權(quán)利要求34的方法，所述方法進一步包括將所述測試受試者顯示出情感障礙癥狀的可能性輸出至用戶界面裝置、監(jiān)測器、可觸摸計算機可讀存儲介質(zhì)、或局部或遠程計算機系統(tǒng)；或以用戶可讀形式顯示所述測試受試者顯示出情感障礙癥狀的可能性。
全文摘要
本發(fā)明涉及用于診斷具有情感障礙的患者的方法和系統(tǒng)。該方法也用于預(yù)測受試者中對于情感障礙的易感性。
文檔編號G06F19/24GK102224256SQ200980142889
公開日2011年10月19日 申請日期2009年8月27日 優(yōu)先權(quán)日2008年8月27日
發(fā)明者C·P·G·格拉爾, I·安東尼耶維克, J·B·維斯蒂森, J·塔姆, R·阿泰米什恩 申請人:H.隆德貝克有限公司