本發(fā)明涉及一種用于MALDI-TOF MS且具有微納米結(jié)構(gòu)的改進(jìn)基片,屬于質(zhì)譜檢測(cè)領(lǐng)域。
背景技術(shù):
MALDI-TOF-MS是Matrix Assisted Laser Desorption Ionization Time of Flight Mass Spectrometry的英文縮寫,即基質(zhì)輔助激光解吸附電離飛行時(shí)間質(zhì)譜,又稱MALDI TOF,它是近年來發(fā)展起來的一種軟電離新型有機(jī)質(zhì)譜,通過引入基質(zhì)分子,使待測(cè)分子不產(chǎn)生碎片,解決了非揮發(fā)性和熱不穩(wěn)定性生物大分子解吸離子化的問題,是分析難揮發(fā)的有機(jī)物質(zhì)的重要手段之一。MALDI TOF在世界范圍內(nèi)得到了突飛猛進(jìn)的發(fā)展,并廣泛應(yīng)用于生物技術(shù)和制藥企業(yè)的藥物開發(fā)、科研領(lǐng)域的生物分析和化學(xué)檢測(cè)以及安全部門的核輻射、化學(xué)物質(zhì)和生物病原體的監(jiān)測(cè)等。
MALDI-TOF MS的原理是:當(dāng)用一定強(qiáng)度的激光照射樣品與基質(zhì)形成的共結(jié)晶薄膜,基質(zhì)從激光中吸收能量,樣品解吸附,基質(zhì)-樣品之間發(fā)生電荷轉(zhuǎn)移使得樣品分子電離,電離的樣品在電場(chǎng)作用下加速飛過飛行管道,根據(jù)到達(dá)檢測(cè)器的飛行時(shí)間不同而被檢測(cè),即測(cè)定離子的質(zhì)量電荷之比(M/Z)與離子的飛行時(shí)間成正比來檢測(cè)離子。MALDI-TOF MS的中心技術(shù)就是依據(jù)樣品的質(zhì)荷比(m/z)的不同來進(jìn)行檢測(cè),并測(cè)得樣品分子的分子量。根據(jù)MALDI-TOF MS的原理,MALDI-TOF MS具有靈敏度高、準(zhǔn)確度高、分辨率高、圖譜簡(jiǎn)明、質(zhì)量范圍廣及速度快等特點(diǎn),在操作上制樣簡(jiǎn)便、可微量化、大規(guī)模、并行化和高度自動(dòng)化處理待檢生物樣品,而且在測(cè)定生物大分子和合成高聚物應(yīng)用方面有特殊的優(yōu)越性。近年來已成為檢測(cè)和鑒定多肽、蛋白質(zhì)、多糖、核苷酸、糖蛋白、高聚物以及多種合成聚合物的強(qiáng)有力工具。如應(yīng)用MALDI-TOF MS測(cè)定蛋白質(zhì)酶解的肽質(zhì)量指紋圖譜(PMF)、源后裂解(PSD)碎片離子圖譜、并結(jié)合質(zhì)譜網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫(kù)檢索,可獲得多肽、蛋白質(zhì)的序列。應(yīng)用MALDI-TOF對(duì)基因組單核苷酸多態(tài)性(SNPs)進(jìn)行分析檢測(cè),可區(qū)分和鑒別相對(duì)分子質(zhì)量達(dá)7,000左右(含20多個(gè)堿基)、僅存在1個(gè)堿基差別的不同DNA。特別值得指出的是,MALDI-TOF已成為生命科學(xué)領(lǐng)域蛋白質(zhì)組研究中必不可缺的重要關(guān)鍵技術(shù)之一。
MALDI-TOF可以解決當(dāng)前蛋白組學(xué)中以下幾種潛在的挑戰(zhàn),即生物標(biāo)記物的發(fā)現(xiàn)、分子診斷研發(fā)、蛋白質(zhì)高通量分析和蛋白質(zhì)組圖譜,但絕不局限于此,MALDI-TOF MS應(yīng)用于生物標(biāo)記物的發(fā)現(xiàn)和在分子層次上對(duì)疾病機(jī)理進(jìn)行揭示,從而被應(yīng)用于分子診斷、目標(biāo)治療以及個(gè)性化用藥,將為人們更完整地提示生長(zhǎng)、發(fā)育和代謝調(diào)控等生命活動(dòng)的規(guī)律和嚴(yán)重疾病的發(fā)生機(jī)理,為人類進(jìn)行疾病的診斷防治和新藥開發(fā)提供重要的理論基礎(chǔ)。
MALDI-TOF由于具備快速分析、操作簡(jiǎn)易、自動(dòng)化、樣品用量少和高通量等特點(diǎn),可直接檢測(cè)血清、血漿、尿液、腦脊液、關(guān)節(jié)腔滑液、支氣管洗脫液、細(xì)胞裂解液、組織提取物和各種分泌物,應(yīng)用MALDI-TOF形成規(guī)模化的重大疾病、重要生物資源的蛋白質(zhì)組學(xué)、蛋白質(zhì)組指紋圖譜或質(zhì)譜肽圖研究技術(shù)平臺(tái),可建立具有獨(dú)立知識(shí)產(chǎn)權(quán)的蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫(kù),發(fā)現(xiàn)疾病的相關(guān)蛋白譜和具有重要應(yīng)用前景的生物標(biāo)記分子譜,以揭示疾病的發(fā)生機(jī)制,作為早期診斷、分子分型、療效及預(yù)后判斷的依據(jù),并找出可能成為新藥設(shè)計(jì)的分子靶點(diǎn),為疾病提供新的治療方案?;贛ALDI-TOF的蛋白質(zhì)組圖譜、質(zhì)譜肽圖、生物標(biāo)記物譜等分析診斷的發(fā)展將是分子醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的一場(chǎng)革命,它不僅提供了一種新的診斷方法,并且具有很高的可行性,它可在數(shù)分鐘時(shí)間內(nèi)從微量血液中測(cè)出上萬個(gè)結(jié)果并對(duì)其進(jìn)行分析。
對(duì)此,本發(fā)明人首先采用MALDI-TOF MS進(jìn)行血清等生物樣品分離、多肽譜快速掃描和疾病特征峰測(cè)序,在研究人類重要生理和病理過程中重要生物標(biāo)志物譜實(shí)驗(yàn)確證和分析技術(shù),獲得若干與人類重大疾病相關(guān)的重要生物標(biāo)志物譜,應(yīng)用于重大疾病的早期預(yù)警和病程判斷。如本發(fā)明人發(fā)現(xiàn)了用于發(fā)現(xiàn)惡性腫瘤血清標(biāo)志物譜,創(chuàng)建具有自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的我國(guó)常見惡性腫瘤人群的“血清質(zhì)譜多肽譜”,獲得腫瘤早期預(yù)警、病程判斷的質(zhì)譜數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn),例如中國(guó)授權(quán)專利200810172142.0、“一種用于檢測(cè)肝癌特征蛋白模型的制備方法”、中國(guó)授權(quán)專利200810147419.4、“用于檢測(cè)腦膠質(zhì)瘤特征蛋白質(zhì)譜模型的制備方法”、中國(guó)授權(quán)專利201110216986.2、“用于檢測(cè)肺癌蛋白的質(zhì)譜模型及構(gòu)建方法”。另外,根據(jù)質(zhì)譜技術(shù)在針對(duì)核酸與待測(cè)物(如微生物、特定來源成分)或癥狀(齲齒、老年癡呆、遺傳性耳聾)的研究中,本發(fā)明人也獲得眾多的中國(guó)授權(quán)專利,例如中國(guó)授權(quán)專利201310158363.3、“制備細(xì)菌核酸指紋特征譜庫(kù)的方法”,中國(guó)授權(quán)專利201310368422.X、“檢測(cè)齲齒蛋白的質(zhì)譜模型及構(gòu)建方法”,中國(guó)授權(quán)專利201310175514.6、“用于檢測(cè)與遺傳性耳聾相關(guān)的基因SNP的引物系統(tǒng)及其用途”。因此,針對(duì)MALDI-TOF MS發(fā)展用于“血清質(zhì)譜多肽譜”的疾病相關(guān)數(shù)據(jù)挖掘的生物信息學(xué)工具和疾病診斷軟件,可應(yīng)用于臨床并推向市場(chǎng)。無論對(duì)于科研領(lǐng)域、醫(yī)療系統(tǒng),還是生物市場(chǎng)皆具有廣闊的前景。
由于在MALDI-TOF的檢測(cè)載體(靶板或基片)上形成超薄且均一的樣品結(jié)晶,一直是改進(jìn)質(zhì)譜圖質(zhì)量的研究方向之一,因此出現(xiàn)一些相關(guān)的研究。中國(guó)授權(quán)專利201410090967.3、“制備親疏水相間的微陣列芯片及其用于質(zhì)譜成像定量分析的方法”提供了一種通過在芯片上設(shè)置疏水和親水區(qū)域來制備檢測(cè)芯片,其中采用絲網(wǎng)印刷技術(shù)將疏水性聚合物(聚二甲基硅氧烷或聚甲基丙烯酸甲酯)按照設(shè)計(jì)好的模板刷在導(dǎo)電玻璃上,其中涂布區(qū)為疏水區(qū),空白區(qū)作為預(yù)留的親水區(qū)。然后,用親水材料(如樣品體系的水溶液)涂布空白區(qū),形成均一間隔的親水區(qū)和疏水區(qū)。該方法通過利用絲網(wǎng)印刷技術(shù)來設(shè)計(jì)模板形狀,預(yù)先在親水區(qū)留出空白區(qū)(又稱“留白處理”),因此需要特殊的印刷設(shè)備和操作軟件,同時(shí)在涂布疏水區(qū)時(shí)靶板要絕對(duì)靜置。同時(shí),絲網(wǎng)印刷技術(shù)的精度低,親疏水區(qū)域的分界不能達(dá)到微米精度。并且,需要將待測(cè)混合物體系水溶液均勻地鋪在親水區(qū),芯片烘干固化,置于烘箱中60攝氏度固化2h,增加了生產(chǎn)時(shí)間和成本。
中國(guó)授權(quán)專利201110401165.6、“對(duì)生物樣品進(jìn)行富集和除鹽凈化處理的方法”公開了一種利用疏水和親水材料制備具有封閉圖案化表面的檢測(cè)靶板的方法,包括通過在基底上構(gòu)筑具有較大直徑的聚合物涂層(如聚甲基丙烯酸甲酯、聚苯乙烯或光刻膠)作為擋層圓區(qū),然后以含氟單分子層或蒸鍍金屬層作為疏水層貼在整個(gè)基底上。由于該疏水層不能粘附在上述擋層圓區(qū),因此將靶板浸入有機(jī)溶劑中進(jìn)行超聲處理,可以除去擋層圓區(qū)。最后,再將所述聚合物涂層在所述圓區(qū)內(nèi)部突變較小直徑的同心圓,從而獲得疏水外圈(含氟單分子層或蒸鍍金屬層)-親水中圈-疏水內(nèi)圈(聚合物涂層)的同心圓圖案的質(zhì)譜靶板,因此該方法又稱“擋層涂布”。然而,該方法在基底上構(gòu)筑疏水-親水-疏水區(qū)域的封閉圖案化表面,需要進(jìn)行兩步疏水處理,即采用含氟的試劑在100~250℃下加熱生長(zhǎng)1~5個(gè)小時(shí),工藝復(fù)雜,過程耗時(shí)。由于該方法需要精確控制兩次聚合物涂層的間距,間距過小導(dǎo)致外圈和內(nèi)圈相連,同時(shí)由于使用兩種不同的疏水材料來分別突變不同的基底表面,所獲得的疏水區(qū)液滴的接觸角過小,導(dǎo)致疏水效果差,影響了普通實(shí)驗(yàn)室的應(yīng)用。
中國(guó)專利申請(qǐng)200610023671.5、公開了“一種低豐度蛋白靶上一步除鹽與富集的方法”,其中通過疏水聚合物(聚甲基丙烯酸甲酯、聚乙烯、聚苯乙烯、聚氟乙烯等)預(yù)先在靶板的樣品池中央部分進(jìn)行涂布,然后進(jìn)行蛋白點(diǎn)樣,使得蛋白樣品富集在疏水聚合物層上。然后,將基質(zhì)溶液加入點(diǎn)樣區(qū),使得蛋白樣品中的污染物和無機(jī)鹽擴(kuò)散出去,最后得到樣品和基質(zhì)均勻細(xì)致的結(jié)晶。由于該方法是直接將蛋白樣品加到疏水層,通過加入過量的基質(zhì)溶液來進(jìn)行純化,雖然客觀上有一定純化效果,但造成了蛋白樣品的浪費(fèi)。同時(shí),如果手動(dòng)操作將0.2μl疏水性聚合物溶液點(diǎn)在每個(gè)Kapton膜的小孔內(nèi),耗時(shí),且0.2μl溶液的精度難以控制,影響小孔表面疏水均一性;如果自動(dòng)操作,需要配置相應(yīng)點(diǎn)樣設(shè)備,增加成本,制備復(fù)雜,并不適合不易制備的微量蛋白樣品的檢測(cè)和應(yīng)用。
由于上述靶板的在先研究中,或是靶板表面沒有親水疏水差異,(如中國(guó)專利200610023671.5),導(dǎo)致結(jié)晶形態(tài)差,或是形成親水疏水差異的涂層,但親疏水分界不能達(dá)到微米精度或液滴接觸角過小,但制備過程過于復(fù)雜,不能節(jié)約時(shí)間和成本(如中國(guó)專利201410090967.3、專利201110401165.6),或是需要額外的裝置和檢測(cè)軟件,或是需要過多的珍貴蛋白樣本進(jìn)行檢測(cè),這些都導(dǎo)致質(zhì)譜檢測(cè)樣本峰的準(zhǔn)確度低,信噪比低,基線高。
另外,隨著MALDI TOF在生物標(biāo)記物的發(fā)現(xiàn)、分子診斷研發(fā)、蛋白質(zhì)高通量分析和蛋白質(zhì)組圖譜領(lǐng)域的廣泛應(yīng)用,提供較為簡(jiǎn)單、便利和廉價(jià)的靶板也成為了現(xiàn)實(shí)需求。為此,本發(fā)明人在先授權(quán)專利201520142252.8、“質(zhì)譜檢測(cè)用的疏水性濃縮靶板”中,提供一種制備靶板的簡(jiǎn)易方法,其中,使用不銹鋼或鋁合金的靶板主體,通過使用疏水性材料(如聚丙烯或聚乙烯或含氧烷基聚合物)貼膜或涂布靶板表面。其中,該靶板設(shè)有與樣品室底部的契合關(guān)系的形狀或結(jié)構(gòu),并通過不同的橫排和豎列標(biāo)識(shí)的組合,以定位不同的樣品。由于含有樣品的基質(zhì)在點(diǎn)樣區(qū)域因疏水作用發(fā)生聚集,可以降低樣品用量,并通過干燥結(jié)晶后再進(jìn)行質(zhì)譜,取得良好的效果。實(shí)驗(yàn)證明,具有上述特定形狀和結(jié)構(gòu)的疏水性濃縮靶板,明顯優(yōu)于單一的金屬靶板,同時(shí)具有樣品定位準(zhǔn)確的優(yōu)點(diǎn),符合質(zhì)譜要求。
如上所述,由于靶板上的樣品形成完好結(jié)晶能在一定上有利于獲得高質(zhì)量的質(zhì)譜檢測(cè)圖,并且出于生產(chǎn)成本的考慮,獲得能夠高質(zhì)量結(jié)晶且制備簡(jiǎn)單和廉價(jià)的質(zhì)譜靶板成為技術(shù)人員不斷深入的研究目的。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
為了克服傳統(tǒng)質(zhì)譜檢測(cè)靶板表面沒有親水疏水差異,導(dǎo)致結(jié)晶形態(tài)差,質(zhì)譜檢測(cè)樣本峰的準(zhǔn)確度低,信噪比低,基線高,同時(shí)制備成本過高和復(fù)雜的缺點(diǎn),液滴接觸角過小影響疏水性能的缺陷,本發(fā)明提供一種用于MALDI-TOF檢測(cè)且具有微納米結(jié)構(gòu)的改進(jìn)基片,通過在表面增加靶板的親水與疏水性差異,使待測(cè)樣本在基片定位孔內(nèi)形成完好結(jié)晶,提高質(zhì)譜檢測(cè)譜圖質(zhì)量,以及鑒定結(jié)果準(zhǔn)確度。
因此,本發(fā)明第一目的是提供一種用于MALDI-TOF檢測(cè)且具有微納米結(jié)構(gòu)的改進(jìn)基片,包括具有親水性的點(diǎn)樣區(qū)、點(diǎn)樣區(qū)外的疏水區(qū)基片,其中:
所述基片的表面被硅烷偶聯(lián)劑處理,從而形成疏水區(qū);
所述點(diǎn)樣區(qū)被酸性試劑處理,去除硅烷偶聯(lián)劑,并發(fā)生化學(xué)反應(yīng)修飾后,從而形成親水區(qū)。
在另一實(shí)施方案中,所述基片是質(zhì)地堅(jiān)韌、平面度佳的不銹鋼、金剛石、單晶硅、石英晶體的基片。在一個(gè)具體實(shí)施方案中,所述基片預(yù)先通過化學(xué)機(jī)械拋光(chemical mechanism polish,CMP)被處理具有單面拋光鏡面效應(yīng)。通過CMP方法,對(duì)基片進(jìn)行兩次拋光,粗拋與細(xì)拋。粗拋目的是去除基片表面殘留的機(jī)械損傷,一般從表面除去30um范圍內(nèi)的厚度。細(xì)拋目的是去除第一次拋光在基片表面留下的輕微損傷和云霧狀缺陷,一般從表面除去2~3um。經(jīng)過兩次拋光的基片表面具有鏡面效應(yīng),在質(zhì)譜檢測(cè)過程中,通過照明、光路反射及攝像頭實(shí)時(shí)顯示,可以直接觀測(cè)基片表面樣本被轟擊的情況,改變激光轟擊的位置,得到最佳圖譜。在一個(gè)更具體實(shí)施方案中,所述基片是單面拋光的硅基片或石英基片。
在一個(gè)實(shí)施方案中,所述硅烷偶聯(lián)劑選自乙烯基硅烷、氨基硅烷、二甲基二氯硅烷。其中,二甲基二氯硅烷生長(zhǎng)疏水膜操作簡(jiǎn)單,接觸較大,疏水性佳,疏水層厚度能達(dá)到納米至微米量級(jí),因此硅烷偶聯(lián)劑優(yōu)選是二甲基二氯硅烷。在一個(gè)具體實(shí)施方案中,被所述偶聯(lián)劑整體硅烷化的疏水表面,其接觸角>120°或>130°或>140°,在更優(yōu)選的實(shí)施方案中,所述接觸角>150°,以形成超疏水表面。在其他優(yōu)選的實(shí)施方案中,所述疏水表面的厚度在納米到微米量級(jí)。
在一個(gè)其他實(shí)施方案中,所述點(diǎn)樣區(qū)被劃隔成適合MALDI-TOF樣品室規(guī)格的長(zhǎng)方形,劃隔精度小于10μm。在一個(gè)具體實(shí)施方案中,制作光刻掩膜版,在基片表面形成親疏水區(qū)域(見圖1),邊界精度達(dá)到微米級(jí)別。所述酸性試劑選自氫氟酸(HF)、硫酸(H4SO2)、溴化氫(HBr),優(yōu)選是氫氟酸(HF)。在另一具體實(shí)施方案中,將經(jīng)過配制的酸性試劑,滴在孔內(nèi)區(qū)域,化學(xué)反應(yīng)修飾后,使得孔內(nèi)區(qū)域呈現(xiàn)親水性。
在上述任一實(shí)施方案中,所述基片具有用于基片身份識(shí)別的二維碼區(qū)域,其中通過光刻或蝕刻來印制二維碼圖形,至少分成8×8~15×15的陣列。在一個(gè)具體實(shí)施方案中,通過計(jì)算機(jī)控制激光光束在基片蝕刻或光刻預(yù)先設(shè)定的二維碼圖形,該圖形厚度在納米到微米量級(jí)。在另一具體實(shí)施方案中,所述用于基片身份識(shí)別,指二維碼與病人的生物信息或樣品的來源信息關(guān)聯(lián)。其他實(shí)施方案中,在進(jìn)行質(zhì)譜檢測(cè)的同時(shí),可用讀碼器或掃碼器讀取二維碼,并將基片對(duì)應(yīng)的病人生物信息或樣品的來源信息以及對(duì)應(yīng)的質(zhì)譜數(shù)據(jù)同時(shí)輸入電腦進(jìn)行編碼、存儲(chǔ)和識(shí)別。
在一個(gè)實(shí)施方案中,所述基片上的親水點(diǎn)樣區(qū)數(shù)量為48、56、70、96、384或其他數(shù)量,親水區(qū)形狀可以選擇圓形,正方形,三角形,多邊形等。在一個(gè)具體實(shí)施方案中,所述親水區(qū)域尺寸范圍為100×100μm至1×1mm,所述基片尺寸為20×30-83×125mm。
在上述所有實(shí)施方案中,其中所述基片是用于MALDI-TOF BIOMARK檢測(cè)的基片。
本發(fā)明第二目的是提供用于MALDI-TOF檢測(cè)的微納米結(jié)構(gòu)基片的制備方法,包括:
(1)選用質(zhì)地堅(jiān)韌、平面度佳的基片作為基底;
(2)用硅烷偶聯(lián)劑處理基片
(i)清洗基片:將先后浸入丙酮、甲醇水溶液、氯仿,分別清洗后,取出干燥;
(ii)在加熱條件下,將濃酸和雙氧水緩慢加入含有基片的水溶液中,進(jìn)行充分氧化反應(yīng)后,分別在氯仿、超純水中進(jìn)行清洗,該步驟可重復(fù)多次;
(iii)將基片置于干凈容器中,加入預(yù)先水解的硅烷偶聯(lián)劑溶液,并加入氨水催化,直至硅烷化反應(yīng)充分完成;
(iv)取出基片,分別置于乙醇、超純水、氯仿中,超聲清洗;
(v)將清洗后的基片,測(cè)量并選擇接觸角>120°的基片,作為合格基片;
(3)點(diǎn)樣區(qū)的親水性處理:將調(diào)制后的酸性試劑直接滴在點(diǎn)樣區(qū)內(nèi),通過該酸性試劑對(duì)表面進(jìn)行化學(xué)修飾后,形成親水性孔狀結(jié)構(gòu),然后分別置于乙醇、超純水、氯仿中,超聲清洗。
在一個(gè)實(shí)施方案中,步驟(1)所述基片是質(zhì)地堅(jiān)韌、平面度佳的不銹鋼、金剛石、單晶硅、石英晶體的基片。在一個(gè)具體實(shí)施方案中,所述基片預(yù)先通過化學(xué)機(jī)械拋光(chemical mechanism polish,CMP)被處理具有單面拋光鏡面效應(yīng)。通過CMP方法,對(duì)基片進(jìn)行兩次拋光,粗拋與細(xì)拋。粗拋目的是去除基片表面殘留的機(jī)械損傷,一般從表面除去30um范圍內(nèi)的厚度。細(xì)拋目的是去除第一次拋光在基片表面留下的輕微損傷和云霧狀缺陷,一般從表面除去2~3um。經(jīng)過兩次拋光的基片表面具有鏡面效應(yīng),在質(zhì)譜檢測(cè)過程中,通過照明、光路反射及攝像頭實(shí)時(shí)顯示,可以直接觀測(cè)基片表面樣本被轟擊的情況,改變激光轟擊的位置,得到最佳圖譜。在一個(gè)更具體實(shí)施方案中,所述基片是單面拋光的硅基片或石英基片。
在另一個(gè)實(shí)施方案中,步驟(2)所述硅烷偶聯(lián)劑選自乙烯基硅烷、氨基硅烷、二甲基二氯硅烷。其中,二甲基二氯硅烷生長(zhǎng)疏水膜操作簡(jiǎn)單,接觸較大,疏水性佳,疏水層厚度能達(dá)到納米至微米量級(jí),因此硅烷偶聯(lián)劑優(yōu)選是二甲基二氯硅烷。在一個(gè)具體實(shí)施方案中,被所述偶聯(lián)劑整體硅烷化的疏水表面,其接觸角>120°,在一個(gè)優(yōu)選的實(shí)施方案中,所述接觸角>150°,以形成超疏水表面。在其他優(yōu)選的實(shí)施方案中,所述疏水表面的厚度在納米到微米量級(jí)。
在一個(gè)其他實(shí)施方案中,步驟(3)所述點(diǎn)樣區(qū)被劃隔成適合MALDI-TOF樣品室規(guī)格的長(zhǎng)方形,劃隔精度小于10μm。在一個(gè)具體實(shí)施方案中,制作光刻掩膜版,在基片表面形成親疏水區(qū)域(見圖1),邊界精度達(dá)到微米級(jí)別。所述酸性試劑選自氫氟酸(HF)、硫酸(H4SO2)、溴化氫(HBr),優(yōu)選是氫氟酸(HF)。在另一具體實(shí)施方案中,將經(jīng)過配制的酸性試劑,滴在孔內(nèi)區(qū)域,化學(xué)反應(yīng)修飾后,使得孔內(nèi)區(qū)域呈現(xiàn)親水性。
在上述任一實(shí)施方案中,步驟(4)所述基片具有用于基片身份識(shí)別的二維碼區(qū)域,其中通過光刻或蝕刻來印制二維碼圖形,至少分成8×8~15×15的陣列。在一個(gè)具體實(shí)施方案中,通過計(jì)算機(jī)控制激光光束在基片蝕刻或光刻預(yù)先設(shè)定的二維碼圖形,該圖形厚度在納米到微米量級(jí)。在另一具體實(shí)施方案中,所述用于基片身份識(shí)別,指二維碼與病人的生物信息或樣品的來源信息關(guān)聯(lián)。其他實(shí)施方案中,在進(jìn)行質(zhì)譜檢測(cè)的同時(shí),可用讀碼器或掃碼器讀取二維碼,并將基片對(duì)應(yīng)的病人生物信息或樣品的來源信息以及對(duì)應(yīng)的質(zhì)譜數(shù)據(jù)同時(shí)輸入電腦進(jìn)行編碼、存儲(chǔ)和識(shí)別。
在一個(gè)實(shí)施方案中,所述基片上的親水點(diǎn)樣區(qū)數(shù)量為48、56、70、96、384或其他數(shù)量,親水區(qū)形狀可以選擇圓形,正方形,三角形,多邊形等。在一個(gè)具體實(shí)施方案中,所述親水區(qū)域尺寸范圍為100×100μm至1×1mm,所述基片尺寸為20×30-83×125mm。
本發(fā)明第三個(gè)目的是提供上述方法所制備的基片。
在一個(gè)實(shí)施方案中,所述基片是用于MALDI-TOF BIOMARK檢測(cè)的基片。
本發(fā)明第四個(gè)目的是提供所述基片用于質(zhì)譜檢測(cè)生物分子或生物標(biāo)記物樣品的用途。
在一個(gè)實(shí)施方案中,所述基片是用于MALDI-TOF BIOMARK檢測(cè)的基片。在另一實(shí)施方案中,所述生物分子生物標(biāo)記物是蛋白或多肽樣品,核酸樣品。在一具體實(shí)施方案中,其中在進(jìn)行質(zhì)譜檢測(cè)時(shí),可用讀碼器或掃碼器讀取二維碼,并將基片對(duì)應(yīng)的病人生物信息或樣品的來源信息以及對(duì)應(yīng)的質(zhì)譜數(shù)據(jù)同時(shí)輸入電腦進(jìn)行編碼、存儲(chǔ)和識(shí)別。
術(shù)語和定義
疏水性(hydrophobicity):在化學(xué)學(xué)科里,疏水性指的是一個(gè)分子(疏水物)與水互相排斥的物理性質(zhì)。疏水性分子偏向于非極性,并因此較會(huì)溶解在中性和非極性溶液(如有機(jī)溶劑)。疏水性分子在水里通常會(huì)聚成一團(tuán),而水在疏水性溶液的表面時(shí)則會(huì)形成一個(gè)很大的接觸角而成水滴狀。舉例來說,疏水性分子包含有烷烴、油、脂肪和多數(shù)含有油脂的物質(zhì)。
親水性(hydrophilic property):指分子帶有極性基團(tuán)的分子,對(duì)水有大的親和能力,可以吸引水分子,或溶解于水。這類分子形成的固體材料的表面,易被水所潤(rùn)濕。具有這種特性都是物質(zhì)的親水性。
接觸角(contact angle):是指在氣、液、固三相交點(diǎn)處所作的氣-液界面的切線穿過液體與固-液交界線之間的夾角θ,是潤(rùn)濕程度的量度。若θ<90°,則固體表面是親水性的,即液體較易潤(rùn)濕固體,其角越小,表示潤(rùn)濕性越好;若θ>90°,則固體表面是疏水性的,即液體不容易潤(rùn)濕固體,容易在表面上移動(dòng)。接觸角的測(cè)定方法很多,有角度測(cè)量法(液滴角度測(cè)量法)、長(zhǎng)度/高度測(cè)量法、力測(cè)量法等。其中液滴角度測(cè)量法是最常用的,即在平整表面滴一小液滴,使用低倍顯微鏡的量角器即可測(cè)量角度大小。
BIOMARK,即生物標(biāo)記物,微生物鑒定、蛋白指紋圖譜檢測(cè)、基因分型與基因突變檢測(cè),歸根結(jié)底是發(fā)現(xiàn)變異的BIOMARK生物標(biāo)記物,用靶板或基片承載,送入MALDI-TO F樣品室,進(jìn)行檢測(cè)分析,基片的結(jié)構(gòu)與指標(biāo)直接影響檢測(cè)結(jié)果的好壞。所述MALDI-TOF BIOMARK,既可以是利用MALDI-TOF檢測(cè)BIOMARK的技術(shù),也可以是以此為基礎(chǔ)研發(fā)的相關(guān)質(zhì)譜儀或質(zhì)譜產(chǎn)品的名稱,例如美國(guó)Fluidigm公司研發(fā)的相關(guān)產(chǎn)品。
硅烷偶聯(lián)劑:指一類具有特殊結(jié)構(gòu)的有機(jī)化合物,含有有機(jī)官能團(tuán),無機(jī)官能團(tuán),同時(shí)與陰極、非極性物質(zhì)產(chǎn)生結(jié)合力。硅烷偶聯(lián)劑的化學(xué)通式為Y-R-SiX3,式中Y是通過碳原子與硅相連的非水解性有機(jī)官能團(tuán),可與粘結(jié)劑機(jī)體中的樹脂發(fā)生反應(yīng)從而提高相容性,如氨基、乙烯基、環(huán)氧基、巰基、丙烯酰氧丙基等;R為具有飽和和不飽和鍵的碳鏈,將Y和Si原子連接起來;X為水解性基團(tuán),如鹵族、烷氧基、異丙烯氧基等。這些基團(tuán)水解形成的硅醇能與金屬或非金屬表面的氧化物或烴基反應(yīng),從而在金屬或非金屬表面形成Si-O-Si三維網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)的硅烷莫,防止金屬或非金屬的腐蝕,表面呈現(xiàn)疏水性。適于本發(fā)明的硅烷偶聯(lián)劑只限于氨基硅烷(如氨丙基三乙氧基硅烷)、乙烯基硅烷(乙烯基三乙氧基硅烷)以及二甲基二氯硅烷,其中優(yōu)選硅烷偶聯(lián)劑為二甲基二氯硅烷。
MALDI-TOF-MS是Matrix Assisted Laser Desorption Ionization Time of Flight Mass Spectrometry的英文縮寫,即基質(zhì)輔助激光解吸附電離飛行時(shí)間質(zhì)譜,又稱MALDI TOF,它是近年來發(fā)展起來的一種軟電離新型有機(jī)質(zhì)譜,通過引入基質(zhì)分子,使待測(cè)分子不產(chǎn)生碎片,解決了非揮發(fā)性和熱不穩(wěn)定性生物大分子解吸離子化的問題,是分析難揮發(fā)的有機(jī)物質(zhì)的重要手段之一,現(xiàn)在已經(jīng)廣泛用于蛋白樣品和核酸樣品的BIOMARK的分子檢測(cè)中。與MALDI TOF相似的技術(shù),表面增強(qiáng)激光解吸電離飛行時(shí)間質(zhì)譜(SELDI-TOF-MS)飛行時(shí)間質(zhì)譜是一種比較新的蛋白鑒定技術(shù)和方法。它最吸引人的地方是它將樣品的分離和質(zhì)譜(準(zhǔn)確的說是色譜)鑒定蛋白聯(lián)用,使得樣品在不用粗分離的狀態(tài)下直接上樣,這使得多蛋白樣品(如血清)能夠快速的得到鑒定。但是,該方法的缺陷在于:(1)對(duì)于不同的樣本,根據(jù)檢測(cè)的目標(biāo)采取或者設(shè)計(jì)幾種芯片,理論上可以把所有的相同性質(zhì)蛋白質(zhì)捕獲,但是實(shí)際上仍有少量的分子沒與表面探針結(jié)合。(2)使用SELDI-TOF-MS,僅能給出蛋白質(zhì)的分子量,不能給出C端、N端的序列,也沒法知道蛋白質(zhì)的構(gòu)型,因此需要將蛋白質(zhì)充分純化后,用蛋白酶消化芯片上的蛋白質(zhì),分析肽段,再用生物信息學(xué)方法鑒定蛋白質(zhì)序列。(3)該方法比較適合臨床診斷,但不能進(jìn)行蛋白質(zhì)的序列鑒定和功能研究。因此,該方法所用的BIOMARK基片不能與MALDI TOF通用。
“二維碼用于基片身份識(shí)別”,指二維碼與病人的生物信息或樣品的來源信息關(guān)聯(lián)。例如,病人的生物信息可包括但不限于,病人病例、生活習(xí)慣、個(gè)人背景,具體可以是病人的就診記錄、病人的家族遺傳關(guān)系、病人生活方式數(shù)據(jù)(是否吸煙、飲酒、熬夜、長(zhǎng)期服藥、居于各種輻射環(huán)境等)。
樣品的來源信息可以包括但不限于,樣品的環(huán)境信息或樣品的產(chǎn)品信息。例如樣品的環(huán)境信息可以包括但不限于:樣品的地理位置信息、水文土壤信息、地理資源信息、動(dòng)植物和微生物等生物信息;或,包括環(huán)境病菌污染物、蛋白或多肽污染物、進(jìn)出口岸污染物的蛋白或多肽的質(zhì)譜數(shù)據(jù)信息。
例如,樣品的產(chǎn)品信息可以包括但不限于:食品、農(nóng)產(chǎn)品、工業(yè)品種的蛋白或多肽污染物或雜質(zhì)的質(zhì)譜數(shù)據(jù)信息。
技術(shù)效果
1、本發(fā)明制備方法具有制備簡(jiǎn)單、快速的特點(diǎn),可以進(jìn)行人工制備,不需要特殊裝置,適于普通實(shí)驗(yàn)室的大規(guī)模使用。
2、本發(fā)明引入二維碼實(shí)現(xiàn)基片身份識(shí)別,與病人的生物信息關(guān)聯(lián),通過計(jì)算機(jī)的實(shí)時(shí)監(jiān)控和信息處理,遠(yuǎn)程管理,適于自動(dòng)化高通量的醫(yī)院使用。
3、相比于常規(guī)基片的樣品蛋白結(jié)晶,能夠有效富集樣本,晶向均一生長(zhǎng),BIOMARK生物檢測(cè)的質(zhì)譜曲線樣本峰準(zhǔn)確度高,信噪比高,基線底。
4、本發(fā)明可以使用工業(yè)級(jí)的硅烷偶聯(lián)劑作為疏水性材料,效果與其他已知的疏水性材料相當(dāng)甚至更佳,無需高溫固化,節(jié)約時(shí)間與成本,操作簡(jiǎn)便,并且所制備的基片表面的水滴接觸角能達(dá)到130~155°,具有優(yōu)異的疏水性能。
5、相比于傳統(tǒng)的疏水和親水處理方法如絲網(wǎng)印刷技術(shù),本發(fā)明通過光刻掩膜版制備親水疏水區(qū)域,邊界精度達(dá)到微米量級(jí),使樣本結(jié)晶形態(tài)規(guī)則,邊界清晰。
6、相比于傳統(tǒng)的疏水和親水處理基片的“擋層涂布”的三步法,本發(fā)明實(shí)際上屬于兩步法,即疏水涂布-親水涂布,不需要特殊裝置和精密處理過程,過程相對(duì)于更加簡(jiǎn)便。
7、本發(fā)明的基片采用CMP(chemical mechanism polish)方法進(jìn)行單面拋光處理,使基片表面具有鏡面效應(yīng),在質(zhì)譜檢測(cè)過程中,通過照明、光路反射及攝像頭實(shí)時(shí)顯示,可以直接觀測(cè)基片表面樣本被轟擊的情況,改變激光轟擊的位置,得到最佳圖譜。
附圖說明
圖1,圖2為一種用于MALDI-TOF檢測(cè)的微納米結(jié)構(gòu)基片示意圖,圖1為正方形孔位,圖2為圓形孔位;其中包括三個(gè)分區(qū):1、親水區(qū)域;2、疏水區(qū)域;3、二維碼區(qū)域;
圖3為濃酸溶液中清洗基片示意圖。
圖4為BIOMARK結(jié)晶形態(tài)對(duì)比示意圖,其中左下圖為基片J1表面接觸角約為135°的樣品結(jié)晶圖,右下圖為基片J2表面接觸角約為155°的樣品結(jié)晶圖。
圖5為MALDI-TOF檢測(cè)樣本峰譜圖對(duì)比。
具體實(shí)施方案
本發(fā)明將結(jié)合具體實(shí)施例做進(jìn)一步的說明,這些實(shí)例僅用于說明目的,而不用于限制本發(fā)明范圍。
實(shí)施例一、制備基片
(一)基片材料選擇
特征是質(zhì)地堅(jiān)韌、平面度佳;如不銹鋼,金剛石,單晶硅,石英晶體等;劃隔成適合MALDI-TOF樣品室規(guī)格的長(zhǎng)方形,為保證質(zhì)量檢測(cè)精度,劃隔精度小于10μm。
(二)硅烷化處理
1、清洗基片
將基片放在一個(gè)燒杯中,平鋪開,不要交疊,用丙酮沖洗基片,清洗后的基片轉(zhuǎn)移到一個(gè)新燒杯中。
向燒杯中加入一定量的甲醇與水的混合液,超聲,時(shí)間30min。
將基片轉(zhuǎn)移到新燒杯中,加入一定量的氯仿,超聲,時(shí)間30min。
取出,干燥基片。
2、用濃酸溶液清洗基片
如圖3所示,將基片放置在干凈的燒杯中,燒杯固定在支架上。
準(zhǔn)備水槽,裝滿水,放置在燒杯下方,加熱;
將濃酸與雙氧水按照一定比例(1:5~1:20)緩緩加入裝有基片的燒杯中,待不斷出現(xiàn)小氣泡,氧化反應(yīng)開始,反應(yīng)時(shí)間40min。注意,需要在通風(fēng)櫥通風(fēng)的條件下小心處理。注意個(gè)人防護(hù)。
將基片取出,放在盛有氯仿的燒杯中,超聲2min;
將基片取出,放在盛有超純水的燒杯中,超聲2min。
重復(fù)步驟8,9,直至清洗完全。
廢液處理:濃酸溶液中加入大量水,緩慢稀釋,并用NaOH中和。
3、硅烷化處理
將基片放置在潔凈的燒杯中。
將硅烷偶聯(lián)劑進(jìn)行水解,按照配比硅烷偶聯(lián)劑:水:乙醇=1:1:8混合,其中硅烷偶聯(lián)劑為濃度5%~10%的二甲基二氯硅烷溶液,水采用去離子水,乙醇濃度為99%。
將水解后的硅烷化溶液取適量加入含有基片的燒杯中;
加入濃度為13%~30%的氨水催化,配比氨水:硅烷化=1:5,加速反應(yīng)進(jìn)行。
將表面產(chǎn)生白煙的溶液放置在通風(fēng)廚中,反應(yīng)持續(xù)至少時(shí)間30分鐘。
4、硅烷化后清洗
取出基片,放置到盛有乙醇的新燒杯中,超聲,時(shí)間10min。
取出基片,放置在成盛有超純水水的新燒杯中,超聲,時(shí)間10min。
取出基片,放置在成盛有氯仿的新燒杯中,超聲,時(shí)間10min。
干燥基片后,在基片表面滴1μl水滴,使用低倍顯微鏡的量角器測(cè)量水滴接觸角大小,分別得到接觸角約135°、155°的兩種基片初品。
(三)親水處理
1、按照基片表面的孔位及尺寸,制作掩蓋模板,金屬或玻璃板材,將孔外疏水區(qū)域掩蓋,或者直接通過計(jì)算機(jī)控制,進(jìn)行親水試劑點(diǎn)樣修飾處理;
2、親水性修飾:選取氫氟酸HF試劑,經(jīng)過配制后,滴在孔內(nèi)區(qū)域,化學(xué)反應(yīng)修飾后,孔內(nèi)區(qū)域呈現(xiàn)親水性;
3、清洗
化學(xué)修飾后的基片放入盛有乙醇的潔凈燒杯中,超聲,5min;
取出基片,放入盛有氯仿的潔凈燒杯中,超聲,5min;
取出基片,放入盛有純凈水或超純水的結(jié)晶燒杯中,超聲,5min;
(四)二維碼刻印
正方形的二維碼區(qū)域,至少分成8×8~15×15的陣列,最小單元尺寸微米量級(jí),激光刻印制作二維碼圖形,厚度為納米至微米量級(jí),MALDI-TOF進(jìn)樣室掃二維碼,識(shí)別基片身份;
經(jīng)過上述步驟,得到接觸角約135°、155°的兩種基片成品。
實(shí)施例二、靶板的樣品結(jié)晶觀察和對(duì)比
將制備好的基質(zhì)溶液取適量分別滴在接觸角約135°、155°的兩種基片J1、J2,以及兩塊傳統(tǒng)靶板T1、T2上;基質(zhì)自然晾干,再吸取適量的樣本滴在J1、J2、T1、T2上,樣本自然晾干后,顯微鏡下觀察結(jié)晶形態(tài),見圖4。
其中,所述傳統(tǒng)靶板為SHIMADZU生產(chǎn)的型號(hào)為TO-488基因檢測(cè)靶板。
如圖4所示,傳統(tǒng)生物檢測(cè)靶板T1、T2結(jié)晶形態(tài)(見圖4)外形不規(guī)整,線條不圓滑,呈咖啡環(huán)狀態(tài),表面不均勻。由于中間空而周圍厚,當(dāng)激光轟擊樣品時(shí),樣本峰準(zhǔn)確度差,噪聲高,基線高。
而本發(fā)明的生物檢測(cè)基片J1、J2結(jié)晶形態(tài)(見圖4)外形呈現(xiàn)規(guī)整的圓形,表面圓潤(rùn)如玉石,質(zhì)地規(guī)則均一,晶體各向生長(zhǎng)細(xì)致,為理想的蛋白結(jié)晶形態(tài)。其中,左下圖J1接觸角約135°,右下圖J2接觸角約155°,相比而言,J2比J1的質(zhì)地更加均勻,結(jié)晶平整。
實(shí)施例三、質(zhì)譜檢測(cè)效果比較
將覆有基因樣品的基片J1和傳統(tǒng)靶板T1,放入MALDI-TOF質(zhì)譜儀中檢測(cè)。
參數(shù)設(shè)置:
Turing mode:linear
Mass Range:3000-9000
Max Laser Rep Rate:10.0
Power:90
Profiles:40
Shots:10
比較兩種靶板的檢測(cè)結(jié)果。
如圖5所示,T1靶板檢測(cè)結(jié)果基線高,出峰少,準(zhǔn)確度差,信噪比低;J1基片檢測(cè)結(jié)果基線低,出峰多,準(zhǔn)確度高,信噪比高。
實(shí)施例四、基片的疏水層和親水層的測(cè)量
本發(fā)明的微納米結(jié)構(gòu)基片,疏水層截面在電鏡下測(cè)量,厚度800nm-1μm,此厚度直接影響疏水性好壞,疏水層薄,接觸角小,疏水性差;疏水層厚,接觸角大,疏水性佳。
親水層厚度300nm-500nm,親水層厚度小于疏水層厚度,親水區(qū)域有凹槽,當(dāng)樣品滴在靶點(diǎn)上,孔內(nèi)親水孔外疏水有助于結(jié)晶形成與生長(zhǎng)。