一種冰草染色體端部特異的串聯(lián)重復(fù)序列及其應(yīng)用
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001] 本發(fā)明屬于生物技術(shù)領(lǐng)域，具體涉及一種冰草染色體端部特異的串聯(lián)重復(fù)序列及 其應(yīng)用。
【背景技術(shù)】
[0002] DNA重復(fù)序列是大多數(shù)植物基因組的主要組成部分。它可以分為兩類：串聯(lián)重復(fù) 序列和分散重復(fù)序列。串聯(lián)重復(fù)序列是高等植物基因組的主要成分，并且分布在染色體的 特定區(qū)域，例如著絲粒、端粒、異染色質(zhì)區(qū)等。一些串聯(lián)排列基因被認為是可以提供大量具 有重要生理和生物功能的蛋白質(zhì)或RNA產(chǎn)物。串聯(lián)重復(fù)序列的變化可以用來研究植物基因 組的演化，并可判斷演化趨勢。
[0003] 染色體的鑒定在分析基因組關(guān)系上是一個重要的環(huán)節(jié)。而熒光原位雜交（FISH) 技術(shù)在鑒別染色體方面具有獨特的優(yōu)勢，它可以快速，清楚的將染色體區(qū)分開。并且隨著探 針的不斷開發(fā)，越來越多的基因組染色體可以通過FISH的方法來區(qū)別。例如小麥的21對 染色體就可以通過pAsl和pHvG38來鑒定；玉米的10對染色體同樣可以用FISH的方法來 區(qū)分。而黑麥染色體1R-7R僅用pScll9.2就可以很好的區(qū)分開。冰草在這方面就落后了， 雖然有對以禮草屬中的P基因組用pAsl和pHvG39進行過研究但是效果并不理想，所以對 冰草染色體鑒定方面的研究還停留在核型分析上。
[0004] 綜上所述，正是由于串聯(lián)重復(fù)序列在植物演化中的意義，以及其在染色體識別上 的重要作用，急需在冰草屬中開發(fā)這樣的串聯(lián)重復(fù)序列。

【發(fā)明內(nèi)容】

[0005] 本發(fā)明的目的是提供一種冰草染色體端部特異的串聯(lián)重復(fù)序列及其應(yīng)用。
[0006] 本發(fā)明提供的冰草染色體端部特異的串聯(lián)重復(fù)序列（分子標記，命名為特異DNA 分子），為序列表的序列1所示的DNA分子。
[0007] 本發(fā)明還保護所述特異DNA分子在鑒定待測植物材料的基因組中是否含有來源 于冰草染色體端部的遺傳物質(zhì)中的應(yīng)用。
[0008] 本發(fā)明還保護一種檢測待測植物材料的基因組中是否含有來源于冰草染色體端 部的遺傳物質(zhì)的方法，包括如下步驟：采用所述DNA特異分子作為探針，對待測植物材料進 行熒光原位雜交，如果具有熒光信號、待測植物材料的基因組中含有來源于冰草染色體端 部的遺傳物質(zhì)，如果不具有熒光信號、待測植物材料的基因組中可能不含有來源于冰草染 色體端部的遺傳物質(zhì)。
[0009] 以上任一所述待測植物可為冰草Z559、冰草Z1842、小麥Fukuho、小麥-冰草6P短 臂端體系、小麥-冰草6P二體附加系4844-12、小麥-冰草附加系5043、小麥-冰草附加系 5038、小麥-冰草附加系II-30-5或小麥-冰草附加系5114。
[0010] 本發(fā)明還保護序列表的序列1所示的DNA分子作為鑒別冰草染色體的探針的應(yīng) 用。
[0011] 本發(fā)明還保護序列表的序列1所示的DNA分子作為逆轉(zhuǎn)座子的應(yīng)用。
[0012] 本發(fā)明的意義如下：（l)pAcTRTl的獲得使冰草的染色體的識別更容易、準確，填 補了冰草染色體鑒定上無理想探針可用的空缺；（2)pAcTRTl可以對小麥背景下冰草染色 體端部的P染色質(zhì)進行檢測。
【附圖說明】
[0013] 圖1為小麥-冰草6P二體附加系4844-12的FISH結(jié)果。
[0014] 圖2為冰草Z1842的FISH結(jié)果。
[0015] 圖3為冰草Z1842兩個不同單株染色體鑒別的FISH結(jié)果。
[0016] 圖4為小麥-冰草附加系5043的FISH結(jié)果。
[0017] 圖5為小麥-冰草附加系5038的FISH結(jié)果。
[0018] 圖6為小麥-冰草附加系II-30-5的FISH結(jié)果。
[0019] 圖7為小麥-冰草附加系5114的FISH結(jié)果。
[0020] 圖8為小麥Fukuho的FISH結(jié)果。
[0021] 圖9為冰草Z1842的FISH結(jié)果。
【具體實施方式】
[0022] 以下的實施例便于更好地理解本發(fā)明，但并不限定本發(fā)明。下述實施例中的實驗 方法，如無特殊說明，均為常規(guī)方法。下述實施例中所用的試驗材料，如無特殊說明，均為自 常規(guī)生化試劑商店購買得到的。
[0023] 冰草Z559(四倍體，4n = 28):中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所作物種質(zhì)資源保 護與研究中心（Wu, J.，X. Yang, H. Wang, H. Li, L. Li, X. Li, et al. 2006. The introgression of chromosome 6P specifying for increased numbers of florets and kernels from Agropyron cristatum into wheat. Theoretical and Applied Geneticsll4:13-20.)〇
[0024] 冰草Z1842(二倍體，2n = 14，P基因組）：中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所作物種 質(zhì)資源保護與研究中心。
[0025] 小麥Fukuho (普通小麥，六倍體，6n = 42, ABD基因組）：中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué) 研究所作物種質(zhì)資源保護與研究中心（Wu, M.，J. Zhang, J. Wang, X. Yang, A. Gao, X. Zhang, et al. 2010. Cloning and characterization of repetitive sequences and development of SCAR markers specific for the P genome of Agropyron cristatum. Euphytica 172:363-372.)〇
[0026] 小麥-冰草6P二體附加系4844-12 (具有42小麥條染色體+1對冰草6P染色體）： 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所作物種質(zhì)資源保護與研究中心（Wu，J.，X. Yang，H. Wang，H. Li, L. Li, X. Li, et al. 2006. The introgression of chromosome 6P specifying for increased numbers of florets and kernels from Agropyron cristatum into wheat. Theoretical and Applied Genetics 114:13-20·)。
[0027] 小麥-冰草6P短臂端體系（具有42條小麥染色體+1對冰草6P染色體短臂）： 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所作物種質(zhì)資源保護與研究中心。
[0028] 小麥-冰草附加系5038 (具有42條小麥染色體+1對冰草P染色體）：中國農(nóng)業(yè) 科學(xué)院作物科學(xué)研究所作物種質(zhì)資源保護與研究中心（Wu，Μ.，J. Zhang，J. Wang，X. Yang，A. Gao,