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人偏肺病毒多表位抗原及其應(yīng)用_2

文檔序號:9465790閱讀:來源:國知局
c,美國);抗hMPV單克隆抗體clone507khemicon, 美國);CellTiter96@A如eousMTSReagentPowder(Promega,美國);HRP-羊抗鼠 IgG、IgGUIgG2a、IgA(Santa,美國);TMB顯色液(KPL美國);如ickAntibody-mouse 5W(北京博奧龍);切toTox-(M^?HomogeneousMembraneIntegrityAssay(P;romega,美 國);F];TC-antimouseCD4、CD8(Biolegend,美國);Bi〇-PlexP;ro?Mouse切tokineThl/ Th2Assay度lO-RAD,美國);無特殊病原體(SP巧級4-6周雌性BALB/c小鼠,購自中國人民 解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院實驗動物中屯、。TJ-hMPV-2 (A型)、TJ-hMPV-2度型)hMPV毒株為本 實驗分離、鑒定并測序分型保存;Vero-ES和P518細胞為本實驗保存。
[0054] 2.主要儀器
[00巧]C〇2細胞培養(yǎng)箱:美國ThermoSCIENTIFIC公司,型號:F0RMADIRECTHEATC02Incub過tor
[0056] 電子分析天平:德國Sartorius公司,型號:BS110S
[0057] 倒置顯微鏡:日本Olympus公司,型號:CK40
[0058] 離屯、機:德國Eppendoi^f公司,型號:5804R
[0059] 全自動酶標板分析儀:瑞:tSUNRI沈公司,型號:SUNRISE-3
[0060] 3.本發(fā)明使用的人偏肺病毒分離培養(yǎng)方法
[0061]RT-PCR檢測為hMPV陽性的呼吸道標本(如咽拭子、鼻拭子,鼻咽吸取物等),接種 于ver〇-E6細胞或LLC-MK2細胞,37它吸附Ih,棄掉接種液,加入病毒生長液(含2%胎牛 血清、0. 013%膜酶的MEM,或含終濃度2Ug/mlTPCK膜酶的MEM),5%C0237它培養(yǎng),每日觀 察病變,2-3d換一次病毒生長液,75%~100%細胞均出現(xiàn)病變時,收獲病毒液,RT-PCR法 鑒定培養(yǎng)物。參考文獻如下:
[0062] ]_)RegevL,HindiyehM,ShulmanLM,BarakA,LevyV,AzarR,ShalevY,Grossman Z,MendelsonE(2006)Characterizationofhumanmetapneumovirusinfectionsin Israel.JClinMicrobiol44:1484 - 1489
[0063] 2)SarasiniA,PercivalleE,民ovidaF,CampaniniG,GeniniE,Torsellini M,PaolucciS,BaldantiF,MarchiA,Grazia民evelloM,GernaG(2006)Detectionand pathogenicityofhumanmetapneumovirusrespiratoryinfectioninpediatric Italianpatientsduringawinter-springseason.JClinVirol35:59 - 68
[0064] 3)AbikoC,MizutaK,ItagakiT,KatsushimaN,ItoS,MatsuzakiY,Okamoto !,NishimuraH,AokiY,MurataT,HoshinaH,HongoS,OotaniK(2007)Outbreakofhuman metapneumovirusdetectedbyuseoftheVeroE6celllineinisolatescollectedin Yamagata,Japan,in2004and2005.JClinMicrobiol45:1912-1919
[006引 4)LiXY,QienJY,KongM,SuX,YiYP,ZouM,Zhang比Prevalenceofhuman metapneumovirusinhospitalizedchildrenwithrespiratorytractinfectionsin Tianjin,China.ArchVirol. 2009 :154(11) :1831-6.doi:10. 1007/s00705-009-0492-8. Epub2009Sep23.
[0066]實施例I :B細胞表位預(yù)測:
[0067]WhMPVA型參考株化/1/OOF蛋白(539aa,GenBank登錄號AF371337)為模板,采 用下列軟件進行預(yù)測:
[0068]l)BepiPred(ht1:p://www.cbs.化U.化/services/BepiPred/),闊值設(shè)定為 0. 35, 〉〇. 35的位點即可能為B細胞表位;
[0069]2)ABCpred(ht1:p://www.imtech.res.in/ra曲ava/油cpred/),闊值設(shè)定為 0. 51;
[0070] 3)8。巧'6(1化1:化://\¥麗.;[11116油.的3.;[]1/^日曲日¥日/13。巧'6(1/),當闊值設(shè)定為 2. 38 ;
[0071] 4化6口5化1:1口://16口3.。3.]11:〇11.6(111.切/,綜合考慮二級結(jié)構(gòu)、親水性、表面可及 性、可塑性、極性和抗原性等參數(shù)進行線性表位預(yù)測;
[0072]5)LBTOPE(ht1:p: //crdd.osdd.net/ra曲ava/lbtope/lndex.php),可能性 >60 % 即 為可能的表位,選擇軟件判斷為高抗原性的片段,與其他方法預(yù)測片段綜合考慮,最終確定 候選表位;
[0073]6)利用blas1:p軟件化ttp://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.Cgi)分別對預(yù)測 的每個B細胞表位膚進行氨基酸序列保守性分析,選擇A、B型間保守的表位,作為B細胞候 選表位,見表1。
[0074] 表1HMPVF蛋白B細胞表位預(yù)測結(jié)果
[0076] *:Y-表示經(jīng)Bcepred預(yù)測為B細胞表位。
[0077] 實施例2.T細胞表位預(yù)測
[0078] 分別WGenBank上登錄的A型參考毒株化/l/00的N、M、F、G、SH、M2-l和M2-2等 7個蛋白的氨基酸序列(GenBank登錄號:AF371337)為模板,采用下列軟件進行預(yù)測,結(jié)合 力數(shù)值〉〇. 426即為可能的CTL和化表位:
[0079] 針對小鼠M肥-I限制性的CTL表位:
[0080] 1)NetMHCpan2.Sserver(http://www.cbs.dtu.dk/services/NetMHCpan/);
[0081] 2)NetMHC3.4server(http://www.cbs.dtu.dk/services/NetMHC/);
[0082] 針對小鼠M肥-II限制性化表位:
[0083] 3)NetMHCII2. 2server(http://genome,cbs.dtu.dk/services/NetMHCII/):
[0084] 4)ClustalX將篩選出的CTL和化候選表位與GenBank上登錄的不同型別hMPV 進行氨基酸保守性比對,選擇A、B型間保守的表位,作為CTL和化候選表位,表2、3。
[0085] 表2HMPV小鼠CTL細胞表位
[0087] #:文獻報道的CTL表位
[008引 表3HMPV小鼠限制性化表位
[0090]SSB-Strongbinding,強結(jié)合力 [00川實施例3:
[0092]hMPV-mea核巧酸序列由Invitrogen德國公司合成,具體方法是采用化學(xué)法合成 Oligo,通過PCR拼接而成,全長hMPV-mea片段兩端加入酶切位點,將該片段與T載體連接, 轉(zhuǎn)化E.Coli宿主細胞進行大量擴增。
[0093] 實施例4AMPV-MEA表達及純化
[0094]W下為W載體祀T32a(+)質(zhì)粒為例進行表達純化。
[0095] 限制性內(nèi)切酶BamHI、HindIII雙酶切人工合成hMPV-mea(62化P)及祀T32a(+) 質(zhì)粒巧90化P),T4DNA連接酶連接獲得祀T32a-hMPV-mea表達重組質(zhì)粒,轉(zhuǎn)化E.coli BL21 〇)E3)宿主菌,經(jīng)含100yg/mlAmp的LB平板培養(yǎng)基篩選,選取抗性菌落培養(yǎng)后,提取 重組質(zhì)粒,酶切(圖1)、測序鑒定重組質(zhì)粒。鑒定正確菌株用Imol/LIPTG分別于30°C誘 導(dǎo)表達外源蛋白,于誘導(dǎo)后化取菌液超聲破碎后上清及沉淀分別進行SDS-PAGE(圖2)。 采用儀親和層析法進行純化,0.OlMPBS(抑7. 5)透析,化a壯ord法測定蛋白含量。重組外 源蛋白對應(yīng)核巧酸長度為1158bp,編碼氨基酸長度為385aa,預(yù)測分子量為40. 55邸,Pl為 6. 21。用抗His抗體或免疫小鼠后獲得的hMPV-MEA抗血清進行WesternBlot檢測,鑒定 表達蛋白,在45kD附近見特異條帶(圖3,圖4),表明表達的hMPV-MEA可與抗化S抗體及 hMPV-MEA抗血清發(fā)生結(jié)合反應(yīng)。
[0096] 實施例5AMPV-MEA動物免疫
[0097] 4-6w齡SPF級雌性BALB/c小鼠分為W下S組,6只/組,如下:hMPV-MEA20yg+如 ickantibodySW/肌肉注射組(W下稱為hMPV-MEAQ組),于初次免疫后3周加強免疫一次, 劑量及免疫方式同前;hMPV-MEA20yg+Alum100y1+CpG0DN5yg腹腔注射組(W下稱為 hMPV-MEAA+C組),于0、2、4周各免疫一次,劑量及免疫方式同前;正常對照組。末次免疫后 2周采血進行蛋白抗體效價測定,免疫巧光法對特異性進行檢測,同時取脾細胞進行淋己細 胞增殖試驗、CTL細胞殺傷活性檢測,脾細胞分泌細胞因子檢測。
[009引實施例6 :間接
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