一組區(qū)分谷子品種的ssr標(biāo)記及其應(yīng)用
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001] 本發(fā)明屬于生物技術(shù)領(lǐng)域，具體涉及一組區(qū)分谷子品種的SSR標(biāo)記及其應(yīng)用。
【背景技術(shù)】
[0002] 谷子（Setaria italica(L. )Beauv.)又名小米、粟，屬禾本科，狗尾草屬，是我國(guó)北 方地區(qū)主要的糧食作物，營(yíng)養(yǎng)價(jià)值豐富。谷子是我國(guó)起源的古老作物，數(shù)千年來一直作為主 栽培作物培育了我國(guó)北方文明，被譽(yù)為中華民族的哺育作物。谷子又因?yàn)榭购敌詮?qiáng)，水分利 用率高，被認(rèn)為是應(yīng)對(duì)未來日愈嚴(yán)重的水資源短缺的戰(zhàn)略貯備作物，更在今天可持續(xù)生態(tài) 農(nóng)業(yè)建設(shè)中具有不可替代的作用。我國(guó)是谷子的起源國(guó)，擁有世界最豐富的品種類型和種 質(zhì)資源，這些品種資源是我國(guó)農(nóng)業(yè)可持續(xù)發(fā)展的戰(zhàn)略貯備和寶貴財(cái)富。建國(guó)65年來，谷子 育種在全國(guó)各地開展，培育530多個(gè)通過國(guó)家或省級(jí)審（鑒）定的品種，我國(guó)谷子的育成品 種的水平居國(guó)際領(lǐng)先或先進(jìn)的水平，很多品種申請(qǐng)了品種權(quán)保護(hù)。近年來，隨著谷子作為健 康食品被越來越多的人認(rèn)識(shí)，谷子生產(chǎn)有了新的發(fā)展，谷子品種的保護(hù)和鑒定就愈加重要。
[0003] 長(zhǎng)期以來，谷子不同基因型的鑒別主要依賴于對(duì)籽粒和田間形態(tài)性狀，如粒色、籽 粒大小、苗色、葉鞘色、花藥顏色、種皮色、穗型、株型和葉型等有限數(shù)量的性狀觀察，并結(jié)合 育種家的經(jīng)驗(yàn)進(jìn)行區(qū)分。由于形態(tài)學(xué)性狀的表現(xiàn)與田間環(huán)境密切相關(guān)，通過傳統(tǒng)的方法很 難準(zhǔn)確的區(qū)分不同谷子品種（基因型）間的差異情況，而且這些性狀受到種植季節(jié)的限制， 必須在田間種植的情況下才能觀察到。這就造成了谷子品種鑒別困難性和不準(zhǔn)確性。

【發(fā)明內(nèi)容】

[0004] 本發(fā)明的一個(gè)目的是提供一種區(qū)分谷子品種的成套引物。
[0005] 本發(fā)明提供的成套引物由引物對(duì)（I)-(IO)組成：
[0006] (1)為由SEQ ID No. 1所示的單鏈DNA和SEQ ID No. 2所示的單鏈DNA組成的引 物對(duì)1 ;
[0007] (2)為由SEQ ID No. 3所示的單鏈DNA和SEQ ID No. 4所示的單鏈DNA組成的引 物對(duì)2 ;
[0008] (3)為由SEQ ID No. 5所示的單鏈DNA和SEQ ID No. 6所示的單鏈DNA組成的引 物對(duì)3 ;
[0009] (4)為由SEQ ID No. 7所示的單鏈DNA和SEQ ID No. 8所示的單鏈DNA組成的引 物對(duì)4 ;
[0010] (5)為由SEQ ID No. 9所示所示的單鏈DNA和SEQ ID No. 10所示的單鏈DNA組成 的引物對(duì)5 ;
[0011] (6)為由SEQ ID No. 11所示的單鏈DNA和SEQ ID No. 12所示的單鏈DNA組成的 引物對(duì)6 ;
[0012] (7)為由SEQ ID No. 13所示的單鏈DNA和SEQ ID No. 14所示的單鏈DNA組成的 引物對(duì)7 ;
[0013] (8)為由SEQ ID No. 15所示所示的單鏈DNA和SEQ ID No. 16所示的單鏈DNA組 成的引物對(duì)8 ;
[0014] (9)為由SEQ ID No. 17所示的單鏈DNA和SEQ ID No. 18所示的單鏈DNA組成的 引物對(duì)9 ;
[0015] (10)為由SEQ ID No. 19所示的單鏈DNA和SEQ ID No. 20所示的單鏈DNA組成的 引物對(duì)10。
[0016] 本發(fā)明的另一個(gè)目的是提供一種區(qū)分谷子品種的成套PCR試劑。
[0017] 本發(fā)明提供的區(qū)分谷子品種的成套PCR試劑由PCR試劑UPCR試劑2、PCR試劑3、 PCR試劑4、PCR試5、PCR試劑6、PCR試劑7、PCR試劑8、PCR試劑9和PCR試劑10組成；
[0018] 所述PCR試劑1包括上述成套引物中的引物對(duì)1 ;
[0019] 所述PCR試劑2包括上述成套引物中的引物對(duì)2 ;
[0020] 所述PCR試劑3包括上述成套引物中的引物對(duì)3 ;
[0021] 所述PCR試劑4包括上述成套引物中的引物對(duì)4 ;
[0022] 所述PCR試劑5包括上述成套引物中的引物對(duì)5 ;
[0023] 所述PCR試劑6包括上述成套引物中的引物對(duì)6 ;
[0024] 所述PCR試劑7包括上述成套引物中的引物對(duì)7 ;
[0025] 所述PCR試劑8包括上述成套引物中的引物對(duì)8 ;
[0026] 所述PCR試劑9包括上述成套引物中的引物對(duì)9 ;
[0027] 所述PCR試劑10包括上述成套引物中的引物對(duì)10。
[0028] 上述成套PCR試劑中，各個(gè)引物對(duì)獨(dú)立包裝，各條引物獨(dú)立包裝。
[0029] 上述成套PCR試劑中，所述引物對(duì)1、引物對(duì)2、引物對(duì)3、引物對(duì)4、引物對(duì)5、引物 對(duì)6、引物對(duì)7、引物對(duì)8、引物對(duì)9和引物對(duì)10的各條引物的物質(zhì)的量相同。
[0030] 含有上述成套引物或上述成套PCR試劑的試劑盒也屬于本發(fā)明的保護(hù)范圍。
[0031] 上述的成套引物或上述的成套PCR試劑或上述的試劑盒在區(qū)分或輔助區(qū)分谷子 品種中的應(yīng)用也屬于本發(fā)明的保護(hù)范圍。
[0032] 本發(fā)明的最后一個(gè)目的是提供一種區(qū)分待測(cè)谷子a和待測(cè)谷子b是否為同一品種 的方法。
[0033] 本發(fā)明提供一種區(qū)分待測(cè)谷子a和待測(cè)谷子b是否為同一品種的方法包括如下步 驟：
[0034] 用上述的成套引物中的引物對(duì)1、引物對(duì)2、引物對(duì)3、引物對(duì)4、引物對(duì)5、引物對(duì) 6、引物對(duì)7、引物對(duì)8、引物對(duì)9和引物對(duì)10分別對(duì)待測(cè)谷子a和待測(cè)谷子b進(jìn)行PCR擴(kuò)增， 得到待測(cè)谷子a的10對(duì)引物對(duì)的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物和待測(cè)谷子b的10對(duì)引物對(duì)的PCR擴(kuò)增產(chǎn) 物；檢測(cè)所述待測(cè)谷子a的10對(duì)引物對(duì)的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物和所述待測(cè)谷子b的10對(duì)引物對(duì) 的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的大?。?br>[0035] 分別比較所述10對(duì)引物對(duì)中同一對(duì)引物對(duì)擴(kuò)增得到的待測(cè)谷子a的PCR擴(kuò)增產(chǎn) 物大小和待測(cè)谷子b的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物大??；
[0036] 若所述待測(cè)谷子a的10對(duì)引物對(duì)的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物大小與所述待測(cè)谷子b的對(duì)應(yīng) 引物對(duì)的擴(kuò)增產(chǎn)物大小均一致，則所述待測(cè)谷子a和所述待測(cè)谷子b為或候選為同一品種； 若所述待測(cè)谷子a的10對(duì)引物對(duì)的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物大小與所述待測(cè)谷子b的對(duì)應(yīng)引物對(duì)的 擴(kuò)增產(chǎn)物大小不一致，則所述待測(cè)谷子a和所述待測(cè)谷子b不為或候選不為同一品種。
[0037] 上述方法中，所述PCR擴(kuò)增的模板為待測(cè)谷子a或待測(cè)谷子b的基因組DNA。
[0038] 上述方法中，所述引物對(duì)1進(jìn)行PCR擴(kuò)增的退火溫度為55°C ;所述引物對(duì)2進(jìn)行 PCR擴(kuò)增的退火溫度為57°C;所述引物對(duì)3進(jìn)行PCR擴(kuò)增的退火溫度為55°C;所述引物對(duì)4 進(jìn)行PCR擴(kuò)增的退火溫度為51°C ;所述引物對(duì)5進(jìn)行PCR擴(kuò)增的退火溫度為57°C ;所述引 物對(duì)6進(jìn)行PCR擴(kuò)增的退火溫度為55°C ;所述引物對(duì)7進(jìn)行PCR擴(kuò)增的退火溫度為57°C ; 所述引物對(duì)8進(jìn)行PCR擴(kuò)增的退火溫度為55°C ;所述