本發(fā)明涉及基因工程領(lǐng)域,具體地說(shuō),涉及蠟梅cpsoc1基因及其在花期調(diào)控中的應(yīng)用。
背景技術(shù):
蠟梅(chimonanthuspraecox(l.)link),屬于蠟梅科(calycanthaceae)蠟梅屬(chimonanthuslindl.),是我國(guó)特有的名貴觀賞花木。蠟梅是少有的冬季開(kāi)花植物,先花后葉,花朵甜美,花色金黃,花瓣蠟質(zhì),花香馥郁,是冬季最好的切花材料。蠟梅在園林觀賞方面得到了廣泛應(yīng)用,其藥用和食用價(jià)值也得到了開(kāi)發(fā)和利用。蠟梅是叢生灌木,可高達(dá)3至4米。落葉,葉對(duì)生,半革質(zhì);花著生于葉腋;最外輪的花被片成褐色鱗片狀,向內(nèi)過(guò)渡為黃色;花期12月至第二年3月;果期8月至9月,屬于聚合瘦果。
在世界范圍內(nèi)將蠟梅科植物分為4個(gè)屬,10個(gè)種。這四個(gè)屬分別是位于澳大利亞昆士蘭的椅子樹(shù)屬(idiospermunblake),美國(guó)東南部和加利福尼亞州生長(zhǎng)的美國(guó)蠟梅屬(calycantusl.),還包括原產(chǎn)中國(guó)溫帶的夏蠟梅屬(sinocalycanthuscheng)及蠟梅屬(calycantusl.)。李燁(1998)通過(guò)研究蠟梅各屬之間的演化及發(fā)展關(guān)系,又把蠟梅科分為了兩個(gè)亞科,分別是椅子樹(shù)亞科(idiospermoideae)及蠟梅亞科(calycanthoideae),其中蠟梅亞科包括夏蠟梅屬、蠟梅屬及美國(guó)蠟梅屬,而椅子樹(shù)亞科只有椅子樹(shù)屬。四個(gè)屬中演化水平最高的屬是椅子樹(shù)屬,而最原始的屬是蠟梅屬。
蠟梅屬是4個(gè)屬中我國(guó)特有的屬,張若蕙(1999)曾在《世界蠟梅》中提到蠟梅屬有6種1變種。六個(gè)種包括西南蠟梅(c.campanulatusr.h.changetc.s.ding)位于我國(guó)云南的東北部,柳葉蠟梅(c.salicifoliuss.y.hu)分布于江浙一帶,浙江蠟梅(c.zhejiangensism.c.liu)產(chǎn)于我國(guó)的浙江南部及福建北部,山臘梅(c.nitenoliv.)生長(zhǎng)在廣西東北部、湖北南部及湖南南部,蠟梅(c.praecox(l.)link)分布在我國(guó)的中部,突托蠟梅(c.grammatusm.c.liu)目前只生長(zhǎng)在江西安遠(yuǎn),一個(gè)變種是分布在貴州興義的貴州蠟梅(c.campanulatusr.h.changetc.s.dingvar.guizhouensisr.h.chang,var.nov.),是由西南蠟梅(c.campanulatusr.h.changetc.s.ding)演變發(fā)展而來(lái)。
隨著現(xiàn)代分子生物學(xué)的發(fā)展,生物技術(shù)已經(jīng)廣泛應(yīng)用于植物、動(dòng)物和微生物的研究中。有關(guān)蠟梅的分子生物學(xué)研究主要分為品種分類和基因功能兩部分。目前rapd、issr等分子標(biāo)記技術(shù)已熟練地用于蠟梅的品種分類和群居遺傳結(jié)構(gòu)分析等。杜靈娟(2012)等人采用rapd技術(shù)對(duì)南京地區(qū)38個(gè)蠟梅品種自然居群遺傳變異進(jìn)行了分析,發(fā)現(xiàn)群內(nèi)每個(gè)單株之間的遺傳差異比較大,而居群間的遺傳距離較近,因此得出遺傳變異主要發(fā)生于群居內(nèi),這與形態(tài)學(xué)分類結(jié)果相符合。趙明曉等(2011)分別將蠟梅成熟葉及嫩葉的基因組進(jìn)行提取檢測(cè)比較,為后人利用aflp技術(shù)對(duì)蠟梅品種分類及自然居群遺傳多樣性分析進(jìn)行了鋪墊。而趙冰等人建立有關(guān)蠟梅的aflp分子標(biāo)記體系,為aflp技術(shù)用于研究蠟梅系統(tǒng)發(fā)育及遺傳多樣性打下基礎(chǔ)(趙冰,2007);楊佳(2012)采用了est-ssr技術(shù)對(duì)蠟梅的遺傳結(jié)構(gòu)和遺傳多樣性進(jìn)行分析,對(duì)蠟梅的遺傳結(jié)構(gòu)特征及遺傳多樣性水平進(jìn)行了初步探討。
此外,眭順照(2006)構(gòu)建了第一個(gè)蠟梅花cdna文庫(kù),且對(duì)蠟梅開(kāi)花過(guò)程中的基因進(jìn)行了表達(dá)分析,在其基礎(chǔ)上先后克隆出不同功能相關(guān)的基因,并對(duì)其進(jìn)行了系統(tǒng)的研究;如cpcor413pm1(秦華,2006)與蠟梅的抗寒性相關(guān),將其轉(zhuǎn)入煙草,對(duì)轉(zhuǎn)基因煙草進(jìn)行處理發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)基因煙草的耐低溫能力提高;cpap3與花瓣?duì)钇鞴侔l(fā)育形成有關(guān);cppex22與抗衰老、抗氧化存在一定關(guān)系;將cpagl6轉(zhuǎn)入擬南芥中,與野生型擬南芥相比出現(xiàn)提前開(kāi)花、植株矮化、雄蕊的形態(tài)及數(shù)目都發(fā)生了變化;cpkti胰蛋白酶抑制基因,將其轉(zhuǎn)入煙草超量表達(dá),發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)基因煙草的抗蟲(chóng)性提高;cpchia(謝樹(shù)章,2009)幾丁質(zhì)酶基因;cppr-4(秦朝,2012)病程相關(guān)蛋白基因等。上述蠟梅基因功能的初步研究,為以后蠟梅分子生物學(xué)研究做出一定貢獻(xiàn)。
花發(fā)育相關(guān)基因中大部分都來(lái)自一個(gè)保守的轉(zhuǎn)錄因子基因家族—mads-box基因家族。mads的名稱來(lái)源于mcm1(minichromosomemaintenancegene)(來(lái)自啤酒酵母)(passmoreetal.1988)、ag(來(lái)自擬南芥)(yanofskyetal.1990)、def(deficiens)(來(lái)自金魚(yú)草)(schwarz-sommeretal.1992)和srf(serumresponsefactor)(來(lái)自現(xiàn)代人)(normanetal.1988)四個(gè)最早被鑒定的該家族成員的首字母。
人們已經(jīng)從被子植物各大類群中分離到了大量的mikcc型mads-box基因,并對(duì)這些基因的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系進(jìn)行了重建,研究表明被子植物中的這些mads-box基因可被劃歸到12個(gè)主要的基因亞家族(genesubfamilies)中去:ap1/squa、ap3/pi、ag/stk、sep、agl6、ggm13、svp/stmads11、soc1/tm3、agl12、agl17、agl15和flc(beckerandtheissen2003)。在許多雙子葉植物如擬南芥、番茄和金魚(yú)草中,大多數(shù)svp基因在花分生組織的確定和控制開(kāi)花時(shí)間中起作用。soc1是mads-box基因家族soc1/tm3亞家族中的一員,在植物生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程發(fā)揮重要作用,尤其是在植物成花誘導(dǎo)過(guò)程中。soc1可以誘導(dǎo)植物從營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng)轉(zhuǎn)變?yōu)樯成L(zhǎng)。植物開(kāi)花過(guò)程十分復(fù)雜,但是開(kāi)花信號(hào)在網(wǎng)絡(luò)途徑傳播中最終還是將開(kāi)花信號(hào)集中與開(kāi)花整合子的轉(zhuǎn)錄調(diào)控上。soc1在植物營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng)階段被flc和svp形成的復(fù)合體所抑制,但在成花過(guò)程中g(shù)a途徑,自主途徑等都會(huì)下調(diào)flc及svp的表達(dá)水平,從而消除對(duì)soc1抑制作用,促進(jìn)植物開(kāi)花(taoetal.,2012)。目前已克隆了多個(gè)soc1的同源基因,例如大豆(glycinemax)中g(shù)mgal1,甜橙(citrussinensis)中cscl1和cssl2,矮牽牛(petuniahybrid)中uns等。但蠟梅中還未有相關(guān)報(bào)道,所以本實(shí)驗(yàn)在前人的基礎(chǔ)上對(duì)蠟梅cpsoc1的功能進(jìn)行研究。
蠟梅作為少有的冬季開(kāi)花植物,且花香濃郁,具有較高經(jīng)濟(jì)和觀賞價(jià)值。因此對(duì)其花發(fā)育研究十分有意義。而soc1基因是與花發(fā)育相關(guān)的重要基因,所以,對(duì)蠟梅中cpsoc1基因功能分析可以為進(jìn)一步研究蠟梅開(kāi)花機(jī)制提供一些有價(jià)值的參考,并且為植物分子育種提供基因資源。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
本發(fā)明的目的是提供蠟梅cpsoc1基因及其在花期調(diào)控中的應(yīng)用。
為了實(shí)現(xiàn)本發(fā)明目的,本發(fā)明的蠟梅cpsoc1蛋白,其為:
1)由seqidno.2所示的氨基酸組成的蛋白質(zhì);或
2)在seqidno.2所示的氨基酸序列中經(jīng)取代、缺失或添加一個(gè)或幾個(gè)氨基酸且具有同等活性的由1)衍生的蛋白質(zhì)。
本發(fā)明還提供蠟梅cpsoc1蛋白的編碼基因,即cpsoc1基因的cdna序列如seqidno.2所示。
本發(fā)明還提供含有cpsoc1基因的載體、宿主細(xì)胞及工程菌。
本發(fā)明還提供cpsoc1基因在調(diào)控植物花期中的應(yīng)用。所述植物為擬南芥。
本發(fā)明還提供cpsoc1基因在延長(zhǎng)植物花萼宿存時(shí)間中的應(yīng)用。
本發(fā)明還提供cpsoc1基因在制備轉(zhuǎn)基因植物中的應(yīng)用。
本發(fā)明進(jìn)一步提供一種轉(zhuǎn)基因植株的構(gòu)建方法,采用農(nóng)桿菌介導(dǎo)的方法,將含有cpsoc1基因的載體轉(zhuǎn)入植物組織中,篩選轉(zhuǎn)基因植株。
本發(fā)明具有以下優(yōu)點(diǎn):
本發(fā)明首次克隆獲得蠟梅cpsoc1基因,并通過(guò)轉(zhuǎn)基因技術(shù),在植物(擬南芥)中驗(yàn)證了該基因的功能,結(jié)果表明,轉(zhuǎn)基因擬南芥花期較對(duì)照提前,轉(zhuǎn)基因擬南芥中表達(dá)量高的株系和表達(dá)量中等的株系花萼的宿存時(shí)間較對(duì)照顯著延長(zhǎng),為植物的花期調(diào)控和觀賞價(jià)值提升提供了可能。
附圖說(shuō)明
圖1為蠟梅cpsoc1蛋白序列比對(duì)(a)及系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)(b);其中,cp:蠟梅chimonanthuspraecox;mv:弗吉尼亞木蘭magnoliavirginiana(acv88635.1);nu:荷花nelumbonucifera(xp_010272601.1);atrr:無(wú)油樟amborellatrichopoda(xp_006829116.1);jr:胡桃juglansregia(xp_018820387.1);gm:大豆glycinemax(np_001236377.1);vv:葡萄vitisvinifera(xp_010661478.1);cc:山核桃caryacathayensis(ahi85950.1);c:黃麻corchoruscapsularis(omo78683.1);ph:矮牽牛petuniaxhybrida(aak21253.1);nt:煙草nicotianatabacum(caa53782.1);pt:美洲山楊populustremuloides(aap46287.1);pm:車前plantagomajor(caj38368.1);md:蘋(píng)果malusdomestica(np_001280844.1);ta:小麥triticumaestivum(abf57922.1);hv:大麥hordeumvulgare(baj99551.1);os:水稻oryzasativa(xp_015630979.1);cs:甜橙citrussinensis(abs84660.1);g:非洲菊gerberahybrid(cbx45125.1);eg:桉樹(shù)eucalyptusgrandis(np_001289658.1);at:擬南芥arabidopsisthaliana,soc1(np_182090.1)、svp(oap09055.1)和agl24(np_194185.1)。mi:杧果mangiferaindica(akj85721.1);zm:玉米zeamays(air75259.1)。
圖2為cpsoc1實(shí)時(shí)定量pcr分析結(jié)果,actin基因作為內(nèi)參。
圖3為35s::cpsoc1#超量表達(dá)轉(zhuǎn)化野生型擬南芥(col-0)t2代在長(zhǎng)日照(14小時(shí)光照/10小時(shí)黑暗)條件下實(shí)時(shí)定量pcr檢測(cè)結(jié)果;cpsoc1相對(duì)表達(dá)量。三個(gè)重復(fù),actin作為內(nèi)參。
圖4為35s::cpsoc1超量表達(dá)轉(zhuǎn)化野生型擬南芥(col-0)t2代的表型分析結(jié)果。
圖5為35s::cpsoc1超量表達(dá)轉(zhuǎn)化野生型擬南芥(col-0)t2代在長(zhǎng)日照(14小時(shí)光照/10小時(shí)黑暗)條件下實(shí)時(shí)定量pcr檢測(cè)結(jié)果;tfl1(5a)、flc(5b)、svp(5c)、ga(5d)、ft(5e)、co(5f)、soc1(5g)、lfy(5h)、ap1(5i)相對(duì)表達(dá)量。三個(gè)重復(fù),tubulin作為內(nèi)參。
具體實(shí)施方式
以下實(shí)施例用于說(shuō)明本發(fā)明,但不用來(lái)限制本發(fā)明的范圍。若未特別指明,實(shí)施例均按照常規(guī)實(shí)驗(yàn)條件,如sambrook等分子克隆實(shí)驗(yàn)手冊(cè)(sambrookj&russelldw,molecularcloning:alaboratorymanual,2001),或按照制造廠商說(shuō)明書(shū)建議的條件。
實(shí)施例1蠟梅cpsoc1基因的克隆及表達(dá)分析
1蠟梅cpsoc1基因克隆
1.1總rna的提取
(1)取罄口蠟梅(chimonanthuspraecox)(種植于重慶市北碚區(qū)天生路2號(hào)西南大學(xué)校園內(nèi)第四運(yùn)動(dòng)場(chǎng)旁邊,常規(guī)養(yǎng)護(hù)管理)花芽、花蕾(4、5、7、9月份)、盛開(kāi)、衰敗及葉片混合樣品。rna提取所用的玻璃器皿、研缽、研杵、剪刀、鑷子、藥勺等均用0.1%depc水溶液在37℃下浸泡處理12h,然后用錫紙包裹于180℃烘箱中干熱滅菌4h后冷卻備用。
rna提取采用北京天根公司生產(chǎn)的rnapreppure植物總rna提取試劑盒,提取過(guò)程根據(jù)說(shuō)明書(shū)略有改動(dòng),具體操作如下:
(1)取500μl裂解液rl轉(zhuǎn)入1.5ml離心管中,加入1%β-巰基乙醇,混勻備用。液氮中研磨適量植物組織成細(xì)粉后,取50mg細(xì)粉轉(zhuǎn)入離心管中,加入上述rl500μl,立即用渦旋振蕩器劇烈震蕩混勻,使其充分裂解。
(2)將溶液于12,000rpm離心5min,小心吸取收集管中的上清至新的rnase-free離心管中,吸頭盡量避免接觸收集管中的細(xì)胞碎片沉淀。
(3)緩慢加入0.5倍上清體積的無(wú)水乙醇(通常為250μl),混勻(此時(shí)可能出現(xiàn)沉淀),將得到的溶液和沉淀一起轉(zhuǎn)入吸附柱cr3中,12,000rpm離心30-60s,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱cr3放回收集管中。
(4)dnasei工作液的配制:取10μldnasei儲(chǔ)存液放入新的rnase-free離心管中,加入70μlrdd溶液,輕柔混勻。
(5)向吸附柱cr3中央加入80μldnasei工作液,室溫放置15min。
(6)向吸附柱cr3中央加入350μl去蛋白液rw1,12,000rpm離心30-60s,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱cr3放回收集管中。
(7)向吸附柱cr3中央加入500μl漂洗液rw(使用前加入無(wú)水乙醇),室溫靜置2min,12,000rpm離心30-60s,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱cr3放回收集管中。重復(fù)該步驟一次。
(8)12,000rpm離心2min,倒掉廢液。將吸附柱cr3置于室溫放置數(shù)分鐘,以徹底晾干吸附材料中殘余的漂洗液。
(9)將吸附柱cr3放入一個(gè)新的rnase-free離心管中,向吸附膜的中間部位懸空滴加20-100μlrnase-freeddh2o,室溫放置2min,12,000rpm離心2min,得到rna溶液。
1.23’race技術(shù)克隆cpsoc1基因3’末端cdna
本實(shí)驗(yàn)根據(jù)與蠟梅親緣關(guān)系較近物種的soc1基因保守部分序列設(shè)計(jì)3'race簡(jiǎn)并引物,以蠟梅cdna為模板進(jìn)行pcr擴(kuò)增,得到蠟梅cpsoc1的部分3'racecdna序列,在獲得的序列5'端用軟件primerprimer5.0設(shè)計(jì)兩輪race的特異引物進(jìn)行pcr擴(kuò)增,將獲得5'端的序列與原來(lái)序列進(jìn)行電子拼接得到蠟梅cpsoc1全長(zhǎng)cdna序列,通過(guò)分析蠟梅cpsoc1全長(zhǎng)cdna序列,用軟件primerprimer5.0在跨最大開(kāi)放閱讀框的兩端設(shè)計(jì)1對(duì)特異引物進(jìn)行pcr擴(kuò)增。引物的序列(見(jiàn)表1):
表1蠟梅cpsoc1基因克隆引物
注:r:a/g;s:g/c;y:c/t;k:g/t;w:a/t;引物后f代表上游,r代表下游。
(1)3'race第一鏈cdna的反轉(zhuǎn)錄合成
以上面提取的蠟梅花芽、花蕾、盛開(kāi)、衰敗及葉片總rna混合樣為模板,用引物3'-racecdsprimera(表1),使用美國(guó)clontech公司的smarterrace5'3'kit試劑盒進(jìn)行3'racecdna第一鏈合成。按照說(shuō)明書(shū)步驟進(jìn)行,具體反轉(zhuǎn)錄體系與程序如下:
反轉(zhuǎn)錄體系:
蠟梅總rna1-11μl
3'-cdsprimera1μl
sterileh2o0-10μl
充分混勻,短暫離心。42℃,溫育90min,72℃加熱10min。-20℃放置可保存3個(gè)月。
(2)3'racepcr擴(kuò)增第一輪
以反轉(zhuǎn)錄合成的第一鏈cdna為模板,以3'race上游簡(jiǎn)并引物和upm(universalprimermix)進(jìn)行pcr擴(kuò)增。
pcr擴(kuò)增的反應(yīng)體系:
pcr反應(yīng)程序:
94℃變性5min;94℃變性30s,63℃退火30s,72℃延伸1min,3個(gè)循環(huán);94℃變性30s,61℃退火30s,72℃延伸1min,3個(gè)循環(huán);94℃變性30s,59℃退火30s,72℃延伸1min,3個(gè)循環(huán);94℃變性30s,57℃退火30s,72℃延伸1min,3個(gè)循環(huán);94℃變性30s,55℃退火30s,72℃延伸1min,3個(gè)循環(huán);94℃變性30s,53℃退火30s,72℃延伸1min,15個(gè)循環(huán)72℃延伸10min。
電泳檢測(cè):取5μl擴(kuò)增產(chǎn)物用瓊脂糖凝膠(1%)電泳,用凝膠成像系統(tǒng)(bio-radmolecμlarimagergeldoxxr+紫外與可見(jiàn)分析系統(tǒng))進(jìn)行觀察,拍照。
(3)3'racepcr擴(kuò)增第二輪
3'racepcr擴(kuò)增第二輪以稀釋50倍的第一輪的產(chǎn)物為模板,正向引物為3'race第二輪簡(jiǎn)并引物,反向引物用nesteduniversalprimera,反應(yīng)體系,pcr程序及其他同3'racepcr擴(kuò)增第一輪相同。
(4)結(jié)果檢測(cè):取pcr產(chǎn)物5μl,電泳檢測(cè)。
1.35’race技術(shù)克隆cpsoc1基因5’末端cdna
以上面提取的蠟梅花芽、花蕾、盛開(kāi)、衰敗及葉片總rna的混合樣為模板,用引物5'-cdsprimera和smarteriiaoligonucleotide引物的序列,使用美國(guó)clontech公司的smarterrace5'3'kit試劑盒進(jìn)行5'racecdna第一鏈的合成。按照說(shuō)明書(shū)的步驟進(jìn)行操作,具體反應(yīng)體系及pcr程序如下:
反轉(zhuǎn)錄體系:
充分混勻,短暫離心。72℃,溫育3min,42℃冷育2min。
充分混勻,短暫離心。42℃,溫育90min,72℃加熱10min。-20℃放置可保存3個(gè)月。用時(shí)加tricineedtabuffer稀釋。
1.45'racepcr擴(kuò)增
(1)5'racepcr擴(kuò)增第一輪
以反轉(zhuǎn)錄合成的5'racecdna第一鏈為模板,正向引物為upm(universalprimermix),反向引物為5'race第一輪引物進(jìn)行pcr擴(kuò)增。
pcr擴(kuò)增的反應(yīng)體系:
pcr反應(yīng)程序:
94℃變性5min;94℃變性30s,60℃退火30s,72℃延伸1min,26個(gè)循環(huán);72℃延伸10min。
電泳檢測(cè):取5μl擴(kuò)增產(chǎn)物用瓊脂糖凝膠(%)電泳,用凝膠成像系統(tǒng)(bio-radmolecμlarimagergeldoxxr+紫外與可見(jiàn)分析系統(tǒng))進(jìn)行觀察,拍照。
(2)5'racepcr擴(kuò)增第二輪
5'racepcr擴(kuò)增第二輪以稀釋50倍的第一輪的擴(kuò)增產(chǎn)物為模板,正向引物為nesteduniversalprimera,反向引物為5'race第二輪特異引物,反應(yīng)體系,pcr程序及其他同5'racepcr擴(kuò)增第一輪相同。
1.5pcr回收產(chǎn)物的純化
pcr擴(kuò)增獲得的產(chǎn)物用l%的瓊脂糖凝膠進(jìn)行檢測(cè),將3’race擴(kuò)增產(chǎn)物中大小為800-1000bp之間的條帶和5’race特異條帶切下來(lái),進(jìn)行回收,并按照天根公司普通瓊脂糖凝膠dna膠回收試劑盒說(shuō)明書(shū)對(duì)目的dna片段進(jìn)行回收。
1.6pcr回收產(chǎn)物的連接
連接反應(yīng)體系見(jiàn)表3。
表3連接反應(yīng)體系
4℃過(guò)夜,進(jìn)行連接反應(yīng)。
1.7cacl2法制備大腸桿菌dh5α感受態(tài)細(xì)胞
(1)從新活化的大腸桿菌平板上挑取一單菌落,接種于3-5mllb液體培養(yǎng)中,37℃振蕩培養(yǎng)12h左右,直至對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期。將該菌懸液以1:100-1:50轉(zhuǎn)接于50mllb液體培養(yǎng)基中,37℃振蕩擴(kuò)大培養(yǎng),至od600為0.4-0.6時(shí)停止培養(yǎng)。
(2)將培養(yǎng)液倒入在冰上預(yù)冷好的無(wú)菌50ml離心管中,冰上放置10min,于4℃,4,100rpm,離心10min。
(3)倒凈上清培養(yǎng)液,在無(wú)菌濾紙上倒置1min,用30ml冰上預(yù)冷的0.1mcacl2溶液輕輕懸浮細(xì)胞,4℃,4,100rpm,離心10min。
(4)棄去上清液,加入2ml冰上預(yù)冷的0.1mo1/lcacl2溶液,輕輕懸浮細(xì)胞。冰上放置片刻后,即制成了感受態(tài)細(xì)胞懸液;制備好的感受態(tài)細(xì)胞懸液可直接用于轉(zhuǎn)化實(shí)驗(yàn),也可加入占總體積15%左右高壓滅菌過(guò)的甘油,混勻分裝后用液氮澆于其上迅速結(jié)凍后于-80℃保存。
1.8連接產(chǎn)物的轉(zhuǎn)化
連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞
(1)將大腸桿菌感受態(tài)從-80℃冰箱取出,置于冰上融化。將連接產(chǎn)物于70℃水浴鍋中滅活10min。
(2)將連接產(chǎn)物或待轉(zhuǎn)化的質(zhì)粒,按照每200μl感受態(tài)細(xì)胞加入100ng已純化質(zhì)粒的標(biāo)準(zhǔn),加入到感受態(tài)細(xì)胞中,輕輕混勻后在冰上靜置30min。
(3)42℃水浴中熱激90s,迅速取出后立即置于冰上2min。
(4)加入600μl37℃預(yù)熱的無(wú)抗lb液體培養(yǎng)基,混勻后于37℃,130rpm震蕩培養(yǎng)1h。
(5)室溫下10,000rpm離心1min,棄掉400μl上清液,將剩余的200μl菌夜重懸,用無(wú)菌的涂棒將重懸菌液均勻涂在含有相應(yīng)抗生素的lb固體平板上,37℃倒置培養(yǎng)12-14h。
1.9陽(yáng)性克隆培養(yǎng)與pcr鑒定
單克隆通過(guò)iptg/x-gal篩選,取無(wú)菌的1.5ml離心管,加入0.5ml含50mg/lamp的lb液體培養(yǎng)基,從轉(zhuǎn)化過(guò)的平板上用無(wú)菌牙簽輕輕挑取單菌落置于離心管中,37℃200rpm搖床中振蕩培養(yǎng)8-10h,待菌液渾濁后,以其作為模板進(jìn)行pcr鑒定。
菌液pcr擴(kuò)增體系:
pcr反應(yīng)程序:
94℃變性5min;94℃變性30s,54℃退火30s,72℃延伸1min,26個(gè)循環(huán);72℃延伸10min。
1.10測(cè)序及序列分析
選擇插入片段大小與預(yù)期接近且特異的陽(yáng)性克隆進(jìn)行測(cè)序。蠟梅cpsoc1基因的cdna序列如seqidno.2所示,其編碼蛋白的氨基酸序列如seqidno.1所示。
蠟梅cpsoc1基因cdna全長(zhǎng)917個(gè)核苷酸,包含1個(gè)12bp(1-12bp)的5'-utr區(qū)(5'-untranslatedregion),1個(gè)678bp(13-690bp)的完整開(kāi)放閱讀框(openingreadframe,orf)和1個(gè)227bp(691-917bp)的3'-utr區(qū)(3'-untranslatedregion)。編碼區(qū)由241個(gè)a、169個(gè)g、131個(gè)c、和137個(gè)t組成,a+t含量約為55.75%,g+c含量約為44.25%。
將蠟梅cpsoc1蛋白與荷花、木蘭、大豆、葡萄、擬南芥(arabidopsisthaliana)等植物的soc1蛋白進(jìn)行多重序列比對(duì)。結(jié)果(如圖1a),蠟梅cpsoc1蛋白與其他soc1蛋白具有較高的相似性,相似度約59.29%,結(jié)構(gòu)比較保守。與其他同源蛋白一樣,蠟梅soc1蛋白具有最保守的m區(qū),半保守的k區(qū),保守性相對(duì)較差的i區(qū)及最不保守的c末端。
蠟梅cpsoc1各類基因的系統(tǒng)發(fā)育分析除了來(lái)自于本發(fā)明所獲得的基因及蛋白序列之外,其他數(shù)據(jù)均來(lái)自ncbi中公開(kāi)發(fā)表的數(shù)據(jù)?;趍ikc結(jié)構(gòu)域的蛋白質(zhì)序列用mega4.0構(gòu)建的nj樹(shù)(tamuraetal,2007)。結(jié)果如圖1b,圖中可以看出不同物種的soc1同源基因聚為一支,擬南芥的atsvp和atagl24聚為一支;單子葉植物的soc1同源基因聚為一支,雙子葉植物的soc1同源基因聚為一支,且蠟梅與無(wú)油樟、荷花、木蘭聚為一支親緣關(guān)系較近,說(shuō)明其進(jìn)化地位比較低。
2蠟梅cpsoc1基因表達(dá)分析
對(duì)蠟梅cpsoc1基因在不同月份的花序原基或花序中表達(dá)分析,發(fā)現(xiàn)該基因在4月(4im),5月(5im),7月(7fm)和9月(9fm)中均有表達(dá),但表達(dá)水平有較大差異(圖2)。該基因在5im時(shí)期表達(dá)量最高,是其他月份中表達(dá)量的6倍以上,其他月份中表達(dá)量相差不大(圖2)。
實(shí)施例2農(nóng)桿菌介導(dǎo)的蠟梅cpsoc1基因轉(zhuǎn)化(擬南芥)
1表達(dá)載體的構(gòu)建
根據(jù)實(shí)驗(yàn)要求,本實(shí)施例中利用了載體pcambia2301g上的多克隆酶切位點(diǎn)特性,將克隆載體上的cdna片段酶切后連接到表達(dá)載體當(dāng)中。
2農(nóng)桿菌gv3101和eha105電激感受態(tài)細(xì)胞的制備和表達(dá)載體的轉(zhuǎn)化
(1)挑取新鮮的農(nóng)桿菌gv3101和eha105單菌落于10mllb液體培養(yǎng)基中,28℃振蕩培養(yǎng)至對(duì)數(shù)晚期;
(2)取1ml菌液加入100ml新鮮lb液體培養(yǎng)基中,28℃振蕩培養(yǎng)至od600約為0.5-1.0;
(3)將菌液轉(zhuǎn)移至50ml離心管中,冰浴30分鐘;
(4)4℃,4000rpm離心10分鐘,收集菌體,棄上清;
(5)沉淀用50ml預(yù)冷的hepes滅菌蒸餾水重懸;
(6)4℃,4000rpm離心10分鐘,收集菌體,棄上清;
(7)重復(fù)操作(5)、(6)兩次,每次hepes減半;
(8)用含10%甘油的滅菌蒸餾水重懸菌體,按每管50μl體積分裝至1.5mleppendorf管中,即為農(nóng)桿菌感受態(tài)細(xì)胞,分裝后直接使用或于-70℃保存?zhèn)溆茫?/p>
(9)取50μl上述制備的感受態(tài)細(xì)胞,加入0.5μg質(zhì)粒,輕輕混勻,置于冰上;
(10)2500伏電擊5ms,立刻加入500μllb液體培養(yǎng)基;
(11)28℃,150rpm,恢復(fù)培養(yǎng)4個(gè)小時(shí);
(12)涂布適量的細(xì)胞于篩選lb固體培養(yǎng)基平板上,超凈臺(tái)吹干表層液體,28℃培養(yǎng)2-3天。
3農(nóng)桿菌介導(dǎo)的擬南芥轉(zhuǎn)化(花芽浸泡法)
待擬南芥花序抽苔約1cm高時(shí),剪去主花序。待植株發(fā)出側(cè)生花序,并生長(zhǎng)至花蕾未展開(kāi)時(shí),進(jìn)行轉(zhuǎn)化實(shí)驗(yàn)。接種含有表達(dá)載體的農(nóng)桿菌克隆于5mllb液體培養(yǎng)基(gen:50mg/l,kan:50mg/l)中,28℃,200rpm中振蕩培養(yǎng)過(guò)夜;按1:50的比例轉(zhuǎn)接到200mllb液體培養(yǎng)基中,28℃,200rpm,振蕩培養(yǎng)5小時(shí);5000rpm,離心15分鐘,收集菌體;重懸于緩沖液(5%蔗糖,0.03%silwetl-77)中,調(diào)od600至0.8。將花序倒置放入混好的農(nóng)桿菌菌液中10秒,用保鮮膜覆蓋整個(gè)花序,24小時(shí)后取下保鮮膜,繼續(xù)培養(yǎng)于培養(yǎng)室(22℃,14小時(shí)光照/10小時(shí)黑暗),直至收獲種子(cloughandbent,1998)。
4擬南芥陽(yáng)性苗的篩選
(1)將收獲的轉(zhuǎn)化擬南芥種子在70%乙醇中浸泡2分鐘,去上清;
(2)次氯酸鈉溶液浸泡5分鐘進(jìn)一步進(jìn)行消毒處理,用無(wú)菌水漂洗3-5次;
(3)將擬南芥種子播于含50μg/ml抗生素kan的1/2ms培養(yǎng)基平板上;
(4)如果穿梭載體上具kan抗性的報(bào)告基因,將培養(yǎng)平板置于光照培養(yǎng)室(22℃,16小時(shí)光照/8小時(shí)黑暗)培養(yǎng)7-10天;選擇經(jīng)過(guò)kan篩選后長(zhǎng)勢(shì)良好,真葉葉片及生長(zhǎng)點(diǎn)呈深綠色且根部可以扎入培養(yǎng)基的植株,初步確定為陽(yáng)性苗,移栽入土中。
5實(shí)時(shí)定量rt-pcr
以轉(zhuǎn)基因擬南芥t2代和以蠟梅各器官為材料,用trizol試劑盒提取總rna,然后用primescriptrtreagentkit(takara,japan)進(jìn)行cdna第一鏈的反轉(zhuǎn)錄。將cdna第一鏈稀釋10倍后作為模板進(jìn)行pcr反應(yīng)。然后利用sybrpremixextaq(bio-rad,usa)反應(yīng)試劑盒,在bio-radcfx96熒光定量pcr儀(bio-rad,美國(guó))上完成反應(yīng)。分析所獲得的數(shù)據(jù)并計(jì)算樣品中目的基因濃度。pcr反應(yīng)體系為10μl,共設(shè)置3個(gè)重復(fù),反應(yīng)條件為40個(gè)循環(huán),95℃60秒,95℃5秒,60℃34秒。
6轉(zhuǎn)基因擬南芥株系cpsoc1基因表達(dá)分析
(1)轉(zhuǎn)基因擬南芥表達(dá)量檢測(cè)
為了可以進(jìn)一步驗(yàn)證cpsoc1基因在轉(zhuǎn)基因的擬南芥中的表達(dá)水平,提取野生型擬南芥和轉(zhuǎn)基因擬南芥較嫩葉片的總rna,進(jìn)行cdna第一鏈反轉(zhuǎn)錄,將反轉(zhuǎn)錄的cdna第一鏈做為模板,把擬南芥actin基因作為內(nèi)參基因,對(duì)轉(zhuǎn)基因擬南芥中cpsoc1基因的表達(dá)量進(jìn)行檢測(cè)及分析,熒光定量pcr結(jié)果(圖3)。野生型的擬南芥中幾乎沒(méi)有檢測(cè)到cpsoc1基因的表達(dá),在檢測(cè)的11個(gè)轉(zhuǎn)基因的擬南芥單株中,cpsoc1基因的表達(dá)水平差異較大,其中5號(hào)株系的表達(dá)量最高,16號(hào)株系中高,8號(hào)株系表達(dá)量次之,其余單株系的表達(dá)量較低。在后期對(duì)轉(zhuǎn)基因的擬南芥分析時(shí),根據(jù)熒光定量的結(jié)果,選取表達(dá)量最高的5-30號(hào)、表達(dá)量中等的16-27號(hào)和表達(dá)量稍低的8-27號(hào)代表不同表達(dá)量的轉(zhuǎn)基因株系進(jìn)行表型觀察。
7轉(zhuǎn)基因擬南芥表型分析
(1)花期提前:野生型擬南芥作為對(duì)照,對(duì)純合的轉(zhuǎn)基因擬南芥t2株系進(jìn)行表型觀察,結(jié)果發(fā)現(xiàn),轉(zhuǎn)基因擬南芥株系的顯蕾時(shí)間、抽葶時(shí)間、第一朵花開(kāi)的時(shí)間和第一個(gè)果莢出現(xiàn)時(shí)間均比野生型擬南芥植株早,但是現(xiàn)蕾時(shí)間cpsoc1/8-27與wt之間沒(méi)有顯著差異,而cpsoc1/16-27和cpsoc1/5-30與wt相比具有顯著差異;抽葶時(shí)間cpsoc1/8-27和cpsoc1/16-27與wt之間沒(méi)有顯著差異,而cpsoc1/5-30與wt相比具有顯著差異;第一朵花開(kāi)的時(shí)間cpsoc1/8-27,cpsoc1/16-27和cpsoc1/5-30與wt相比三者都具有顯著差異;第一個(gè)果莢的時(shí)間cpsoc1/8-27與wt之間沒(méi)有顯著差異,而cpsoc1/16-27和cpsoc1/5-30與wt相比且具有顯著差異;轉(zhuǎn)基因擬南芥的三個(gè)株系與野生型擬南芥相比蓮座葉的數(shù)量均比野生型的減少,其中cpsoc1/8-27與wt之間差異不顯著(蓮座葉平均數(shù)為10.08和11.02片),而cpsoc1/16-27和cpsoc1/5-30(蓮座葉平均數(shù)為6.53和6.33片)與wt相比具有顯著差異;轉(zhuǎn)基因擬南芥的三個(gè)株系與野生型擬南芥相比,cpsoc1/5-30莖生葉數(shù)量比野生型的增多,而其他兩個(gè)株系都比野生型的少,其中cpsoc1/5-30與wt之間差異不顯著,而cpsoc1/16-27和cpsoc1/5-30與wt相比具有顯著差異;轉(zhuǎn)基因三個(gè)株系的葉片總數(shù)都比野生型減少,其中cpsoc1/8-27與wt之間差異不顯著,而cpsoc1/16-27和cpsoc1/5-30與wt相比具有顯著差異(表2,圖4)。
(2)株高變高、花萼宿存:轉(zhuǎn)基因擬南芥的三個(gè)株系與野生型擬南芥相比株高都變高了,其中cpsoc1/8-27和cpsoc1/16-27與野生型相比具有顯著差異,而cpsoc1/5-30與野生型相比則具有極顯著差異(表2,圖4)。轉(zhuǎn)基因擬南芥還發(fā)現(xiàn)了表達(dá)量高的株系和表達(dá)量中等的株系花萼的宿存時(shí)間延長(zhǎng),表達(dá)低的株系和野生型的擬南芥卻不會(huì)有花萼宿存的現(xiàn)象。
表235s::cpsoc1/擬南芥t2代株系表型相關(guān)指標(biāo)觀察
每組數(shù)為平均值±標(biāo)準(zhǔn)差;a、b、c、d表示p<0.05水平上差異顯著;
可以看出,表達(dá)量越高顯蕾時(shí)間、抽葶時(shí)間、開(kāi)花時(shí)間越提前,其蓮座葉和葉片總數(shù)的數(shù)量越少。由于植物由營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng)向生殖生長(zhǎng)轉(zhuǎn)化的時(shí)間提前,導(dǎo)致其營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng)時(shí)間變短,所以蓮座葉和葉片總數(shù)的數(shù)目變少,開(kāi)花時(shí)間提前等。由以上的結(jié)果可以得出cpsoc1基因具有促進(jìn)植物開(kāi)花和促進(jìn)植物生長(zhǎng)的功能。
8轉(zhuǎn)基因擬南芥內(nèi)源基因的實(shí)時(shí)熒光定量pcr檢測(cè)
為了研究轉(zhuǎn)入擬南芥的cpsoc1基因的超表達(dá)對(duì)其自身開(kāi)花基因的影響,分別對(duì)轉(zhuǎn)基因株系及野生型擬南芥提取rna,進(jìn)行熒光定量pcr檢測(cè),結(jié)果表明擬南芥中轉(zhuǎn)入cpsoc1會(huì)使其自身的ap1和lfy表達(dá)量升高,對(duì)其他基因的表達(dá)量影響較小(圖5)。擬南芥開(kāi)花過(guò)程受到flc、ap1、soc1和lfy等基因的共同調(diào)節(jié),其中flc對(duì)ft和soc1起到抑制作用,soc1和ap1等基因可以促進(jìn)植物開(kāi)花,flc對(duì)植物開(kāi)花起到抑制作用。由此可以推測(cè)出cpsoc1的超量表達(dá)使植物開(kāi)花的ap1基因和lfy基因的表達(dá)量上調(diào),從而促使轉(zhuǎn)基因擬南芥的開(kāi)花時(shí)間提前。
雖然,上文中已經(jīng)用一般性說(shuō)明及具體實(shí)施方案對(duì)本發(fā)明作了詳盡的描述,但在本發(fā)明基礎(chǔ)上,可以對(duì)之作一些修改或改進(jìn),這對(duì)本領(lǐng)域技術(shù)人員而言是顯而易見(jiàn)的。因此,在不偏離本發(fā)明精神的基礎(chǔ)上所做的這些修改或改進(jìn),均屬于本發(fā)明要求保護(hù)的范圍。
序列表
<110>西南大學(xué)
<120>蠟梅cpsoc1基因及其編碼的蛋白和應(yīng)用
<130>
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