本發(fā)明涉及利用基因組生物信息分析技術(shù)的優(yōu)勢，具體涉及一種用于食蟹猴起源(亞群)鑒定的snp標(biāo)記及其應(yīng)用；通過高通量測序并篩選出食蟹猴的48個snp標(biāo)記，用以區(qū)分不同起源(亞群)的食蟹猴。
背景技術(shù)：
目前國內(nèi)生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)迅猛發(fā)展，實驗動物作為生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)的重要支撐條件及生命科學(xué)研究的重要材料，其質(zhì)量直接關(guān)系到實驗結(jié)果的可靠性和真實性。實驗動物的遺傳質(zhì)量是實驗動物質(zhì)量好壞的重要因素之一，只有應(yīng)用遺傳特性穩(wěn)定的實驗動物才能保證生物醫(yī)學(xué)研究結(jié)果具有可比性及實驗結(jié)果的可靠性。因此，實驗動物質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)化，尤其遺傳質(zhì)量的標(biāo)準(zhǔn)化將直接影響生物醫(yī)藥的研發(fā)水平。但由于缺乏統(tǒng)一的、標(biāo)準(zhǔn)化的遺傳質(zhì)量控制標(biāo)準(zhǔn)，實驗動物的遺傳質(zhì)量監(jiān)控也漸漸成為其生產(chǎn)應(yīng)用中較突出的問題。就目前情況而言，篩查到國內(nèi)外廣泛認(rèn)可的有效遺傳標(biāo)記是實現(xiàn)實驗動物遺傳質(zhì)量監(jiān)測技術(shù)突破的有途徑之一。
目前，我國實驗動物遺傳監(jiān)測主要推行國家標(biāo)準(zhǔn)(gb14923-2010)，主要采取形態(tài)學(xué)(毛色基因測試法)、數(shù)量遺傳學(xué)(下頜骨測定法)、免疫標(biāo)記基因檢測法(皮膚移植法)以及生化標(biāo)記基因檢測法等。這些方法各有優(yōu)勢，而且在實驗動物的繁殖生產(chǎn)和日常監(jiān)測管理工作中仍有至關(guān)重要的使用價值，但隨著實驗動物科學(xué)和分子生物學(xué)的飛速發(fā)展，傳統(tǒng)的檢測方法包括國標(biāo)力推的生化標(biāo)記基因檢測法、皮膚移植法和免疫學(xué)檢測法已不能完全適應(yīng)多種品系實驗動物的遺傳監(jiān)測工作。
隨著dna指紋技術(shù)、隨機擴增多態(tài)性(rapd)、微衛(wèi)星和單核苷酸多態(tài)性(snp)等一系列分子遺傳標(biāo)記的發(fā)現(xiàn)，微衛(wèi)星和snp標(biāo)記脫穎而出，已經(jīng)大量應(yīng)用于實驗動物的遺傳檢測，其中，snp標(biāo)記是繼生化標(biāo)記和rapd遺傳標(biāo)記之后的第三代dna分子標(biāo)記，具有位點豐富、遺傳穩(wěn)定、篩選規(guī)?；蕊@著優(yōu)點。然而，相比于目前先進的分子檢測技術(shù)及國際同行的領(lǐng)先程度，我國的遺傳監(jiān)測標(biāo)準(zhǔn)還有待改進，且刻不容緩。
技術(shù)實現(xiàn)要素：
為了克服現(xiàn)有技術(shù)的缺點與不足，本發(fā)明的目的在于提供一種用于食蟹猴起源(亞群)鑒定的snp標(biāo)記。
食蟹猴(macacafascicularis)是生物醫(yī)藥研究中常用的靈長類動物，其自然分布區(qū)域在靈長類中僅次于人類及恒河猴，主要分布于亞洲東南部國家，其不同區(qū)域種群間的遺傳差異會對相同實驗的治療效果產(chǎn)生一定偏差影響，因此，本發(fā)明旨在利用高通量測序篩選出食蟹猴的48個snp標(biāo)記，用以區(qū)分不同起源(亞群)的食蟹猴。
本發(fā)明的另一目的在于提供所述的用于食蟹猴起源(亞群)鑒定的snp標(biāo)記的應(yīng)用。
本發(fā)明的目的通過下述技術(shù)方案實現(xiàn)：
本發(fā)明首先對由20只已知起源(亞群)的食蟹猴dna樣本組成的簡化代表文庫進行簡化基因組測序，利用生物信息學(xué)方法仔細篩選出48個起源(亞群)標(biāo)記(aimspanel)，盡量最大覆蓋整個基因組，用以鑒定未知地理起源(亞群)食蟹猴的起源(亞群)鑒定。
然后，隨機抽取了400只未知起源(亞群)的食蟹猴，應(yīng)用48個snp(aimspanel)對提取的dna進行基因分型，并用structure來鑒定食蟹猴的地理起源(亞群)，并將已知起源(亞群)(分別為印度支那、毛里求斯、馬來西亞群島及菲律賓群島)的食蟹猴作為參考樣本。
所述的48個snp位點為snp1、snp2、snp3、snp4、snp5、snp6、snp7、snp8、snp9、snp10、snp11、snp12、snp13、snp14、snp15、snp16、snp17、snp18、snp19、snp20、snp21、snp22、snp23、snp24、snp25、snp26、snp27、snp28、snp29、snp30、snp31、snp32、snp33、snp34、snp35、snp36、snp37、snp38、snp39、snp40、snp41、snp42、snp43、snp44、snp45、snp46、snp47、snp48。
所述的snp1表示該snp位點位于seqidno：1所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基k(g/t)；
所述的snp2表示該snp位點位于seqidno：2所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基k(t/g)；
所述的snp3表示該snp位點位于seqidno：3所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基k(g/t)；
所述的snp4表示該snp位點位于seqidno：4所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基r(a/g)；
所述的snp5表示該snp位點位于seqidno：5所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基y(t/c)；
所述的snp6表示該snp位點位于seqidno：6所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基r(a/g)；
所述的snp7表示該snp位點位于seqidno：7所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基y(t/c)；
所述的snp8表示該snp位點位于seqidno：8所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基r(g/a)；
所述的snp9表示該snp位點位于seqidno：9所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基r(a/g)；
所述的snp10表示該snp位點位于seqidno：10所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基r(g/a)；
所述的snp11表示該snp位點位于seqidno：11所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基r(g/a)；
所述的snp12表示該snp位點位于seqidno：12所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基y(c/t)；
所述的snp13表示該snp位點位于seqidno：13所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基r(g/a)；
所述的snp14表示該snp位點位于seqidno：14所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基r(g/a)；
所述的snp15表示該snp位點位于seqidno：15所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基r(a/g)；
所述的snp16表示該snp位點位于seqidno：16所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基w(a/t)；
所述的snp17表示該snp位點位于seqidno：17所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基y(t/c)；
所述的snp18表示該snp位點位于seqidno：18所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基y(t/c)；
所述的snp19表示該snp位點位于seqidno：19所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基w(a/t)；
所述的snp20表示該snp位點位于seqidno：20所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基r(a/g)；
所述的snp21表示該snp位點位于seqidno：21所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基r(g/a)；
所述的snp22表示該snp位點位于seqidno：22所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基y(t/c)；
所述的snp23表示該snp位點位于seqidno：23所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基m(a/c)；
所述的snp24表示該snp位點位于seqidno：24所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基s(g/c)；
所述的snp25表示該snp位點位于seqidno：25所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基y(c/t)；
所述的snp26表示該snp位點位于seqidno：26所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基r(g/a)；
所述的snp27表示該snp位點位于seqidno：27所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基r(a/g)；
所述的snp28表示該snp位點位于seqidno：28所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基r(g/a)；
所述的snp29表示該snp位點位于seqidno：29所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基m(a/c)；
所述的snp30表示該snp位點位于seqidno：30所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基w(a/t)；
所述的snp31表示該snp位點位于seqidno：31所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基r(g/a)；
所述的snp32表示該snp位點位于seqidno：32所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基s(g/c)；
所述的snp33表示該snp位點位于seqidno：33所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基y(t/c)；
所述的snp34表示該snp位點位于seqidno：34所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基y(t/c)；
所述的snp35表示該snp位點位于seqidno：35所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基r(g/a)；
所述的snp36表示該snp位點位于seqidno：36所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基y(c/t)；
所述的snp37表示該snp位點位于seqidno：37所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基r(a/g)；
所述的snp38表示該snp位點位于seqidno：38所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基k(t/g)；
所述的snp39表示該snp位點位于seqidno：39所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基k(t/g)；
所述的snp40表示該snp位點位于seqidno：40所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基w(a/t)；
所述的snp41表示該snp位點位于seqidno：41所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基r(a/g)；
所述的snp42表示該snp位點位于seqidno：42所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基s(g/c)；
所述的snp43表示該snp位點位于seqidno：43所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基s(c/g)；
所述的snp44表示該snp位點位于seqidno：44所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基r(g/a)；
所述的snp45表示該snp位點位于seqidno：45所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基r(a/g)；
所述的snp46表示該snp位點位于seqidno：46所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基k(g/t)；
所述的snp47表示該snp位點位于seqidno：47所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基r(a/g)；
所述的snp48表示該snp位點位于seqidno：48所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基r(g/a)；
所述的48個snp位點所在的dna片段，其序列分別如seqidno：1～seqidno：48所示。
所述的48個snp位點可應(yīng)用于食蟹猴起源(亞群)的鑒定。
所述的48個snp位點在制備試劑盒或檢測方法中的應(yīng)用；所述的試劑盒或檢測方法的用途為食蟹猴起源(亞群)的鑒定。
所述的dna片段在輔助進行食蟹猴起源(亞群)的鑒定中的應(yīng)用。
本發(fā)明相對于現(xiàn)有技術(shù)，具有如下的優(yōu)點及效果：
本發(fā)明采用生物信息技術(shù)的優(yōu)勢開發(fā)出能用于食蟹猴起源(亞群)鑒定的snp標(biāo)記，對于進口食蟹猴真實起源(亞群)的鑒定，snp標(biāo)記的應(yīng)用可大大降低成本和簡化操作。snp標(biāo)記應(yīng)用可達到快速初篩和降低檢測成本的目的，從而促進食蟹猴起源(亞群)鑒定標(biāo)準(zhǔn)化進程。
附圖說明
圖1是400只未知起源(亞群)的食蟹猴的的結(jié)構(gòu)(k＝4)。
具體實施方式
下面結(jié)合實施例及附圖對本發(fā)明作進一步詳細的描述，但本發(fā)明的實施方式不限于此。
實施例1
1、實驗動物樣本
20只已知起源(亞群)的食蟹猴(包括有菲律賓、馬來西亞、毛里求斯、印度支那等)；400只未知起源(亞群)的食蟹猴；
2、動物血樣來源：藍島生物技術(shù)有限公司
3、目標(biāo)snp的篩選過程
3.1、測序
首先，測序了由20只食蟹猴dna樣本組成的簡化基因組文庫，這20只食蟹猴的來源包括4個不同地區(qū)。
dna樣品濃度設(shè)置為90ng/μl，分別用hinfi酶消化，然后對消化產(chǎn)物進行清洗，對清洗后的片段進行電泳，回收200～500bp間的條帶，重復(fù)以上步驟直至原料回收充足，再次量化調(diào)整合成溶液，然后分別從這20個回收處理過的樣品中，取等量體積混合，且混合體積為75μl，最后用illuminagenomeanalyzerii進行測序。
3.2、snp篩選
檢測到146,250個snp，其中約5000個snp是唯一存在于其中一個種群的，從這些地理上唯一的snp中，針對每個種群，分別挑選出12個頻率最高的位點，組成48個起源(亞群)標(biāo)記(aimspanel)，盡量最大覆蓋整個基因組。
所述的48個snp位點為snp1、snp2、snp3、snp4、snp5、snp6、snp7、snp8、snp9、snp10、snp11、snp12、snp13、snp14、snp15、snp16、snp17、snp18、snp19、snp20、snp21、snp22、snp23、snp24、snp25、snp26、snp27、snp28、snp29、snp30、snp31、snp32、snp33、snp34、snp35、snp36、snp37、snp38、snp39、snp40、snp41、snp42、snp43、snp44、snp45、snp46、snp47、snp48。
所述的snp1表示該snp位點位于seqidno：1所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基k(g/t)；
所述的snp2表示該snp位點位于seqidno：2所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基k(t/g)；
所述的snp3表示該snp位點位于seqidno：3所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基k(g/t)；
所述的snp4表示該snp位點位于seqidno：4所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基r(a/g)；
所述的snp5表示該snp位點位于seqidno：5所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基y(t/c)；
所述的snp6表示該snp位點位于seqidno：6所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基r(a/g)；
所述的snp7表示該snp位點位于seqidno：7所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基y(t/c)；
所述的snp8表示該snp位點位于seqidno：8所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基r(g/a)；
所述的snp9表示該snp位點位于seqidno：9所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基r(a/g)；
所述的snp10表示該snp位點位于seqidno：10所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基r(g/a)；
所述的snp11表示該snp位點位于seqidno：11所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基r(g/a)；
所述的snp12表示該snp位點位于seqidno：12所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基y(c/t)；
所述的snp13表示該snp位點位于seqidno：13所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基r(g/a)；
所述的snp14表示該snp位點位于seqidno：14所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基r(g/a)；
所述的snp15表示該snp位點位于seqidno：15所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基r(a/g)；
所述的snp16表示該snp位點位于seqidno：16所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基w(a/t)；
所述的snp17表示該snp位點位于seqidno：17所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基y(t/c)；
所述的snp18表示該snp位點位于seqidno：18所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基y(t/c)；
所述的snp19表示該snp位點位于seqidno：19所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基w(a/t)；
所述的snp20表示該snp位點位于seqidno：20所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基r(a/g)；
所述的snp21表示該snp位點位于seqidno：21所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基r(g/a)；
所述的snp22表示該snp位點位于seqidno：22所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基y(t/c)；
所述的snp23表示該snp位點位于seqidno：23所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基m(a/c)；
所述的snp24表示該snp位點位于seqidno：24所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基s(g/c)；
所述的snp25表示該snp位點位于seqidno：25所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基y(c/t)；
所述的snp26表示該snp位點位于seqidno：26所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基r(g/a)；
所述的snp27表示該snp位點位于seqidno：27所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基r(a/g)；
所述的snp28表示該snp位點位于seqidno：28所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基r(g/a)；
所述的snp29表示該snp位點位于seqidno：29所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基m(a/c)；
所述的snp30表示該snp位點位于seqidno：30所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基w(a/t)；
所述的snp31表示該snp位點位于seqidno：31所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基r(g/a)；
所述的snp32表示該snp位點位于seqidno：32所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基s(g/c)；
所述的snp33表示該snp位點位于seqidno：33所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基y(t/c)；
所述的snp34表示該snp位點位于seqidno：34所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基y(t/c)；
所述的snp35表示該snp位點位于seqidno：35所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基r(g/a)；
所述的snp36表示該snp位點位于seqidno：36所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基y(c/t)；
所述的snp37表示該snp位點位于seqidno：37所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基r(a/g)；
所述的snp38表示該snp位點位于seqidno：38所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基k(t/g)；
所述的snp39表示該snp位點位于seqidno：39所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基k(t/g)；
所述的snp40表示該snp位點位于seqidno：40所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基w(a/t)；
所述的snp41表示該snp位點位于seqidno：41所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基r(a/g)；
所述的snp42表示該snp位點位于seqidno：42所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基s(g/c)；
所述的snp43表示該snp位點位于seqidno：43所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基s(c/g)；
所述的snp44表示該snp位點位于seqidno：44所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基r(g/a)；
所述的snp45表示該snp位點位于seqidno：45所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基r(a/g)；
所述的snp46表示該snp位點位于seqidno：46所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基k(g/t)；
所述的snp47表示該snp位點位于seqidno：47所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基r(a/g)；
所述的snp48表示該snp位點位于seqidno：48所示的核苷酸序列的第61位，并且該位置處核苷酸序列為簡并堿基r(g/a)；
所述的48個snp位點所在的dna片段，其序列分別如seqidno：1～seqidno：48所示。
4、分型
然后，隨機抽取了400只未知起源(亞群)的食蟹猴，應(yīng)用48個snp(aimspanel)對提取的dna進行分型，并用structure來鑒定食蟹猴的地理起源(亞群)，并將已知起源(亞群)(分別為印度支那、馬來西亞群島、菲律賓群島及毛里求斯)的食蟹猴作為參考樣本。如圖1，結(jié)果顯示這400只食蟹猴起源(亞群)于印度支那地區(qū)。
上述實施例為本發(fā)明較佳的實施方式，但本發(fā)明的實施方式并不受上述實施例的限制，其他的任何未背離本發(fā)明的精神實質(zhì)與原理下所作的改變、修飾、替代、組合、簡化，均應(yīng)為等效的置換方式，都包含在本發(fā)明的保護范圍之內(nèi)。
sequencelisting
<110>華南理工大學(xué)
<120>用于食蟹猴起源（亞群）鑒定的snp標(biāo)記及其應(yīng)用
<130>1
<160>48
<170>patentinversion3.5
<210>1
<211>121
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<223>snp1位點所在的dna序列
<400>1
ctccttcccactccattctatttcattccactgcatagcctccctcccacccatctattc60
gtcccagcccccaaactgacactgggattgccatatccaggaagccacgtggaaggcttt120
t121
<210>2
<211>121
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<223>snp2位點所在的dna序列
<400>2
atttttaaacctgattcatctctactgcattgtaaatggcaaactgaattgacagtaaaa60
ttacgtgcatgtcaaaaaataatacacacacacaacgaggatagagtaagaacgaatgaa120
g121
<210>3
<211>121
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<223>snp3位點所在的dna序列
<400>3
ctttgtgtagagtcgattaaaattagaaaccagccaggaagcgattatagaaatccagga60
gagcactgttgggagtatgcactgaaggggtgatggggtaggagaaggagtgccccaggg120
a121
<210>4
<211>121
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<223>snp4位點所在的dna序列
<400>4
cccccgcacagggtgagtggtgcctttattctgagttatttaaggatcccagtcattatg60
atacaggagctagaaagaaatttaggcagagaaggagggtaagagagtcctcagcaaagt120
t121
<210>5
<211>121
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<223>snp5位點所在的dna序列
<400>5
ggagtccagcactagtgagcagagtgccagaatgacagccatggacaatgccagcaagaa60
tgcttgtaagtacacaataaggatggtgccagcaggaatgcttgtgagcacacagtgaat120
c121
<210>6
<211>121
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<223>snp6位點所在的dna序列
<400>6
tgtttgtttgttttgagacaaagtcccactctgtcacccaggctggagtgcagtggcaca60
atctcagcttactgcaacctctgcctcccaggttcgagtgattctctgcctcagtctccc120
a121
<210>7
<211>121
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<223>snp7位點所在的dna序列
<400>7
gaagcaagctaaagtattccattaatcttccccagtgcagaggattaagtgagtggttct60
taggtttgaacacatgtcaggagggcttgtatcaatgcagagtgtggacccacctccaga120
g121
<210>8
<211>121
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<223>snp8位點所在的dna序列
<400>8
tttgagcagcttttgcttcatgccctacaaatatctctgagcatctggactggacaatgg60
gatctgatttgagtttgaggagtggtaagaactataacttggactcagcttactcctgaa120
g121
<210>9
<211>121
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<223>snp9位點所在的dna序列
<400>9
ggataaggaaatagaaggggatgaaagagatggcatggggtatgctttcccatctggctt60
agaaaaatagttttaatatccagtggaaagagggatagagcaaaggataaataaattcta120
t121
<210>10
<211>121
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<223>snp10位點所在的dna序列
<400>10
aggattctaggataggtttaccagaacttaaagctgggaggcccctcagggaaggagagg60
ggaaattgtttgttgaaagcaacacagcaagggcagagcagagccagggctagggtccgg120
c121
<210>11
<211>121
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<223>snp11位點所在的dna序列
<400>11
tccacagcaaaggagagtaagttcttattgaggtggtcgagatcctacctgagacactgg60
gaaggtggcgggagattggaacatgcagtagttgcgttctggagtttactgaggttttcc120
c121
<210>12
<211>121
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<223>snp12位點所在的dna序列
<400>12
ttacaaaatccataaagttaaaccaggagaaatggacaaaaacacactcattgtagaggt60
ctttaatgatcccttggctcatggcagagcagttagacacacacacacacacacacacac120
a121
<210>13
<211>121
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<223>snp13位點所在的dna序列
<400>13
agagctgagctggagttgagtaacctaatgtagcttgtcccaaaccatatgccacaaacc60
gctacatcctcaagacattcacaggtgttgtctggaaaaacaacaagagtgagaatccca120
t121
<210>14
<211>121
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<223>snp14位點所在的dna序列
<400>14
ttcaggctggagtgcagtggggcaatcataactcactgcagcctcaaactcctgggctca60
ggtgaccctcctgcctcagcctcctgagtagctaggactataagtccgtatcaccatacc120
t121
<210>15
<211>121
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<223>snp15位點所在的dna序列
<400>15
aggcttaggaaaagctttgtgtttacagagagggagatggtgtgccggcatcattcttag60
ataaggaagctgaggcttgtgtggatgtgcaactatgccagggtcagttttgggtacaat120
g121
<210>16
<211>121
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<223>snp16位點所在的dna序列
<400>16
gctggtccaaagagcacactttaagtagcaagggtataaatggcaatgggataaggcaaa60
aatatatatatattttgactaaagtttgaggaaattgcaatagattattgagtaggattg120
t121
<210>17
<211>121
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<223>snp17位點所在的dna序列
<400>17
agtcaatgtgttactttaactagagacttgacttatggttggtattaaaatctttgttcc60
tggatacaggagagccaagaatcattaggtatatgtggatatattttaggagatgagagt120
g121
<210>18
<211>121
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<223>snp18位點所在的dna序列
<400>18
atcgcttgaccctgggaggcggagactgcagtaagccaagatcgtgctgctgctctccag60
tctgggtgacagagtgagatccagtccaaaaaaagaaagagagggattgtcttttccaca120
t121
<210>19
<211>121
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<223>snp19位點所在的dna序列
<400>19
ccacgagagtgaaaggttctgtctcactgtcattctgggtgctactggggtattaaaaaa60
aaactgccactagcttgggtctgcaaaaacagtgcccaattttgtggttgaaaccctggg120
c121
<210>20
<211>121
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<223>snp20位點所在的dna序列
<400>20
gactcagttcatttggaacgatagtgtcctgacagttgtttttgtttccttctttctaac60
atatcaaccttttgaaatctgaacccaatggagtatgtcagcacaaccaggcaggtttct120
g121
<210>21
<211>121
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<223>snp21位點所在的dna序列
<400>21
atcccataaagcagagtgaaatcctatacgtgggaaaatgtaggggcaattggctaaggt60
ggcctctttaccccacccatccttcttgcctacyyctggtggcttatcctagaatcgagg120
c121
<210>22
<211>121
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<223>snp22位點所在的dna序列
<400>22
catgccttcagtcctgctctgctctccctgtctgccactgtccaaaatgggaagcctgcc60
tgctctgcaaggcttgtctccagtccagcccatttcaccctctgcacggggttctgcttt120
g121
<210>23
<211>121
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<223>snp23位點所在的dna序列
<400>23
cttttgattatagccttcctggtaggtatgaagtagtatctcactgtggttttgatttct60
attttctcaataactaatgatgttgggaatctttttatgtgtttattggctatttgtata120
t121
<210>24
<211>121
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<223>snp24位點所在的dna序列
<400>24
cctagaaattcttgatgttgaaggcacagcagccaactgccaccagctgatgccacacca60
gagccaggactaggacagatttatggggccagaaacgtgaggccaggctgccggctcccc120
a121
<210>25
<211>121
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<223>snp25位點所在的dna序列
<400>25
tgctcctcatttgtcttccaccaggattgtaaggcctccccaaccatgtggaactctgag60
ccagtaaaacctctttcctttataaattacccagtcttgagtatgtctttatttagcagc120
a121
<210>26
<211>121
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<223>snp26位點所在的dna序列
<400>26
ttagatggcttttacctgctgacagcgctaaagtgttgaggtcttgcaatgagctaaata60
ggctatgcttgataacaaattgatgcgaggttacaccagggagaggatgggactgtgaat120
t121
<210>27
<211>121
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<223>snp27位點所在的dna序列
<400>27
gtgatggcagttaggggagtgggtgagttgggtgcacacacacctacaccgagtatggat60
ataggtacacacagcccgggcgcggtggctcctgcctgtgatcccaacactttgggaggc120
t121
<210>28
<211>121
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<223>snp28位點所在的dna序列
<400>28
tcaaggccaacagattttacaaataaagaaaaggagtgcaagaaaggttaagagctccaa60
gtcacatggctagtcaagtacagtcttcctcatggctcctgtagtgcctgttaacagaaa120
t121
<210>29
<211>121
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<223>snp29位點所在的dna序列
<400>29
actgagcagtttttttcatttgtttaagttcttatagctttaaaactccrtcacgaattt60
aatgttttttcttcttttgtctttagtagcaccatattgagagtggtcaatatcaaaatt120
g121
<210>30
<211>121
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<223>snp30位點所在的dna序列
<400>30
ctacaaagagaataaaatacctaggaatccaacttacaagggatgtgaaggacgtcttca60
aggagaactacaaatcactgcttaatgaaataaaagagaacacaaacaaagagaagaaca120
t121
<210>31
<211>121
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<223>snp31位點所在的dna序列
<400>31
agtatacatgtgcagcaacctctttgggatgtttgaatgtgcaggattatctgaggaaac60
gtttgatccacttgaaagcccatttagtggtaggacatggtgccgagtgtcagagtccag120
t121
<210>32
<211>121
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<223>snp32位點所在的dna序列
<400>32
acccaccaactgcttgcaccctcaccgtggaaaaggtacaggcactcaacaccagcccag60
gccatgaggacagctgcaaagccacaggtgcagagctgcccaaggccttgggagcccagc120
c121
<210>33
<211>121
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<223>snp33位點所在的dna序列
<400>33
ctgcctggctctcattgaacccacttagtcttcttcctgatgagttggcacaggcaggcc60
tagctttcccttcaacattttgtcatcttacacataaccagattccaaaccctctcaatt120
c121
<210>34
<211>121
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<223>snp34位點所在的dna序列
<400>34
gttcatctgtctcagcttctctttgcctacagacgtggatgagtgcgagcgagaggataa60
tgcaggttgtgtgcatgactgtgtcaacatccctggcaattaccggtgtacctgctatga120
t121
<210>35
<211>121
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<223>snp35位點所在的dna序列
<400>35
ttggaggccgagatggaaggatcacttcaggccaggagttcaagactaacctgttcaaca60
gaagtagtactacagaacaaagaaatgactgtctttgtgacactgttaggaacactggat120
a121
<210>36
<211>121
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<223>snp36位點所在的dna序列
<400>36
gaatctctctctctctccaatttcaccactatcctagcacaagctactatcatgtccagc60
ctccatatcacctgtgcttacctagtactgtactcatgcatgcactggttccccctgcca120
g121
<210>37
<211>121
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<223>snp37位點所在的dna序列
<400>37
aggctccatgggaagcggggttcagccttcctctctactccacctgcctgcccagagtgg60
acctggcacaaagtgagcagacagtagccatcggttgacaggatcactaaatcccaaatc120
t121
<210>38
<211>121
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<223>snp38位點所在的dna序列
<400>38
gggtttcactcctgttgcccagattggagtgcagtggcatgatctcaactcactgcaacc60
tccaccttccggttcaagcaattctcctgcttcagcctcccaagcagctgggactacagg120
t121
<210>39
<211>121
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<223>snp39位點所在的dna序列
<400>39
aatctgtcccaggctatagaaaatgtcctgagtgtcctgctcttctacccggatgatgag60
tctgccaagagggctctgaaccagtaccaggcccagctgggagagccgagacctggcctc120
g121
<210>40
<211>121
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<223>snp40位點所在的dna序列
<400>40
gcatatgagtcacatcacgaggtaagtcacacaggctagcagaggtgctagctcagggaa60
agggaaatcaaaaatagatataaagtaggaagtcaggagggcataaggtttttcagaaaa120
t121
<210>41
<211>121
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<223>snp41位點所在的dna序列
<400>41
acagaattcccaaaccctctggagagagttttccctcttgtgggagggatccagtgggaa60
ataattgcatcacaggggctggtctttcccgttctgttctcatgatagtgaataagtctc120
a121
<210>42
<211>121
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<223>snp42位點所在的dna序列
<220>
<221>misc_feature
<222>(6)..(30)
<223>nisa,c,g,ort
<400>42
caggtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactcatttagttctgaggattgataccgcc60
gagcactggaaggtgagtgctgattggttggttcaggtgaactctgattggctggttcag120
g121
<210>43
<211>121
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<223>snp43位點所在的dna序列
<400>43
ccagcaatgctgggatctcttacgataaactttcctgagagattgacacactcagaacaa60
cgtatgtgctgcttaaaatcttacatgtcttgtacttccagccattgtcagactggccac120
c121
<210>44
<211>121
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<223>snp44位點所在的dna序列
<400>44
cctaaggctctgttcttctacatacacatacaccaggtgcacacacatacacactcatgt60
gcacacatacatgcagagacatgtggtatacatgacaacataggaataatttaattttat120
a121
<210>45
<211>121
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<223>snp45位點所在的dna序列
<400>45
aattggatgacactccaggaaggaggggggaaatgaaaacagctgttccgagaggacaac60
acggtgttgtgcagaagatgagcccacagcccgggaggactgagcagcctgggaggactg120
a121
<210>46
<211>121
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<223>snp46位點所在的dna序列
<400>46
agctgggactacaggtacctgccactatgcctggctagtttccgtatttttagtagaagt60
ggactttcaccatattgaccaggctggtctcgaactcctgaccttaaatgatccacccac120
c121
<210>47
<211>121
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<223>snp47位點所在的dna序列
<400>47
caatgaagccagtctgagtcccaaaacctcaaaagtaaggaagacaacagtgcagccttc60
agtctgtggccaaaggcccgagagcccttagcaaaccactggtgtaagtccaagagtcca120
a121
<210>48
<211>121
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<223>snp48位點所在的dna序列
<400>48
aagaggtatttttagatatgagtccaagagggtttcccagaggaggtgacctaaatgaag60
gaagggaacaagccatttgaagatccaggggaagagcgaggggatggatttggggaagac120
t121