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一種即時(shí)檢測(cè)陰道加德納菌的熒光恒溫檢測(cè)試劑盒的制作方法

文檔序號(hào):11506334閱讀:268來(lái)源:國(guó)知局
一種即時(shí)檢測(cè)陰道加德納菌的熒光恒溫檢測(cè)試劑盒的制造方法與工藝
本發(fā)明涉及一種即時(shí)檢測(cè)陰道加德納菌的熒光恒溫檢測(cè)試劑盒,特別涉及一種不依賴于高能量分子的恒溫?cái)U(kuò)增技術(shù)。
背景技術(shù)
:陰道加德納氏菌(gv)是引起細(xì)菌性陰道?。╞v)的病原菌。其致病與厭氧菌共同作用有關(guān),除引起bv以外,gv還可致早產(chǎn)、產(chǎn)褥熱、新生兒敗血癥、絨毛膜羊膜炎、產(chǎn)后敗血癥、膿毒血癥、尿路感染、腎周膿腫及膀胱炎等。gv是一種大小為1.5~2.5×0.5μm,多形性,無(wú)莢膜,無(wú)鞭毛,革蘭氏染色不穩(wěn)定的細(xì)菌。在普通瓊脂培養(yǎng)基上不生長(zhǎng),在血瓊脂培養(yǎng)基、巧克力培養(yǎng)基上生長(zhǎng),但不需x因子、v因子、輔酶因子。兼性厭氧,在足夠co2的環(huán)境中,容易生長(zhǎng)。生長(zhǎng)最適溫度為35~37℃,ph為6.0~6.5。幾十年來(lái),國(guó)內(nèi)外學(xué)者研究表明,該菌還可以引起宮頸炎,不潔流產(chǎn),術(shù)后感染,尿道感染等多種疾病,是新認(rèn)識(shí)的一種性傳播疾病的病原菌和條件致病菌。陰道加德納菌是引起細(xì)菌性陰道病和尿道炎的重要病原體,在bv的微生物菌群中處于優(yōu)勢(shì)地位,含量明顯高于其他非正常菌群,已被確認(rèn)為bv的重要病原體。在bv患者與健康人群中,加德納菌的檢出率存在顯著差異,加德納菌抗原檢測(cè)可作為bv的一項(xiàng)重要檢測(cè)指標(biāo),結(jié)合臨床表現(xiàn)進(jìn)行bv診斷。同時(shí)臨床研究表明,加德納菌感染還與不孕不育、異常妊娠高度相關(guān),可引起輸卵管妊娠、胎膜早破和新生兒早產(chǎn)等不良妊娠結(jié)局,不孕和不良懷孕史患者中30~40%可檢出加德納菌,配偶之間互感率高達(dá)90%。檢測(cè)陰道加德納菌對(duì)于婦產(chǎn)科疾病以及不孕不育的預(yù)防和診斷有著較為重大的意義?;诓≡wdna直接進(jìn)行檢測(cè),相比amsel等傳統(tǒng)方法大大提高靈敏度,可以極大提升陽(yáng)性檢出率。陰道加德納菌檢測(cè)最常用的是生化檢測(cè)和免疫熒光檢測(cè)技術(shù),但涂片鏡檢測(cè)等人工操作多,人為主觀因素占重要部分,免疫方法檢測(cè)多采用間接法,受樣本采集方法影響大,靈敏度不及核酸檢測(cè)方法。陰道加德納菌的dna檢測(cè)目前在國(guó)內(nèi)還沒有商業(yè)推廣用的試劑盒,國(guó)外最常見就是bd公司的affirmtm陰道微生物檢測(cè)系統(tǒng)。本發(fā)明的恒溫?cái)U(kuò)增技術(shù)主要利用重組酶的活性,不進(jìn)行核酸解鏈和退火即可在恒溫條件下(如37℃)進(jìn)行核酸的擴(kuò)增,與生化檢測(cè)和免疫熒光檢測(cè)技術(shù)相比,有著更少人為干預(yù),不需要人為判斷,能夠直接檢測(cè)病原體,靈敏度高等特點(diǎn)。與傳統(tǒng)的pcr技術(shù)相比,不需要昂貴的儀器,也避免了高溫對(duì)酶的損耗。同時(shí)恒溫?cái)U(kuò)增技術(shù)在體系中不需要加入過(guò)量的引物,降低了引物與模板錯(cuò)配或生成引物二聚體的可能性。另外,恒溫?cái)U(kuò)增體系有多重工具酶匹配進(jìn)行有效擴(kuò)增,擴(kuò)增效率遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于傳統(tǒng)pcr技術(shù),所用時(shí)間更短,最短可以在5min內(nèi)實(shí)現(xiàn)。最后,相對(duì)于目前其他恒溫?cái)U(kuò)增技術(shù)平臺(tái)相比,本發(fā)明所用的重組酶依賴擴(kuò)增技術(shù)平臺(tái)是新一代核酸檢測(cè)的利器,在檢測(cè)的時(shí)效性,便捷性和技術(shù)參數(shù)等多個(gè)方面都優(yōu)于其它恒溫?cái)U(kuò)增技術(shù)平臺(tái),通過(guò)試劑的有效匹配,甚至可以在人體腋下進(jìn)行擴(kuò)增反應(yīng)。在該技術(shù)平臺(tái)上,除了可以開發(fā)基于小型便攜式設(shè)備用于醫(yī)療檢測(cè)機(jī)構(gòu)如醫(yī)院急診科、婦產(chǎn)科、手術(shù)室;社區(qū)服務(wù)中心和基層醫(yī)療機(jī)構(gòu);檢驗(yàn)檢疫疾病防控機(jī)構(gòu)的分子診斷產(chǎn)品,還可以開發(fā)出適合家庭使用的分子診斷產(chǎn)品,使我國(guó)不同區(qū)域即便存在經(jīng)濟(jì)條件參差不齊的情況下,也可以展開全國(guó)性病毒性疾病、腫瘤和遺傳性疾病的定期和即時(shí)普查。這是一個(gè)非常巨大的潛在市場(chǎng),其經(jīng)濟(jì)價(jià)值和社會(huì)效益不可估量。當(dāng)前我們已經(jīng)開發(fā)適用于醫(yī)療機(jī)構(gòu)和家庭使用的hiv檢測(cè)產(chǎn)品和宮頸癌hpv檢測(cè)產(chǎn)品。隨著平臺(tái)的不斷成熟,可進(jìn)一步拓展到食品安全、檢驗(yàn)檢疫、防恐等多個(gè)領(lǐng)域。本發(fā)明陰道加德納菌即時(shí)檢測(cè)試劑盒將恒溫?cái)U(kuò)增技術(shù)應(yīng)用到陰道陰道加德納菌感染的檢測(cè)上,縮短了反應(yīng)時(shí)間,降低了體系對(duì)反應(yīng)條件的要求,大大地提高了檢測(cè)的效率,也不需要人為主觀判讀結(jié)果,同時(shí)檢測(cè)結(jié)果不受混合其他病原體感染的干擾,因此能更準(zhǔn)確的提示陰道加德納菌感染,非常有利于臨床的即時(shí)診斷和對(duì)癥治療。技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:本發(fā)明的目的在于提供一種即時(shí)檢測(cè)陰道加德納菌的熒光恒溫檢測(cè)方法及其試劑盒,包括反應(yīng)液,啟動(dòng)液,反應(yīng)酶系,陰道加德納菌特異性引物及探針。陰道加德納菌恒溫檢測(cè)方法及其試劑盒反應(yīng)液的具體組分如下:品名濃度(摩爾濃度/質(zhì)量分?jǐn)?shù)/質(zhì)量濃度)tris-hcl80mmkcl40mmnacl10mm二硫蘇糖醇5mm甜菜堿1m海藻糖3.5%peg3.5%bsa0.1mg/ml作為上述反應(yīng)液的進(jìn)一步改進(jìn),tris-hcl的ph為7.0~9.0,優(yōu)選ph為8.3。陰道加德納菌恒溫檢測(cè)方法及其試劑盒啟動(dòng)液的具體組分如下:品名摩爾濃度氯化鎂5mm~20mm作為上述啟動(dòng)液的進(jìn)一步改進(jìn),氯化鎂的優(yōu)選濃度為10mm。陰道加德納菌恒溫檢測(cè)方法及其試劑盒反應(yīng)酶系的具體組分如下:品名濃度(摩爾濃度/酶濃度/質(zhì)量濃度)dntps200um聚合酶bsu100ng/ul單鏈結(jié)合蛋白262ng/ul重組酶(e.colirect)360ng/ul上游引物200nm下游引物200nm作為上述反應(yīng)酶系的進(jìn)一步改進(jìn),重組酶選自e.colirect蛋白。陰道加德納菌恒溫檢測(cè)方法及其試劑盒特異性引物及探針序列如下:上游引物1ataggctttttactggtgtatcactggtaagg(seqidno:1)下游引物1cactcttctcaaccccgtcagaggctgaacagt(seqidno:2)熒光探針1ggaccgatgaaggacgtgacgggctgcga(fam-dt)a(dspacer)(bhq-dt)tgcctcggggagctg(seqidno:3)作為本發(fā)明方法的進(jìn)一步改進(jìn),恒溫?cái)U(kuò)增的溫度為35~42℃,優(yōu)選擴(kuò)增溫度為40℃。本發(fā)明的有益效果:本發(fā)明的恒溫?cái)U(kuò)增體系,不依賴于atp、磷酸肌酸等高能能量分子,相對(duì)現(xiàn)有的恒溫?cái)U(kuò)增體系,其組成更為簡(jiǎn)單,成本更為低廉,使用更為方便。本發(fā)明的恒溫?cái)U(kuò)增體系適用于復(fù)雜模板的擴(kuò)增,擴(kuò)增速度快且穩(wěn)定,可以在15min以內(nèi)完成擴(kuò)增反應(yīng),擴(kuò)增的靈敏度和準(zhǔn)確性高,不易出現(xiàn)錯(cuò)配,擴(kuò)增效果好。本發(fā)明的恒溫?cái)U(kuò)增體系使用熒光實(shí)時(shí)定量技術(shù),應(yīng)用范圍更廣,適用于市面上大多數(shù)熒光定量擴(kuò)增儀。本發(fā)明檢測(cè)陰道加德納菌。對(duì)比常規(guī)檢測(cè)的培養(yǎng)方法和鏡檢方法,時(shí)間更短,靈敏度高受培養(yǎng)條件限制少,人為誤操作幾率低。附圖說(shuō)明圖1為最適反應(yīng)溫度下熒光擴(kuò)展曲線結(jié)果,圖中熒光曲線的標(biāo)號(hào)對(duì)應(yīng)實(shí)施例中反應(yīng)管的標(biāo)號(hào)。圖2為非最適反應(yīng)溫度下熒光擴(kuò)展曲線結(jié)果,圖中熒光曲線的標(biāo)號(hào)對(duì)應(yīng)實(shí)施例中反應(yīng)管的標(biāo)號(hào)。圖3為非最適反應(yīng)溫度下熒光擴(kuò)展曲線結(jié)果,圖中熒光曲線的標(biāo)號(hào)對(duì)應(yīng)實(shí)施例中反應(yīng)管的標(biāo)號(hào)。圖4為重復(fù)性特異性實(shí)驗(yàn)熒光擴(kuò)展曲線結(jié)果,圖中熒光曲線的標(biāo)號(hào)對(duì)應(yīng)實(shí)施例中反應(yīng)管的標(biāo)號(hào)。圖5為實(shí)驗(yàn)熒光擴(kuò)展曲線結(jié)果,圖中熒光曲線的標(biāo)號(hào)對(duì)應(yīng)實(shí)施例中反應(yīng)管的標(biāo)號(hào)。圖6為靈敏度實(shí)驗(yàn)熒光擴(kuò)展曲線結(jié)果,圖中熒光曲線的標(biāo)號(hào)對(duì)應(yīng)實(shí)施例中反應(yīng)管的標(biāo)號(hào)。具體實(shí)施方式一種即時(shí)檢測(cè)陰道加德納菌的熒光恒溫檢測(cè)方法及其試劑盒,采用了一種不依賴于高能能量分子的恒溫?cái)U(kuò)增技術(shù)。試劑盒成分包括反應(yīng)液,啟動(dòng)液,反應(yīng)酶系,陰道加德納菌特異性引物及探針,各成分的具體組分如下:陰道加德納菌恒溫檢測(cè)方法及其試劑盒反應(yīng)液的具體組分如下:品名濃度(摩爾濃度/質(zhì)量分?jǐn)?shù)/質(zhì)量濃度)tris-hcl(ph8.3)80mmkcl40mmnacl10mm二硫蘇糖醇5mm甜菜堿1m海藻糖3.5%peg3.5%bsa0.1mg/ml陰道加德納菌恒溫檢測(cè)方法及其試劑盒啟動(dòng)液的具體組分如下:品名摩爾濃度氯化鎂10mm陰道加德納菌恒溫檢測(cè)方法及其試劑盒反應(yīng)酶系的具體組分如下:品名濃度(摩爾濃度/酶濃度/質(zhì)量濃度)dntps200um聚合酶bsu100ng/ul單鏈結(jié)合蛋白262ng/ul重組酶(e.colirect)360ng/ul上游引物200nm下游引物200nm陰道加德納菌恒溫檢測(cè)方法及其試劑盒特異性引物及探針序列如下:上游引物1ataggctttttactggtgtatcactggtaagg(seqidno:1)下游引物1cactcttctcaaccccgtcagaggctgaacagt(seqidno:2)熒光探針1ggaccgatgaaggacgtgacgggctgcga(fam-dt)a(dspacer)(bhq-dt)tgcctcggggagctg(seqidno:3)下面結(jié)合具體的實(shí)驗(yàn),進(jìn)一步說(shuō)明陰道加德納菌恒溫檢測(cè)方法及其試劑盒的優(yōu)勢(shì),但并非限制本發(fā)明。實(shí)驗(yàn)樣本來(lái)源:以細(xì)菌性陰道炎患者中分離的陰道加德納菌經(jīng)提取得到的核酸溶液作為樣本;以外購(gòu)金黃色葡萄球菌、卷曲乳桿菌、詹式乳桿菌、惰性乳桿菌、支原體菌株、陰道毛滴蟲、白色念珠菌經(jīng)提取得到的核酸溶液作為特異性實(shí)驗(yàn)的樣本;以正常人陰道分泌物提取物為陰性對(duì)照樣本。實(shí)施例1(陰道加德納菌的檢測(cè)):取2個(gè)200ul反應(yīng)管,分別標(biāo)記為反應(yīng)管1~2。在反應(yīng)管1~2中分別加入20ul反應(yīng)液、5ul反應(yīng)酶系;在反應(yīng)管1、2中加入上游引物1(200nm)、下游引物1(200nm)、熒光探針1(150nm)。在反應(yīng)管1中加入陰道加德納菌樣本2ul,反應(yīng)管2加入陰性對(duì)照樣本2ul。各反應(yīng)管均用滅菌水補(bǔ)足體系到45ul,振蕩混勻后各管再分別加入5ul啟動(dòng)液(各管的終體積為50ul)。選擇熒光定量pcr儀進(jìn)行擴(kuò)增及收集熒光,具體上機(jī)條件為:40℃,30s,30個(gè)循環(huán),每個(gè)循環(huán)都搜集熒光。實(shí)施例2(非最優(yōu)擴(kuò)增溫度條件的檢測(cè)):同實(shí)施例1,不同之處在于上機(jī)條件改為:35℃,30s,30個(gè)循環(huán),每個(gè)循環(huán)都收集熒光。結(jié)果如圖2。實(shí)施例3(非最優(yōu)擴(kuò)增溫度條件的檢測(cè)):同實(shí)施例1,不同處在于上機(jī)條件改為:42℃,30s,30個(gè)循環(huán),每個(gè)循環(huán)都收集熒光。結(jié)果如圖3。實(shí)施例4(特異性實(shí)驗(yàn)):按照實(shí)施例1配制體系8管,分別標(biāo)記1~8反應(yīng)管。在1~8反應(yīng)管的體系中加入上游引物1(200nm)、下游引物1(200nm)、熒光探針1(150nm);在1~8號(hào)反應(yīng)管中按順序分別加入陰道加德納菌、黃色葡萄球菌、卷曲乳桿菌、詹式乳桿菌、惰性乳桿菌、支原體菌株、陰道毛滴蟲、白色念珠菌樣本2ul;各反應(yīng)管均用滅菌水補(bǔ)足體系到45ul,振蕩混勻后各管再分別加入5ul啟動(dòng)液(各管的終體積為50ul)。選擇熒光定量pcr儀進(jìn)行擴(kuò)增及收集熒光,具體上機(jī)條件為:40℃,30s,30個(gè)循環(huán),每個(gè)循環(huán)都搜集熒光,結(jié)果如圖4。實(shí)施例5(陰道加德納菌重復(fù)性實(shí)驗(yàn)):按實(shí)施例1配制體系10管,分別標(biāo)記反應(yīng)管1~10。在反應(yīng)管1~10中加入上游引物1(200nm)、下游引物1(200nm)、熒光探針1(150nm)。在反應(yīng)管1~5中均加陰道加德納菌樣本2ul,在反應(yīng)管6~10中加入陰性對(duì)照樣本2ul。各反應(yīng)管均用滅菌水補(bǔ)足體系到45ul,振蕩混勻后各管再分別加入5ul啟動(dòng)液(各管的終體積為50ul)。選擇熒光定量pcr儀進(jìn)行擴(kuò)增及收集熒光,具體上機(jī)條件為:40℃,30s,30個(gè)循環(huán),每個(gè)循環(huán)都搜集熒光,結(jié)果如圖5。實(shí)施例6(陰道加德納菌靈敏度實(shí)驗(yàn))按實(shí)施例1配制體系8管,分別標(biāo)記反應(yīng)管1~8。在反應(yīng)管1~10中加入上游引物1(200nm)、下游引物1(200nm)、熒光探針1(150nm)。在反應(yīng)管1~7中加入不同濃度的陰道加德納菌樣本2ul,在反應(yīng)管8中加入陰性對(duì)照樣本2ul。各反應(yīng)管均用滅菌水補(bǔ)足體系到45ul,振蕩混勻后各管再分別加入5ul啟動(dòng)液(各管的終體積為50ul)。選擇熒光定量pcr儀進(jìn)行擴(kuò)增及收集熒光,具體上機(jī)條件為:40℃,30s,30個(gè)循環(huán),每個(gè)循環(huán)都搜集熒光,結(jié)果如圖6。結(jié)論:1.從圖1的結(jié)果可以看出,陰道加德納氏菌反應(yīng)管有“s”型擴(kuò)增曲線,陰道對(duì)照管沒有擴(kuò)增曲線,說(shuō)明本發(fā)明試劑盒的陰陽(yáng)性恒溫?cái)U(kuò)增效果好。2.從圖2、3的結(jié)果可以看出,即使不是在最適溫度下進(jìn)行擴(kuò)增反應(yīng),仍然得到穩(wěn)定的陽(yáng)性結(jié)果,說(shuō)明本發(fā)明試劑盒有較寬的反應(yīng)溫度范圍,非最優(yōu)擴(kuò)增溫度下的樣本出峰時(shí)間和信號(hào)值影響不大,試劑的容錯(cuò)率高、穩(wěn)定性強(qiáng),可以適用于溫度不能精確控制的儀器或反應(yīng)裝置,使試劑盒的使用范圍更為廣泛。3.從圖4的結(jié)果可以看出,非本試劑盒檢測(cè)范圍內(nèi)的其他陰道內(nèi)微生物(黃色葡萄球菌、卷曲乳桿菌、詹式乳桿菌、惰性乳桿菌、支原體菌株、陰道毛滴蟲、白色念珠)沒有曲線增長(zhǎng),檢測(cè)結(jié)果陰性,而陽(yáng)性對(duì)照(陰道加德納)擴(kuò)增結(jié)果陽(yáng)性,說(shuō)明試劑盒特異性較強(qiáng)。4.從圖5的結(jié)果可以看出,陰道加德納菌進(jìn)行了重復(fù)實(shí)驗(yàn),均得到相應(yīng)的“s”型擴(kuò)增曲線,擴(kuò)增曲線出峰時(shí)間相差不超過(guò)1min,熒光信號(hào)波動(dòng)范圍小,說(shuō)明本試劑盒的重復(fù)性好。5.從圖6的結(jié)果可以看出,陰道加德納菌進(jìn)行了靈敏度實(shí)驗(yàn),均得到相應(yīng)的“s”型擴(kuò)增曲線,樣本濃度從1×105~1×102cfu/ml,在1×102cfu/ml下均為陽(yáng)性,即使樣本在極濃度下本試劑盒仍能穩(wěn)定檢測(cè)出陽(yáng)性,說(shuō)明本試劑盒的靈敏度高,適應(yīng)臨床上各種發(fā)病期的樣本。。綜上,本發(fā)明試劑盒的擴(kuò)增效果好,特異性強(qiáng),容錯(cuò)率高,穩(wěn)定性強(qiáng),靈敏度高。sequencelisting<110>廣州和實(shí)生物技術(shù)有限公司<120>一種即時(shí)檢測(cè)陰道加德納菌的熒光恒溫檢測(cè)試劑盒<130>2016<160>3<170>patentinversion3.5<210>1<211>32<212>dna<213>人工序列<400>1ataggctttttactggtgtatcactggtaagg32<210>2<211>33<212>dna<213>人工序列<400>2cactcttctcaaccccgtcagaggctgaacagt33<210>3<211>45<212>dna<213>人工序列<400>3ggaccgatgaaggacgtgacgggctgcgaatgcctcggggagctg45當(dāng)前第1頁(yè)12
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