本申請(qǐng)是申請(qǐng)日為2004年06月24日、申請(qǐng)?zhí)枮?01210408569.2、發(fā)明名稱為“新的β-肌動(dòng)蛋白和rps21啟動(dòng)子及其應(yīng)用”的發(fā)明分案申請(qǐng)的再分案申請(qǐng)(原申請(qǐng)?zhí)?00480017948.2)。本發(fā)明要求2003年6月24日提交的美國臨時(shí)申請(qǐng)no.60/480,768的優(yōu)先權(quán),該申請(qǐng)引作參考而并入此文。生物材料的保藏以下生物材料已經(jīng)保藏于美國典型培養(yǎng)物保藏中心(americantypeculturecollection,atcc):本發(fā)明涉及調(diào)節(jié)基因元件,如啟動(dòng)子及其應(yīng)用,例如,在表達(dá)蛋白中的應(yīng)用。更特別地,本發(fā)明涉及β-肌動(dòng)蛋白和核糖體蛋白s21基因的啟動(dòng)子。技術(shù)背景每種真核基因含有驅(qū)動(dòng)該基因轉(zhuǎn)錄的調(diào)節(jié)元件。該調(diào)節(jié)元件包括典型地直接位于該基因編碼區(qū)上游的啟動(dòng)子。作為轉(zhuǎn)錄機(jī)制的一部分,啟動(dòng)子通過提供轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合位點(diǎn)來調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄。啟動(dòng)子通常被用于在細(xì)胞培養(yǎng)中和體內(nèi)表達(dá)蛋白質(zhì)。很多啟動(dòng)子是已知的并被用于各種表達(dá)系統(tǒng)中表達(dá)蛋白質(zhì)。啟動(dòng)子的例子包括巨細(xì)胞病毒(cmv)立即早期啟動(dòng)子、勞氏肉瘤病毒基因組大基因組長(zhǎng)末端重復(fù)(rsv)、猿病毒40(sv40)啟動(dòng)子、干擾素基因啟動(dòng)子、金屬硫因啟動(dòng)子、和胸腺嘧啶激酶啟動(dòng)子及其它,如fernandez等人(1999)在geneexpressionsystem,academicpress中所描述的。然而,在本領(lǐng)仍需要提供一種可以產(chǎn)生高表達(dá)水平和/或在長(zhǎng)時(shí)間內(nèi)維持表達(dá)的啟動(dòng)子。β-肌動(dòng)蛋白是一種結(jié)構(gòu)蛋白,其通常在從原核到真核,包括人的所有物種中表達(dá)。先前描述了人和雞的β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子。一般而言,β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子表現(xiàn)出比廣泛被應(yīng)用的cmv啟動(dòng)子更普遍的活性(xu等(2001)gene272:149-156)。僅僅當(dāng)其被連接到cmv增強(qiáng)子序列時(shí),雞的β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子比病毒cmv和sv40啟動(dòng)子具有更高的活性(xu等,supra)。核糖體蛋白s21(rps21)與核糖體40s亞單位有關(guān)。人的rps21基因的啟動(dòng)子已被鑒別(接收號(hào)no.aj250907)。與大多數(shù)核糖體啟動(dòng)子基因相似,其缺少傳統(tǒng)的轉(zhuǎn)錄元件,如tata盒和caat序列(smirnova等(2000)bioorg.khim.26(5):392-396)。技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:本發(fā)明提供了一種新的β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子,其與前述公知的β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子相比具有低水平的序列同源性(如,人或雞)。本發(fā)明還提供了新的rps21啟動(dòng)子,其與前述公知的rps21啟動(dòng)子相比具有低水平的序列同源性(如,人或小鼠)。本發(fā)明部分基于對(duì)中國倉鼠卵巢細(xì)胞(cho)系來源的β-肌動(dòng)蛋白和rps21啟動(dòng)子的發(fā)現(xiàn)和分離。本發(fā)明進(jìn)一步部分基于倉鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子比cmv啟動(dòng)子具有顯著的高活性的觀察。本發(fā)明進(jìn)一步部分基于當(dāng)被用于表達(dá)一定基因時(shí),rps21啟動(dòng)子至少具有與倉鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子相同的活性的觀察。本發(fā)明提供了這些啟動(dòng)子的核酸序列,并包括具有啟動(dòng)子活性的各種核酸序列的變種。在一些實(shí)施例中,本發(fā)明的β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子來源于嚙齒類,如倉鼠、大鼠和小鼠。典型地rps21啟動(dòng)子來源于倉鼠。本發(fā)明進(jìn)一步提供了含有可操作地連接到異源核酸上的本發(fā)明的β-肌動(dòng)蛋白或rps21啟動(dòng)子的載體。在某些實(shí)施例中,本發(fā)明的載體包括可操作地連接到異源核酸上的啟動(dòng)子,該異源核酸編碼異源表達(dá)產(chǎn)物,如治療蛋白質(zhì)或其片段。在示例性實(shí)施例中,表達(dá)產(chǎn)物是酸性鞘磷脂酶(asm)、α-葡萄糖苷酶(gaa)、或組織血漿酶原激活劑(tpa)。本發(fā)明還提供了用本發(fā)明的載體轉(zhuǎn)染的宿主細(xì)胞。在描述性實(shí)施例中,宿主細(xì)胞是哺乳動(dòng)物細(xì)胞,如cho、hek和bhk。本發(fā)明還提供了用于產(chǎn)生蛋白質(zhì)的方法。產(chǎn)生蛋白質(zhì)的方法包括,例如,培養(yǎng)轉(zhuǎn)染細(xì)胞,該細(xì)胞用含有可操作地連接到編碼蛋白質(zhì)的異源核酸上的本發(fā)明的β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子和/或rps21啟動(dòng)子的載體轉(zhuǎn)染的細(xì)胞,以及回收蛋白質(zhì)。在一些實(shí)施例中,異源表達(dá)產(chǎn)物是分泌蛋白,其從培養(yǎng)基中被回收。在描述性實(shí)施例中,蛋白質(zhì)是asm、gaa、或tpa。本發(fā)明還涉及下述實(shí)施方案:1.一種選自seqidnos:1、2、3的核苷酸序列的分離的嚙齒動(dòng)物β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子或其具有啟動(dòng)子活性的變種。2.一種seqidno:1中列出的分離的倉鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子核苷酸序列,或其具有啟動(dòng)子活性的變種。3.一種seqidno:2中列出的分離的大鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子核苷酸序列,或其具有啟動(dòng)子活性的變種。4.一種seqidno:3中列出的分離的小鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子核苷酸序列,或其具有啟動(dòng)子活性的變種。5.一個(gè)包括seqidno:1中列出的核苷酸序列的分離的核酸,或其具有啟動(dòng)子活性的變種。6.一個(gè)包括seqidno:2中列出的核苷酸序列的分離的核酸,或其具有啟動(dòng)子活性的變種。7.一個(gè)載體,其包括seqidno:1中的啟動(dòng)子,或其具有啟動(dòng)子活性的變種。8.一個(gè)載體,其包括seqidno:2中的啟動(dòng)子,或其具有啟動(dòng)子活性的變種。9.一個(gè)載體,其包括seqidno:3中的啟動(dòng)子,或其具有啟動(dòng)子活性的變種。10.根據(jù)實(shí)施方案7-9的任何一項(xiàng)所述的載體,其中啟動(dòng)子被可操作地連接到異源核酸上。11.根據(jù)實(shí)施方案10所述的載體,其中異源核酸編碼治療性蛋白。12.根據(jù)實(shí)施方案11所述的載體,其中治療性蛋白選自酸性鞘磷脂酶、α-葡萄糖苷酶或組織血漿酶原激活劑。13.用實(shí)施方案7-12的任何一項(xiàng)的所述的載體轉(zhuǎn)染的宿主細(xì)胞。14.根據(jù)實(shí)施方案13的宿主細(xì)胞,其中細(xì)胞是cho細(xì)胞。15.一種生產(chǎn)蛋白質(zhì)的方法,其包括:(a)培養(yǎng)用含有倉鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子或其變種的載體轉(zhuǎn)染的細(xì)胞,該啟動(dòng)子或其變種被可操作地連接到編碼該蛋白質(zhì)的核酸上,和;(b)回收蛋白質(zhì)。16.根據(jù)實(shí)施方案15所述的方法,其中蛋白質(zhì)是抗體。17.根據(jù)實(shí)施方案16所述的方法,其中抗體結(jié)合tgf-β族成員。18.根據(jù)實(shí)施方案15所述的方法,其中蛋白質(zhì)是治療性蛋白。19.根據(jù)實(shí)施方案18所述的方法,其中治療性蛋白選自酸性鞘磷脂酶、α-葡萄糖苷酶或組織血漿酶原激活劑。20.含有實(shí)施方案1-6的任何一項(xiàng)所述的啟動(dòng)子的轉(zhuǎn)基因動(dòng)物。21.根據(jù)實(shí)施方案20所述的轉(zhuǎn)基因動(dòng)物,其中動(dòng)物是哺乳動(dòng)物。22.具有seqidno:39的核苷酸序列的分離的rps21啟動(dòng)子,或其具有啟動(dòng)子活性的變種。23.含有seqidno:39的核苷酸序列或其具有啟動(dòng)子活性的變種的載體。24.根據(jù)實(shí)施方案23所述的載體,其中核苷酸序列被可操作地連接到異源核酸上。25.根據(jù)實(shí)施方案24所述的載體,其中異源核酸編碼治療性蛋白。26.根據(jù)實(shí)施方案25所述的載體,其中治療性蛋白是α-葡萄糖苷酶或酸性鞘磷脂酶。27.用實(shí)施方案23-26的任何一項(xiàng)所述的載體轉(zhuǎn)染的宿主細(xì)胞。28.根據(jù)實(shí)施方案27所述的宿主細(xì)胞,其中細(xì)胞是cho細(xì)胞。29.一種生產(chǎn)蛋白的方法,其包括:(a)培養(yǎng)用含有倉鼠rps21啟動(dòng)子或其變種的載體轉(zhuǎn)染的細(xì)胞,該啟動(dòng)子或其變種被可操作地連接到該編碼蛋白質(zhì)的核酸上,和;(b)回收蛋白質(zhì)。30.根據(jù)實(shí)施方案29所述的方法,其中蛋白是抗體。31.根據(jù)實(shí)施方案29所述的方法,其中蛋白是治療性蛋白。32.根據(jù)實(shí)施方案31所述的方法,其中治療性蛋白是α-葡萄糖苷酶或酸性鞘磷脂酶。33.一種含有實(shí)施方案22所述的啟動(dòng)子的轉(zhuǎn)基因動(dòng)物。34.根據(jù)實(shí)施方案33所述的轉(zhuǎn)基因動(dòng)物,其中動(dòng)物是哺乳動(dòng)物。35.一種分離的β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子,其核苷酸序列作為atcc參考號(hào)pta-5309被保藏,其分類命名為:含有克隆到噬菌粒載體pbluescriptiiks+的β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子的倉鼠基因組克隆:pblueβ-肌動(dòng)蛋白/avr(hamstergenomicclonecontainingβ-actinpromoterclonedinphagemidvectorpbluescriptiiks+:pblueβ-actin/avr),保藏單位為美國典型培養(yǎng)物保藏中心(americantypeculturecollection,atcc),保藏日為2003年7月3日。36.一種分離的rps21啟動(dòng)子,其核苷酸序列作為atcc參考號(hào)____被保藏。附圖說明圖1a顯示了倉鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子部分核苷酸序列(seqidno:1)與大鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子(seqidno:2)的比對(duì),顯示出seqidno:1中的核苷酸487-893與seqidno:2中的核苷酸1-417具有79%的同一性。大鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子(seqidno:2)與倉鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子(seqidno:1)的全長(zhǎng)相比具有67%的同一性。圖1b顯示了倉鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子部分核苷酸序列(seqidno:1)與大鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子(seqidno:2)的比對(duì),顯示出seqidno:1中的核苷酸1047-3006與seqidno:2中的核苷酸546-2493具有83%的同一性。圖2a顯示了倉鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子部分核苷酸序列(seqidno:1)與小鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子(seqidno:3)的比對(duì),顯示出seqidno:1中的核苷酸33-487與seqidno:3中的核苷酸1-449具有84%的同一性。小鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子(seqidno:3)與倉鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子(seqidno:1)的全長(zhǎng)相比具有80%的同一性。圖2b顯示了倉鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子部分核苷酸序列(seqidno:1)與小鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子(seqidno:3)的比對(duì),顯示出seqidno:1中的核苷酸996-3006與seqidno:1中的核苷酸921-2953具有83%的同一性。圖3顯示了倉鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子部分核苷酸序列(seqidno:1)與倉鼠β-肌動(dòng)蛋白基因(接收號(hào)no.u20114;seqidno:4)的比對(duì),顯示出seqidno:1中的核苷酸1775-3006與seqidno:4中的核苷酸1-1232具有98%的同一性。倉鼠β-肌動(dòng)蛋白基因序列與倉鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子序列(seqidno:1)的全長(zhǎng)相比具有40%的同一性。圖4顯示了倉鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子部分核苷酸序列(seqidno:1)與在先已知的人β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子(接收號(hào)no.gi28337;seqidno:5)的比對(duì),顯示出seqidno:1中的核苷酸113-148與seqidno:5中的核苷酸38-73具有94%的同一性,seqidno:1中的核苷酸362-433與seqidno:5中的核苷酸303-374具有83%的同一性,seqidno:1中的核苷酸1728-1764與seqidno:5中的核苷酸1791-1830具有90%的同一性,seqidno:1中的核苷酸1797-1966與seqidno:5中的核苷酸1840-2007具有91%的同一性。倉鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子序列(seqidno:5)與人β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子(seqidno:1)的全長(zhǎng)相比具有10%的同一性。圖5顯示了倉鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子核苷酸序列(seqidno:1)與先前已知的雞β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子(接收號(hào)no.gi217043;seqidno:6)的比對(duì),顯示出seqidno:1中的核苷酸1878-1919與seqidno:6中的核苷酸186-227具有83%的同一性。雞的β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子序列(seqidno:6)與倉鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子(seqidno:1)的全長(zhǎng)相比具有1%的同一性。圖6a描述了cho-k1細(xì)胞中的半乳糖結(jié)合蛋白、鐵蛋白和β-肌動(dòng)蛋白的rna斑點(diǎn)印跡。mrnas分別分離自放射菌素d處理后0、4、8、10和15小時(shí)后的細(xì)胞。圖6b描述了半乳糖結(jié)合蛋白、鐵蛋白和β-肌動(dòng)蛋白的相對(duì)mrna表達(dá)水平。mrnas分別分離自放射菌素d處理后的cho-k1細(xì)胞10、4、8、10和15小時(shí)后的細(xì)胞。圖7a描述了在cho-k1細(xì)胞中的瞬時(shí)轉(zhuǎn)染分析檢測(cè)下列啟動(dòng)子的相對(duì)啟動(dòng)子強(qiáng)度:cmv、人ef-1、倉鼠gapdh、倉鼠rps21_和倉鼠β-肌動(dòng)蛋白。在pdsred-1質(zhì)粒中啟動(dòng)子分別被克隆到紅色熒光蛋白(rfp)基因的上游。用facs檢測(cè)熒光。圖7b描述了在cho-k1細(xì)胞中的穩(wěn)定轉(zhuǎn)染分析檢測(cè)中下列啟動(dòng)子的相對(duì)啟動(dòng)子強(qiáng)度:cmv、人ef-1、倉鼠gapdh、倉鼠rps21_和倉鼠β-肌動(dòng)蛋白。在pdsred-1質(zhì)粒中分別將啟動(dòng)子被克隆到紅色熒光蛋白(rfp)基因的上游。用facs檢測(cè)平均熒光。圖8a描述了在來源于三個(gè)被含有可操作地連接到cmv啟動(dòng)子或倉鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子上的asmcdna的載體轉(zhuǎn)染的cho-dxb11細(xì)胞池的培養(yǎng)基中酸性鞘磷脂酶(asm)蛋白的表達(dá)。用分析asm酶活性的分析方法分析asm的表達(dá)。圖8b描述了在來源于三個(gè)被含有可操作地連接到cmv啟動(dòng)子或倉鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子上的gaacdna的載體轉(zhuǎn)染的cho-dxb11細(xì)胞池的培養(yǎng)基中α-葡萄糖苷酶(gaa)蛋白的表達(dá)。用分析α-葡萄糖苷酶(gaa)蛋白酶活性的分析方法分析gaa的表達(dá)。圖9描述了在來源于被含有可操作地連接到倉鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子上的tpacdna的載體轉(zhuǎn)染的cho-dxb11細(xì)胞池的培養(yǎng)基中tpa蛋白的表達(dá)。用elisa方法分析tpa的表達(dá)。具體實(shí)施方式為了更容易地理解本發(fā)明,首先對(duì)術(shù)語進(jìn)行定義。另外的定義在貫穿說明書的詳細(xì)說明中列出。術(shù)語“啟動(dòng)子”指調(diào)節(jié)元件,其指導(dǎo)與其可操作地連接的核酸的轉(zhuǎn)錄。啟動(dòng)子可以調(diào)節(jié)可操作地連接到其上的核酸的轉(zhuǎn)錄速率和效率。啟動(dòng)子還可以被可操作地連接到其它的調(diào)節(jié)元件上,其可增強(qiáng)(“增強(qiáng)子”)或抑制(“抑制子”)啟動(dòng)子依賴的的核酸轉(zhuǎn)錄。術(shù)語“可操作地連接”指處于與其它核酸有功能關(guān)系的位置的核酸。啟動(dòng)子通常位于核酸轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)的5’端(即,上游)。然而,啟動(dòng)子可以包括轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)的3’端(即,下游)。啟動(dòng)子還可以包括可操作地連接的核酸的轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)的5’和3’端。術(shù)語“啟動(dòng)子活性”指啟動(dòng)子啟動(dòng)與其可操作連接的核酸轉(zhuǎn)錄的能力??梢詰?yīng)用本領(lǐng)域公知的或?qū)嵤├忻枋龅姆椒z測(cè)啟動(dòng)子活性。例如,可以通過測(cè)量被轉(zhuǎn)錄的mrna的量測(cè)量啟動(dòng)子的活性,例如,rna印跡或聚合酶鏈反應(yīng)(pcr)??晒┻x擇地,可以通過測(cè)量被翻譯的蛋白產(chǎn)物的量測(cè)量啟動(dòng)子的活性,例如,蛋白印跡、elisa、如bradford分析(bradford(1976)anal.biochem.,72:248)的色比色分析和各種活性分析,包括報(bào)告基因分析和其他本領(lǐng)域公知的或?qū)嵤├忻枋龅姆椒?。術(shù)語“載體”指可以攜帶其他核酸的病毒或非病毒、原核或真核、脫氧核糖核酸、核糖核酸或核酸類似物。載體可攜帶核酸進(jìn)入被稱為“宿主細(xì)胞”的細(xì)胞,從而使核酸的全部或部分被轉(zhuǎn)錄或表達(dá)。可供選擇地,載體可被用于體外轉(zhuǎn)錄分析中。載體通常來源于不同病毒、細(xì)菌或哺乳動(dòng)物基因元件的組合物裝配而成。載體含有各種包括編碼選擇性標(biāo)記(如,抗生素抗性基因)、有助于其在細(xì)菌中增殖的序列、或僅在某些細(xì)胞類型中表達(dá)的一個(gè)或多個(gè)轉(zhuǎn)錄單位的編碼和非編碼序列。例如,哺乳動(dòng)物表達(dá)載體通常即含有有助于載體在細(xì)菌中增殖的原核序列,又含有僅在真核細(xì)胞中表達(dá)的一個(gè)或多個(gè)真核轉(zhuǎn)錄單位。本領(lǐng)域技術(shù)人員應(yīng)該理解載體的設(shè)計(jì)取決于如所選擇的被轉(zhuǎn)染的宿主細(xì)胞、所需的蛋白質(zhì)表達(dá)水平等因素。載體包括例如,質(zhì)粒、噬菌粒和病毒載體。對(duì)于已具有啟動(dòng)子的載體,可以使用本領(lǐng)域熟知的標(biāo)準(zhǔn)重組dna技術(shù)對(duì)載體進(jìn)行修飾,從而用任何seqidnos:1、2、3或39或其變種列出的啟動(dòng)子序列取代已存在的啟動(dòng)子序列,。一般而言,合適的載體或者可以選自商售的那些,也可以應(yīng)用本領(lǐng)域熟知的標(biāo)準(zhǔn)重組dna技術(shù)構(gòu)建。(見,如molecularcloning:alaboratorymanual:2ndedition,sambrooketal.,1989,coldspringharborlaboratorypress.)術(shù)語“轉(zhuǎn)化”和“轉(zhuǎn)染”指向細(xì)胞內(nèi)導(dǎo)入核酸??梢允褂帽绢I(lǐng)域熟知的方法或此處描述的方法將核酸導(dǎo)入植物或動(dòng)物細(xì)胞,或原核或真核細(xì)胞。術(shù)語“分離的”指使用不是自然發(fā)生的方式,從其他核酸序列中分離的脫氧核糖核酸、核糖核酸、或多聚核苷酸的核酸類似物。分離的核酸包括使用本領(lǐng)域的標(biāo)準(zhǔn)技術(shù)部分或全部化學(xué)地或重組地合成和/或純化的核酸。涉及啟動(dòng)子的術(shù)語“變種”指如果變種具有啟動(dòng)子活性,則與啟動(dòng)子序列全長(zhǎng)或其互補(bǔ)鏈全長(zhǎng)基本上具有同一性的核苷酸序列。只要其長(zhǎng)度至少有1250個(gè)核苷酸β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子的變種可以與seqidnos:1、2或3的核苷酸序列同樣長(zhǎng)、或短。只要其具啟動(dòng)子活性rps21啟動(dòng)子的變種可以與seqidnos:39的核苷酸序列同樣長(zhǎng)、或短。β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子的變種可以是自然發(fā)生的,如從除人和雞以外的物種分離的自然發(fā)生的β-肌動(dòng)蛋白,或人工生成的β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子。當(dāng)被最優(yōu)比對(duì)時(shí),在seqidno:1序列的核苷酸1-3007的全長(zhǎng)上,seqidno:1列出的倉鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子與其變種之間的同一性至少為45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、或99%。相似地,在seqidno:2列出的序列的核苷酸1-2493的全長(zhǎng)上,seqidno:2的大鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子與其變種之間的同一性至少為60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、或99%。seqidno:3序列的核苷酸1-2953的全長(zhǎng)上,seqidno:3的小鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子與其變種之間的同一性至少為55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、或99%。相似地,在seqidno:39列出的序列的核苷酸1-1958的全長(zhǎng)上,seqidno:39的倉鼠rps21啟動(dòng)子與其變種之間在最優(yōu)比對(duì)時(shí)的同一性,至少為40%、50%、55%、60%、65%、70%、80%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、或99%。β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子的變種可以,例如,包括其他物種中的β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子的同源物(orthologs),其他物種包括嚙齒動(dòng)物和其他哺乳動(dòng)物,但除外人和雞β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子及其已知的變種。本發(fā)明的啟動(dòng)子的變種還可以在其他嚙齒動(dòng)物中被發(fā)現(xiàn),如豚鼠、花白旱獺、麝鼠、沙鼠、松鼠、花栗鼠、土撥鼠、海貍、豪豬和野鼠。術(shù)語“變種”進(jìn)一步包括具有啟動(dòng)子活性的任何一個(gè)或多個(gè)本發(fā)明啟動(dòng)子的片段。β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子的變種具有至少1250核苷酸的長(zhǎng)度。例如,可通過5’端切斷seqidno:1中列出的的倉鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子的而衍生出本發(fā)明的β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子。在一些實(shí)施方案中,β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子的變種包括seqidno:1的核苷酸50-3000、100-3000、150-3000、200-3000、250-3000、500-3000、1000-3000、或1500-3000的序列。在另一些實(shí)施例中,可通過5’端切斷seqidno:2中序列而衍生出β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子,例如包括seqidno:2的核苷酸50-2490、100-2490、150-2490、200-2490、250-2490、500-2490、或1000-2490的序列。還可通過5’端切斷seqidno:3中序列而衍生出β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子,其包括例如,seqidno:3的核苷酸50-2950、100-2950、150-2950、200-2950、250-2950、500-2950、1000-2950或1500-2950的序列。例如,可以通過切斷seqidno:7中較長(zhǎng)的倉鼠啟動(dòng)子核苷酸序列的5’端而衍生出倉鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子的長(zhǎng)片段。此種變種包括,如,核苷酸50-3668、100-3668、150-3668、200-3668、250-3668、500-3668或600-3668的序列。可以通過5’和/或3’端的切斷seqidno:39的序列來衍生rps21啟動(dòng)子的變種。此變種包括,例如,核苷酸50-1958、100-1958、150-1958、200-1958、250-1958、500-1958、1000-1958、1-1900、1-1850、1-1800、1-1750、1-1700、1-1600或1-1500的序列。在某些實(shí)施方案中,本發(fā)明的β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子包括來自于seqidnos:1、2或3的至少1250、1500、1550、1600、1650、1700、1750、1800、1850、1900、1950、2000、2500或3000個(gè)核苷酸的相鄰的分支。此seqidnos:1、2和3的相鄰分支還可以包括一個(gè)突變(插入或缺失),前提是突變序列保留了至少原始序列的一些功能以及在低、中等或高度嚴(yán)格的條件下可以分別與seqidnos:1、2或3雜交的能力??梢酝ㄟ^5’切斷seqidnos:1、2、3或7或上述其變種的任何序列的而衍生出β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子的相鄰分支。在其他實(shí)施方案中,本發(fā)明的rps21啟動(dòng)子包括來自seqidno:39的至少500、600、700、800、900、1000、1100、1200、1300、1400、1500、1600、1700、1800、1850或1900個(gè)核苷酸的相鄰分支。本發(fā)明的β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子的變種進(jìn)一步包括可以和seqidnos:1、2或3中所示的β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子或其互補(bǔ)序列全長(zhǎng)雜交的核苷酸序列,兩者具有最多0、1、2、3、4、5、10、15、20、25、30、35、40、45%的堿基對(duì)錯(cuò)配。本發(fā)明的rps21啟動(dòng)子序列包括可與seqidnos:39中所示的全長(zhǎng)rps21啟動(dòng)子序列或其互補(bǔ)序列雜交的核苷酸序列,兩者具有最多0、1、2、3、4、5、10、15、20、30、40、45、50、55、60%的堿基對(duì)錯(cuò)配??墒褂帽绢I(lǐng)域公知的或此處描述的技術(shù)測(cè)定堿基對(duì)的錯(cuò)配率。在此處用于修飾核酸的術(shù)語“異源的”是指除可操作地連接到自然發(fā)生的基因組的啟動(dòng)子核酸以外的核酸。例如,術(shù)語“異源的”指當(dāng)此核酸被可操作地連接到倉鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子時(shí),除倉鼠β-肌動(dòng)蛋白基因以外的任何核酸。同樣地,當(dāng)此核酸被可操作地連接到大鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子時(shí),術(shù)語“異源的”指除大鼠β-肌動(dòng)蛋白基因以外的任何核酸。相似地,當(dāng)此核酸被可操作地連接到小鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子時(shí),術(shù)語“異源的”指任何核酸。類似地,當(dāng)此核酸被可操作地連接到倉鼠rps21啟動(dòng)子時(shí),此術(shù)語可以指除倉鼠rps21基因以外的任何核酸。術(shù)語“轉(zhuǎn)基因”指含有基因操作細(xì)胞的任何動(dòng)物,其中本發(fā)明的啟動(dòng)子不再被可操作地連接如天然發(fā)生的基因組中的相同的核酸上。術(shù)語“轉(zhuǎn)基因”包括,例如,含有具有整合到動(dòng)物染色體中的本發(fā)明的啟動(dòng)子或其變種的細(xì)胞的動(dòng)物。術(shù)語“轉(zhuǎn)基因”還包括含有在染色體外具有由本發(fā)明的啟動(dòng)子或其變種組成的復(fù)制的dna序列的細(xì)胞的動(dòng)物。轉(zhuǎn)基因動(dòng)物可以是如嚙齒動(dòng)物或人的哺乳動(dòng)物。本發(fā)明部分基于新的β-肌動(dòng)蛋白和rps21基因的啟動(dòng)子的發(fā)現(xiàn)和分離。特別地,本發(fā)明的特征為包括但不局限于倉鼠、大鼠和小鼠的嚙齒動(dòng)物β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子,以及倉鼠rps21啟動(dòng)子。如實(shí)施例中所描述的,本發(fā)明是基于發(fā)現(xiàn)和證實(shí)本發(fā)明的β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子具有高于cmv的啟動(dòng)子活性的基礎(chǔ)上。本發(fā)明進(jìn)一步基于當(dāng)用于表達(dá)某些基因時(shí),倉鼠rps21啟動(dòng)子的活性至少與倉鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子的活性相同的發(fā)現(xiàn)的基礎(chǔ)上。本發(fā)明提供了包括倉鼠、大鼠和小鼠的嚙齒動(dòng)物β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子的核苷酸序列,以及其應(yīng)用方法。本發(fā)明進(jìn)一步提供了鑒別和分離本發(fā)明的啟動(dòng)子變種的方法,包括具有啟動(dòng)子活性的啟動(dòng)子的同源物或片段。另外,本發(fā)明提供了用于倉鼠rps21啟動(dòng)子的核苷酸序列及其使用方法。在導(dǎo)致本發(fā)明的實(shí)驗(yàn)中,倉鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子的基因克隆被稱為基因表達(dá)的系列分析技術(shù)或“sage”(valculescoetal.(1995)science,270:484-487和valculescoetal.(1987)cell,88:243-251)鑒定為活性啟動(dòng)子在識(shí)別后從cho細(xì)胞中分離出來。sage技術(shù)可被用于整個(gè)基因組的轉(zhuǎn)錄圖譜中。使用sage技術(shù),β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子被鑒定為是cho細(xì)胞中最具活性的啟動(dòng)子之一。因此從cho細(xì)胞中克隆β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子??蓱?yīng)用相似的方法從cho細(xì)胞中克隆倉鼠rps21啟動(dòng)子。該方法可被用于其他基因組的轉(zhuǎn)錄圖譜以確認(rèn)在其他基因組中相應(yīng)的β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子或rps21啟動(dòng)子的活性??墒褂帽绢I(lǐng)域公知的標(biāo)準(zhǔn)技術(shù)或此處描述的技術(shù)克隆這些啟動(dòng)子。可以通過將其與一個(gè)或多個(gè)seqidnos:1、2、3或39列出的啟動(dòng)子序列雜交的方法鑒別本發(fā)明的啟動(dòng)子的變種。同源性每降低1%,雙鏈核酸的熔點(diǎn)(tm)就降低1-1.5℃是公知的(見,如bonneretal.(1973)j.mol.biol.,81:123)。因此,例如可以將公認(rèn)的核苷酸序列與seqidnos:1、2、3或39或其變種序列雜交,并將此雜化物的熔點(diǎn)和seqidnos:1、2、3或39或其變種序列與其互補(bǔ)序列的雜化物的熔點(diǎn)相比較,從而鑒定物種間的同源性。然后可以計(jì)算待測(cè)雜化物的堿基對(duì)錯(cuò)配數(shù)。因此,待測(cè)雜化物的熔點(diǎn)與含有任何seqidnos:1、2、3或39的公認(rèn)同源物的雜化物的熔點(diǎn)的差別越小,表明公認(rèn)的核苷酸序列與本發(fā)明的啟動(dòng)子序列之間的同源性越大。例如,在其他嚙齒動(dòng)物如,豚鼠、花白旱獺、麝鼠、沙鼠、松鼠、花栗鼠、土撥鼠、海貍、豪豬和野鼠中的變種可以表現(xiàn)為與本發(fā)明的啟動(dòng)子及其變種具有更高的同源性。已知多種因子影響核酸雙鏈的雜交效率。其包括,例如,核酸序列的長(zhǎng)度,鹽濃度和序列的g/c含量。例如,為了雜交dna的長(zhǎng)片段,howleyetal.(1997)j.biol.chem.,254:4876,確定了使50%dna與互補(bǔ)鏈雜交的熔點(diǎn)為:tm=81.5+16.6logm+41(%g+%c)-500/l-0.62f,其中,m是單價(jià)陽離子的摩爾濃度;(%g+%c)是序列中g(shù)和c核苷酸各自的份額,l是雜合dna的長(zhǎng)度;f是甲酰胺的摩爾濃度。本領(lǐng)域技術(shù)人員可以如ausubeletal.(1995)currentprotocolsinmolecularbiology,johnwiley&sons,的第2、4和6部分列舉的通過最少的實(shí)驗(yàn)來選擇恰當(dāng)?shù)碾s交條件。另外,嚴(yán)格的雜交條件在sambrooketal.(1989)molecularcloning:alaboratorymanual,2nded.,coldspringharborpress,第7、9和11章中描述。低嚴(yán)格的雜交條件的非限制性的例子如下。含有dna的濾紙?jiān)?0℃下,在含有35%甲酰胺、5xssc、50mmtris-hcl(ph7.5)、5mmedta、0.1%pvp、0.1%ficolitm、1%bsa、和500ug/ml變性的鮭魚精子dna的溶液中預(yù)處理6小時(shí)。雜交在具有以下變動(dòng)的相同的溶液中進(jìn)行:0.02%pvp、0.02%ficolitm、0.2%bsa、100ug/ml變性的鮭魚精子dna、10%(wt/vol)硫酸葡聚糖以及使用5-20x10632p-標(biāo)記的探針。濾紙?jiān)?0℃下,在雜交混合液中孵育18-20小時(shí),然后在55℃的含2xssc、25mmtris-hcl(ph7.4)、5mmedta和0.1%sds的溶液中洗脫1.5小時(shí)。用新鮮溶液替換洗脫液并在60℃下繼續(xù)賦育1.5小時(shí)。吸干濾紙,使其暴露于射線自顯儀。也可以使用本領(lǐng)域公知的其他的低嚴(yán)格條件(如,種間雜交所用的)。一個(gè)高度嚴(yán)格的雜交條件的非限制性的示例如下所述。含有dna的濾紙的預(yù)雜交在含有6xssc、50mmtris-hcl(ph7.5)、1mmedta、0.02%pvp、0.02%ficolltm、0.02%bsa和500ug/ml變性的鮭魚精子dna的緩沖液中,在65℃處理8小時(shí)至過夜。濾紙?jiān)?5℃下,含有100ug/ml變性的鮭魚精子dna和5-20x106cpm的32p-標(biāo)記的探針的雜交液中雜交48小時(shí)。在37℃下,含有2xssc、0.01%pvp、0.01%ficolltm和0.01%bsa的溶液中洗脫濾紙1小時(shí),之后在50℃,0.1×ssc溶液中洗脫45分鐘。一個(gè)中度嚴(yán)格的雜交條件的非限制性的例子包括在5xssc、0.5%sds、1.0mmedta,ph8.0的溶液中預(yù)洗脫;在50%甲酰胺、6xssc的溶液中42℃進(jìn)行雜交;在0.5xssc、0.1%sds的條件下,60℃進(jìn)行洗脫。還可以通過公認(rèn)變種的核苷酸序列和seqidnos:1、2、3或39中的序列或其互補(bǔ)鏈間同一性的百分比鑒定本發(fā)明啟動(dòng)子的變種。同一性百分比可以通過,例如,可見觀測(cè)或本領(lǐng)域公知的或?qū)嵤├忻枋龅母鞣N計(jì)算機(jī)程序來確定。例如,可以通過使用devereux等(1984)nucl.acids.res.,12:387中描述的并從威斯康星州大學(xué)的基因計(jì)算機(jī)組(uwgcg)中可獲得的gap計(jì)算機(jī)程序比較序列信息來確定兩核苷酸序列的同一性百分比。還可以通過使用如tatusoveetal.(1999)femsmicrobiol.lett.,174:247中描述的程序(www.ncbi.nlm.nih.gov/blast)比對(duì)兩核苷酸序列以確定同一性百分比。例如,使用程序進(jìn)行核苷酸序列比對(duì)時(shí),默認(rèn)參數(shù)設(shè)定如下:匹配回報(bào)為2,不匹配懲罰為-2,開口間隙和延伸間隙懲罰分別為5和2,間隙xdropoff為50,預(yù)期值為10,字大小為11,過濾器關(guān)閉。通過序列同一性鑒別的本發(fā)明的啟動(dòng)子包括,例如,seqidnos:2和3序列分別列出的大鼠和小鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子的序列,顯示出與seqidno1列出的倉鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子序列的1-3007核苷酸相比具有67%和80%的同一性。應(yīng)用此處描述的和本領(lǐng)域熟知的多種技術(shù)可以很容易地鑒別其他變種??梢酝ㄟ^所描述的方法確定倉鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子(seqidno1)與已知的β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子間的同一性百分比。例如,當(dāng)用默認(rèn)參數(shù)的序列比對(duì)對(duì)seqidno1與人β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子(seqidno5)進(jìn)行對(duì)比時(shí),顯示出在seqidno1的全長(zhǎng)上僅有大約10%的同一性。相似地,當(dāng)seqidno1與雞β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子(seqidno6)對(duì)比時(shí),顯示出在seqidno1的全長(zhǎng)上僅有大約1%的同一性。由于同源性的水平如此低,因此不認(rèn)為人和雞的β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子是seqidno1列出的倉鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子的變種。而且,seqidno1的3’部分顯示出與倉鼠β-肌動(dòng)蛋白基因序列的5’部分(接收號(hào)no。u20114;seqidno4)具有顯著的同源性。特別地,如圖3所示,seqidno4的前1232個(gè)核苷酸顯示出與seqidno1的3’部分具有98%的同一性。此同一性位于倉鼠β-肌動(dòng)蛋白基因的第一內(nèi)含子區(qū)內(nèi)。整體上看,在seqidno1的全長(zhǎng)上,seqidno4僅顯示出40%的同源性。而且,seqidno4或其片段并不具有啟動(dòng)子活性。應(yīng)用具有默認(rèn)參數(shù)的序列比對(duì)發(fā)現(xiàn)在先前知道的人rps21啟動(dòng)子(接收號(hào)noaj250907的核苷酸1-2344)與seqidno39的倉鼠rps21啟動(dòng)子的核苷酸1-1958之間沒有同一性。在seqidno39的倉鼠rps21啟動(dòng)子和跨越小鼠rps21基因的小鼠基因組dna(接收號(hào)nont_039212)之間有很低的同一性。在小鼠的序列中有兩個(gè)具同源性的區(qū)域。第一個(gè)是seqidno39的核苷酸1775-1945(172個(gè)核苷酸中有137個(gè)相匹配)。第二個(gè)是seqidno39的核苷酸580-851(274個(gè)核苷酸中有208個(gè)相匹配)。這兩個(gè)具同一性的區(qū)域在倉鼠序列(seqidno39)中被923個(gè)核苷酸分開,在小鼠基因組序列(nt_039212)中被1745個(gè)核苷酸分開。在一些實(shí)施方案中,具有啟動(dòng)子活性的分離的啟動(dòng)子或其變種包括seqidno39中的核苷酸1775-1945和/或seqidno39中的核苷酸580-851的核苷酸序列??蛇x擇的,此啟動(dòng)子或變種進(jìn)一步包括從seqidno39的全部或如核苷酸852-1774所示的部分序列。seqidnos:1、2、3或39所示的核苷酸序列或其變種可用作探針以用于篩選基因組庫的,以便分離與一個(gè)或多個(gè)seqidnos:1、2、3或39所示序列或其變種的基因組序列。根據(jù)本發(fā)明的啟動(dòng)子或其變種被可操作地連接到被其所表達(dá)的異源核酸上。啟動(dòng)子既可單獨(dú)使用,也可以與其他調(diào)節(jié)元件,如增強(qiáng)子和抑制子聯(lián)合使用。可供選擇地,此啟動(dòng)子可被整合到宿主細(xì)胞或動(dòng)物的基因組上,從而在宿主細(xì)胞中表達(dá)內(nèi)源性基因。根據(jù)本發(fā)明的啟動(dòng)子可被用在表達(dá)異源核酸的載體中。在某些實(shí)施方案中,異源核酸編碼治療性蛋白。治療性蛋白的例子包括,但不局限于α-葡萄糖苷酶、酸性鞘磷脂酶、胰島素、組織血漿酶原激活劑、促甲狀腺素α注射液刺激的激素(thyrogenstimulatinghormon)、紅細(xì)胞生成素、葡糖腦苷脂酶、α-半乳糖苷酶和各種抗體??贵w的例子包括但不局限于結(jié)合如tgf-β-1、2和3tgf-β族成員的抗體。本發(fā)明進(jìn)一步提供了含有具有啟動(dòng)子活性的本發(fā)明的啟動(dòng)子或其變種的載體。在一些實(shí)施方案中,本發(fā)明的載體包括位于啟動(dòng)子下游的合適的限制性酶切位點(diǎn),其可用于插入異源的核酸。該限制性酶切位點(diǎn)可以包括用于一種限制性酶的一個(gè)限制性位點(diǎn)或其可包括用于多種限制性酶的多個(gè)限制性位點(diǎn),從而有助于插入多個(gè)不同異源的核酸。本發(fā)明的載體還可以包括異源核酸插入點(diǎn)下游的一個(gè)多腺苷序列。含有本發(fā)明啟動(dòng)子的載體還可以含有用于細(xì)菌復(fù)制的原核dna元件和用于載體在細(xì)菌細(xì)胞中生長(zhǎng)和選擇的抗生素選擇標(biāo)記,以及一個(gè)控制轉(zhuǎn)錄過程的另外的dna元件,如終止信號(hào)。載體可以進(jìn)一步包含指導(dǎo)蛋白質(zhì)向細(xì)胞外分泌的dna序列。在某些實(shí)施方案中,含有本發(fā)明的啟動(dòng)子序列的載體是雙順反子載體。設(shè)計(jì)成雙順反子載體可以使兩個(gè)核酸被轉(zhuǎn)錄而生成一個(gè)轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物。此轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物通常含有翻譯成一個(gè)蛋白的第一部分和翻譯成另一個(gè)蛋白的第二部分。一個(gè)蛋白可以是興趣蛋白,如治療蛋白,另一個(gè)蛋白可以被用作可供選擇的標(biāo)記。雙順反子載體通常含有一個(gè)啟動(dòng)子和一個(gè)內(nèi)部的核糖體進(jìn)入位點(diǎn)或位于兩個(gè)核酸間的ires。這使得兩個(gè)核酸轉(zhuǎn)錄為一個(gè)雙順反mrna。在這種方式下,可將載體構(gòu)建成含有本發(fā)明的β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子或其變種和在兩個(gè)異源核酸間的ires。含有本發(fā)明的β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子或其變種的雙順反子載體可被用于表達(dá)連接報(bào)告基因的治療蛋白,例如,酸性鞘磷脂酶或α-葡萄糖苷酶。本發(fā)明進(jìn)一步提供了鑒定具有啟動(dòng)子活性的本發(fā)明的β-肌動(dòng)蛋白和rps21啟動(dòng)子的變種的方法。例如,將本發(fā)明的啟動(dòng)子或其變種插入合適載體的報(bào)告基因的上游,并且報(bào)告基因的表達(dá),擇確定啟動(dòng)子活性的鑒定。例如,為鑒定本發(fā)明的具有啟動(dòng)子活性的啟動(dòng)子變種,則將此變種克隆到報(bào)告基因的上游。報(bào)告基因可以編碼能催化產(chǎn)生視覺可辨別信號(hào)的反應(yīng)的酶。此種信號(hào)基因的例子包括β-半乳糖苷酶和熒光素酶。其他信號(hào)基因的例子包括堿性磷酸酶、胭脂堿合成酶、章魚堿合成酶、β-葡萄糖醛酸苷酶、氯霉素乙?;D(zhuǎn)移酶(chloremphenicolacetyltransferase)。在下列實(shí)施例中,編碼???discosomastriata)紅色熒光蛋白(rfp)的報(bào)告基因被用于檢測(cè)啟動(dòng)子活性。然而,本領(lǐng)域技術(shù)人員可以使用任何適當(dāng)?shù)膱?bào)告基因和分析技術(shù)檢測(cè)啟動(dòng)子活性。可以在體外表達(dá)系統(tǒng)或細(xì)胞內(nèi)(如體內(nèi))分析啟動(dòng)子啟動(dòng)的報(bào)告基因的表達(dá)。本發(fā)明進(jìn)一步提供了被含有可操作地連接到異源基因的啟動(dòng)子的本發(fā)明的載體轉(zhuǎn)染的宿主細(xì)胞。此宿主細(xì)胞可以是原核細(xì)胞或真核細(xì)胞。宿主細(xì)胞可以是培養(yǎng)的,也可以是動(dòng)物中的細(xì)胞。培養(yǎng)的宿主細(xì)胞的例子包括,但不局限于hela細(xì)胞、cho細(xì)胞、nso、hek細(xì)胞、bhk細(xì)胞、nih-3t3、mdck細(xì)胞和cos細(xì)胞。如實(shí)施例中所述的,培養(yǎng)中的宿主細(xì)胞可以懸浮或在微載體中生長(zhǎng)。可以使用許多恰當(dāng)?shù)姆椒▽⒈景l(fā)明的核酸導(dǎo)入宿主細(xì)胞。含有本發(fā)明啟動(dòng)子序列的載體可以被導(dǎo)入原核或真核細(xì)胞??梢詫⒑怂釋?dǎo)入真核細(xì)胞的技術(shù)的例子包括,例如,磷酸鈣沉淀、deae-右旋糖苷轉(zhuǎn)染、電穿孔、脂質(zhì)體介導(dǎo)的轉(zhuǎn)染、應(yīng)用病毒載體的轉(zhuǎn)導(dǎo)等??梢杂迷S多恰當(dāng)?shù)谋磉_(dá)系統(tǒng)來生成使用本發(fā)明的啟動(dòng)子的蛋白質(zhì)。一個(gè)此種表達(dá)系統(tǒng)應(yīng)用了二氫葉酸還原酶(dhfr)基因,該基因被導(dǎo)入含有可操作地連接到異源核酸的本發(fā)明啟動(dòng)子或其變種的載體??晒┻x擇地,如果使用dfhr缺陷細(xì)胞作表達(dá),可將表達(dá)dhfr的表達(dá)載體共同轉(zhuǎn)染到宿主細(xì)胞。當(dāng)增加甲氨蝶呤(mtx),一種主要的酶dhfr的競(jìng)爭(zhēng)性抑制劑的濃度被施加到轉(zhuǎn)染細(xì)胞時(shí),僅僅具dhfr較高表達(dá)水平的細(xì)胞存活。進(jìn)一步增加mtx水平時(shí),僅僅那些dhfr基因的拷貝數(shù)增幅的細(xì)胞存活。在這種方式下,通過增加含啟動(dòng)子的載體的拷貝數(shù),可以增加異源核酸的表達(dá),從而提高蛋白質(zhì)產(chǎn)量。第二個(gè)表達(dá)系統(tǒng)使用了谷氨酸合成酶(gs)基因,該基因被導(dǎo)入含有被可操作地連接到異源核酸的本發(fā)明的啟動(dòng)子或其變種的載體中。使用另外gs的競(jìng)爭(zhēng)性抑制劑,如,硫代甲硫氨酸(methioninesulphoximine)(msx),以增加載體的拷貝數(shù),實(shí)現(xiàn)增加的蛋白質(zhì)產(chǎn)量。任何恰當(dāng)?shù)脑嘶蛘婧吮磉_(dá)系統(tǒng)可被用來表達(dá)應(yīng)用本發(fā)明的啟動(dòng)子蛋白質(zhì)。表達(dá)系統(tǒng)的例子包括,但不局限于,植物、桿狀病毒、酵母、細(xì)菌、果蠅、哺乳動(dòng)物或無細(xì)胞(cellfree)表達(dá)系統(tǒng)。例如,在ausubel(1995),supra中提供了將表達(dá)載體導(dǎo)入哺乳動(dòng)物、細(xì)菌、酵母、昆蟲和植物細(xì)胞的標(biāo)準(zhǔn)方法。在某些實(shí)施方案中,本發(fā)明的啟動(dòng)子及其變種被用于基因治療的方法中。例如,本發(fā)明的啟動(dòng)子及其變種被克隆到病毒或非病毒基因治療載體中,使其被可操縱的連接到興趣基因上。當(dāng)載體被運(yùn)送到目的物,如人類病人時(shí),啟動(dòng)子啟動(dòng)編碼治療蛋白的基因表達(dá)。以下實(shí)施例提供了本發(fā)明的說明性實(shí)施方案。本領(lǐng)域的普通技術(shù)人員將意識(shí)到在不改變本發(fā)明的主旨和范圍時(shí),可進(jìn)行多種修飾和改動(dòng)。這些修飾和改動(dòng)仍包括在本發(fā)明的范圍內(nèi)。這些實(shí)施例不以任何方式限制本發(fā)明。實(shí)施例以下描述了實(shí)施例中所用的物質(zhì)和方法a.cho-k1細(xì)胞的培養(yǎng)cho-k1細(xì)胞從americantypeculturecollection(manassas,va)(atccno.crl-9618)獲得。在250ml含有15g/lde-52微載體(whatman,kent,uk)、和10%供體小牛血清(dcs)(invitrogen)的925細(xì)胞培養(yǎng)基中旋轉(zhuǎn)培養(yǎng)細(xì)胞。細(xì)胞在37℃下,使用20-40%o2和5%co2、并在大約60rpm下晃動(dòng)6天。細(xì)胞在血清存在下生長(zhǎng)后,每天用不含血清的925培養(yǎng)基更換80%(v/v)培養(yǎng)基。細(xì)胞在不含血清的培養(yǎng)基中生長(zhǎng)11天后從細(xì)胞中提取rna。為了確定mrna的半衰期,將7mg/l的放射菌素d加入不含血清相中。b.rna的提取和分析使用promega(madison,wi)的rnagents試劑盒從cho-k1細(xì)胞中分離rna。用rna印記法分析基因表達(dá)。為進(jìn)行rna印記分析,應(yīng)用試劑盒(ambion,ausein,tx)在變性的glycoxal/二甲基亞砜凝膠上電泳分離5ugrna。而后將rna轉(zhuǎn)到尼龍膜上(schleiche&schuell,dassel,德國)。用通過pcr擴(kuò)增的下述基因探針雜交斑點(diǎn):半乳糖結(jié)合蛋白(接收號(hào)no.m96676,核苷酸14-383);β-肌動(dòng)蛋白(接收號(hào)no.u20114,核苷酸238-381);ef-1(接收號(hào)no.d00522,核苷酸7-192);rps21(接收號(hào)no.x79059,核苷酸68-340);鐵蛋白(接收號(hào)no.m99692,核苷酸182-303)或商業(yè)上可購得的甘油醛-3-磷酸脫氫酶(gapdh)片段(ambion,austin,tx)。使用隨機(jī)引物將每種pcr產(chǎn)物放射標(biāo)記。用于擴(kuò)增每種基因的pcr引物在表一中列出。表1c.cho-k1細(xì)胞的轉(zhuǎn)染為了瞬時(shí)轉(zhuǎn)染,cho-k1細(xì)胞被鋪在含10%胎牛血清(fbs)(invitrogen)的925培養(yǎng)基的6孔培養(yǎng)平板中。在用lipofectaminetm(invitrogen)進(jìn)行轉(zhuǎn)染之前,細(xì)胞生長(zhǎng)至50-75%融合度。pdsred-1質(zhì)粒(clontech,paloalto,ca)與編碼用于鑒別轉(zhuǎn)染細(xì)胞的細(xì)胞表面cd20標(biāo)記的psv40-cd20質(zhì)粒共同轉(zhuǎn)染。pdsred-1質(zhì)粒編碼海葵紅色熒光蛋白(rfp),可通過fasc檢測(cè)其表達(dá)。根據(jù)廠家的說明書進(jìn)行轉(zhuǎn)染。簡(jiǎn)言之,細(xì)胞與脂質(zhì)體-dna復(fù)合物在不含血清的opti-memtm培養(yǎng)基(invitrogen)中孵育16小時(shí)。用含10%fbs的925培養(yǎng)基替換該培養(yǎng)基,轉(zhuǎn)染48小時(shí)后收集細(xì)胞。d.熒光活化細(xì)胞挑選分析為進(jìn)行facs分析,用胰蛋白酶處理1x106個(gè)細(xì)胞,并用含2%fbs的冷pbs沖洗。隨后用fitc標(biāo)記的抗cd20抗體(pharmingen,sandiego,ca)在冰上孵育細(xì)胞30分鐘。然后用含2%fbs的冷pbs沖洗,并用1ml冷的pbs/2%fbs將細(xì)胞懸浮。使用facscaliburtm(bdbiosciences,sandiego,ca)進(jìn)行facs分析。評(píng)估所有的cd20陽性物的紅色熒光蛋白的平均熒光強(qiáng)度,以分析啟動(dòng)子強(qiáng)度。e.asm分析將由編碼酸性鞘磷脂酶(asm)的載體轉(zhuǎn)染的細(xì)胞的培養(yǎng)物在37℃下,與在250mm的醋酸鈉中,濃度為12.5mm的合成底物2-(n-六癸?;被?-4-硝基苯基磷?;?calbiochem,sandiego,ca)、ph5.5、0,含有1m醋酸鋅、0.25mg/ml的牛血清白蛋白(bsa)和0.15%的吐溫20中孵育。通過加入含50%乙醇的0.2m的甘氨酸-氫氧化鈉終止反應(yīng)。通過使用比色儀測(cè)量415nm下的光密度,測(cè)量所產(chǎn)生的2-(n-六癸?;被?-4-硝基酚鹽的量來測(cè)定asm的活性。f.gaa分析將被編碼α-葡萄糖苷酶(gaa)的載體轉(zhuǎn)染的細(xì)胞培養(yǎng)基在37℃下,與在50mm的醋酸鈉中濃度為40mm的合成底物p-硝基苯基-d-a-吡喃葡萄糖酯(sigma,stlouis,mo)、ph4.3,并含有0.1%的胎牛血清(bsa)中孵育。通過加入0.3m的甘氨酸,ph10.6終止反應(yīng)。通過使用比色儀測(cè)量400nm的光密度,測(cè)量所產(chǎn)生的p-硝基苯基的量來測(cè)定gaa的活性或量。實(shí)驗(yàn)例1:cho-k1細(xì)胞中β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子的鑒別應(yīng)用基因表達(dá)的系列分析(sage)分析在不含血清的完全覆蓋旋轉(zhuǎn)培養(yǎng)(perfusedspinnerculture)上生長(zhǎng)的cho-k1細(xì)胞的完整的轉(zhuǎn)錄圖譜。sage的第一步包括使用標(biāo)準(zhǔn)技術(shù)從分離的cho-k1細(xì)胞mrna中合成雙鏈dna。隨后用限制性內(nèi)切酶nlalll,又稱錨定酶切斷該cdna,預(yù)期至少一次可切出最多的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物。通過結(jié)合到鏈霉親和素的磁珠而將每一個(gè)被切斷的cdna的3’部分分離。然后將cdna分成兩部分,通過將其限制性位點(diǎn)錨定連接到含有ii型限制性內(nèi)切酶位點(diǎn)(例如,foki)的連接物上。ii型限制性內(nèi)切酶在離其不對(duì)稱的識(shí)別位點(diǎn)最多20個(gè)堿基對(duì)的指定位置切斷。ii型酶典型地被稱為標(biāo)記酶。用標(biāo)記酶切段連接物產(chǎn)物可以使連接物與短的cdna片段被釋放出來。錨定和標(biāo)記酶的聯(lián)合使用可產(chǎn)生對(duì)于一個(gè)基因是唯一的10個(gè)堿基對(duì)的標(biāo)記。應(yīng)用這種方法,每個(gè)基因的標(biāo)記序列可以用3’最多的nlalll位點(diǎn)及其后的獨(dú)特的10bp的序列代表。在標(biāo)記不能別指定到已知基因的例子中,可以使用sage標(biāo)記和常用是m13正向引物(gttttcccagtcacgac,seqidno:18)對(duì)sage庫的cdna進(jìn)行pcr擴(kuò)增。隨后將pcr產(chǎn)物克隆到pcr2.1載體(invitrogen),并用標(biāo)準(zhǔn)的技術(shù)測(cè)序?;虻蔫b定是以pcr產(chǎn)物的序列與(www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank)中已知序列的同源性為基礎(chǔ)的。使核酸序列與小鼠和/或大鼠的相對(duì)物進(jìn)行比對(duì)(www.ncbi.nlm.nih.gov/blast)以確定標(biāo)記來源的序列。在分析鑒定出來的16個(gè)最豐富標(biāo)記中,(表2),除一個(gè)標(biāo)記外,其余的標(biāo)記基因都被鑒定出來。在這15個(gè)被鑒定出來的基因中,5個(gè)是線粒體來源,3個(gè)是核重復(fù)元件。在每個(gè)細(xì)胞中,這些基因有多重拷貝發(fā)生,可能是其在sage的輸出中豐富的原因。這些序列不能進(jìn)行下一步的評(píng)估。表2應(yīng)用此種方法,作為cho-k1細(xì)胞中最活躍的四個(gè)基因的啟動(dòng)子被鑒別出來。這些啟動(dòng)子是:β-肌動(dòng)蛋白、核糖體蛋白s21(rps21)、延伸因子1(ef-1)和甘油醛-3-磷酸脫氫酶(gapdh)。在cho-k1細(xì)胞中這些mrna高水平的表達(dá)即歸功于其各自啟動(dòng)子的活性,又歸功于mrnas的內(nèi)在穩(wěn)定性。盡管sage分析提供了基因mrna的總體穩(wěn)定狀態(tài)的定量,其并不能區(qū)分基因的啟動(dòng)子活性和mrna的穩(wěn)定性哪一個(gè)是高表達(dá)水平基礎(chǔ)的。因此,為了區(qū)分這兩種可能性,測(cè)定了mrnas的半衰期。簡(jiǎn)言之,通過對(duì)放射菌素d處理后的不同點(diǎn)的旋轉(zhuǎn)培養(yǎng)中的cho-k1細(xì)胞的rna印記分析評(píng)估了候補(bǔ)基因的表達(dá)。最初,分析了rps21、gapdh和ef-1基因,發(fā)現(xiàn)這所有的基因都具有相對(duì)穩(wěn)定的mrnas,其半衰期大于8個(gè)小時(shí)。這表明這些mrnas的豐富來自于mrnas穩(wěn)定,而不是各自啟動(dòng)子較高的活性。同樣如上所述的在放射菌素d處理后的0、4、8、10和15小時(shí)后使用rna印記方法測(cè)量半乳糖結(jié)合蛋白、鐵蛋白、和β-肌動(dòng)蛋白mrna的半衰期。各自的rna印記的結(jié)果在圖6a中表示。相對(duì)mrna水平在圖6b中以曲線說明。這些數(shù)據(jù)表明雖然半乳糖結(jié)合蛋白和鐵蛋白的半衰期大于8小時(shí),β-肌動(dòng)蛋白mrna變化的更快,其半衰期為大約6小時(shí)。因此,對(duì)于β-肌動(dòng)蛋白,啟動(dòng)子強(qiáng)度在總的穩(wěn)定狀態(tài)的mrna水平中的貢獻(xiàn)大于cho-k1細(xì)胞中的其他候選。因此,在這些條件下,β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子具有強(qiáng)啟動(dòng)子特點(diǎn)。實(shí)施例2:倉鼠β-肌動(dòng)蛋白和rps21啟動(dòng)子的分離和其特征根據(jù)實(shí)施例1中描述的結(jié)果,選擇具有最高豐富度的候選(rps21)和具有最快mrna變化(β-肌動(dòng)蛋白)進(jìn)行進(jìn)一步的研究。篩選λfixiicho-k1基因組文庫(stratagene,lajolla,ca)以分離倉鼠的β-肌動(dòng)蛋白和rps21啟動(dòng)子的基因組dna。為了分離β-肌動(dòng)蛋白和rps21基因克隆,將大腸桿菌株,xl1-bluemra(p2)培養(yǎng)在含10mm硫酸鎂和0.2%麥芽糖的lb培養(yǎng)基中。使600nm處的吸光度為0.5時(shí)收集細(xì)菌,而后再重新懸浮在10mm硫酸鎂中,。從庫中取大約100萬噬菌體,將其與細(xì)菌細(xì)胞在37℃中孵育15分鐘。將熔化的瓊脂糖凝膠加入噬菌體/細(xì)菌混合物,將細(xì)菌平鋪在含瓊脂的bioassay平板(nunc,rochester,ny)。瓊脂糖表面變硬后,將平板倒置,在30℃中過夜生長(zhǎng)。而后將平板冷卻,用genescreenplustm(perkelmerlifescience,wellesley,ma)尼龍濾紙覆蓋兩次。在具有1.5m的氯化鈉的0.1m的氫氧化鈉中將濾紙變性2分鐘,隨后中和。用uv交聯(lián)濾紙,并標(biāo)記。用于分離倉鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子的探針通過β-肌動(dòng)蛋白5’末端(接收號(hào)nou20114的核苷酸238-381)的隨機(jī)pcr產(chǎn)生。用于分離倉鼠rps21啟動(dòng)子的探針通過使用seqidnos:12和13中的引物的pcr產(chǎn)生。使用標(biāo)準(zhǔn)的技術(shù)純化雜交β-肌動(dòng)蛋白和rps21啟動(dòng)子的噬菌體。通過氯仿,酚,酚/氯仿(1:1)以及最后氯仿一系列抽提從噬菌體裂解液中分離噬菌體dna。為了分離倉鼠β-肌動(dòng)蛋白基因啟動(dòng)子,在乙醇沉淀后,用在倉鼠β-肌動(dòng)蛋白基因的5’部分有切點(diǎn)的內(nèi)切酶消化dna,并用與篩選基因組庫相同的探針進(jìn)行dna印記雜交。應(yīng)用此方法,產(chǎn)生了大約7kb的avrll片段和大約5.5kb的sall片段,兩者均可與探針雜交。隨后將其克隆到pbluescriptiiks質(zhì)粒(stratagene)。7kb的avrll片段的atcc參考號(hào)no----,保藏----,200----,美國組織培養(yǎng)中心,郵政信箱1549,manassas,va20108,美國。含有avrll和sall片段的質(zhì)粒被sfol消化,除去片斷包含β-肌動(dòng)蛋白開放閱讀框的片段的3’端。然后將這些片斷克隆到pdsred-1質(zhì)粒(clontech)以產(chǎn)生稱為pdsred-avr(6.5kb)和pdsred-avr(5.1kb)的構(gòu)建體。為了生成含有β-肌動(dòng)蛋白基因內(nèi)含子1全部的構(gòu)建,使用以下引物作pcr:正向:aggcccagcttgggaccaagacagaa(seqidno:35)反向:cgcggatccggcgaactatatcagggc(seqidno:36)pcr片段產(chǎn)生兩種產(chǎn)物:一個(gè)預(yù)期的大約7kb的產(chǎn)物和一個(gè)小點(diǎn)的3kb的非預(yù)期產(chǎn)物。兩種pcr產(chǎn)物均被克隆到pdsred-1質(zhì)粒(clontech)以產(chǎn)生pdsred-avr(1)-7和pdsred-avr(1)-3構(gòu)建體。將克隆到pdsred-1質(zhì)粒(clontech)的倉鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子每一個(gè)片段都被轉(zhuǎn)染到cho-k1細(xì)胞。使用上述的facs測(cè)定每一個(gè)倉鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子片段的相對(duì)啟動(dòng)子強(qiáng)度?;钚苑治龅慕Y(jié)果將在下面總結(jié)??缭胶塑账?1970至+1037的β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子的avr(1)-3片段表現(xiàn)出最高的啟動(dòng)子活性??缭胶塑账?6000至+1037的avr(1)-7片段表現(xiàn)出avr(1)-3活性的47%的活性。avr(6.5kb)、sal(5.1kb)、肌動(dòng)蛋白(3kb)和肌動(dòng)蛋白-p(2.8kb)片段分別僅表現(xiàn)出avr(1)-3活性的2%、2%、2%和0%的啟動(dòng)子活性。隨即對(duì)avr(1)-3片段測(cè)序,序列為seqidno:1中的序列。另外,也對(duì)avr(1)-3的5’上游區(qū)域的660核苷酸進(jìn)行測(cè)序。這個(gè)從-2622到+1037的相對(duì)長(zhǎng)的序列在seqidno:7中列出。從雜交的噬菌體中分離出dna后,為了分離rps21啟動(dòng)子,使用下列引物通過pcr對(duì)dna擴(kuò)增:正向:agctctaatacgactcactatagggc(seqidno:40)反向:ctctaggccagcggagcgcag(seqidno:41)。將pcr產(chǎn)物克隆到pcr2.1載體(invitrogen)中,隨后測(cè)序。倉鼠rps21啟動(dòng)子的核苷酸序列為seqidno:39中的序列。使用在克隆點(diǎn)側(cè)面的ecori位點(diǎn)切下啟動(dòng)子,將其克隆到pdsred1-1載體(clontech)。2kb的倉鼠rps21啟動(dòng)子序列的atcc參考號(hào)nopta-6194,保藏于2005年8月5日,美國組織培養(yǎng)中心,郵政信箱1549,manassas,va20108,美國。實(shí)施例3:倉鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子與cmv啟動(dòng)子的功能對(duì)比將avr(1)-3的啟動(dòng)子活性與cmv立即早期啟動(dòng)子(invitrogen)和人ef-1啟動(dòng)子(invitrogen)的活性進(jìn)行比較。用含有avr(1)-3、cmv立即早期啟動(dòng)子上游、或人ef-1啟動(dòng)子的pdsred-1質(zhì)粒轉(zhuǎn)染cho-k1細(xì)胞,每一個(gè)啟動(dòng)子都可操作地連接有rfp基因。轉(zhuǎn)染48小時(shí)后用facs檢測(cè)rfp的表達(dá)。如圖7a所示,在avr(1)-3轉(zhuǎn)染的細(xì)胞中,β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子序列(seqidno:1)與cmv或ef-1啟動(dòng)子相比,表現(xiàn)出較高水平的rfp表達(dá)。特別地,avr(1)-3轉(zhuǎn)染的表達(dá)大約比cmv啟動(dòng)子的高2倍。為了確定觀察到的表達(dá)情況在穩(wěn)定的轉(zhuǎn)染中是否保留,用g418tm篩選轉(zhuǎn)染的cho-k1細(xì)胞,共兩周。然后分析存活的細(xì)胞中的rfp的表達(dá)。如圖7b中所示,與瞬時(shí)轉(zhuǎn)染的細(xì)胞相似,β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子序列在seqidno:1中列出的avr(1)-3轉(zhuǎn)染的細(xì)胞中觀察到最高的rfp表達(dá),。實(shí)施例4:bhk-21和hek293細(xì)胞中倉鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子的活性在應(yīng)用實(shí)施例3所述的穩(wěn)定轉(zhuǎn)染的bhk-21(atccno.ccl10)和hek293(atccno.crl-1573)細(xì)胞中比較倉鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子和cmv啟動(dòng)子的活性。如在cho-k1細(xì)胞中所見到的,當(dāng)用β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子而不是cmv啟動(dòng)子時(shí),在bhk-21細(xì)胞中的rfp的表達(dá)顯著較高(表3)。在hek293細(xì)胞中,β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子啟動(dòng)的rfp的表達(dá)大體上與cmv啟動(dòng)子所引起的表達(dá)相同。表3細(xì)胞系cmv啟動(dòng)子β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子bhk-218.3±0.4121±99.8hek293139±9.9102±8.3實(shí)施例5:大鼠和小鼠的β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子使用默認(rèn)參數(shù)檢索了公開的核苷酸序列數(shù)據(jù)庫,以查找seqidno:1的倉鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子序列的同源序列。倉鼠β-肌動(dòng)蛋白基因的5’部分(接收號(hào)no.u21104;seqidno:4)顯示出與倉鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子3’部分的98%的同一性??墒牵趕eqidno:1的倉鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子序列的全長(zhǎng)上,此同一性僅為40%。這部分沒有啟動(dòng)子活性。應(yīng)用默認(rèn)的參數(shù)和程序?qū)ο惹耙阎娜?接收號(hào)nogi28337a)和雞(接收號(hào)nogi2170437)β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子:與倉鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子進(jìn)行比對(duì),以確定同源性。與倉鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子(seqidno:1)相比,人和雞β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子僅分別具有10%和1%的同一性。大鼠(rattusnorvegcus)基因組超重疊群(接收號(hào)no.nw_042778)被鑒定為在大鼠12號(hào)染色體上,其含有與seqidno:1序列全長(zhǎng)有67%同一性的核苷酸序列。相似地,在小鼠(musmusculus)基因組第5號(hào)染色體上鑒別出一個(gè)重疊群(接收號(hào)no.nt_039324),其與seqidno:1序列全長(zhǎng)有80%同一性。倉鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子(seqidno:1)與倉鼠基因序列、人、雞、大鼠、和小鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子的比對(duì)分別在圖3、4、5、1a-1b和2a-2b中說明。實(shí)施例6:大鼠和小鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子的活性分別在seqidnos:1和2中列出的大鼠和小鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子序列,并被克隆到pdsred-1質(zhì)粒(clontech)。cmv啟動(dòng)子也被克隆到pdsred-1質(zhì)粒中rfp基因的上游。將這些質(zhì)粒轉(zhuǎn)染到cho-k1細(xì)胞,或其他細(xì)胞系。轉(zhuǎn)染48小時(shí)后,用facs分析rfp的表達(dá)。用大鼠或小鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子轉(zhuǎn)染的細(xì)胞預(yù)期比相似的條件下cmv啟動(dòng)子轉(zhuǎn)染的rfp的表達(dá)高。實(shí)施例7:使用倉鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子的表達(dá)蛋白質(zhì)為了進(jìn)一步評(píng)估倉鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子的活性,使用二氫葉酸還原酶(dhfr)選擇和甲氨蝶呤(mtx)擴(kuò)增的表達(dá)系統(tǒng)。載體pgz6衍生自pclhaxsv2dhfr質(zhì)粒,因而除含有sv40早期啟動(dòng)子控制的dhfr基因外,還含有3kb的倉鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子(seqidno:1)。pclhaxsv2dhfr質(zhì)粒先前曾被coleetal.(1993)biotechnology,11:1014-1024描述。簡(jiǎn)言之,pclhaxsv2dhfr載體中的金屬硫因啟動(dòng)子(mt)被β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子替換而生成pgz6載體。治療目的的兩種蛋白的cdna,酸性鞘磷脂酶(asm)和α-葡萄糖苷酶(gaa)被可操作地連接到倉鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子。asmcdna從imagetm協(xié)會(huì)(接收號(hào)no.a1587087)獲得。gaa的cdna從紐約醫(yī)科大學(xué)的drmartinuik處獲得。asm和gaacdna的核苷酸序列分別在seqidnos:37和38中列出。相似地,兩個(gè)cdna也被克隆到含有dhfr表達(dá)卡盒的載體中的cmv啟動(dòng)子的下游。dhfr缺陷cho-k1細(xì)胞系dxb11被兩套表達(dá)載體一式三份的轉(zhuǎn)染。在兩周后,含有20nmmtx的核酸缺陷培養(yǎng)基中,用pbs沖洗異源未被克隆的細(xì)胞池,并將其轉(zhuǎn)入不含血清的介質(zhì)。24小時(shí)后,測(cè)量介質(zhì)中的asm或gaa的量。此試驗(yàn)的結(jié)果在圖8a和8b中表示。在穩(wěn)定的細(xì)胞池中,倉鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子產(chǎn)生的asm的水平比cmv啟動(dòng)子多2到15倍,而在gaa的細(xì)胞中,多2到5倍。進(jìn)一步應(yīng)用穩(wěn)定的細(xì)胞池來評(píng)估β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子維持長(zhǎng)期蛋白表達(dá)的能力。典型地,為了產(chǎn)業(yè)上生產(chǎn)蛋白,通過增加選擇步驟的次數(shù)和/或mtx濃度的方法選擇具有較高基因拷貝的細(xì)胞,從而實(shí)現(xiàn)高表達(dá)。為了確定能否通過β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子(seqidno:1)實(shí)現(xiàn)較高表達(dá),將早期在20nmmtx下選擇的asm細(xì)胞池放大,使用高于10倍的mtx(200nm)選擇兩周。如表4中所總結(jié)的,3個(gè)被測(cè)β-肌動(dòng)蛋白池中的兩個(gè)在放大后顯示出相對(duì)起始20nm細(xì)胞池的asm水平高2-3倍。相反地,僅有一個(gè)被檢測(cè)的cmv池顯示比其來源的20nm池高的水平。在兩個(gè)啟動(dòng)子產(chǎn)生的六個(gè)細(xì)胞池中,β-肌動(dòng)蛋白產(chǎn)生的最高表達(dá)是cmv啟動(dòng)子產(chǎn)生的最高表達(dá)的6倍。這表明,至少在檢測(cè)條件下,倉鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子優(yōu)于cmv啟動(dòng)子。表4在另一個(gè)試驗(yàn)中,倉鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子被用來表達(dá)組織血漿酶原激活劑(tpa)蛋白,該蛋白是一種溶解血栓劑,可解決病人的凝血問題。用在該載體中倉鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子被可操作地連接到tpa基因的pgz6-tpa表達(dá)載體轉(zhuǎn)染cho-dxb11細(xì)胞,。通過在含有200nmmtx的核酸缺陷培養(yǎng)基中生長(zhǎng)來選擇穩(wěn)定轉(zhuǎn)染的細(xì)胞。然后將得到的未克隆細(xì)胞池中加入500nmmtx以放大轉(zhuǎn)染基因的拷貝數(shù)。從細(xì)胞中除去mtx,在1l的旋轉(zhuǎn)培養(yǎng)中放大細(xì)胞池并種植到cytoporetm2微載體上。細(xì)胞在含血清的培養(yǎng)基中生長(zhǎng)7天,以后的4天,每天用不含血清的培養(yǎng)基替換80%的血清。然后用15天收集培養(yǎng)基并用可買到的elisa試劑盒(tpa試劑盒,biopoolinternational,inc.,ventura,ca)分析tpa表達(dá)。如本的圖9所示,使用倉鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子導(dǎo)致tpa的表達(dá)濃度為每天30mg/l。此結(jié)果可以與最近發(fā)表的報(bào)道相比,用其他啟動(dòng)子4-8天后可產(chǎn)生30-40mg/ltpa(sengeretal.(2003)biotechnologyprogress19:1199-1209;dowd等人(2000)biotechnologyprogress16:786-794)。實(shí)施例8:應(yīng)用倉鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子制備抗體產(chǎn)量為了生成抗tgf-β族抗體,在兩個(gè)分別的pgz6表達(dá)載體中,編碼抗tgf-β抗體輕鏈或抗tgf-β抗體重鏈的核酸被克隆到β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子的下游。用兩種表達(dá)載體轉(zhuǎn)染dhfr缺陷cho-k1細(xì)胞系dxb11。在含有mtx的核酸缺陷培養(yǎng)基中選擇兩個(gè)星期后,測(cè)定培養(yǎng)基中輕鏈和重鏈的抗tgf-β抗體水平。實(shí)施例9:使用倉鼠rps21啟動(dòng)子的蛋白表達(dá)在cho-dxb11細(xì)胞中比較了倉鼠rps21啟動(dòng)子與倉鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子的表達(dá)活性。用含有可操作地連接到倉鼠rps21啟動(dòng)子seqidno:39(pgz31c-gaa)或倉鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子seqidno:1(pgz61c-gaa)的人α-葡萄糖苷酶(rhgaa)的表達(dá)載體轉(zhuǎn)染到cho-dxb11細(xì)胞。在兩種情況下,rhgaa通過內(nèi)部核糖體進(jìn)入點(diǎn)(ires)序列被連接到編碼細(xì)胞表面標(biāo)記(cd20)的基因。在核酸缺陷培養(yǎng)基中,用0.2um的mtx選擇細(xì)胞后,用fitc連接的抗cd20抗體標(biāo)記細(xì)胞,并用過facs分離高表達(dá)的克隆。將被選出的細(xì)胞鋪到96孔平板上,放大以分析rhgaa的表達(dá)。分析了倉鼠rps21啟動(dòng)子的38個(gè)克隆和倉鼠β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子的29個(gè)克隆。表5顯示了所得兩種啟動(dòng)子克隆的表達(dá)范圍分布。表5在另一個(gè)試驗(yàn)中,倉鼠rps21啟動(dòng)子被用于在cho-dxb11細(xì)胞中表達(dá)asm。對(duì)rps21啟動(dòng)子與β-肌動(dòng)蛋白和cmv啟動(dòng)子的活性進(jìn)行了比較。cho-dxb11細(xì)胞分三分轉(zhuǎn)染,直接在200nmmtx中選擇,或先在20nmmtx而后在200nmmtx中放大兩周,如實(shí)施例7中所述的。如所述測(cè)量培養(yǎng)基中的asm水平。在未轉(zhuǎn)染的細(xì)胞中測(cè)不到asm表達(dá)。如表6所總結(jié)的,三份rps21細(xì)胞池在放大后均顯示出相對(duì)其來源的初始20nm細(xì)胞池大2-3倍的asm表達(dá)水平。另外,所產(chǎn)生的asm水平比cmv啟動(dòng)子所產(chǎn)生的asm水平高(實(shí)施例7)。表6在直接用200nmmtx選擇的細(xì)胞所產(chǎn)生的asm表達(dá)水平在表7中總結(jié)。表7倉鼠rps21啟動(dòng)子在200nmmtx中產(chǎn)生的asm水平比cmv所產(chǎn)生的平均高大約1-2倍。在另一方面,β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子產(chǎn)生的asm水平比cmv所產(chǎn)生的平均高大約3-4倍。因此,當(dāng)用于表達(dá)gaa時(shí),rps21啟動(dòng)子至少具有與β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子一樣的活性,然而,當(dāng)用于asm表達(dá)時(shí),其表現(xiàn)出低于β-肌動(dòng)蛋白啟動(dòng)子的活性。然而,兩種啟動(dòng)子的活性均大于cmv啟動(dòng)子。根據(jù)在此引作參考的說明書中的對(duì)比文獻(xiàn),可以充分理解書明書。說明書中的實(shí)施分案為本發(fā)明的實(shí)施方案提供了解釋,但并不限制本發(fā)明的范圍。本領(lǐng)域技術(shù)人員應(yīng)該意識(shí)到許多其他的實(shí)施方案也包括在本發(fā)明的范圍內(nèi)。在此引用的所有的出版物和專利和在此公開通過接收號(hào)和數(shù)據(jù)庫參考而鑒別的序列被作為整體通過參考而并入此文。在一定程度上被引入作參考的內(nèi)容與本說明書相矛盾或不一致的程度,本說明將取代這些內(nèi)容。在此引用的任何參考文獻(xiàn)并非是本發(fā)明的現(xiàn)有技術(shù)。除非特別指出,應(yīng)該認(rèn)為所有在本說明書,包括權(quán)利要求中的用于表示成分、細(xì)胞培養(yǎng)、處理?xiàng)l件等的數(shù)字都用術(shù)語“大約”限定。從而,除非特別指出是相反的,數(shù)字參數(shù)是大概的,可以依據(jù)本發(fā)明所要獲得的特性的不同而不同。除非特別指出,在一系列成分前的術(shù)語“至少”應(yīng)當(dāng)被理解成指系列中的每一個(gè)成分。本領(lǐng)域技術(shù)人員可以使用不超出常規(guī)的實(shí)驗(yàn)認(rèn)識(shí)到或者可以確定此處描述的發(fā)明的特定實(shí)施方案的許多等同方案。這些等同方案包括在權(quán)利要求中?! ⌒蛄斜怼 ?lt;110>s·埃斯蒂斯 w·q·張 建新公司 <120>新的β-肌動(dòng)蛋白和rps21啟動(dòng)子及其應(yīng)用 <130>7680.27-304 <140> <141> <150>60/480,768 <151>2003-06-24 <160>41 <170>patentinversion3.2 <210>1 <211>3007 <212>dna <213>人造序列 <220> <223>分離自cho細(xì)胞的β-激動(dòng)蛋白啟動(dòng)子 <400>1 gggaccaagacagaaccataagccagtgggatagatcagaaatgttccagaggtgggatg60 gggccagagtgcctgccccttgaaccgtcccagggaccagaggtgacaaagtggcaacac120 aggtcctgcctgggaatctggtctgctcctacttagtaaagctgcctggtgtcacacaag180 aggcccccacttattcctgcacccctggtggtaggtggcgtcttctcccctgcagccacc240 aggctcccctgagaacactgccggcagtcctcattgacaggcagtattcgctctgcccca300 cccccacctgtgaattgcagggctggcaggtcctcaggcagctggcaaaccgcctgaaca360 actgagagatacagggccagggccagggcagtcccgtcccccggaggcagggaggggacg420 tgctgggaaagttctctctctcaggcccaggttggtgactgcagaaggcttctgtcaaat480 ctcttttgtgggaaccacagagtagccctgaacgtgggggtgtgcttccagtatactctg540 gggtcaccctttccatactggaggcctctgcaacttcaaaatgctctgctaccaacctag600 cacaaggaagttggtccagcctccccacgcagggccactgctgcagtccatatatggact660 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