用于腫瘤早期篩查的腫瘤血小板RNA定量檢測模型及方法與流程

文檔序號：11126265閱讀：來源：國知局

技術特征：

1.一種用于腫瘤早期篩查的腫瘤血小板RNA定量檢測模型，其特征在于，該模型包括PCR檢測特異性引物，所述PCR檢測特異性引物包括SEQ ID NO.1的F端引物和RT引物、SEQ ID NO.2的F端引物和RT引物、SEQ ID NO.3的F端引物和RT引物、SEQ ID NO.4的F端引物和RT引物、SEQ ID NO.5的F端引物和RT引物、SEQ ID NO.6的F端引物和RT引物、SEQ ID NO.7的F端引物和RT引物、SEQ ID NO.8的F端引物和RT引物以及SEQ ID NO.9的F端引物和RT引物。

2.根據(jù)權利要求1所述的用于腫瘤早期篩查的腫瘤血小板RNA定量檢測模型，其特征在于，所述PCR檢測特異性引物用以臨床診斷腫瘤血小板RNA 生物標志物組合，所述腫瘤血小板RNA 生物標志物組合包括以下血小板RNA：

CD79A(ENSG00000105369),CD81(ENSG00000110651),SYTL1(ENSG00000142765),CENPC(ENSG00000145241),TTN(ENSG00000155657),RHOH(ENSG00000168421),ZNF101(ENSG00000181896),TRABD2A(ENSG00000186854)和TRAC(ENSG00000229164)。

3. 根據(jù)權利要求2所述的用于腫瘤早期篩查的腫瘤血小板RNA定量檢測模型，其特征在于，所述腫瘤血小板RNA 生物標志物組合在使用時按照以下公式系數(shù)進行分配，所述公式為：

Y=0.0148108×ACD79A(ENSG00000105369)+0.07848907× BCD81(ENSG00000110651)+0.1531495×CSYTL1(ENSG00000142765)+ 0.08874548×DCENPC(ENSG00000145241)+0.05914998×ETTN(ENSG00000155657) + 0.22891517×FRHOH(ENSG00000168421) + 0.5210493×GZNF101(ENSG00000181896) + 0.05066299× HTRABD2A(ENSG00000186854)+0.31206518×ITRAC(ENSG00000229164)；其中，

ACD79A(ENSG00000105369)是CD79A(ENSG00000105369) 在腫瘤血小板中的表達量(2^ΔCt值)，

BCD81(ENSG00000110651)是CD81(ENSG00000110651)在腫瘤血小板中的表達量(2^ΔCt值)，

CSYTL1(ENSG00000142765)是SYTL1(ENSG00000142765)在腫瘤血小板中的表達量(2^ΔCt值)，

DCENPC(ENSG00000145241)是CENPC(ENSG00000145241)在腫瘤血小板中的表達量(2^ΔCt值)，

ETTN(ENSG00000155657)是TTN(ENSG00000155657)在腫瘤血小板中的表達量(2^ΔCt值),

FRHOH(ENSG00000168421)是RHOH(ENSG00000168421)在腫瘤血小板中的表達量(2^ΔCt值)，

GZNF101(ENSG00000181896)是ZNF101(ENSG00000181896)在腫瘤血小板中的表達量(2^ΔCt值),

HTRABD2A(ENSG00000186854)是TRABD2A(ENSG00000186854)在腫瘤血小板中的表達量(2^ΔCt值 )

ITRAC(ENSG00000229164)是TRAC(ENSG00000229164)在腫瘤血小板中的表達量(2^ΔCt值)。

4.一種用于腫瘤早期篩查的腫瘤血小板RNA定量檢測方法，其特征在于，該方法包括以下步驟：

1)制備樣本：制備待測人血漿樣本，以健康人血漿樣本作為正常對照；

2)提取RNA：提取血小板總RNA；

3)逆轉錄：將血小板總RNA逆轉錄成cDNA；

4)PCR檢測：以cDNA為模板，在PCR檢測特異性引物和實時定量嵌合熒光法PCR檢測試劑盒的聯(lián)合應用下進行實時熒光定量PCR技術檢測SEQ ID NO.1—SEQ ID NO.9在待測人血小板和健康人血小板中的表達量，并采用 2^ΔCt表示待測樣本中目的 RNA 表達量相對于管家基因GAPDH(ENSG00000111640)變化的倍數(shù)；

5) 用算式計算 Y 值：