1.一種用于預(yù)示和鑒定鴨生長(zhǎng)和腹脂率的分子標(biāo)記方法,其特征在于,包括以下步驟:
以包含VLDLR基因的待測(cè)鴨全基因組DNA為模板,用Primer5.0設(shè)計(jì)引物,擴(kuò)增長(zhǎng)度為374bp,上下游引物序列為:
上游5’-ATTACACTGCCAAATGACC-3’;
下游5’-CGGGAACTGGGATTCTTC-3’;
產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)后進(jìn)行純化雙向測(cè)序,測(cè)序鑒定鴨VLDLR基因5'UTR和信號(hào)肽編碼區(qū)多態(tài)性;
對(duì)鴨VLDLR基因單倍型組合與屠宰性狀之間進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析,發(fā)現(xiàn)能影響生長(zhǎng)速度和腹脂率的有效分子標(biāo)記信息,進(jìn)而用于培育出優(yōu)質(zhì)肉鴨新品系。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的用于檢測(cè)鴨生長(zhǎng)和腹脂率的分子標(biāo)記方法,其特征在于,所述PCR擴(kuò)增反應(yīng)體系為25μL,反應(yīng)程序?yàn)?4℃預(yù)變性10min,然后35個(gè)循環(huán)(94℃變性30S,53.5℃退火30S,72℃延伸30S),72℃延伸10min,4℃保存。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的用于檢測(cè)鴨生長(zhǎng)和腹脂率的分子標(biāo)記方法,其特征在于,所述純化雙向測(cè)序是以PCR反應(yīng)的引物作為測(cè)序引物,和PCR產(chǎn)物進(jìn)行純化測(cè)序,使用PHASE軟件統(tǒng)計(jì)SNP位點(diǎn)的單倍型、單倍型頻率及構(gòu)建單倍型組合。
4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的用于檢測(cè)鴨生長(zhǎng)和腹脂率的分子標(biāo)記方法,其特征在于,所述鴨VLDLR基因5'UTR和信號(hào)肽編碼區(qū)多態(tài)性結(jié)果該VLDLR基因具有4個(gè)多態(tài)位點(diǎn):g.151、g.170、g.206、g.278-295;
在g.151位點(diǎn),GA基因型的頻率最高,為0.56,AA基因型的頻率最低,為0.04,等位基因頻率G>A;
在g.170位點(diǎn),CC基因型的頻率最高,為0.50,CT基因型的頻率最低,為0.22,等位基因頻率C>T;
在g.206位點(diǎn),AG基因型的頻率最高,為0.50,GG基因型的頻率最低,為0.17,等位基因頻率A>G;
在g.278-295位點(diǎn),DD型的頻率最高,為0.65,DB型的頻率最低,為0.11,等位基因頻率D>B。
5.權(quán)利要求1-4中任一所述的用于檢測(cè)鴨生長(zhǎng)和腹脂率的分子標(biāo)記方法在鴨育種過程中進(jìn)行標(biāo)記輔助選擇的應(yīng)用。