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動(dòng)物產(chǎn)地來源的鑒定方法、鑒定模型的建立方法及其應(yīng)用與流程

文檔序號(hào):12697546閱讀:來源:國知局

技術(shù)特征:

1.一種動(dòng)物產(chǎn)地來源的鑒定方法,其特征在于,包括如下步驟:

1)獲取動(dòng)物腸道微生物的豐度信息;

2)將豐度信息進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析,根據(jù)分析結(jié)果判斷動(dòng)物的產(chǎn)地來源。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的動(dòng)物產(chǎn)地來源的鑒定方法,其特征在于,所述的動(dòng)物為螃蟹;優(yōu)選地,所述的動(dòng)物為大閘蟹。

3.根據(jù)權(quán)利要求1任一項(xiàng)所述的動(dòng)物產(chǎn)地來源的鑒定方法,其特征在于,步驟1)進(jìn)一步包括如下步驟:

i.獲取腸道微生物分子鐘區(qū)域序列信息;

ii.根據(jù)步驟i得到的序列信息,將微生物分類,并統(tǒng)計(jì)各種微生物的豐度信息。

優(yōu)先地,步驟(i)所述的分子鐘區(qū)域?yàn)?6S區(qū)域;優(yōu)選地,分子鐘區(qū)域?yàn)?6S V5-V4區(qū)域;更為優(yōu)選地,分子鐘區(qū)域?yàn)?6S DNA V5-V4區(qū)域。

4.根據(jù)權(quán)利要求1-3任一項(xiàng)所述的動(dòng)物產(chǎn)地來源的鑒定方法,其特征在于,步驟2)所述的關(guān)聯(lián)分析為主成分分析或者聚類分析,所述的分析結(jié)果為PC1,PC2分布區(qū)域或是否屬于同一聚類;優(yōu)選地,步驟2)所述的分析結(jié)果為PC1的數(shù)值分布。

5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的動(dòng)物產(chǎn)地來源的鑒定方法,其特征在于,步驟1)所述的腸道微生物包括擬桿菌門和變形菌門;優(yōu)先地,步驟1)所述的腸道微生物包括擬桿菌門、變形菌門、放線菌門、藍(lán)細(xì)菌門、厚壁菌門、浮霉菌門、軟壁菌門、疣微菌門;

步驟2)根據(jù)PC1的數(shù)值判斷大閘蟹的產(chǎn)地來源,具體為:當(dāng)PC1<12,判斷大閘蟹產(chǎn)地來源為陽澄湖。

6.一種動(dòng)物產(chǎn)地來源鑒定模型的建立方法,其特征在于,包括如下步驟:

1)采集各產(chǎn)地來源動(dòng)物的建模數(shù)據(jù)庫,所謂的建模數(shù)據(jù)庫為每個(gè)動(dòng)物腸道微生物的豐度信息;

2)將豐度信息用于關(guān)聯(lián)分析,分析結(jié)果圖譜特征作為動(dòng)物產(chǎn)地來源鑒定模型。

7.根據(jù)權(quán)利要求6所述的動(dòng)物產(chǎn)地來源鑒定模型的建立方法,其特征在于,所述的動(dòng)物為動(dòng)物為螃蟹;優(yōu)選地,所述的動(dòng)物為大閘蟹。

8.根據(jù)權(quán)利要求6-7任一項(xiàng)所述的動(dòng)物產(chǎn)地來源鑒定模型的建立方法,其特征在于:步驟2)所述的關(guān)聯(lián)分析為為主成分分析方法或者聚類分析,所述的分析結(jié)果圖譜特征為PC1,PC2整體分布區(qū)域或者是否屬于同一聚類;優(yōu)選地,步驟2)所述的分析結(jié)果圖譜特征為PC1數(shù)值分布。

9.根據(jù)權(quán)利要求8所述的動(dòng)物產(chǎn)地來源鑒定模型的建立方法,其特征在于:所述的腸道微生物為擬桿菌門和變形菌門的微生物;優(yōu)先地,所述的腸道微生物為擬桿菌門、變形菌門、放線菌門、藍(lán)細(xì)菌門、厚壁菌門、浮霉菌門、軟壁菌門、疣微菌門的微生物;

步驟2)根據(jù)PC1的數(shù)值判斷大閘蟹的產(chǎn)地來源,具體為:當(dāng)PC1<12,判斷大閘蟹產(chǎn)地來源為陽澄湖。

10.權(quán)利要求6,7,9任一所述的動(dòng)物產(chǎn)地來源鑒定模型的建立方法在動(dòng)物產(chǎn)地來源鑒定中的應(yīng)用。

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