本發(fā)明涉及一種體內(nèi)活性氧水平失調(diào)動(dòng)物模型的試劑盒,屬于生物
技術(shù)領(lǐng)域:
。
背景技術(shù):
:已發(fā)現(xiàn)越來(lái)越多的的疾病與所謂的體內(nèi)活性氧水平失調(diào)有關(guān),但目前體內(nèi)活性氧水平相關(guān)的動(dòng)物模型多為小鼠,導(dǎo)致研究周期長(zhǎng)、費(fèi)用高,而且無(wú)法實(shí)現(xiàn)高通量。大家急需一種簡(jiǎn)便、低費(fèi)用,且可實(shí)現(xiàn)高通量的體內(nèi)活性氧水平失調(diào)動(dòng)物模型試劑盒。新模式生物秀麗隱桿線蟲的isp-1基因編碼線粒體呼吸鏈復(fù)合體III的Rieske鐵硫蛋白(Rieskeironsulphurprotein,ISP)催化亞基,該復(fù)合體主要催化電子由泛醌傳遞到細(xì)胞色素c(cytochromec,cytc),該基因部分功能缺失會(huì)引起電子傳遞減弱,體內(nèi)活性氧水平下降,個(gè)體的壽命延長(zhǎng)。該亞基的序列在所有線粒體及好氧細(xì)菌中高度保守。研究表明,isp-1基因RNAi后的秀麗隱桿線蟲表現(xiàn)低耗氧,長(zhǎng)壽,發(fā)育緩慢等特征。因此如果能建立以isp-1基因RNAi后的秀麗隱桿線蟲為模型的試劑盒,則可建成一種簡(jiǎn)便、低費(fèi)用,且可實(shí)現(xiàn)高通量的體內(nèi)活性氧水平下降的動(dòng)物模型試劑盒,這將極大方便科研人員研究相關(guān)體內(nèi)活性氧水平失調(diào)疾病。本發(fā)明利用秀麗隱桿線蟲作為模式生物,構(gòu)建isp-1基因RNAi后的秀麗隱桿線蟲體內(nèi)活性氧水平失調(diào)動(dòng)物模型的試劑盒。本發(fā)明建立的以秀麗隱桿線蟲為體內(nèi)活性氧水平失調(diào)動(dòng)物模型的試劑盒,該試劑盒中的秀麗隱桿線蟲可以模擬動(dòng)物體內(nèi)總活性氧含量降低的狀態(tài),可用于研究體內(nèi)活性氧水平失調(diào)對(duì)機(jī) 體各種生理生化代謝過(guò)程的影響,為研究相關(guān)體內(nèi)活性氧水平失調(diào)疾病的科研工作者提供了一種工具。技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:本發(fā)明主要提供一種體內(nèi)活性氧水平失調(diào)動(dòng)物模型的試劑盒,該試劑盒使用方法簡(jiǎn)單易行、成本低廉,本發(fā)明建立的以秀麗隱桿線蟲為體內(nèi)活性氧水平失調(diào)動(dòng)物模型的試劑盒,該試劑盒中的秀麗隱桿線蟲可以模擬動(dòng)物體內(nèi)活性氧含量降低的狀態(tài),可用于研究體內(nèi)活性氧水平失調(diào)對(duì)機(jī)體各種生理生化代謝過(guò)程的影響,為研究相關(guān)體內(nèi)活性氧水平失調(diào)疾病的科研工作者提供了一種工具。本發(fā)明的另外一個(gè)目的是提供上述體內(nèi)活性氧水平失調(diào)動(dòng)物模型試劑盒的使用方法,本發(fā)明利用isp-1基因RNAi后的秀麗隱桿線蟲作為動(dòng)物模型,操作簡(jiǎn)單、快速。本發(fā)明是通過(guò)以下技術(shù)方案實(shí)現(xiàn)的:一種體內(nèi)活性氧水平失調(diào)動(dòng)物模型的試劑盒,所述試劑盒包括的材料為:①isp-1基因RNAi后的秀麗隱桿線蟲;②NGM培養(yǎng)基;③大腸桿菌OP50。所述的isp-1基因RNAi后的秀麗隱桿線蟲是通過(guò)分子生物學(xué)手段將秀麗隱桿線蟲isp-1基因片段插入到質(zhì)粒載體上,并將其轉(zhuǎn)化到宿主細(xì)胞中,構(gòu)建克隆菌,誘導(dǎo)轉(zhuǎn)化后的克隆菌表達(dá)isp-1的dsRNA,給秀麗隱桿線蟲飼喂克隆菌,即建立isp-1基因RNAi后的秀麗隱桿線蟲。其中,所述isp-1基因片段是用PCR的方法從秀麗隱桿線蟲基因組DNA中擴(kuò)增出來(lái)的。其中,所述質(zhì)粒載體為質(zhì)粒L4440(pPD129.36),宿主細(xì)胞為大腸桿菌 HT115(DE3)。其中,構(gòu)建重組質(zhì)粒的方法為:將isp-1基因片段插入到質(zhì)粒L4440(pPD129.36)兩個(gè)反向T7啟動(dòng)子之間的多克隆位點(diǎn)處構(gòu)建重組質(zhì)粒。其中,所述的誘導(dǎo)轉(zhuǎn)化后的重組克隆菌時(shí)所用的誘導(dǎo)劑為異丙基硫代半乳糖苷(IPTG)。本發(fā)明還提供一種體內(nèi)活性氧水平失調(diào)動(dòng)物模型試劑盒在篩選治療體內(nèi)活性氧水平失調(diào)疾病藥物中的應(yīng)用,所述活性氧水平失調(diào)是由活性氧下降引起的。本發(fā)明還提供一種體內(nèi)活性氧水平失調(diào)動(dòng)物模型試劑盒在篩選治療體內(nèi)代謝異常藥物中的應(yīng)用,所述代謝異常是活性氧下降所引起的。本發(fā)明還提供一種體內(nèi)活性氧水平失調(diào)動(dòng)物模型試劑盒在研究體內(nèi)活性氧升高對(duì)機(jī)體各種生理生化代謝過(guò)程的影響中的應(yīng)用。另外,本發(fā)明還提供上述體內(nèi)活性氧水平失調(diào)動(dòng)物模型試劑盒的使用方法,將isp-1基因RNAi后的秀麗隱桿線蟲用鎳鉻絲挑針?lè)謩e轉(zhuǎn)移到含有待測(cè)化合物的NGM培養(yǎng)基平板和不含有待測(cè)化合物的NGM培養(yǎng)基平板上,不含有待測(cè)化合物的NGM培養(yǎng)基平板作為空白對(duì)照組,每塊平板上接種25條isp-1基因RNAi后的秀麗隱桿線蟲,待測(cè)化合物組與空白對(duì)照組均設(shè)置3個(gè)平行,上述平板均接種大腸桿菌OP50作為秀麗隱桿線蟲食物,每天計(jì)數(shù)待測(cè)化合物組與空白對(duì)照組的秀麗隱桿線蟲的存活條數(shù),直至平板上所有的秀麗隱桿線蟲全部死亡,計(jì)算待測(cè)化合物組與空白對(duì)照組中秀麗隱桿線蟲的壽命。同以前的方法相比,本發(fā)明存在以下優(yōu)勢(shì):本發(fā)明利用秀麗隱桿線蟲作為模式生物,構(gòu)建isp-1基因RNAi后的秀麗隱桿線蟲體內(nèi)活性氧水平失調(diào)動(dòng)物模型試劑盒,該藥物試劑盒具有操作簡(jiǎn)單、 快速、高效的優(yōu)點(diǎn),為研究相關(guān)體內(nèi)活性氧水平失調(diào)疾病的科研工作者提供了一種工具。附圖說(shuō)明圖1為質(zhì)粒L4440的圖譜。圖2為秀麗隱桿線蟲isp-1基因RNAi后對(duì)應(yīng)基因mRNA表達(dá)量的變化。圖3秀麗隱桿線蟲isp-1基因RNAi后體內(nèi)活性氧含量的變化。圖4為PQ對(duì)isp-1基因RNAi后秀麗隱桿線蟲壽命的影響。圖5為NAC對(duì)isp-1基因RNAi后秀麗隱桿線蟲壽命的影響。圖6為PQ對(duì)isp-1基因RNAi后秀麗隱桿線蟲運(yùn)動(dòng)能力的影響。圖7為NAC對(duì)isp-1基因RNAi后秀麗隱桿線蟲運(yùn)動(dòng)能力的影響。圖8為PQ對(duì)isp-1基因RNAi后秀麗隱桿線蟲抗熱脅迫能力的影響。圖9為NAC對(duì)isp-1基因RNAi后秀麗隱桿線蟲抗熱脅迫能力的影響。具體實(shí)施方式以下提供具體實(shí)施例以實(shí)現(xiàn)本發(fā)明所述的一種體內(nèi)活性氧水平失調(diào)動(dòng)物模型的試劑盒,但不限于這些實(shí)施例。1.生物材料(1)秀麗隱桿線蟲株系:秀麗隱桿線蟲野生型N2,購(gòu)自CaenorhabditisGeneticsCenter(CGC)。(2)大腸桿菌:E.coliHT115(DE3),作為重組質(zhì)粒的宿主細(xì)胞,CaenorhabditisGeneticsCenter(CGC);E.coliOP50,作為秀麗隱桿秀麗隱桿線蟲正常的食物,購(gòu)自CaenorhabditisGeneticsCenter(CGC)。(3)質(zhì)粒載體:L4440(pPD129.36),RNAi質(zhì)粒載體,購(gòu)于Addgene。2.試劑(1)50×TAEBuffer:242gTris堿,57mL乙酸,100mL0.5mol/L的EDTA(pH8.0),用蒸餾水定容至1000mL,使用時(shí)根據(jù)要求用蒸餾水進(jìn)行稀釋。(2)1%瓊脂糖粉:將1g瓊脂糖粉溶于100mL1×TAEBuffer中,用微波爐加熱,使瓊脂糖粉完全溶解,室溫冷卻至60℃左右時(shí)加入適量溴化乙錠(EB),充分混勻后倒入膠槽,插入合適的梳子,待凝膠完全凝固后拔去梳子即可使用。(3)鹽酸四環(huán)素(TetracyclineHydrochloride,Tet):水溶,過(guò)濾除菌,母液濃度為25mg/mL,-20℃避光保存(生工生物工程(上海)股份有限公司)。(4)氨芐青霉素(Ampicillin,Amp):水溶,過(guò)濾除菌,母液濃度為100mg/mL,-20℃避光保存(生工生物工程(上海)股份有限公司)。(5)CaCl2:水溶,高溫高壓(121℃,20min)滅菌,儲(chǔ)存濃度為1mol/L,4℃保存。(6)限制性內(nèi)切酶:BglII、XhoI、HindIII(購(gòu)自TaKaRa公司)(7)T4連接酶(購(gòu)自TaKaRa)(8)DL-2000DNAmaker和DL-10000DNAmaker(購(gòu)自TaKaRa)(9)6×LoadingBuffer(購(gòu)自TaKaRa)(10)膽固醇(Cholesterol):醇溶,過(guò)濾除菌,儲(chǔ)存濃度為5mg/mL,4℃避光保存(天津市光復(fù)精細(xì)化工研究所)。(11)MgSO4:水溶,高溫高壓(121℃,20min)滅菌,儲(chǔ)存濃度為1mol/L,室溫保存。(12)S基礎(chǔ)液:NaCl0.585g,K2HPO40.1g,KH2PO40.6g,用蒸餾水 定容至100mL。(13)半飽和KCl溶液:向適量體積的蒸餾水中加入過(guò)量KCl,充分?jǐn)嚢瑁谷芤哼_(dá)到飽和狀態(tài),過(guò)濾上清,將濾液與蒸餾水按照1:1(v:v)的比例混勻,即為半飽和KCl溶液。(14)連二亞硫酸鈉:保險(xiǎn)粉,分子式:NaO2SSO2Na。(15)4%Na2CO3溶液:4gNa2CO3溶解于100mL蒸餾水中,室溫保存。(16)2%NaOH溶液:0.8gNaOH溶解于100mL蒸餾水中,室溫保存。(17)0.04mol/LCuSO4溶液:1g硫酸銅(CuSO4·5H2O)溶解于100ml蒸餾水中,室溫保存。(18)0.1mol/L酒石酸鉀溶液:2g酒石酸鉀溶解于100ml蒸餾水中,室溫保存。(19)Folin-Ciocalteu’s:福林酚試劑(生工生物工程(上海)股份有限公司)。(20)M9緩沖液:NaCl5g,Na2HPO46g,KH2PO43g,MgSO4·7H2O0.25g,用蒸餾水定容至1000mL。(21)堿性硫酸銅溶液:(A)將0.1mol/L酒石酸鉀溶液和0.04mol/LCuSO4溶液等體積混合均勻,(B)將4%Na2CO3溶液和2%NaOH溶液等體積混合均勻,然后將(A)液和(B)液按照50:1(v:v)的比例混合即可。現(xiàn)配現(xiàn)用。3.試劑盒(1)基因組提取試劑盒(購(gòu)自天根生化科技(北京)有限公司)(2)質(zhì)粒DNA小量提取試劑盒(PlasmidMiniKitI,TaKaRa)(3)DNA膠回收試劑盒(AgaroseGelDNAFragmentRecoveryKit,購(gòu)自TaKaRa)(4)總RNA提取試劑盒(RNAisoPlus,購(gòu)自TaKaRa)(5)反轉(zhuǎn)錄試劑盒(PrimeScriptTMRTreagentKit,購(gòu)自TaKaRa)(6)熒光實(shí)時(shí)定量PCR試劑盒(PremixExTaqTMII,購(gòu)自TaKaRa)4.培養(yǎng)基(1)NGM(NematodeGrowthMedium)培養(yǎng)基:配制如下(500mL):NaCl1.52gKH2PO48.52gK2HPO41.15g胰蛋白胨1.36g瓊脂粉8.58g配制方法:稱取上述物質(zhì)(除瓊脂粉之外)于錐形瓶中,加入500mL蒸餾水,使各組分充分溶解,再加入瓊脂粉。高溫高壓(121℃,20min)滅菌,分別加入1mol/L的MgSO4500μL,1mol/L的CaCl2500μL,5mg/mL的膽固醇500μL,充分搖勻,待瓶?jī)?nèi)泡沫消失后倒板。如需NGM(RNAi誘導(dǎo))培養(yǎng)基,在NGM培養(yǎng)基經(jīng)高溫高壓(121℃,20min)滅菌后,分別加入500μL1mol/L的MgSO4,500μL1mol/L的CaCl2,500μL5mg/mL的膽固醇,待培養(yǎng)基冷卻至60-70℃時(shí)加入100mg/mLAmp母液至終濃度為100μg/mL,25mg/mLTet母液至終濃度為5μg/mL,1mol/LIPTG母液至終濃度為0.1mmol/L,充分搖勻,待瓶?jī)?nèi)泡沫消失后倒板。(2)LB(Luria-Bertani)培養(yǎng)基:配置如下(50mL)NaCl0.50g胰蛋白胨0.50g酵母膏0.25g配制方法:稱取上述物質(zhì)于錐形瓶中,加入50mL蒸餾水,使各組分充分溶解,用1mol/L的NaOH調(diào)節(jié)pH至7.0,高溫高壓(121℃,20min)滅菌,4℃保存。如需LB固體培養(yǎng)基,按1.6-1.8%(w:v)的比例加入AgarPowder即可。如需LB(Amp+Tet)液體培養(yǎng)基,在LB液體培養(yǎng)基經(jīng)高溫高壓(121℃,20min)滅菌后,冷卻至60-70℃時(shí)加入100mg/mLAmp母液至終濃度為100μg/mL,25mg/mLTet母液至終濃度為5μg/mL。4℃保存。如需LB(Amp+Tet)固體培養(yǎng)基,在LB固體培養(yǎng)基經(jīng)高溫高壓(121℃,20min)滅菌后,冷卻至60-70℃時(shí)加入100mg/mLAmp母液至終濃度為100μg/mL,25mg/mLTet母液至終濃度為5μg/mL,充分搖勻,待瓶?jī)?nèi)泡沫消失后倒板。5.主要儀器超凈工作臺(tái)(蘇州凈化設(shè)備有限公司);高壓滅菌鍋(上海申安醫(yī)療器械廠);電子天平(北京賽多利斯儀器系統(tǒng)有限公司);臺(tái)式離心機(jī)(日立);恒溫培養(yǎng)搖床(上海一恒科技有限公司);微量移液器(Eppendorf);PCR儀(ABI公司);水平電泳儀(Bio-Rad公司);凝膠成像系統(tǒng)(GE公司);超純水儀(Millipore);恒溫金屬浴(北京鼎昊源科技有限公司);連續(xù)變倍體視顯微鏡(上海一恒科學(xué)儀器有限公司);紫外-可見分光光度計(jì)(上海精科);液態(tài)氧電極(Hansatech公司);熒光實(shí)時(shí)定量PCR儀(Bio-Rad公司);實(shí)施例1秀麗隱桿線蟲體內(nèi)活性氧水平失調(diào)動(dòng)物模型的建立1.線粒體呼吸鏈isp-1基因RNAi克隆菌的構(gòu)建(1)引物設(shè)計(jì)根據(jù)Wormbase數(shù)據(jù)庫(kù)中的相關(guān)序列信息設(shè)計(jì)合成isp-1基因的特異性的 引物。具體序列如下:表1目的基因片段擴(kuò)增引物isp-1基因的預(yù)期擴(kuò)增產(chǎn)物長(zhǎng)度為1074bp,其余為酶切位點(diǎn)。(2)秀麗隱桿線蟲基因組DNA的提取用基因組提取試劑盒提取秀麗隱桿線蟲基因組DNA。具體操作步驟詳見試劑盒說(shuō)明書。(3)isp-1基因片段的擴(kuò)增使用表1中的引物,利用PCR技術(shù)從秀麗隱桿線蟲基因組DNA中擴(kuò)增isp-1基因的片段。PCR反應(yīng)體系如下:表2擴(kuò)增isp-1基因片段的PCR反應(yīng)體系PCR的反應(yīng)程序如下:94℃3min;之后進(jìn)入PCR循環(huán),具體為:94℃30s,55℃30s,72℃1min,總共進(jìn)行30個(gè)cycles;72℃5min;4℃保存。1.0%的Agarosegel電泳鑒定PCR后得到的isp-1基因片段的純度和濃度。(4)isp-1基因片段的雙酶切使用BglII和XhoI限制性內(nèi)切酶對(duì)上一步驟中得到的isp-1基因片段進(jìn)行雙酶切。isp-1基因雙酶切體系如下:表3isp-1基因片段的雙酶切體系37℃進(jìn)行酶切2小時(shí),將雙酶切的產(chǎn)物進(jìn)行1.0%的Agarosegel電泳,再用DNA膠回收試劑盒(AgaroseGelDNAFragmentRecoveryKit,TaKaRa)回收酶切產(chǎn)物片段。(5)質(zhì)粒L4440的制備將帶有L4440質(zhì)粒的E.coliHT115(DE3)菌株在LB(Amp+Tet)固體培養(yǎng)基上劃線,37℃培養(yǎng)16h,挑取平板上培養(yǎng)出的單菌落于5mlLB(Amp+Tet)液體培養(yǎng)基中,37℃,220rpm,震蕩培養(yǎng)16h,用質(zhì)粒DNA小量提取試劑盒(PlasmidMiniKitI,TaKaRa)提取質(zhì)粒。將提取的pPD129.36(L4440)質(zhì)粒進(jìn)行雙酶切。isp-1基因?yàn)檫B接對(duì)象,雙酶切體系如下:表4與isp-1基因片段連接的質(zhì)粒L4440的雙酶切體系37℃進(jìn)行酶切2小時(shí),將雙酶切的產(chǎn)物進(jìn)行1.0%的Agarosegel電泳,用DNA膠回收試劑盒(AgaroseGelDNAFragmentRecoveryKit,TaKaRa)回收酶切產(chǎn)物中的目的基因片段。(6)isp-1基因片段和質(zhì)粒的連接通過(guò)1.0%的Agarosegel電泳鑒定質(zhì)粒和目的片段之間的摩爾數(shù)關(guān)系,雙酶切后回收的載體片段與回收的目的基因片段之間的摩爾數(shù)比以1:10為宜,然后在連接酶的作用下將載體與isp-1基因片段連接。連接體系如下:表5連接體系16℃連接4h即完成連接,得到連接產(chǎn)物。(7)E.coliHT115(DE3)感受態(tài)細(xì)胞的制備參照《精編分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)指南》,制備感受態(tài)細(xì)胞,具體操作如下:1、取HT115(DE3)菌液1.5ml于離心管中,4℃4000rpm離心5min,棄上清,重復(fù)此過(guò)程兩次。2、向留有沉淀的試管中加入預(yù)冷的0.1mol/L的CaCl2溶液800μL,清洗菌體,4℃4000rpm離心5min。3、徹底除去殘液,向試管內(nèi)加入預(yù)冷的0.1mol/L的CaCl2溶液200μl,懸浮菌體。即感受態(tài)細(xì)胞制備完成。(8)連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化E.coliHT115(DE3)、篩選陽(yáng)性克隆及其鑒定將10μL連接產(chǎn)物加入到200μL冰浴上放置的E.coliHT115(DE3)感受態(tài)細(xì)胞溶液中,42℃熱激90s,然后迅速冰浴2min。向試管中加入800μLLB液體培養(yǎng)基,37℃,150rpm復(fù)蘇1h,再將培養(yǎng)物涂到LB(Amp+Tet)固體平板上,37℃培養(yǎng)16h,之后挑單菌落于1mlLB液體(Amp+Tet)培養(yǎng)基中培養(yǎng),37℃,220rpm,振蕩培養(yǎng)5h,進(jìn)行菌液PCR鑒定。將得到的菌液進(jìn)行菌液PCR。PCR反應(yīng)體系如下:表6菌液PCR驗(yàn)證體系PCR的反應(yīng)程序如下:94℃5mim;之后進(jìn)入PCR循環(huán),具體為:94℃15s,55℃15s,72℃1min,總共進(jìn)行30個(gè)cycles;72℃15min;4℃保存。將上述鑒定的PCR陽(yáng)性克隆菌液用質(zhì)粒DNA小量提取試劑盒(PlasmidMiniKitI,TaKaRa)提取質(zhì)粒,然后對(duì)質(zhì)粒進(jìn)行雙酶切驗(yàn)證。不同基因陽(yáng)性克隆的質(zhì)粒使用不同的限制性內(nèi)切酶。isp-1基因酶切體系如下:表7經(jīng)菌液PCR鑒定的isp-1陽(yáng)性克隆的質(zhì)粒酶切驗(yàn)證體系1.0%Agarosegel電泳鑒定,分子量大小與理論推斷相符合,將樣品送出測(cè)序,經(jīng)blast在線比對(duì),結(jié)果表明測(cè)序結(jié)果與已知的isp-1序列一致。即證明RNAi克隆菌(L4440-isp-1-HT115)構(gòu)建完成。isp-1測(cè)序結(jié)果AGATATACGACTCCTATAGGGAGACCGGCAGATCTACGTCCAGAAGCGTCGTAGTGAGATCCGTGACAAGGGCAGTAATAACCTCCGTAATCTCCAGCATCGGCTGAAAATTCAAAATATGATTTCAAAAATTCAGGAGAAAAAAGACTGCATACCAATTGGGACACATCCAAGATGGGTGCACACTCCAATGACAACGGACCATTCATCTTTCTGCACACGTTCGTCGTCATGTTGTGGATGACGGAGATCGGCGACAGGGACGGCCTTTTCCTTGGCAATCTCAGCCTTGGTACGATGTTTGACGAAGACTGGCTTTCCACGCCATTCGAATGTCTTTGTTTTTCCTTCTGGAATATCAGCCATGTTGATTTCGATCGAAGCCAAGGCACGTTGATCAGCTGCCATAGCCTGGAAAAATTAATTTAAAAACGGTGTAATGGAAATTCAACATACTTTGTAAGAAACAAGAGTCTGTACAACTTCCTTTCCGGCCCACAAAGATAGAACTCCTCCAGCTGTAATAAAACAATGTTTAGACCGAATAAAAAATAATTCGAACCTCCATAATACAGAGCAGTTGGAAGAGCACGACGTTGATCCTCGGTGTCACGGGCTGGCACTTGAGTGTTCTTTGTAGAATCACGACGATAGTTTGACATATCGGGGAATGTCACATCAGTGTGAGCCAAACGGCGAGAGGTGACTTAAAAATTAATGAATTAATATATTAAATTCAATTTCAAATACCATTGATTCCCTTGACAGCAAGTCCATTGGTGAAGACACCTCCGGTGCTGTGACTAACAGCGGCTTGACGAGCTTCAGCCGTGGAGAACTCAGCTGGAACATCGCGGAAAGCAGCGACCTGGATACTAGACAATAAAATAATATTCTGCAACTTTAAATACTTACATTATCGGCGGCTGGTGTTGCGGCAACAAAGTTTACATGTTGCTGGGATCCGCTGATCTGAAAGAAAACTATTTATAAACTATTGGACAAATTTTAGAACTGTAATCGATATCTTAATCATTTCGACACCGTCCAGTGTTTTGGAACGAGAATAGTTTAAACAAATACATTTTAAACAAAATTTTCGAACCGCGCTCGAGGGGGGGCCCGGTACCCAATT CGCCCTAAAGTGGAGTCGAAT2.秀麗隱桿秀麗隱桿線蟲體內(nèi)活性氧水平失調(diào)動(dòng)物模型的建立(1)秀麗隱桿線蟲的同步化①挑選成熟的秀麗隱桿線蟲至裝有1mlM9液的2ml離心管中,4000rpm離心5分鐘,去上清;②向離心管中加入500μL1M氫氧化鈉,500μL6.4%(V/V)次氯酸鈉,震蕩裂解;③去掉上清,向沉淀中加入1.5μLM9液,搖勻,4000rpm離心5分鐘,重復(fù)該步驟三次;④向洗凈的卵中加入500μLM9液,18℃24小時(shí)孵化成L1期秀麗隱桿線蟲。(2)秀麗隱桿線蟲的RNAi處理使用NGM(RNAi誘導(dǎo))培養(yǎng)基,在培養(yǎng)基表面均勻涂布RNAi克隆菌(L4440-isp-1-HT115),37℃培養(yǎng)16h,然后將同步化的L1期N2秀麗隱桿線蟲定量接到涂有RNAi克隆菌的NGM(RNAi誘導(dǎo))平板上(秀麗隱桿線蟲以大腸桿菌作為唯一食物),20℃培養(yǎng)至成蟲,即得到體內(nèi)活性氧水平失調(diào)的動(dòng)物。(3)秀麗隱桿線蟲總RNA的提取收集經(jīng)RNAi處理的秀麗隱桿線蟲,用M9緩沖液清洗秀麗隱桿線蟲3次,盡量除去秀麗隱桿線蟲體壁附著的RNAi克隆菌。然后按照總RNA提取試劑盒(RNAisoPlus,TaKaRa)的說(shuō)明書提取秀麗隱桿線蟲的總RNA,取2μL所提的總RNA樣品,加2μLddH2O,1μL6×LoadingBuffer,共5μL加入點(diǎn)樣空,1.0%的Agarosegel電泳。將本步驟中驗(yàn)證的陽(yáng)性克隆樣品進(jìn)行測(cè)序。經(jīng)blast在線比對(duì),結(jié)果表明 測(cè)序結(jié)果與已知的isp-1序列一致。(4)cDNA的合成按照反轉(zhuǎn)錄試劑盒(PrimeScriptTMRTreagentKit,TaKaRa)的說(shuō)明書將(3)中提取的秀麗隱桿線蟲總RNA反轉(zhuǎn)錄為cDNA。共兩個(gè)反應(yīng),即去除基因組DNA反應(yīng)和反轉(zhuǎn)錄反應(yīng),反應(yīng)程序按照說(shuō)明書進(jìn)行。將得到的反轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物cDNA放在4℃保存。如需長(zhǎng)期保存,可放在-20℃。(5)引物設(shè)計(jì)通過(guò)Wormbase數(shù)據(jù)庫(kù)(www.wormbase.org)檢索C.elegans的isp-1及內(nèi)參β-actin基因的序列,用PrimerPremier5.0,根據(jù)引物設(shè)計(jì)原則,設(shè)計(jì)引物。所設(shè)計(jì)的引物序列見表8。表8實(shí)時(shí)熒光定量PCR基因擴(kuò)增引物(6)標(biāo)準(zhǔn)曲線和溶解曲線的驗(yàn)證將秀麗隱桿線蟲cDNA以10倍稀釋倍數(shù)稀釋六個(gè)濃度,10-1,10-2,10-3,10-4,10-5,10-6,并以這些梯度cDNA作為模板,用isp-1及β-actin的引物,做熒光實(shí)時(shí)定量PCR,得到對(duì)應(yīng)基因的標(biāo)準(zhǔn)曲線。反應(yīng)體系為:表9實(shí)時(shí)熒光定量PCR反應(yīng)體系實(shí)時(shí)熒光定量PCR反應(yīng)程序如下:1)STAGE1,95℃預(yù)變性2min2)STAGE2,95℃變性10s3)STAGE3,50℃退火30sSTAGE2和STAGE3循環(huán)38次,并檢測(cè)熒光;4)STAGE4,60℃升溫至95℃,每3s升溫0.5℃;分析溶解曲線,記錄熒光值;5)STAGE5,95℃10s6)STAGE6,60℃30s7)STAGE7,4℃∞結(jié)果表明:所有基因的擴(kuò)增效率均達(dá)到100%±10%,其標(biāo)準(zhǔn)曲線的R2值也達(dá)到了實(shí)驗(yàn)要求。isp-1及內(nèi)參基因β-actin的溶解曲線均為單一對(duì)稱峰,無(wú)引物二聚體,擴(kuò)增反應(yīng)特異性良好。(7)熒光實(shí)時(shí)定量PCR檢測(cè)對(duì)應(yīng)基因的表達(dá)量以(4)得到的cDNA為模板,熒光實(shí)時(shí)定量PCR檢測(cè)對(duì)應(yīng)基因的表達(dá)量。(8)isp-1基因的相對(duì)表達(dá)量以處理組的cDNA為模板進(jìn)行熒光實(shí)時(shí)定量PCR。β-actin作為內(nèi)參基因,2-△△Ct計(jì)算方法計(jì)算基因mRNA的相對(duì)表達(dá)量?!鳌鰿t法計(jì)算公式為:相對(duì)含量%=2-△△Ct△Ct=CT待測(cè)樣品-CT對(duì)照樣品△△Ct=△Ct靶基因-△Ct內(nèi)參基因利用熒光實(shí)時(shí)定量PCR的方法檢測(cè)秀麗隱桿線蟲isp-1基因RNAi的效率。秀麗隱桿線蟲RNAi空載體組為陰性對(duì)照組,isp-1基因表達(dá)量與喂食E.coliOP50的空白組秀麗隱桿線蟲相關(guān)基因表達(dá)量相比無(wú)明顯變化,這說(shuō)明飼喂帶有空載體L4440的E.coliHT115菌并不影響秀麗隱桿線蟲中isp-1的基因表達(dá)。從圖2中可以看出,isp-1基因被沉默之后,其mRNA的表達(dá)量只有陰性對(duì)照組的19.76%,干擾效率達(dá)到了80.24%。實(shí)施例2體內(nèi)活性氧水平失調(diào)動(dòng)物模型試劑盒的裝配本發(fā)明所述的體內(nèi)活性氧水平失調(diào)動(dòng)物模型試劑盒,所述試劑盒包括的材料為:①isp-1基因RNAi后的秀麗隱桿線蟲;②NGM培養(yǎng)基;③大腸桿菌OP50。其中,所述秀麗隱桿線蟲的濃度為100條/20μl,大腸桿菌OP50的濃度為10mg/ml。將以上試劑分裝于合適的容器中,放置到外包試劑盒中,其中M9緩沖液、S緩沖液、LB培養(yǎng)基詳細(xì)記載于使用說(shuō)明書中。實(shí)施例3秀麗隱桿線蟲體內(nèi)活性氧水平失調(diào)模型的驗(yàn)證1.秀麗隱桿線蟲mev-1基因RNAi后總活性氧含量的測(cè)定(1)秀麗隱桿線蟲體內(nèi)總活性氧含量的檢測(cè)取實(shí)施例1構(gòu)建的體內(nèi)活性氧水平失調(diào)的動(dòng)物模型,用M9緩沖液清洗秀麗隱桿線蟲3次,盡量洗去秀麗隱桿線蟲蟲體上的RNAi克隆菌。將每個(gè)處理組的秀麗隱桿線蟲用S基礎(chǔ)液進(jìn)行稀釋,使每20μL中含有25條秀麗隱桿線蟲,將每個(gè)處理組的稀釋好的秀麗隱桿線蟲液準(zhǔn)確轉(zhuǎn)移至底透384微孔板中,每個(gè) 孔加40μL秀麗隱桿線蟲液,每個(gè)處理組做3個(gè)復(fù)孔,然后在避光條件下加活性氧熒光染料H2DCF-DA,染料濃度為50mmol/L,每個(gè)孔準(zhǔn)確加入10μL。暗室反應(yīng)15min后,用熒光酶標(biāo)儀檢測(cè)每個(gè)孔的熒光強(qiáng)度,激發(fā)波長(zhǎng)為504nm,發(fā)射波長(zhǎng)為529nm,檢測(cè)溫度為28℃。秀麗隱桿線蟲RNAi空載體組為陰性對(duì)照組,按上面方法做同樣處理,測(cè)定總活性氧含量。(2)秀麗隱桿線蟲isp-1基因RNAi后體內(nèi)總活性氧含量的變化用ROS熒光探針H2DCF-DA檢測(cè)秀麗隱桿線蟲體內(nèi)總活性氧含量的變化,結(jié)果如圖3所示:isp-1基因被干擾之后,秀麗隱桿線蟲體內(nèi)活性氧含量顯著降低(p<0.05)。實(shí)施例4體內(nèi)活性氧水平失調(diào)動(dòng)物模型試劑盒的使用方法和可靠性驗(yàn)證體內(nèi)活性氧水平失調(diào)相關(guān)疾病研究的一個(gè)重要內(nèi)容是篩選出能夠回調(diào)體內(nèi)活性氧水平的新化合物,這些化合物具有成為治療體內(nèi)活性氧水平失調(diào)相關(guān)疾病的潛力。本實(shí)施例就驗(yàn)證了體內(nèi)活性氧水平失調(diào)動(dòng)物模型試劑盒在這方面的應(yīng)用。本實(shí)施例以抗氧化劑N-乙酰-L-半胱氨酸、氧化劑百草枯作為供試樣品驗(yàn)證體內(nèi)活性氧水平失調(diào)動(dòng)物模型試劑盒的可靠性。1.試劑1)抗氧化劑:N-乙酰-L-半胱氨酸(N-Acetyl-L-cysteine,NAC):水溶,過(guò)濾除菌,儲(chǔ)存濃度為1mol/L,-20℃避光保存(購(gòu)自梯希愛(上海)化成工業(yè)發(fā)展有限公司)。2)氧化劑:百草枯(Paraquat,PQ):水溶,過(guò)濾除菌,儲(chǔ)存濃度為50mmol/L,-20℃避光保存(購(gòu)自Sigma公司)。1.實(shí)驗(yàn)方法:(1)PQ及NAC對(duì)RNAi后秀麗隱桿線蟲壽命的影響將isp-1基因RNAi后的秀麗隱桿線蟲用鎳鉻絲挑針?lè)謩e轉(zhuǎn)移到NGM(0.1mmol/LPQ),NGM(0.5mmol/LPQ),NGM(0.4mmol/LNAC),NGM(2.0mmol/LNAC)和NGM培養(yǎng)基上,不含有待測(cè)化合物的NGM培養(yǎng)基平板作為空白對(duì)照組,每塊平板上接種25條isp-1基因RNAi后的秀麗隱桿線蟲,待測(cè)化合物組與空白對(duì)照組均設(shè)置3個(gè)平行,每天計(jì)數(shù)待測(cè)化合物組與空白對(duì)照組的秀麗隱桿線蟲的存活條數(shù),直至平板上所有的秀麗隱桿線蟲全部死亡,計(jì)算待測(cè)化合物組與空白對(duì)照組中秀麗隱桿線蟲的壽命。為防止世代交替,在線蟲產(chǎn)卵期期間每隔一天將秀麗隱桿線蟲挑到新的處理板上。計(jì)算待測(cè)化合物組與空白對(duì)照組中秀麗隱桿線蟲的壽命。同時(shí)設(shè)定L4440組,L4440組接入的秀麗隱桿線蟲為轉(zhuǎn)入空載體L4400(不含有isp-1基因片段)的N2秀麗隱桿線蟲,將含有空載體L4400的N2秀麗隱桿線蟲接入到NGM培養(yǎng)基(不含有待測(cè)物)上,其他操作同上。用SPSS軟件進(jìn)行Kaplan-Meier壽命分析,抗氧化劑NAC對(duì)isp-1RNAi后線蟲的壽命無(wú)顯著影響(p>0.05);氧化劑PQ可使isp-1RNAi秀麗隱桿線蟲的壽命顯著延長(zhǎng)(p<0.05),兩兩比較(PairwiseComparisons)比較結(jié)果如下:表10PQ處理isp-1基因RNAi后秀麗隱桿線蟲壽命結(jié)果兩兩比較L4440isp-1RNAiisp-1RNAi+0.1PQisp-1RNAi+0.5PQL4440isp-1RNAip=0.035isp-1RNAi+0.1PQp=0.000p=0.022isp-1RNAi+0.5PQp=0.000p=0.005p=0.925從表10中可以看出,isp-1RNAi處理組秀麗隱桿線蟲的壽命明顯大于L4440組,該結(jié)果與已有文獻(xiàn)中的報(bào)道相符合。用PQ處理isp-1RNAi后的秀麗隱桿線蟲,秀麗隱桿線蟲的壽命相比isp-1RNAi處理組顯著延長(zhǎng)(p<0.05),在一定濃度范圍內(nèi),這種作用與PQ的濃度呈現(xiàn)正相關(guān)。秀麗隱桿線蟲經(jīng)過(guò)isp-1RNAi處理之后,其中位生存時(shí)間和平均壽命都有所增加;PQ(0.1mmol/L和0.5mmol/L)能進(jìn)一步延長(zhǎng)isp-1RNAi秀麗隱桿線蟲的中位生存時(shí)間和平均壽命。如表11所示,PQ(0.1mmol/L)使isp-1RNAi秀麗隱桿線蟲的中位生存時(shí)間和平均壽命延長(zhǎng)了30.0%和23.8%;PQ(0.5mmol/L)使isp-1RNAi線蟲的中位生存時(shí)間和平均壽命大約延長(zhǎng)了40.0%和29.7%。表11PQ作用isp-1基因RNAi秀麗隱桿線蟲后壽命的中位生存時(shí)間和平均壽命組別中位生存時(shí)間平均壽命L44408.0±0.98.2±0.5isp-1RNAi10.0±1.210.1±0.7isp-1RNAi+0.1PQ13.0±0.912.5±0.8A%130.0123.8isp-1RNAi+0.5PQ14.0±0.813.1±0.7B%140.0129.7A%=(isp-1RNAi+0.1PQ)/isp-1RNAi;B%=(isp-1RNAi+0.5PQ)/isp-1RNAi(2)PQ及NAC對(duì)RNAi后秀麗隱桿線蟲運(yùn)動(dòng)能力的影響將經(jīng)過(guò)isp-1RNAi處理的N2成蟲用鎳鉻絲挑針?lè)謩e轉(zhuǎn)移到NGM(0.1mmol/LPQ),NGM(0.5mmol/LPQ),NGM(0.4mmol/LNAC),NGM(2.0mmol/LNAC)和NGM培養(yǎng)基上,計(jì)數(shù)10日齡成蟲的運(yùn)動(dòng)能力。運(yùn)動(dòng)能力的評(píng)價(jià)分為MotionA和MotionB兩個(gè)等級(jí),其中MotionA為線蟲表現(xiàn)非常活躍,運(yùn)動(dòng) 軌跡呈正常的正弦曲線;MotionB為線蟲在培養(yǎng)基上行動(dòng)緩慢,用鎳鉻絲輕觸線蟲身體,線蟲只是頭部擺動(dòng)。從圖6和圖7中可以看出,isp-1基因被干擾的線蟲與L4440對(duì)照組相比,其運(yùn)動(dòng)能力傾向于正常。用PQ(0.1mmol/L和0.5mmol/L)處理干擾后的線蟲,發(fā)現(xiàn)其運(yùn)動(dòng)能力相對(duì)干擾組的線蟲傾向于提高。用NAC處理isp-1基因被干擾的線蟲,各處理組之間沒(méi)有明顯變化,但是隨著NAC濃度的升高,isp-1基因被干擾的線蟲的運(yùn)動(dòng)能力有減弱的趨勢(shì)。(3)PQ及NAC對(duì)RNAi后秀麗隱桿線蟲抗熱脅迫能力的影響將經(jīng)過(guò)isp-1RNAi處理的N2成蟲用鎳鉻絲挑針?lè)謩e轉(zhuǎn)移到NGM(0.1mmol/LPQ),NGM(0.5mmol/LPQ),NGM(0.4mmol/LNAC),NGM(2.0mmol/LNAC)和NGM培養(yǎng)基上,3天之后將線蟲轉(zhuǎn)移至35℃,8小時(shí)之后,每隔半小時(shí)觀察對(duì)照組線蟲的存活率,當(dāng)對(duì)照組線蟲的死亡率大于50%時(shí),開始計(jì)數(shù)其他所有組別線蟲的死亡率。每個(gè)處理組設(shè)3個(gè)平行,每個(gè)平行統(tǒng)計(jì)30條線蟲。實(shí)驗(yàn)過(guò)程中,isp-1RNAi各處理組線蟲的熱脅迫時(shí)間為16.5h,此時(shí)L4440對(duì)照組的線蟲已全部死亡,所以在圖5中沒(méi)有顯示L4440對(duì)照組的結(jié)果。如圖8和圖9所示,PQ對(duì)isp-1基因被干擾的秀麗隱桿線蟲抗熱脅迫能力沒(méi)有顯著影響(p>0.05),而高濃度的NAC對(duì)isp-1基因被干擾的秀麗隱桿線蟲抗熱脅迫能力產(chǎn)生負(fù)影響。用PQ處理之后,發(fā)現(xiàn)線蟲的壽命比空白對(duì)照組有所延長(zhǎng),在一定濃度范圍內(nèi),線蟲的壽命與PQ濃度成正相關(guān),線蟲第十天運(yùn)動(dòng)能力在PQ的作用下相比對(duì)照組也有增強(qiáng)的趨勢(shì),抗熱脅迫能力也有所改進(jìn)。用NAC處理之后,發(fā)現(xiàn)線蟲的壽命相比對(duì)照組無(wú)明顯變化,第十天運(yùn)動(dòng)能力隨NAC濃度的升高有減弱的趨勢(shì)。實(shí)驗(yàn)結(jié)果驗(yàn)證了PQ對(duì)體內(nèi)活性氧水平異常的治療效果,同時(shí)也證明了本發(fā)明公開的試劑盒的可靠性,能夠用于篩選治療體內(nèi)活性氧水平失調(diào)相關(guān)疾病的藥物。當(dāng)前第1頁(yè)1 2 3