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一種基于評論文本信息增強(qiáng)的藥物不良反應(yīng)預(yù)測方法

文檔序號:40444502發(fā)布日期:2024-12-24 15:18閱讀:來源:國知局

技術(shù)特征:

1.一種基于評論文本信息增強(qiáng)的藥物不良反應(yīng)預(yù)測方法,其特征在于,包括以下步驟:

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種基于評論文本信息增強(qiáng)的藥物不良反應(yīng)預(yù)測方法,其特征在于:步驟2中以藥物評論網(wǎng)站中數(shù)據(jù)集中的藥物的評論為采集對象,采集到的信息包括評論文本以及評論者的性別、年齡、患病情況、用藥時長。

3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種基于評論文本信息增強(qiáng)的藥物不良反應(yīng)預(yù)測方法,其特征在于,步驟5的①中,計算公式如下:

4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種基于評論文本信息增強(qiáng)的藥物不良反應(yīng)預(yù)測方法,其特征在于,步驟5的①中,患者特征信息也作為藥物相似度計算依據(jù)之一,處理性別、年齡、患病情況、用藥時長數(shù)據(jù)的缺失值和異常值,將性別作為數(shù)值型變量使用,對用藥時長、年齡進(jìn)行分區(qū)方式轉(zhuǎn)換為分類變量,患病情況或病種根據(jù)疾病類型進(jìn)行分類,對以上特征類型使用獨熱編碼,并對患病情況使用word2vec進(jìn)行特征構(gòu)造,將所有特征,包括獨熱編碼的特征和word2vec生成的特征,拼接起來,形成一個患者的特征向量,多個患者的特征形成一個特征矩陣,特征矩陣經(jīng)過降維技術(shù)轉(zhuǎn)換為一個一維向量,代表一種藥物的患者特征;根據(jù)余弦相似度計算藥物基于患者特征的相似度,得到藥物基于患者特征的相似度矩陣。

5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的一種基于評論文本信息增強(qiáng)的藥物不良反應(yīng)預(yù)測方法,其特征在于,

6.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種基于評論文本信息增強(qiáng)的藥物不良反應(yīng)預(yù)測方法,其特征在于,步驟5的②中,計算公式如下:

7.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種基于評論文本信息增強(qiáng)的藥物不良反應(yīng)預(yù)測方法,其特征在于,步驟6中異構(gòu)圖g表示為:

8.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種基于評論文本信息增強(qiáng)的藥物不良反應(yīng)預(yù)測方法,其特征在于,步驟7中編碼器層數(shù)為2,為了充分利用藥物和不良反應(yīng)節(jié)點的嵌入,自適應(yīng)地動態(tài)調(diào)整不同gcn層的重要性權(quán)重,在節(jié)點特征表示過程中加入注意力機(jī)制。

9.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種基于評論文本信息增強(qiáng)的藥物不良反應(yīng)預(yù)測方法,其特征在于,步驟8中評價指標(biāo)計算公式如下所示:


技術(shù)總結(jié)
本發(fā)明涉及生物信息學(xué)技術(shù)領(lǐng)域,公開了一種基于評論文本信息增強(qiáng)的藥物不良反應(yīng)預(yù)測方法,包括以下步驟:藥物不良反應(yīng)詞典的構(gòu)建;基于評論文本的藥物不良反應(yīng)信息的提取;藥物不良反應(yīng)信息的整合;公共數(shù)據(jù)庫藥物特征信息的整合;相似度計算;異構(gòu)圖的構(gòu)建;圖卷積網(wǎng)絡(luò)模型的搭建;模型訓(xùn)練與評估;藥物的不良反應(yīng)案例預(yù)測;藥物不良反應(yīng)發(fā)生機(jī)制分析。本發(fā)明采用上述的一種基于評論文本信息增強(qiáng)的藥物不良反應(yīng)預(yù)測方法,綜合利用藥物評論、臨床試驗數(shù)據(jù)、實際用藥經(jīng)驗和反饋等多樣化的數(shù)據(jù),添加患者特征豐富藥物及不良反應(yīng)之間的關(guān)系,提供了更加全面的藥物安全性評估,另外GCN模型相較于其他模型,訓(xùn)練與預(yù)測更為快速,可以減輕計算難度。

技術(shù)研發(fā)人員:邰楊芳,姬航琦,趙燕凌,吳娟
受保護(hù)的技術(shù)使用者:山西醫(yī)科大學(xué)
技術(shù)研發(fā)日:
技術(shù)公布日:2024/12/23
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