本公開的實(shí)施方案通常涉及用于檢測和/或量化分析物的計(jì)算機(jī)實(shí)現(xiàn)的方法，并且更具體地，涉及通過免疫測定方法檢測和/或定量分析物。

背景技術(shù)：

1、免疫測定實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)技術(shù)通常利用經(jīng)驗(yàn)檢驗(yàn)方法來識(shí)別最佳參數(shù)并故障排除問題。這些經(jīng)驗(yàn)方法(例如試錯(cuò)試驗(yàn))在時(shí)間和資源方面可能效率較低。例如，一些免疫測定方法(諸如免疫印跡方法或蛋白質(zhì)印跡方法)由于預(yù)優(yōu)化的局限性并不易于擴(kuò)展，并且當(dāng)引入多變量優(yōu)化時(shí)，優(yōu)化測定很快變得更加復(fù)雜和耗時(shí)。

2、優(yōu)化免疫測定性能的關(guān)鍵因素在于確定最佳試劑和實(shí)驗(yàn)參數(shù)，以確保免疫測定中的檢測成功。試劑的選擇，連同分析物或蛋白質(zhì)濃度和抗體稀釋度都是確保免疫測定實(shí)驗(yàn)中的檢測成功的考慮因素。這些最佳變量值通常以實(shí)驗(yàn)方式確定。

3、盡管優(yōu)化技術(shù)(例如使用基于最佳猜測的經(jīng)驗(yàn)值和/或測試單個(gè)實(shí)驗(yàn)的一系列值)非常耗費(fèi)時(shí)間并且成本高昂，但它們在蛋白質(zhì)印跡實(shí)驗(yàn)和涉及成像器和印跡裝置等儀器的工作流程中尤其常見，例如但不限于ibright?fl1500tm、iblottm和化學(xué)發(fā)光檢測技術(shù)。

4、其他因素(例如，基于分析物豐度、抗體結(jié)合變化和選擇敏感性檢測底物的免疫測定參數(shù)的優(yōu)化)可對實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)造成干擾，并導(dǎo)致誤導(dǎo)性數(shù)據(jù)、錯(cuò)誤和客戶不滿。此外，由于在建立和執(zhí)行免疫測定時(shí)蛋白質(zhì)制備、蛋白質(zhì)形式和實(shí)驗(yàn)參數(shù)的變量發(fā)生變化，在檢測分析物時(shí)也可能會(huì)造成干擾。

技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路

1、本公開的實(shí)施方案涉及用于檢測諸如免疫測定等的測定中的一個(gè)或多個(gè)分析物的計(jì)算機(jī)實(shí)現(xiàn)的系統(tǒng)和方法。本公開的實(shí)施方案系統(tǒng)和方法可使用關(guān)于分析物的免疫測定參考數(shù)據(jù)來訓(xùn)練機(jī)器學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò)，并輸出一組目標(biāo)實(shí)驗(yàn)輸入?yún)?shù)以檢測該分析物。機(jī)器學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò)可利用所接收到的數(shù)據(jù)來生成目標(biāo)參數(shù)，并且開發(fā)或生成免疫測定參數(shù)集以檢測和/或定量分析物。本公開的計(jì)算機(jī)實(shí)現(xiàn)的系統(tǒng)和方法還可生成用于免疫測定的故障排除輔助輸出。

2、實(shí)施方案涉及用于生成和輸出目標(biāo)參數(shù)(例如但不限于目標(biāo)實(shí)驗(yàn)輸入?yún)?shù))以實(shí)現(xiàn)免疫測定，和/或用于檢測免疫測定中的一個(gè)或多個(gè)分析物，和/或用于操作一個(gè)或多個(gè)免疫測定支持系統(tǒng)和設(shè)備的計(jì)算機(jī)實(shí)現(xiàn)的系統(tǒng)和方法。在一些實(shí)施方案中，生成和輸出目標(biāo)實(shí)驗(yàn)輸入?yún)?shù)是為了改進(jìn)或優(yōu)化通過免疫測定對分析物的檢測。一些實(shí)施方案利用半自動(dòng)化方法從標(biāo)準(zhǔn)免疫印跡數(shù)據(jù)中提取數(shù)據(jù)，使用經(jīng)驗(yàn)證的免疫印跡數(shù)據(jù)來訓(xùn)練機(jī)器學(xué)習(xí)模型，并且應(yīng)用參考數(shù)據(jù)集來生成和/或輸出和/或預(yù)測用于免疫測定的目標(biāo)實(shí)驗(yàn)參數(shù)。目標(biāo)參數(shù)可包括輸入變量，例如實(shí)驗(yàn)輸入變量(諸如樣品濃度、蛋白質(zhì)濃度、檢測試劑和目標(biāo)負(fù)載濃度等)。目標(biāo)負(fù)載濃度可有助于實(shí)現(xiàn)所期望的結(jié)果，并且可基于相對于樣品(例如包括一個(gè)或多個(gè)分析物的樣品，疑似包括一個(gè)或多個(gè)分析物的樣品)、特定分析物等產(chǎn)生的實(shí)驗(yàn)類型。

3、在一些實(shí)施方案中，用于檢測測定(例如免疫測定)中的一個(gè)或多個(gè)分析物的系統(tǒng)和方法，該方法包括：使用免疫測定參考數(shù)據(jù)來訓(xùn)練機(jī)器學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò)，該免疫測定參考數(shù)據(jù)包括多組參考輸入?yún)?shù)和對應(yīng)的參考分析物檢測數(shù)據(jù)；接收一組實(shí)驗(yàn)輸入?yún)?shù)，其中該實(shí)驗(yàn)輸入?yún)?shù)包括分析物的標(biāo)識(shí)符；將該機(jī)器學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò)應(yīng)用于該免疫測定參考數(shù)據(jù)以基于該分析物識(shí)別目標(biāo)參數(shù)；基于該目標(biāo)參數(shù)確定免疫測定參數(shù)集，其中該免疫測定參數(shù)集包括該分析物中的至少一種分析物的負(fù)載濃度和檢測試劑。

4、在各個(gè)實(shí)施方案中，參考數(shù)據(jù)集包括來自大量抗體驗(yàn)證數(shù)據(jù)集的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)。在一些示例中，大規(guī)模數(shù)據(jù)集可跨越大量細(xì)胞和組織集上的25000多個(gè)數(shù)據(jù)點(diǎn)。此類數(shù)據(jù)可手動(dòng)創(chuàng)建，并且包括所分類的數(shù)據(jù)，所分類的數(shù)據(jù)展示了從細(xì)胞或組織裂解物中檢測蛋白質(zhì)的各種負(fù)載濃度，檢測試劑和抗體親和性。

5、實(shí)施方案可進(jìn)一步利用機(jī)器學(xué)習(xí)和統(tǒng)計(jì)學(xué)習(xí)模型來生成和輸出目標(biāo)參數(shù)和/或指導(dǎo)用戶進(jìn)行目標(biāo)負(fù)載和試劑選擇。因此，結(jié)果可提供對因果變量的深入了解，以優(yōu)化免疫測定性能，并且生成針對試劑選擇、阻斷劑、稀釋度范圍的推薦，其中該稀釋度范圍可包括樣品稀釋度范圍、抗體稀釋度范圍和試劑稀釋度范圍，例如蛋白質(zhì)載量和檢測試劑等。

6、機(jī)器學(xué)習(xí)模型的實(shí)施方案可獨(dú)特地將細(xì)胞和組織蛋白質(zhì)豐度的關(guān)鍵參考數(shù)據(jù)(例如樣品類型的豐度)與一系列免疫測定的實(shí)驗(yàn)性能數(shù)據(jù)的訓(xùn)練數(shù)據(jù)集結(jié)合到一起，并且進(jìn)一步利用來自多個(gè)克隆性和物種特異性主鏈的抗體的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)。這些技術(shù)還可利用具有目標(biāo)結(jié)合親和性、負(fù)載值、多個(gè)檢測敏感度和細(xì)胞系的數(shù)據(jù)集來導(dǎo)出輸出值(諸如每個(gè)蛋白質(zhì)豐度值的結(jié)合變化等)等。

7、這些技術(shù)可應(yīng)用于臨床、研究、學(xué)術(shù)或診斷環(huán)境等。在各個(gè)實(shí)施方案中，系統(tǒng)和方法可在具有圖形用戶界面的計(jì)算裝置上執(zhí)行，例如網(wǎng)絡(luò)工具、應(yīng)用程序或其他顯示器。此類實(shí)現(xiàn)方式可執(zhí)行以下中的一者或多者：用于單重測定的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)工具和推薦器、解決問題功能、實(shí)驗(yàn)工具上的功能擴(kuò)展、用戶云賬戶、故障排除模塊、優(yōu)化模塊、用于多重設(shè)計(jì)的許可的可執(zhí)行程序、具有儀器控制的功能以及用于多重測定的分析軟件。實(shí)現(xiàn)方式可還包括自動(dòng)化接口，該自動(dòng)化接可模擬免疫測定實(shí)驗(yàn)的檢測，并且分析理論實(shí)驗(yàn)輸出。

8、因此，本公開的系統(tǒng)和方法可向最終用戶提供關(guān)于目標(biāo)分析物檢測和定量的目標(biāo)實(shí)驗(yàn)參數(shù)的信息。示例性分析物包括但不限于半抗原、激素、核酸、肽、經(jīng)修飾的肽、蛋白質(zhì)或前述分析物的任何一個(gè)分析物的經(jīng)修飾的形式。用于定量蛋白質(zhì)檢測設(shè)計(jì)的工具可為自動(dòng)化工具，并且根據(jù)其他實(shí)施方案可確定用于非飽和信號(hào)的蛋白質(zhì)裂解物的目標(biāo)負(fù)載值。用于目標(biāo)實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)的各種計(jì)算選擇方案可包括實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)選擇符和用于細(xì)胞系選擇的代碼。

9、所公開的技術(shù)的附加優(yōu)點(diǎn)和方面包括通過軟件接口向最終用戶通知用于檢測和定量免疫印跡測定(例如蛋白質(zhì)印跡測定)中的蛋白質(zhì)的目標(biāo)蛋白質(zhì)載量。輸出可通知檢測的范圍，以提供關(guān)于抗體濃度和檢測試劑選擇的推薦，以實(shí)現(xiàn)蛋白質(zhì)的最佳檢測，例如目標(biāo)范圍內(nèi)的檢測。在實(shí)施方案中，目標(biāo)范圍可基于一個(gè)或多個(gè)因素來定義，包括但不限于用戶選擇、實(shí)現(xiàn)特定結(jié)果的范圍(例如可見性、識(shí)別或分析物)，或者其他明確的標(biāo)準(zhǔn)。因此，這些工具可告知用戶在免疫測定中選擇和設(shè)計(jì)多重蛋白質(zhì)檢測的最佳變量，并有助于實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)、優(yōu)化和故障排除。

10、所公開的技術(shù)的實(shí)施方案還包括手動(dòng)和自動(dòng)圖像分析工具，以從免疫測定和免疫印跡數(shù)據(jù)中提取蛋白質(zhì)檢測值。此類實(shí)施方案可將蛋白質(zhì)檢測匹配到蛋白質(zhì)豐度或轉(zhuǎn)錄物豐度的參考值。系統(tǒng)可應(yīng)用方法來清理和擬合數(shù)據(jù)，以排除關(guān)于蛋白質(zhì)不穩(wěn)定性的異常數(shù)據(jù)，并對一系列細(xì)胞系中的變量數(shù)據(jù)(例如抗體克隆性、檢測敏感性、負(fù)載濃度和蛋白質(zhì)豐度)進(jìn)行分類。可使用一個(gè)或多個(gè)統(tǒng)計(jì)模型、機(jī)器學(xué)習(xí)模型或它們的組合對數(shù)據(jù)集進(jìn)行建模、訓(xùn)練和測試。

11、在特定示例中，所公開的技術(shù)的實(shí)施方案可從標(biāo)準(zhǔn)免疫印跡實(shí)驗(yàn)(例如蛋白質(zhì)印跡)中提取蛋白質(zhì)檢測信息。實(shí)施方案可對蛋白質(zhì)豐度、克隆性、檢測進(jìn)行建模，并選擇多重蛋白質(zhì)檢測和目標(biāo)負(fù)載檢測值。

12、一種用于免疫測定中的分析物檢測的計(jì)算機(jī)實(shí)現(xiàn)的方法，該方法可包括：接收包括多組參考輸入?yún)?shù)和對應(yīng)的參考分析物檢測數(shù)據(jù)的免疫測定參考數(shù)據(jù)；接收一組實(shí)驗(yàn)輸入?yún)?shù)，其中該實(shí)驗(yàn)輸入?yún)?shù)包括分析物；將機(jī)器學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò)應(yīng)用于免疫測定參考數(shù)據(jù)以基于該分析物識(shí)別目標(biāo)參數(shù)；并且基于該目標(biāo)參數(shù)確定免疫測定參數(shù)集，其中該輸出免疫測定參數(shù)集包括分析物中的至少一個(gè)分析物的負(fù)載濃度和檢測試劑。在一些實(shí)施方案中，該分析物中的至少一個(gè)分析物的負(fù)載濃度包括包含該分析物的樣品的負(fù)載濃度。在一些實(shí)施方案中，該分析物中的至少一個(gè)分析物的負(fù)載濃度包括包含該分析物的樣品的負(fù)載濃度，其中該樣品可位于樣品緩沖液中。在一些實(shí)施方案中，該分析物中的至少一個(gè)分析物的負(fù)載濃度包括緩沖液或溶液或混合物中包含的該分析物的負(fù)載濃度。

13、在各個(gè)實(shí)施方案中，免疫測定參考數(shù)據(jù)包括蛋白質(zhì)印跡數(shù)據(jù)、多重蛋白質(zhì)印跡捕獲、定量數(shù)據(jù)、任選地表示蛋白質(zhì)相對豐度的該定量數(shù)據(jù)、分類數(shù)據(jù)、蛋白質(zhì)檢測數(shù)據(jù)和免疫細(xì)胞術(shù)數(shù)據(jù)中的至少一個(gè)數(shù)據(jù)。

14、訓(xùn)練輸入?yún)?shù)可包括以下中的一者或多者：用戶輸入、分析物類型、蛋白質(zhì)類型、克隆性、細(xì)胞系、檢測試劑、抗體濃度、底物、底物敏感性、檢測敏感性、裂解物濃度、細(xì)胞系，一組蛋白質(zhì)、抗體結(jié)合變化、阻斷數(shù)據(jù)、細(xì)胞裂解物制備數(shù)據(jù)、蛋白質(zhì)不穩(wěn)定性、蛋白質(zhì)穩(wěn)定性、凝膠參數(shù)(例如，凝膠組成、凝膠孔隙率等)、分析物質(zhì)量范圍、蛋白質(zhì)質(zhì)量范圍、細(xì)胞系、檢測數(shù)據(jù)、裂解物類型、裂解物負(fù)載濃度、蛋白質(zhì)、蛋白質(zhì)同種型、蛋白質(zhì)或轉(zhuǎn)譯后經(jīng)修飾的蛋白質(zhì)的片段、抗體結(jié)合位點(diǎn)、抗體克隆性、抗體濃度/稀釋度、結(jié)合親和性、抗體同種型特異性、主鏈類型、蛋白質(zhì)穩(wěn)定性、蛋白質(zhì)不穩(wěn)定性、檢測標(biāo)記、酶、檢測多重性或檢測敏感性。在實(shí)施方案中，訓(xùn)練輸入?yún)?shù)可包括用戶輸入。例如，在單重實(shí)驗(yàn)中，訓(xùn)練輸入可包括蛋白質(zhì)種類、細(xì)胞系、裂解物濃度和抗體稀釋度。在多重實(shí)驗(yàn)和故障排除實(shí)驗(yàn)中，訓(xùn)練輸入可包括指示變量(例如一組蛋白質(zhì))的用戶輸入。在建模操作中，訓(xùn)練輸入可包括變量的一組范圍。變量可涉及與實(shí)驗(yàn)相關(guān)一個(gè)或多個(gè)參數(shù)、所需的輸入或輸出以及與免疫測定實(shí)驗(yàn)或設(shè)備相關(guān)的其他信息。

15、免疫測定參數(shù)集可指示用于執(zhí)行免疫測定實(shí)驗(yàn)的一個(gè)或多個(gè)變量、設(shè)置和實(shí)驗(yàn)輸入的輸出或預(yù)測或生成。免疫測定參數(shù)集可包括以下中的一者和多者：例如細(xì)胞系、分析物負(fù)載范圍、目標(biāo)蛋白質(zhì)、檢測數(shù)據(jù)、裂解物類型、裂解物負(fù)載濃度、抗體克隆性、抗體類型、抗體結(jié)合位點(diǎn)、抗體稀釋度范圍、樣品稀釋度范圍、試劑稀釋度范圍、結(jié)合親和性、抗體同種型特異性、主鏈類型、蛋白質(zhì)穩(wěn)定性、蛋白質(zhì)不穩(wěn)定性、檢測標(biāo)記、酶、檢測試劑、檢測多重性、檢測敏感性、該分析物中的至少一個(gè)分析物的負(fù)載濃度的目標(biāo)范圍，其中在一些實(shí)施方案中，該分析物包含在樣品中，和/或包含在緩沖液、樣品緩沖液、溶液和/或混合物中，克隆性、抗體類型、檢測試劑、免疫測定性能預(yù)測、推薦的蛋白質(zhì)來源、最佳細(xì)胞系、細(xì)胞來源、抗體克隆性、檢測技術(shù)、克隆性推薦，抗體推薦、分析物推薦、分析物的來源推薦、凝膠類型、生成或輸出或推薦的檢測試劑、抗體類型、抗體負(fù)載濃度/稀釋度、蛋白質(zhì)裂解物濃度、目標(biāo)細(xì)胞系、目標(biāo)蛋白質(zhì)來源、分析物質(zhì)量、轉(zhuǎn)移條件、驗(yàn)證標(biāo)志和預(yù)測的分析物定位。在實(shí)施方案中，分析物可位于一些位置中，例如分析物可從細(xì)胞中分泌；分析物存在于細(xì)胞外液中；分析物重組地表達(dá)并靶向非原生部位；分析物以細(xì)胞內(nèi)方式存在于一個(gè)或多個(gè)細(xì)胞隔室中；在生物化學(xué)上進(jìn)行分級(jí)，和/或解析生物物理/生物化學(xué)特性(例如在蛋白質(zhì)印跡或等電聚焦中)

16、一種用于檢測免疫測定中的一個(gè)或多個(gè)分析物的系統(tǒng)，該系統(tǒng)包括：至少一個(gè)計(jì)算裝置，該計(jì)算裝置包括處理器和至少一個(gè)存儲(chǔ)器，該至少一個(gè)存儲(chǔ)器存儲(chǔ)指令，該指令在由所述處理器執(zhí)行時(shí)使得該計(jì)算裝置：接收包括多組輸入?yún)?shù)和對應(yīng)分析物檢測數(shù)據(jù)的免疫測定參考數(shù)據(jù)；接收一組實(shí)驗(yàn)輸入?yún)?shù)，其中該實(shí)驗(yàn)輸入?yún)?shù)包括分析物的標(biāo)識(shí)符和克隆性；將機(jī)器學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò)應(yīng)用于該免疫測定參考數(shù)據(jù)以基于該分析物識(shí)別目標(biāo)參數(shù)；基于該目標(biāo)參數(shù)來確定免疫測定參數(shù)集；并且提供該免疫測定參數(shù)集，其中該免疫檢測參數(shù)集包括樣品、緩沖液、溶液和/或混合物中包含的分析物中的至少一個(gè)分析物的負(fù)載濃度和檢測試劑。

17、在一些實(shí)施方案中，在本公開的系統(tǒng)中，該至少一個(gè)存儲(chǔ)器存儲(chǔ)指令，該指令在由所述處理器執(zhí)行時(shí)進(jìn)一步使得該計(jì)算裝置：基于該實(shí)驗(yàn)輸入?yún)?shù)提取相關(guān)免疫測定參考數(shù)據(jù)；確定該實(shí)驗(yàn)輸入?yún)?shù)和對應(yīng)的參考分析物檢測數(shù)據(jù)之間的關(guān)系；并且確定或生成用于檢測該分析物的目標(biāo)參數(shù)。

18、在一些實(shí)施方案中，在本公開的系統(tǒng)中，該至少一個(gè)存儲(chǔ)器存儲(chǔ)指令，該指令在由該處理器執(zhí)行時(shí)使得該計(jì)算裝置：將該相關(guān)免疫測定參考數(shù)據(jù)分類為變量；并且應(yīng)用統(tǒng)計(jì)模型來確定兩個(gè)或更多個(gè)變量之間的關(guān)系；并且使用兩個(gè)或更多個(gè)變量之間的關(guān)系來訓(xùn)練機(jī)器學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò)。

19、在一些實(shí)施方案中，在本公開的系統(tǒng)中，該指令進(jìn)一步使該計(jì)算裝置從表示實(shí)驗(yàn)免疫測定數(shù)據(jù)的圖像中提取免疫測定參考數(shù)據(jù)。

20、在一些實(shí)施方案中，本公開的系統(tǒng)還包括用戶界面，并且該用戶界面包括儀器控制臺(tái)、網(wǎng)絡(luò)工具、圖形用戶界面和計(jì)算裝置上的顯示器中的至少一者。

21、在一些實(shí)施方案中，本公開包括存儲(chǔ)指令的非暫態(tài)算機(jī)可讀介質(zhì)，該指令在由一個(gè)或多個(gè)處理器執(zhí)行時(shí)，使裝置執(zhí)行本文所述的該方法中的一種方法。

22、在一些實(shí)施方案中，本公開的計(jì)算機(jī)實(shí)現(xiàn)的方法用于操作免疫測定儀器支持裝置，并且該計(jì)算機(jī)實(shí)現(xiàn)的方法包括：接收包括多組參考輸入?yún)?shù)和對應(yīng)的參考分析物檢測數(shù)據(jù)的免疫測定參考數(shù)據(jù)；接收一組實(shí)驗(yàn)輸入?yún)?shù)，該實(shí)驗(yàn)輸入?yún)?shù)包括與該免疫測定實(shí)驗(yàn)相關(guān)的至少一個(gè)變量；接收指示以下中的至少一者的問題的信息：該免疫測定參考數(shù)據(jù)、實(shí)驗(yàn)輸入?yún)?shù)和免疫測定實(shí)驗(yàn)的結(jié)果；將機(jī)器學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò)應(yīng)用于該免疫測定參考數(shù)據(jù)以基于該問題識(shí)別目標(biāo)參數(shù)；并且基于該目標(biāo)參數(shù)確定要解析的免疫測定參數(shù)集。

23、示例性問題包括但不限于分析物檢測問題或免疫測定參考數(shù)據(jù)提取問題中的至少一者。在一些實(shí)施方案中，問題涉及從指示實(shí)驗(yàn)免疫測定數(shù)據(jù)的圖像中提取免疫測定參考數(shù)據(jù)。

24、在一些實(shí)施方案中，本公開的計(jì)算機(jī)實(shí)現(xiàn)的方法用于操作免疫測定儀器支持裝置，并且該計(jì)算機(jī)實(shí)現(xiàn)的方法包括：接收包括多組參考輸入?yún)?shù)和對應(yīng)的參考分析物檢測數(shù)據(jù)的免疫測定參考數(shù)據(jù)；接收一組實(shí)驗(yàn)輸入?yún)?shù)；接收用于免疫測定實(shí)驗(yàn)的至少一個(gè)目標(biāo)變量；將機(jī)器學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò)應(yīng)用于該免疫測定參考數(shù)據(jù)以基于該目標(biāo)變量識(shí)別目標(biāo)參數(shù)；并且基于該目標(biāo)參數(shù)來確定用于獲取該目標(biāo)變量的免疫測定參數(shù)集，其中該目標(biāo)變量為分析物。在實(shí)施方案中，一組實(shí)驗(yàn)輸入?yún)?shù)表示一種實(shí)驗(yàn)方法。非限制性實(shí)驗(yàn)方法包括蛋白質(zhì)印跡方法、免疫印跡方法、轉(zhuǎn)移方法和利用蛋白質(zhì)凝膠的方法。

25、在一些實(shí)施方案中，用于操作免疫測定儀器支持裝置以實(shí)現(xiàn)免疫印跡的本公開的計(jì)算機(jī)實(shí)現(xiàn)的方法包括：接收包括多組參考輸入?yún)?shù)和對應(yīng)的參考分析物檢測數(shù)據(jù)的免疫印跡參考數(shù)據(jù)；接收一組實(shí)驗(yàn)輸入?yún)?shù)，其中該實(shí)驗(yàn)輸入?yún)?shù)包括分析物的標(biāo)識(shí)符；將機(jī)器學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò)應(yīng)用于該免疫印跡參考數(shù)據(jù)以基于該分析物識(shí)別目標(biāo)參數(shù)；并且基于該目標(biāo)參數(shù)確定免疫測定參數(shù)集，其中該免疫測定參數(shù)集包括樣品、緩沖液、混合物和/或溶液中包含的分析物中的至少一個(gè)分析物的負(fù)載濃度和檢測試劑。

26、在一些實(shí)施方案中，用于操作免疫測定儀器支持裝置以實(shí)現(xiàn)免疫印跡的本公開的計(jì)算機(jī)實(shí)現(xiàn)的方法包括：接收包括多組參考輸入?yún)?shù)和對應(yīng)的參考分析物檢測數(shù)據(jù)的免疫印跡參考數(shù)據(jù)；接收一組實(shí)驗(yàn)輸入?yún)?shù)，其中該實(shí)驗(yàn)輸入?yún)?shù)包括分析物的標(biāo)識(shí)符；將機(jī)器學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò)應(yīng)用于該免疫印跡參考數(shù)據(jù)以基于該分析物識(shí)別目標(biāo)參數(shù)；并且基于該目標(biāo)參數(shù)確定免疫測定參數(shù)集，其中該免疫測定參數(shù)集包括樣品、緩沖液、混合物和/或溶液中包含的分析物中的至少一個(gè)分析物的負(fù)載濃度和檢測試劑。

27、在本公開的一些實(shí)施方案中，一種用于操作免疫測定儀器支持裝置的方法，該方法包括：接收免疫測定參考數(shù)據(jù)，該免疫測定參考數(shù)據(jù)包括多組參考輸入?yún)?shù)和對應(yīng)的參考分析物檢測數(shù)據(jù)；接收一組實(shí)驗(yàn)輸入?yún)?shù)，其中該實(shí)驗(yàn)輸入?yún)?shù)包括分析物的標(biāo)識(shí)符和單細(xì)胞信息；將機(jī)器學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò)應(yīng)用于該免疫測定參考數(shù)據(jù)，以基于分析物的標(biāo)識(shí)符來識(shí)別目標(biāo)參數(shù)；并且基于該目標(biāo)參數(shù)確定用于檢測該單細(xì)胞中的多個(gè)蛋白質(zhì)的免疫測定參數(shù)集，其中該免疫測定參數(shù)集包括樣品中包含的分析物中的至少一個(gè)分析物的負(fù)載濃度和檢測試劑。單細(xì)胞的非限制性示例包括以下中的一者或多者：通過顯微鏡形態(tài)學(xué)識(shí)別的細(xì)胞系或細(xì)胞譜系，使用一個(gè)或多個(gè)生物標(biāo)志物標(biāo)簽分類/追蹤的，表達(dá)熒光報(bào)告基因的細(xì)胞，或作為分離的原代細(xì)胞系或所維持的細(xì)胞系培養(yǎng)的細(xì)胞。單細(xì)胞信息的非限制性示例可包括以下中的一者或多者：轉(zhuǎn)錄物豐度、分析物(諸如蛋白質(zhì)、核酸等)定位信息或分析物/蛋白質(zhì)豐度的蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)(諸分析物/蛋白質(zhì)豐度的質(zhì)譜研究等)、蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)譯后修飾(諸如聚糖修飾、磷酸化、泛素化、類泛素化、脂錨等)。

28、一些實(shí)施方案描述了用于操作免疫測定儀器支持裝置以進(jìn)行基于流的免疫測定的計(jì)算機(jī)實(shí)現(xiàn)的方法，該方法包括：接收包括多組參考輸入?yún)?shù)和對應(yīng)的參考分析物檢測數(shù)據(jù)的免疫測定參考數(shù)據(jù)，其中該免疫測定參考數(shù)據(jù)包括至少一組基于流的免疫測定數(shù)據(jù)；接收一組實(shí)驗(yàn)輸入?yún)?shù)，其中該實(shí)驗(yàn)輸入?yún)?shù)包括分析物的標(biāo)識(shí)符和單細(xì)胞信息；將機(jī)器學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò)應(yīng)用于包括基于流的免疫測定數(shù)據(jù)的該免疫測定參考數(shù)據(jù)，以基于該分析物識(shí)別目標(biāo)參數(shù)；并且基于該目標(biāo)參數(shù)確定用于檢測該單細(xì)胞中的多個(gè)蛋白質(zhì)的免疫測定參數(shù)集，其中該免疫測定參數(shù)集包括樣品中包含的分析物中的至少一個(gè)分析物的負(fù)載濃度和檢測試劑。

29、在一些實(shí)施方案中，單細(xì)胞信息可為表面標(biāo)志物、分泌的分析物或細(xì)胞內(nèi)標(biāo)志物的數(shù)據(jù)。這種單細(xì)胞信息可來源于流式細(xì)胞術(shù)、圖像分析或蛋白質(zhì)定位研究。

30、示例性非限制性流式測定包括測定，該測定要對具有不同豐度的一組分析物/蛋白質(zhì)進(jìn)行分析，并且要匹配的染料強(qiáng)度與分析物/蛋白質(zhì)豐度值成反比。在這些示例中，一個(gè)實(shí)施方案是細(xì)胞類型表達(dá)一組分析物(蛋白質(zhì)或蛋白質(zhì)修飾目標(biāo)抗體)，并且包括識(shí)別適合于在實(shí)驗(yàn)中同時(shí)研究用戶選擇的該組分析物的細(xì)胞。另一個(gè)實(shí)施方案是基于染料強(qiáng)度和所預(yù)期的分析物豐度來選擇導(dǎo)致最佳光譜補(bǔ)償?shù)囊唤M抗體和染料。

31、因此，所公開的技術(shù)的實(shí)施方案包括用于以下一個(gè)或多個(gè)操作的系統(tǒng)和方法：應(yīng)用機(jī)器學(xué)習(xí)來改進(jìn)免疫測定中的檢測；并且/或者經(jīng)由諸如用戶界面等輸入?yún)?shù)并且接收目標(biāo)免疫測定參數(shù)集的輸出，將各種技術(shù)應(yīng)用于計(jì)算機(jī)、網(wǎng)絡(luò)工具或其他硬件裝置；和/或故障排除問題。此類技術(shù)可應(yīng)用于蛋白質(zhì)印跡方法、基于珠粒的測定、多個(gè)分析物的分析、多個(gè)分析物的檢測、多個(gè)蛋白質(zhì)的分析、多個(gè)蛋白質(zhì)的檢測、分析物成像、蛋白質(zhì)成像、基于流式細(xì)胞術(shù)的檢測以及熒光和染料檢測。