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新的細(xì)胞因子受體、其編碼序列及用途的制作方法

文檔序號:453518閱讀:270來源:國知局
專利名稱:新的細(xì)胞因子受體、其編碼序列及用途的制作方法
技術(shù)領(lǐng)域
本發(fā)明屬于生物技術(shù)和醫(yī)學(xué)領(lǐng)域,具體地說,本發(fā)明涉及新的編碼人細(xì)胞因子受體-CRL1(cytokine receptor like molecule 1,簡稱為“CRL1”)受體的多核苷酸,以及此多核苷酸編碼的多肽。本發(fā)明還涉及此多核苷酸和多肽的用途和制備。具體地說,本發(fā)明的多肽是一種新的與免疫有關(guān)的細(xì)胞因子受體,它是一種gp130同源分子。
細(xì)胞因子是指一類由免疫細(xì)胞和相關(guān)細(xì)胞產(chǎn)生的高活性多功能多肽類分子,參與多種細(xì)胞增殖、分化以及功能的調(diào)節(jié),在免疫應(yīng)答、炎癥和造血細(xì)胞的分化發(fā)育等生命過程中發(fā)揮重要作用(Pan et al.FEBS Lett 1998,431:351)。細(xì)胞因子的作用依賴于其與受體的特異結(jié)合,細(xì)胞因子受體的研究對深入闡明細(xì)胞因子的功能特征、信號傳導(dǎo)途徑和作用機理具有重要意義。同時,細(xì)胞因子受體還可作為藥物設(shè)計的作用靶點,應(yīng)用于抗腫瘤、抗感染和抗移植排斥等疾病的防治,如將抗腫瘤等治療性藥物與細(xì)胞因子偶聯(lián),利用受體配體特異結(jié)合的原理將其定向?qū)氚薪M織;或用可溶性細(xì)胞因子受體特異性阻斷細(xì)胞因子的體內(nèi)作用。因此細(xì)胞因子受體的研究具有重要的理論探索意義和實際應(yīng)用價值。
根據(jù)細(xì)胞因子受體膜外區(qū)的結(jié)構(gòu)特點,可將細(xì)胞因子受體分為細(xì)胞因子受體超家族、免疫球蛋白超家族、腫瘤壞死因子(TNF)受體超家族、酪氨酸激酶(TPK)受體超家族和G蛋白偶聯(lián)受體超家族等5個不同的超家族(Kwon et al.J BiolChem.1999,5;274:6056)。不同家族的細(xì)胞因子受體在其結(jié)構(gòu)、信號傳導(dǎo)和介導(dǎo)的生物學(xué)功能等方面都有其各自的特點。大多數(shù)細(xì)胞因子受體屬于細(xì)胞因子受體超家族,細(xì)胞因子受體超家族成員主要與造血和免疫功能的調(diào)節(jié),其結(jié)構(gòu)特點是胞外區(qū)段有兩個特征性結(jié)構(gòu)域的同源區(qū),一是N端由60個氨基酸組成、含有4個保守性半胱氨酸殘基(Cys)的結(jié)構(gòu)區(qū),二是C端由30個特殊氨基酸組成、含Trp-Ser-X-Trp-Ser(WSXWS)基序的結(jié)構(gòu)區(qū),其中WSXWS基序中的兩個W殘基對于受體膜外分子的折疊以形成一定的空間構(gòu)象和發(fā)揮生物學(xué)效應(yīng)至關(guān)重要。細(xì)胞因子受體超家族包含一個gp130亞家族,主要由gp130、OSMR、LIFR、G-CSFR、EPOR、IL-12R和Leptin受體等,其中g(shù)p130是IL-6、IL-11、LIF、OSM、CNTF和心肌營養(yǎng)素(cadiotrophin-1)等共用的信號傳導(dǎo)鏈,受激活后形成同源二聚體或與LIFR形成異源二聚體,誘導(dǎo)激酶的活化,通過Jak/STAT途徑介導(dǎo)胞內(nèi)的信號傳導(dǎo),該亞家族的G-CSFR、EPOR、IL-12R與配體結(jié)合后形成同源二聚體,直接通過Jak/STAT途徑介導(dǎo)胞內(nèi)的信號傳導(dǎo)(Taga et al.Annu RevImmunol.1997,15:797)。
細(xì)胞因子受體有膜結(jié)合型和可溶性兩種存在形式。包括gp130在內(nèi)的大部分細(xì)胞因子受體都發(fā)現(xiàn)有可溶性形式的存在。可溶性細(xì)胞因子受體(sCKR)的產(chǎn)生機理有二一是膜受體經(jīng)蛋白酶水解,胞外區(qū)自細(xì)胞膜表面脫落產(chǎn)生,二是由受體mRNA不同剪接方式產(chǎn)生的sCKR分泌至胞外。現(xiàn)在認(rèn)為sCKR可能主要是通過后一種機理產(chǎn)生。一種受體可通過以上兩種不同的機制產(chǎn)生可溶性受體,如可溶性IL-6R的產(chǎn)生??扇苄约?xì)胞因子受體的生物學(xué)作用復(fù)雜多樣,主要有以下四方面①作為一種自我調(diào)節(jié)機理,通過膜結(jié)合型受體的酶解產(chǎn)生可溶性受體下調(diào)膜結(jié)合型細(xì)胞因子受體,②運載細(xì)胞因子做為細(xì)胞因子的一種結(jié)合蛋白,③拮抗細(xì)胞因子的生物學(xué)活性通過競爭性抑制細(xì)胞因子與mCKR結(jié)合,④傳導(dǎo)細(xì)胞因子信號某些可溶性細(xì)胞因子受體與配體結(jié)合后能作用于相關(guān)的亞基,如slL-6R與IL-6結(jié)合后能作用于gp130,使靶細(xì)胞對IL-6的刺激產(chǎn)生反應(yīng)??扇苄允荏w的拮抗作用在臨床具有應(yīng)用價值,如能阻斷T細(xì)胞活化的共刺激信號的可溶性受體CTLA(B7的一種受體)用于抗移植排斥,可溶性TNF受體用于內(nèi)毒素休克的防治,等等。
因此,本領(lǐng)域迫切需要開發(fā)新的細(xì)胞因子受體。
本發(fā)明的目的是提供一種新的人細(xì)胞因子受體-CRL1蛋白以及其片段、類似物和衍生物。
本發(fā)明的另一目的是提供編碼這些多肽的多核苷酸。
本發(fā)明的另一目的是提供生產(chǎn)這些多肽的方法以及該多肽和編碼序列的用途。本發(fā)明的CRL1蛋白是一種gp130同源分子。
在本發(fā)明的第一方面,提供新穎的分離出的CRL1多肽,該多肽是人源的,它包含具有SEQ ID NO:2或3氨基酸序列的多肽、或其保守性變異多肽、或其活性片段、或其活性衍生物。較佳地,該多肽是具有SEQ ID NO:2或3氨基酸序列的多肽。
在本發(fā)明的第二方面,提供編碼分離的這些多肽的多核苷酸,該多核苷酸包含一核苷酸序列,該核苷酸序列與選自下組的一種核苷酸序列有至少70%相同性(a)編碼上述人CRL1多肽的多核苷酸;和(b)與多核苷酸(a)互補的多核苷酸。較佳地,該多核苷酸編碼具有SEQ ID NO:2或3所示氨基酸序列的多肽。更佳地,該多核苷酸的序列是選自下組的一種(a)具有SEQ ID NO:1中126-2036位的序列;(b)具有SEQ ID NO:1中251-2036位的序列;(c)具有SEQ ID NO:1中1-2677位的序列。
在本發(fā)明的第三方面,提供了含有上述多核苷酸的載體,以及被該載體轉(zhuǎn)化或轉(zhuǎn)導(dǎo)的宿主細(xì)胞或者被上述多核苷酸直接轉(zhuǎn)化或轉(zhuǎn)導(dǎo)的宿主細(xì)胞。
在本發(fā)明的第四方面,提供了制備具有人CRL1蛋白活性的多肽的方法,該方法包含(a)在適合表達(dá)人CRL1蛋白的條件下,培養(yǎng)上述被轉(zhuǎn)化或轉(zhuǎn)導(dǎo)的宿主細(xì)胞;(b)從培養(yǎng)物中分離出具有人CRL1蛋白活性的多肽。
在本發(fā)明的第五方面,提供了與上述的人CRL1多肽特異性結(jié)合的抗體。還提供了可用于檢測的核酸分子,它含有上述的多核苷酸中連續(xù)的10-2677個核苷酸。
在本發(fā)明的第六方面,提供了模擬、促進(jìn)、拮抗人CRL1多肽活性的化合物,以及抑制人CRL1多肽的表達(dá)的化合物。還提供了篩選和/或制備這些化合物的方法。較佳地,該化合物是人CRL1多肽的編碼序列或其片段的反義序列。
在本發(fā)明的第七方面,提供了檢測樣品中是否存在CRL1蛋白的方法,它包括將樣品與CRL1蛋白的特異性抗體接觸,觀察是否形成抗體復(fù)合物,形成了抗體復(fù)合物就表示樣品中存在CRL1蛋白。
在本發(fā)明的第八方面,提供了一種檢測與人CRL1多肽異常表達(dá)相關(guān)的疾病或疾病易感性的方法,該方法包括檢測編碼所述多肽的核酸序列中是否存在突變。
在本發(fā)明的第九方面,提供了本發(fā)明多肽和編碼序列的用途。例如本發(fā)明多肽可被用于篩選促進(jìn)人CRL1多肽活性的激動劑,或者篩選抑制人CRL1多肽活性的拮抗劑、或者被用于肽指紋圖譜鑒定。本發(fā)明的人CRL1蛋白的編碼序列或其片段,可被作為引物用于PCR擴(kuò)增反應(yīng),或者作為探針用于雜交反應(yīng),或者用于制造基因芯片或微陣列。
在本發(fā)明的第十方面,提供了一種藥物組合物,它含有安全有效量的本發(fā)明的人CRL1多肽或其拮抗劑以及藥學(xué)上可接受的載體。這些藥物組合物可治療腫瘤、炎癥、免疫排斥等病癥。
本發(fā)明的其它方面由于本文的技術(shù)的公開,對本領(lǐng)域的技術(shù)人員而言是顯而易見的。
下列附圖用于說明本發(fā)明的具體實施方案,而不用于限定由權(quán)利要求書所界定的本發(fā)明范圍。


圖1是本發(fā)明的人CRL1的cDNA序列,其中非編碼序列用小寫字母表示,編碼序列用大寫字母表示。
圖2是本發(fā)明的人CRL1蛋白的全長氨基酸序列。
圖3是本發(fā)明的人CRL1蛋白與人GP130蛋白的氨基酸序列同源性比較圖。上方序列是人CRL1,下方序列是人GP130蛋白。相同的氨基酸在兩個序列之間用“|”標(biāo)出,相似的氨基酸用“”或“.”標(biāo)出。
圖4是本發(fā)明的人CRL1蛋白的Kyte-doolitte疏水性分析的疏水性曲線圖。
在本發(fā)明中,術(shù)語“CRL1蛋白”、“CRL1多肽”或“CRL1受體”可互換使用,都指具有人細(xì)胞因子受體CRL1氨基酸序列的全長形式(SEQ ID NO:2)或無信號肽的成熟形式(SEQ ID NO:3)的氨基酸序列的人細(xì)胞因子受體CRL1。它們包括含有或不含起始甲硫氨酸的細(xì)胞因子受體CRL1。
如本文所用,“分離的”是指物質(zhì)從其原始環(huán)境中分離出來(如果是天然的物質(zhì),原始環(huán)境即是天然環(huán)境)。如活體細(xì)胞內(nèi)的天然狀態(tài)下的多聚核苷酸和多肽是沒有分離純化的,但同樣的多聚核苷酸或多肽如從天然狀態(tài)中同存在的其他物質(zhì)中分開,則為分離純化的。
如本文所用,“分離的CRL1蛋白或多肽”是指CRL1多肽基本上不含天然與其相關(guān)的其它蛋白、脂類、糖類或其它物質(zhì)。本領(lǐng)域的技術(shù)人員能用標(biāo)準(zhǔn)的蛋白質(zhì)純化技術(shù)純化CRL1蛋白?;旧霞兊亩嚯脑诜沁€原聚丙烯酰胺凝膠上能產(chǎn)生單一的主帶。CRL1多肽的純度能用氨基酸序列分析。
本發(fā)明的多肽可以是重組多肽、天然多肽、合成多肽,優(yōu)選重組多肽。本發(fā)明的多肽可以是天然純化的產(chǎn)物,或是化學(xué)合成的產(chǎn)物,或使用重組技術(shù)從原核或真核宿主(例如,細(xì)菌、酵母、高等植物、昆蟲和哺乳動物細(xì)胞)中產(chǎn)生。根據(jù)重組生產(chǎn)方案所用的宿主,本發(fā)明的多肽可以是糖基化的,或可以是非糖基化的。本發(fā)明的多肽還可包括或不包括起始的甲硫氨酸殘基。
本發(fā)明還包括人CRL1蛋白的片段、衍生物和類似物。如本文所用,術(shù)語“片段”、“衍生物”和“類似物”是指基本上保持本發(fā)明的天然人CRL1蛋白相同的生物學(xué)功能或活性的多肽。本發(fā)明的多肽片段、衍生物或類似物可以是(ⅰ)有一個或多個保守或非保守性氨基酸殘基(優(yōu)選保守性氨基酸殘基)被取代的多肽,而這樣的取代的氨基酸殘基可以是也可以不是由遺傳密碼編碼的,或(ⅱ)在一個或多個氨基酸殘基中具有取代基團(tuán)的多肽,或(ⅲ)成熟多肽與另一個化合物(比如延長多肽半衰期的化合物,例如聚乙二醇)融合所形成的多肽,或(ⅳ)附加的氨基酸序列融合到此多肽序列而形成的多肽(如前導(dǎo)序列或分泌序列或用來純化此多肽的序列或蛋白原序列,或與抗原IgG片段的形成的融合蛋白)。根據(jù)本文的教導(dǎo),這些片段、衍生物和類似物屬于本領(lǐng)域熟練技術(shù)人員公知的范圍。
在本發(fā)明中,術(shù)語“人CRL1多肽”指具有人CRL1蛋白活性的SEQ ID NO.2或3序列的多肽。該術(shù)語還包括具有與人CRL1蛋白相同功能的、SEQ ID NO.2或3序列的變異形式。這些變異形式包括(但并不限于)若干個(通常為1-50個,較佳地1-30個,更佳地1-20個,最佳地1-10個)氨基酸的缺失、插入和/或取代,以及在C末端和/或N末端添加一個或數(shù)個(通常為20個以內(nèi),較佳地為10個以內(nèi),更佳地為5個以內(nèi))氨基酸。例如,在本領(lǐng)域中,用性能相近或相似的氨基酸進(jìn)行取代時,通常不會改變蛋白質(zhì)的功能。又比如,在C末端和/或N末端添加一個或數(shù)個氨基酸通常也不會改變蛋白質(zhì)的功能。該術(shù)語還包括人CRL1蛋白的活性片段和活性衍生物。
該多肽的變異形式包括同源序列、保守性變異體、等位變異體、天然突變體、誘導(dǎo)突變體、在高或低的嚴(yán)緊度條件下能與人CRL1 DNA雜交的DNA所編碼的蛋白、以及利用抗人CRL1多肽的抗血清獲得的多肽或蛋白。本發(fā)明還提供了其他多肽,如包含人CRL1多肽或其片段的融合蛋白。除了幾乎全長的多肽外,本發(fā)明還包括了人CRL1多肽的可溶性片段。通常,該片段具有人CRL1多肽序列的至少約10個連續(xù)氨基酸,通常至少約30個連續(xù)氨基酸,較佳地至少約50個連續(xù)氨基酸,更佳地至少約80個連續(xù)氨基酸,最佳地至少約100個連續(xù)氨基酸。
發(fā)明還提供人CRL1蛋白或多肽的類似物。這些類似物與天然人CRL1多肽的差別可以是氨基酸序列上的差異,也可以是不影響序列的修飾形式上的差異,或者兼而有之。這些多肽包括天然或誘導(dǎo)的遺傳變異體。誘導(dǎo)變異體可以通過各種技術(shù)得到,如通過輻射或暴露于誘變劑而產(chǎn)生隨機誘變,還可通過定點誘變法或其他已知分子生物學(xué)的技術(shù)。類似物還包括具有不同于天然L-氨基酸的殘基(如D-氨基酸)的類似物,以及具有非天然存在的或合成的氨基酸(如β、Y-氨基酸)的類似物。應(yīng)理解,本發(fā)明的多肽并不限于上述例舉的代表性的多肽。
修飾(通常不改變一級結(jié)構(gòu))形式包括體內(nèi)或體外的多肽的化學(xué)衍生形式如乙?;螋然?。修飾還包括糖基化,如那些在多肽的合成和加工中或進(jìn)一步加工步驟中進(jìn)行糖基化修飾而產(chǎn)生的多肽。這種修飾可以通過將多肽暴露于進(jìn)行糖基化的酶(如哺乳動物的糖基化酶或去糖基化酶)而完成。修飾形式還包括具有磷酸化氨基酸殘基(如磷酸酪氨酸,磷酸絲氨酸,磷酸蘇氨酸)的序列。還包括被修飾從而提高了其抗蛋白水解性能或優(yōu)化了溶解性能的多肽。
在本發(fā)明中,“人CRL1蛋白保守性變異多肽”指與SEQ ID NO:2或3的氨基酸序列相比,有至多10個,較佳地至多8個,更佳地至多5個,最佳地至多3個氨基酸被性質(zhì)相似或相近的氨基酸所替換而形成多肽。這些保守性變異多肽最好根據(jù)表1進(jìn)行氨基酸替換而產(chǎn)生。
表1
本發(fā)明的多核苷酸可以是DNA形式或RNA形式。DNA形式包括cDNA、基因組DNA或人工合成的DNA。DNA可以是單鏈的或是雙鏈的。DNA可以是編碼鏈或非編碼鏈。編碼成熟多肽的編碼區(qū)序列可以與SEQ ID NO:1所示的編碼區(qū)序列相同或者是簡并的變異體。如本文所用,“簡并的變異體”在本發(fā)明中是指編碼具有SEQ ID NO:2或3的蛋白質(zhì),但與SEQ ID NO:1所示的編碼區(qū)序列有差別的核酸序列。
編碼SEQ ID NO:2或3的成熟多肽的多核苷酸包括只編碼成熟多肽的編碼序列;成熟多肽的編碼序列和各種附加編碼序列;成熟多肽的編碼序列(和任選的附加編碼序列)以及非編碼序列。
術(shù)語“編碼多肽的多核苷酸”可以是包括編碼此多肽的多核苷酸,也可以是還包括附加編碼和/或非編碼序列的多核苷酸。
本發(fā)明還涉及上述多核苷酸的變異體,其編碼與本發(fā)明有相同的氨基酸序列的多肽或多肽的片段、類似物和衍生物。此多核苷酸的變異體可以是天然發(fā)生的等位變異體或非天然發(fā)生的變異體。這些核苷酸變異體包括取代變異體、缺失變異體和插入變異體。如本領(lǐng)域所知的,等位變異體是一個多核苷酸的替換形式,它可能是一個或多個核苷酸的取代、缺失或插入,但不會從實質(zhì)上改變其編碼的多肽的功能。
本發(fā)明還涉及與上述的序列雜交且兩個序列之間具有至少50%,較佳地至少70%,更佳地至少80%相同性的多核苷酸。本發(fā)明特別涉及在嚴(yán)格條件下與本發(fā)明所述多核苷酸可雜交的多核苷酸。在本發(fā)明中,“嚴(yán)格條件”是指(1)在較低離子強度和較高溫度下的雜交和洗脫,如0.2×SSC,0.1%SDS,60℃;或(2)雜交時加有變性劑,如50%(v/v)甲酰胺,0.1%小牛血清/0.1%Ficoll,42℃等;或(3)僅在兩條序列之間的相同性至少在90%以上,更好是95%以上時才發(fā)生雜交。并且,可雜交的多核苷酸編碼的多肽與SEQ ID NO:2所示的成熟多肽有相同的生物學(xué)功能和活性。
本發(fā)明還涉及與上述的序列雜交的核酸片段。如本文所用,“核酸片段”的長度至少含15個核苷酸,較好是至少30個核苷酸,更好是至少50個核苷酸,最好是至少100個核苷酸以上。核酸片段可用于核酸的擴(kuò)增技術(shù)(如PCR)以確定和/或分離編碼CRL1蛋白的多聚核苷酸。
本發(fā)明中的多肽和多核苷酸優(yōu)選以分離的形式提供,更佳地被純化至均質(zhì)。
本發(fā)明的人CRL1核苷酸全長序列或其片段通常可以用PCR擴(kuò)增法、重組法或人工合成的方法獲得。對于PCR擴(kuò)增法,可根據(jù)本發(fā)明所公開的有關(guān)核苷酸序列,尤其是開放閱讀框序列來設(shè)計引物,并用市售的cDNA庫或按本領(lǐng)域技術(shù)人員已知的常規(guī)方法所制備的cDNA庫作為模板,擴(kuò)增而得有關(guān)序列。當(dāng)序列較長時,常常需要進(jìn)行兩次或多次PCR擴(kuò)增,然后再將各次擴(kuò)增出的片段按正確次序拼接在一起。
一旦獲得了有關(guān)的序列,就可以用重組法來大批量地獲得有關(guān)序列。這通常是將其克隆入載體,再轉(zhuǎn)入細(xì)胞,然后通過常規(guī)方法從增殖后的宿主細(xì)胞中分離得到有關(guān)序列。
此外,還可用人工合成的方法來合成有關(guān)序列,尤其是片段長度較短時。通常,通過先合成多個小片段,然后再進(jìn)行連接可獲得序列很長的片段。
目前,已經(jīng)可以完全通過化學(xué)合成來得到編碼本發(fā)明蛋白(或其片段,或其衍生物)的DNA序列。然后可將該DNA序列引入本領(lǐng)域中已知的各種現(xiàn)有的DNA分子(或如載體)和細(xì)胞中。此外,還可通過化學(xué)合成將突變引入本發(fā)明蛋白序列中。
應(yīng)用PCR技術(shù)擴(kuò)增DNA/RNA的方法(Saiki,et al.Science 1985;2301350-1354)被優(yōu)選用于獲得本發(fā)明的基因。特別是很難從文庫中得到全長的cDNA時,可優(yōu)選使用RACE法(RACE-cDNA末端快速擴(kuò)增法),用于PCR的引物可根據(jù)本文所公開的本發(fā)明的序列信息適當(dāng)?shù)剡x擇,并可用常規(guī)方法合成??捎贸R?guī)方法如通過凝膠電泳分離和純化擴(kuò)增的DNA/RNA片段。
本發(fā)明也涉及包含本發(fā)明的多核苷酸的載體,以及用本發(fā)明的載體或CRL1蛋白編碼序列經(jīng)基因工程產(chǎn)生的宿主細(xì)胞,以及經(jīng)重組技術(shù)產(chǎn)生本發(fā)明所述多肽的方法。
通過常規(guī)的重組DNA技術(shù)(Science,1984;224:1431),可利用本發(fā)明的多聚核苷酸序列可用來表達(dá)或生產(chǎn)重組的CRL1多肽。一般來說有以下步驟(1).用本發(fā)明的編碼人CRL1多肽的多核苷酸(或變異體),或用含有該多核苷酸的重組表達(dá)載體轉(zhuǎn)化或轉(zhuǎn)導(dǎo)合適的宿主細(xì)胞;(2).在合適的培養(yǎng)基中培養(yǎng)的宿主細(xì)胞;(3).從培養(yǎng)基或細(xì)胞中分離、純化蛋白質(zhì)。
本發(fā)明中,人CRL1多核苷酸序列可插入到重組表達(dá)載體中。術(shù)語“重組表達(dá)載體”指本領(lǐng)域熟知的細(xì)菌質(zhì)粒、噬菌體、酵母質(zhì)粒、植物細(xì)胞病毒、哺乳動物細(xì)胞病毒如腺病毒、逆轉(zhuǎn)錄病毒或其他載體。在本發(fā)明中適用的載體包括但不限于在細(xì)菌中表達(dá)的基于T7的表達(dá)載體(Rosenberg,et al.Gene,1987,56:125);在哺乳動物細(xì)胞中表達(dá)的pMSXND表達(dá)載體(Lee and Nathans,J Bio Chem.2633521,1988)和在昆蟲細(xì)胞中表達(dá)的來源于桿狀病毒的載體??傊?,只要能在宿主體內(nèi)復(fù)制和穩(wěn)定,任何質(zhì)粒和載體都可以用。表達(dá)載體的一個重要特征是通常含有復(fù)制起點、啟動子、標(biāo)記基因和翻譯控制元件。
本領(lǐng)域的技術(shù)人員熟知的方法能用于構(gòu)建含人CRL1編碼DNA序列和合適的轉(zhuǎn)錄/翻譯控制信號的表達(dá)載體。這些方法包括體外重組DNA技術(shù)、DNA合成技術(shù)、體內(nèi)重組技術(shù)等(Sambroook,et al.Molecular Cloning,a Laboratory Manual,coldSpring Harbor Laboratory.New York,1989)。所述的DNA序列可有效連接到表達(dá)載體中的適當(dāng)啟動子上,以指導(dǎo)mRNA合成。這些啟動子的代表性例子有大腸桿菌的lac或trp啟動子;入噬菌體PL啟動子;真核啟動子包括CMV立即早期啟動子、HSV胸苷激酶啟動子、早期和晚期SV40啟動子、反轉(zhuǎn)錄病毒的LTRs和其他一些已知的可控制基因在原核或真核細(xì)胞或其病毒中表達(dá)的啟動子。表達(dá)載體還包括翻譯起始用的核糖體結(jié)合位點和轉(zhuǎn)錄終止子。
此外,表達(dá)載體優(yōu)選地包含一個或多個選擇性標(biāo)記基因,以提供用于選擇轉(zhuǎn)化的宿主細(xì)胞的表型性狀,如真核細(xì)胞培養(yǎng)用的二氫葉酸還原酶、新霉素抗性以及綠色熒光蛋白(GFP),或用于大腸桿菌的四環(huán)素或氨芐青霉素抗性。
包含上述的適當(dāng)DNA序列以及適當(dāng)啟動子或者控制序列的載體,可以用于轉(zhuǎn)化適當(dāng)?shù)乃拗骷?xì)胞,以使其能夠表達(dá)蛋白質(zhì)。
宿主細(xì)胞可以是原核細(xì)胞,如細(xì)菌細(xì)胞;或是低等真核細(xì)胞,如酵母細(xì)胞;或是高等真核細(xì)胞,如哺乳動物細(xì)胞。代表性例子有大腸桿菌,鏈霉菌屬;鼠傷寒沙門氏菌的細(xì)菌細(xì)胞;真菌細(xì)胞如酵母;植物細(xì)胞;果蠅S2或Sf9的昆蟲細(xì)胞;CHO、COS、293細(xì)胞、或Bowes黑素瘤細(xì)胞的動物細(xì)胞等。
本發(fā)明的多核苷酸在高等真核細(xì)胞中表達(dá)時,如果在載體中插入增強子序列時將會使轉(zhuǎn)錄得到增強。增強子是DNA的順式作用因子,通常大約有10到300個堿基對,作用于啟動子以增強基因的轉(zhuǎn)錄??膳e的例子包括在復(fù)制起始點晚期一側(cè)的100到270個堿基對的SV40增強子、在復(fù)制起始點晚期一側(cè)的多瘤增強子以及腺病毒增強子等。
本領(lǐng)域一般技術(shù)人員都清楚如何選擇適當(dāng)?shù)妮d體、啟動子、增強子和宿主細(xì)胞。
用重組DNA轉(zhuǎn)化宿主細(xì)胞可用本領(lǐng)域技術(shù)人員熟知的常規(guī)技術(shù)進(jìn)行。當(dāng)宿主為原核生物如大腸桿菌時,能吸收DNA的感受態(tài)細(xì)胞可在指數(shù)生長期后收獲,用CaCl2法處理,所用的步驟在本領(lǐng)域眾所周知。另一種方法是使用MgCl2。如果需要,轉(zhuǎn)化也可用電穿孔的方法進(jìn)行。當(dāng)宿主是真核生物,可選用如下的DNA轉(zhuǎn)染方法磷酸鈣共沉淀法,常規(guī)機械方法如顯微注射、電穿孔、脂質(zhì)體包裝等。
獲得的轉(zhuǎn)化子可以用常規(guī)方法培養(yǎng),表達(dá)本發(fā)明的基因所編碼的多肽。根據(jù)所用的宿主細(xì)胞,培養(yǎng)中所用的培養(yǎng)基可選自各種常規(guī)培養(yǎng)基。在適于宿主細(xì)胞生長的條件下進(jìn)行培養(yǎng)。當(dāng)宿主細(xì)胞生長到適當(dāng)?shù)募?xì)胞密度后,用合適的方法(如溫度轉(zhuǎn)換或化學(xué)誘導(dǎo))誘導(dǎo)選擇的啟動子,將細(xì)胞再培養(yǎng)一段時間。
在上面的方法中的重組多肽可在細(xì)胞內(nèi)、或在細(xì)胞膜上表達(dá)、或分泌到細(xì)胞外。如果需要,可利用其物理的、化學(xué)的和其它特性通過各種分離方法分離和純化重組的蛋白。這些方法是本領(lǐng)域技術(shù)人員所熟知的。這些方法的例子包括但并不限于常規(guī)的復(fù)性處理、用蛋白沉淀劑處理(鹽析方法)、離心、滲透破菌、超處理、超離心、分子篩層析(凝膠過濾)、吸附層析、離子交換層析、高效液相層析(HPLC)和其它各種液相層析技術(shù)及這些方法的結(jié)合。
重組的人CRL1蛋白或多肽有多方面的用途。這些用途包括(但不限于)直接做為藥物治療CRL1蛋白功能低下或喪失所致的疾病,和用于篩選促進(jìn)或?qū)笴RL1蛋白功能的抗體、多肽或其它配體。用表達(dá)的重組人CRL1蛋白篩選多肽庫可用于尋找有治療價值的能抑制或刺激人CRL1蛋白功能的多肽分子。
另一方面,本發(fā)明還包括對人CRL1 DNA或是其片段編碼的多肽具有特異性的多克隆抗體和單克隆抗體,尤其是單克隆抗體。這里,“特異性”是指抗體能結(jié)合于人CRL1基因產(chǎn)物或片段。較佳地,指那些能與人CRL1基因產(chǎn)物或片段結(jié)合但不識別和結(jié)合于其它非相關(guān)抗原分子的抗體。本發(fā)明中抗體包括那些能夠結(jié)合并抑制人CRL1蛋白的分子,也包括那些并不影響人CRL1蛋白功能的抗體。本發(fā)明還包括那些能與修飾或未經(jīng)修飾形式的人CRL1基因產(chǎn)物結(jié)合的抗體。
本發(fā)明不僅包括完整的單克隆或多克隆抗體,而且還包括具有免疫活性的抗體片段,如Fab′或(Fab)2片段;抗體重鏈;抗體輕鏈;遺傳工程改造的單鏈Fv分子(Ladner等人,美國專利No.4,946,778);或嵌合抗體,如具有鼠抗體結(jié)合特異性但仍保留來自人的抗體部分的抗體。
本發(fā)明的抗體可以通過本領(lǐng)域內(nèi)技術(shù)人員已知的各種技術(shù)進(jìn)行制備。例如,純化的人CRL1基因產(chǎn)物或者其具有抗原性的片段,可被施用于動物以誘導(dǎo)多克隆抗體的產(chǎn)生。與之相似的,表達(dá)人CRL1蛋白或其具有抗原性的片段的細(xì)胞可用來免疫動物來生產(chǎn)抗體。本發(fā)明的抗體也可以是單克隆抗體。此類單克隆抗體可以利用雜交瘤技術(shù)來制備(見Kohler等人,Nature 256;495,1975;Kohler等人,Eur.J.Immunol.6:511,1976;Kohler等人,Eur.J.Immunol.6:292,1976;Hammerling等人,In Monoclonal Antibodies and T Cell Hybridomas,Elsevier,N.Y.,1981)。本發(fā)明的抗體包括能阻斷人CRL1蛋白功能的抗體以及不影響人CRL1蛋白功能的抗體。本發(fā)明的各類抗體可以利用人CRL1基因產(chǎn)物的片段或功能區(qū),通過常規(guī)免疫技術(shù)獲得。這些片段或功能區(qū)可以利用重組方法制備或利用多肽合成儀合成。與人CRL1基因產(chǎn)物的未修飾形式結(jié)合的抗體可以用原核細(xì)胞(例如E.Coli)中生產(chǎn)的基因產(chǎn)物來免疫動物而產(chǎn)生;與翻譯后修飾形式結(jié)合的抗體(如糖基化或磷酸化的蛋白或多肽),可以用真核細(xì)胞(例如酵母或昆蟲細(xì)胞)中產(chǎn)生的基因產(chǎn)物來免疫動物而獲得。
抗人CRL1蛋白的抗體可用于免疫組織化學(xué)技術(shù)中,檢測活檢標(biāo)本中的人CRL1蛋白。此外,與人CRL1蛋白結(jié)合的單克隆抗體也可用放射性同位素標(biāo)記,注入體內(nèi)可跟蹤其位置和分布。這種放射性標(biāo)記的抗體可作為一種非創(chuàng)傷性診斷方法用于腫瘤細(xì)胞的定位和判斷是否有轉(zhuǎn)移。
本發(fā)明中的抗體可用于治療或預(yù)防與人CRL1蛋白相關(guān)的疾病。給予適當(dāng)劑量的抗體可以刺激或阻斷人CRL1蛋白的產(chǎn)生或活性。
抗體也可用于設(shè)計成針對體內(nèi)某一特殊部位的免疫毒素。如人CRL1蛋白高親和性的單克隆抗體可與細(xì)菌或植物毒素(如白喉毒素,蓖麻蛋白,紅豆堿等)共價結(jié)合。一種通常的方法是用巰基交聯(lián)劑如SPDP,攻擊抗體的氨基,通過二硫鍵的交換,將毒素結(jié)合于抗體上,這種雜交抗體可用于殺滅人CRL1蛋白陽性的細(xì)胞(例如淋巴結(jié)細(xì)胞等)。
多克隆抗體的生產(chǎn)可用人CRL1蛋白或多肽免疫動物,如家兔,小鼠,大鼠等。多種佐劑可用于增強免疫反應(yīng),包括但不限于弗氏佐劑等。
利用本發(fā)明蛋白,通過各種常規(guī)篩選方法,可篩選出與CRL1蛋白發(fā)生相互作用的物質(zhì),如受體、抑制劑或拮抗劑等。
本發(fā)明蛋白及其抗體、抑制劑、拮抗劑或受體等,當(dāng)在治療上進(jìn)行施用(給藥)時,可提供不同的效果。通常,可將這些物質(zhì)配制于無毒的、惰性的和藥學(xué)上可接受的水性載體介質(zhì)中,其中pH通常約為5-8,較佳地pH約為6-8,盡管pH值可隨被配制物質(zhì)的性質(zhì)以及待治療的病癥而有所變化。配制好的藥物組合物可以通過常規(guī)途徑進(jìn)行給藥,其中包括(但并不限于)肌內(nèi)、腹膜內(nèi)、靜脈內(nèi)、皮下、皮內(nèi)、或局部給藥。
本發(fā)明的多肽可直接用于疾病治療,例如,調(diào)節(jié)免疫、造血方面的失調(diào)。在使用本發(fā)明CRL1蛋白或其抗體時,還可同時使用其他治療劑,如其他調(diào)節(jié)造血或免疫的物質(zhì),如EPO、IL-6等。
本發(fā)明還提供了一種藥物組合物,它含有安全有效量的本發(fā)明CRL1多肽或其拮抗劑以及藥學(xué)上可接受的載體或賦形劑。這類載體包括(但并不限于)鹽水、緩沖液、葡萄糖、水、甘油、乙醇、及其組合。藥物制劑應(yīng)與給藥方式相匹配。本發(fā)明的藥物組合物可以被制成針劑形式,例如用生理鹽水或含有葡萄糖和其他輔劑的水溶液通過常規(guī)方法進(jìn)行制備。諸如片劑和膠囊之類的藥物組合物,可通過常規(guī)方法進(jìn)行制備。藥物組合物如針劑、溶液、片劑和膠囊宜在無菌條件下制造。活性成分的給藥量是治療有效量,例如每天約1微克/千克體重-約5毫克/千克體重。此外,本發(fā)明的多肽還可與其他治療劑一起使用。
使用藥物組合物時,是將安全有效量的CRL1蛋白或其拮抗劑、激動劑施用于哺乳動物,其中該安全有效量通常至少約10微克/千克體重,而且在大多數(shù)情況下不超過約8毫克/千克體重,較佳地該劑量是約10微克/千克體重-約1毫克/千克體重。當(dāng)然,具體劑量還應(yīng)考慮給藥途徑、病人健康狀況等因素,這些都是熟練醫(yī)師技能范圍之內(nèi)的。
人CRL1蛋白的多聚核苷酸也可用于多種治療目的?;蛑委熂夹g(shù)可用于治療由于CRL1蛋白的無表達(dá)或異常/無活性的CRL1蛋白的表達(dá)所致的細(xì)胞增殖、發(fā)育或代謝異常。重組的基因治療載體(如病毒載體)可設(shè)計成表達(dá)變異的CRL1蛋白,以抑制內(nèi)源性的CRL1蛋白活性。來源于病毒的表達(dá)載體如逆轉(zhuǎn)錄病毒、腺病毒、腺病毒相關(guān)病毒、單純皰疹病毒、細(xì)小病毒等可用于將CRL1基因轉(zhuǎn)移至細(xì)胞內(nèi)。構(gòu)建攜帶CRL1基因的重組病毒載體的方法可見于已有文獻(xiàn)(Sambrook,et al.)。另外重組人CRL1基因可包裝到脂質(zhì)體中,然后再轉(zhuǎn)移至細(xì)胞內(nèi)。
抑制人CRL1 mRNA的寡聚核苷酸(包括反義RNA和DNA)以及核酶也在本發(fā)明的范圍之內(nèi)。核酶是一種能特異性分解特定RNA的酶樣RNA分子,其作用機制是核酶分子與互補的靶RNA特異性雜交后進(jìn)行核酸內(nèi)切作用。反義的RNA和DNA及核酶可用已有的任何RNA或DNA合成技術(shù)獲得,如固相磷酸酰胺化學(xué)合成法合成寡核苷酸的技術(shù)已廣泛應(yīng)用。反義RNA分子可通過編碼該RNA的DNA序列在體外或體內(nèi)轉(zhuǎn)錄獲得。這種DNA序列已整合到載體的RNA聚合酶啟動子的下游。為了增加核酸分子的穩(wěn)定性,可用多種方法對其進(jìn)行修飾,如增加兩側(cè)的序列長度,核糖核苷之間的連接應(yīng)用磷酸硫酯鍵或肽鍵而非磷酸二酯鍵。
多聚核苷酸導(dǎo)入組織或細(xì)胞內(nèi)的方法包括將多聚核苷酸直接注入到體內(nèi)組織中;或在體外通過載體(如病毒、噬菌體或質(zhì)粒等)先將多聚核苷酸導(dǎo)入細(xì)胞中,再將細(xì)胞移植到體內(nèi)等。
能與人CRL1蛋白結(jié)合的多肽分子可通過篩選由各種可能組合的氨基酸結(jié)合于固相物組成的隨機多肽庫而獲得。篩選時,必須對人CRL1蛋白分子進(jìn)行標(biāo)記。
本發(fā)明還涉及定量和定位檢測人CRL1蛋白水平的診斷試驗方法。這些試驗是本領(lǐng)域所熟知的,且包括FISH測定和放射免疫測定。試驗中所檢測的人CRL1蛋白水平,可以用作解釋人CRL1蛋白在各種疾病中的重要性和用于診斷CRL1蛋白起作用的疾病。
一種檢測檢測樣品中是否存在CRL1蛋白的方法是利用CRL1蛋白的特異性抗體進(jìn)行檢測,它包括將樣品與CRL1蛋白特異性抗體接觸;觀察是否形成抗體復(fù)合物,形成了抗體復(fù)合物就表示樣品中存在CRL1蛋白。
CRL1蛋白的多聚核苷酸可用于CRL1蛋白相關(guān)疾病的診斷和治療。在診斷方面,CRL1蛋白的多聚核苷酸可用于檢測CRL1蛋白的表達(dá)與否或在疾病狀態(tài)下CRL1蛋白的異常表達(dá)。如CRL1 DNA序列可用于對活檢標(biāo)本的雜交以判斷CRL1蛋白的表達(dá)異常。雜交技術(shù)包括Southern印跡法,Northern印跡法、原位雜交等。這些技術(shù)方法都是公開的成熟技術(shù),相關(guān)的試劑盒都可從商業(yè)途徑得到。本發(fā)明的多核苷酸的一部分或全部可作為探針固定在微陣列(microarray)或DNA芯片(又稱為“基因芯片”)上,用于分析組織中基因的差異表達(dá)分析和基因診斷。用CRL1蛋白特異的引物進(jìn)行RNA-聚合酶鏈反應(yīng)(RT-PCR)體外擴(kuò)增也可檢測CRL1蛋白的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物。
檢測CRL1基因的突變也可用于診斷CRL1蛋白相關(guān)的疾病。CRL1蛋白突變的形式包括與正常野生型CRL1 DNA序列相比的點突變、易位、缺失、重組和其它任何異常等。可用已有的技術(shù)如Southern印跡法、DNA序列分析、PCR和原位雜交檢測突變。另外,突變有可能影響蛋白的表達(dá),因此用Northern印跡法、Western印跡法可間接判斷基因有無突變。
本發(fā)明的序列對染色體鑒定也是有價值的。簡而言之,根據(jù)本發(fā)明CRL1蛋白的cDNA制備PCR引物(優(yōu)選15-35bp),可以將序列定位于染色體上。然后,將這些引物用于PCR篩選含各條人染色體的體細(xì)胞雜合細(xì)胞。只有那些含有相應(yīng)于引物的人基因的雜合細(xì)胞會產(chǎn)生擴(kuò)增的片段。
一旦序列被定位到準(zhǔn)確的染色體位置,此序列在染色體上的物理位置就可以與基因圖數(shù)據(jù)相關(guān)聯(lián)。這些數(shù)據(jù)可見于例如,V.Mckusick,Mendelian Inheritance inMan(可通過與Johns Hopkins University Welch Medical Library聯(lián)機獲得)。然后可通過連鎖分析,確定基因與業(yè)已定位到染色體區(qū)域上的疾病之間的關(guān)系。
在本發(fā)明的一個實例中,提供了一種分離的多核苷酸,它編碼具有SEQ ID NO2或3所示氨基酸序列的成熟多肽。本發(fā)明的多核苷酸是從人樹突狀細(xì)胞cDNA文庫中分離出的。其序列如SEQ ID NO:1所示,它包含的多核苷酸序列全長為2677個堿基,其開放讀框位于126-2036位,編碼全長為636個氨基酸的人CRL1蛋白(SEQ ID NO:2)。其中,氨基酸1-32位為信號肽。該CRL1蛋白僅有受體的膜外段,無跨膜區(qū),成熟的多肽分子由604個氨基酸殘基組成(SEQ ID NO:2),含有四個位置保守的Cys和WSXWS基序,符合細(xì)胞因子受體超家族膜外段的結(jié)構(gòu)特征,與gp130和G-CSFR高度同源,為一未見報道的屬于gp130亞家族的新型細(xì)胞因子受體。起結(jié)合配體和/或傳導(dǎo)配體生物學(xué)功能的刺激信號,參與免疫調(diào)節(jié)和造血調(diào)控,通過激活或阻斷該受體分子的信號通路,可為治療腫瘤、炎癥、免疫排斥等疾病提供新的治療途徑,因而具有巨大的應(yīng)用前景。
下面結(jié)合具體實施例,進(jìn)一步闡述本發(fā)明。應(yīng)理解,這些實施例僅用于說明本發(fā)明而不用于限制本發(fā)明的范圍。下列實施例中未注明具體條件的實驗方法,通常按照常規(guī)條件如Sambrook等人,分子克隆實驗室手冊(New York:Cold SpringHarbor Laboratory Press,1989)中所述的條件,或按照制造廠商所建議的條件。
實施例1:CRL1受體蛋白cDNA的克隆用Trizol(Gibco公司)提取人樹突狀細(xì)胞總RNA。然后,從總RNA中分離poly(A)mRNA。將poly(A)mRNA經(jīng)逆轉(zhuǎn)錄形成cDNA后,用SuperScriptⅡ克隆試劑盒(購自Gibco)將cDNA片段定向插入到載體的多克隆位點上,轉(zhuǎn)化DH5α細(xì)菌形成cDNA質(zhì)粒文庫。用雙脫氧法測定隨機挑選克隆的5′末端的序列。將測定的cDNA序列與已有的公共DNA序列數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比較,結(jié)果發(fā)現(xiàn)有一個cDNA克隆的DNA序列為新的全長cDNA。通過合成一系列引物對新克隆所含的DNA序列進(jìn)行雙向測定。計算機分析表明,克隆所含的全長cDNA是一個新的cDNA序列(如SEQ ID NO:1所示),編碼一個新的蛋白質(zhì)(如SEQ ID NO:2所示)。此蛋白質(zhì)被命名為CRL1受體蛋白,其編碼基因命名為CRL1受體基因。
CRL1 cDNA為2677bp(圖1和SEQ ID NO:1),含有完整的開放性讀框1911bp,編碼含636氨基酸殘基的多肽(圖2和SEQ ID NO:2)。根據(jù)Kyte-doolitte疏水性分析結(jié)果(圖4),已表明CRL1蛋白含有32個氨基酸殘基組成的信號肽,僅有受體的膜外段,無跨膜區(qū),成熟的多肽分子由604個氨基酸殘基組成(SEQ IDNO:3),含有四個位置保守的Cys和WSXWS基序,符合細(xì)胞因子受體超家族膜外段的結(jié)構(gòu)特征,分子量約為68kD。CRL1蛋白與gp130和G-CSFR高度同源,其中與gp130受體的同源比較見圖3,相同性為20%,相似性為28%。
綜上所述,CRL1蛋白為一未見報道的屬于gp130亞家族的新型細(xì)胞因子受體。實施例2用RT-PCR方法克隆CRL1受體蛋白的編碼序列用Trizol(Gibco公司)提取處于對數(shù)生長期人髓單核細(xì)胞U937細(xì)胞總RNA,取6μg細(xì)胞總RNA與0.5μg Oligo-dT12-18混合,進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄。反轉(zhuǎn)錄體系為20μl,反應(yīng)結(jié)束后加80μl ddH2O進(jìn)行稀釋。PCR擴(kuò)增所用的引物如下有義引物5′-ggcctgccggggtggttcggcttcccgttg-3′(SEQ ID NO:4),反義引物5′-gctttttattagtttgtttatttttgagat-3′(SEQ ID NO:5)。PCR反應(yīng)體積為50μl,其中含反轉(zhuǎn)錄模板10μl、0.4μM引物、0.2μM dNTP和1U ExTaq DNA聚合酶(TakaraInc.),擴(kuò)增參數(shù)為94℃30秒、60℃30秒、72℃45秒,25個循環(huán)后PCR產(chǎn)物行2%瓊脂糖凝膠電泳初步確認(rèn)。DNA序列分析結(jié)果表明該PCR產(chǎn)物的編碼DNA序列與SEQ ID NO:1所示的1-2649bp完全相同。實施例3 CRL1的Northern印跡雜交分析按如下常規(guī)方法進(jìn)行Northern印跡待檢濾膜置于10ml經(jīng)68℃預(yù)熱的雜交液,在雜交爐(Bellco)中于68℃預(yù)雜交30分鐘;將標(biāo)記好的cDNA探針于95~100℃變性2~5分鐘,置冰上迅速冷卻后加入雜交液(cDNA探針終濃度為2~10ng/ml或1~2×106cpm/ml),充分混勻,于68℃雜交2小時。雜交結(jié)束后,濾膜用2×SSC、0.05%SDS室溫淋洗數(shù)次,繼振蕩沖洗30~40分鐘,其間更換洗液數(shù)次。隨后用0.1×SSC、0.1%SDS于50℃振蕩沖洗20~40分鐘。最后濾膜用塑料保鮮膜包裹,于-70℃曝光X線膠片24~48小時。
結(jié)果顯示,CRL1蛋白在胸腺、扁桃體、脾臟和淋巴結(jié)等免疫組織中優(yōu)勢表達(dá),提示其與造血和免疫相關(guān)。在樹突狀細(xì)胞和人髓單核細(xì)胞U937等細(xì)胞中通過Northern檢測發(fā)現(xiàn)有4.5kb和2.5kb兩種轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物,提示存在其相應(yīng)的膜結(jié)合型和可溶型受體。鑒于其結(jié)構(gòu)的相似性,提示該新型的細(xì)胞因子受體CRL1與造血和免疫功能的調(diào)節(jié)相關(guān)。實施例4 CRL1受體重組表達(dá)和純化在該實施例中,以實施例2中的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物為模板,用序列如下的5′和3′端的PCR寡核苷酸引物進(jìn)行擴(kuò)增,獲得人CRL1 DNA作為插入片段。
PCR反應(yīng)中使用的5′端寡核苷酸引物序列為5′-cgggatccCAGGGCAGCGCCGGG-3′(SEQ ID NO:6)該引物含有BamHⅠ限制性內(nèi)切酶的酶切位點,在該酶切位點之后是由編碼CRL1成熟分子第一個氨基酸開始的部分編碼序列;3′端引物序列為5′-ggaattcggttcaggccagaacctg-3′(SEQ ID NO.7),該引物含有EcoRⅠ限制性內(nèi)切酶的酶切位點、翻譯終止子和人CRL1的部分編碼序列。
人CRL1受體cDNA PCR產(chǎn)物純化后經(jīng)BamHⅠ/EcoRⅠ酶切再與質(zhì)粒pUC18按常規(guī)方法重組并轉(zhuǎn)化至感受態(tài)大腸桿菌DH5α,挑取陽性克隆鑒定后純化并測序(ABI公司的377型測序儀,BigDye Terminator試劑盒,PE公司)。將正確序列的人CRL1受體cDNA BamHⅠ/EcoRⅠ酶切片段克隆至表達(dá)載體pGEX-2T(Pharmacia公司),形成載體pGEX-2T-CRL1,然后轉(zhuǎn)化人DH5α。
挑表達(dá)CRL1的陽性DH5α克隆接種于100ml 2×YTA培養(yǎng)基中,37℃300rpm振蕩培養(yǎng)12-15hr,1∶10稀釋于預(yù)熱的2×YTA培養(yǎng)基繼續(xù)振蕩培養(yǎng)1.5hr,加100mM IPTG至0.1mM后30℃誘導(dǎo)2-6hr,5,000g 4℃離心10min去上清,置冰上用50ml 1×PBS(0.14M NaCl,2.7 mM KCl,10.1mM Na2HPO4,1.8mM KH2PO4,pH7.3)重懸,超聲(B.Braun Labsonic U)破碎后再加入20%TritonX-100至1%輕搖30min,然后12,000g 4℃離心10min,上清用0.8μm濾膜過濾后,過1ml 50%谷胱甘肽Sepharose 4B層析柱,1×PBS充分洗滌后,加入500ul谷胱甘肽洗脫緩沖液(10 mM谷胱甘肽,50 mM Tris-HCl,pH 8.0)室溫靜置30分鐘后收集洗脫液,重復(fù)洗脫2-3次,得到N端含GST的人CRL1融合蛋白,經(jīng)thrombin(Sigma)酶切去除GST后得到CRL1蛋白,分子量為68kD。
用Edams水解法進(jìn)行N-端氨基酸序列分析,證實其N端序列與SEQ ID NO3所示的N端序列相符。實施例5抗CRL1受體抗體的產(chǎn)生將實施例4中獲得的重組人CRL1受體用來免疫動物以產(chǎn)生抗體,具體方法如下。重組分子用層析法進(jìn)行分離后備用。也可用SDS-PAGE凝膠電泳法進(jìn)行分離,將電泳條帶從凝膠中切下,并用等體積的完全Freund′s佐劑乳化。用50-100μg/0.2ml乳化過的蛋白,對小鼠進(jìn)行腹膜內(nèi)注射。14天后,用非完全Freund′s佐劑乳化的同樣抗原,對小鼠以50-100μg/0.2ml的劑量進(jìn)行腹膜內(nèi)注射以加強免疫。每隔14天進(jìn)行一次加強免疫,至少進(jìn)行三次。獲得的抗血清的特異反應(yīng)活性用它在體外沉淀人CRL1受體蛋白基因翻譯產(chǎn)物的能力加以評估。結(jié)果發(fā)現(xiàn),抗體可特異性地與本發(fā)明蛋白發(fā)生結(jié)合。
在本發(fā)明提及的所有文獻(xiàn)都在本申請中引用作為參考,就如同每一篇文獻(xiàn)被單獨引用作為參考那樣。此外應(yīng)理解,在閱讀了本發(fā)明的上述講授內(nèi)容之后,本領(lǐng)域技術(shù)人員可以對本發(fā)明作各種改動或修改,這些等價形式同樣落于本申請所附權(quán)利要求書所限定的范圍。
序列表(1)一般信息(ⅱ)發(fā)明名稱新的細(xì)胞因子受體、其編碼序列及用途(ⅲ)序列數(shù)目7(2)SEQ ID NO:1的信息(ⅰ)序列特征(A)長度2677bp(B)類型核酸(C)鏈性雙鏈(D)拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)線性(ⅱ)分子類型cDNA(ⅹⅰ)序列描述SEQ ID NO:1ggcctgccgg ggtggttcgg cttcccgttg ccgcctcggg cgctgtaccc agagctggaa 60gaggagcagc gcggccgcgc ggacccggca aggctgggcc ggactcgggg ctcccgaggg 120acgccATGCG GGGAGGCAGG GGCGCCCCTT TCTGGCTGTG GCCGCTGCCC AAGCTGGCGC 180TGCTGCCTCT GTTGTGGGTG CTTTTCCAGC GGACGCGTCC CCAGGGCAGC GCCGGGCCAC 240TGCAGTGCTA CGGAGTTGGA CCCTTGGGCG ACTTGAACTG CTCGTGGGAG CCTCTTGGGG 300ACCTGGGAGC CCCCTCCGAG TTACACCTCC AGAGCCAAAA GTACCGTTCC AACAAAACCC 360AGACTGTGGC AGTGGCAGCC GGACGGAGCT GGGTGGCCAT TCCTCGGGAA CAGCTCACCA 420TGTCTGACAA ACTCCTTGTC TGGGGCACTA AGGCAGGCCA GCCTCTCTGG CCCCCCGTCT 480TCGTGAACCT AGAAACCCAA ATGAAGCCAA ACGCCCCCCG GCTGGGCCCT GACGTGGACT 540TTTCCGAGGA TGACCCCCTG GAGGCCACTG TCCATTGGGC CCCACCTACA TGGCCATCTC 600ATAAAGTTCT GATCTGCCAG TTCCACTACC GAAGATGTCA GGAGGCGGCC TGGACCCTGC 660TGGAACCGGA GCTGAAGACC ATACCCCTGA CCCCTGTTGA GATCCAAGAT TTGGAGCTAG 720CCACTGGCTA CAAAGTGTAT GGCCGCTGCC GGATGGAGAA AGAAGAGGAT TTGTGGGGCG 780AGTGGAGCCC CATTTTGTCC TTCCAGACAC CGCCTTCTGC TCCAAAAGAT GTGTGGGTAT 840CAGGGAACCT CTGTGGGACG CCTGGAGGAG AGGAACCTTT GCTTCTATGG AAGGCCCCAG 900GGCCCTGTGT GCAGGTGAGC TACAAAGTCT GGTTCTGGGT TGGAGGTCGT GAGCTGAGTC 960CAGAAGGAAT TACCTGCTGC TGCTCCCTAA TTCCCAGTGG GGCGGAGTGG GCCAGGGTGT 1020CCGCTGTCAA CGCCACAAGC TGGGAGCCTC TCACCAACCT CTCTTTGGTC TGCTTGGATT 1080CAGCCTCTGC CCCCCGTAGC GTGGCAGTCA GCAGCATCGC TGGGAGCACG GAGCTACTGG 1140TGACCTGGCA ACCGGGGCCT GGGGAACCAC TGGAGCATGT AGTGGACTGG GCTCGAGATG 1200GGGACCCCCT GGAGAAACTC AACTGGGTCC GGCTTCCCCC TGGGAACCTC AGTGCTCTGT 1260TACCAGGGAA TTTCACTGTC GGGGTCCCCT ATCGAATCAC TGTGACCGCA GTCTCTGCTT 1320CAGGCTTGGC CTCTGCATCC TCCGTCTGGG GGTTCAGGGA GGAATTAGCA CCCCTAGTGG 1380GGCCAACGCT TTGGCGACTC CAAGATGCCC CTCCAGGGAC CCCCGCCATA GCGTGGGGAG 1440AGGTCCCAAG GCACCAGCTT CGAGGCCACC TCACCCACTA CACCTTGTGT GCACAGAGTG 1500GAACCAGCCC CTCCGTCTGC ATGAATGTGA GTGGCAACAC ACAGAGTGTC ACCCTGCCTG 1560ACCTTCCTTG GGGTCCCTGT GAGCTGTGGG TGACAGCATC TACCATCGCT GGACAGGGCC 1620CTCCTGGTCC CATCCTCCGG CTTCATCTAC CAGATAACAC CCTGAGGTGG AAAGTTCTGC 1680CGGGCATCCT ATTCTTGTGG GGCTTGTTCC TGTTGGGGTG TGGCCTGAGC CTGGCCACCT 1740CTGGAAGGTG CTACCACCTA AGGCACAAAG TGCTGCCCCG CTGGGTCTGG GAGAAAGTTC 1800CTGATCCTGC CAACAGCAGT TCAGGCCAGC CCCACATGGA GCAAGTACCT GAGGCCCAGC 1860CCCTTGGGGA CTTGCCCATC CTGGAAGTGG AGGAGATGGA GCCCCCGCCG GTTATGGAGT 1920CCTCCCAGCC CGCCCAGGCC ACCGCCCCGC TTGACTCTGG GTATGAGAAG CACTTCCTGC 1980CCACACCTGA GGAGCTGGGC CTTCTGGGGC CCCCCAGGCC ACAGGTTCTG GCCTGAacca 2040cacgtctggc tgggggctgc cagccaggct agagggatgc tcatgcaggt tgcaccccag 2100tcctggatta gccctcttga tggatgaaga cactgaggac tcagagaggc tgagtcactt 2160acctgaggac acccagccag gcagagctgg gattgaagga cccctataga gaagggcttg 2220gcccccatgg ggaagacacg gatggaaggt ggagcaaagg aaaatacatg aaattgagag 2280tggcagctgc ctgccaaaat ctgttccgct gtaacagaac tgaatttgga ccccagcaca 2340gtggctcacg cctgtaatcc cagcactttg gcaggccaag gtggaaggat cacttagagc 2400taggagtttg agaccagcct gggcaatata gcaagacccc tcactacaaa aataaaacat 2460caaaaacaaa aacaattagc tgggcatgat ggcacacacc tgtagtccga gccacttggg 2520aggctgaggt gggaggatcg gttgagccca ggagttcgaa gctgcaggga cctctgattg 2580caccactgca ctccaggctg ggtaacagaa tgagacctta tctcaaaaat aaacaaacta 2640ataaaaagca aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaa 2677(2)SEQ ID NO:2的信息(ⅰ)序列特征(A)長度636個氨基酸(B)類型氨基酸(D)拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)線性(ⅱ)分子類型多肽(ⅹⅰ)序列描述SEQ ID NO:2:MRGGRGAPFW LWPLPKLALL PLLWVLFQRT RPQGSAGPLQ CYGVGPLGDL 50NCSWEPLGDL GAPSELHLQS QKYRSNKTQT VAVAAGRSWV AIPREQLTMS 100DKLLVWGTKA GQPLWPPVFV NLETQMKPNA PRLGPDVDFS EDDPLEATVH 150WAPPTWPSHK VLICQFHYRR CQEAAWTLLE PELKTIPLTP VEIQDLELAT 200GYKVYGRCRM EKEEDLWGEW SPILSFQTPP SAPKDVWVSG NLCGTPGGEE 250PLLLWKAPGP CVQVSYKVWF WVGGRELSPE GITCCCSLIP SGAEWARVSA 300VNATSWEPLT NLSLVCLDSA SAPRSVAVSS IAGSTELLVT WQPGPGEPLE 350HVVDWARDGD PLEKLNWVRL PPGNLSALLP GNFTVGVPYR ITVTAVSASG 400LASASSVWGF REELAPLVGP TLWRLQDAPP GTPAIAWGEV PRHQLRGHLT 450HYTLCAQSGT SPSVCMNVSG NTQSVTLPDL PWGPCELWVT ASTIAGQGPP 500GPILRLHLPD NTLRWKVLPG ILFLWGLFLL GCGLSLATSG RCYHLRHKVL 550PRWVWEKVPD PANSSSGQPH MEQVPEAQPL GDLPILEVEE MEPPPVMESS 600QPAQATAPLD SGYEKHFLPT PEELGLLGPP RPQVLA 636(2)SEQ ID NO:3的信息(ⅰ)序列特征(A)長度604個氨基酸(B)類型氨基酸(D)拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)線性(ⅱ )分子類型多肽(ⅹⅰ)序列描述SEQ ID NO:3:QGSAGPLQCY GVGPLGDLNC SWEPLGDLGA PSELHLQSQK YRSNKTQTVA 50VAAGRSWVAI PREQLTMSDK LLVWGTKAGQ PLWPPVFVNL ETQMKPNAPR 100LGPDVDFSED DPLEATVHWA PPTWPSHKVL ICQFHYRRCQ EAAWTLLEPE 150LKTIPLTPVE IQDLELATGY KVYGRCRMEK EEDLWGEWSP ILSFQTPPSA 200PKDVWVSGNL CGTPGGEEPL LLWKAPGPCV QVSYKVWFWV GGRELSPEGI 250TCCCSLIPSG AEWARVSAVN ATSWEPLTNL SLVCLDSASA PRSVAVSSIA 300GSTELLVTWQ PGPGEPLEHV VDWARDGDPL EKLNWVRLPP GNLSALLPGN 350FTVGVPYRIT VTAVSASGLA SASSVWGFRE ELAPLVGPTL WRLQDAPPGT 400PAIAWGEVPR HQLRGHLTHY TLCAQSGTSP SVCMNVSGNT QSVTLPDLPW 450GPCELWVTAS TIAGQGPPGP ILRLHLPDNT LRWKVLPGIL FLWGLFLLGC 500GLSLATSGRC YHLRHKVLPR WVWEKVPDPA NSSSGQPHME QVPEAQPLGD 550LPILEVEEME PPPVMESSQP AQATAPLDSG YEKHFLPTPE ELGLLGPPRP 600QVLA 604(2)SEQ ID NO:4的信息(ⅰ)序列特征(A)長度30堿基(B)類型核酸(C)鏈性單鏈(D)拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)線性(ⅱ)分子類型寡核苷酸(ⅹⅰ)序列描述SEQ ID NO:4:GGCCTGCCGG GGTGGTTCGG CTTCCCGTTG 30(2)SEQ ID NO:5的信息(ⅰ)序列特征(A)長度30堿基(B)類型核酸(C)鏈性單鏈(D)拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)線性(ⅱ)分子類型寡核苷酸(ⅹⅰ)序列描述SEQ ID NO:5:GCTTTTTATT AGTTTGTTTA TTTTTGAGAT30(2)SEQ ID NO:6的信息(ⅰ)序列特征(A)長度23堿基(B)類型核酸(C)鏈性單鏈(D)拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)線性(ⅱ)分子類型寡核苷酸(ⅹⅰ)序列描述SEQ ID NO:6:CGGGATCCCA GGGCAGCGCC GGG 23(2)SEQ ID NO:7的信息(ⅰ)序列特征
(A)長度25堿基(B)類型核酸(C)鏈性單鏈(D)拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)線性(ⅱ)分子類型寡核苷酸(ⅹⅰ)序列描述SEQ ID NO:7:GGAATTCGGT TCAGGCCAGA ACCTG
權(quán)利要求
1.一種分離的人CRL1多肽,其特征在于,它包含具有SEQ ID NO:2或3氨基酸序列的多肽、或其保守性變異多肽、或其活性片段、或其活性衍生物。
2.如權(quán)利要求1所述的多肽,其特征在于,該多肽是具有SEQ ID NO:2或3氨基酸序列的多肽。
3.一種分離的多核苷酸,其特征在于,它包含一核苷酸序列,該核苷酸序列與選自下組的一種核苷酸序列有至少70%相同性(a)編碼如權(quán)利要求1和2所述多肽的多核苷酸;(b)與多核苷酸(a)互補的多核苷酸。
4.如權(quán)利要求3所述的多核苷酸,其特征在于,該多核苷酸編碼具有SEQ ID NO:2或3所示氨基酸序列的多肽。
5.如權(quán)利要求3所述的多核苷酸,其特征在于,該多核苷酸的序列選自下組的一種(a)具有SEQ ID NO:1中126-2036位的序列;(b)具有SEQ ID NO:1中251-2036位的序列;(c)具有SEQ ID NO:1中1-2677位的序列。
6.一種載體,其特征在于,它含有權(quán)利要求3所述的多核苷酸。
7.一種遺傳工程化的宿主細(xì)胞,其特征在于,它含有權(quán)利要求6所述的載體。
8.一種具有人CRL1蛋白活性的多肽的制備方法,其特征在于,該方法包含(a)在適合表達(dá)人CRL1蛋白的條件下,培養(yǎng)權(quán)利要求7所述的宿主細(xì)胞;(b)從培養(yǎng)物中分離出具有人CRL1蛋白活性的多肽。
9.一種能與權(quán)利要求1所述的人CRL1蛋白特異性結(jié)合的抗體。
10.一種核酸分子,它含有權(quán)利要求3所述的多核苷酸中連續(xù)的10-2677個核苷酸。
11.一種檢測樣品中是否存在CRL1蛋白的方法,其特征在于,包括將樣品與權(quán)利要求9所述的抗體接觸,觀察是否形成抗體復(fù)合物,形成了抗體復(fù)合物就表示樣品中存在CRL1蛋白。
12.如權(quán)利要求1所述的多肽的用途,其特征在于,它被用于篩選促進(jìn)人CRL1蛋白活性的激動劑,或者篩選抑制人CRL1蛋白活性的拮抗劑、或者被用于肽指紋圖譜鑒定。
13.一種如權(quán)利要求10所述的核酸分子的用途,其特征在于,它被作為引物用于PCR擴(kuò)增反應(yīng),或者作為探針用于雜交反應(yīng),或者用于制造基因芯片或微陣列。
14.一種藥物組合物,其特征在于,它含有安全有效量的權(quán)利要求1所述的多肽或權(quán)利要求9所述的抗體以及藥學(xué)上可接受的載體。
全文摘要
本發(fā)明提供了一種新的細(xì)胞因子受體-CRL1受體,編碼CRL1受體的多核苷酸和經(jīng)重組技術(shù)產(chǎn)生這種CRL1受體的方法。CRL1受體是gp130的同源分子。本發(fā)明還公開了編碼這種CRL1受體的多核苷酸的用途。本發(fā)明還公開了此CRL1蛋白受體用于治療多種疾病的方法,如用于腫瘤、炎癥、免疫排斥等疾病的治療。
文檔編號C12N15/11GK1299828SQ99124269
公開日2001年6月20日 申請日期1999年12月16日 優(yōu)先權(quán)日1999年12月16日
發(fā)明者曹雪濤, 章衛(wèi)平, 何龍, 萬濤, 李楠, 袁正隆, 陶群 申請人:上海華晨生物技術(shù)研究所
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