專利名稱:一種香菇香九菌種的ssr標(biāo)記指紋圖譜與應(yīng)用的制作方法
技術(shù)領(lǐng)域:
本發(fā)明屬于香菇菌種的檢測領(lǐng)域,特別涉及一種香菇香九菌種的SSR標(biāo)記指紋圖譜與應(yīng)用。
背景技術(shù):
我國香菇產(chǎn)量已從1983年的I. 95萬噸迅速發(fā)展到2005年的242萬噸,占全球香菇總產(chǎn)量的70%以上,改寫了世界食用菌產(chǎn)量的排行榜,并不斷縮小與排行第一的雙孢蘑菇產(chǎn)量差距,有專家預(yù)測,由于中國香菇產(chǎn)業(yè)的迅猛發(fā)展,在近10年內(nèi)其將成為世界產(chǎn)量 最高的食用菌。中國香菇以其驚人的發(fā)展速度,優(yōu)質(zhì)的品質(zhì)及低廉的成本為世界菇業(yè)人士矚目,中國香菇已風(fēng)靡世界。優(yōu)質(zhì)菌種在香菇單產(chǎn)和質(zhì)量中的貢獻(xiàn)率舉足輕重,這決定了香菇菌種在香菇產(chǎn)業(yè)中的重要地位。1999年我國簽署了《國際植物新品種保護(hù)法》,這不僅要求我們尊重其它國家的品種知識產(chǎn)權(quán),同時也要加強(qiáng)保護(hù)我們國家自己的品種知識產(chǎn)權(quán),為了建立食用菌新品種登記制度來真正保護(hù)我國的品種產(chǎn)權(quán),必須首先建立成熟的品種鑒定技術(shù),為新品種登記奠定基礎(chǔ)。尤其日本2004年4月I日開始實(shí)行《種苗法修正案》,對我國食用菌尤其是香菇的出口構(gòu)成了極大的威脅。就國內(nèi)而言,香菇栽培菌種“同種異名,異種同名”的現(xiàn)象,不僅給菇農(nóng)帶來了極大的損失,影響了他們的栽培積極性,也極大地影響了中國香菇的快速發(fā)展;而且,隨著大規(guī)模的工廠化栽培方式的出現(xiàn),對香菇栽培菌株質(zhì)量的要求越來越高,需要發(fā)展更為簡便、快速、準(zhǔn)確的菌株鑒定技術(shù),以保證每批次的用種都準(zhǔn)確無誤。面對這種局勢,就需要我們進(jìn)一步加快菌種鑒定技術(shù)的研究,在香菇的研究中引進(jìn)更為有效的菌種鑒定體系。
發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明所要解決的技術(shù)問題是提供一種香菇香九菌種的SSR標(biāo)記指紋圖譜及其構(gòu)建方法與應(yīng)用,該指紋圖譜與常規(guī)形態(tài)學(xué)檢測、拮抗試驗、出菇試驗相比,具有檢測時間短,準(zhǔn)確性高,重復(fù)性好的優(yōu)點(diǎn)。本發(fā)明的一種香菇香九菌種的SSR標(biāo)記指紋圖譜,該指紋圖譜由7對SSR標(biāo)記組成,是基于香菇基因組簡單重復(fù)序列片段開發(fā)SSR引物,擴(kuò)增帶型好,重復(fù)性高的SSR引物,標(biāo)記詳細(xì)信息如表I。表I SSR標(biāo)記詳細(xì)信息列表
權(quán)利要求
1.一種香菇香九菌種的SSR標(biāo)記指紋圖譜,其特征在于該指紋圖譜由7對基于香菇基因組序列開發(fā)的SSR標(biāo)記的特異等位片段組合而成,7對SSR標(biāo)記在香菇香九菌種上擴(kuò)增的等位片段信息具體為 Le_fp0001的等位片段的數(shù)量為1,等位片段I相對于50bp DNA ladder的分子量為600bp ; Le_fp0002的等位片段的數(shù)量為1,等位片段3相對于50bp DNA ladder的分子量為270bp ; Le_fp0003的等位片段的數(shù)量為1,等位片段I相對于50bp DNA ladder的分子量為900bp Le_fp0004的等位片段的數(shù)量為O ; Le_fp0005的等位片段的數(shù)量為1,等位片段6相對于50bp DNA ladder的分子量為530bp ; Le_fp0006的等位片段的數(shù)量為1,等位片段2相對于50bp DNA ladder的分子量為780bp ; Le_fp0007的等位片段的數(shù)量為1,等位片段I相對于50bp DNA ladder的分子量為700bp。
2.根據(jù)權(quán)利要求I所述的一種香菇香九菌種的SSR標(biāo)記指紋圖譜,其特征在于所述7對SSR標(biāo)記等位片段的特異編號組合為1310621。
3.—種如權(quán)利要求I所述的香菇香九菌種的SSR標(biāo)記指紋圖譜的應(yīng)用,其特征在于應(yīng)用于鑒定香菇香九菌種的特異等位變異組合以及鑒定香菇香九菌種相對于其他國審香菇品種的特異性。
全文摘要
本發(fā)明涉及一種香菇香九菌種的SSR標(biāo)記指紋圖譜與應(yīng)用,該指紋圖譜由7對基于香菇基因組序列開發(fā)的SSR標(biāo)記的特異等位片段組合而成。應(yīng)用包括對香菇菌種進(jìn)行SSR標(biāo)記擴(kuò)增,將得到的帶型與指紋圖譜對照,與該指紋圖譜一致即為香菇香九菌種。本發(fā)明與常規(guī)形態(tài)學(xué)檢測、拮抗試驗、出菇試驗相比,具有檢測時間短、準(zhǔn)確性高、可重復(fù)性好的優(yōu)點(diǎn),在收集的我國25個國審的香菇主栽菌種中具有香菇香九菌種的專一性。
文檔編號C12Q1/68GK102936627SQ201210465639
公開日2013年2月20日 申請日期2012年11月16日 優(yōu)先權(quán)日2012年11月16日
發(fā)明者張丹, 巫萍, 譚琦, 尚曉冬, 宋春艷, 章爐軍, 鮑大鵬, 楊慧 申請人:上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院