專利名稱：一種寡核苷酸標(biāo)簽及其應(yīng)用的制作方法
技術(shù)領(lǐng)域：
本發(fā)明涉及一種寡核苷酸標(biāo)簽及其應(yīng)用。
背景技術(shù)：
與已知生物基因組序列無相似性(同源性)的寡核苷酸標(biāo)簽(oligonucleotidetag)在現(xiàn)代分子生物學(xué)應(yīng)用中扮演越來越重 要的作用。例如，在RNA模板特異性PCR擴(kuò)增(RS-PCR)中，就是在反轉(zhuǎn)錄中使用了一種5’端帶有一段寡核苷酸標(biāo)簽的反轉(zhuǎn)錄引物，在完成反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)后，以這段寡核苷酸標(biāo)簽為引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增，就可以只擴(kuò)增RNA的反轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物，而不會擴(kuò)增污染的基因組DNA，實(shí)現(xiàn)RNA模板的特異性PCR擴(kuò)增，避免了假陽性的出現(xiàn)。其中，所使用的寡核苷酸標(biāo)簽必須與該生物基因組沒有顯著的序列相似性。在單核苷酸多態(tài)性分型(SNP genotyping)研究中，也經(jīng)常使用一種“tag-antitag”系統(tǒng)。即，在核酸擴(kuò)增中將每種可能的SNP類型和一種特定的寡核苷酸標(biāo)簽相連接，這種帶有寡核苷酸標(biāo)簽的SNP序列將會和DNA微陣列或微球上的tag互補(bǔ)序列(antitag)相結(jié)合,從而判別出是否存在某種類型的SNP。與生物基因組無顯著相似性的寡核苷酸標(biāo)簽還被廣泛應(yīng)用于基因芯片中的探針臂和多種高通量檢測技術(shù)的接頭、多種多重檢測技術(shù)的“條碼”(barCOde)等等，這些現(xiàn)代高通量檢測技術(shù)的檢測效果高度依賴于所用寡核苷酸標(biāo)簽的質(zhì)量，其中衡量寡核苷酸標(biāo)簽質(zhì)量的最重要的指標(biāo)就是該標(biāo)簽與生物基因組的相似性是否足夠低，如果相似性不夠低，就會出現(xiàn)交叉雜交、非特異性擴(kuò)增等問題，嚴(yán)重干擾這些檢測技術(shù)的準(zhǔn)確性。

發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明的一個(gè)目的是提供一種與人基因組相似性低的寡核苷酸。本發(fā)明所提供的寡核苷酸，其核苷酸序列如SEQ ID NO 1所示。上述寡核苷酸在以RNA為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增中的應(yīng)用也屬于本發(fā)明的保護(hù)范圍。上述寡核苷酸在檢測寡核苷酸多態(tài)性中的應(yīng)用也屬于本發(fā)明的保護(hù)范圍。上述寡核苷酸在作為基因芯片中的探針臂中的應(yīng)用也屬于本發(fā)明的保護(hù)范圍。上述寡核苷酸在作為高通量檢測技術(shù)的接頭中的應(yīng)用也屬于本發(fā)明的保護(hù)范圍。上述寡核苷酸在作為多重檢測技術(shù)的條碼中的應(yīng)用也屬于本發(fā)明的保護(hù)范圍。實(shí)驗(yàn)證明，本發(fā)明得到的寡核苷酸標(biāo)簽與人基因組的相似性明顯低于對照，因此本發(fā)明標(biāo)簽在基因芯片中的探針臂、多種高通量檢測技術(shù)的接頭、多種多重檢測技術(shù)的“條碼”(barcode)等領(lǐng)域具有廣闊的應(yīng)用前景。


圖I為PCR擴(kuò)增結(jié)果。圖2為雜交結(jié)果
具體實(shí)施例方式下述實(shí)施例中所使用的實(shí)驗(yàn)方法如無特殊說明，均為常規(guī)方法。下述實(shí)施例中所用的材料、試劑等，如無特殊說明，均可從商業(yè)途徑得到。實(shí)施例I、寡核苷酸的制備及驗(yàn)證
權(quán)利要求
1.一種寡核苷酸，其核苷酸序列如SEQ ID N0:1所示。
2.權(quán)利要求I所述的寡核苷酸在以RNA為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增中的應(yīng)用。
3.權(quán)利要求I所述的寡核苷酸在檢測寡核苷酸多態(tài)性中的應(yīng)用。
4.權(quán)利要求I所述的寡核苷酸在作為基因芯片中的探針臂中的應(yīng)用。
5.權(quán)利要求I所述的寡核苷酸在作為高通量檢測技術(shù)的接頭中的應(yīng)用。
6.權(quán)利要求I所述的寡核苷酸在作為多重檢測技術(shù)的條碼中的應(yīng)用。
全文摘要
本發(fā)明公開了一種寡核苷酸標(biāo)簽。本發(fā)明的寡核苷酸，其核苷酸序列如SEQ ID NO1所示。實(shí)驗(yàn)證明，本發(fā)明得到的寡核苷酸標(biāo)簽與人基因組的相似性明顯低于對照，因此本發(fā)明標(biāo)簽在基因芯片中的探針臂、多種高通量檢測技術(shù)的接頭、多種多重檢測技術(shù)的“條碼”(barcode)等領(lǐng)域具有廣闊的應(yīng)用前景。
文檔編號C12N15/11GK102732512SQ20121009987
公開日2012年10月17日 申請日期2012年4月6日 優(yōu)先權(quán)日2011年4月8日
發(fā)明者孫義民, 張亮, 張巖, 楊萍 申請人:博奧生物有限公司, 清華大學(xué)