專利名稱:可用于分離建鯉、黃河鯉和建鯉正交群體的試劑盒的制作方法
技術(shù)領域:
本發(fā)明涉及魚類育種領域,尤其涉及一種可用于分離建鯉、黃河鯉和建鯉正交群體的試劑盒,是一種用于魚混雜群體分離的技術(shù)。
背景技術(shù):
在鯉生產(chǎn)中種質(zhì)混雜現(xiàn)象比較嚴重,混雜種質(zhì)的有效利用率更低。因此,從混雜的 種質(zhì)中鑒別、分離種質(zhì)成為解決種質(zhì)混雜問題的一個重要且必須的途徑。因而,簡單、便捷 的可用于解決混雜種質(zhì)分離的試劑盒的開發(fā)顯得很重要。因此,開發(fā)一種可用于分離建鯉、 黃河鯉和建鯉正交群體的試劑盒是解決育種和生產(chǎn)實踐中造成種質(zhì)混雜現(xiàn)象的有效方法。
發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明的目的是針對建鯉、黃河鯉和建鯉正交群體的分離種質(zhì)問題,提供一種簡 單、便捷、可靠的用于分離建鯉、黃河鯉和建鯉正交群體的試劑盒,以克服現(xiàn)有技術(shù)的不足。本發(fā)明的目的通過以下技術(shù)方案來實現(xiàn)
一種可用于分離建鯉、黃河鯉和建鯉正交群體的試劑盒,所述試劑盒的PCR (聚合酶鏈 式反應)反應體系由分離包裝的IOX擴增緩沖液lml、25mmol/L的Mg2+lml、各2mmol/L的 dNTP 混合物 800ul、IOmmo 1/L 的上游引物 5,一>3,GTGCCTCTTATTGCTTTCTACC 和 IOmmol/ L 的下游引物 5,—>3,GAAACATCTCGCTCGGACTT 各 60ul、5U/ul 的 TaqDNA 聚合酶 30ul、 CldH2Olml、100ng/ul的模板野生型DNA和lOOng/ul的模板突變型DNA各15ul組成,所述試 劑盒還包括試劑盒使用說明書、野生型序列圖和突變型序列圖。本發(fā)明所述的試劑盒采用的分離方法包括
1)獲取建鯉、黃河鯉和建鯉正交Fl代群體的血液,并提取血液中的DNA樣本;
2)將步驟1)中提取的DNA樣本通過本發(fā)明所述的試劑盒進行PCR(聚合酶鏈式反應) 反應,獲得的PCR產(chǎn)物用質(zhì)量濃度為8%的非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳并結(jié)合goldview顯 色進行檢測,然后回收該PCR產(chǎn)物,送往測序公司進行核苷酸序列檢測;
3)將步驟2)得到的核苷酸序列檢測結(jié)果與本發(fā)明所述的試劑盒中提供的序列圖進行 對照,根據(jù)給定的對照(野生型堿基C,突變型為CA),鑒別并分離出突變型或野生型的種質(zhì) 資源。本發(fā)明的有益效果在于能夠方便、快捷的從建鯉、黃河鯉和建鯉正交混合群體中 分離出建鯉,且概念為67. 6%,分離出黃河鯉和建鯉正交Fl代的概率為100%。由于黃河鯉 和建鯉正交Fl代的自交后代可遺傳突變型標記,故可用于這種混雜群體的種質(zhì)分離,且突 變型為自交后代的概率也為100%。
具體實施例方式本發(fā)明實施例所述的一種可用于分離建鯉、黃河鯉和建鯉正交群體的試劑盒, 其中,試劑盒的PCR (聚合酶鏈式反應)反應體系由分離包裝的IOX擴增緩沖液1ml、25mmol/L 的 Mg2+Iml、各 2mmol/L 的 dNTP 混合物 800ul、IOmmo 1/L 的上游引物 5,一>3, GTGCCTCTTATTGCTTTCTACC 和 10mmol/L 的下游引物 5,一>3,GAAACATCTCGCTCGGACTT 各 60ul、5U/ul 的 TaqDNA 聚合酶 30ul、ddH201ml、100ng/ul 的模板野生型 DNA 和 100ng/ul 的 模板突變型DNA各15ul組成,所述試劑盒還包括試劑盒使用說明書、野生型序列圖和突變 型序列圖。本發(fā)明實施例所述的試劑盒采用的分離方法包括 1)獲取建鯉、黃河鯉和建鯉正交Fl代群體的血液,并提取血液中的DNA樣本;
2)將步驟1)中提取的DNA樣本通過本發(fā)明所述的試劑盒進行PCR(聚合酶鏈式反應) 反應,獲得的PCR產(chǎn)物用質(zhì)量濃度為8%的非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳并結(jié)合goldview顯 色進行檢測,然后回收該PCR產(chǎn)物,送往測序公司進行核苷酸序列檢測;
3)將步驟2)得到的核苷酸序列檢測結(jié)果與本發(fā)明所述的試劑盒中提供的序列圖進行 對照,根據(jù)給定的對照(野生型堿基C,突變型為CA),鑒別并分離出突變型或野生型的種質(zhì) 資源。其中,步驟2)中PCR (聚合酶鏈式反應)反應步驟為94°C預變性3min ;94°C變性 20s ;56°C退火溫度20s ;72°C延伸30s ;33個循環(huán);72°C再延伸IOmin。本發(fā)明根據(jù)已獲取的能夠從建鯉、黃河鯉和建鯉的正交Fl代混合群體中進行種 質(zhì)鑒別的遺傳標記,結(jié)合遺傳標記的檢測過程進行系統(tǒng)集成,做成試劑盒??蓪⒋龣z測個體 提取血液DNA,并進行質(zhì)量檢測,質(zhì)量檢測后,即可通過試劑盒獲取目的序列,并與試劑盒中 提供的序列圖進行序列比對,確定突變型和野生型,從而達到方便、快捷分離種質(zhì)資源的目 的。本發(fā)明能夠方便、快捷的從建鯉、黃河鯉和建鯉正交混合群體中分離出建鯉,且概念為 67. 6%,分離出黃河鯉和建鯉正交Fl代的概率為100%。由于黃河鯉和建鯉正交Fl代的自交 后代可遺傳突變型標記,故可用于這種混雜群體的種質(zhì)分離,且突變型為自交后代的概率 也為100%。
權(quán)利要求
一種可用于分離建鯉、黃河鯉和建鯉正交群體的試劑盒,其特征在于所述試劑盒的PCR反應體系由分離包裝的10×擴增緩沖液1ml、25mmol/L的Mg2+1ml、各2mmol/L的dNTP混合物800ul、10mmol/L的上游引物5’ >3’ GTGCCTCTTATTGCTTTCTACC和10mmol/L的下游引物5’ >3’ GAAACATCTCGCTCGGACTT各60ul、5U/ul的TaqDNA聚合酶30ul、ddH2O1ml、100ng/ul的模板野生型DNA和100ng/ul的模板突變型DNA各15ul組成。
全文摘要
本發(fā)明涉及一種可用于分離建鯉、黃河鯉和建鯉正交群體的試劑盒,其中,試劑盒的PCR(聚合酶鏈式反應)反應體系由分離包裝的10×擴增緩沖液1ml、25mmol/L的Mg2+1ml、各2mmol/L的dNTP混合物800ul、10mmol/L的上游引物5’-->3’GTGCCTCTTATTGCTTTCTACC和10mmol/L的下游引物5’-->3’GAAACATCTCGCTCGGACTT各60ul、5U/ul的TaqDNA聚合酶30ul、ddH2O1ml、100ng/ul的模板野生型DNA和100ng/ul的模板突變型DNA各15ul組成,試劑盒還包括試劑盒使用說明書、野生型序列圖和突變型序列圖。本發(fā)明的有益效果為能夠方便、快捷的從建鯉、黃河鯉和建鯉正交混合群體中分離出建鯉,且概念為67.6%,分離出黃河鯉和建鯉正交F1代的概率為100%。
文檔編號C12Q1/68GK101974648SQ20101056247
公開日2011年2月16日 申請日期2010年11月29日 優(yōu)先權(quán)日2010年11月29日
發(fā)明者蘇勝彥, 董在杰, 袁新華 申請人:中國水產(chǎn)科學研究院淡水漁業(yè)研究中心