一種谷胱甘肽-S-轉(zhuǎn)移酶基因dsRNA及其在防治麥長(zhǎng)管蚜中的應(yīng)用的制作方法
【專利摘要】本發(fā)明公開了一種谷胱甘肽-S-轉(zhuǎn)移酶基因dsRNA及其在防治麥長(zhǎng)管蚜中的應(yīng)用。本發(fā)明所提供的dsRNA,為由序列表中序列1所示的核苷酸和其反向互補(bǔ)序列所示的核苷酸組成的雙鏈RNA。實(shí)驗(yàn)證明,飼喂谷胱甘肽-S-轉(zhuǎn)移酶基因dsRNA后,麥長(zhǎng)管蚜谷胱甘肽-S-轉(zhuǎn)移酶基因有不同程度的降低,說明麥長(zhǎng)管蚜通過口針攝入的dsRNA進(jìn)入了麥長(zhǎng)管蚜的細(xì)胞內(nèi)發(fā)生了RNAi級(jí)聯(lián)反應(yīng),目的基因的表達(dá)受到了干擾。在形態(tài)學(xué)角度來看,麥長(zhǎng)管蚜的生長(zhǎng)狀態(tài)均發(fā)生了變化,飼喂谷胱甘肽-S-轉(zhuǎn)移酶基因dsRNA的麥長(zhǎng)管蚜的蛻皮指數(shù)和存活率均比對(duì)照顯著降低。這表明谷胱甘肽-S-轉(zhuǎn)移酶基因dsRNA可以用于麥長(zhǎng)管蚜的防治,本發(fā)明為下一步利用植物介導(dǎo)的RNAi技術(shù)創(chuàng)建小麥新種質(zhì)奠定了基礎(chǔ)。
【專利說明】一種谷胱甘肽-S-轉(zhuǎn)移酶基因dsRNA及其在防治麥長(zhǎng)管蚜 中的應(yīng)用
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001] 本發(fā)明屬于生物【技術(shù)領(lǐng)域】,涉及一種谷胱甘肽-S-轉(zhuǎn)移酶基因 dsRNA及其在防治 麥長(zhǎng)管蚜中的應(yīng)用。
【背景技術(shù)】
[0002] 小麥?zhǔn)俏覈?guó)的主要糧食作物。小麥田內(nèi)害蟲種類很多,主要害蟲有地下害蟲、小 麥吸漿蟲、麥蚜、麥蜘蛛、食葉的粘蟲等,其中麥蚜對(duì)小麥的危害最為嚴(yán)重。麥蚜屬同翅目 蚜科,俗稱膩蟲、由汗、蜜蟲等,是我國(guó)小麥上的主要害蟲之一。其種類主要包括麥長(zhǎng)管蚜 (Sitobion avenae)、麥二叉蟲牙(Schizaphis graminum)、禾谷溢管蟲牙(Rhopalosiphum padi Linnaeus)、麥無網(wǎng)長(zhǎng)管姆(Acyrthosiphon dirhodum)等。麥長(zhǎng)管姆、麥二叉姆和禾谷纟益管 蚜在世界各個(gè)地區(qū)廣泛分布,我國(guó)小麥種植區(qū)內(nèi)均有發(fā)生。麥二叉蚜主要分布在西北、華北 地區(qū),麥長(zhǎng)管蚜危害南北麥區(qū),禾谷縊管蚜在南方地區(qū)發(fā)生嚴(yán)重。麥蚜的發(fā)生受氣候影響較 大,在小麥生不同的生長(zhǎng)期內(nèi),麥蚜的危害優(yōu)勢(shì)種有所不同,在小麥拔節(jié)期,麥二叉蚜種群 密度大,到達(dá)抽穗期,麥長(zhǎng)管蚜逐漸變?yōu)閮?yōu)勢(shì)種,麥二叉蚜與麥長(zhǎng)管蚜混合發(fā)生,小麥抽穗 以后,禾谷縊管蚜發(fā)生嚴(yán)重。
[0003] 麥蚜以若蚜、成蚜聚集在小麥葉片、莖干,吸食小麥汁液,造成小麥葉片出現(xiàn)黃斑 或枯萎,在苗期危害嚴(yán)重時(shí)造成小麥苗枯死,后期危害穗部,造成小麥籽粒干癟,使小麥品 質(zhì)變劣,產(chǎn)量降低。麥蚜排出的廢物覆蓋在葉片上使葉片變黑,光合作用受到嚴(yán)重影響。此 夕卜,麥姆還分泌毒素,傳播病害,嚴(yán)重影響小麥產(chǎn)量和品質(zhì)。因麥姆的危害造成小麥減產(chǎn)一 般在10% -20%,麥蚜危害嚴(yán)重時(shí)小麥減產(chǎn)量達(dá)到30%。麥蚜還可以傳播小麥與大麥黃矮 病毒,使小麥產(chǎn)量降低。
[0004] RNAi的基本過程包括起始階段和效應(yīng)階段。在起始階段,dsRNA穿過細(xì)胞膜進(jìn)入 細(xì)胞后,細(xì)胞質(zhì)中的一種RNA酶III家族的內(nèi)切酶Dicer酶特異識(shí)別dsRNA,Dicer酶將dsRNA 切割成許多 21bp_23bp 的小片段(small interference RNA,siRNA),每個(gè) siRNA 都有 2 個(gè)突出的核苷酸。效應(yīng)階段,siRNA與一個(gè)酶復(fù)合物形成一種沉默復(fù)合物(RNA-indueed sileneeing eomplex,RISC)。在ATP存在的前提下,攜帶的雙鏈siRNA被RISC變成單鏈 siRNA分子,變成具有活性的RlSC(Slicer)。之后Slicer與外源性基因表達(dá)的mRNA分子結(jié) 合,RISC在結(jié)合部位開始切割mRNA。切割后的mRNA誘導(dǎo)細(xì)胞降解這些mRNA片段。siRNA還 能引導(dǎo)目的RNA結(jié)合RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase, RdRP),合成新的 dsRNA, 然后由Dicer酶切割產(chǎn)生新的siRNA,又引發(fā)新一輪的合成切割過程,沉默信號(hào)逐漸擴(kuò)大。
[0005] 目前常用的dsRNA導(dǎo)入的方法有注射法、浸泡法、飼喂法、組織培養(yǎng)法、植物介導(dǎo) 法等。注射法是通過顯微注射儀將dsRNA導(dǎo)入到昆蟲體內(nèi),是目前最常用的方法。這種方 法既有優(yōu)點(diǎn)又有缺點(diǎn),優(yōu)點(diǎn)是效率高,缺點(diǎn)是體外合成保存dsRNA成本高,難以避免注射的 傷口影響昆蟲生長(zhǎng)。浸泡法是用dsRNA溶液浸泡昆蟲組織或細(xì)胞,可以有效地抑制基因表 達(dá)。浸泡法有一定的局限性,只適合于昆蟲一定的發(fā)育階段和易吸收dsRNA的細(xì)胞組織, 在研究中應(yīng)用較少。飼喂法操作方便且簡(jiǎn)單,對(duì)昆蟲的影響小。喂食dsRNA在許多昆蟲中 都取得了成功,例如半翅目、鱗翅目、鞘翅目昆蟲。組織培養(yǎng)法將dsRNA混入培養(yǎng)基,昆蟲 細(xì)胞從培養(yǎng)基里吸收dsRNA。目前利用這種方法取得成功的昆蟲有果蠅、埃及伊蚊、白紋伊 蚊。這種方法要求的培養(yǎng)基條件嚴(yán)格,不容易培養(yǎng)得到符合要求的細(xì)胞,對(duì)這種方法的使用 受一定限制。轉(zhuǎn)基因植物介導(dǎo)法是借助植物持續(xù)不斷的產(chǎn)生穩(wěn)定的dsRNA,昆蟲持續(xù)取食 這種植物會(huì)不斷的攝入dsRNA。但是這種方法也有一定的局限性,不同昆蟲或同一昆蟲的 不同基因?qū)νㄟ^口腔進(jìn)入的RNAi的敏感性不同,影響喂食dsRNA的成功率的關(guān)鍵因素是昆 蟲的上皮細(xì)胞攝入dsRNA的效率。Walshe等發(fā)現(xiàn)利用喂食方法可以抑制刺舌蠅(Glossina morsitans morsitans)中腸表達(dá)TsetseEP,卻不能抑制脂肪體的傳遞蛋白基因2A192的表 達(dá)。
【發(fā)明內(nèi)容】
[0006] 本發(fā)明的目的是提供一種谷胱甘肽-S-轉(zhuǎn)移酶基因(GST基因)dsRNA及其在防治 麥長(zhǎng)管蚜中的應(yīng)用。
[0007] 本發(fā)明所提供的dsRNA,具體為由序列表中序列1所示的核苷酸和其反向互補(bǔ)序 列所示的核苷酸組成的雙鏈RNA。
[0008] 編碼所述dsRNA的DNA分子也屬于本發(fā)明的保護(hù)范圍。
[0009] 所述DNA分子的核苷酸序列具體為序列表中序列2。
[0010] 含有所述DNA分子的表達(dá)盒、重組載體、重組菌或轉(zhuǎn)基因系細(xì)胞系也屬于本發(fā)明 的保護(hù)范圍。
[0011] 所述dsRNA、或所述DNA分子、或所述表達(dá)盒、重組載體、重組菌或轉(zhuǎn)基因系細(xì)胞 系,在如下(al)_(a5)任一中的應(yīng)用也屬于本發(fā)明的保護(hù)范圍:
[0012] (al)防治麥長(zhǎng)管蚜或制備防治麥長(zhǎng)管蚜的產(chǎn)品;
[0013] (a2)降低麥長(zhǎng)管蚜存活率或制備降低麥長(zhǎng)管蚜存活率的產(chǎn)品;
[0014] (a3)抑制麥長(zhǎng)管蚜生長(zhǎng)或制備抑制麥長(zhǎng)管蚜生長(zhǎng)的產(chǎn)品;
[0015] (a4)降低麥長(zhǎng)管蚜蛻皮指數(shù)或制備降低麥長(zhǎng)管蚜蛻皮指數(shù)的產(chǎn)品;
[0016] (a5)抑制麥長(zhǎng)管姆谷胱甘肽-S-轉(zhuǎn)移酶基因表達(dá)或制備抑制麥長(zhǎng)管姆谷胱甘 肽-s-轉(zhuǎn)移酶基因表達(dá)的產(chǎn)品。
[0017] 進(jìn)一步,所述應(yīng)用為將所述dsRNA導(dǎo)入麥長(zhǎng)管蚜,從而實(shí)現(xiàn)防治麥長(zhǎng)管蚜、降 低麥長(zhǎng)管蚜存活率、抑制麥長(zhǎng)管蚜生長(zhǎng)、降低麥長(zhǎng)管蚜蛻皮指數(shù)或抑制麥長(zhǎng)管蚜谷胱甘 肽-S-轉(zhuǎn)移酶基因表達(dá)。
[0018] 在本發(fā)明中,所述導(dǎo)入的方式具體為飼喂。
[0019] 更加具體的,所述飼喂為:將所述dsRNA混合于液體飼料中,得到混合液;用所述 混合液飼喂麥長(zhǎng)管蚜;所述dsRNA在所述混合液中的終濃度具體為5-20ng/μ L (如20ng/ μ L)。
[0020] 所述飼喂持續(xù)的時(shí)間可為5天以上,具體如5-6天。
[0021] 在本發(fā)明中,所述麥長(zhǎng)管蚜具體為若蟲期麥長(zhǎng)管蚜,具體如2齡麥長(zhǎng)管蚜。
[0022] 活性成分為如下A-C中任一種的產(chǎn)品也屬于本發(fā)明的保護(hù)范圍:
[0023] A、所述 dsRNA;
[0024] B、所述DNA分子;
[0025] C、所述表達(dá)盒、重組載體、重組菌或轉(zhuǎn)基因系細(xì)胞系;
[0026] 所述產(chǎn)品具有如下(al)-(a5)功能中的至少一種:
[0027] (al)防治麥長(zhǎng)管蚜;
[0028] (a2)降低麥長(zhǎng)管蚜存活率;
[0029] (a3)抑制麥長(zhǎng)管蚜生長(zhǎng);
[0030] (a4)降低麥長(zhǎng)管蚜蛻皮指數(shù);
[0031] (a5)抑制麥長(zhǎng)管蚜谷胱甘肽-S-轉(zhuǎn)移酶基因表達(dá)。
[0032] 另外,抑制麥長(zhǎng)管蚜谷胱甘肽-S-轉(zhuǎn)移酶基因表達(dá)的物質(zhì),在如下(al)_(a4)任一 中的應(yīng)用同樣屬于本發(fā)明的保護(hù)范圍:
[0033] (al)防治麥長(zhǎng)管蚜或制備防治麥長(zhǎng)管蚜的產(chǎn)品;
[0034] (a2)降低麥長(zhǎng)管蚜存活率或制備降低麥長(zhǎng)管蚜存活率的產(chǎn)品;
[0035] (a3)抑制麥長(zhǎng)管蚜生長(zhǎng)或制備抑制麥長(zhǎng)管蚜生長(zhǎng)的產(chǎn)品;
[0036] (a4)降低麥長(zhǎng)管蚜蛻皮指數(shù)或制備降低麥長(zhǎng)管蚜蛻皮指數(shù)的產(chǎn)品。
[0037] 本發(fā)明將麥長(zhǎng)管蚜GST基因 dsRNA(序列1)采用體外飼喂的方法飼喂麥長(zhǎng)管蚜, 實(shí)際上是利用RNAi技術(shù)對(duì)GST基因的表達(dá)進(jìn)行干擾。結(jié)果顯示,從mRNA水平上檢測(cè)飼喂 后的麥長(zhǎng)管蚜GST基因有不同程度的降低,說明麥長(zhǎng)管蚜通過口針攝入的dsRNA進(jìn)入了麥 長(zhǎng)管蚜的細(xì)胞內(nèi)發(fā)生了 RNAi級(jí)聯(lián)反應(yīng),目的基因的表達(dá)受到了干擾。在形態(tài)學(xué)角度來看, 麥長(zhǎng)管蚜的生長(zhǎng)狀態(tài)均發(fā)生了變化,飼喂GST基因 dsRNA的麥長(zhǎng)管蚜的蛻皮指數(shù)和存活率 均比對(duì)照降低。這表明GST基因 dsRNA可以用于麥長(zhǎng)管蚜的防治,本發(fā)明為下一步利用植 物介導(dǎo)的RNAi技術(shù)創(chuàng)建小麥新種質(zhì)奠定了基礎(chǔ)。
【專利附圖】
【附圖說明】
[0038] 圖1為麥長(zhǎng)管蚜總RNA的提取結(jié)果。
[0039] 圖2為麥長(zhǎng)管蚜谷胱甘肽-S-轉(zhuǎn)移酶基因(GST基因)cDNA片段的PCR擴(kuò)增。Μ為 標(biāo)準(zhǔn)DNA marker ; 1為GST基因。
[0040] 圖3為體外轉(zhuǎn)錄所得麥長(zhǎng)管蚜GST基因 dsRNA和GFP基因 dsRNA的瓊脂糖凝膠電 泳結(jié)果。M :D2000plus ;1 :麥長(zhǎng)管蚜GST基因體外轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物dsRNA ;2 :GFP基因體外轉(zhuǎn)錄產(chǎn) 物dsRNA ;可以看到,得到目的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物。
[0041] 圖4為不同齡期麥長(zhǎng)管蚜GST基因的表達(dá)量分析。其中,L1-L4為1-4齡麥長(zhǎng)管 蟲牙幼蟲,Adult為麥長(zhǎng)管蟲牙成蟲。圖中,*表示P〈0. 05, **表示P〈0. 01。
[0042] 圖5為不同濃度的dsGST飼喂麥長(zhǎng)管蚜后GST基因的表達(dá)水平分析。圖中,*表 示 Ρ〈0· 05, ** 表示 Ρ〈0· 01。
[0043] 圖6為飼喂dsGST后不同處理組中麥長(zhǎng)管蚜的存活率統(tǒng)計(jì)。圖中,*表示Ρ〈0. 05, ** 表示 Ρ〈〇· 01。
[0044] 圖7為飼喂dsGST 6天后不同處理組中麥長(zhǎng)管蚜的蛻皮指數(shù)統(tǒng)計(jì)。圖中,*表示 Ρ〈0· 05, ** 表示 Ρ〈0· 01。
[0045] 圖8為飼喂dsGST 6天后不同處理組中麥長(zhǎng)管蚜GST基因的表達(dá)水平分析。圖中, * 表示 Ρ〈〇· 05, ** 表示 Ρ〈0· 01。
【具體實(shí)施方式】
[0046] 下述實(shí)施例中所使用的實(shí)驗(yàn)方法如無特殊說明,均為常規(guī)方法。
[0047] 下述實(shí)施例中所用的材料、試劑等,如無特殊說明,均可從商業(yè)途徑得到。
[0048] 麥長(zhǎng)管姆(Sitobion avenae):從中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)上莊實(shí)驗(yàn)站小麥試驗(yàn)田獲得,按 照"王春芝,3種小麥蚜蟲的形態(tài)識(shí)別與防治技術(shù),農(nóng)技服務(wù),2008, 25(3) :50, 58" 一文記載 的方法,鑒定證實(shí)確為麥長(zhǎng)管姆(Sitobion avenae)。其形態(tài)學(xué)特征如下:無翅孤雌姆體長(zhǎng) 3. 1mm,寬1.4mm,長(zhǎng)卵形,草綠色至橙紅色,有時(shí)頭部帶紅色或褐色,腹部?jī)蓚?cè)有不明顯的灰 綠至灰黑色斑。觸角黑色,第3節(jié)有8 -12個(gè)感覺圈排成一行。腹部第6-8節(jié)及腹面具橫網(wǎng) 紋,無緣瘤。喙粗大,黑色,長(zhǎng)度超過中足基節(jié)。腹管長(zhǎng)圓筒形,黑色,長(zhǎng)為體長(zhǎng)的1/4,在端部 有十幾行網(wǎng)紋。有翅孤雌蚜體長(zhǎng)3. 0_,橢圓形,綠色。喙不達(dá)中足基節(jié)。腹管長(zhǎng)圓筒形,黑 色,端部具15?16行橫行網(wǎng)紋,尾片長(zhǎng)圓錐狀,有8?9根毛。若蚜體綠色,有時(shí)粉紅色,復(fù) 眼紅色,一般體較短。麥長(zhǎng)管姆的飼養(yǎng)條件是:溫度(22±1)°C,光周期16L : 8D,相對(duì)濕度 控制在85 % -90 %。用溫水浸泡小麥種子4h-8h,然后將小麥種子種在直徑8cm,高為12cm 的花盆中,放在人工氣候培養(yǎng)箱中培養(yǎng)(溫度22±1°C,光周期16L : 8D,RH85%-90%)。 待5天后,小麥葉片長(zhǎng)出約5cm時(shí)在小麥上接蚜蟲。
[0049] pEGAD質(zhì)粒:GenBank N0:AF218816. 1,購于美國(guó)俄亥俄州立大學(xué)。在文獻(xiàn)"Random GFP::cDNA fusions enable visualization of subcellular structures in cells of Arabidopsis at a high frequency^ Proc Natl Acad Sci USA. 97 (7), 3718-3723 (2000) 中報(bào)道過。
[0050] 總 RNA 提取試劑 TRIzol,F(xiàn)astQuant RT Kit(With gDNase),PCR 產(chǎn)物純化試劑盒, 質(zhì)粒小提試劑盒、突光定量試劑RealMasterMix(SYBR Green)均購自天根生化科技(北京) 有限公司。T 載體 pMD19_T Simple Vector、Ex Taq?購自 TaKaRa。T7RiboMAX expression RNAisystem購自promega。2XTaqMasterMix購自北京艾德萊生物科技有限公司。乙醇、 異丙醇均為國(guó)產(chǎn)試劑。
[0051] 麥長(zhǎng)管蚜的人工飼料:制備過程可參考文獻(xiàn)"李彩霞,高麗鋒,高玲玲,李 潤(rùn)植.全純?nèi)斯I(yíng)養(yǎng)液飼養(yǎng)蚜蟲的研究.山西農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào),1997, 17(3) :225-228. Li C X, Gao L F, Gao L L, Li R Z. Study on the rearing of aphids on a artificially holidic diets. Journal of Shanxi Agricultural University, 1997, 17(3):225-228. (in Chinese) "進(jìn)行,用0. 2 μ m的細(xì)菌過濾器過濾人工飼料,分裝到2. OmL滅菌的離心管保存 于-20°C的冰箱中,避免反復(fù)凍融。
[0052] 實(shí)施例1、麥長(zhǎng)管蚜谷胱甘肽-S-轉(zhuǎn)移酶基因 dsRNA的獲得
[0053] -、麥長(zhǎng)管蚜總RNA的提取及反轉(zhuǎn)錄
[0054] 1、總 RNA 提取
[0055] 1)取50頭麥長(zhǎng)管姆放入無 RNA酶的1. 5mL EP離心管中,加入60 μ LTrizol Reagent,用電動(dòng)研磨器研磨至勻楽狀態(tài);
[0056] 2)取出1-2 μ L總RNA進(jìn)行1. 5 %瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),同時(shí)用NanoDrop測(cè)定 260/280吸光值、260/230吸光值和核酸濃度,剩余的放于-80°C備用。
[0057] 結(jié)果如圖1所示,可見提取的總RNA比較完整,總RNA的5S、18S、28S條帶比較清 晰,RNA未降解。
[0058] 2、反轉(zhuǎn)錄
[0059] 按反轉(zhuǎn)錄試劑盒進(jìn)行操作,操作如下:
[0060] (1)配制基因組 DNA 去除體系混合液:5 X gDNA buffer 2 μ 1 ;總 RNA1 μ g ;RNase free ddH20 補(bǔ)足 10 μ 1。
[0061] 42°C孵育3min,冰上放置。
[0062] (2)配制反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)體系混合液:RT Enzyme Mix 1 μ 1 ;10XFast RT buffer 2μ 1 ;FQ_RT Primer Mix 2μ 1 ;RNasefree ddH20 補(bǔ)足 10μ 1。
[0063] (3)將步驟⑴配得的混合液加入步驟⑵中配得的混合液中,充分混勻。42°C孵 育15min之后95°C孵育3min。將反轉(zhuǎn)錄后得到的cDNA存放于-20°C保存。
[0064] 二、含有麥長(zhǎng)管蚜谷胱甘肽-S-轉(zhuǎn)移酶基因片段的重組質(zhì)粒的構(gòu)建
[0065] 根據(jù)豌豆蚜的谷胱甘肽-S-轉(zhuǎn)移酶基因(GST基因)(GenBank登錄號(hào): NM_001162802. 2)序列設(shè)計(jì)引物,引物如下:
[0066] 引物 GSTF :5' -ACGGTGAACACATGAAACC-3'(序列 5 的第 1-19 位);
[0067] 引物 GSTR :5' -CAAAATCTGATCGGAATAAACG-3'(序列 5 的第 562-583 位的反向互補(bǔ) 序列)。
[0068] 以步驟一反轉(zhuǎn)錄所得cDNA為模板,采用引物GSTF和GSTR進(jìn)行PCR擴(kuò)增。反應(yīng)條 件是:94°C 3min ;94°C 30s、55°C 30s、72°C 30s,35 個(gè)循環(huán);72°C lOmin。
[0069] 將所得PCR產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳。如圖2所示,可見PCR產(chǎn)物大小約為583bp。 將PCR產(chǎn)物膠回收后與pMD19-T Simple Vector相連,得到重組質(zhì)粒,命名為pMD19-GST。 測(cè)序表明,重組質(zhì)粒PMD19-GST在pMD19_T Simple Vector的缺口處連入了序列表中序列 5所示DNA片段。
[0070] 三、麥長(zhǎng)管蚜谷胱甘肽-S-轉(zhuǎn)移酶基因 dsRNA的獲得
[0071] 1、引物的設(shè)計(jì)
[0072] 體外合成dsRNA需要帶有T7序列的引物,利用Primer5. 0設(shè)計(jì)并合成如下引物:
[0073] 針對(duì)GST基因的引物對(duì)如下:
[0074] dsGSTFt :5' -TAATACGACTCACTATAGGAAAGACGATTCGCTGTTC-3' (無下劃線部分為序 列2的第1-18位);
[0075] dsGSTRt :5' -TAATACGACTCACTATAGGATTGCTTGGTGAGGTTG-3'(無下劃線部分為序 列2的第396-412位的反向互補(bǔ)序列)。
[0076] 針對(duì)作為對(duì)照的GFP基因的引物對(duì)如下:
[0077] dsGFPFt :5' -TAATACGACTCACTATAGGCACAAGTTCAGCGTGTCCG-3' (無下劃線部分為 序列4的第1-19位);
[0078] dsGFPRt :5 ' -TAATACGACTCACTATAGGGTTCACCTTGATGCCGTTC-3 '(無下劃線部分為 序列4的第402-420位的反向互補(bǔ)序列)。
[0079] 引物中標(biāo)有下劃線的序列為T7啟動(dòng)子序列。
[0080] 2、合成DNA模版
[0081] 將步驟二所得重組質(zhì)粒PMD19-GST稀釋成濃度為5ng/l·! 1,作為模板,用帶有T7啟 動(dòng)子序列的引物對(duì)dsGSTFt/dsGSTRt做PCR合成帶有T7序列的DNA。
[0082] 將pEGAD質(zhì)粒稀釋成濃度為5ng/l·! 1,作為模板,用帶有T7啟動(dòng)子序列的引物對(duì) dsGFPFt/dsGFPRt做PCR合成帶有Τ7序列的DNA。
[0083] PCR反應(yīng)體系:2XTaq Master Mix 10μ 1 ;ddH20 8 μ 1 ;上游引物(λ 5μ 1 ;下游引 物 〇. 5μ1 ;模板 Ιμ?。
[0084] 反應(yīng)條件:94°C 3min ;94°C 30s、51°C 30s、72°C 40s,38 個(gè)循環(huán);72°C lOmin。
[0085] 反應(yīng)結(jié)束后進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳。結(jié)果顯示,采用引物對(duì)dsGSTFt/dsGSTRt 擴(kuò)增得到大小約為450bp的DNA片段,進(jìn)一步測(cè)序?yàn)?TAATACGACTCACTATAGG+序列 2+CCTATAGTGAGTCGTATTA"。采用引物對(duì) dsGFPFt/dsGFPRt 擴(kuò)增得到大小約為 458bp 的 DNA 片段,進(jìn)一步測(cè)序?yàn)?"TAATACGACTCACTATAGG+ 序列 4+CCTATAGTGAGTCGTATTA"。
[0086] 3、合成 dsRNA
[0087] 以步驟2獲得的兩端帶有T7啟動(dòng)子序列的DNA片段為模板,利用T7Rib〇MAX expression RNAisystem(promega)試劑盒體外高效轉(zhuǎn)錄生成麥長(zhǎng)管姆的dsRNA片段。
[0088] 體外轉(zhuǎn)錄的(T7RiboMax)反應(yīng)體系:RiboMaxTM Express T72XbufferlO μ L ;DNA 模版 1 μ g ;Enzyme Mix 2 μ L ;RNase Free 水補(bǔ)充至 20 μ L。
[0089] 1)將上述溶液輕輕混勻,置于37°C中金屬浴中孵育2hr-6hr ;
[0090] 2)孵育結(jié)束后將反應(yīng)液放于70°C水浴lOmin,緩慢降至室溫,約20min ;
[0091] 3)向冷卻至室溫的反應(yīng)液中加入1 μ L RQIRNase-Free DNase和1 μ L RNase Solution (RNase Solution 稀釋 200 倍)去除模板 DNA 和單鏈 RNA,37°C溫浴 30min ;
[0092] 4)加入與管中溶液等體積的3M醋酸鈉水溶液,冰浴5min ;
[0093] 5) 15000rpmin 離心 lOmin ;
[0094] 6)棄上清,用500 μ L 70% (體積分?jǐn)?shù))乙醇洗兩次,棄上清,空氣中干燥15min, 加 50 μ L RNase Free 水溶解;
[0095] 7)將產(chǎn)物電泳檢測(cè)后,放于_80°C超低溫冰箱中保存。
[0096] 反應(yīng)結(jié)束后,取反應(yīng)產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)。
[0097] 結(jié)果如圖3所示,M :D2000plus ;1 :麥長(zhǎng)管蚜GST基因體外轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物dsRNA ;2 :GFP 基因體外轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物dsRNA ;可以看到,得到目的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物。
[0098] 將麥長(zhǎng)管蚜GST基因 dsRNA和GFP基因 dsRNA分別測(cè)序,結(jié)果如下:
[0099] 麥長(zhǎng)管蚜GST基因 dsRNA為雙鏈RNA,由正義鏈和反義鏈組成,其正義鏈的核苷酸 序列為序列表中的序列1,其反義鏈的核苷酸序列為序列表中的序列1的反向互補(bǔ)序列; [0100] GFP基因 dsRNA為雙鏈RNA,由正義鏈和反義鏈組成,其正義鏈的核苷酸序列為序 列表中的序列3,其反義鏈的核苷酸序列為序列表中的序列3的反向互補(bǔ)序列。
[0101] 當(dāng)然,也可以直接人工合成序列1所示的麥長(zhǎng)管蚜GST基因 dsRNA和序列3所示 的GFP基因 dsRNA用于下述實(shí)施例。
[0102] 實(shí)施例2、麥長(zhǎng)管蚜GST基因 dsRNA在防治麥長(zhǎng)管蚜中的應(yīng)用
[0103] 一、不同齡期麥長(zhǎng)管蚜GST基因的表達(dá)量分析
[0104] 在做飼喂實(shí)驗(yàn)之前,挑取處于不同齡期的麥長(zhǎng)管蚜分別檢測(cè)GST基因的表達(dá)量。 每個(gè)齡期(1齡幼蟲、2齡幼蟲、3齡幼蟲、4齡幼蟲和成蟲)選取20頭左右的蚜蟲提取總RNA 然后檢測(cè)基因表達(dá)量。
[0105] 利用Primer5. 0分別設(shè)計(jì)不同基因的熒光定量引物,熒光定量引物如下:
[0106] 用于檢測(cè)麥長(zhǎng)管蚜GST基因的引物:
[0107] GSTRTF :5' -AAAAGCGACGACAAAGAG-3'(序列 2 的第 133-150 位);
[0108] GSTRTR :5' -AAGCGACTAAAGCCACAT-3'(序列 2 的第 236-253 位的反向互補(bǔ)序列)。
[0109] 用于檢測(cè)內(nèi)參基因 RpL7Actin的引物:
[0110] 內(nèi)參基因 RpL7ActinF :5, -CCGAAAAGCTGTCATAATGAAGACC-3,;
[0111] 內(nèi)參基因 RpL7ActinR :5' -GGTGAAACCTTGTCTACTGTTACATCTTG-3'。
[0112] 采用的熒光定量試劑盒為RealMasterMix (SYBR Green),所用的PCR反應(yīng)體系為: RealMasterMix 8yL,20XSYBR Sloution lyL,ddH20 9.8 yL,上游引物 O.lyL,下游引 物 0· 1 μ L,cDNA 模板 1 μ L。擴(kuò)增反應(yīng)條件為:94°C 2min ;94°C 20s,54°C 30s,68°C 40s,40 個(gè)循環(huán)。每個(gè)樣本重復(fù)3次,最后結(jié)果用2^6&法(Ct表示循環(huán)數(shù))進(jìn)行計(jì)算,AACt = (目的基因的Ct-內(nèi)參基因的Ct) 目的基因的Ct-內(nèi)參基因的Ct) ,將1齡幼蟲 作為對(duì)照組,其ACt = Ctgs?H-Ctrt#SH定義為1.0,其余齡期作為實(shí)驗(yàn)組,計(jì)算各組的平 均值,進(jìn)行差異顯著性分析。
[0113] 結(jié)果如圖4所示,可以看出,2齡的麥長(zhǎng)管蚜GST基因表達(dá)量顯著高于成蟲期 (P〈0. 05),但與若蟲期差異不顯著,說明若蟲期GST基因的表達(dá)量較穩(wěn)定。后續(xù)試驗(yàn)中采用 2齡麥長(zhǎng)管蚜作為研究對(duì)照。
[0114] 二、dsRNA的飼喂及最佳飼喂?jié)舛鹊拇_定
[0115] 1、麥長(zhǎng)管蚜的dsRNA飼喂方法
[0116] 飼喂麥長(zhǎng)管蚜?xí)r采用的是兩端開口直徑為2-3. 5cm、長(zhǎng)度為3-4cm的玻璃通管。將 Parafilm膜截成1. 5cm2,用手拉展開膜覆蓋在玻璃管的一端,放在紫外燈下照射15分鐘,然 后在Parafilm膜表面加上150 μ L的人工飼料或者是人工飼料與dsRNA的混合液,再在其上 面另覆蓋一層Parafilm膜。將麥長(zhǎng)管蚜放入管內(nèi),玻璃管的另一端用細(xì)棉紗網(wǎng)封住以防止 蚜蟲逃逸。將玻璃管放到光照培養(yǎng)箱中飼養(yǎng),溫度22°C ±1°C,相對(duì)濕度為85%?90%, 光周期16 : 8(L : D)。選用同齡的蚜蟲為供試群體,饑餓4小時(shí)左右后接入玻璃管內(nèi),每 管內(nèi)接麥長(zhǎng)管蚜15頭,每個(gè)處理重復(fù)2管,實(shí)驗(yàn)重復(fù)3次。
[0117] 2、飼喂?jié)舛鹊拇_定
[0118] 為了確定比較合適的GST基因 dsRNA的飼喂?jié)舛龋炔捎萌齻€(gè)不同濃度的dsRNA 飼喂麥長(zhǎng)管蚜(2齡幼蟲),飼喂實(shí)驗(yàn)在飼喂6天后檢測(cè)基因的表達(dá)量(具體操作參見步 驟一)。采用三組不同的GST基因 dsRNA終濃度分別為Srig/yUlOng/yl^Ong/yU# 5ng/ μ L為例,為將GST基因 dsRNA與人工飼料混合,形成混合液,GST基因 dsRNA在所述混 合液中的終濃度為5ng/μ L。其余濃度所表示含義以此類推)。在實(shí)驗(yàn)中以相同濃度的GFP 基因 dsRNA的飼喂為對(duì)照。將5ng/ μ L GFP基因 dsRNA對(duì)照組的Λ Ct = Ct __ -Ct _基 H定義為1. 〇,計(jì)算各組的平均值,進(jìn)行差異顯著性分析。
[0119] 結(jié)果顯示,采用三種不同濃度的GST基因 dsRNA飼喂麥長(zhǎng)管蚜?xí)r,與對(duì)照相比,麥 長(zhǎng)管蚜的GST基因表達(dá)量在三種濃度下都顯著降低(P〈0. 05),說明在RNA干擾實(shí)驗(yàn)中任意 采用三種濃度都可以達(dá)到RNA干擾目的。在后續(xù)實(shí)驗(yàn)中采用20ng/μ L這個(gè)濃度對(duì)麥長(zhǎng)管 蚜進(jìn)行RNA干擾實(shí)驗(yàn)。具體結(jié)果詳見圖5。
[0120] 三、dsRNA飼喂后麥長(zhǎng)管蚜存活率、蛻皮指數(shù)及GST基因表達(dá)量的測(cè)定
[0121] 1、實(shí)驗(yàn)方法
[0122] 以2齡麥長(zhǎng)管蚜為研究對(duì)象,參照上文所述方法對(duì)其進(jìn)行dsRNA飼喂,dsRNA的濃 度選用20ng/μ L,同設(shè)置3個(gè)處理,S卩GST基因 dsRNA飼喂組(簡(jiǎn)稱dsGST)、GFP基因 dsRNA 飼喂組(簡(jiǎn)稱dsGFP)、以及向人工飼料中加入等量的DEPCH20的對(duì)照組。共飼喂6天。用 dsRNA飼喂蚜蟲后每天觀察麥長(zhǎng)管蚜的生長(zhǎng)狀態(tài),記錄麥長(zhǎng)管蚜的存活數(shù)和蛻皮數(shù)。每天 計(jì)算每個(gè)處理的麥長(zhǎng)管蚜的存活率,飼喂6天后計(jì)算每個(gè)處理的麥長(zhǎng)管蚜的蛻皮指數(shù)。另 夕卜,飼喂6天后檢測(cè)每個(gè)處理的麥長(zhǎng)管蚜GST基因的表達(dá)量,其中AACt=(目的基因的 Ct-內(nèi)參基因的Ct) (目的基因的Ct-內(nèi)參基因的Ct) ,將DEPCH20對(duì)照組的Λ Ct =Ct _ct __定乂為1. 0 (100 *% ),計(jì)算各組的平均值,進(jìn)彳了差異顯者性分析。
[0123] 計(jì)算公式如下:
[0124] 存活率=前一天的存活蟲數(shù)/當(dāng)天的存活蟲數(shù)X 100% ;
[0125] 蛻皮指數(shù)(Im) = Σ (蛻皮數(shù)/前一天的存活蟲數(shù))。
[0126] 2、實(shí)驗(yàn)結(jié)果
[0127] (1)麥長(zhǎng)管蚜存活數(shù)
[0128] 結(jié)果顯示,dsGST處理組的麥長(zhǎng)管蚜5天后存活率開始顯著低于對(duì)照組(P〈0. 05), 飼喂6天后蚜蟲的存活率僅為44. 45%,而dsGFP對(duì)照組為80. 00%,DEPCH20對(duì)照組為 76. 99%。從飼喂第1天到第6天處理組和對(duì)照組的存活率如下:dsGST處理組的麥長(zhǎng)管 蚜存活率分別為 95. 55 %,88. 89 %,77. 78 %,57. 78 %,5L 11 %,44. 45 % ;dsGFP 對(duì)照組為 97. 78 %,95. 55 %,93. 33 %,86. 67 %,82. 22 %,80 % ;DEPCH20 對(duì)照組為 97. 62 %,93. 01 %, 93. 01%,83. 97%,81. 59%,76. 99%。結(jié)果詳見圖 6。
[0129] (2)麥長(zhǎng)管蚜蛻皮指數(shù)
[0130] 結(jié)果顯示,dsGST飼喂能顯著降低麥長(zhǎng)管蚜的蛻皮指數(shù)(P〈0. 05),阻礙麥長(zhǎng)管 蚜的生長(zhǎng),dsGST處理組麥長(zhǎng)管蚜的蛻皮指數(shù)為1. 30±0. 06 (平均值土標(biāo)準(zhǔn)誤),dsGFP 對(duì)照組的蛻皮指數(shù)為1.73±0.07(平均值土標(biāo)準(zhǔn)誤),DEPCH20對(duì)照組的蛻皮指數(shù)為 1.75±0. 10(平均值土標(biāo)準(zhǔn)誤)。結(jié)果詳見圖7。
[0131] (3)GST基因的表達(dá)量
[0132] 結(jié)果顯示,與對(duì)照相比,dsGST處理組的麥長(zhǎng)管蚜的GST基因表達(dá)量降低,顯著低 于dsGFP處理組(P〈0. 05),極顯著低于DECH20對(duì)照組(P〈0. 001)(圖8)。
[0133] 本發(fā)明受農(nóng)業(yè)部行業(yè)項(xiàng)目"作物蚜蟲綜合防控技術(shù)研究和示范推廣(201103022) " 的支持。
【權(quán)利要求】
1. 一種dsRNA,為由序列表中序列1所示的核苷酸和其反向互補(bǔ)序列所示的核苷酸組 成的雙鏈RNA。
2. 編碼權(quán)利要求1所述dsRNA的DNA分子,其核苷酸序列為序列表中序列2。
3. 含有權(quán)利要求2所述DNA分子的表達(dá)盒、重組載體、重組菌或轉(zhuǎn)基因系細(xì)胞系。
4. 權(quán)利要求1所述的dsRNA、或權(quán)利要求2所述的DNA分子、或權(quán)利要求3所述的表達(dá) 盒、重組載體、重組菌或轉(zhuǎn)基因系細(xì)胞系,在如下(al)-(a5)任一中的應(yīng)用: (al)防治麥長(zhǎng)管蚜或制備防治麥長(zhǎng)管蚜的產(chǎn)品; (a2)降低麥長(zhǎng)管蚜存活率或制備降低麥長(zhǎng)管蚜存活率的產(chǎn)品; (a3)抑制麥長(zhǎng)管蚜生長(zhǎng)或制備抑制麥長(zhǎng)管蚜生長(zhǎng)的產(chǎn)品; (a4)降低麥長(zhǎng)管蚜蛻皮指數(shù)或制備降低麥長(zhǎng)管蚜蛻皮指數(shù)的產(chǎn)品; (a5)抑制麥長(zhǎng)管蚜谷胱甘肽-S-轉(zhuǎn)移酶基因表達(dá)或制備抑制麥長(zhǎng)管蚜谷胱甘肽-S-轉(zhuǎn) 移酶基因表達(dá)的廣品。
5. 根據(jù)權(quán)利要求4所述的應(yīng)用,其特征在于:所述應(yīng)用為將權(quán)利要求1所述的dsRNA導(dǎo) 入麥長(zhǎng)管蚜,從而實(shí)現(xiàn)防治麥長(zhǎng)管蚜、降低麥長(zhǎng)管蚜存活率、抑制麥長(zhǎng)管蚜生長(zhǎng)、降低麥長(zhǎng) 管蚜蛻皮指數(shù)或抑制麥長(zhǎng)管蚜谷胱甘肽-S-轉(zhuǎn)移酶基因表達(dá)。
6. 根據(jù)權(quán)利要求5所述的應(yīng)用,其特征在于:所述導(dǎo)入的方式為飼喂。
7. 根據(jù)權(quán)利要求6所述的應(yīng)用,其特征在于:所述飼喂為:將所述dsRNA混合于液體飼 料中,得到混合液;用所述混合液飼喂麥長(zhǎng)管蚜; 所述dsRNA在所述混合液中的終濃度為5-20ng/ μ L ; 所述飼喂持續(xù)的時(shí)間具體為5天以上。
8. 根據(jù)權(quán)利要求4-7中任一所述的應(yīng)用,其特征在于:所述麥長(zhǎng)管蚜為若蟲期麥長(zhǎng)管 蚜。
9. 產(chǎn)品,其活性成分為如下A-C中任一種: Α、權(quán)利要求1所述的dsRNA ; B、 權(quán)利要求2所述的DNA分子; C、 權(quán)利要求3所述的表達(dá)盒、重組載體、重組菌或轉(zhuǎn)基因系細(xì)胞系; 所述產(chǎn)品具有如下(al)_(a5)功能中的至少一種: (al)防治麥長(zhǎng)管蚜; (a2)降低麥長(zhǎng)管蚜存活率; (a3)抑制麥長(zhǎng)管蚜生長(zhǎng); (a4)降低麥長(zhǎng)管蚜蛻皮指數(shù); (a5)抑制麥長(zhǎng)管姆谷胱甘肽-S-轉(zhuǎn)移酶基因表達(dá)。
10. 抑制麥長(zhǎng)管姆谷胱甘肽-S-轉(zhuǎn)移酶基因表達(dá)的物質(zhì),在如下(al)-(a4)任一中的應(yīng) 用: (al)防治麥長(zhǎng)管蚜或制備防治麥長(zhǎng)管蚜的產(chǎn)品; (a2)降低麥長(zhǎng)管蚜存活率或制備降低麥長(zhǎng)管蚜存活率的產(chǎn)品; (a3)抑制麥長(zhǎng)管蚜生長(zhǎng)或制備抑制麥長(zhǎng)管蚜生長(zhǎng)的產(chǎn)品; (a4)降低麥長(zhǎng)管蚜蛻皮指數(shù)或制備降低麥長(zhǎng)管蚜蛻皮指數(shù)的產(chǎn)品。
【文檔編號(hào)】A01N57/16GK104232646SQ201410474737
【公開日】2014年12月24日 申請(qǐng)日期:2014年9月17日 優(yōu)先權(quán)日:2014年9月17日
【發(fā)明者】梁榮奇, 趙章武, 鄧菲 申請(qǐng)人:中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)