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人體耐力水平的檢測(cè)試劑盒和方法_2

文檔序號(hào):9882361閱讀:來源:國(guó)知局
MgC12 ;dNTPs混合物,該dNTPs混合物為三磷酸鳥嘌呤脫氧核苷酸dGTP,三磷 酸腺嘌呤脫氧核苷酸dATP,三磷酸胸腺嘧啶脫氧核苷酸dTTP,三磷酸胞嘧啶脫氧核苷酸 dCTP四種核苷酸,各組分濃度為2. 5mM ;5υ/μ 1熱啟動(dòng)Taq酶。
[0013] (3)瓊脂糖凝膠電泳分析試劑:瓊脂糖、TAE緩沖液、DNA分子量標(biāo)準(zhǔn)、Goldview 染色液和DNA上樣緩沖液,該緩沖液以溴酚藍(lán)為指示劑稀釋至IX后使用。
[0014] 使用上述耐力水平基因檢測(cè)試劑盒按如下步驟進(jìn)行檢測(cè): (1)提取樣本基因組DNA。
[0015] 采集該測(cè)試者唾液,向l_2ml唾液樣品中加入500ul提取緩沖溶液,該DNA提取 緩沖溶液溶劑為50mM的Tris-HCl pH7. 4、0. 5mM的EDTA和50mM的NaCl,反復(fù)吹打混勻 后,8000Xg離心5分鐘,棄去上清,此步驟重復(fù)一次;得到的沉淀中加入500ul裂解液, 該裂解液溶劑為 50mM Tris-HCl pH7.4,50mM Tris-HCl ρΗ7· 4,150mM NaCl,lmM EDTA,1% Triton x_100,l% Sodium deoxycholate,0.1% SDS,蛋白酶 K20mg/mL,徹底懸浮沉淀并 充分混勻后,室溫放置30分鐘,期間來回顛倒離心管數(shù)次;得到的混合液中,加入濃度為 lOmg/mLRNA酶的水溶液10 μ L,37°C下靜置10min ;得到的上清液中,加入等體積苯酚-氯 仿混合溶液,苯酚和氯仿體積比為1 : 1,充分混勻,混合液4°C,12000Xg離心5分鐘,上清 液移入干凈離心管內(nèi);加入等體積苯氛-氯仿-異戊醇混合溶液,苯酚、氯仿和異戊醇體積 比為25 : 24 : 1,充分混勻后,4°C,12000Xg離心5分鐘,上清液移入干凈離心管內(nèi);加 入等體積氯仿-異戊醇混合溶液,充分混勻后,4°C,12000Xg離心5分鐘,上清液移入干 凈離心管內(nèi);加入0. 6倍體積的冰浴異丙醇溶液及0. 1倍的3mol/L醋酸鈉溶液,-20°C靜 置60分鐘后,4°C,12000 X g離心10分鐘,棄上清液;得到的沉淀物中加入0. 5mL 70 %乙醇 清洗沉淀物,4°C,12000 X g離心5分鐘,棄上清液,此步驟重復(fù)一次;得到的沉淀物自然風(fēng) 干,加入20 μ L無菌超純水回溶,電泳檢測(cè),-20°C保存。
[0016] (2)PCR 擴(kuò)增 本實(shí)施例同時(shí)檢測(cè) rsl042713、rsl815739、rsl2722、rs7181866、rs8192678、 rs4253778、rsl205和rs2010963。每個(gè)SNP的檢測(cè)需要一對(duì)上下游引物、兩條多態(tài)引物共 4條PCR引物,共需要32條引物。每個(gè)SNP的檢測(cè)需要做兩管PCR擴(kuò)增,為防止出現(xiàn)假陽(yáng)性 之類的反應(yīng),衡量PCR是否成功,加設(shè)一管陰性對(duì)照組,共做17管PCR,所述陰性對(duì)照組基 因組模板及反應(yīng)體系是一樣的,但沒有引物存在。
[0017] 根據(jù)不同的檢測(cè)位點(diǎn),用相應(yīng)的引物按如下比例分別配制PCR反應(yīng)體系: 2·5μ 110XPCR緩沖液,2μ 1 dNTPs,0.5y 1引物組,熱啟動(dòng)Taq酶0· 15μ 1,基因組模板 80mg,添加超純水至總體積為25 μ 1。
[0018] 將裝有反應(yīng)溶液的Eppendorf試管放入ΑΒΙ 9700 PCR儀中,設(shè)置反應(yīng)條件如下: 預(yù)變性95°0 31^11;熱循環(huán)941:3〇8,6〇1:3〇8,721:3〇8,35個(gè)循環(huán);延伸721:31^11。反應(yīng) 結(jié)束后,取出試管。
[0019] 由于17管PCR擴(kuò)增反應(yīng)是在同一臺(tái)PCR儀上同步進(jìn)行的,為了實(shí)現(xiàn)檢測(cè)的高 效性、特異性,要求32條PCR引物的Tm值相近,為此需要先進(jìn)行大量的DNA序列軟件分析 來設(shè)計(jì)PCR引物,并通過大量的實(shí)驗(yàn)來進(jìn)行Tm值的優(yōu)化并確定設(shè)計(jì)的合理性,本試劑盒各 基因 SNP多態(tài)性的檢測(cè)是既相對(duì)獨(dú)立又相互聯(lián)系的,不可分割。
[0020] (3 )瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè) 將擴(kuò)增后的產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖電泳檢測(cè),過程如下:3g瓊脂糖,加入100mL去離子水,微 波爐加熱lmin,冷卻到60°C時(shí)加入5 μ L Goldview染色液,制成3%的瓊脂糖凝膠。PCR產(chǎn) 物10 μ L與6 X TBE緩沖液0. 8 μ L混合上樣,電壓100V電泳15min。紫外燈下讀取結(jié)果并 拍照,所得瓊脂糖電泳檢測(cè)圖如圖1所示。
[0021] 檢測(cè)得到8個(gè)基因分型分析結(jié)果如下:
根據(jù)以上分型結(jié)果,該測(cè)試者的耐力水平較高,適合耐力類的運(yùn)動(dòng)項(xiàng)目。如果是專業(yè)運(yùn) 動(dòng)員,其耐力水平雖然較高,但尚沒有達(dá)到頂尖水平,建議國(guó)家級(jí)運(yùn)動(dòng)機(jī)構(gòu)不重點(diǎn)培養(yǎng)。如 果是業(yè)余健身愛好者,則在其日常的鍛煉中,多注意提高耐力相關(guān)運(yùn)動(dòng),可適當(dāng)增加強(qiáng)度, 比如增加每日跑步的時(shí)間和距離,而不是速度。耐力運(yùn)動(dòng)可大大提高該測(cè)試者的心肺功能, 有益健康。
[0022] 以上所述僅為本發(fā)明的較佳實(shí)施例,并不用以限制本發(fā)明,凡在本發(fā)明的精神和 原則之內(nèi),所作的任何修改、等同替換、改進(jìn)等,均應(yīng)包含在本發(fā)明的保護(hù)范圍之內(nèi)。
【主權(quán)項(xiàng)】
1.耐力水平基因檢測(cè)試劑盒,包括盒體及盒體內(nèi)單獨(dú)存放的試劑,其特征在于:存放 的試劑包括: (1)針對(duì)8個(gè)基因 SNP多態(tài)位點(diǎn)的PCR反應(yīng)引物組(以下引物序列方向均為5'端至3' 立而): 針對(duì)SNP rsl042713的引物組: 1 CCTTCTTGCTGGCACCCAATA 2 GTCCGGCGCATGGCTTCC 3 GCTGAGTGTGCAGGAC 4 CCAGTGAAGTGATGAAG 針對(duì)SNP rsl815739的引物組: 1 CTGCCCGAGGCTGACC 2 GGCACCTCGCTCTCA 3 GCACACTGCTGCCCTTTC 4 CACATCTGAAGATGGAC 針對(duì)SNP rsl2722的引物組: 1 CTCTGTCCACACCCAC 2 CTCCCGGGGCGCA 3 TCTACGCCTCGGCAC 4 AATGGATCGTGTTGGAG 針對(duì)SNP rs7181866的引物組: 1 CATAGAATAGGAGAGAGTA 2 CACCATCATTTTGGGC 3 CCTAATGGAGTTTTTTTC 4 GTGATTAACGCATCCC 針對(duì)SNP rs8192678的引物組: 1 GAAGCAGACAAGACCA 2 CTGTCCCTCAGTTCACC 3 GAGAGACTTTGGAGGCA 4 AGGAGACACATTGAAC 針對(duì)SNP rs4253778的引物組: 1 CTTGATATCTAGTTTC 2 GAAATGAAGCTTTTGAATCC 3 TCCCCACTCTGGGTCTCCT 4 TATTCATAGACTAGG 針對(duì)SNP rsl205的引物組: 1 GTTTGGCTTCTGTCCTCAC 2 CACATGGAGAGAGACTA 3 TAGTCACAACTTCTAAAG 4 GAGGATAGTTGGATAG 針對(duì)SNP rs2010963的引物組: 1 GTGCGAGCAGCGAAAGC 2 GCACTTTGCCCCTGTCC 3 AGCGGACTCACCGGCCAG 4 GGGCTCACGCCGCGCTC (2) PCR擴(kuò)增試劑; (3) 瓊脂糖凝膠電泳分析試劑。2. 根據(jù)權(quán)利要求1所述的耐力水平基因檢測(cè)試劑盒,其特征在于:所述引物用量均為 0· 5_1· Ο μ 1 〇3. 根據(jù)權(quán)利要求1所述的耐力水平基因檢測(cè)試劑盒,其特征在于:所述PCR擴(kuò)增試劑 包括:10XPCR緩沖液,dNTPs,熱啟動(dòng)Taq酶,基因組模板。4. 根據(jù)權(quán)利要求3所述的耐力水平基因檢測(cè)試劑盒,其特征在于:所述PCR緩沖液包 含:100mM Tris-HCl pH8.3,500mM KCl,15mM MgCl2。5. 根據(jù)權(quán)利要求3所述的耐力水平基因檢測(cè)試劑盒,其特征在于:所述PCR擴(kuò)增試 劑用量為:l〇XPCR緩沖液2. 5μ 1,dNTPs2l·! 1,熱啟動(dòng)Taq酶0. 1-0. 2μ 1,基因組模板 50-100ng〇6. 根據(jù)權(quán)利要求1所述的耐力水平基因檢測(cè)試劑盒,其特征在于:所述瓊脂糖凝膠電 泳分析試劑包括:瓊脂糖、TAE緩沖液、DNA分子量標(biāo)準(zhǔn)、DNA無毒染料和DNA上樣緩沖 液。7. 根據(jù)權(quán)利要求6所述的耐力水平基因檢測(cè)試劑盒,其特征在于:所述DNA無毒染料 優(yōu)選Biotium Gelred無毒染料。
【專利摘要】本發(fā)明提供了人體耐力水平的基因檢測(cè)試劑盒,該試劑盒包括盒體及盒體內(nèi)單獨(dú)存放的試劑,試劑包括:(1)針對(duì)8個(gè)基因SNP多態(tài)位點(diǎn)的PCR反應(yīng)引物組(2)PCR擴(kuò)增試劑(3)瓊脂糖凝膠電泳分析試劑。本發(fā)明通過PCR引物的設(shè)計(jì)使多個(gè)PCR擴(kuò)增反應(yīng)可在同一臺(tái)PCR儀上同步進(jìn)行,對(duì)受測(cè)者的相關(guān)基因進(jìn)行檢測(cè),并實(shí)現(xiàn)檢測(cè)的高效性、特異性,分析得到耐力力水平的基因基礎(chǔ),評(píng)估個(gè)體是否適合從事與耐力力相關(guān)的體育項(xiàng)目,為專業(yè)體育機(jī)構(gòu)和教練提供選拔運(yùn)動(dòng)員的科學(xué)依據(jù)。對(duì)于大眾健身鍛煉來講,為個(gè)體提供個(gè)人潛在的運(yùn)動(dòng)能力評(píng)估,幫助個(gè)體更好的選擇適合自身體質(zhì)條件的運(yùn)動(dòng)項(xiàng)目,從而更有效合理的發(fā)揮自身優(yōu)勢(shì),達(dá)到鍛煉目的。
【IPC分類】C12Q1/68
【公開號(hào)】CN105648048
【申請(qǐng)?zhí)枴?br>【發(fā)明人】李則軒, 張舒, 朱軼凡, 邱嘉銘, 張靜靜, 別茜, 范家成, 盧駿
【申請(qǐng)人】武漢白原科技有限公司, 湖北省體育科學(xué)研究所
【公開日】2016年6月8日
【申請(qǐng)日】2014年11月17日
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