大麗輪枝菌adp-atp載體蛋白病程關(guān)鍵靶基因及其干擾載體和應用
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001] 本發(fā)明涉及大麗輪枝菌ADP-ATP載體蛋白病程關(guān)鍵靶基因,還涉及含有所述 ADP-ATP載體蛋白病程關(guān)鍵靶基因的RNA干擾載體,本發(fā)明還涉及所述大麗輪枝菌ADP-ATP 載體蛋白病程關(guān)鍵靶基因或干擾載體在提高植物對大麗輪枝菌抗病性中的應用,屬于大麗 輪枝菌病程關(guān)鍵基因的克隆及應用領(lǐng)域。
【背景技術(shù)】
[0002] 棉花黃萎病于1914年首次在美國發(fā)現(xiàn),目前已成為一種世界性的病害,其病原菌 為大麗輪枝菌大麗輪枝菌Verticillium dahliae,屬于半知菌亞門(Deuteromycotina)、 淡色孢科(Moniliaceae)、輪枝菌屬(Verticillium),它不僅嚴重危害棉花的纖維質(zhì)量和 皮棉產(chǎn)量,還可危害40科660種植物,其中農(nóng)作物184種,雜草153種(Rowe R. C.,Davis J. R. , Powelson M. L.,et al. Potato early dying:causal agents and management strategies. Plant Disease 1987,71:482-489)〇
[0003] ATP-ADP 載體蛋白(ADP,ATP carrier protein,AACP,VDAG-07535. I)作 為真核生物體線粒體膜上一種跨膜蛋白(Kim Y. H.,Haidl G.,Schaefer M.,et al. Compartmentalization of a unique ADP/ATP carrier protein SFEC (Sperm Flagellar Energy Carrier,AAC4)with glycolytic enzymes in the fibrous sheath of the human sperm flagellar principal piece. Developmental Biology 2007, 302:463-476.),介導線粒體與細胞質(zhì)基質(zhì)之間的ADP/ATP交換(K1 ingenberg M. The ADP and ATP transport in mitochondria and its carrier. Biochimica et Biophysica Acta 2008, 1778:1978-2021.),在通過氧化磷酸化作用產(chǎn)生ATP給細胞提 供能量的過程中起著中心的作用,是保持細胞內(nèi)能量平衡的關(guān)鍵成分(Pebay-Peyroula E., Dahout-Gonzalez C. , Kahn R. , et al. Structure of mitochondrial ADP/ATP carrier in complex with carboxyatractyloside. Nature 2003,426:39-44)。AACP 與線粒體膜 上其它多種蛋白共同組成線粒體通透性轉(zhuǎn)換孔,對保持線粒體內(nèi)的電化學平衡及穩(wěn)定狀態(tài) 具有重要作用(Kroemer G. , Zangami N. , and Susin S. A. Mitochondria and apotosis. Immumology Today 1997, 18:44-51.) 酵母的AACP2與多個蛋白復合體特有的大小和 成分有密切關(guān)系,例如線粒體載體家族(Claypool,S. M.,Oktay,Y.,Boontheung,P.,et al. Cardiolipin defines the interactome of the major ADP/ATP carrier protein of the mitochondrial inner membrane. Journal of Cell Biology 2008, 182:937-950.)〇 在酵母的遺傳轉(zhuǎn)化研究中,Pep4p和AACP可以調(diào)節(jié)線粒體的降解(Pereira C.,Chaves S., Alves S.,et al. Mitochondrial degradation in acetic acid-induced yeast apoptosis: the role of Pep4and the ADP/ATP carrier. Molecular Microbiology 2010, 76:1398-1410.) AACP不僅作為負責能量分子傳導的轉(zhuǎn)運蛋白,在細胞凋亡調(diào)控 網(wǎng)絡中也具有重要的作用(Tsujimoto Y.,and Shimizu S. Role of the mitochondrial membrane permeability transition in cell death. Apoptosis 2007, 12:835-840.)〇 因 此,AACP是生物體內(nèi)能量產(chǎn)生與能量消耗的橋梁,與細胞的發(fā)育、繁殖和凋亡密切相關(guān)。
[0004] AACP在條形柄銹菌(Puccinia striiformis f. sp. Tritici)孢子萌發(fā)時的表達量 較少,在孢子形成時有大量表達。在病原菌與寄主植物相互作用的過程中,此基因的表達量 呈上升趨勢,這說明它在病原菌與植物互作的過程中可能發(fā)揮著重要功能(董艷玲.小麥 成株抗條銹病差異表達基因的cDNA-AFLP分析及小麥與條銹菌互作相關(guān)基因的克隆與特 征研究[博士學位論文].楊凌:西北農(nóng)林科技大學,2010)。
[0005] 目前對于AACP的研究主要集中于其與能量代謝之間的關(guān)系,在真菌中的研究較 少,尤其是其與致病性之間的關(guān)系。因此,以大麗輪枝菌的AACP作為靶標基因,研究其與病 原菌致病力之間的關(guān)系,對于提高植物對大麗輪枝菌的抗病性將具有重要的意義。
【發(fā)明內(nèi)容】
[0006] 本發(fā)明所要解決的技術(shù)問題是提供大麗輪枝菌(Verticillium dahliae)的 ADP-ATP載體蛋白病程關(guān)鍵靶基因;
[0007] 本發(fā)明所要解決的另一個技術(shù)問題是提供含有所述ADP-ATP載體蛋白病程關(guān)鍵 靶基因的RNA干擾載體和宿主細胞;
[0008] 本發(fā)明所要解決的第三個技術(shù)問題是將所述ADP-ATP載體蛋白病程關(guān)鍵靶基因 或RNA干擾載體應用于提高植物對大麗輪枝菌的抗病性。
[0009] 為解決上述技術(shù)問題,本發(fā)明所采取的技術(shù)方案是:
[0010] 本發(fā)明首先公開了大麗輪枝菌(Verticillium dahliae)的ADP-ATP載體蛋白 (ADP,ATP carrier protein,AACP)病程關(guān)鍵靶基因,其核苷酸序列分別為SEQ ID No. 1、 SEQ ID No. 2、SEQ ID No. 3、SEQ ID No. 4 或 SEQ ID No. 5 所示;優(yōu)選的,所述 ADP-ATP 載體 蛋白病程關(guān)鍵靶基因的核苷酸序列為SEQ ID No. 1、SEQ ID No. 3或SEQ ID No. 5所示。
[0011] 本發(fā)明采用寄主誘導的基因沉默技術(shù)(Host-induced gene silencing),以高致 病力的大麗輪枝菌株V991為實驗材料,根據(jù)大麗輪枝菌AACP cDNA序列信息(其核苷酸序 列為SEQ ID No. 6所示),設計引物克隆獲得針對靶標基因的5個不同區(qū)段,其核苷酸序列 分別為SEQ ID No. 1-5所示。本發(fā)明進一步將克隆獲得的大麗輪枝菌基因的5個靶標片段 分別構(gòu)建到TRV2載體中,成為VIGS系列RNAi載體并轉(zhuǎn)化農(nóng)桿菌,用于本氏煙草的注射,從 注射VIGS系列載體后的第8天進行大麗輪枝菌接種。病情指數(shù)分析結(jié)果表明,與空載相 比,注射真菌靶標基因片段的本氏煙草,病情指數(shù)均有所下降;其中分別注射VIGS系列載 體VIGS-I (靶標片段的核苷酸序列為SEQ ID No. 1所示)、VIGS-3(靶標片段的核苷酸序列 為SEQ ID No. 3所示)、VIGS-5 (靶標片段的核苷酸序列為SEQ ID No. 5所示)的煙草,病 情指數(shù)一直保持在較低水平,初步說明它們與病原菌的致病性存在一定關(guān)系。
[0012] 本發(fā)明所述ADP-ATP載體蛋白病程關(guān)鍵靶基因能夠應用于提高植物對大麗輪枝 菌的抗病性,包括以下步驟:(1)構(gòu)建含有所述ADP-ATP載體蛋白病程關(guān)鍵靶基因的RNA干 擾表達載體;(2)將所構(gòu)建的RNA干擾表達載體轉(zhuǎn)化到植物或植物細胞中;(3)篩選獲得對 大麗輪枝菌抗病性提高的轉(zhuǎn)基因植物。
[0013] 本發(fā)明進一步公開了含有所述ADP-ATP載體蛋白病程關(guān)鍵靶基因的RNA干擾載體 以及含有所述RNA干擾載體的宿主細胞。
[0014] 構(gòu)建含有所述ADP-ATP載體蛋白病程關(guān)鍵靶基因的RNA干擾載體的方法為本領(lǐng)域 技術(shù)人員所熟知,優(yōu)選為Gateway技術(shù),只需BP反應和LR反應就可以完成RNA干擾表達載 體的構(gòu)建。
[0015] 本發(fā)明所述RNA干擾載體也能夠應用于提高植物對大麗輪枝菌的抗病性,包括以 下步驟:(1)將所述RNA干擾表達載體轉(zhuǎn)化到植物或植物細胞中;(2)篩選獲得對大麗輪枝 菌抗病性提高的轉(zhuǎn)基因植物。
[0016] 本發(fā)明還公開了一種培育抗大麗輪枝菌的轉(zhuǎn)基因植物新品種的方法,包括以下步 驟:(1)構(gòu)建含有所述ADP-ATP載體蛋白病程關(guān)鍵靶基因的RNA干擾表達載體;(2)將所構(gòu) 建的RNA干擾表達載體轉(zhuǎn)化到植物或植物細胞中;(3)篩選獲得對大麗輪枝菌抗病性提高 的轉(zhuǎn)基因植物新品種。
[0017] 本發(fā)明所述轉(zhuǎn)化的方案以及將所述核苷酸引入植物的方案可視用于轉(zhuǎn)化的植物 或植物細胞的類型而變化。將所述核苷酸引入植物細胞的合適方法包括:顯微注射、電穿 孔、農(nóng)桿菌介導的轉(zhuǎn)化和直接基因轉(zhuǎn)移等。
[0018] 本發(fā)明所述植物包括:大麗輪枝菌的寄主植物,優(yōu)選為農(nóng)作物,包括:棉花、煙草、 番茄、馬鈴薯、甜瓜、西瓜、黃瓜或花生中的任意一種或多種。
[0019] 本發(fā)明根據(jù)瞬時轉(zhuǎn)化的煙草病情指數(shù)的變化,選擇核苷酸序列分別為SEQ ID No. 1、SEQ ID No. 3、SEQ ID No. 5所示的AACP三個DNA區(qū)段,用于Gateway干擾載體的構(gòu) 建。通過BP反應和LR反應,將上述3個靶標片段連接到Gateway干擾載體pK7GWIWG2 (I),0 上,形成含有真菌靶標基因的植物轉(zhuǎn)化載體,轉(zhuǎn)化至農(nóng)桿菌,用于本氏