表、圖示800a和/或 指示優(yōu)選試驗(yàn)分子。
[0106] 作為另外的實(shí)例。圖8B為對于各模擬的API-API(g卩，參比分子-參比分子)平均徑 向分布函數(shù)的圖示800b。第一曲線801b表示對于模擬API和第一輔料的第一 API-API平均徑 向分布函數(shù)，第二曲線802b表示對于模擬API和第二輔料的第二API-API平均徑向分布函 數(shù)。
[0107] 如圖示800b所示，計(jì)算設(shè)備可以確定第一 API-API平均徑向分布函數(shù)的極大值出 現(xiàn)在約〇.9nm。計(jì)算設(shè)備也可以確定第二API-API平均徑向分布函數(shù)(g(r))的極大值出現(xiàn)在 約0.4nm的徑向距離(r)。在所述實(shí)例中，計(jì)算設(shè)備可以執(zhí)行方框702的步驟，確定第一API-API平均徑向分布函數(shù)的極大值為約0.9,第二API-API平均徑向分布函數(shù)的極大值為約 0.65。因此，計(jì)算設(shè)備可以確定第一 API-API平均徑向分布函數(shù)的極大值小于第二API-API 平均徑向分布函數(shù)的極大值。
[0108] 在方框704,計(jì)算設(shè)備可以生成按上升順序排列平均徑向分布函數(shù)極大值的表。如 前述實(shí)例所述的，計(jì)算設(shè)備可以生成使得第一輔料在第一排和第二輔料在第二排的表。另 外，計(jì)算設(shè)備可以在方框706識別第一輔料為優(yōu)選試驗(yàn)分子，計(jì)算設(shè)備可以在方框410顯示 表、圖示800b和/或指示優(yōu)選試驗(yàn)分子。
[0109] 在上述實(shí)例中，計(jì)算設(shè)備可以包括表示Μ個(gè)接觸概率的一個(gè)或多個(gè)、Μ個(gè)極大值的 一個(gè)或多個(gè)、表和/或優(yōu)選試驗(yàn)分子的信息。當(dāng)執(zhí)行方法400的方框410步驟時(shí)，計(jì)算設(shè)備可 以使顯示設(shè)備顯示表示模擬結(jié)果例如表和/或優(yōu)選試驗(yàn)分子的信息。
[0110] 雖然上述方法和實(shí)例是描述關(guān)于單一計(jì)算設(shè)備執(zhí)行所述方法的內(nèi)容，但每個(gè)方法 步驟可以由一個(gè)或多個(gè)計(jì)算設(shè)備執(zhí)行。例如，所述方法的一個(gè)或多個(gè)可以由分布式計(jì)算系 統(tǒng)(例如關(guān)于圖1描述的分布式計(jì)算系統(tǒng)1〇〇)實(shí)施。例如，計(jì)算終端102可以顯示配置為接收 一個(gè)或多個(gè)輸入信號的GUI。然后計(jì)算終端可以將一個(gè)或多個(gè)輸入信號經(jīng)由網(wǎng)絡(luò)104發(fā)送至 服務(wù)器設(shè)備106。服務(wù)器設(shè)備106在完成方法400的步驟時(shí)，例如可以將信號經(jīng)由網(wǎng)絡(luò)104發(fā) 送至計(jì)算終端102,促使計(jì)算終端102的顯示部件顯示表示模擬結(jié)果的信息。
[0111] 關(guān)于圖和本申請中所述的任何或全部的信息流圖、方案和流程圖，各步驟、方框 和/或通信可以代表處理根據(jù)示例實(shí)施方式的信息和/或傳輸信息?？商娲膶?shí)施方式包括 在這些示例實(shí)施方式的范圍中。在這些替代實(shí)施方式中，例如，如步驟、方框、傳輸、通信、請 求、響應(yīng)和/或信息描述的功能可以由所示或所述的順序進(jìn)行執(zhí)行，包括按基本并行或反向 順序，這取決于所涉及的功能性。此外，較多或較少的步驟、方框和/或功能可以使用本申請 中所述的任何信息流圖、方案和流程圖，這些信息流程圖、方案和流程圖可以部分或全部地 相互合并。
[0112] 表示處理信息的步驟或方框可以對應(yīng)于電路圖，其可配置為執(zhí)行本申請中所述的 方法或技術(shù)的具體邏輯功能。可選擇地或另外，表示處理信息的步驟或方框可以對應(yīng)于模 塊、片段或一部分程序代碼(包括相關(guān)數(shù)據(jù)）。程序代碼可以包括可由處理器執(zhí)行的一個(gè)或 多個(gè)指令用于實(shí)施所述方法或技術(shù)中的具體邏輯功能或作用。程序代碼和/或有關(guān)數(shù)據(jù)可 以儲存在任何類型的計(jì)算機(jī)可讀介質(zhì)上，例如儲存設(shè)備，包括磁盤驅(qū)動(dòng)器、硬盤驅(qū)動(dòng)器或其 他儲存介質(zhì)。
[0113] 計(jì)算機(jī)可讀介質(zhì)也可以包括儲存短時(shí)期數(shù)據(jù)的非暫時(shí)性計(jì)算機(jī)可讀介質(zhì)，例如計(jì) 算機(jī)可讀介質(zhì)，如寄存器存儲器、處理器緩存和/或隨機(jī)存取存儲器(RAM)。計(jì)算機(jī)可讀介質(zhì) 也可以包括儲存較長時(shí)期的程序代碼和/或數(shù)據(jù)的非暫時(shí)性計(jì)算機(jī)可讀介質(zhì)，例如二次或 持續(xù)性長期存儲，例如只讀存儲器(R0M)、光或磁盤、和/或光盤只讀存儲器(CD-ROM)。計(jì)算 機(jī)可讀介質(zhì)也可以為任何其他易失性或非易失性存儲系統(tǒng)。計(jì)算機(jī)可讀介質(zhì)可以考慮例如 計(jì)算機(jī)可讀存儲介質(zhì)或可觸摸存儲設(shè)備。
[0114] 此外，表示一個(gè)或多個(gè)信息傳輸?shù)牟襟E或方框可以對應(yīng)于相同物理設(shè)備中軟件 和/或硬件模塊之間的信息傳輸。然而，其他信息傳輸可以在不同物理設(shè)備中的軟件模塊 和/或硬件模塊之間。
[0115] 雖然以上已根據(jù)其優(yōu)選實(shí)施方式描述了本發(fā)明，但可在本公開內(nèi)容的范圍內(nèi)修 改。因此本申請意在覆蓋本發(fā)明使用本申請中披露的一般原則的任何變化、用途或適應(yīng)。此 外，本申請意在覆蓋因?yàn)楸景l(fā)明所屬領(lǐng)域內(nèi)已知或通常實(shí)踐而偏離本披露內(nèi)容并且落入以 下權(quán)利要求限制內(nèi)的內(nèi)容。
【主權(quán)項(xiàng)】
1. 方法，包括： 通過計(jì)算設(shè)備使用分子模擬器生成Μ組模擬數(shù)據(jù)，其中Μ組模擬數(shù)據(jù)中的每一組包括一 個(gè)或多個(gè)模擬數(shù)據(jù)樣品，所述一個(gè)或多個(gè)模擬數(shù)據(jù)樣品表示在溶劑中（i)參比分子中的分 子和（ii)M種試驗(yàn)分子中一種的分子的模擬位置，其中（a)M為自然數(shù)，（b)參比分子為活性 藥物成分，和(c )M種試驗(yàn)分子各自為聚合物或低聚物輔料； 確定Μ組模擬數(shù)據(jù)中每一組的α物類與β物類之間的接觸概率，提供Μ個(gè)接觸概率，其中 接觸在當(dāng)β物類粒子在α物類粒子的徑向距離范圍內(nèi)時(shí)發(fā)生，其中α物類和β物類各自為參比 分子、溶劑，或Μ種試驗(yàn)分子中的一個(gè)中的一種； 基于Μ個(gè)接觸概率中的至少一個(gè)確定模擬結(jié)果;和 使顯示設(shè)備顯示表示模擬結(jié)果的信息。2. 權(quán)利要求1的方法，進(jìn)一步包括:通過所述計(jì)算設(shè)備經(jīng)由用戶界面接收一個(gè)或多個(gè)輸 入，所述一個(gè)或多個(gè)輸入包括表示所述參比分子、Μ種試驗(yàn)分子或溶劑中至少一種的信息。3. 權(quán)利要求2的方法，其中為接收所述Μ種試驗(yàn)分子，所述計(jì)算設(shè)備配置為經(jīng)由所述用 戶界面接收： 對聚合物或低聚物的選擇； 對一個(gè)或多個(gè)取代基的選擇;和 對其中所述一個(gè)或多個(gè)取代基各自連接到所述聚合物或低聚物的位置的選擇。4. 權(quán)利要求3的方法，其中所述聚合物或低聚物為聚環(huán)氧乙烷、聚乙烯吡咯烷酮、纖維 素或環(huán)糊精中的一種。5. 權(quán)利要求3-4中任一項(xiàng)的方法，其中所述一個(gè)或多個(gè)取代基包括:一個(gè)或多個(gè)單體烷 基、酰基或陽離子基團(tuán)；或 一個(gè)或多個(gè)能夠接枝到其他聚合物或低聚物上的聚合物或低聚物基團(tuán)。6. 前述權(quán)利要求中任一項(xiàng)的方法，進(jìn)一步包括在生成所述Μ組模擬數(shù)據(jù)之前，使用所述 分子模擬器確定Μ組熱力學(xué)平衡條件，其中： Μ組熱力學(xué)平衡條件各自包括一個(gè)或多個(gè)對于溶劑體系的熱力學(xué)平衡條件，所述溶劑 體系包括所述參比分子和所述Μ種試驗(yàn)分子中的一種； 所述分子模擬器使用所述Μ組熱力學(xué)平衡條件中的一組條件生成Μ組模擬數(shù)據(jù)中的每 一組;和 所述分子模擬器用于確定Μ組熱力學(xué)平衡條件中每一組的分子數(shù)目，小于所述分子模 擬器用于生成Μ組模擬數(shù)據(jù)中每一組的分子數(shù)目。7. 前述權(quán)利要求中任一項(xiàng)的方法，其中： 所述α物類粒子為所述α物類的原子、分子或化學(xué)基團(tuán)中的一種;和 所述β物類粒子為所述β物類的原子、分子或化學(xué)基團(tuán)中的一種。8. 前述權(quán)利要求中任一項(xiàng)的方法，其中確定所述Μ個(gè)接觸概率包括確定Μ個(gè)平均徑向分 布函數(shù)，其中確定Μ個(gè)平均徑向分布函數(shù)中的每一個(gè)包括： 確定包括在Μ組模擬數(shù)據(jù)的一組中所述一個(gè)或多個(gè)模擬數(shù)據(jù)樣品中每一個(gè)的徑向分布 函數(shù)，提供一個(gè)或多個(gè)徑向分布函數(shù)，其中所述一個(gè)或多個(gè)徑向分布函數(shù)中的每一個(gè)基于 在所述α物類粒子徑向距離范圍內(nèi)的所述β物類粒子數(shù)目； 使所述一個(gè)或多個(gè)徑向分布函數(shù)中的每一個(gè)標(biāo)準(zhǔn)化，提供一個(gè)或多個(gè)標(biāo)準(zhǔn)化徑向分布 函數(shù)； 將所述一個(gè)或多個(gè)標(biāo)準(zhǔn)化徑向分布函數(shù)平均，提供平均徑向分布函數(shù);和 確定Μ個(gè)平均徑向分布函數(shù)中每一個(gè)的極大值，提供Μ個(gè)極大值，其中Μ個(gè)極大值中的每 一個(gè)都與所述Μ種試驗(yàn)分子中的一種相關(guān)聯(lián)。9. 權(quán)利要求8的方法，其中模擬結(jié)果包括表示以下的信息：（i)包括在所述Μ種試驗(yàn)分子 中的一種或多種試驗(yàn)分子和（ii)與所述一種或多種試驗(yàn)分子中每一種試驗(yàn)分子相關(guān)聯(lián)的 極大值。10. 權(quán)利要求8-9中任一項(xiàng)的方法，進(jìn)一步包括： 根據(jù)與所述一種或多種試驗(yàn)分子的每一種試驗(yàn)分子相關(guān)聯(lián)的極大值，生成排列包括在 所述Μ種試驗(yàn)分子中一種或多種試驗(yàn)分子的表;和 使所述顯示設(shè)備顯示表示所述表的信息。11. 權(quán)利要求8-10中任一項(xiàng)的方法，進(jìn)一步包括： 從所述Μ種試驗(yàn)分子基于與每一種試驗(yàn)分子相關(guān)聯(lián)的極大值來識別優(yōu)選試驗(yàn)分子，其 中所述模擬結(jié)果包括表示所述優(yōu)選試驗(yàn)分子的信息。12. 權(quán)利要求11的方法，其中所述優(yōu)選試驗(yàn)分子為包括在所述Μ種試驗(yàn)分子中的聚合物 輔料，其與當(dāng)所述α物類和β物類為API時(shí)最低的極大值相關(guān)聯(lián)。13. 權(quán)利要求的11方法，其中所述優(yōu)選試驗(yàn)分子為包括在所述Μ種試驗(yàn)分子中的試驗(yàn)分 子，其與當(dāng)所述α物類或所述β物類中的至少一個(gè)為一種所述溶劑或所述Μ種試驗(yàn)分子中的 一種時(shí)最大的極大值相關(guān)聯(lián)。14. 計(jì)算設(shè)備，包括： 用戶界面部件； 顯不設(shè)備； 處理器;和 非臨時(shí)性數(shù)據(jù)存儲，其包含可由所述處理器執(zhí)行的指令以執(zhí)行權(quán)利要求1-13中任一項(xiàng) 所述的方法。15. 系統(tǒng)，包括： 計(jì)算設(shè)備，其包括用戶界面;和 服務(wù)器，其配置為執(zhí)行權(quán)利要求1-13中任一項(xiàng)所述方法的步驟，其中所述計(jì)算設(shè)備配 置為： 經(jīng)由所述用戶界面的輸入部件接收所述一個(gè)或多個(gè)輸入;和 在所述用戶界面的輸出部件上顯示表示所述模擬結(jié)果的信息。
【專利摘要】披露用于設(shè)計(jì)試驗(yàn)分子的方法、系統(tǒng)和設(shè)備。實(shí)例方法包括使用分子模擬器以生成各組模擬數(shù)據(jù)。每一組模擬數(shù)據(jù)可以包括模擬數(shù)據(jù)，表示在溶劑中(i)參比分子中的分子和(ii)M種試驗(yàn)分子中一種分子的模擬位置。所述方法也可以包括確定每一組模擬數(shù)據(jù)的α物類與β物類之間的接觸概率。接觸可以在當(dāng)β物類粒子在α物類粒子的徑向距離內(nèi)時(shí)發(fā)生。α物類和β物類可以各自為參比分子、溶劑中的一個(gè)或M種試驗(yàn)分子中的一種。所述方法可以進(jìn)一步包括基于至少一個(gè)接觸概率確定模擬結(jié)果。
【IPC分類】G06F19/00
【公開號】CN105593861
【申請?zhí)枴緾N201480054293
【發(fā)明人】R·拉森, P·賈, R·施密特, W·波特
【申請人】陶氏環(huán)球技術(shù)有限責(zé)任公司, 密歇根大學(xué)董事會
【公開日】2016年5月18日
【申請日】2014年10月23日
【公告號】WO2015061602A1