本發(fā)明涉及生物信息分析技術(shù)領(lǐng)域,特別涉及無(wú)參轉(zhuǎn)錄組分析系統(tǒng)中的項(xiàng)目報(bào)告自動(dòng)生成方法。該方法根據(jù)無(wú)參轉(zhuǎn)錄組自動(dòng)化分析流程生成的結(jié)果,自動(dòng)整理報(bào)告及結(jié)果,減少手動(dòng)生成報(bào)告的錯(cuò)誤,提高工作效率,提高報(bào)告可讀性。
背景技術(shù):
隨著第二代測(cè)序技術(shù)的迅猛發(fā)展,其高通量、快速、低成本的特點(diǎn)成為越來(lái)越多的生物學(xué)研究者在解決生物學(xué)問(wèn)題時(shí)的首選,尤其在轉(zhuǎn)錄組測(cè)序方面更顯示出極大的潛力。
同一單位的轉(zhuǎn)錄組分析項(xiàng)目的結(jié)題報(bào)告形式基本統(tǒng)一,在整理結(jié)果報(bào)告時(shí),大量的分析項(xiàng)目需要重復(fù)勞動(dòng),浪費(fèi)人力物力,且容易出錯(cuò)。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
本發(fā)明的目的是針對(duì)現(xiàn)有轉(zhuǎn)錄組分析項(xiàng)目的結(jié)題報(bào)告生產(chǎn)過(guò)程中所存在的問(wèn)題而提供一種項(xiàng)目報(bào)告自動(dòng)生成方法,其可以統(tǒng)一整理分析結(jié)果,自動(dòng)生成網(wǎng)頁(yè)版結(jié)題報(bào)告,大大提高工作效率,降低成本,可以自動(dòng)檢查分析結(jié)果的完整性,減少錯(cuò)誤。
為了實(shí)現(xiàn)上述目的,本發(fā)明所采用的技術(shù)方案如下:
項(xiàng)目報(bào)告自動(dòng)生成方法,其首先使用html,Javascript制作相應(yīng)分析報(bào)告模板并將各項(xiàng)分析內(nèi)容放置對(duì)應(yīng)的目錄,然后制作程序,可同時(shí)讀取報(bào)告模板,檢查分析結(jié)果完整性,使用perl寫(xiě)作腳本讀取分析結(jié)果,修改報(bào)告模板,生成對(duì)應(yīng)項(xiàng)目的結(jié)題報(bào)告,以及整理好的結(jié)果目錄。
在本發(fā)明的一個(gè)優(yōu)選實(shí)施例中,所述分析報(bào)告模板包括相關(guān)的通用圖形、結(jié)構(gòu)樣和js腳本。
本發(fā)明可以避免大量的手動(dòng)重復(fù)工作,降低成本,提高效率,減少錯(cuò)誤。
附圖說(shuō)明
圖1示出了本發(fā)明一個(gè)實(shí)施例的參數(shù)說(shuō)明圖;
具體實(shí)施方式
項(xiàng)目報(bào)告自動(dòng)生成方法,其首先使用html,Javascript制作相應(yīng)分析報(bào)告模板并將各項(xiàng)分析內(nèi)容放置對(duì)應(yīng)的目錄,然后制作圖1所示的程序,可同時(shí)讀取報(bào)告模板,檢查分析結(jié)果完整性,使用perl寫(xiě)作腳本讀取分析結(jié)果,修改報(bào)告模板,生成對(duì)應(yīng)項(xiàng)目的結(jié)題報(bào)告,以及整理好的結(jié)果目錄。