本申請根據(jù)35U.S.C.§119(e)要求于2014年3月28日提交的美國臨時專利申請U.S.S.N.61/972,099的優(yōu)先權(quán)，其全部內(nèi)容通過引用并入本文。發(fā)明背景總前列腺特異性抗原(PSA)的血液水平升高與包括前列腺癌的前列腺相關(guān)病癥有關(guān)。有相當多的證據(jù)表明分別測量PSA的亞型的水平(而不是在單個總PSA測量中將其合并到一起)導(dǎo)致關(guān)于對象中前列腺癌的存在的預(yù)測得到改進。也有證據(jù)表明hK2(將PSA由其前體形式轉(zhuǎn)換為活性形式的分子)的測量對這樣的預(yù)測提供有用的信息。此外，已經(jīng)提出將基于這樣的測量的多標記圖(multimarkerpanel)用于評估對象中前列腺癌狀態(tài)。然而，仍然需要用于評價前列腺癌的改進方法，特別是用于評估侵略性前列腺組織活檢所需的改進方法。技術(shù)實現(xiàn)要素：本公開內(nèi)容的方面涉及用于預(yù)測從對象獲得的前列腺組織活檢是否將會包含可檢測的前列腺癌的改進方法。在一些實施方式中，所述方法涉及使用從對象獲得的血液樣品以進行測量前列腺特異性抗原水平的一種或更多種免疫測定。在一些實施方式中，已經(jīng)發(fā)現(xiàn)測量血漿制備物中的前列腺特異性抗原水平導(dǎo)致比通過測量其他血液制備物(例如血清制備物)中的水平獲得的結(jié)果更好的預(yù)測結(jié)果。在一些實施方式中，已經(jīng)發(fā)現(xiàn)，在低pH值緩沖液中執(zhí)行某些免疫測定導(dǎo)致抗原檢測更敏感，并且因此導(dǎo)致更好的預(yù)測結(jié)果。此外，在一些實施方式中，已經(jīng)發(fā)現(xiàn)，通過將關(guān)于測量的前列腺特異性抗原水平的信息與關(guān)于對象的年齡、過去的直腸指檢結(jié)果和先前的活檢狀態(tài)的一個或更多個的信息合并可獲得改進的預(yù)測結(jié)果。本文公開的改進方法可用于預(yù)測侵略性前列腺組織活檢是否應(yīng)該用于確定對象是否患有前列腺癌特別是高級別前列腺癌(例如，Gleason評分大于或等于7.0)的用途。此外，本文公開的方法是有利的，因為它們產(chǎn)生指示以下可能性的結(jié)果：侵略性的和相對冒險的診斷程序(例如前列腺組織活檢)將是有提示性的且值得執(zhí)行。因此，所述方法使有用的，因為它們使得醫(yī)療服務(wù)提供者能夠關(guān)于對象的護理做出更明智的決策。本公開內(nèi)容的方面涉及確定從對象獲得的前列腺組織活檢將會包含可檢測的前列腺癌的概率的方法。在一些實施方式中，所述方法包括：i)使對象的血漿樣品進行免疫測定，以測量血漿樣品中總前列腺特異性抗原(tPSA)的水平；ii)如果tPSA水平高于閾值水平，則通過加權(quán)測量的tPSA水平和指示所述對象是否先前有過前列腺組織活檢的參數(shù)來確定所述前列腺組織活檢將會包含可檢測的前列腺癌的概率；以及iii)如果tPSA水平處于或低于閾值水平，則使血漿樣品進行免疫測定，以測量血漿樣品中游離前列腺特異抗原(fPSA)、完整前列腺特異性抗原(iPSA)和人激肽釋放酶2(hK2)的水平，并且通過加權(quán)測量的tPSA、fPSA、iPSA和hK2的水平和指示對象是否先前有過前列腺組織活檢的參數(shù)來確定前列腺組織活檢將會包含可檢測的前列腺癌的概率。在一些實施方式中，所述方法包括：i)使對象的血漿樣品進行免疫測定，以測量游離前列腺特異抗原(fPSA)、完整前列腺特異性抗原(iPSA)、總前列腺特異性抗原(tPSA)和人激肽釋放酶2(hK2)的水平；以及ii)通過加權(quán)fPSA、iPSA、tPSA和hK2的測量水平和指示對象是否先前有過前列腺組織活檢的參數(shù)來確定前列腺組織活檢將會包含可檢測的前列腺癌的概率。本公開內(nèi)容的另一些方面涉及確定對象是否是前列腺組織活檢的候選者的方法。在一些實施方式中，所述方法包括：i)從所述對象獲得血液樣品；ii)使用步驟i)中獲得的血液樣品來確定前列腺組織活檢將會包含可檢測的前列腺癌的概率，其中a)如果使用血液樣品測量的tPSA水平高于閾值水平，則所述概率基于加權(quán)tPSA水平和指示所述對象是否先前有過前列腺組織活檢的參數(shù)，否則，b)如果tPSA水平處于或低于閾值水平，則所述概率基于加權(quán)使用血液樣品測量的tPSA、fPSA、iPSA和hK2的水平和指示所述對象是否先前有過前列腺組織活檢的參數(shù)；以及iv)基于如步驟ii)中確定的前列腺組織活檢將會包含可檢測的前列腺癌的概率來確定所述對象是否是前列腺組織活檢的候選者。本公開內(nèi)容的另一些方面涉及評估對象是否患有前列腺癌的方法。在一些實施方式中，所述方法包括：i)從所述對象獲得血液樣品；ii)確定從所述對象獲得的前列腺組織活檢將會包含可檢測的前列腺癌的概率，其中a)如果使用血液樣品測量的tPSA水平高于閾值水平，則所述概率基于加權(quán)tPSA水平和指示所述對象是否先前有過前列腺組織活檢的參數(shù)，否則，b)如果tPSA水平處于或低于閾值水平，則所述概率基于加權(quán)使用血液樣品測量的tPSA、fPSA、iPSA和hK2的水平和指示所述對象是否先前有過前列腺組織活檢的參數(shù)；iii)基于步驟ii)的結(jié)果來確定所述對象是否是前列腺組織活檢的候選者；以及iv)如果基于步驟ii)的結(jié)果所述對象為前列腺組織活檢的候選者，則從所述對象獲得前列腺組織活檢，并基于前列腺組織活檢的分析來確定所述對象是否患有前列腺癌。本公開內(nèi)容的另一些方面涉及確定對象是否患有前列腺癌的方法。在一些實施方式中，所述方法包括：i)從所述對象獲得前列腺組織活檢，其中，基于前列腺組織活檢將會包含可檢測的前列腺癌的概率，所述對象用于前列腺組織活檢，其中a)如果使用從所述對象獲得的血液樣品測量的tPSA水平高于閾值水平，則所述概率基于加權(quán)tPSA水平和指示所述對象是否先前有過前列腺組織活檢的參數(shù)，否則，b)如果tPSA水平處于或低于閾值水平，則所述概率基于加權(quán)使用血液樣品測量的tPSA、fPSA、iPSA和hK2水平和指示所述對象是否先前有過前列腺組織活檢的參數(shù)；以及ii)基于前列腺組織活檢的分析來確定所述對象是否患有前列腺癌。本公開內(nèi)容的另一些方面涉及用于測量樣品中iPSA水平的免疫測定方法。在一些實施方式中，所述方法包括：在捕獲抗體至少與iPSA結(jié)合的條件下，使樣品中存在的iPSA接觸iPSA和有缺口PSA特異的捕獲抗體，從而產(chǎn)生捕獲抗體-iPSA復(fù)合物；在pH為6.5至小于7.75范圍的緩沖液中將捕獲抗體-iPSA復(fù)合物與適當?shù)氖聚檮┖喜?，以使所述示蹤劑與捕獲抗體-iPSA復(fù)合物結(jié)合；并且檢測與捕獲抗體-iPSA復(fù)合物結(jié)合的示蹤劑。在一些實施方式中，所述方法包括：在捕獲抗體至少與iPSA結(jié)合的條件下，使樣品中存在的iPSA接觸iPSA和有缺口PSA特異的捕獲抗體，從而產(chǎn)生捕獲抗體-iPSA復(fù)合物，其中所述捕獲抗體是Fab；在示蹤劑與捕獲抗體-iPSA復(fù)合物結(jié)合的條件下，將捕獲抗體-iPSA復(fù)合物與適當?shù)氖聚檮┖喜?；以及檢測與所述捕獲抗體-iPSA復(fù)合物結(jié)合的示蹤劑。在一些實施方式中，F(xiàn)ab是5A10Fab。本公開內(nèi)容的另一些方面涉及用于測量樣品中hK2水平的免疫測定方法。在一些實施方式中，所述方法包括：在捕獲抗體至少與hK2結(jié)合的條件下，使樣品中存在的hK2接觸hK2和有缺口PSA特異的捕獲抗體，從而產(chǎn)生捕獲抗體-hK2的復(fù)合物，其中所述捕獲抗體是Fab；將捕獲抗體-hK2復(fù)合物與適當?shù)氖聚檮┖喜?；并且檢測與所述捕獲抗體-hK2復(fù)合物結(jié)合的示蹤劑。在一些實施方式中，所述Fab是F(ab)2。在一些實施方式中，所述F(ab)2是6H10F(ab)2。本公開內(nèi)容的另一些方面涉及用于評估樣品(例如，血漿樣品)的方法。在一些實施方式中，所述方法包括：(a)使樣品進行測量fPSA、iPSA、tPSA和hK2水平的免疫測定，其中，測量fPSA水平的免疫測定包括將樣品中存在的fPSA與H117捕獲抗體接觸，以產(chǎn)生捕獲抗體-fPSA復(fù)合物，并使用5A10示蹤劑抗體檢測捕獲抗體-fPSA復(fù)合物，其中測量iPSA水平的免疫測定包括將樣品中存在的iPSA與5A10Fab捕獲抗體接觸，以產(chǎn)生捕獲抗體-iPSA復(fù)合物，并使用4D4示蹤劑抗體檢測捕獲抗體-iPSA復(fù)合物，其中測量tPSA水平的免疫測定包括將樣品中存在的tPSA與H117捕獲抗體接觸，以產(chǎn)生捕獲抗體-tPSA復(fù)合物，并使用H50示蹤劑抗體檢測捕獲抗體-tPSA復(fù)合物，其中測量hK2水平的免疫測定包括將血漿樣品中的PSA與阻斷抗體接觸，使樣品中存在的hK2與6H10F(ab)2捕獲抗體接觸，以產(chǎn)生捕獲抗體-hK2復(fù)合物，并使用7G1示蹤劑抗體檢測捕獲抗體-hK2復(fù)合物；以及(b)基于測量的fPSA、iPSA、tPSA和hK2水平來評估所述樣品。本公開內(nèi)容的另一些方面涉及用于確定前列腺癌相關(guān)事件的概率的方法。在一些實施方式中，所述方法包括：經(jīng)由輸入接口接收指示對象的血漿樣品中存在的tPSA水平的信息；經(jīng)由輸入接口接收關(guān)于所述對象是否先前有過前列腺組織活檢的信息；使用至少一個處理器，至少部分地基于接收的信息來評估邏輯回歸模型，以確定對象中與前列腺癌相關(guān)事件的概率，其中評估所述邏輯回歸模型包括：至少部分地基于tPSA值和關(guān)于對象是否先前有過前列腺組織活檢的信息來確定與前列腺癌相關(guān)事件的概率；以及輸出與前列腺癌相關(guān)事件的概率的指示。在一些實施方式中，所述方法包括：經(jīng)由輸入接口接收指示對象的血漿樣品中存在的tPSA、fPSA、iPSA和hK2水平的信息；經(jīng)由輸入接口接收關(guān)于所述對象是否先前有過前列腺組織活檢的信息；使用至少一個處理器，至少部分地基于接收的信息來評估邏輯回歸模型，以確定對象中與前列腺癌相關(guān)事件的概率，其中，評估所述邏輯回歸模型包括：至少部分地基于指示tPSA、fPSA、iPSA和hK2水平的信息和關(guān)于所述對象是否先前有過前列腺組織活檢的信息來確定與前列腺癌相關(guān)事件的概率；以及輸出與前列腺癌相關(guān)事件的概率的指示。在本公開內(nèi)容的某些方面中，提供了用于確定與前列腺癌相關(guān)事件的概率的計算機。在一些實施方式中，所述計算機包括：輸入接口，其被配置成接收指示對象的血漿樣品中存在的tPSA水平的信息和關(guān)于對象是否先前有過前列腺組織活檢的信息；至少一個處理器，其被編程以至少部分地基于接收信息來評估邏輯回歸模型，以確定對象中與前列腺癌相關(guān)事件的概率，其中，評估所述邏輯回歸模型包括：至少部分地基于tPSA值和關(guān)于對象是否先前有過前列腺組織活檢的信息來確定與前列腺癌相關(guān)事件的概率；以及輸出接口，其被配置成輸出與前列腺癌相關(guān)事件的概率的指示。在一些實施方式中，所述計算機包括：輸入接口，其被配置成接收指示對象的血漿樣品中存在的tPSA、fPSA、iPSA和hK2水平的信息和關(guān)于所述對象是否先前有過前列腺組織活檢的信息；至少一個處理器，其被編程以至少部分地基于接收的信息來評估邏輯回歸模型，以確定對象中與前列腺癌相關(guān)事件的概率，其中，評估所述邏輯回歸模型包括：至少部分地基于指示tPSA、fPSA、iPSA和hK2水平的信息和關(guān)于所述對象是否先前有過前列腺組織活檢的信息來確定與前列腺癌相關(guān)事件的概率；以及輸出接口，其被配置成輸出與前列腺癌相關(guān)事件的概率的指示。在本公開內(nèi)容的其它方面中，提供了用于確定與前列腺癌相關(guān)事件的概率的系統(tǒng)。在一些實施方式中，所述系統(tǒng)包括：a)檢測器，其被配置成測量對象的血漿樣品中存在的tPSA水平；以及b)計算機，其與所述檢測器進行電子通信，其中，所述計算機包括：i)輸入接口，其被配置成接收來自指示測量的tPSA水平的檢測器的信息，并且接收關(guān)于所述對象是否先前有過前列腺組織活檢的信息；ii)至少一個處理器，其被編程以至少部分地基于接收的信息來評估邏輯回歸模型，以確定對象中與前列腺癌相關(guān)事件的概率，其中，評估所述邏輯回歸模型包括：至少部分地基于指示tPSA水平的信息和關(guān)于所述對象是否先前有過前列腺組織活檢的信息來確定與前列腺癌相關(guān)事件的概率；以及iii)輸出接口，其被配置成輸出與前列腺癌相關(guān)事件的概率的指示。在一些實施方式中，所述系統(tǒng)包括：a)檢測器，其被配置成測量對象的血漿樣品中存在的tPSA、fPSA、iPSA和hK2水平；以及b)計算機，其與所述檢測器進行電子通信，其中所述計算機包括：i)輸入接口，其被配置成接收來自指示測量的tPSA、fPSA、iPSA和hK2水平的檢測器的信息，并且接收關(guān)于所述對象是否先前有過前列腺組織活檢的信息；ii)至少一個處理器，其被編程以至少部分地基于接收的信息來評估邏輯回歸模型，以確定對象中與前列腺癌相關(guān)事件的概率，其中，評估所述邏輯回歸模型包括：至少部分地基于指示tPSA、fPSA、iPSA和hK2水平的信息和關(guān)于所述對象是否先前有過前列腺組織活檢的信息來確定與前列腺癌相關(guān)事件的概率；以及iii)輸出接口，其被配置成輸出與前列腺癌相關(guān)事件的概率的指示。在本公開內(nèi)容的另一些方面中，提供了編碼有多個指令的計算機可讀存儲介質(zhì)，當所述指令由計算機執(zhí)行時，其執(zhí)行用于確定與前列腺癌相關(guān)事件的概率的方法。在一些實施方式中，所述方法包括：至少部分地基于表示對象的血漿樣品中存在的tPSA水平的信息和關(guān)于所述對象是否先前有過前列腺組織活檢的信息來評估邏輯回歸模型，以確定對象中與前列腺癌相關(guān)事件的概率，其中，評估所述邏輯回歸模型包括：至少部分地基于tPSA值和關(guān)于所述對象是否先前有過前列腺組織活檢的信息來確定與前列腺癌相關(guān)事件的概率；以及輸出與前列腺癌相關(guān)事件的概率的指示。在一些實施方式中，所述方法包括：至少部分基于指示對象的血漿樣品中存在的tPSA、fPSA、iPSA和hK2水平的信息和關(guān)于所述對象是否先前有過前列腺組織活檢的信息來評估邏輯回歸模型，以確定對象中與前列腺癌相關(guān)事件的概率，其中，評估所述邏輯回歸模型包括：至少部分地基于指示tPSA、fPSA、iPSA和hK2水平的信息和關(guān)于所述對象是否先前有過前列腺組織活檢的信息來確定與前列腺癌相關(guān)事件的概率；以及輸出與前列腺癌相關(guān)事件的概率的指示。附圖簡述圖1A是示出用于確定活檢將會包含可檢測的前列腺癌的概率的方法的非限制性示意圖；圖1B是配置用于實施用于確定活檢將會包含可檢測的前列腺癌的概率的方法的計算機的非限制性示意圖；圖1C是配置用于實施用于確定活檢將會包含可檢測的前列腺癌的概率的方法的計算機網(wǎng)絡(luò)的非限制性示意圖；圖2是比較高級別癌癥的實際風(fēng)險與預(yù)測風(fēng)險的圖的非限制性示例；圖3是比較任何級別的癌癥的實際風(fēng)險與預(yù)測風(fēng)險的圖的非限制性示例；圖4是示出了高級別癌癥的決策曲線分析的圖的非限制性示例；圖5是示出了任何級別癌癥的決策曲線分析的圖的非限制性示例；圖6是針對高級別癌癥的接受者操作曲線(ReceiverOperatingCurve，ROC)的圖的非限制性示例；圖7是針對任何級別的癌癥的接受者操作曲線(ROC)的圖的非限制性示例；圖8A是高級別癌癥活檢閾值處陽性預(yù)測值的圖的非限制性示例；圖8B是高級別癌癥活檢閾值處陰性預(yù)測值的圖的非限制性示例；圖9A是任何級別的癌癥活檢閾值處陽性預(yù)測值的圖的非限制性示例；圖9B是任何級別的癌癥活檢閾值處陰性預(yù)測值的圖的非限制性示例；圖10示出了表示在活檢時按年齡患有高級別疾病的人的比例的圖的非限制性示例；圖11A和11B示出了表示在驗證研究的所有患者中檢測高級別癌癥的預(yù)測概率與實際概率的圖的非限制性示例；圖11C示出了表示在驗證研究的所有患者中檢測任何級別癌癥的預(yù)測概率與實際概率的圖的非限制性示例；圖12A和12B示出了在驗證研究的50-75歲的患者中檢測高級別癌癥的預(yù)測概率與實際概率的圖的非限制性示例；圖12C示出了在驗證研究的50-75歲的患者中檢測任何級別癌癥的預(yù)測概率與實際概率的圖的非限制性示例；圖13A和13B示出了在驗證研究的小于71歲的患者中檢測高級別癌癥的預(yù)測概率與實際概率的圖的非限制性示例；圖13C示出了表示在小于71歲的患者中檢測任何級別的癌癥的預(yù)測概率與實際概率的圖的非限制性示例；圖14A和14B示出了表示驗證研究的所有患者的凈效益(netbenefit)與閾值概率水平的圖的非限制性示例；圖15A和15B示出表示驗證研究的50-75歲的所有患者的凈效益與閾值概率水平的圖的非限制性示例；以及圖16A和16B示出表示驗證研究的小于71歲的所有患者的凈效益與閾值概率水平的圖的非限制性示例。發(fā)明詳述本公開內(nèi)容的方面涉及用于以下的改進方法：預(yù)測從對象獲得的前列腺組織活檢是否將會包含可檢測的前列腺癌，包括高級別前列腺癌(Gleason7或更高)。因此，本文公開的方法可以被醫(yī)療服務(wù)提供者用于確定是否值得進行前列腺組織活檢的目的。在一些實施方式中，所述方法涉及使用從對象獲得的血液樣品來進行測量前列腺特異性抗原(例如總前列腺特異性抗原(tPSA)、游離前列腺特異抗原(fPSA)、完整前列腺特異性抗原(iPSA)和人激肽釋放酶2(hK2))水平的一種或更多種免疫測定。在一些實施方式中，已經(jīng)發(fā)現(xiàn)測量血漿制備物中一種或更多種這些抗原的水平導(dǎo)致比測量其他血液制備物(例如血清)中的水平獲得的結(jié)果更好的預(yù)測結(jié)果。在一些實施方式中，提供了合并tPSA、fPSA、iPSA和/或hK2的血漿水平的預(yù)測模型(例如，邏輯回歸模型)，以確定前列腺組織活檢將會包含可檢測的癌癥的概率。此外，在一些實施方式中，已經(jīng)發(fā)現(xiàn)通過合并有關(guān)測量的前列腺特異性抗原水平的信息和患者的信息(特別是關(guān)于所述對象是否先前有過用于檢測前列腺癌的存在的活檢的信息)可以獲得改進的預(yù)測結(jié)果。因此，提供了用于確定對象是否應(yīng)進行侵略性前列腺組織活檢的改進方法。本公開內(nèi)容的方面提供了確定從對象獲得的前列腺組織活檢將會包含可檢測的前列腺癌的概率的方法。這樣的方法可包括使對象的血漿樣品進行至少測量血漿樣品中總前列腺特異性抗原(tPSA)水平的免疫測定。如果tPSA水平高于閾值水平，則可以通過加權(quán)測量的tPSA水平和指示所述對象是否先前有過前列腺組織活檢的參數(shù)來確定前列腺組織活檢將會包含可檢測的前列腺癌的概率。另一方面，如果tPSA水平處于閾值水平或低于閾值水平，則可通過加權(quán)測量的tPSA、fPSA、iPSA和hK2水平和指示所述對象是否先前有過前列腺組織活檢的參數(shù)來確定前列腺組織活檢會包含可檢測的前列腺癌的概率。因此，在一些實施方式中，本文提供的方法可以包括使血漿樣品進行如下免疫測定：測量血漿樣品中游離前列腺特異性抗原(fPSA)、完整前列腺特異性抗原(iPSA)和人激肽釋放酶2(hK2)水平。在一些實施方式中，通過加權(quán)指示對象年齡的參數(shù)來進一步確定所述概率。在一些實施方式中，通過加權(quán)指示對所述對象進行的直腸指檢的結(jié)果的一個或更多個參數(shù)來進一步確定所述概率。在一些實施方式中，用于模型選擇的tPSA的閾值水平是這樣的水平，其表示單獨使用tPSA或與某些患者特定信息(例如，先前的活檢狀態(tài))一起使用tPSA是否足夠用于建立前列腺組織活檢將會包含可檢測的前列腺癌的概率的目的。在一些實施方式中，所述閾值水平為5ng/mL、10ng/mL、15ng/mL、20ng/mL、25ng/mL、30ng/mL、35ng/mL或40ng/mL。因為與某些患者指定信息(specificationinformation)特別是先前的活檢狀態(tài)結(jié)合的tPSA水平可足以得到提示性預(yù)測，在一些實施方式中，在首先確定tPSA水平之前不進行檢測另一些抗原的免疫測定可節(jié)約成本。然而，在一些實施方式中，可并行地或與其他標志物水平(例如，fPSA、iPSA或hK2)一起確定tPSA水平。在一些實施方式中，在相同的測定中并行地確定抗原水平(例如，tPSA、fPSA、iPSA和hK2中的兩個或更多個的水平)。在另一些實施方式中，在不同的測定中確定這樣的抗原水平。在一些實施方式中，從來自對象的相同的原始抽血(例如，靜脈抽血)來確定抗原水平。在一些實施方式中，從不同的抽血確定抗原水平。在一些實施方式中，使用來自相同或不同的抽血的血漿制備物來確定抗原水平。在一些實施方式中，使用血漿制備物來確定一種或更多種抗原水平，并且使用不同類型的血液制備物(例如血清)來確定一種或更多種其他抗原。血漿是血液的淡黃色液體成分。在一些實施方式中，可通過以下方法來制備血漿：使含有抗凝劑(例如，肝素、EDTA等)的血液的試管在離心機中旋轉(zhuǎn)，直到血細胞和碎片移動到試管的底部為止，在此之后，可以傾倒或抽出血漿。本文提供了用于確定對象是否是前列腺組織活檢的候選者的方法。這樣的方法可包括：醫(yī)師或醫(yī)療保健提供者從對象獲得血液樣品，并至少部分地基于使用血液樣品確定的所測量的抗原水平來確定前列腺組織活檢將會含有可檢測的前列腺癌的概率。血液樣品可在本地處理(例如，在正評估對象的相同醫(yī)療機構(gòu)或企業(yè)內(nèi)部)，或者可將其派送到外面的或第三方實驗室或機構(gòu)以進行處理和分析。如果使用血液樣品測量的tPSA水平高于閾值水平，則基于加權(quán)tPSA水平來確定所述概率。否則，如果tPSA水平處于所述閾值水平或低于所述閾值水平，則所述概率基于加權(quán)使用血液樣品測量的tPSA、fPSA、iPSA和hK2的水平。不論哪種情況，所述概率通常還基于加權(quán)指示所述對象是否先前有過前列腺組織活檢的參數(shù)。醫(yī)師或醫(yī)療保健提供者可基于前列腺組織活檢將會包含可檢測的前列腺癌的概率來確定對象是否是前列腺組織活檢的候選者。在一些實施方式中，醫(yī)師或醫(yī)療保健提供者可設(shè)置概率界限(probabilitycut-off)，其中，如果概率等于或高于界限，則將指示活檢。例如，如果概率大于5％、7.5％、10％、12.5％、15％、20％、25％、30％、35％、40％、45％、50％、55％、60％、65％、70％、75％、80％、85％、90％、95％、99％或更大，則醫(yī)師或醫(yī)療保健提供者可確定所述對象為前列腺組織活檢的候選者。在一些實施方式中，基于前列腺組織活檢將會包含可檢測的高級別(例如，Gleason評分為7或以上)前列腺癌的概率，界限為5％、7.5％、10％、12.5％或15％。在一些實施方式中，基于前列腺組織活檢將會包含可檢測的任何級別的前列腺癌的概率，界限為10％、12.5％、15％、20％、25％或30％。在一些實施方式中，如果概率低于界限，那么醫(yī)師或醫(yī)療保健提供者將不安排活檢，而是將繼續(xù)對所述對象進行監(jiān)測，例如概率水平的提高或指示前列腺癌的其它風(fēng)險因素的變化。在一些實施方式中，如果對象被確定為前列腺組織活檢的候選者，則醫(yī)師或醫(yī)療保健提供者可以從對象獲得或要求從所述對象獲得前列腺組織活檢，并基于前列腺組織活檢的分析來確定所述對象是否已患有前列腺癌?？墒褂萌魏芜m當?shù)姆椒?包括例如細胞學(xué)或組織學(xué)分析)來分析前列腺組織活檢。組織樣品可基于癌癥的其臨床階段來表征。樣品可基于Gleason分級來表征。Gleason3+3(6.0)對應(yīng)于低級別腫瘤和預(yù)后較好的腫瘤。Gleason3+4(7.0)和3+5(8.0)通常對應(yīng)于主要具有低級別轉(zhuǎn)化(lowgradetransformation)以及一些高級別轉(zhuǎn)化的組織的腫瘤。Gleason4+3(7.0)和5+3(8.0)通常對應(yīng)于主要具有高級別轉(zhuǎn)化以及一些低級別轉(zhuǎn)化的組織的腫瘤。Gleason4+4(8.0)、4+5(9.0)、(9.0)和5+5(10.0)對應(yīng)于高級別腫瘤。因此，在一些實施方式中，前列腺癌包括高級別癌癥(例如，Gleason≥7.0)。免疫測定可通過任何適當?shù)姆椒ㄔu估前列腺特異性抗原(例如，tPSA、iPSA、fPSA和hK2)的水平。在一些實施方式中，提供了適合用于免疫測定的抗體或抗原結(jié)合片段(antibodiesorantigen-bindingfragments)。利用這樣抗體或抗原結(jié)合片段的免疫測定可以是直接或間接方式的競爭性和非競爭性免疫測定。這樣的免疫測定的非限制性示例是酶聯(lián)免疫測定(ELISA)、放射免疫測定(RIA)、夾心測定(免疫計量測定)、流式細胞術(shù)、western印跡測定、免疫沉淀測定、免疫組織化學(xué)、免疫顯微術(shù)、側(cè)向流動免疫色譜測定和蛋白質(zhì)組學(xué)陣列。例如可以通過與固體支持物(例如，載體、膜、柱、蛋白質(zhì)組學(xué)陣列等)結(jié)合來將與其結(jié)合的抗原或抗體或抗原結(jié)合片段固定。固體支持物材料的示例包括玻璃、聚苯乙烯、聚氯乙烯、聚偏二氟乙烯、聚丙烯、聚乙烯、聚碳酸酯、葡聚糖、尼龍、直鏈淀粉、天然和改性的纖維素例如硝酸纖維素、聚丙烯酰胺、瓊脂糖和磁鐵礦。支持物的性質(zhì)可以是固定或懸浮于溶液(例如，珠粒)中。在一些實施方式中，標記的抗體或抗原結(jié)合片段可用作示蹤劑，以檢測抗原結(jié)合抗體復(fù)合物?？捎糜诋a(chǎn)生示蹤劑的標記類型的示例包括酶、放射性同位素、膠體金屬、熒光化合物、磁、化學(xué)發(fā)光化合物和生物發(fā)光化合物。通過耦合放射性同位素例如153Eu、3H、32P、35S、59Fe或125I(其隨后可以由γ計數(shù)器、閃爍計數(shù)器或通過放射自顯影來檢測)以已知的方式制備放射性標記的抗體。如本文中所討論的，抗體和抗原結(jié)合片段可以用酶例如酵母醇脫氫酶、辣根過氧化物酶、堿性磷酸酶等替代地標記，然后顯影并以分光光度法或可視地進行檢測。合適的熒光標記包括熒光素異硫氰酸酯、熒光胺、若丹明等。合適的化學(xué)發(fā)光標記包括魯米諾、咪唑、草酸酯、螢光素等。免疫測定可以包括：在使抗體或抗原結(jié)合片段與抗原之間能夠形成結(jié)合復(fù)合物的條件下，使含有抗原的樣品(例如，血漿樣品)與抗體或抗原結(jié)合片段(例如，F(xiàn)(ab)、F(ab)2)接觸。在一些實施方式中，如果抗原存在于樣品中，在抗體或抗原結(jié)合片段適合與靶抗原結(jié)合的條件下，使血漿樣品與抗體或抗原結(jié)合片段結(jié)合接觸。這可以在合適的反應(yīng)室(例如試管、板井(platewell)、膜浴、細胞培養(yǎng)皿、載玻片以及其他腔室)中進行。在一些實施方式中，抗體或抗原結(jié)合片段被固定到固體支持物上。與樣品中抗原結(jié)合的抗體或抗原結(jié)合片段可以被稱為捕獲抗體。在一些實施方式中，捕獲抗體包含標簽(例如，生物素標記)，其通過涉及標簽的相互作用(例如，生物素-鏈霉親和素相互作用，其中鏈霉親和素被固定到固體支持物)促進其固定化到固體支持物上。在一些實施方式中，所述固體支持物是反應(yīng)室的表面。在一些實施方式中，所述固體支持物是聚合物膜(例如，硝化纖維素條、聚偏二氟乙烯(PVDF)膜等)。在另一些實施方式中，所述固體支持物是生物結(jié)構(gòu)(例如，細菌細胞表面)。在本文公開了另一些示例性固體支持物，并且其對于本領(lǐng)域普通技術(shù)人員將是顯而易見的。在一些實施方式中，抗體和抗原結(jié)合片段在與抗原接觸之前被固定到固體支持物上。在另一些實施方式中，在形成結(jié)合復(fù)合物后進行抗體和抗原結(jié)合片段的固定化。在又一些實施方式中，抗原在形成結(jié)合復(fù)合物之前被固定到固體支持物上。在一些實施方式中，可以向反應(yīng)室添加示蹤劑，以檢測固定的結(jié)合復(fù)合物。在一些實施方式中，所述示蹤劑包含針對抗原的可檢測標記的第二抗體。在一些實施方式中，所述示蹤劑包含針對捕獲抗體的可檢測標記的第二抗體。在一些實施方式中，第一抗體或抗原結(jié)合片段本身是可檢測標記的。在一個實施方式中，本文公開的免疫測定方法包括：將抗體或抗原結(jié)合片段固定化到固相支持物上；在允許抗原與抗體或抗原結(jié)合片段(如果在樣品中存在)結(jié)合的條件下，將樣品(例如，血漿樣品)施加到固體支持物上；從所述固體支持物移除過量的樣品；在允許示蹤劑與抗原結(jié)合的固定化抗體或抗原結(jié)合片段結(jié)合的條件下，施加示蹤劑(例如，可檢測標記的抗體或抗原結(jié)合片段)；洗滌固體支持物，并測定存在的示蹤劑。在一些實施方式中，抗體和抗原結(jié)合片段在反應(yīng)室中與抗原接觸后被固定在固體支持物上。在一些實施方式中，抗體和抗原結(jié)合片段在反應(yīng)室中與抗原接觸之前被固定到固體支持物上。不論哪種情況，可向反應(yīng)室添加示蹤劑，以檢測固定的結(jié)合復(fù)合物。在一些實施方式中，所述示蹤劑包含針對抗原的可檢測標記的第二抗體。在一些實施方式中，所述示蹤劑包含針對第一抗體或抗原結(jié)合片段的可檢測標記的第二抗體。如本文所公開的，可檢測標記可以是例如放射性同位素、熒光團、發(fā)光分子、酶、生物素基團、表位標簽或染料分子。本文描述了合適的可檢測標記。在一些實施方式中，已經(jīng)發(fā)現(xiàn)，在低pH值緩沖液中進行某些免疫測定導(dǎo)致抗原檢測更敏感。因此，在一些實施方式中，在pH為6.5至小于7.75范圍的緩沖液中，示蹤劑抗體與捕獲抗體接觸，使得示蹤劑與捕獲抗體-抗原復(fù)合物結(jié)合。在一些實施方式中，緩沖液pH為約6.5、6.6、6.7、6.8、6.9、7.0、7.1、7.2、7.3、7.4、7.5或7.6。應(yīng)理解，在本文公開的任何測定中，捕獲抗體可以與示蹤劑抗體交換。在一些實施方式中，測量fPSA水平的免疫測定包括：在其中第一捕獲抗體與fPSA結(jié)合的條件下，使血漿樣品中存在的fPSA與fPSA特異的捕獲抗體接觸，從而產(chǎn)生捕獲抗體-fPSA復(fù)合物；以及使用示蹤劑檢測捕獲抗體-fPSA復(fù)合物。捕獲抗體可以是H117抗體。在一些實施方式中，所述示蹤劑包括5A10抗體或其片段(例如，F(xiàn)(ab)片段)?？梢圆⑷肫沃械?A10抗體的重鏈和輕鏈序列如下所示：5A10重鏈EVQLVESGPGILQPSQTLSLTCSFSGFSLSTTGMGVSWIRQPSGKGLEWLAHLYWDEDKRYNPSLKSRLTISEDSSRNQVFLKITSVGPADSATYYCARKGYYGYFDYWGQGTALTVSS(SEQIDNO：1)5A10輕鏈DIVMTQSQKFMSTSVGDRVSVTCKASQNVNTDVAWYQQKPGQSPKALIFSTSYRSSGVPDRFTGSGSGTDFTLTTTNVQSEDLAEYFCQQYSNYPLTFGAGTKVDLN(SEQIDNO：2)在一些實施方式中，測量iPSA水平的免疫測定包括：在其中第二捕獲抗體至少與iPSA結(jié)合的條件下，使血漿樣品中存在的iPSA與游離PSA特異的捕獲抗體(其包括iPSA和有缺口PSA)接觸，從而產(chǎn)生捕獲抗體-iPSA復(fù)合物，并使用第二示蹤劑檢測捕獲抗體-iPSA復(fù)合物。在一些實施方式中，所述示蹤劑包括4D4抗體。在一些實施方式中，所述捕獲抗體是5A10抗體或其片段(例如，F(xiàn)(ab)片段)。在一些實施方式中，測量tPSA水平的免疫測定包括：在其中第三捕獲抗體與tPSA結(jié)合的條件下，使血漿樣品中存在的tPSA與tPSA特異的捕獲抗體接觸，從而產(chǎn)生捕獲抗體-tPSA復(fù)合物；和使用第三示蹤劑檢測捕獲抗體tPSA復(fù)合物。在一些實施方式中，所述示蹤劑包括H50抗體。在一些實施方式中，所述捕獲抗體是H117抗體。在一些實施方式中，測量hK2水平的免疫測定包括：使血漿樣品中的PSA與PSA特異的阻斷抗體接觸；在其中第四捕獲抗體與hK2結(jié)合的條件下，使血漿樣品中存在的hK2與hK2特異的第四捕獲抗體接觸；從而產(chǎn)生捕獲抗體-hK2復(fù)合物；并使用第四示蹤劑檢測捕獲抗體-hK2復(fù)合物。在一些實施方式中，所述示蹤劑包括7G1抗體。在一些實施方式中，捕獲抗體是6H10F(ab)2。在一些實施方式中，所述阻斷抗體包括5H7抗體、5H6抗體和2E9抗體。下表0列出了可用于本文公開的方法中的抗體和抗原結(jié)合片段及其相應(yīng)的表位。表0：抗體和表位/抗體的來源微流體樣品分析儀應(yīng)理解，可以使用微流體裝置(例如，微流體樣品分析儀)執(zhí)行或?qū)嵤┍疚墓_的任何免疫測定方法。例如，微流體裝置可用于確定標志物(例如，tPSA、fPSA、iPSA或hK2水平)的一種或多種特性。在一些實施方式中，裝置是微流體樣品分析儀，其例如可配置為分析盒中提供的樣品，所述盒具有一個或更多個微流體通道，以用于容納和/或引導(dǎo)包含免疫組分(例如，抗原-抗體復(fù)合物、示蹤劑等)的樣品流。在一些實施方式中，裝置還包含光學(xué)系統(tǒng)，其包括一個或更多個光源和/或一個或更多個被配置用于測量一個或更多個微流體通道中存在的抗原-抗體復(fù)合物和/或示蹤劑的水平的檢測器。此外，在一些實施方式中，提供了這樣的系統(tǒng)，其可以包括與微流體裝置(例如，微流體樣品分析儀)進行電子通信的編程以評估預(yù)測模型(例如，邏輯回歸模型)的處理器或計算機，或基于標志物的水平(例如，tPSA、fPSA、iPSA或hK2的水平)用于確定與前列腺癌相關(guān)事件的概率的另一些裝置。合適的微流體裝置的非限制性示例在2013年10月17日公開的題為“METHODSANDAPPARATUSESFORPREDICTINGRISKOFPROSTATECANCERANDPROSTATEGANDVOLUME”的美國專利申請公開號US2013/0273643中公開，其內(nèi)容通過引用整體并入本文用于所有目的。然而，應(yīng)理解，也可使用其他類型的裝置(例如，板讀數(shù)器(platereaders)、微孔ELISA型測定的分析儀等)，因為本公開內(nèi)容并不被限制于此方面。預(yù)測模型和計算機實施方法本公開內(nèi)容的方面提供了用于確定與前列腺癌相關(guān)事件的概率(例如前列腺組織活檢將會包含可檢測的癌癥的概率)的計算機實施方法。這樣的方法可以包括：經(jīng)由輸入接口接收指示血漿樣品中存在的tPSA水平的信息，以及經(jīng)由輸入接口接收關(guān)于對象是否先前有過前列腺組織活檢的信息。在一些實施方式中，所述方法還包括：使用至少一個處理器至少部分地基于接收的信息來評估適合的預(yù)測模型(例如，邏輯回歸模型)，以確定對象中與前列腺癌相關(guān)事件的概率。至少部分地基于測量的tPSA水平和關(guān)于對象是否先前有過前列腺組織活檢的信息，預(yù)測性模型可以產(chǎn)生與前列腺癌相關(guān)事件的概率。至少部分地基于測量的tPSA、fPSA、iPSA和hK2水平和關(guān)于對象是否先前有過前列腺組織活檢的信息，預(yù)測性模型可產(chǎn)生與前列腺癌相關(guān)事件的概率。圖1示出了根據(jù)本公開內(nèi)容的一些實施方式的過程100的流程圖。在步驟101中，使用本文描述的一種或更多種技術(shù)通過至少一個用于處理的處理器來接收表示對應(yīng)于年齡、指檢狀態(tài)和/或先前的活檢狀態(tài)的患者數(shù)據(jù)的一個或多個值。在步驟102中，通過至少一個處理器接收表示tPSA、fPSA、iPSA和/或hK2的標志物數(shù)據(jù)的一個或更多個值。可通過任何合適的方式(包括但不限于：通過本地輸入接口，例如鍵盤、觸摸屏、麥克風(fēng)或其他輸入設(shè)備)從網(wǎng)絡(luò)連接的接口(其接收來自位于遠離一個或更多個處理器的設(shè)備的值)或直接從測量血液標志物值的一個或更多個檢測器(例如，在其中處理器與包括一個或更多個檢測器的測量裝置集成的實施中)來接收所述值。在步驟103中，在接收tPSA值之后，該過程繼續(xù)進行，使得如果tPSA的水平高于閾值(例如，25ng/mL)，則選擇第一預(yù)測模型，而如果tPSA水平等于或低于閾值，則選擇第二預(yù)測模型。因此，在步驟104中，如果tPSA的水平高于閾值水平，則選擇基于DRE狀態(tài)、先前的活檢狀態(tài)和tPSA水平的預(yù)測模型。替代地，在步驟105中，如果tPSA水平等于或低于閾值水平，則基于DRE狀態(tài)、先前的活檢狀態(tài)和tPSA、fPSA、iPSA和hK2的水平選擇預(yù)測模型。步驟104、105的預(yù)測模型用于確定對象患有前列腺癌的概率。取決于所使用的模型，所述預(yù)測可用于任何級別的癌癥或用于高級別的癌癥。確定癌癥的概率之后，該過程繼續(xù)進行值步驟106，其中，概率被輸出至用戶(例如，醫(yī)生、患者)以指導(dǎo)進一步的診斷過程和/或治療決定。概率可以以任何合適的方式輸出。例如，在一些實施方式中，可通過在設(shè)備的顯示屏幕上顯示表示概率的數(shù)值來輸出概率。在另一些實施方式中，可使用設(shè)備上的一個或更多個光源或其他可視指示器來輸出概率。在又一些實施方式中，可使用音頻輸出、觸覺輸出或一個或更多個音頻、觸覺和視覺輸出的一些組合來提供概率。在一些實施方式中，輸出概率包括向網(wǎng)絡(luò)連接設(shè)備發(fā)送信息，以通知用戶所確定的概率。例如，可通過位于遠程站點的一個或更多個處理器來確定概率，并且響應(yīng)于在遠程站點處確定概率，可以使用一個或更多個網(wǎng)絡(luò)將概率的指示發(fā)送到用戶(例如，醫(yī)生)的電子設(shè)備。根據(jù)本文所述的技術(shù)為用戶提供輸出的電子設(shè)備可以是任何合適的設(shè)備，包括但不限于：筆記本電腦、臺式機或平板計算機、智能電話、尋呼機、個人數(shù)字助理和電子顯示屏。在一些實施方式中，根據(jù)下面給出的等式(I)確定前列腺癌的概率：其中，使用多個邏輯回歸模型中任一個確定分對數(shù)(L)?？捎糜诟鶕?jù)本文所述的技術(shù)中的不同類型的邏輯回歸模型的非限制性示例包括：1.簡單模型(僅tPSA)L＝β0+β1(Age)+β2(tPSA)+β3(priorbx)(2)或L＝β0+β1tpsa+β2dreneg+β3drepos+β4priorbx(3)2.使用游離/總比的四項測定模型在該模型中，游離PSA與總PSA的比替代游離PSA項。3.使用log(tPSA)和游離/總比的四項測定模型在該模型中，tPSA的對數(shù)替代tPSA項，以說明這種預(yù)測因子增加的貢獻。4.多項式模型在該模型中，額外的tPSA和fPSA的非線性項都包括在內(nèi)。在下面提供的示例等式中，tPSA的平方用于強調(diào)該項與前列腺癌的風(fēng)險之間的直接關(guān)系，而游離/總PSA項的平方根用來反映該項與風(fēng)險的負相關(guān)。然而，應(yīng)理解，在一些實施方式中也可包含較高階(例如，三次)的多項式項。5.所有四項測定的線性樣條(Splines)在該模型中，添加了線性樣條，在中值處有單個結(jié)點(knot)?？梢允褂靡韵碌仁酱_定樣條：其中，模型表示為：L＝β0+β1(Age)+β2(tPSA)+β3(fPSA)+β4(iPSA)+β5(hK2)+β6(sp1[tPSA])+β7(sp2[tPSA])+β8(sp1[fPSA])+β9(sp2[fPSA])+β10(sp1[iPSA])+β11(sp2[iPSA])+β12(sp1[hK2])+β13(sp2[hK2])+β14(priorbx)(8)6.tPSA和fPSA的線性樣條在該模型中，僅tPSA和fPSA包含線性樣條以減少變量數(shù)目并簡化模型。L＝β0+β1(Age)+β2(tPSA)+β3(fPSA)+β4(iPSA)+β5(hK2)+β6(sp1[tPSA])+β7(sp2[tPSA])+β8(sp1[fPSA])+β9(sp2[fPSA])+β10(priorbx)(9)在上面的等式中，“priorbx”是指示對象是否先前有過活檢以檢測前列腺癌的二進制值。值為1表示發(fā)生過先前的活檢，而值為0表示沒有發(fā)生先前的活檢。7.所有四項測定的三次樣條(cubicSplines)在該模型中，每個項都包含三次樣條。在下面提供的示例中，描述了具有四個節(jié)點的三次樣條。然而，應(yīng)理解，使用任何合適數(shù)量的結(jié)點的三次樣條包括但不限于：五節(jié)點、六節(jié)點、七節(jié)點以及替代地可使用八節(jié)點?？梢岳孟旅娴牡仁絹泶_定樣條：其中，knot1和knot4為三次樣條的外部節(jié)點，knot2和knot3為三次樣條的內(nèi)部節(jié)點。外部節(jié)點可被設(shè)置為群體中tPSA、fPSA、iPSA或hK2的最小和最大水平。內(nèi)部結(jié)點(例如，knot2)可被設(shè)置為群體中tPSA、fPSA、iPSA或hK2水平的33.3百分位數(shù)值。另一個內(nèi)部結(jié)點(例如，knot3)可被設(shè)置為群體中tPSA、fPSA、iPSA或hK2水平的66.6百分位數(shù)。在一些實施方式中，內(nèi)部結(jié)點均被指定在以下范圍內(nèi)：約2至約8之間和約3至約6之間(對于tPSA)、約0.25至約2之間和約0.5至約1.5之間(對于fPSA)、約0.2至約0.5之間和約0.4至約0.8之間(對于iPSA)、約0.02至約0.04之間和約0.04至約0.08之間(對于hK2)。例如，在一個實施中，3.92和5.61的值用于tPSA的內(nèi)部結(jié)點、0.82和1.21的值用于fPSA的內(nèi)部結(jié)點、0.3和0.51的值用于iPSA的內(nèi)部結(jié)點，以及0.036和0.056的值用于hK2的內(nèi)部結(jié)點。在某些實施方式中，tPSA的一個或更多個內(nèi)部結(jié)點可獨立地在以下范圍內(nèi)：約3至約5之間、約3至約6之間、約2.5至約6之間、約2.5至約6.5之間、約5至約8之間、約5.5至約8之間、約5至約9之間、約5至約10之間、約1至約5之間、約1至約4之間以及約1至約3之間。其他范圍也可以。在某些實施方式中，fPSA的一個或多個內(nèi)部結(jié)點可獨立地在以下范圍內(nèi)：約0.1至約1.0之間、約0.1至約1.2之間、約0.3至約0.8之間、約0.4至約0.9之間、約0.5至約1.2之間、約0.7至約1.4之間、約0.7至約0.9之間、約1.1至約1.6之間、約1.1至約1.2之間、約1.1至約2之間。其他范圍也可以。在某些實施方式中，iPSA的一個或多個內(nèi)部結(jié)點可獨立地在以下范圍內(nèi)：約0.05至約0.5之間、約0.1至約0.5之間、約0.2至約0.5之間、約0.1至約0.8之間、約0.2至約0.8之間、約0.4至約0.8之間、約0.4至約1.0之間、約0.3至約0.6之間、約0.5至約1.0之間以及約0.6至約0.8之間。其他范圍也可以。在某些實施方式中，hK2的一個或多個內(nèi)部結(jié)點可以獨立地在以下范圍內(nèi)：約0.01至約0.03之間、約0.01至約0.04之間、約0.01至約0.05之間、約0.02至約0.05之間、約0.02至約0.06之間、約0.03至約0.05之間、約0.4至約0.07之間、約0.04至約1.0之間、約0.5至約1.0之間以及約0.6至約1.0之間。其他范圍也可以。如上所述，可使用并入任何適當數(shù)量的內(nèi)部結(jié)點(例如，三個、四個、五個、六個內(nèi)部節(jié)點)的三次樣條，并且僅提供包括兩個內(nèi)部結(jié)點的三次樣條的示例，以用于說明而非限制。在包括兩個以上的內(nèi)部結(jié)點的實施方式中，結(jié)點可在上述討論的一個或更多個范圍內(nèi)，或在一些其他合適的范圍內(nèi)。例如，在一些實施方式中，可以指定結(jié)點以使得每一對相鄰結(jié)點之間的樣條段的長度基本相等。該模型可表示為：L＝β0+β1(Age)+β2(tPSA)+β3(fPSA)+β4(iPSA)+β5(hK2)+β6(sp1[tPSA])+β7(sp2[tPSA])+β8(sp1[fPSA])+β9(sp2[fPSA])+β10(sp1[iPSA])+β11(sp2[iPSA])+β12(sp1[hK2])+β13(sp2[hK2])+β14(priorbx)(12)8.tPSA閾值模型在一些實施方式中，選擇的模型可取決于在樣品中是否檢測到tPSA的閾值水平。在一些實施方式中，如果樣品中tPSA的水平高于閾值，則預(yù)測模型如下：L＝β0+β1(tPSA)+β2(DRE)neg+β3(DRE)pos+β4(priorbx)(13)在一些實施方式中，在該模型中的加權(quán)系數(shù)的值的范圍如下表1中所示。適于于確定前列腺組織活檢將具有任何級別的癌癥的概率的系數(shù)在第二和第三列中示出；而適于確定前列腺組織活檢將具有高級別癌癥的概率的系數(shù)在第四和第五列中示出。表1：當tPSA的水平大于閾值時將使用的加權(quán)系數(shù)：在一些實施方式中，如果樣品中檢測出的tPSA水平小于或等于閾值水平，則該預(yù)測模型如下：L＝β0+β1(Age)+β2(tPSA)+β3sp1(tPSA)+β4sp2(tPSA)+β5(fPSA)+β6sp1(fPSA)+β7sp2(fPSA)+β8(iPSA)+β9hK2)+β10(DREneg)+β11(DREpos)+β12(priorbx)(14)在一些實施方式中，在該模型中的加權(quán)系數(shù)的值的范圍如下表2中所示。適于確定前列腺組織活檢將具有任何級別的癌癥的概率的系數(shù)在第二和第三列中示出；而適于確定前列腺組織活檢將具有高級別癌癥的概率的系數(shù)在第四和第五列中示出。表2：當tPSA的水平小于或等于閾值時使用的加權(quán)系數(shù)可根據(jù)上文模型#7下提出的三次樣條公式(等式(10和11))確定上述模型中sp1(tPSA)、sp2(tPSA)、sp1(fPSA)和sp2(fPSA)的樣條項。在一些實施方式中，內(nèi)部結(jié)點2和3以及外部節(jié)點1和4的值在下表3所列tPSA和fPSA的范圍內(nèi)。表3：結(jié)點值范圍計算機實施計算機系統(tǒng)106的示例性實施(在其上可以實施本文描述的一些或全部技術(shù)和/或用戶交互)如圖1B所示。計算機系統(tǒng)106可包括一個或更多個處理器107和一個或更多個計算機-可讀非臨時性存儲介質(zhì)(例如，存儲器108和一個或更多個非易失性存儲介質(zhì)110)。(一個或更多個)處理器107可以任何合適的方式來控制數(shù)據(jù)寫入存儲器108和非易失性存儲裝置110以及從存儲器108和非易失性存儲裝置110讀出數(shù)據(jù)，因為本文描述的本發(fā)明的各方面并不限制于此方面。為了執(zhí)行本文所描述的任何功能，(一個或更多個)處理器107可以執(zhí)行存儲在一個或更多個計算機可讀存儲介質(zhì)(例如，存儲器108)中的一個或更多個指令(例如程序模塊)，所述一個或更多個計算機可讀存儲介質(zhì)可作為存儲由處理器107執(zhí)行的指令的非臨時性計算機可讀存儲介質(zhì)。通常，程序模塊包括執(zhí)行特定任務(wù)或?qū)崿F(xiàn)特定抽象數(shù)據(jù)類型的例程、程序、對象、組件、數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)等。實施方式也可在分布式計算環(huán)境中執(zhí)行，其中，任務(wù)由通過通信網(wǎng)絡(luò)鏈接的遠程處理設(shè)備執(zhí)行。在分布式計算環(huán)境中，程序模塊可以位于包括存儲器設(shè)備的本地和遠程計算機存儲介質(zhì)中。數(shù)據(jù)輸入和程序命令可由計算機106通過輸入接口109接收。輸入接口109可以包括鍵盤、觸摸屏、USB端口、CD驅(qū)動器、DVD驅(qū)動器或其他輸入接口。計算機106可在使用與一個或更多個遠程計算機邏輯連接的網(wǎng)絡(luò)環(huán)境中工作。所述一個或更多個遠程計算機可以包括個人計算機、服務(wù)器、路由器、網(wǎng)絡(luò)PC、對等端設(shè)備或其他常見的網(wǎng)絡(luò)節(jié)點，并且通常包括許多或所有以上關(guān)于計算機106描述的元件。計算機106與一個或更多個遠程計算機之間的邏輯連接可以包括但不限于：局域網(wǎng)(LAN)和廣域網(wǎng)(WAN)，但也可包括其它網(wǎng)絡(luò)。這樣的網(wǎng)絡(luò)可以基于任何合適的技術(shù)并可根據(jù)任何合適的協(xié)議來操作，并且可包括無線網(wǎng)絡(luò)、有線網(wǎng)絡(luò)或光纖網(wǎng)絡(luò)。這樣的網(wǎng)絡(luò)環(huán)境常見于辦公室、企業(yè)范圍計算機網(wǎng)絡(luò)、內(nèi)聯(lián)網(wǎng)和因特網(wǎng)。當在LAN網(wǎng)絡(luò)環(huán)境中使用時，計算機106可以通過網(wǎng)絡(luò)接口或適配器與LAN連接。當在WAN網(wǎng)絡(luò)環(huán)境中使用時，計算機106通常包括調(diào)制解調(diào)器或用于通過WAN(例如因特網(wǎng))建立通信的其他裝置。在網(wǎng)絡(luò)化環(huán)境中，程序模塊或其部分可以被存儲在遠程存儲器存儲設(shè)備中。本文描述的用于評估前列腺癌的風(fēng)險以及/或者確定前列腺體積的多種輸入可由計算機106通過網(wǎng)絡(luò)(例如，LAN、WAN或某些其他網(wǎng)絡(luò))從存儲與輸入相關(guān)聯(lián)的數(shù)據(jù)的一個或更多個遠程計算機或設(shè)備接收。一個或更多個遠程計算機/設(shè)備可以預(yù)先對遠程存儲的數(shù)據(jù)進行分析，以發(fā)送分析結(jié)果作為計算機300的輸入數(shù)據(jù)。替代地，遠程存儲的數(shù)據(jù)可被發(fā)送到計算機106，因為它被遠程存儲而沒有任何遠程分析。此外，可使用可被并入為計算機106的組件的任意數(shù)量的輸入接口(例如，輸入接口109)由計算機106的用戶直接接收輸入。本文描述的多種輸出(包括前列腺癌的風(fēng)險的概率和/或前列腺體積的輸出)可以被可視化地提供在與計算機106直接連接的輸出設(shè)備(例如，顯示器)上，或者所述輸出可以經(jīng)由一個或更多個有線或無線網(wǎng)絡(luò)提供到與計算機106連接的位于遠端的輸出裝置，因為本發(fā)明的實施方式并不限于此方面。除了使用視覺顯示之外，本文中描述的輸出可以另外地或替代地提供。例如，向其提供輸出的計算機300或遠程計算機可包括一個或更多個輸出接口，包括但不限于：用于提供輸出指示的揚聲器和振動輸出接口。應(yīng)理解，雖然計算機106作為單一的設(shè)備示于圖1中，但是在一些實施方式中，計算機106可以包括多個通信耦合的設(shè)備，以執(zhí)行本文描述的一些或全部功能，并且計算機106僅是可以根據(jù)本發(fā)明的實施方式使用的計算機的一個示例性實施。例如，在一些實施方式中，計算機106可以被集成到系統(tǒng)中以及/或者與系統(tǒng)進行電子通信。如上所述，在一些實施方式中，計算機106可包括在網(wǎng)絡(luò)環(huán)境中，其中，用于確定前列腺癌的概率和/或前列腺體積的有關(guān)一個或更多個血液標志物的信息被從外部源發(fā)送到計算機106，以用于使用本文描述的一種或更多種技術(shù)進行分析。根據(jù)本發(fā)明的一些實施方式的示例性網(wǎng)絡(luò)環(huán)境111示于圖1C。在網(wǎng)絡(luò)環(huán)境中111中，計算機106經(jīng)由網(wǎng)絡(luò)114連接到測定系統(tǒng)112。如以上所討論的，網(wǎng)絡(luò)114可以是任何適當類型的有線或無線網(wǎng)絡(luò)，并且可包括一個或更多個局域網(wǎng)(LAN)或廣域網(wǎng)(WAN)，例如因特網(wǎng)?？梢允褂糜嬎銠C系統(tǒng)，例如下面描述的計算機系統(tǒng)的多種實施方式來實施本文描述的計算方法、步驟、仿真、算法、系統(tǒng)和系統(tǒng)元件。本文描述的方法、步驟、系統(tǒng)和系統(tǒng)元件在其實施中不限于本文所述的任何特定的計算機系統(tǒng)，可以使用許多其他的不同機器。所述計算機系統(tǒng)可包括處理器，例如，市售的處理器，例如可從英特爾購買的x86系列之一、Celeron和Pentium處理器，可從AMD和Cyrix購買的類似設(shè)備，可從Motorola購買的680X0系列微處理器，來自IBM的PowerPC處理器和ARM處理器。許多其他處理器可用，并且計算機系統(tǒng)不限于特定的處理器。處理器通常執(zhí)行稱為操作系統(tǒng)的程序，其中以Windows7、Windows8、UNIX、Linux、DOS、VMS、MacOS和OSX和iOS為示例，其控制其他計算機程序的執(zhí)行并提供調(diào)度、調(diào)試、輸入/輸出控制、會計、編輯、存儲分配、數(shù)據(jù)管理和存儲管理、通信控制和相關(guān)服務(wù)。處理器和操作系統(tǒng)一起限定以高級編程語言編寫的應(yīng)用程序的計算機平臺。所述計算機系統(tǒng)不限于特定的計算機平臺。所述計算機系統(tǒng)可包括存儲器系統(tǒng)，其通常包括計算機可讀和可寫非易失性記錄介質(zhì)，以磁盤、光盤、閃速存儲器和磁帶為示例。這種記錄介質(zhì)可以是可移除的，例如軟盤、讀/寫CD或記憶棒，或者可以是永久的，例如，硬盤驅(qū)動器。這樣的記錄介質(zhì)通常以二進制形式(即，解釋為一和零的序列的形式)存儲信號。(例如，磁或光)盤具有若干磁道，在其上通常以二進制形式(即，解釋為一和零的序列的形式)存儲這樣的信號。這樣的信號可限定由微處理器執(zhí)行的軟件程序(例如應(yīng)用程序)或者由應(yīng)用程序處理的信息。所述計算機系統(tǒng)的存儲器系統(tǒng)還可包括集成電路存儲器元件，這通常是非易失性隨機存取存儲器，例如動態(tài)隨機存取存儲器(DRAM)或靜態(tài)存儲器(SRAM)。通常，在操作時，處理器使得從非易失性記錄介質(zhì)讀取的程序和數(shù)據(jù)進入集成電路存儲器元件，與非易失性記錄介質(zhì)相比，其通常允許由處理器更快地訪問的程序指令和數(shù)據(jù)。處理器通常根據(jù)程序指令操縱集成電路存儲器元件內(nèi)的數(shù)據(jù)，然后在處理完成之后將操作的數(shù)據(jù)復(fù)制到非易失性記錄介質(zhì)中。已知多種機制可用于管理非易失性記錄介質(zhì)和集成電路存儲器元件之間的數(shù)據(jù)移動，并且實現(xiàn)上述方法、步驟、系統(tǒng)和系統(tǒng)元件的計算機系統(tǒng)不限于此。計算機系統(tǒng)不限于特定的存儲器系統(tǒng)。上述這樣的存儲器系統(tǒng)的至少一部分可以用來存儲上述的一個或更多個數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)(例如，查找表)或等式。例如，非易失性記錄介質(zhì)中的至少一部分可存儲包括一個或更多個這樣數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)的數(shù)據(jù)庫中的至少一部分。這樣的數(shù)據(jù)庫可以是多種類型的數(shù)據(jù)庫的任一種，例如，包括一個或更多個平面文件數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)的文件系統(tǒng)(其中數(shù)據(jù)被組織到經(jīng)由分隔符隔開的數(shù)據(jù)單元中)、關(guān)系數(shù)據(jù)庫(其中數(shù)據(jù)被組織到存儲在表中的數(shù)據(jù)單元中)、面向?qū)ο蟮臄?shù)據(jù)庫(其中數(shù)據(jù)被組織到作為對象存儲的數(shù)據(jù)單元中)、另一類型的數(shù)據(jù)庫，或者其任意組合。所述計算機系統(tǒng)可以包括視頻和音頻數(shù)據(jù)I/O子系統(tǒng)。子系統(tǒng)的音頻部分可包括模擬-數(shù)字(A/D)轉(zhuǎn)換器，其接收模擬音頻信息，并將其轉(zhuǎn)換成數(shù)字信息。使用已知的壓縮系統(tǒng)可將數(shù)字信息壓縮以在硬盤上進行存儲，以便在另一時間使用。I/O子系統(tǒng)的典型的視頻部分可以包括視頻圖像壓縮/解壓縮，其中許多是本領(lǐng)域已知的。這樣的壓縮/解壓縮將模擬視頻信息轉(zhuǎn)換成壓縮的數(shù)字信息，反之亦然。所述壓縮數(shù)字信息可被存儲在硬盤上以便稍后使用。所述計算機系統(tǒng)可以包括一個或更多個輸出設(shè)備。示例輸出設(shè)備包括陰極射線管(CRT)顯示器、液晶顯示器(LCD)和其他視頻輸出設(shè)備、打印機、通信設(shè)備例如調(diào)制解調(diào)器或網(wǎng)絡(luò)接口、存儲設(shè)備例如磁盤或磁帶以及音頻輸出設(shè)備例如揚聲器。所述計算機系統(tǒng)還可包括一個或更多個輸入設(shè)備。示例輸入設(shè)備包括鍵盤、小鍵盤、軌跡球、鼠標、筆和寫字板、例如如上所述的通信設(shè)備以及數(shù)據(jù)輸入設(shè)備，例如音頻和視頻捕獲設(shè)備和傳感器。計算機系統(tǒng)不限于本文所述的特定的輸入或輸出設(shè)備。應(yīng)理解的是，一個或更多個任何類型的計算機系統(tǒng)可用來實施本文所述的多種實施方式。本公開內(nèi)容的方面可以在軟件、硬件或固件或其任何組合中實施。所述計算機系統(tǒng)可包括專門編程的專用硬件，例如專用集成電路(ASIC)。這種專用硬件可被配置成作為上述計算機系統(tǒng)的一部分或作為獨立組件來實施一種或更多種如上所述的方法、步驟、仿真、算法、系統(tǒng)和系統(tǒng)元件。計算機系統(tǒng)及其組件可使用各種各樣的一種或更多種合適的計算機編程語言中的任一種來進行編程。這樣的語言可包括過程編程語言，例如C、Pascal、Fortran和BASIC、面向?qū)ο蟮恼Z言例如C++、Java和Eiffel和其他語言，例如腳本語言甚至是匯編語言。使用可由這樣的計算機系統(tǒng)執(zhí)行的各種適當?shù)木幊陶Z言(包括過程程序設(shè)計語言、面向?qū)ο蟮某绦蛟O(shè)計語言、其他語言及其組合)中的任何一種來實施所述方法、步驟、仿真、算法、系統(tǒng)和系統(tǒng)元件。這樣的方法、步驟、仿真、算法、系統(tǒng)和系統(tǒng)元件可以實施為計算機程序的單獨模塊，或者可以分別實施為單獨的計算機程序。這樣的模塊和程序可以在不同的計算機上執(zhí)行。這樣的方法、步驟、仿真、算法、系統(tǒng)和系統(tǒng)元件可以單獨或組合地可實施為有形地體現(xiàn)為計算機可讀介質(zhì)上的計算機可讀信號的計算機程序產(chǎn)品，例如，非易失性記錄介質(zhì)、集成電路存儲器元件或其組合。對于每個這樣的方法、步驟、仿真、算法、系統(tǒng)或系統(tǒng)元件，這樣的計算機程序產(chǎn)品可包括在限定指令的計算機可讀介質(zhì)上有形地體現(xiàn)的計算機可讀信號，例如，如一個或更多個程序的一部分，即，作為由計算機執(zhí)行的結(jié)果，表示計算機來執(zhí)行所述方法，步驟、仿真、算法、系統(tǒng)或系統(tǒng)元件。應(yīng)理解，可形成具有一個或更多個上述特征的多個實施方式。可以任何合適的組合采用上述方面和特征，因為本發(fā)明并不限于此方面。還應(yīng)理解，附圖示出了可并入到多個實施方式中的多種組件和特征。為了簡化，附圖中的一些可示出一個以上的可選特征或組件。然而，本發(fā)明并不限于附圖中公開的具體實施方式。應(yīng)認識到，本公開內(nèi)容涵蓋如下實施方式，其可以包括在任一圖中所示的組件的僅一部分，以及/或者也可以涵蓋將在多個不同附圖中所示組件合并的實施方式。示例示例1-測定和預(yù)測模型本文描述了基于四項激肽釋放酶標志物的圖的測定，四項激肽釋放酶標志物包括經(jīng)由多變量算法與患者特定信息聯(lián)系的總前列腺特異性抗原(tPSA)、游離PSA(fPSA)、完整PSA(iPSA)和人激肽釋放酶2(hK2)。所述算法返回兩個經(jīng)校準的概率：一個用于活檢之前任何級別的癌癥的風(fēng)險，另一個用于活檢之前高級別癌癥(Gleason7或更高)的風(fēng)險。已經(jīng)單獨地和以多種組合的方式研究了四項激肽釋放酶標志物，以用于前列腺癌檢測應(yīng)用。結(jié)合這四項標志物的血漿水平以及患者的具體信息(例如年齡)、直腸指檢(DRE)的結(jié)果和先前陰性前列腺活檢的存在的邏輯回歸算法表明比單獨的PSA測試具有更高的前列腺癌的陽性預(yù)測值。三百名患者納入初始校準研究。這包括在每個研究地點入選的前5名患者，然后是按順序入選的患者。排除了沒有進行最佳儲存和/或裝運的樣品，或在測量激肽釋放酶標志物過程中產(chǎn)生異常結(jié)果的樣品。用于計算活檢癌癥風(fēng)險的邏輯回歸算法通過校準研究建立了用于計算活檢的癌癥風(fēng)險的預(yù)測模型的公式，并如下文所示。正如所指出的，取決于總PSA水平使用不同的公式。此外，取決于模型是否用來確定含有任何級別的檢測的癌癥與高級別(例如，Gleason評分為7.0或更高)的可檢測的癌癥的活檢的概率來使用不同的加權(quán)系數(shù)。加權(quán)系數(shù)在本文表1和2規(guī)定的范圍內(nèi)。公式中的變量在表4中進行了描述。如果總PSA≤25ng/mLXβ＝β0+β1age+β2tpsa+β3sptpsa1+β4sptpsa2+β5fpsa+β6spfpsal+β7spfpsa2+β8ipsa+β9hK2+β10dreneg+β11drepos+β12priorbx(14)如果總PSA＞25ng/mLXβ＝β0+β1tpsa+β2dreneg+β3drepos+β4priorbx(13)限制性三次樣條項對于模型(總PSA和游離PSA)中的一些變量，包括限制性三次樣條項，這意味著對于每個樣條項向模型中的每一個添加了兩個附加項。用于計算兩個樣條項的公式如下。針對總的和游離的PSA使用以上公式計算sp[var]1和sp[var]2。使用表3中指定范圍內(nèi)的結(jié)點值來計算總PSA的樣條項。表4.計算活檢上癌癥風(fēng)險的公式的變量變量名稱描述年齡抽血時的年齡tpsa總PSA以ng/ml計fpsa游離PSA以ng/ml計iPSA完整PSA以ng/ml計hk2hK2以ng/ml計sptpsa1總PSA的第一樣條項sptpsa2總PSA的第二樣條項spfpsa1游離PSA的第一樣條項spfpsa2游離PSA的第二樣條項priorbx先前的活檢；如果先前沒有過活檢則為0,如果先前有過活檢則為1dreneg如果DRE已被確定認為陰性，則值等于1,否則為0drepos如果DRE已被確定認為陽性，則值等于1,否則為0校準的結(jié)果入選研究的校準階段的患者的特性示于表5中。表5.校準階段患者的特征模型校準基于歐洲組群開發(fā)了模型。以斜率和截距系數(shù)二者使用邏輯回歸校準來測試美洲組群的校準誤差。如果有證據(jù)表明β0≠0，或β1≠1，這將表示其對于重新校準模型是有用的。預(yù)測高級別癌癥的模型表現(xiàn)出近乎完美的校準，因為預(yù)測低于0.2(或20％)，雖然似乎有一些低估實際的風(fēng)險，因為預(yù)測高于0.2(或20％)(圖2)。應(yīng)指出，向患者參考的決定是活檢將在低于0.2(或20％)的閾值發(fā)生，這時所述模型似乎準確預(yù)測高級別癌癥的真實風(fēng)險。出于這個原因，對于高級模型沒有進行重新校準。預(yù)測任何級別的癌癥的模型也沒有表現(xiàn)出顯著的校準誤差，因此沒有被重新校準(圖3)。圖2和3中的數(shù)據(jù)點示出了預(yù)測概率和實際概率之間的關(guān)系，并且虛線是擬合數(shù)據(jù)的線。示出了表示實際概率變化程度的條。實線反映了完美的校準，此時實際的概率等于預(yù)測概率。模型性能下面是預(yù)測模型的性能的報告。使用重復(fù)的10倍交叉驗證對所有的過度擬合統(tǒng)計數(shù)據(jù)進行了較正。表6.預(yù)測模型的辯別力AUC(95％CI)任何級別的癌癥0.769(0.715,0.824)高級別癌癥0.857(0.805,0.909)表7.預(yù)測模型的布萊爾評分布萊爾評分任何級別的癌癥0.1967高級別癌癥0.1144在可變活檢方案下避免的活檢確定了每1000名患者通過不同活檢方案發(fā)現(xiàn)和遺漏的高級別癌癥(表5)和任何級別的癌癥(表6)的數(shù)目。表8.發(fā)現(xiàn)/遺漏的高級別癌癥標記活檢避免的活檢發(fā)現(xiàn)的高級別癌癥遺漏的高級別癌癥高級別前列腺癌癥的概率>5％68631419010>7.5％53846218119>10％44555517327>12.5％37063016733表9.發(fā)現(xiàn)/遺漏的任何級別的癌癥標記活檢避免的活檢發(fā)現(xiàn)的癌癥遺漏的癌癥高級別前列腺癌癥的概率>5％68631437152>7.5％53846232995>10％445555297126>12.5％370630270154決策曲線分析高級別癌癥的決定曲線分析示于圖4中。任何級別的癌癥的決定曲線分析示于圖5中。接受者操作曲線(ROC)高級別癌癥的ROC示于圖6中。任何級別癌的癥的ROC示于圖7中?；顧z閾值處的陰性預(yù)測值和陽性預(yù)測值對于高級別癌癥的活檢閾值處的陽性預(yù)測值和陰性預(yù)測值分別示于圖8A和圖8B中。對于任何級別的癌癥的活檢閾值處的陽性預(yù)測值和陰性預(yù)測值分別示于圖9A和圖9B中。示例2：驗證研究：示例1中示出了模型的性能的評估，并在等式(10、11、13、14)中列出，這在本示例中被稱為“測試模型”，其是基于在研究的驗證階段入選的663個患者進行評估的。對于整個組群、先前有過活檢的男性、先前沒有過活檢的男性以及年齡50-75歲的男性分別示出了結(jié)果。圖10示出了在活檢年齡患有高級別疾病的男性的比例。老年男性患有高級疾病的比率要高得多。對于觀察到的較高年齡中風(fēng)險增加的一種可能性是更有選擇性的活檢。換句話說，泌尿科醫(yī)生可能只可對70歲(在許多指南中為PSA篩查的上限)以上的男性進行活檢-如果有令人信服的理由這樣做的話。為了評估在老年男性中高級別癌癥的比例增加是否是由于活檢選擇，我們使用了PCPT風(fēng)險計算器(參見ThompsonIM,AnkerstDP,ChiC,GoodmanPJ,TangenCM,LuciaMS,FengZ,ParnesHL,ColtmanCAJr：Assessingprostatecancerrisk:ResultsfromtheProstateCancerPreventionTrial,JournaloftheNationalCancerInstitute98:529-534,2006)。PCPT風(fēng)險計算器是建立在其中不分年齡地向所有男性提供活檢的男性組群中。在高級別疾病的邏輯回歸模型中，依照結(jié)果與PCPT風(fēng)險和年齡作為協(xié)變量，如果年齡系數(shù)是顯著的，則它表示我們觀察到的年齡影響是由于選擇，而不是風(fēng)險的生物學(xué)增加。這些結(jié)果表示在老年男性中風(fēng)險高于預(yù)期(p＝0.072)，從而表示選擇效應(yīng)。對50-75歲的男性進行亞組分析。由于存在年齡小于50歲的20名患者，所以進行排除年齡超過70歲的患者的額外的亞組分析。比較了兩個獨立的模型：“測試模型”和基于總PSA、年齡、先前的活檢和DRE的基本模型。表10是校準階段和驗證階段組群之間患者特性的差異的概述。表10.患者特性下表11提供了由癌癥狀態(tài)分開的驗證階段組群的患者特性。發(fā)現(xiàn)測試模型具有比基礎(chǔ)模型對高級疾病更高的辨別力，其中，AUC增加約0.06。在不同條件下這種差異相對穩(wěn)定。這對于具有先前活檢的患者而言略微更大(0.09)并處在診斷的“灰色區(qū)”(0.07-0.09)。陽性活檢端點的基礎(chǔ)模型和測試模型之間的差異較小，從而清楚地表明測試模型對高級別疾病的選擇性。下表14和15概述了每1000名患者中通過不同的活檢方案對所有患者以及那些年齡低于70歲的患者發(fā)現(xiàn)和遺漏的高級別(癌癥)的數(shù)目。在臨床結(jié)果的分析中，發(fā)現(xiàn)使用7.5％的分選點(cut-point)使活檢的數(shù)目降低約50％。這確實會導(dǎo)致遺漏一些高級別癌癥，當分析僅限于年齡小于71的患者時，該效果降低。年輕患者的風(fēng)險<7.5％，5.5％具有Gleason評分7或8，這意味著將需要進行18個活檢，以在這一組中發(fā)現(xiàn)一個高級別癌癥。在遺漏的高級別癌癥中，53％是3+4，40％為4+3和7％為4+4。表11.癌癥狀態(tài)下的驗證階段組群表12.模型差異表13.布萊爾評分所有患者表14.高級別癌癥標記活檢避免的活檢發(fā)現(xiàn)的高級別癌癥遺漏的高級別癌癥高級別前列腺癌的概率>2.5％80519521011>5％66433620417>7.5％53446619327>10％45454618139>12.5％38661416951年齡小于71表15.高級別癌癥閾值活檢避免的活檢發(fā)現(xiàn)的高級別癌癥遺漏的高級別癌癥高級別前列腺癌的概率>2.5％77922117811>5％62437617019>7.5％49051016128>10％40659415137>12.5％34066014049圖11A和11B示出了在所有患者(n＝663)中檢測高級別癌癥的預(yù)測概率與實際的概率。圖11C示出了在所有患者(n＝663)中檢測任何級別癌癥的預(yù)測概率與實際概率。圖12A和12B示出了在50-75歲的患者(n＝587)中檢測高級別癌癥的預(yù)測概率與實際概率。圖12C示出了在50-75歲的所有患者(n＝587)中檢測任何級別癌癥的預(yù)測概率與實際概率。圖13A和13B示出了在小于71歲的患者(n＝535)中檢測高級別癌癥的預(yù)測概率與實際概率。圖13C示出了在小于71歲的所有患者(n＝535)中檢測任何級別癌癥的預(yù)測概率與實際概率。上述結(jié)果表示，有一定程度的低預(yù)測風(fēng)險，通過將樣品限制到小于71歲的患者來降低這種效果。對于圖11至13，數(shù)據(jù)點顯示預(yù)測概率和實際概率之間的關(guān)系，而虛線是擬合數(shù)據(jù)的線。示出了表示實際概率變化程度的條。實線反映了完美的校準，其中，實際概率等于預(yù)測概率。圖14A和14B示出了所有患者(n＝663)的凈效益與閾值概率水平。圖15A和15B示出了50-75歲患者(n＝587)的凈效益與閾值概率水平。圖16A和16B示出了小于71歲的所有患者(n＝535)的凈效益與閾值概率水平。數(shù)據(jù)表示預(yù)測模型的使用與用于檢測高級別癌癥的清楚的凈效益相關(guān)。對于小于71歲的患者這種效果加強。如在VickersA.J等中描述的評估凈效益，使用MedDecisMaking.2006；26(6):565–574(其全部內(nèi)容通過引用并入本文)中公開的方法來確立凈效益和閾值概率。示例3-免疫測定方法：以下測定方法可用于使用AutoDELFIA自動免疫測定系統(tǒng)來確定人血漿樣品中存在的tPSA、fPSA、iPSA和hK2的水平(例如，以ng/mL計的水平)并結(jié)合示例1和示例2使用。根據(jù)對每個標志物的重復(fù)測試來計算每個標志物的平均量，并將其用于預(yù)測模型以確定如示例2中提出的給定的人血漿樣品的風(fēng)險評分。也可使用Elecsys測定免疫分析儀(RocheDiagnostics)確定tPSA和fPSA。每次運行使用至少一套的三個板：一個板用于f/tPSA、一個板用于iPSA和一個板用于hK2。滿負荷的完整運行包括兩套的這些三個板。取決于運行的板的數(shù)目，整個過程從起始到獲得測試結(jié)果包括約3至5小時。試劑：·hK2測定緩沖液·iPSA標準(A-G)·hK2標準(A-G)·增強液(PerkinElmer產(chǎn)品#13800753)·濃縮沖洗液(PerkinElmer產(chǎn)品#B117-100)·iPSA測定對照(低、中和高)·hK2測定對照(低、中和高)·96孔，黃鏈霉親和素板(PerkinElmer產(chǎn)品#AAAND-0005)·試劑級水·t/fPSA的PROSTATUS試劑盒(PerkinElmer產(chǎn)品#B073-301)·iPSA生物素化捕獲溶液(100x)·iPSA示蹤劑溶液(100x)·hK2生物素化捕獲溶液(100x)·hK2阻斷溶液(50x)·hK2示蹤劑溶液(100x)某些抗體和試劑的詳情示于下表中。表16:試劑耗材：●Wallac移液管頭，1.25mL(PerkinElmer產(chǎn)品#1235-402)●稀釋容器(PerkinElmer產(chǎn)品#1235-411)●15mL管●永久性記號筆設(shè)備：●101-1000μL容量移液管●移液管頭●AutoDELFIA板處理器(PerkinElmer：1235-001)●AutoDELFIA樣品處理器(PerkinElmer：1297-014)●AutoDELFIAPC(PerkinElmer：1235-8060)(包括軟件、工作站和Multicalc)樣品：●血漿過程：在免疫測定系統(tǒng)(例如，Roche儀器)中加載患者標本的等分試樣，以確定tPSA和fPSA。對于用AutoDELFIA儀器確定iPSA、hK2和(以及可選的fPSA和tPSA)遵循以下步驟：所有試劑均平衡至室溫，包括測定具體標準(7級)、測定具體對照(3級)。用pH6.8的iPSA測定緩沖液將iPSA生物素化捕獲溶液(100x)稀釋100倍，并在iPSA板的每個孔中分配捕獲溶液。用hK2pH7.8的測定緩沖液稀釋hK2生物素化捕獲溶液(100x)100倍，并在hK2板的每個孔中分配捕獲溶液。在室溫下培育30至60分鐘。如果使用Prostatus試劑盒來確定tPSA和fPSA，則按照試劑盒說明來確定tPSA和fPSA。將測定試劑和患者標本加載到AutoDELFIA儀器中。運行儀器協(xié)議進行iPSA和hK2測定，直到完成。標本采集和處理將血液抽入K2EDTA管中，并在2-8℃下存儲，直到其被以冷凍冰袋連夜裝運到實驗室為止。在到達實驗室后，在實驗室跟蹤系統(tǒng)中檢查并登記(如果可行)標本并將其在2-8℃冰箱中存儲在K2EDTA管中。盡快旋轉(zhuǎn)血液并將血漿吸移到運輸管中。在接收時間的24小時或更短時間期間，將血漿樣品在2-8℃下儲存，但是對于周期大于24小時的，在-70℃至-80℃下儲存血漿。示例4：PSA和人激肽釋放酶2的序列PSA蛋白(SEQIDNO:3)IVGGWECEKHSQPWQVLVASRGRAVCGGVLVHPQWVLTAAHCIRNKSVILLGRHSLFHPEDTGQVFQVSHSFPHPLYDMSLLKNRFLRPGDDSSHDLMLLRLSEPAELTDAVKVMDLPTQEPALGTTCYASGWGSIEPEEFLTPKKLQCVDLHVISNDVCAQVHPQKVTKFMLCAGRWTGGKSTCSGDSGGPLVCNGVLQGITSWGSEPCALPERPSLYTKVVHYRKWIKDTIVANPhK2蛋白(SEQIDNO:4)IVGGWECEKHSQPWQVAVYSHGWAHCGGVLVHPQWVLTAAHCLKKNSQVWLGRHNLFEPEDTGQRVPVSHSFPHPLYNMSLLKHQSLRPDEDSSHDLMLLRLSEPAKITDVVKVLGLPTQEPALGTTCYASGWGSIEPEEFLRPRSLQCVSLHLLSNDMCARAYSEKVTEFMLCAGLWTGGKDTCGGDSGGPLVCNGVLQGITSWGPEPCALPEKPAVYTKVVHYRKWIKDTIAANP序列表<110>OPKODiagnostics,LLC<120>與前列腺癌的診斷有關(guān)的組合物和方法<130>C1256.70013WO00<150>US61/972,099<151>2014-03-28<160>5<170>PatentInversion3.5<210>1<211>119<212>PRT<213>人工序列<220><223>合成多肽<400>1GluValGlnLeuValGluSerGlyProGlyIleLeuGlnProSerGln151015ThrLeuSerLeuThrCysSerPheSerGlyPheSerLeuSerThrThr202530GlyMetGlyValSerTrpIleArgGlnProSerGlyLysGlyLeuGlu354045TrpLeuAlaHisLeuTyrTrpAspGluAspLysArgTyrAsnProSer505560LeuLysSerArgLeuThrIleSerGluAspSerSerArgAsnGlnVal65707580PheLeuLysIleThrSerValGlyProAlaAspSerAlaThrTyrTyr859095CysAlaArgLysGlyTyrTyrGlyTyrPheAspTyrTrpGlyGlnGly100105110ThrAlaLeuThrValSerSer115<210>2<211>107<212>PRT<213>人工序列<220><223>合成多肽<400>2AspIleValMetThrGlnSerGlnLysPheMetSerThrSerValGly151015AspArgValSerValThrCysLysAlaSerGlnAsnValAsnThrAsp202530ValAlaTrpTyrGlnGlnLysProGlyGlnSerProLysAlaLeuIle354045PheSerThrSerTyrArgSerSerGlyValProAspArgPheThrGly505560SerGlySerGlyThrAspPheThrLeuThrIleThrAsnValGlnSer65707580GluAspLeuAlaGluTyrPheCysGlnGlnTyrSerAsnTyrProLeu859095ThrPheGlyAlaGlyThrLysValAspLeuAsn100105<210>3<211>237<212>PRT<213>人工序列<220><223>合成多肽<400>3IleValGlyGlyTrpGluCysGluLysHisSerGlnProTrpGlnVal151015LeuValAlaSerArgGlyArgAlaValCysGlyGlyValLeuValHis202530ProGlnTrpValLeuThrAlaAlaHisCysIleArgAsnLysSerVal354045IleLeuLeuGlyArgHisSerLeuPheHisProGluAspThrGlyGln505560ValPheGlnValSerHisSerPheProHisProLeuTyrAspMetSer65707580LeuLeuLysAsnArgPheLeuArgProGlyAspAspSerSerHisAsp859095LeuMetLeuLeuArgLeuSerGluProAlaGluLeuThrAspAlaVal100105110LysValMetAspLeuProThrGlnGluProAlaLeuGlyThrThrCys115120125TyrAlaSerGlyTrpGlySerIleGluProGluGluPheLeuThrPro130135140LysLysLeuGlnCysValAspLeuHisValIleSerAsnAspValCys145150155160AlaGlnValHisProGlnLysValThrLysPheMetLeuCysAlaGly165170175ArgTrpThrGlyGlyLysSerThrCysSerGlyAspSerGlyGlyPro180185190LeuValCysAsnGlyValLeuGlnGlyIleThrSerTrpGlySerGlu195200205ProCysAlaLeuProGluArgProSerLeuTyrThrLysValValHis210215220TyrArgLysTrpIleLysAspThrIleValAlaAsnPro225230235<210>4<211>237<212>PRT<213>智人<400>4IleValGlyGlyTrpGluCysGluLysHisSerGlnProTrpGlnVal151015AlaValTyrSerHisGlyTrpAlaHisCysGlyGlyValLeuValHis202530ProGlnTrpValLeuThrAlaAlaHisCysLeuLysLysAsnSerGln354045ValTrpLeuGlyArgHisAsnLeuPheGluProGluAspThrGlyGln505560ArgValProValSerHisSerPheProHisProLeuTyrAsnMetSer65707580LeuLeuLysHisGlnSerLeuArgProAspGluAspSerSerHisAsp859095LeuMetLeuLeuArgLeuSerGluProAlaLysIleThrAspValVal100105110LysValLeuGlyLeuProThrGlnGluProAlaLeuGlyThrThrCys115120125TyrAlaSerGlyTrpGlySerIleGluProGluGluPheLeuArgPro130135140ArgSerLeuGlnCysValSerLeuHisLeuLeuSerAsnAspMetCys145150155160AlaArgAlaTyrSerGluLysValThrGluPheMetLeuCysAlaGly165170175LeuTrpThrGlyGlyLysAspThrCysGlyGlyAspSerGlyGlyPro180185190LeuValCysAsnGlyValLeuGlnGlyIleThrSerTrpGlyProGlu195200205ProCysAlaLeuProGluLysProAlaValTyrThrLysValValHis210215220TyrArgLysTrpIleLysAspThrIleAlaAlaAsnPro225230235<210>5<211>9<212>PRT<213>人工序列<220><223>合成多肽<400>5SerCysProHisHisHisHisHisHis15當前第1頁1 2 3