本申請涉及細胞主成分分析技術(shù)領(lǐng)域,尤其涉及一種分析藥物對細胞作用點的方法。
背景技術(shù):
藥物對細胞的作用點分析是精確研究藥物毒理學、藥理學的重要手段。藥物對細胞作用,有些作用蛋白質(zhì),有些作用dna?,F(xiàn)有技術(shù)中的傳統(tǒng)研究藥物對細胞作用點的方法,如流式細胞儀、熒光顯微鏡等方法,精確度不高,而且對細胞損傷較大。光譜檢測是一種非損傷的檢測,不需要對細胞進行標記、損傷等處理,該方法與傳統(tǒng)的細胞檢測手段,如流式細胞術(shù)等相比,有著不可比擬的優(yōu)勢。
在現(xiàn)有技術(shù)中的光譜檢測方法中,將對照藥物作用前和作用后的細胞的光譜數(shù)據(jù),對比藥物作用前后的光譜特征峰強度,并根據(jù)強度關(guān)系分析出細胞內(nèi)特定蛋白質(zhì)、dna的含量,進而得出藥物對細胞的作用點。但是,由于細胞與細胞之間有細微差異,即使是在同一種環(huán)境中的同類細胞,細胞成分也不盡相同。因此,如果僅對照被測細胞的光譜特征峰強度,則不可避免地包含了細胞的差異成分,所以不能夠保證測量結(jié)果的精確性。
技術(shù)實現(xiàn)要素:
有鑒于此,本發(fā)明提供了一種分析藥物對細胞作用點的方法,從而可以得出更為精確的分析結(jié)果,保證分析結(jié)果的精確性。
本發(fā)明的技術(shù)方案具體是這樣實現(xiàn)的:
一種分析藥物對細胞作用點的方法,該方法包括:
將細胞分為兩類,第一類細胞正常培養(yǎng),第二類細胞用藥物對細胞進行作用;
用光譜對兩類細胞進行探測,分別獲取兩類細胞的光譜數(shù)據(jù);
對獲取的光譜數(shù)據(jù)進行標準化,得到標準化矩陣;
根據(jù)標準化矩陣計算得到相關(guān)系數(shù)矩陣;
計算得到相關(guān)系數(shù)矩陣的特征方程的特征根,并對每個特征根計算得到對應的特征向量;
根據(jù)各個特征向量,將標準化后的光譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)變?yōu)橹鞒煞郑?/p>
根據(jù)得到的主成分,計算主成分載荷曲線;
根據(jù)主成分載荷曲線分析得到藥物對細胞的作用點。
較佳的,所述對獲取的光譜數(shù)據(jù)進行標準化,得到標準化矩陣包括:
將所獲取的n個光譜數(shù)據(jù)作為n個樣品數(shù)據(jù);
根據(jù)樣品數(shù)據(jù)構(gòu)造樣本矩陣,并標準化樣本矩陣陣元,得到標準化矩陣z。
較佳的,設(shè)n個樣品數(shù)據(jù)為:xi=(xi1,xi2,...,xip)t,i=1,2,…,n;p為特征根的個數(shù);
則標準化樣本矩陣陣元為:
其中,i為標準化矩陣的行數(shù),j為標準化矩陣的列數(shù),
較佳的,通過如下的公式計算得到相關(guān)系數(shù)矩陣r:
較佳的,所述計算得到相關(guān)系數(shù)矩陣的特征方程的特征根,并對每個特征根計算得到對應的特征向量包括:
設(shè)相關(guān)系數(shù)矩陣的特征方程為:
|r-λip|=0,
其中,r為相關(guān)系數(shù)矩陣,λ為特征方程的特征根,p為特征根的個數(shù),ip為p的單位矩陣;
對每個特征根λj,j=1,2,…,n,通過如下公式計算得到對應的特征向量:
rb=λjb,
其中,b為特征根λj的特征向量,記為
較佳的,通過如下的公式將標準化后的光譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)變?yōu)橹鞒煞郑?/p>
其中,u1是貢獻率最高的新變量,被稱為第一主成分,u2是貢獻率第二高的新變量,被稱為第二主成分,…,um是貢獻率排名為m的新變量,稱為第m主成分。
如上可見,在本發(fā)明的技術(shù)方案中,由于先用光譜對兩類細胞進行探測,分別獲取兩類細胞的光譜數(shù)據(jù),然后對獲取的光譜數(shù)據(jù)進行標準化,得到標準化矩陣,并計算得到相關(guān)系數(shù)矩陣以及其特征方程的特征根和特征向量,隨后根據(jù)各個特征向量,將標準化后的數(shù)據(jù)變量轉(zhuǎn)變?yōu)橹鞒煞郑⒂嬎阒鞒煞州d荷曲線,最后可根據(jù)主成分載荷曲線分析得到藥物對細胞的作用點。與現(xiàn)有技術(shù)中的分析方法相比,由于本發(fā)明中的方法中是將獲得的光譜數(shù)據(jù)用統(tǒng)計方法進行分析,并對細胞的光譜曲線(即主成分載荷曲線)進行分析,而并不是單一地對照特征峰,從而可以得出更為精確的分析結(jié)果,保證分析結(jié)果的精確性,例如,可以精確地分析得到細胞的dna、蛋白質(zhì)等的含量,進而精確地分析出藥物對細胞的作用點。因此,本發(fā)明中的方法與現(xiàn)有技術(shù)中傳統(tǒng)的細胞檢測手段,如流式細胞術(shù)等方法,有著不可比擬的優(yōu)勢。
附圖說明
圖1為本發(fā)明實施例中的分析藥物對細胞作用點的方法的流程圖。
具體實施方式
為使本發(fā)明的技術(shù)方案及優(yōu)點更加清楚明白,以下結(jié)合附圖及具體實施例,對本發(fā)明作進一步詳細的說明。
圖1為本發(fā)明實施例中的分析藥物對細胞作用點的方法的流程圖。如圖1所示,本發(fā)明實施例中的分析藥物對細胞作用點的方法包括如下所述步驟:
步驟101,將細胞分為兩類,第一類細胞正常培養(yǎng),第二類細胞用藥物對細胞進行作用。
步驟102,用光譜對兩類細胞進行探測,分別獲取兩類細胞的光譜數(shù)據(jù)。
步驟103,對獲取的光譜數(shù)據(jù)進行標準化,得到標準化矩陣。
在本發(fā)明的技術(shù)方案中,可以通過多種方式對獲取的光譜數(shù)據(jù)進行標準化。以下將以其中的一種具體實現(xiàn)方式為例,對本發(fā)明的技術(shù)方案進行介紹。
例如,較佳的,在本發(fā)明的一個具體實施例中,所述步驟103包括:
將所獲取的n個光譜數(shù)據(jù)作為n個樣品數(shù)據(jù);
根據(jù)樣品數(shù)據(jù)構(gòu)造樣本矩陣,并標準化樣本矩陣陣元,得到標準化矩陣z。
例如,較佳的,在本發(fā)明的一個具體實施例中,可以設(shè)n個樣品數(shù)據(jù)為:xi=(xi1,xi2,...,xip)t,i=1,2,…,n;p為特征根的個數(shù);
因此,標準化樣本矩陣陣元為:
其中,i為標準化矩陣的行數(shù),j為標準化矩陣的列數(shù),
步驟104,根據(jù)標準化矩陣計算得到相關(guān)系數(shù)矩陣。
例如,較佳的,在本發(fā)明的一個具體實施例中,可以通過如下所述的公式計算得到相關(guān)系數(shù)矩陣r:
步驟105,計算得到相關(guān)系數(shù)矩陣的特征方程的特征根,并對每個特征根計算得到對應的特征向量。
例如,較佳的,在本發(fā)明的一個具體實施例中,可以設(shè)所述相關(guān)系數(shù)矩陣的特征方程為:
|r-λip|=0
其中,r為相關(guān)系數(shù)矩陣,λ為特征方程的特征根,p為特征根的個數(shù),ip為p的單位矩陣;
對每個特征根λj,j=1,2,…,n,通過如下公式計算得到對應的特征向量:
rb=λjb
其中,b為特征根λj的特征向量,可記為
步驟106,根據(jù)各個特征向量,將標準化后的光譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)變?yōu)橹鞒煞帧?/p>
例如,較佳的,在本發(fā)明的一個具體實施例中,可以通過如下所述的公式將標準化后的光譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)變?yōu)橹鞒煞郑?/p>
其中,u1是貢獻率最高的新變量,被稱為第一主成分,u2是貢獻率第二高的新變量,被稱為第二主成分,…,um是貢獻率排名為m的新變量,稱為第m主成分。
步驟107,根據(jù)得到的主成分,計算主成分載荷曲線。
步驟108,根據(jù)主成分載荷曲線分析得到藥物對細胞的作用點。
在本發(fā)明的技術(shù)方案中,載荷越大,則說明兩類細胞在該處的光譜差別越大,對照該處特征峰所對應的細胞成分,則說明藥物對細胞的此成分作用效果最大。因此,在得到主成分載荷曲線之后,即可分析出藥物的作用點。
綜上所述,在本發(fā)明的技術(shù)方案中,由于先用光譜對兩類細胞進行探測,分別獲取兩類細胞的光譜數(shù)據(jù),然后對獲取的光譜數(shù)據(jù)進行標準化,得到標準化矩陣,并計算得到相關(guān)系數(shù)矩陣以及其特征方程的特征根和特征向量,隨后根據(jù)各個特征向量,將標準化后的數(shù)據(jù)變量轉(zhuǎn)變?yōu)橹鞒煞?,并計算主成分載荷曲線,最后可根據(jù)主成分載荷曲線分析得到藥物對細胞的作用點。與現(xiàn)有技術(shù)中的分析方法相比,由于本發(fā)明中的方法中是將獲得的光譜數(shù)據(jù)用統(tǒng)計方法進行分析,并對細胞的光譜曲線(即主成分載荷曲線)進行分析,而并不是單一地對照特征峰,從而可以得出更為精確的分析結(jié)果,保證分析結(jié)果的精確性,例如,可以精確地分析得到細胞的dna、蛋白質(zhì)等的含量,進而精確地分析出藥物對細胞的作用點。因此,本發(fā)明中的方法與現(xiàn)有技術(shù)中傳統(tǒng)的細胞檢測手段,如流式細胞術(shù)等方法,有著不可比擬的優(yōu)勢。
以上所述僅為本發(fā)明的較佳實施例而已,并不用以限制本發(fā)明,凡在本發(fā)明的精神和原則之內(nèi),所做的任何修改、等同替換、改進等,均應包含在本發(fā)明保護的范圍之內(nèi)。