一種b族鏈球菌pcr熒光探針法核酸檢測試劑盒的制作方法
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001] 本發(fā)明設(shè)及一種B族鏈球菌核酸檢測試劑盒,具體設(shè)及一種B族鏈球菌PCR巧光 探針法核酸檢測試劑盒。
【背景技術(shù)】
[0002] B族鏈球菌(groupBstreptococcus,GB巧是一種寄生于人類泌尿生殖道及下消 化道的條件致病菌,健康人群帶菌率可達(dá)35%。早在20世紀(jì)70年代B族鏈球菌就已經(jīng)被 證實為圍產(chǎn)期母嬰感染的重要致病菌之一。定植于產(chǎn)婦生殖道的B族鏈球菌,可在分娩時 垂直傳播給新生兒,而新生兒B族鏈球菌感染所引起的新生兒敗血癥、腦膜炎和肺炎等癥 致死率極高,并可導(dǎo)致神經(jīng)系統(tǒng)后遺癥。2010年美國疾病預(yù)防中屯、制定了《圍產(chǎn)期GBS預(yù) 防指南》,建議孕婦于妊娠35-37周進行GBS篩查。
[0003] 目前,B族鏈球菌的診斷方法主要有培養(yǎng)法和免疫學(xué)方法,其中,培養(yǎng)法的特異性 和敏感性高,但臨床檢測時間過長(至少需要24h-4她,甚至更長時間),過程繁瑣,需要 使用特殊的培養(yǎng)介質(zhì)W及易受雜菌影響,不適用于大范圍檢測。免疫學(xué)方法,如:乳膠凝 集實驗(latexagglutination,LA),酶聯(lián)免疫吸附試驗(enzymelinkedimmunosorbent assay,ELISA),協(xié)同凝集試驗(^countercurrentimmunoelectrophotesis,CoA)及對流免疫 電泳kountercurrentimmunoelectrophotesis,CIE;)等,雖然特異性可W高達(dá) 95%,但是 敏感性不夠,檢出率較低。美國抑A已于1997年發(fā)出了運些方法假陰性和假陽性率均很高 的可行度警告,加之其試劑盒價格昂貴,所W運些方法的應(yīng)用迅速減少。
[0004] 近年來,聚核酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)法漸漸顯現(xiàn)了其在檢測上的優(yōu)勢,標(biāo)準(zhǔn)PCR過程分 為Ξ步:DNA變性(90°C-96°C):雙鏈DNA模板在熱作用下,氨鍵斷裂,形成單鏈DNA;退火 (60°C-65°C):系統(tǒng)溫度降低,引物與DNA模板結(jié)合,形成局部雙鏈;延伸(70°C-75°C):在 Taq酶(在72°C左右,活性最佳)的作用下,W脫氧核糖核巧Ξ憐酸(dNT巧為原料,從引物 的3'端開始W從5' - 3'端的方向延伸,最終合成與模板互補的DNA鏈。每一循環(huán)經(jīng)過 變性、退火和延伸,DNA含量即增加一倍。
[0005] 運用PCR技術(shù)檢測主要設(shè)及到兩個方面:核酸的提取和核酸的擴增檢測。目前,國 內(nèi)臨床上主要采用煮沸法對B族鏈球菌的核酸進行提?。合葘⒎置谖飿颖緷饪s、洗涂,再加 裂解液,煮沸,高速離屯、,取上清為模板。步驟繁瑣,而且各廠家濃縮和裂解效率差異較大, 樣本依賴性強,對于較復(fù)雜的樣本提取效率低。
[0006] 巧光定量PCR技術(shù)是基于傳統(tǒng)PCR技術(shù)并結(jié)合光譜技術(shù)而發(fā)展起來的一種更靈 敏、更特異、更精確的核酸檢測技術(shù)。檢測結(jié)果準(zhǔn)確,重復(fù)性高,能動態(tài)反應(yīng)患者治療前、后 病原體動態(tài)變化及與臨床的關(guān)系,且整個過程中避免了傳統(tǒng)PCR需后處理的問題,減少了 污染。實時巧光定量PCR技術(shù)使用一種帶有巧光檢測裝置的PCR擴增儀,巧光檢測裝置能夠 按照一定的程序周期性地發(fā)出特定波長的激發(fā)光,收集檢測巧光信號,通過檢測巧光信號 的動態(tài)變化實時反映PCR的每個循環(huán)的擴增水平,試驗結(jié)束后可通過軟件自動分析獲得擴 增曲線,根據(jù)擴增曲線與巧光闊值線的交點(即Ct值)W及擴增曲線的形狀,可W判斷陰 陽性結(jié)果;如果同一反應(yīng)中有已知濃度的定量參考品或標(biāo)準(zhǔn)品,則可w通過軟件自動分析 獲得標(biāo)準(zhǔn)曲線,由此實現(xiàn)對未知樣本的定值(即定量檢測)。與傳統(tǒng)的PCR相對比,其在反 應(yīng)體系中增加了一條兩端分別標(biāo)記巧光報告基團和澤滅基團的探針。探針結(jié)構(gòu)完整時,巧 光報告基團發(fā)出的巧光能量被澤滅基團吸收,呈現(xiàn)澤滅效應(yīng);如果擴增過程中有祀序列的 存在,隨著目標(biāo)片段的延伸,探針分子逐漸被Taq酶水解切斷,巧光報告基團與澤滅基團相 互解離,阻斷了二者間巧光能量轉(zhuǎn)移效應(yīng),巧光報告基團發(fā)出的巧光信號被巧光檢測裝置 收集。隨著擴增的進行,巧光信號隨著目的片段的擴增而呈現(xiàn)線性增強。試驗結(jié)束后,可W 通過巧光PCR儀自帶的軟件自動分析數(shù)據(jù),可W獲得陰陽性結(jié)果和樣本濃度的定值結(jié)果, 因此,該技術(shù)在祀多核巧酸樣品的檢測和定量分析中,已逐漸取代傳統(tǒng)的PCR方法,得到十 分廣泛的應(yīng)用。研究顯示,實時巧光PCR檢測方法與標(biāo)準(zhǔn)的細(xì)菌培養(yǎng)方法在GBS檢測的敏 感性和特異性方面均達(dá)90%W上,達(dá)到篩檢標(biāo)準(zhǔn),已經(jīng)得到美國食品和藥品管理局(抑A) 的批準(zhǔn)并應(yīng)用于臨床。因此,在國內(nèi)采用實時巧光PCR技術(shù)進行GBS篩檢是最快速、可靠的 方法。
[0007] 目前,國內(nèi)已有數(shù)種基于實時巧光PCR技術(shù)檢測B族鏈球菌-DNA的試劑盒應(yīng)用于 臨床檢測中,運些試劑盒所提供的B族鏈球菌-DNA提取方法主要是煮沸法。在實際臨床應(yīng) 用中,此方法暴露出諸多不足之處:1)核酸提取過程較復(fù)雜,樣本處理耗時長,且在處理樣 本時,經(jīng)過煮沸裂解、高速離屯、富集DNA等多個步驟,DNA損耗嚴(yán)重,且對高濃度的樣本存在 裂解和富集不充分的問題;2)同時由于采用了水浴或金屬浴的高溫加熱步驟,容易造成氣 溶膠污染;3)檢測靈敏度偏低,約在lOOOcopies/ml左右;4)沒有設(shè)置陽性內(nèi)對照(即內(nèi) 標(biāo)),無法監(jiān)控假陰性。
【發(fā)明內(nèi)容】
[0008] 本發(fā)明提供一種B族鏈球菌PCR巧光探針法核酸檢測試劑盒,W解決現(xiàn)有技術(shù)中 試劑盒檢測效果差、靈敏度低的問題。
[0009] 本發(fā)明提供一種核酸釋放劑在B族鏈球菌檢測中的應(yīng)用,所述核酸釋放劑包含莎 梵婷0.05-0.51111/1、氯化鐘 100-3001111/1、十二烷基橫酸鋼0.05-3%和乙醇0.01-1%。
[0010] 本發(fā)明還提供一種B族鏈球菌PCR巧光探針法核酸檢測試劑盒,所述B族鏈球菌 PCR巧光探針法核酸檢測試劑盒包括:核酸釋放劑和PCR反應(yīng)液,所述核酸釋放劑包含莎梵 婷0. 05-0. 氯化鐘100-300mM/l、+二烷基橫酸鋼0. 05-3%和乙醇0. 01-1% ;所述 PCR反應(yīng)液包括用于祀多核巧酸擴增的上游引物、下游引物W及用于祀多核巧酸檢測的探 針。
[0011] 優(yōu)選的,所述用于祀多核巧酸檢測的探針序列為:5'-CAAATAACATTTCATATGTTATCT GGCAACAAAAGT-3^ 〇
[0012] 優(yōu)選的,所述用于祀多核巧酸擴增的上游引物和下游引物的序列分別為:上游引 物:5' -TTCTCAGCCTTCGCACGCG-3' ;下游引物:5' -AGATGGCACGACAGAGAATGGAAG-3'。
[0013] 優(yōu)選的,所述B族鏈球菌PCR巧光探針法核酸檢測試劑盒還包括內(nèi)標(biāo),所述內(nèi)標(biāo)序 列為:5,-TTCTCAGCCTTCGCACGCGTATTACTCTTGTCACAGCGTCGTTTGCGGTCTGTGGTATGCACGAAGGTC TTTGAAGTTTGTGCTGTCTTCCATTCTCTGTCGTGCCATCT-3 >。
[0014] 優(yōu)選的,所述B族鏈球菌PCR巧光探針法核酸檢測試劑盒還包括用于內(nèi)標(biāo)片段擴 增的上下游引物和用于檢測內(nèi)標(biāo)的探針,且所述檢測內(nèi)標(biāo)的探針序列為:5' -ATTACTCTTGTC ACAGCGTCGTTTGCG-3'。
[001引優(yōu)選的,所述B族鏈球菌PCR巧光探針法核酸檢測試劑盒中還包括酶混合液,所述 酶混合液中包括耐熱DNA聚合酶和尿喀晚DNA糖基化酶,同時在所述PCR反應(yīng)液中還包括 加TP。
[0016] 優(yōu)選的,所述B族鏈球菌PCR巧光探針法核酸檢測試劑盒還包括陽性對照和陰性 對照。
[0017] 本發(fā)明還提供一種B族鏈球菌PCR巧光探針法核酸檢測試劑盒,所述B族鏈球菌 PCR巧光探針法核酸檢測試劑盒包括PCR反應(yīng)液,所述PCR反應(yīng)液包括用于祀多核巧酸擴 增的上游引物、下游引物W及用于祀多核巧酸檢測的探針,且所述用于祀多核巧酸擴增的 上游引物和下游引物的序列分別為:上游引物:5' -TTCTCAGCCTTCGCACGCG-3';下游引物: 5' -AGATGGCACGACAGAGAATGGAAG-3'。
[0018] 本發(fā)明還提供一種B族鏈球菌PCR巧光探針法核酸檢測試劑盒,所述B族鏈球菌 PCR巧光探針法核酸檢測試劑盒包括PCR反應(yīng)液,所述PCR反應(yīng)液包括用于祀多核巧酸擴增 的上游引物、下游引物W及用于祀多核巧酸檢測的探針,且所述用于祀多核巧酸檢測的探 針序列為:5'-CAAATAACATTTCATATGTTATCTGGCAACAAAAGT-3,。
[0019] 本發(fā)明的實施例提供的技術(shù)方案可W包括W下有益效果:
[0020] 本發(fā)明提供一種B族鏈球菌PCR巧光探針法核酸檢測試劑盒,所述B族鏈球菌PCR 巧光探針法核酸檢測試劑盒包括:核酸釋放劑和PCR反應(yīng)液,所述核酸釋放劑包含莎梵婷 0.05-0.51111/1、氯化鐘100-3001111/1、十二烷基橫酸鋼0.05-3%和乙醇0.01-1%;所述口〇? 反應(yīng)液包括用于祀多核巧酸擴增的上游引物、下游引物W及用于祀多核巧酸檢測的探針。