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人NF-kB的核酸適配體及其應(yīng)用

文檔序號(hào):9367722閱讀:1357來(lái)源:國(guó)知局
人NF-kB的核酸適配體及其應(yīng)用
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001 ] 本申請(qǐng)涉及一種人NF-kB的核酸適配體及其應(yīng)用。
【背景技術(shù)】
[0002] 因子kB(NF-kB)是一種廣泛存在于體內(nèi)多種細(xì)胞的核轉(zhuǎn)錄因子,同時(shí)也是一種具 有多向性調(diào)節(jié)作用的蛋白質(zhì)分子。目前已發(fā)現(xiàn)NF-kB調(diào)節(jié)著100多種靶基因的表達(dá),包括 細(xì)胞因子、趨化因子、生長(zhǎng)因子、黏附分子、某些急性期反應(yīng)蛋白以及參與免疫識(shí)別的受體 和抗原遞呈的蛋白質(zhì)等。這些分子大多數(shù)在免疫調(diào)控、炎癥、應(yīng)激反應(yīng)及細(xì)胞凋亡中起重要 作用。NF-kB的過(guò)度活化會(huì)激活、增強(qiáng)機(jī)體的非特異及特異性免疫反應(yīng),造成組織損傷和器 官功能紊亂。NF-kB還可上調(diào)CyclinDl (CCNDI)等致癌基因的表達(dá),促進(jìn)細(xì)胞生長(zhǎng)。NF-kB 激活對(duì)腫瘤的增殖、轉(zhuǎn)移和侵襲具有明顯的促進(jìn)作用。因此,對(duì)腫瘤細(xì)胞內(nèi)NF-kB信號(hào)強(qiáng)度 的計(jì)算和調(diào)控,將有利于實(shí)現(xiàn)對(duì)細(xì)胞惡性表型的檢測(cè)和逆轉(zhuǎn)。
[0003] 核酸適配體(aptamer)由約50bp寡核苷酸組成的DNA或RNA序列,一般經(jīng)過(guò)體外 系統(tǒng)進(jìn)化技術(shù)篩選而得到。核酸適配體能形成特定的三維空間結(jié)構(gòu)與靶分子特異性得相結(jié) 合。Aptamer的靶分子廣泛,可以是蛋白質(zhì)、核酸、短肽、氨基酸、化合物、代謝小分子等,甚至 可以是細(xì)胞。核酸適配體已在高靈敏分析、疾病診斷和癌癥治療等方面顯示出重要的應(yīng)用 前景。有研究提示,如果將核酸適配體的序列插入至一些目的基因的5'非翻譯區(qū)內(nèi),當(dāng)與 配體相結(jié)合時(shí),可在局部形成非常穩(wěn)定的二級(jí)結(jié)構(gòu),并抑制核糖體小亞基的結(jié)合或滑動(dòng),從 而可以有效抑制目的基因的翻譯起始和表達(dá)。

【發(fā)明內(nèi)容】

[0004]本發(fā)明提供一種新的人NF-kB的核酸適配體及其應(yīng)用。
[0005] 本發(fā)明提供一種人NF-kB的核酸適配體,其序列如SEQIDNO: 1所示。
[0006]所述的核酸適配體作為NF-kB抑制劑的應(yīng)用。
[0007]所述的核酸適配體在制備抑制腫瘤細(xì)胞增殖的產(chǎn)品中的應(yīng)用。
[0008]所述腫瘤包括膀胱癌、前列腺癌、胃癌、肝癌、結(jié)腸癌、子宮內(nèi)膜癌和黑色素瘤。所 述腫瘤細(xì)胞為膀胱癌細(xì)胞系T24和UM-UC-3。
[0009]所述的核酸適配體在調(diào)控腫瘤細(xì)胞中NF-kB信號(hào)強(qiáng)度的應(yīng)用。
[0010] 檢測(cè)時(shí),可以將核酸適配體表達(dá)載體轉(zhuǎn)染入膀胱癌細(xì)胞系T24。
[0011] 本發(fā)明的有益效果是:通過(guò)設(shè)計(jì)NF-kB的核酸適配體,能夠?qū)崿F(xiàn)對(duì)NF-kB的抑制, 進(jìn)而能夠有效抑制腫瘤細(xì)胞增殖。
【附圖說(shuō)明】
[0012] 圖1是本實(shí)施方式人NF-kB的核酸適配體的構(gòu)建示意圖;
[0013] 圖2是顯示NF-kB監(jiān)控系統(tǒng)能夠產(chǎn)生對(duì)細(xì)胞內(nèi)源性NF-kB信號(hào)的有效應(yīng)答的檢測(cè) 圖,其中,林表示與對(duì)照組相比,P值小于0. 01,A指陰性對(duì)照,B指NF-kB監(jiān)控系統(tǒng),C指 陰性對(duì)照+NF-kB siRNA,D指NF-kB監(jiān)控系統(tǒng)+NF-kBsiRNA,E指NF-kB監(jiān)控系統(tǒng)+siRNA對(duì) 眧.
[0014] 圖3是顯示NF-kB監(jiān)控系統(tǒng)能夠有效降低NF-kB下游靶基因的表達(dá)的檢測(cè)圖,其 中,**表示與對(duì)照組相比,P值小于0. 01,黑色長(zhǎng)條指陰性對(duì)照,白色長(zhǎng)條指NF-kB監(jiān)控系 統(tǒng);
[0015] 圖4是顯示NF-kB監(jiān)控系統(tǒng)能夠有效抑制了膀胱癌細(xì)胞系T24的增殖的檢測(cè)圖, 其中,**表示與對(duì)照組相比,P值小于0. 01,上面的線條表示陰性對(duì)照,下面的線條表示實(shí) 驗(yàn)組(NF-kB監(jiān)控系統(tǒng));
[0016] 圖5是顯示NF-kB監(jiān)控系統(tǒng)能夠有效誘導(dǎo)了膀胱癌細(xì)胞系T24的凋亡的檢測(cè)圖。
【具體實(shí)施方式】
[0017] 下面通過(guò)【具體實(shí)施方式】結(jié)合附圖對(duì)本發(fā)明作進(jìn)一步詳細(xì)說(shuō)明。
[0018] 技術(shù)與方法
[0019] 1?細(xì)胞培養(yǎng)
[0020] 膀胱癌細(xì)胞系T24和UM-UC-3購(gòu)自American Type Culture Collection (ATCC, Manassas, USA),細(xì)胞培養(yǎng)液由 90 % 的DMEM (Invitrogen, CA),10 % 的胎 牛血清(Invitrogen),1%-2%的谷氨酰胺和0? 5% -1%的雙抗配成。
[0021] 2.NF-kB監(jiān)控系統(tǒng)的構(gòu)建
[0022] 體外化學(xué)合成NF-kB的核酸適配體序列兩個(gè)拷貝。中間以連接序列分開(kāi)。引入酶 切位點(diǎn)StuI和NheI于該元件的上下游,同時(shí)用酶切psiCHECKTM-2雙熒光素酶表達(dá)載體。 經(jīng)T4DNA連接酶將二者連接6小時(shí),連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化入感受態(tài)細(xì)胞,搖菌、涂板、挑選陽(yáng)性克 隆,并提純質(zhì)粒。
[0023] 3?細(xì)胞轉(zhuǎn)染
[0024] 轉(zhuǎn)染前一天,4-5XIO4個(gè)細(xì)胞接種在24孔板上,加入0. 5ml培養(yǎng)基,放在37°C、5% CO2培養(yǎng)箱內(nèi)。生長(zhǎng)24小時(shí)后,細(xì)胞匯合度達(dá)到70%,在50ul的無(wú)血清培養(yǎng)基內(nèi)加入Iug 重組質(zhì)粒,柔和混勻。在50ul無(wú)血清培養(yǎng)基內(nèi)加入lulLipofectamin2000(Invitrogen,CA )試劑,輕輕混勻,室溫放置5min。將稀釋好的質(zhì)粒和Lipo2000輕柔混勻,室溫放置20分 鐘,以便形成質(zhì)粒/lipofectamin復(fù)合物。將質(zhì)粒/Iipofectamin混合物加入24孔板內(nèi), 輕柔搖晃24孔板。放入培養(yǎng)箱內(nèi),4-6小時(shí)后更換培養(yǎng)基,48小時(shí)后收集細(xì)胞,準(zhǔn)備下一步 實(shí)驗(yàn)。
[0025] 4?總RNA提取
[0026] 使用美國(guó)nvitrogen公司的Trizol試劑提取總RNA。使用紫外分光光度計(jì)和2% 瓊脂糖凝膠檢測(cè)提取的總RNA質(zhì)量。定量后于-80°C儲(chǔ)存?zhèn)溆谩?br>[0027] 5?實(shí)時(shí)定量PCR
[0028]使用美國(guó)Fermentas的RevertAidTMFirstStrandcDNASynthesisKit把上 述總RNA逆轉(zhuǎn)錄為cDNA。根據(jù)說(shuō)明書(shū)步驟如下:取總RNA2ug,加入oligo(dT) 18 (0. 5ug/ ul),加DEPC處理的水至12ul。65°C反應(yīng)5分鐘,取出后立即置冰上。加5Xreaction buffer4ul,RNA酶抑制劑(20u/ul)lul,dNTP(10mM)2ul,混勻,瞬時(shí)離心。37°C反應(yīng) 5 分鐘,取出后立即置冰上。加MMLV逆轉(zhuǎn)錄酶(200u/ul)lul至20ul。42°C反應(yīng)60分 鐘。85°C10分鐘終止反應(yīng)后,立即置于冰上冷卻,逆轉(zhuǎn)錄所得的cDNA儲(chǔ)存于-80°C。PCR引物由上海生工生物工程有限公司合成。實(shí)時(shí)定量PCR引物序列如下:HIF-1a 正向引物(SEQIDNO:3) :5 ' -CCATTAGAAAGCAGTTCCGC-3 ',反向引物(SEQIDNO: 4):5,-TGGGTAGGAGATGGAGATGC-3,;VEGF正向引物(SEQIDNO:5):5,-AGCCTTG CCGCCTTGCTGCTCTA-3 ',反向引物(SEQIDN0:6):5 ' -GTGCTGGCCTTGGTGAGG-3 '; Bcl-XL正向引物(SEQIDN0:7):5 ' -GGTCGCAITGTGGCCTTCTT-3 ',反向引物 (SEQIDN0:8):5,-GCAGGTCTGCTGACCTCACT-3,;GAPDH正向引物(SEQIDNO: 9) : 5,-CGCTCTCTGCTCCTCCTGITC-3,,反向引物(SEQIDNO: 10) : 5'-ATCCGITGACTCCGAC CTTCAC-3'.GAPDH用作內(nèi)參。PCR總反應(yīng)體系為 20ul,包括 10iil2XAll-in-0ne?qPCR Mix(GeneCopoieaInc,美國(guó)),0.4iil正向引物,0.4iil反向引物,IniFirst-Strand cDNA, 50XR0XReferenceDyeO. 4ul和 7. 8ul雙蒸水。使用ABIPRISM7000Fluorescent QuantitativePCRSystem(App
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