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中期因子mRNA在肺癌患者外周血中的表達及其應(yīng)用

文檔序號:8247119閱讀:188來源:國知局
中期因子mRNA在肺癌患者外周血中的表達及其應(yīng)用
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001 ] 本發(fā)明涉及中期因子mRNA在癌癥診斷中的應(yīng)用,尤其是外周血中中期因子mRNA 用于非小細胞肺癌鑒別診斷的應(yīng)用。
【背景技術(shù)】
[0002] 肺癌是我國最常見的惡性腫瘤之一,其發(fā)病率和死亡率均位于惡性腫瘤之首。非 小細胞肺癌(Non-Small Cell Lung Cancer,NSCLC)約占其80%,近些年療效雖有提高, 但長期生存率仍較偏低,絕大多數(shù)患者確診時已是癌癥晚期,只能采取姑息性治療,預(yù)后較 差。
[0003] 中期因子(midkine,MK)是一種分泌型肝素結(jié)合生長因子,為低分子量的蛋白質(zhì)。 MK大量表達于妊娠中期并在妊娠的發(fā)展中起著重要的作用。在成人,MK被限制在一定的組 織中表達。然而,在腫瘤發(fā)生,炎癥和組織細胞修復(fù)的過程中,MK的表達明顯增強。近年 發(fā)現(xiàn)MK在多種實體瘤中過表達,在癌前病變和腫瘤潛伏期也呈高表達,因此MK可能成為 新的腫瘤標記物.MK與惡性腫瘤的關(guān)系不十分清楚,但一些實驗已證實MK參與腫瘤生長、 血管生成、多藥耐藥形成等過程.應(yīng)用MK反義寡脫氧核糖核苷酸(MKasODN)或MK啟動子 進行基因治療,可能成為基因治療的新靶點.
[0004] 本發(fā)明擬通過建立外周血熒光定量PCR檢測MKmRNA的表達方法,比較和分析了外 周血中MK mRNA的表達水平在不同人群(NSCLC患者,LEL患者,正常體檢者)中的表達差 異及與NSCLC的臨床病理特征的關(guān)系,并對其作為NSCLC的診斷標志物的可行性進行了探 討。
[0005] 在實施過程中,本發(fā)明人成功建立了外周血中MK mRNA的熒光定量PCR檢測方法, 發(fā)現(xiàn)外周血中MK mRNA的表達水平在NSCLC患者,LEL患者,正常體檢者間存在顯著性差異, 且其高表達水平與NSCLC的臨床分期、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移,細胞分化程度有顯著的相關(guān)性。在鑒別 診斷NSCLC患者和正常人時,ROC曲線下面積AUC值為0. 814 (95% CI = 0. 738 to 0. 894), 在鑒別診斷NSCLC患者和LEL患者時,ROC曲線下面積AUC值為0. 759(95% Cl = 0. 673 to 0. 846),將cut-off值設(shè)在0. 0063時,MKmRNA鑒別診斷NSCLC患者與LEL患者和鑒別 診斷NSCLC患者和正常人的敏感性和特異性分別為57. 47%和93. 33% ;以及56. 32%和 93. 33%。此外,Logistic回歸分析認為,外周血中MK mRNA的高水平表達是NSCLC發(fā)生的 獨立危險因素。

【發(fā)明內(nèi)容】

[0006] 本發(fā)明通過建立外周血MKmRNA的Taqman熒光定量PCR法檢測方法,比較NSCLC 患者、LEL患者、健康體檢者外周血中MK mRNA的表達水平,并分析其表達水平與NSCLC臨 床病理特征的相關(guān)性,通過ROC曲線和多元Logistic回歸分析,發(fā)現(xiàn)NSCLC患者外周血中 MK mRNA表達可以作為診斷NSCLC的腫瘤標志物。
[0007] 本發(fā)明建立了敏感、特異、穩(wěn)定的NSCLC外周血MK mRNATaqman探針real time PCR檢測方法:
[0008] (1)培養(yǎng)肺癌細胞A549,抽提總RNA,合成cDNA,
[0009] (2)設(shè)計PCR擴增引物,擴增獲取目的基因 MK和內(nèi)參基因 GAPDH的擴增片段;
[0010] MK 引物:
[0011] MK-For : 5 ' -CGCGGATCCATGCAGCACCGAGGCTTC-3 '
[0012] MK-Rev :5' -CCCAAGCTTCTAGTCCTTTCCCTTCCCTTTC-3'
[0013] GAPDH引物序列:
[0014] GAPDH-For :5' -CCGGAATTCCTTCGCTCTCTGCTCCTCCTG-3'
[0015] GAPDH-Rev :5' -CCGCTCGAGCTCTTCCTCTTGTGCTCTTGCTG-3'
[0016] (3)PCR片段轉(zhuǎn)化、鏈接、篩選、測序,構(gòu)建質(zhì)粒pET28a - MK,pET28a - GAPDH ;
[0017] (4)設(shè)計 Real-Time PCR 引物探針
[0018] MK引物及探針:
[0019] MK-For :5, -CATCACACGCACCCCAGTT-3'
[0020] MK-Probe :5' -CTTGCAGTCGGCTCCAAACTCCTTCTT-3'
[0021] MK-ReV : 5 ' ATTGCGGCGTGGGTTTC-3 '
[0022] GAPDH引物及探針:
[0023] GAPDH-For :5' -CTTTACCAGAGTTAAAAGCAGCCC-3'
[0024] GAPDH-Probe :5' -CCAAATCCGTTGACTCCGACCTTCA-3'
[0025] GAPDH-Rev :5' -CCAGCCGAGCCACAT-3'
[0026] e)以梯度稀釋質(zhì)粒PCR擴增制備標準曲線,建立Taqman探針real time PCR檢測 方法
[0027] 反應(yīng)體系建立:
[0028]
【主權(quán)項】
1. 一種用于診斷NSCLC的試劑盒,其使用過程包括檢測外周血中中期因子mRNA的步 驟。
2. -種MK和GAPDH基因的引物探針,其特征在于其序列如下: MK引物及探針: MK-For :5' - CATCACACGCACCCCAGTT-3' MK-Probe :5' -CTTGCAGTCGGCTCCAAACTCCTTCTT-3' MK-Rev :5' ATTGCGGCGTGGGTTTC-3' GAPDH引物及探針: GAPDH-For :5' -CTTTACCAGAGTTAAAAGCAGCCC-3' GAPDH-Probe :5' -CCAAATCCGTTGACTCCGACCTTCA-3' GAPDH-Rev :5' -CCAGCCGAGCCACAT-3'。
3. -種試劑盒,包括權(quán)利要求2所述的引物及探針。
【專利摘要】本發(fā)明公開了一種外周血中中期因子(midkine,MK)mRNA的熒光定量PCR檢測方法。本發(fā)明比較了非小細胞肺癌(NSCLC)患者、肺良性疾病患者(LEL)、健康體檢者(Healthy)外周血中MK?mRNA的表達水平,并分析了其表達水平與NSCLC臨床病理特征的相關(guān)性,并對外周血中MK?mRNA的表達作為NSCLC鑒別診斷標志物的可行性進行了探討,結(jié)果顯示,外周血中MK?mRNA的表達水平在NSCLC患者,LEL患者,正常體檢者間存在顯著性差異,且其高表達水平與NSCLC的臨床分期、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移,細胞分化程度有顯著的相關(guān)性。因此,外周血中MK?mRNA的檢測可以用于鑒別診斷NSCLC的高效檢測。
【IPC分類】C12Q1-68, C12N15-11
【公開號】CN104561298
【申請?zhí)枴緾N201410841608
【發(fā)明人】馬志紅, 李麗琴, 黃惠蓮, 李靜, 戴利成
【申請人】湖州市中心醫(yī)院
【公開日】2015年4月29日
【申請日】2014年12月29日
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