本發(fā)明屬于基因工程,具體涉及一種通過添加甜菜堿調(diào)控prpb基因啟動子表達(dá)強(qiáng)度的方法。
背景技術(shù):
1、啟動子是rna聚合酶特異識別和結(jié)合的dna序列,它是基因的一個組成部分,像“開關(guān)”一樣控制著基因轉(zhuǎn)錄的起始時間和轉(zhuǎn)錄表達(dá)的程度。啟動子是位于結(jié)構(gòu)基因5'端上游的一段dna序列,能夠指導(dǎo)全酶(holoenzyme)和模板正確結(jié)合,激活rna聚合酶,啟動基因轉(zhuǎn)錄,啟動子本身并不能直接控制基因表達(dá),而是通過與轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合進(jìn)而控制結(jié)構(gòu)基因表達(dá)。
2、目前常用的啟動子類型有組成型啟動子(能夠使基因在所有細(xì)胞中都能啟動表達(dá)的啟動子)和誘導(dǎo)型啟動子(在某些特定的物理信號、化學(xué)信號或小分子信號的刺激下,特定的誘導(dǎo)型啟動子才能啟動下游結(jié)構(gòu)基因的轉(zhuǎn)錄表達(dá))。組成型啟動子的調(diào)控不受外界條件的影響,所啟動基因的表達(dá)具有持續(xù)性,但不表現(xiàn)時間特異性,不可以人為調(diào)控,在實(shí)際應(yīng)用中不具備可操作性;而誘導(dǎo)型啟動子可以通過外界的特殊信號人為的調(diào)控結(jié)構(gòu)基因的表達(dá)。目前,常用的誘導(dǎo)信號包括iptg、乳糖等化學(xué)物質(zhì),在實(shí)際生產(chǎn)過程中面臨成本過高等問題。
3、甜菜堿(betaine,分子式為c5h12no2)具有提高細(xì)胞對胞外環(huán)境滲透壓的耐受能力、為目標(biāo)產(chǎn)物合成提供甲基供體以及保護(hù)生物體內(nèi)關(guān)鍵酶的活性等多種生理功能,被廣泛的應(yīng)用于微生物發(fā)酵生產(chǎn)過程中。cn106636023a公布了通過在表達(dá)體系或發(fā)酵體系中添加甜菜堿實(shí)現(xiàn)zwf基因啟動子表達(dá)強(qiáng)度增強(qiáng)0.2-0.98倍。除此之外,甜菜堿的誘導(dǎo)功能尚未被認(rèn)識開發(fā)利用。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路
1、針對現(xiàn)有技術(shù)不足,本發(fā)明目的是提供一種調(diào)控prpb基因啟動子表達(dá)強(qiáng)度的方法,具體是通過在微生物表達(dá)體系中添加甜菜堿以實(shí)現(xiàn)調(diào)控prpb基因啟動子表達(dá)強(qiáng)度提高和/或降低的目的。
2、本發(fā)明技術(shù)方案如下:
3、第一方面,本發(fā)明提供了一種調(diào)控prpb基因啟動子表達(dá)強(qiáng)度的方法,所述方法是,在含有prpb基因啟動子的表達(dá)體系中添加甜菜堿,可以調(diào)控prpb基因啟動子的表達(dá)強(qiáng)度在微生物生長的對數(shù)期提高和/或穩(wěn)定期降低。
4、如上述第一方面本發(fā)明提供的方法,所述prpb基因啟動子的表達(dá)強(qiáng)度在微生物生長的對數(shù)期提高了160%-180%。
5、如上述第一方面本發(fā)明提供的方法,所述prpb基因啟動子的表達(dá)強(qiáng)度在微生物生長的穩(wěn)定期降低了70%-80%。
6、第二方面,本發(fā)明提供了一種調(diào)控目的基因表達(dá)水平的方法,所述方法是,在含有目的基因及其上游的prpb基因啟動子的表達(dá)體系中添加甜菜堿,可以調(diào)控所述目的基因的表達(dá)水平在微生物生長的對數(shù)期提高和/或穩(wěn)定期降低。
7、本發(fā)明的有益效果如下:
8、本發(fā)明中在微生物發(fā)酵體系中添加的甜菜堿區(qū)別于作為常見的甲基供體,而是作為一種新型誘導(dǎo)劑,調(diào)控表達(dá)體系中prpb基因啟動子的表達(dá)強(qiáng)度在對數(shù)期顯著提高和/或穩(wěn)定期顯著降低;進(jìn)而利用該方法可以實(shí)現(xiàn)對表達(dá)體系中目的基因表達(dá)水平的精準(zhǔn)調(diào)控。實(shí)現(xiàn)這種精準(zhǔn)調(diào)控具有以下多方面好處或作用:
9、快速響應(yīng):啟動子表達(dá)強(qiáng)度的快速提高使細(xì)胞能夠迅速對外部刺激或內(nèi)部需求作出反應(yīng),啟動相關(guān)基因的表達(dá)。
10、精確調(diào)控:隨后表達(dá)強(qiáng)度的降低有助于避免資源的過度消耗和不必要的基因表達(dá),實(shí)現(xiàn)精確的基因表達(dá)調(diào)控。
11、適應(yīng)環(huán)境變化:這種調(diào)控模式使細(xì)胞能夠更好地適應(yīng)不斷變化的環(huán)境條件,維持內(nèi)環(huán)境的穩(wěn)定。
12、避免負(fù)面效應(yīng):某些基因的高表達(dá)可能產(chǎn)生負(fù)面效應(yīng),通過精準(zhǔn)調(diào)控適時降低表達(dá)強(qiáng)度可以避免這些效應(yīng)的發(fā)生。
1.一種調(diào)控prpb基因啟動子表達(dá)強(qiáng)度的方法,其特征在于,所述方法是在含有prpb基因啟動子的表達(dá)體系中添加甜菜堿,可以調(diào)控prpb基因啟動子的表達(dá)強(qiáng)度在微生物生長的對數(shù)期提高和/或穩(wěn)定期降低。
2.如權(quán)利要求1所述的方法,其特征在于,所述prpb基因啟動子的表達(dá)強(qiáng)度在微生物生長的對數(shù)期提高了160%-180%。
3.如權(quán)利要求1所述的方法,其特征在于,所述prpb基因啟動子的表達(dá)強(qiáng)度在微生物生長的穩(wěn)定期降低了70%-80%。
4.如權(quán)利要求1所述的方法,其特征在于,所述表達(dá)體系是大腸桿菌表達(dá)體系。
5.如權(quán)利要求4所述的方法,其特征在于,所述prpb基因啟動子的表達(dá)強(qiáng)度在發(fā)酵8-12h時提高了160%-180%,在發(fā)酵16-20h時降低了70%-80%。
6.如權(quán)利要求1所述的方法,其特征在于,所述甜菜堿的添加量是在發(fā)酵體系中工作濃度1g/l。
7.如權(quán)利要求1所述的方法,其特征在于,所述prpb基因啟動子的核苷酸序列如seq?idno.1所示。
8.一種調(diào)控目的基因表達(dá)水平的方法,所述方法是,在含有目的基因及其上游的prpb基因啟動子的表達(dá)體系中添加甜菜堿,可以調(diào)控所述目的基因的表達(dá)水平在微生物生長的對數(shù)期提高和/或穩(wěn)定期降低。