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細(xì)胞內(nèi)熒光響應(yīng)標(biāo)記DNA的光點(diǎn)擊探針及其制備方法與應(yīng)用與流程

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細(xì)胞內(nèi)熒光響應(yīng)標(biāo)記DNA的光點(diǎn)擊探針及其制備方法與應(yīng)用與流程

本發(fā)明屬于核酸標(biāo)記領(lǐng)域,特別涉及一種細(xì)胞內(nèi)熒光響應(yīng)標(biāo)記dna的光點(diǎn)擊探針及其制備方法與應(yīng)用。



背景技術(shù):

在生命科學(xué)研究領(lǐng)域,具有熒光響應(yīng)的核酸標(biāo)記技術(shù)在研究核酸分子結(jié)構(gòu)以及其在細(xì)胞內(nèi)的合成過(guò)程具有非常重要的價(jià)值和意義。尤其是利用生物正交反應(yīng)觸發(fā)的熒光響應(yīng)標(biāo)記方法經(jīng)成為一種生物分子標(biāo)記的重要工具,這種標(biāo)記方法可以在溫和的條件下選擇性標(biāo)記和追蹤生物分子,并進(jìn)行靈敏的可視化熒光成像。最初的標(biāo)記方法有熒光響應(yīng)的合成后標(biāo)記,模板介導(dǎo)的連接和dna或rna的代謝標(biāo)記,這些方法是基于一價(jià)銅離子催化的疊氮和炔烴的環(huán)化加成反應(yīng)[gierlich,j.;burley,g.a.;gramlich,p.m.;hammond,d.m.;carell,t.org.lett.2006,8,3639–3642]。為了打破銅離子催化的高毒性[kennedy,d.c.;mckay,c.s.;legault,m.c.b.;danielson,d.c.;blake,j.a.;pegoraro,a.f.;stolow,a.;mester,z.;pezacki,j.p.j.am.chem.soc.2011,133,17993-18001]熒光響應(yīng)標(biāo)記核酸進(jìn)一步發(fā)展為基于非銅催化的生物正交反應(yīng),非銅催化的生物正交反應(yīng)包括張力促進(jìn)的1,3-兩極環(huán)化加成反應(yīng),狄爾斯-阿爾德反應(yīng)和親核加成反應(yīng)[domnick,c.;eggert,f.;kath-schorr,s.chem.commun.2015,51,8253–8256]。但是即便如此,由于非銅催化的反應(yīng)基團(tuán)的尺寸的限制,到目前為止還沒(méi)有報(bào)道過(guò)在細(xì)胞內(nèi)有熒光響應(yīng)的dna快速標(biāo)記和成像的方法。在細(xì)胞環(huán)境內(nèi)熒光響應(yīng)標(biāo)記核酸對(duì)于探究核酸的復(fù)制及轉(zhuǎn)運(yùn)過(guò)程是非常重要的。

光誘導(dǎo)的疊氮-炔烴環(huán)化加成反應(yīng)即光點(diǎn)擊反應(yīng)是一種非金屬催化的具有熒光響應(yīng)的生物正交反應(yīng)。光點(diǎn)擊反應(yīng)已經(jīng)作為一種有效的蛋白定點(diǎn)修飾方法,近年來(lái)這種反應(yīng)引起了很多人的關(guān)注。光點(diǎn)擊反應(yīng)已經(jīng)成功地被證明可以用可見(jiàn)光405nm[an,p.;yu,z.;lin,q.chem.commun.2013,49,9920-9922.]和近紅外光700nm激發(fā)[yu,z.;ohulchanskyy,t.y.;an,p.;prasad,p.n.;lin,q.j.am.chem.soc.2013,135,16766–16769]。通過(guò)改變四唑化合物的結(jié)構(gòu)來(lái)減少紫外光的限制。鑒于這一優(yōu)勢(shì),近期光點(diǎn)擊化學(xué)反應(yīng)已經(jīng)開(kāi)始被應(yīng)用于在體外對(duì)核酸的修飾[(a)holstein,j.m.;stummer,d.;rentmeister,a.chem.sci.2015,6,1362–1369.(b)arndt,s.;wagenknecht,h.-a.angew.chem.int.ed.2014,53,14580–14582]。但是,有的文獻(xiàn)報(bào)道的四唑化合物通過(guò)光點(diǎn)擊反應(yīng)標(biāo)記核酸后的產(chǎn)物熒光較弱或者無(wú)光,有的文獻(xiàn)則用四唑化合物可以熒光響應(yīng)標(biāo)記rna[li,j.;huang,l.;xiao,x.;chen,y.;wang,x.;zhou,z.;zhang,y.j.am.chem.soc.2016,138,15943-15949]。在光點(diǎn)擊反應(yīng)標(biāo)記核酸的過(guò)程中,這種不明確的熒光響應(yīng)行為成為其首要問(wèn)題。因此,解決光點(diǎn)擊反應(yīng)標(biāo)記核酸中的熒光響應(yīng)問(wèn)題及探究可以用于活體內(nèi)代謝標(biāo)記核酸的具有熒光響應(yīng)能力的探針具有非常重要的意義。



技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:

本發(fā)明的首要目的在于克服現(xiàn)有技術(shù)的缺點(diǎn)與不足,提供一種細(xì)胞內(nèi)熒光響應(yīng)標(biāo)記dna的光點(diǎn)擊探針。該探針具有光點(diǎn)擊反應(yīng)的特征性?xún)?yōu)點(diǎn)如:反應(yīng)速度快,反應(yīng)基團(tuán)分子為小且易修飾具有烯烴基團(tuán)的化合物,并且該探針具有細(xì)胞核靶向性,適合應(yīng)用于活細(xì)胞內(nèi)核酸的快速代謝標(biāo)記。

本發(fā)明的另一目的在于提供了所述細(xì)胞內(nèi)熒光響應(yīng)標(biāo)記dna的光點(diǎn)擊探針的制備方法。

本發(fā)明的再一目的在于提供所述細(xì)胞內(nèi)熒光響應(yīng)標(biāo)記dna的光點(diǎn)擊探針的應(yīng)用。

本發(fā)明的目的通過(guò)下述技術(shù)方案實(shí)現(xiàn):一種細(xì)胞內(nèi)熒光響應(yīng)標(biāo)記dna的光點(diǎn)擊探針,為香豆素四唑化合物w1和w2中的至少一種;所述的w1和w2的結(jié)構(gòu)式如式i和式ii所示:

其中,r為c1-c2烷基、烷基衍生物取代基,含酯基衍生物取代基或芳香烴衍生物取代基。

所述的c1-c2烷基、烷基衍生物取代基優(yōu)選為甲基、乙基或三氟甲基;

所述的含酯基衍生物取代基優(yōu)選為乙酸乙酯取代基

所述的芳香烴衍生物取代基優(yōu)選為苯甲基對(duì)三氟甲基苯甲基對(duì)甲氧基苯甲基或2,5-二甲氧基苯甲基

所述的細(xì)胞內(nèi)熒光響應(yīng)標(biāo)記dna的光點(diǎn)擊探針的制備方法,包括如下步驟:

(1)將香豆素衍生物加入乙醇水溶液中,接著加入濃鹽酸,然后在5℃條件下加入nano2(亞硝酸鈉)水溶液,再在-15℃的條件下滴加到4-甲基((2-(苯磺酰)亞肼基)甲基)苯甲酸鹽的吡啶中,恢復(fù)室溫進(jìn)行反應(yīng),萃取、減壓蒸餾、得到香豆素四唑化合物(w1);

(2)將步驟(1)中得到的香豆素四唑化合物(w1)和氫氧化鋰在四氫呋喃、甲醇和水的混溶液中加熱攪拌反應(yīng),反應(yīng)終止后再調(diào)節(jié)溶液的ph值至出現(xiàn)紫色沉淀,得到中間體a;

(3)將步驟(2)中得到的中間體a、nhs(n-羥基丁二酰亞胺)和edc(1-(3-二甲氨基丙基)-3-乙基碳二亞胺鹽酸鹽)在dmf(n,n-二甲基甲酰胺)中攪拌反應(yīng)(用于活化香豆素四唑化合物),反應(yīng)終止后再加入飽和食鹽水析出沉淀,得到四唑化合物b;

(4)將步驟(3)中得到的四唑化合物b加入到含有三乙胺的dcm(二氯甲烷)和dmso(二甲基亞砜)溶液中,然后加入?;撬崴芤簲嚢璺磻?yīng),減壓蒸餾,加甲醇稀釋沉淀過(guò)濾后,調(diào)ph值至中性,再加入乙醚、過(guò)濾、取沉淀,得到w2,即為細(xì)胞內(nèi)熒光響應(yīng)標(biāo)記dna的光點(diǎn)擊探針。

步驟(1)中所述的香豆素衍生物和4-甲基((2-(苯磺酰)亞肼基)甲基)苯甲酸鹽優(yōu)選為按摩爾比10:9配比計(jì)算。

步驟(1)中所述的乙醇水溶液為乙醇和水按體積比1:1配比得到。

步驟(1)中所述的反應(yīng)的條件為攪拌過(guò)夜進(jìn)行反應(yīng)。

步驟(1)中所述的乙醇水溶液的用量為按乙醇水溶液和濃鹽酸的體積比6:1配比計(jì)算。

步驟(1)中所述的濃鹽酸的濃度優(yōu)選為體積百分比37%。

步驟(1)中所述的萃取為采用dcm(二氯甲烷)進(jìn)行萃取。

所述的具有熒光響應(yīng)的dna光點(diǎn)擊探針的制備方法,還包括將步驟(1)中得到的香豆素四唑化合物經(jīng)硅膠柱進(jìn)一步純化。

步驟(2)中所述的香豆素四唑化合物和氫氧化鋰優(yōu)選為按摩爾比1:20配比計(jì)算。

步驟(2)中所述的四氫呋喃的用量為按四氫呋喃、甲醇和水體積比2:1:1配比計(jì)算。

步驟(3)中所述的中間體a、nhs和edc優(yōu)選為按摩爾比1:2:2配比計(jì)算。

步驟(3)中所述的反應(yīng)的時(shí)間優(yōu)選為12h。

步驟(4)所述的四唑化合物b、三乙胺和?;撬醿?yōu)選為按摩爾比1:2:2配比計(jì)算。

步驟(4)中所述的dcm的用量為按dcm和dmso體積比4~6:1配比計(jì)算;優(yōu)選為按體積比5:1配比計(jì)算。

步驟(4)中所述的調(diào)ph值優(yōu)選為用氫氧化鈉的甲醇溶液進(jìn)行調(diào)ph值。

所述的氫氧化鈉的濃度優(yōu)選為0.5mol/l。

步驟(4)中所述的反應(yīng)優(yōu)選為在氮?dú)獗Wo(hù)下進(jìn)行反應(yīng)。

所述的細(xì)胞內(nèi)熒光響應(yīng)標(biāo)記dna的光點(diǎn)擊探針在核酸標(biāo)記領(lǐng)域中的應(yīng)用。

所述的細(xì)胞內(nèi)熒光響應(yīng)標(biāo)記dna的光點(diǎn)擊探針在核酸標(biāo)記領(lǐng)域中的應(yīng)用,通過(guò)如下方法實(shí)現(xiàn):

(i)將細(xì)胞內(nèi)熒光響應(yīng)標(biāo)記dna的光點(diǎn)擊探針與具有氨基的核酸序列在硼酸鈉緩沖液中避光孵育進(jìn)行縮合反應(yīng),用預(yù)冷的無(wú)水乙醇將核酸沉降出來(lái),得到香豆素四唑修飾的核酸;

(ii)將步驟(i)得到的香豆素四唑修飾的核酸分別與異丙基丙烯酰胺和n-(2-羥乙基)馬來(lái)酰亞胺在磷酸鹽緩沖液中、紫外光照射下發(fā)生光點(diǎn)擊反應(yīng),得到具有熒光響應(yīng)的核酸。

步驟(i)中所述的細(xì)胞內(nèi)熒光響應(yīng)標(biāo)記dna的光點(diǎn)擊探針和核酸序列優(yōu)選為按摩爾比(8~12):1配比計(jì)算;更優(yōu)選為按10:1配比計(jì)算。

步驟(i)中所述的核酸序列優(yōu)選為5’端氨基標(biāo)記。

步驟(i)中所述的硼酸鈉緩沖液的ph優(yōu)選為8.0。

步驟(i)中所述的縮合反應(yīng)的時(shí)間優(yōu)選為14小時(shí)。

步驟(ii)中所述的紫外光的波長(zhǎng)優(yōu)選為350nm。

步驟(ii)中所述的紫外光的照射時(shí)間優(yōu)選為10分鐘。

步驟(ii)中所述的磷酸鹽緩沖液的ph值為5.5~7.5,優(yōu)選為7.5。

所述的細(xì)胞內(nèi)熒光響應(yīng)標(biāo)記dna的光點(diǎn)擊探針在核酸標(biāo)記領(lǐng)域中的應(yīng)用,還可以通過(guò)如下方法實(shí)現(xiàn):

①將細(xì)胞傳代到培養(yǎng)皿中培養(yǎng)貼壁后,加入5-乙烯基-2’-脫氧尿苷(vdu)進(jìn)行培養(yǎng);

②換成新的dmem培養(yǎng)液孵育后,再加入細(xì)胞內(nèi)熒光響應(yīng)標(biāo)記dna的光點(diǎn)擊探針繼續(xù)培養(yǎng);

③加入新的dmem培養(yǎng)液孵育后,再用紫外光照射進(jìn)行反應(yīng)。

步驟①中所述的細(xì)胞優(yōu)選為腫瘤細(xì)胞。

步驟①中所述的細(xì)胞內(nèi)熒光響應(yīng)標(biāo)記dna的光點(diǎn)擊探針優(yōu)選為ctz-so3。

步驟①中所述的加入vdu為加入終濃度為30~50μm的vdu;優(yōu)選為加入終濃度為30μm的vdu。

步驟①中所述的培養(yǎng)的時(shí)間為12~20小時(shí);優(yōu)選為16小時(shí)。

步驟②中所述的加入細(xì)胞內(nèi)熒光響應(yīng)標(biāo)記dna的光點(diǎn)擊探針為加入終濃度為10~20μm的細(xì)胞內(nèi)熒光響應(yīng)標(biāo)記dna的光點(diǎn)擊探針,優(yōu)選為加入終濃度為10μm的細(xì)胞內(nèi)熒光響應(yīng)標(biāo)記dna的光點(diǎn)擊探針。

步驟②中所述的孵育的時(shí)間為3~6小時(shí);優(yōu)選為4小時(shí)。

步驟②中所述的繼續(xù)培養(yǎng)的時(shí)間為3~6小時(shí);優(yōu)選為4小時(shí)。

步驟③中所述的孵育的時(shí)間優(yōu)選為2小時(shí)。

步驟③中所述的紫外光波長(zhǎng)優(yōu)選為350nm。

步驟③中所述的紫外光的照射時(shí)間為8~14分鐘;優(yōu)選為10分鐘。

本發(fā)明中細(xì)胞內(nèi)熒光響應(yīng)標(biāo)記dna的光點(diǎn)擊探針標(biāo)記核酸的發(fā)光原理是:標(biāo)記核酸后產(chǎn)物發(fā)光部分由兩部分組成,熒光探針香豆素衍生物部分和吡唑啉部分,吡唑啉部分發(fā)光可以被核酸引起的光誘導(dǎo)的電子轉(zhuǎn)移效應(yīng)淬滅,但是香豆素部分的熒光不受影響,因此,香豆素四唑在紫外光的照射下可以熒光響應(yīng)的標(biāo)記核酸。

本發(fā)明相對(duì)于現(xiàn)有技術(shù)具有如下的優(yōu)點(diǎn)及效果:

(1)本文中光點(diǎn)擊探針具有細(xì)胞核靶向性適用于活體內(nèi)的核酸代謝標(biāo)記。

(2)反應(yīng)基團(tuán)分子小,不干擾細(xì)胞內(nèi)核酸正常的代謝過(guò)程。

(3)反應(yīng)速度快,可以快速標(biāo)記細(xì)胞內(nèi)的核酸。

(4)反應(yīng)中用350nm的紫外光照射減少對(duì)細(xì)胞及核酸的損傷。

(5)反應(yīng)過(guò)程中有熒光響應(yīng),反應(yīng)完后不需要清洗步驟即可,核酸標(biāo)記成像不需要將細(xì)胞固定或核酸變性。

(6)反應(yīng)原料容易獲得,反應(yīng)產(chǎn)物合成簡(jiǎn)單,操作簡(jiǎn)單,易于普及。

(7)本發(fā)明中具有熒光響應(yīng)的dna光點(diǎn)擊探針,香豆素的ehomo值在-0.324hartree以下時(shí)香豆素的熒光可以被四氮唑淬滅,隨著香豆素的ehomo值逐漸降低,標(biāo)記核酸產(chǎn)物的熒光量子產(chǎn)率會(huì)逐漸升高,同時(shí)香豆素四唑化合物的熒光量子產(chǎn)率也會(huì)有所增加。

附圖說(shuō)明

圖1是本發(fā)明中細(xì)胞內(nèi)熒光響應(yīng)標(biāo)記dna的光點(diǎn)擊探針的合成路線(xiàn)圖與實(shí)施1中產(chǎn)物1~7的結(jié)構(gòu)圖,其中,圖a為合成路線(xiàn)圖;圖b為產(chǎn)物1~7的結(jié)構(gòu)圖。

圖2是實(shí)施例2中計(jì)算的香豆素衍生物的最高占據(jù)分子軌道能量值(ehomo)和熒光量子產(chǎn)率關(guān)系圖(圖中uv表示350nm紫外光)。

圖3是實(shí)施例3中香豆素四唑修飾的核酸和不同帶烯烴的化合物光點(diǎn)擊反應(yīng)后的熒光圖;其中,圖a為香豆素四唑修飾的核酸分別與異丙基丙烯酰胺和n-(2-羥乙基)馬來(lái)酰亞胺反應(yīng)產(chǎn)物的熒光光譜圖;圖b為在不同ph值的緩沖液中香豆素四唑修飾的核酸與n,n-二甲基乙基丙烯酰胺反應(yīng)產(chǎn)物的熒光光譜圖。

圖4是實(shí)施例4中細(xì)胞內(nèi)熒光響應(yīng)標(biāo)記dna的光點(diǎn)擊探針ctz-so3和vdu光點(diǎn)擊反應(yīng)后的熒光圖和吸收?qǐng)D;其中,圖a為ctz-so3和vdu反應(yīng)前后的熒光光譜圖;圖b為ctz-so3和vdu反應(yīng)前后的吸收譜圖。

圖5是實(shí)施例4中光點(diǎn)擊速率數(shù)據(jù)分析圖。

圖6是實(shí)施例5中細(xì)胞內(nèi)熒光響應(yīng)標(biāo)記dna的光點(diǎn)擊探針ctz-so3標(biāo)記細(xì)胞核酸圖(圖中uv表示350nm紫外光);其中圖a為ctz-so3標(biāo)記細(xì)胞dna的原理示意圖;圖b為ctz-so3標(biāo)記細(xì)胞dna的共聚焦顯微成像圖。

圖7是實(shí)施例6中驗(yàn)證活細(xì)胞內(nèi)胞內(nèi)熒光響應(yīng)標(biāo)記dna的光點(diǎn)擊探針ctz-so3具有細(xì)胞核靶向性的共聚焦顯微成像圖。

具體實(shí)施方式

下面結(jié)合實(shí)施例及附圖對(duì)本發(fā)明作進(jìn)一步詳細(xì)的描述,但本發(fā)明的實(shí)施方式不限于此。

1、實(shí)施例中所涉及的化學(xué)試劑均由阿拉丁購(gòu)買(mǎi);所涉及的dna產(chǎn)品和dmem細(xì)胞培養(yǎng)液均購(gòu)自生工生物工程(上海)股份有限公司;細(xì)胞來(lái)源于atcc細(xì)胞庫(kù);3k超濾管購(gòu)自頗爾公司;熒光光譜儀(ls55),紫外吸收光譜儀(lambada35;perkinelmer,beaconsweld,bucks,uk);激光共聚焦掃描顯微鏡(lsm510/con-focor2,carl-zeiss,jena,germany)。

2、實(shí)施例中4-甲基((2-(苯磺酰)亞肼基)甲基)苯甲酸鹽的合成參考:li,z.,qian,l.,li,l.,bernhammer,j.c.,huynh,h.v.,lee,j.s.,&yao,s.q.(2016).angewandtechemieinternationaledition,55(6),2002-2006。

實(shí)施例1一系列種基于光點(diǎn)擊反應(yīng)且具有熒光響應(yīng)的dna探針的制備

(1)將香豆素衍生物1′(1mmol)加入6ml的乙醇/水(etoh/h2o,體積比1:1)中然后加入1ml濃度為37%(v/v)的濃鹽酸攪拌,并在5℃的條件下慢慢加入到1.5mlnano2(1mmol)的水溶液中并攪拌;然后在-15℃的條件下將這些混合物逐滴的滴加到4-甲基((2-(苯磺酰)亞肼基)甲基)苯甲酸鹽((e)-methyl4-((2-(phenylsulfonyl)hydrazono)methyl)benzoate,0.9mmol)的干燥吡啶(8ml)中恢復(fù)室溫?cái)嚢柽^(guò)夜,反應(yīng)完全后,反應(yīng)混合物用dcm(二氯甲烷)萃取,減壓蒸餾,然后用硅膠柱進(jìn)一步提純(洗脫劑為甲醇:二氯甲烷、體積比1:5;硅膠柱規(guī)格為300目),得到純品產(chǎn)物(香豆素四唑化合物1),如圖1所示;

(2)參考上述制備方法,分別用香豆素衍生物2′~7′替換上述香豆素衍生物1′,得到香豆素四唑化合物2~7(如圖1所示);

上述香豆素衍生物1′~7′的結(jié)構(gòu)式如下所示:

產(chǎn)率及表征數(shù)據(jù):

1:yield:52%.1hnmr(400mhz,cdcl3):δ=8.35(m,2h),8.23(m,4h),7.81(m,1h),6.39(d,j=1.0hz,1h),3.96(s,3h),2.50(d,j=1.5hz,3h);

2:yield:50%.1hnmr(400mhz,cdcl3):δ=8.37(d,j=4.0hz,2h),8.30(d,j=8.0hz,2h),8.24(d,j=8.0hz,2h),7.98(d,j=8.0hz,1h),6.92(s,1h),3.98(s,3h);ms(esi)calcdforc19h11f3n4o4,416.32[m+],found417.04.

3:yield:48%.1hnmr(400mhz,dmso-d6):δ=8.34(d,j=8.0hz,2h),8.22(d,j=8.0hz,2h),8.17(s,1h),8.01(d,j=4.0hz,1h),7.94(d,j=4.0hz,1h),6.64(s,1h),4.16(m,j=4.0hz,2h),4.06(s,2h),3.92(s,3h),1.22(t,j=6.0hz,3h);ms(esi)calcdforc22h18n4o6,434.40[m+],found434.60.

4:yield:45%.1hnmr(400mhz,cdcl3):δ=8.36(d,j=8.0hz,2h),8.22(d,j=4.0hz,3h),8.16(d,j=4.0hz,1h),7.87(d,j=8.0hz,1h),7.39(d,j=8.0hz,2h),7.34(d,j=8.0hz,1h),7.27(d,j=8.0hz,2h),6.24(s,1h),4.18(s,2h),3.97(s,3h);ms(esi)calcdforc25h18n4o4,438.44[m+],found439.10.

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(2)ctz-so3的制備

將上述得到的香豆素四唑化合物1(362mg,1.0mmol)與氫氧化鋰(840mg,20.0mmol)在四氫呋喃、甲醇和水的混合液(體積比2:1:1)中加熱攪拌反應(yīng),反應(yīng)終止后調(diào)節(jié)溶液的ph值至出現(xiàn)紫色沉淀;得到中間體8;稱(chēng)取中間體8(240mg,0.69mmol)放入25ml單頸燒瓶中,加入4ml的dmf(二甲基甲酰胺)使攪拌其溶解,得到中間體8溶液;稱(chēng)取nhs(208mg,1.38mmol)和edc(264mg,1.38mmol)放入25ml單頸燒瓶中,加入3mldmf攪拌使其溶解,得到nhs(n-羥基丁二酰亞胺)/edc(1-(3-二甲氨基丙基)-3-乙基碳二亞胺鹽酸鹽)溶液;將中間體8溶液緩慢地滴入到nhs/edc溶液中,攪拌過(guò)夜(12h),tlc(薄層色譜)跟蹤檢測(cè)反應(yīng);反應(yīng)完全后,向反應(yīng)液中加入飽和食鹽水,沉淀析出;過(guò)濾收集沉淀,用水沖洗沉淀;將沉淀烘干,得到四唑化合物9。

將四唑化合物9(200mg,0.45mmol)和三乙胺(125μl,0.9mmol)加入到含有三乙胺的dcm(二氯甲烷)/dmso(二甲基亞砜)體積比為5:1的溶液中,然后再加牛磺酸(112.5mg,0.9mmol)的水溶液2ml,氮?dú)獗Wo(hù)進(jìn)行反應(yīng)。反應(yīng)完全后減壓蒸餾,加甲醇稀釋沉淀過(guò)濾后,濾液用0.5m氫氧化鈉的甲醇溶液調(diào)至中性,然后加乙醚,過(guò)濾沉淀得到183mgctz-so3(結(jié)構(gòu)式如式iii所示),產(chǎn)率78%,即為具有細(xì)胞核靶向性熒光響應(yīng)的dna探針。

其中,r為甲基。

數(shù)據(jù)表征:1hnmr(400mhz,dmso-d6):δ=8.70(t,j=4.0hz,1h),8.28(d,j=8.0hz,2h),8.17(t,j=4.0hz,2h),8.09(d,j=8.0hz,1h),8.02(d,j=8.0hz,2h),6.56(s,1h),3.55(t,j=4.0hz,2h),2.71(t,j=4.0hz,2h),2.48(s,3h);ms(esi)calcdforc20h16n5o6s,454.08[m-],found453.94.

(3)ctz-el的制備

將三乙胺(138μl,1.0mmol)加入10ml的二氯甲烷中,然后加入上述制得的四唑化合物9(45mg,0.1mmol),然后加入乙胺(65μl,1.0mmol),混合物在氮?dú)獗Wo(hù)下攪拌1小時(shí),反應(yīng)完后減壓蒸餾,然后經(jīng)過(guò)硅膠柱提純得最終產(chǎn)物ctz-el,其結(jié)構(gòu)式如式iv所示:

其中,r為甲基。

數(shù)據(jù)表征:1hnmr(400mhz,cdcl3):δ=8.33(d,j=4.0hz,2h),8.19(d,j=4.0hz,2h),7.93(t,j=4.0hz,2h),7.81(d,j=8.0hz,1h),6.40(s,1h),6.23(s,1h),3.53(m,2h),2.52(s,3h),1.29(t,j=4.0hz,3h);ms(esi)calcdforc20h17n5o3,375.13,[m+h+],found376.15.

實(shí)施例2:香豆素四唑1-7和標(biāo)記dna產(chǎn)物的光動(dòng)力學(xué)特性

將實(shí)施例1中得到的香豆素四唑化合物1-7分別與修飾烯烴的dna結(jié)構(gòu)如式iii反應(yīng),香豆素四唑化合物1-7的濃度是100μm,修飾烯烴的dna的濃度是10μm,在350nm紫外燈下照射10分鐘,反應(yīng)完后用超濾管提純產(chǎn)物。測(cè)7種反應(yīng)產(chǎn)物的熒光并計(jì)算反應(yīng)產(chǎn)物的熒光量子產(chǎn)率,結(jié)果見(jiàn)表1。圖2是實(shí)施例1中計(jì)算的香豆素衍生物的ehomo(最高占據(jù)分子軌道能量值,根據(jù)wb97xd/6-311+g(d,p)方法計(jì)算,)和熒光量子產(chǎn)率關(guān)系圖。從表1和圖2中反應(yīng)前除香豆素四唑2外其它香豆素四唑幾乎沒(méi)有熒光,光點(diǎn)擊反應(yīng)后可以產(chǎn)生明顯熒光響應(yīng)。從表2中可以看出在計(jì)算的香豆素的ehomo值在-0.324hartree以下時(shí)香豆素的熒光可以被四氮唑淬滅,隨著香豆素的ehomo值逐漸降低,標(biāo)記核酸產(chǎn)物的熒光量子產(chǎn)率會(huì)逐漸升高從0.129升至0.389,同時(shí)香豆素四唑化合物的熒光量子產(chǎn)率也會(huì)有所增加。

表1四唑化合物1-7和標(biāo)記dna產(chǎn)物的光學(xué)特性

實(shí)施例3:香豆素四唑標(biāo)記核酸后發(fā)光原理的探究

取香豆素四唑1作為實(shí)施案例中的樣品,將其活化后的四唑化合物9(方法同實(shí)施例1),取一管5’端氨基標(biāo)記的核酸序列離心(12000rpm,20min);將離心管蓋打開(kāi),快速加入55μl0.1m硼酸鈉緩沖液(ph8.0)迅速蓋上管蓋;在漩渦儀上充分振蕩10min;加入30μl50mm的四唑化合物9(提前用二甲基亞砜配置成50mm的溶液);將離心管纏上錫箔紙,放在離心管加上振蕩孵育14小時(shí);往離心管中加入1ml預(yù)冷訂的無(wú)水乙醇,上下振蕩1min;然后放入超低溫冰箱靜置2小時(shí);4℃、12000rpm離心20min;吸去上層澄清溶液,加入1ml預(yù)冷1ml預(yù)冷訂的無(wú)水乙醇,上下振蕩1min;然后放入超低溫冰箱靜置2小時(shí);4℃、12000rpm離心20min;吸去上層澄清溶液,靜置30min,加55μl無(wú)菌水,充分振蕩5min;12000rpm離心10min;吸去上層澄清溶液放入離心管中-20℃保存,得到香豆素四唑修飾的核酸,結(jié)構(gòu)式如式vi所示;然后將香豆素四唑修飾的核酸分別與異丙基丙烯酰胺和n-(2-羥乙基)馬來(lái)酰亞胺在ph7.5的磷酸鹽緩沖液中在350nm紫外光下照射10分鐘,反應(yīng)后用超濾管提純,然后用熒光光譜儀測(cè)熒光,實(shí)驗(yàn)結(jié)果圖3a所示,從圖中可以看出,香豆素四唑修飾的核酸與異丙基丙烯酰胺反應(yīng)后產(chǎn)生熒光在490nm,n-(2-羥乙基)馬來(lái)酰亞胺反應(yīng)產(chǎn)物熒光在450nm,這些發(fā)現(xiàn)表明反應(yīng)產(chǎn)物的淬滅效應(yīng)可能是由于烯烴化合物的光誘導(dǎo)的電子轉(zhuǎn)移。為了驗(yàn)證這個(gè)觀(guān)點(diǎn)將香豆素四唑修飾的核酸與n,n-二甲基乙基丙烯酰胺在350nm的紫外光下分別在ph5.5~7.5的磷酸鹽緩沖液中反應(yīng),反應(yīng)后用超濾管提純,然后用熒光光譜儀測(cè)測(cè)熒光。實(shí)驗(yàn)結(jié)果如圖3b所示,從圖中可已看出隨著ph從5.5增加到7.5,在490nm處的熒光逐漸減弱并在450nm處出現(xiàn)一個(gè)新的發(fā)射峰。這些實(shí)驗(yàn)結(jié)果近一步證明帶有香豆素的四唑化合物的環(huán)化加成反應(yīng)產(chǎn)物的發(fā)射峰在450nm和490nm分別來(lái)自于香豆素和吡唑啉部分。更重要的是基于這些發(fā)現(xiàn)我們可以預(yù)測(cè)以及監(jiān)測(cè)一些烯烴化合物和帶香豆素四唑化合物反應(yīng)產(chǎn)物的發(fā)射峰。

實(shí)施例4:光點(diǎn)擊反應(yīng)速率的測(cè)定

5μm的vdu(5-乙烯基-2’-脫氧尿苷)分別和25μm、50μm的四唑化合物ctz-so3(實(shí)施例1制得)在350nm紫外燈下分別照射1分鐘、5分鐘、10分鐘、20分鐘后,用高效液相色譜(hplc)檢測(cè)反應(yīng)產(chǎn)物,并計(jì)算反應(yīng)產(chǎn)率,再通過(guò)公式計(jì)算反應(yīng)速度,其中,

公式是;ln(vdu/(vdu-[product]t))=kobserved*t;kobserved=kcycloaddition*[ctz-so3]

式中:product表示產(chǎn)物濃度;kobserved表示實(shí)驗(yàn)中觀(guān)察到的反應(yīng)速率;kcycloaddition表示實(shí)際點(diǎn)擊反應(yīng)速率;t表示時(shí)間;vdu表示vdu的濃度;ctz-so3表示ctz-so3的濃度。

實(shí)驗(yàn)結(jié)果如圖4所示,圖4是具有細(xì)胞核靶向的四唑香豆素和vdu光點(diǎn)擊反應(yīng)后的熒光和吸收?qǐng)D;從圖4a中可以看出光照后450nm處熒光明顯增強(qiáng),圖4b中光照后330nm處吸收降低395nm處吸收增強(qiáng),表明產(chǎn)物生成。

光點(diǎn)擊反應(yīng)符合準(zhǔn)一階反應(yīng),在vdu相同濃度,四唑化合物不同濃度的條件下用350nm紫外燈照射不同的時(shí)間,然后用高效液相色譜(hplc)分析生成產(chǎn)物的濃度及產(chǎn)率,實(shí)驗(yàn)結(jié)果如表2所示,表2表示反應(yīng)產(chǎn)物和時(shí)間的關(guān)系,從表2中可以看出隨著光照時(shí)間的增加生成的產(chǎn)物不斷增加,并且香豆素四唑濃度大的組產(chǎn)物生成的速度比濃度小的組要快。數(shù)據(jù)分析如圖5所示,圖5是表中的數(shù)據(jù)分析后線(xiàn)性擬合的結(jié)果,通過(guò)公式計(jì)算光點(diǎn)擊反應(yīng)速率為k(5.0equiv.)=14.8m-1s-1;k(10equiv.)=19.8m-1s-1,相比反電子需求的diels-alde的vdu和四唑化合物連接反應(yīng)的速率(0.02m-1s-1)明顯增加。

擬合的線(xiàn)性部分的結(jié)果:kobserved,5.0eq=3.71205e-4;kobserved,10eq=9.89344e-4.

根據(jù)公式計(jì)算的反應(yīng)速度是:k(5.0equiv.)=14.8m-1s-1;k(10equiv.)=19.8m-1s-1.

實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明本文中光點(diǎn)擊速率最快可達(dá)到20m-1s-1,表明可以通過(guò)光點(diǎn)擊反應(yīng)可以快速的代謝標(biāo)記細(xì)胞內(nèi)的dna,這種光誘導(dǎo)的生物正交反應(yīng)區(qū)別于其他正交反應(yīng)的優(yōu)勢(shì)是可以快速追蹤細(xì)胞內(nèi)dna或rna的合成和轉(zhuǎn)錄過(guò)程。

表2光點(diǎn)擊反應(yīng)速率條件

實(shí)施例5細(xì)胞內(nèi)代謝標(biāo)記dna

(一)活細(xì)胞內(nèi)的核酸代謝標(biāo)記

將a549細(xì)胞傳代到培養(yǎng)皿中培養(yǎng)貼壁后,實(shí)驗(yàn)組加入30μm的vdu,對(duì)照組加入同樣體積的pbs(ph7.4)培養(yǎng)16小時(shí),然后換成新的dmem培養(yǎng)液孵育4小時(shí)后都加入10μm的香豆素四唑ctz-so3(實(shí)施例1制得)孵育4小時(shí),然后加入新的dmem細(xì)胞培養(yǎng)液孵育2小時(shí)后,分別用350nm紫外光(uv)照射10分鐘后,激光共聚焦顯微鏡成像。

(二)固定細(xì)胞內(nèi)的核酸代謝標(biāo)記

將a549細(xì)胞傳代到培養(yǎng)皿中培養(yǎng)貼壁后,實(shí)驗(yàn)組加入30μm的vdu,對(duì)照組加入同樣體積的pbs(ph7.4)培養(yǎng)16小時(shí),然后換成新的dmem培養(yǎng)液孵育4小時(shí),棄掉培養(yǎng)液,用3.7%(v/v)多聚甲醛溶液固定細(xì)胞10分鐘后用0.2%(v/v)tritonx-100通透細(xì)胞,然后分別加入10μm的香豆素四唑ctz-so3避光孵育2小時(shí),用350nm紫外燈照射10分鐘,用激光共聚焦顯微鏡成像。

實(shí)驗(yàn)結(jié)果如實(shí)驗(yàn)圖6所示,從圖中可以看出活細(xì)胞中加vdu孵育的實(shí)驗(yàn)組產(chǎn)生明顯的熒光信號(hào),沒(méi)有加vdu孵育的對(duì)照組中的熒光非常微弱。固定細(xì)胞中加vdu孵育的實(shí)驗(yàn)組產(chǎn)生明顯的熒光信號(hào),活細(xì)胞標(biāo)記和固定細(xì)胞標(biāo)記結(jié)果無(wú)明顯差別,并且重要的是在活細(xì)胞標(biāo)記dna實(shí)驗(yàn)過(guò)程是在免洗的條件下,不需要使dna變性。該實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明我們成功的在活細(xì)胞中基于光點(diǎn)擊反應(yīng)熒光響應(yīng)的標(biāo)記細(xì)胞dna。

實(shí)施例6探針具有細(xì)胞核靶向性

香豆素四唑ctz-so3具有細(xì)胞核靶向性的驗(yàn)證:

將a549細(xì)胞傳代到培養(yǎng)皿中培養(yǎng)貼壁后,實(shí)驗(yàn)組加入100μm的香豆素四唑ctz-so3,對(duì)照組加入100μm的香豆素四唑ctz-el(實(shí)施例1制得),孵育過(guò)夜,再加入新的培養(yǎng)液孵育2h后,分別用350nm紫外光照射10分鐘后,激光共聚焦顯微鏡成像。實(shí)驗(yàn)結(jié)果如圖7所示,從圖中可以看出實(shí)驗(yàn)組熒光部位主要集中在細(xì)胞核,而加入ctz-el的對(duì)照組的熒光部位主要集中在細(xì)胞質(zhì),該實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明帶陰離子的香豆素四唑ctz-so3具有良好的細(xì)胞核靶向性。

上述實(shí)施例為本發(fā)明較佳的實(shí)施方式,但本發(fā)明的實(shí)施方式并不受上述實(shí)施例的限制,其他的任何未背離本發(fā)明的精神實(shí)質(zhì)與原理下所作的改變、修飾、替代、組合、簡(jiǎn)化,均應(yīng)為等效的置換方式,都包含在本發(fā)明的保護(hù)范圍之內(nèi)。

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