本發(fā)明涉及一種具有很好的抗酶解穩(wěn)定性的含D型非天然抗菌肽類似物,本發(fā)明同時還涉及該含D型非天然抗菌肽類似物的和成功及其在制備抗菌藥物的應(yīng)用,屬于生物化學(xué)技術(shù)領(lǐng)域。
背景技術(shù):
近年來,濫用抗生素產(chǎn)生的耐藥性問題日益嚴重,對人類疾病造成了巨大的威脅。尋找新的可替代抗生素的新藥迫在眉睫??咕模ˋntimicrobial peptides),是生物體經(jīng)誘導(dǎo)產(chǎn)生的一類具有抗菌活性的小分子多肽,來源廣泛,其分子量小,大約在 3~6 kD 之間,有耐熱、 耐酸性強,水溶性好,快速的殺菌能力等特點(Hancock REW, Scott MG. Proc Natl AcadSci USA,2000,97(16):8856~ 8861)??咕牡目咕鷻C制不同于普通抗生素,抗菌機制一般包括①快速破壞菌膜,使菌體內(nèi)容物泄露,細菌死亡②抗菌肽與細菌細胞內(nèi)容物(如DNA或RNA)作用,干擾細菌細胞正常的合成和代謝,導(dǎo)致菌體死亡(劉立偉,鄧磊. 抗菌肽作用機制研究進展[J].河北化工,2012,35(7):13-15)。所以,抗菌肽不易誘導(dǎo)耐藥性的產(chǎn)生,使其成為生物醫(yī)藥領(lǐng)域的熱門研究內(nèi)容。
但是天然抗菌肽也存在一些弊端,比如:酶解穩(wěn)定性差,生物利用度低;選擇性不強,對哺乳動物細胞會產(chǎn)生破壞作用等,都會限制天然抗菌肽的進一步發(fā)展。因此,對天然抗菌肽進行改造成為研究的熱點,其中非天然的D型氨基酸的引入常被作為一種常用的手段,優(yōu)化抗菌肽,以提高耐受酶降解的能力(Di Grazia A, Cappiello F, Cohen H.et.al.D-Amino acids incorporation in the frog skin-derived peptide esculentin-1a(1-21)NH2 is beneficial for its multiple functions[J].Amino Acids,2015,47(12):2505-19.)。
技術(shù)實現(xiàn)要素:
本發(fā)明的目的是提供一種含D型非天然氨基酸的抗菌肽類似物;
本發(fā)明的另一目的是提供上述含D型非天然氨基酸的抗菌肽類似物的合成方法;
本發(fā)明的還有一個目的,就是提供上述含D型非天然氨基酸的抗菌肽類似物在制備抗菌藥物中的應(yīng)用。
一、含D型非天然氨基酸的抗菌肽類似物的設(shè)計
本發(fā)明含D型非天然氨基酸的抗菌肽類似物,是在抗菌肽Anoplin的親水面、疏水面分別引入D型非天然氨基酸,對天然抗菌肽Anoplin進行修飾而得。
在抗菌肽Anoplin的疏水面引入的D型氨基酸為D型Leu,引入位點分別為9和10位,命名為Anoplin-D9,10;其結(jié)構(gòu)式為: GLLKRIKTLL-NH2。
在抗菌肽Anoplin的疏水面引入的D型氨基酸為D型Leu,引入位點分別為9,10和3位,命名為Anoplin-D9,10,3;其結(jié)構(gòu)式為:GLLKRIKTLL-NH2。
在抗菌肽Anoplin的親水面引入的D型氨基酸為D型Lys,引入位點分別為4和7位,命名為Anoplin-D4,7;其結(jié)構(gòu)式為: GLLKRIKTLL-NH2。
在抗菌肽Anoplin的親水面引入的D型氨基酸為D型Arg和D型Lys,引入位點分別為5和7位,命名為Anoplin-D5,7;其結(jié)構(gòu)式為:GLLKRIKTLL-NH2 。
二、含D型非天然氨基酸的抗菌肽類似物的合成
以Rink-MBHA Resin 為起始原料, 采用Fmoc固相合成方法,按照設(shè)計的替換位點在天然抗菌肽Anoplin的相應(yīng)位置引入非天然D型氨基酸,然后按序列延長肽鏈即得。
在天然抗菌肽Anoplin的親水面引入的D型非天然型氨基酸為D型Arg或/和D型Lys:在天然抗菌肽Anoplin的疏水面引入的D型非天然氨基酸 為D型Leu。
三、含D型氨基酸抗菌肽類似物的體外抑菌實驗
1. 對標準菌株的抑菌實驗
采用常見的二倍稀釋法測定藥物的最小抑菌濃度,即MIC值。結(jié)果重復(fù)三次以上的、平行實驗。結(jié)果見表1:
2. 酶解穩(wěn)定性試驗
具體方法: 將胰蛋白酶或糜蛋白酶配成一系列濃度 2000,200,20,2, 0.2, 0.02μg/ml。將抗菌肽Anoplin; Anoplin-D9,10;Anoplin-D9,10,3;Anoplin-D4,7; Anoplin-D5,7 用PBS配成相應(yīng)濃度,將母液與不同濃度的胰酶孵育(1:4, v/v),不含胰酶的PBS做對照,孵育物37℃孵育6小時,隨后,取出60℃烘箱滅活10min, 后用MH肉湯稀釋到2×MIC,加入96孔板中,每孔100μl,設(shè)定3個復(fù)孔,然后加菌,每孔加菌100μl, 37℃孵育過夜,隨后酶標儀測定OD600nm, 根據(jù)給藥組的OD值比陰性組的OD值作為細菌存活率。
圖1為耐受胰酶6小時穩(wěn)定性試驗結(jié)果??梢钥闯?,Anoplin-D5,7和Anoplin-D4,7 耐受胰酶降解的能力顯著提高,跟母肽Anoplin相比,耐受胰酶分別提高104和105倍。
圖2 為耐受糜蛋白酶6小時穩(wěn)定性試驗結(jié)果??梢钥闯?,四條D型類似物耐受糜蛋白酶的能力較母肽Anoplin顯著提高,Anoplin-D5,7和Anoplin-D4,7 耐受糜蛋白酶降解的能力提高100倍,Anoplin-D9,10和Anoplin-D9,10,3 耐受糜蛋白酶降解的能力提高10倍。
3. RP-HPLC降解率曲線
抗菌肽Anoplin,與其D型類似物D-4,7; D-5,7 與200 μg/ml的胰酶37攝氏度孵育,在不同時間段,吸取孵育液,進行RP-HPLC分析,繪制降解率-時間曲線(圖3)??梢钥闯觯鸽腁noplin在120min時間內(nèi)就被完全快速100%降解,而類似物D-5,7和D-4,7 降解率顯著降低,在共孵育24小時(1440min),降解率僅為20%左右。
抗菌肽Anoplin,與其D型類似物D-4,7; D-5,7 與20μg/ml的糜蛋白酶37攝氏度孵育,在不同時間段,吸取孵育液,進行RP-HPLC分析,繪制降解率-時間曲線(圖4)。可以看出,母肽Anoplin在300min時間內(nèi)就被完全快速100%降解,而類似物D-5,7和D-4,7 降解率顯著降低,在共孵育24小時(1440min),降解率僅為20%和15%左右。
抗菌肽Anoplin,與其D型類似物D-9,10; D-9,10,3與2μg/ml的糜蛋白酶37攝氏度孵育,在不同時間段,吸取孵育液,進行RP-HPLC分析,繪制降解率-時間曲線(圖5)??梢钥闯觯谙嗤瑫r間間隔,母肽Anoplin的降解率均高于類似物D-9,10和D-9,10,3。
4. 抑制生物膜形成試驗
孵育方法:將標準銅綠假單孢菌分別用胰蛋白胨大豆肉湯含0.5%葡萄糖(TSBG)培養(yǎng)到中間對數(shù)期,最終用TSBG稀釋到5×105 CFU/ml. 將其加到96孔板中,每孔20 μl, 然后將抗菌肽按二倍稀釋的方法,使其濃度分別是2×MIC,1×MIC, 0.5×MIC, 0.25×MIC, 0.125×MIC, 0.0625×MIC. 然后將藥物分別加到孔中,每個濃度6個平行,將共孵育物37℃孵育24小時。
處理方法:到時間后將平板取出,吸去上清液,加入PBS洗,每孔洗2遍,然后加無水甲醇固定生物膜,固定15min,然后吸去,空氣中晾干,然后每孔加入200μl ,0.1% 結(jié)晶紫染色15min, 染色后,將其吸去,用去離子水洗,每孔洗2遍,最后加入95%無水乙醇,釋放染料15min, 快速測定595nm處的吸光值。
生物膜形成率=(OD給藥組-OD陰性組)/OD陰性組
抑制生物膜形成率%= 1-生物膜的形成率
試驗結(jié)果見圖6。橫坐標是藥物濃度,縱坐標是抑制銅綠假單胞菌生物膜形成率,發(fā)現(xiàn)生物膜抑制率呈現(xiàn)出劑量依賴性,母肽Anoplin和類似物D-9,10; D-9,10,3; D-4,7; D-5,7在高濃度2×MIC時,呈現(xiàn)出98%以上的抑膜形成率。在低濃度1×MIC時,母肽Anoplin 和類似物D-9,10; D-5,7抑膜形成率有所降低,但D-9,10,3仍然保留了很強的抑制率。在0.5×MIC時, 母肽Anoplin,D-4,7, D-5,7幾乎喪失了抑膜能力,抑制膜形成率低于10%。只有類似物D-9,10和D-9,10,3仍然可以抑制生物膜的形成,抑制率40%。在濃度低于0.5×MIC時,所有肽都不能表現(xiàn)出抑制生物膜形成的能力。
附圖說明
圖1為本發(fā)明含D型氨基酸抗菌肽類似物耐受胰酶6小時穩(wěn)定性試驗。
圖2為本發(fā)明含D型氨基酸抗菌肽類似物耐受糜蛋白酶6小時穩(wěn)定性。
圖3為Anoplin、D型類似物D-4,7、D-5,7 與200 μg/ml的胰酶37攝氏度孵育不同時間的RP-HPLC降解率曲線。
圖4為Anoplin、D型類似物D-4,7、D-5,7 與20 μg/ml的胰酶37攝氏度孵育不同時間的RP-HPLC分析。
圖5為Anoplin、D型類似物D-9,10、D-9,10,3與2μg/ml的糜蛋白酶37攝氏度孵育不同時間的RP-HPLC分析。
圖6為本發(fā)明含D型氨基酸抗菌肽類似物抑制生物膜形成試驗。
圖7為純肽Anoplin-D9,10的RP-HPLC分析譜圖。
圖8為純肽Anoplin-D9,10,3的RP-HPLC分析譜圖。
圖9為純肽Anoplin-D4,7的RP-HPLC分析譜圖。
圖10為純肽Anoplin-D5,7的RP-HPLC分析譜圖。
具體實施方式
下面通過具體實施例對本發(fā)明D型氨基酸抗菌肽類似物的結(jié)構(gòu)、合成作進一步說明。
實施例1、類似物Anoplin-D9,10的合成
稱取Rink-MBHA 樹脂,取代值為0.43mmol/g, 合肽量為0.15mmol,加入重蒸的二氯甲烷溶液,充分攪拌溶脹樹脂,時間為30min, 然后加入10%的六氫吡啶脫樹脂F(xiàn)moc保護,每次洗2min, 共洗4遍,然后用重蒸DMF溶液洗樹脂,同樣每次2min, 共洗4遍,最后使用茚檢指示劑(苯酚:氰化鉀吡啶:茚三酮=1:2:1)檢驗樹脂是否脫去Fmoc保護基團,沸水煮樹脂1min,立即觀察,樹脂顯藍色,則證明Fmoc基團已脫出,按合肽的序列,從C末端開始,稱取第一個氨基酸為d-Leu,1.5倍過量,加入HOBT (1倍過量),HBTU(1倍過量),待氨基酸溶解后,加入啟動劑DIEA (4倍過量)。上述氨基酸與樹脂共同攪拌反應(yīng),時間1h,反應(yīng)結(jié)束后,茚檢試劑檢驗,沸水煮樹脂1min, 樹脂變?yōu)闊o色,說明D型Leu氨基酸成功接上,如此重復(fù)操作,直至后續(xù)接完d-leu-Thr-Lys-Ile-Arg-Lys-Leu-Leu-Gly氨基酸序列。經(jīng)RP-HPLC制備純化,使用C18柱純化,洗脫條件為20%-60%乙腈,8ml/min。純肽Anoplin-D9,10的RP-HPLC分析譜圖見附圖說明7。
實施例2 類似物Anoplin-D9,10,3的合成
稱取Rink-MBHA 樹脂,取代值為0.43mmol/g, 合肽量為0.25mmol,加入重蒸的二氯甲烷溶液,充分攪拌溶脹樹脂,時間為30min, 然后加入15%的六氫吡啶脫樹脂F(xiàn)moc保護,每次洗2min, 共洗4遍,然后用重蒸DMF溶液洗樹脂,同樣每次2min, 共洗4遍,然后茚檢指示劑(苯酚:氰化鉀吡啶:茚三酮=1:2:1)檢驗,樹脂顯藍色,證明樹脂上的Fmoc基團已脫出,按合肽的序列,從C末端開始,稱取第一個氨基酸d-Leu氨基酸,2倍過量,加入HOBT (3倍過量),HBTU(3倍過量),待氨基酸溶解后,加入啟動劑DIEA (6倍過量)。上述氨基酸與樹脂共同攪拌反應(yīng),時間1.5h,反應(yīng)結(jié)束后,茚檢試劑檢驗,樹脂變?yōu)闊o色,說明第一個氨基酸成功接上,如此重復(fù)操作,后續(xù)接完d-leu-Thr-Lys-Ile-Arg-Lys-d-Leu-Leu-Gly氨基酸序列。經(jīng)RP-HPLC制備純化,使用C18柱純化,洗脫條件為20%-60%乙腈,8ml/min。純肽Anoplin-D9,10,3的RP-HPLC分析譜圖見附圖說明8。
實施例3、類似物Anoplin-D4,7的合成
稱取Rink-MBHA 樹脂,取代值為0.43mmol/g, 合肽量為0.2mmol,加入重蒸的二氯甲烷溶液,充分攪拌溶脹樹脂,時間為30min, 然后加入15%的六氫吡啶脫樹脂F(xiàn)moc保護,每次洗2min, 共洗4遍,然后用重蒸DMF溶液洗樹脂,同樣每次2min, 共洗4遍,然后茚檢指示劑(苯酚:氰化鉀吡啶:茚三酮=1:2:1)檢驗,樹脂顯藍色,證明Fmoc基團已脫出,按合肽的序列,從C末端開始,稱取第一個氨基酸Leu,3倍過量,加入HOBT (5倍過量),HBTU(5倍過量),待氨基酸溶解后,加入啟動劑DIEA (6倍過量)。上述氨基酸與樹脂共同攪拌反應(yīng),時間1h,反應(yīng)結(jié)束后,茚三酮檢驗,若樹脂變?yōu)闊o色,說明氨基酸成功接上,如此重復(fù)操作,直至接完后面的序列l(wèi)eu-Thr-d-Lys-Ile-Arg-d-Lys-Leu-Leu-Gly。經(jīng)RP-HPLC制備純化,使用C18柱純化,洗脫條件為20%-60%乙腈,8ml/min。純肽Anoplin-D4,7的RP-HPLC分析譜圖見附圖說明9.
實施例4、類似物Anoplin-D5,7的合成
稱取Rink-MBHA 樹脂,取代值為0.43mmol/g, 合肽量為0.2mmol,加入重蒸的二氯甲烷溶液,充分攪拌溶脹樹脂,時間為30min, 然后加入15%的六氫吡啶脫樹脂F(xiàn)moc保護,每次洗2min, 共洗4遍,然后用重蒸DMF溶液洗樹脂,同樣每次2min, 共洗4遍,然后然后茚檢指示劑(苯酚:氰化鉀吡啶:茚三酮=1:2:1)檢驗,樹脂顯藍色,顯藍色,證明Fmoc基團已脫出,按合肽的序列,從C末端開始,稱取第一個氨基酸Leu,3.4倍過量,加入HOBT (6倍過量),HBTU(6倍過量),待氨基酸溶解后,加入啟動劑DIEA (8倍過量)。上述氨基酸與樹脂共同攪拌反應(yīng),時間2h,反應(yīng)結(jié)束后,茚檢指示劑檢驗,若樹脂變?yōu)闊o色,說明氨基酸成功接上,如此重復(fù)操作,直至按序列接完剩下的氨基酸leu-Thr-d-Lys-Ile-d-Arg- Lys-Leu-Leu-Gly。經(jīng)RP-HPLC制備純化,純肽Anoplin-D5,7的RP-HPLC分析譜圖見附圖說明10。