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加熱處理條件的推定裝置及其方法、核酸片段化系統(tǒng)及其方法與流程

文檔序號:11836903閱讀:來源:國知局

技術(shù)特征:

1.加熱處理條件的推定裝置,其是推定用于由加熱處理將含核酸和緩沖劑的樣品中的上述核酸片段化為期望的平均核苷酸長的加熱處理條件的裝置,

其具備:

接受選自加熱時間、加熱溫度、上述緩沖劑的種類及上述樣品的鹽濃度的1~3個加熱處理條件的信息和上述期望的平均核苷酸長的信息的輸入的輸入部,及

控制部,

上述控制部基于由上述輸入部接受輸入的上述信息,推定上述選自加熱時間、上述加熱溫度、上述緩沖劑的種類及上述樣品的鹽濃度的加熱處理條件。

2.權(quán)利要求1所述的裝置,其中上述輸入部還接受關(guān)于上述核酸的種類的信息的輸入。

3.權(quán)利要求1或2所述的裝置,其中上述輸入部還接受關(guān)于上述加熱處理前的核酸的核苷酸長的信息的輸入。

4.權(quán)利要求1~3之任一項所述的裝置,其中上述對應(yīng)關(guān)系信息含規(guī)定上述緩沖劑的種類、上述樣品的鹽濃度和上述加熱溫度或上述加熱時間的對應(yīng)關(guān)系的處理條件庫。

5.權(quán)利要求4所述的裝置,其中上述控制部基于由上述輸入部接受輸入的上述信息,從上述存儲部閱讀出上述處理條件庫,使用上述處理條件庫輸出關(guān)于上述由加熱處理的核酸的片段化的速度的常數(shù)。

6.權(quán)利要求4或5所述的裝置,其中上述控制部使用上述處理條件庫,輸出關(guān)于由上述加熱處理得到的核酸片段的最小核苷酸長的信息。

7.權(quán)利要求1~6之任一項所述的裝置,其還具備存儲規(guī)定上述期望的平均核苷酸長、上述加熱時間、上述加熱溫度、上述緩沖劑的種類及上述樣品的鹽濃度的相互間的對應(yīng)關(guān)系的對應(yīng)關(guān)系信息的存儲部,

上述控制部基于由上述輸入部接受輸入的上述信息和上述存儲部中存儲的對應(yīng)關(guān)系信息,推定上述選自加熱時間、上述加熱溫度、上述緩沖劑的種類及上述樣品的鹽濃度的加熱處理條件。

8.權(quán)利要求7所述的裝置,其中上述存儲部還存儲顯示上述期望的平均核苷酸長、最小核苷酸長、加熱處理前的核酸的核苷酸長、由加熱處理的核酸的片段化能、加熱溫度和加熱處理的開始溫度的相關(guān)關(guān)系的關(guān)系式。

9.權(quán)利要求8所述的裝置,其中上述關(guān)系式是以下式(I)所表示的式:

M=A+B×exp{-H(T-D)} (I)

式中,

M表示上述期望的平均核苷酸長、

A表示上述最小核苷酸長、

B表示上述加熱處理前的核酸的核苷酸長、

H表示上述由加熱處理的核酸的片段化能常數(shù)、

T表示上述加熱溫度、D表示上述加熱處理的開始溫度。

10.權(quán)利要求7所述的裝置,其中上述存儲部還存儲顯示上述期望的平均核苷酸長、最小核苷酸長、加熱處理前的核酸的核苷酸長、由加熱處理的核酸的片段化速度和加熱時間的相關(guān)關(guān)系的關(guān)系式。

11.權(quán)利要求10所述的裝置,其中上述關(guān)系式是以下式(II)所表示的式:

M=A+B×exp{-Kt} (II)

式中,

M表示上述期望的平均核苷酸長、

A表示上述最小核苷酸長、

B表示上述加熱處理前的核酸的核苷酸長、

K表示上述由加熱處理的核酸的片段化速度常數(shù)、

t表示上述加熱時間。

12.權(quán)利要求6~11之任一項所述的裝置,其中上述存儲部還存儲關(guān)于上述最小核苷酸長的信息。

13.權(quán)利要求12所述的裝置,其中上述最小核苷酸長是10~80核苷酸長。

14.權(quán)利要求1~13之任一項所述的裝置,其中上述加熱溫度是90~200℃。

15.權(quán)利要求1~14之任一項所述的裝置,其還具備由上述控制部輸出推定的加熱處理條件的輸出部。

16.權(quán)利要求15所述的裝置,其中上述控制部

基于關(guān)于上述緩沖劑的種類的信息、關(guān)于上述樣品的鹽濃度的信息和關(guān)于上述選自加熱時間及加熱溫度的條件的信息,將顯示上述所選的條件與由加熱處理得到的核酸片段的平均核苷酸長的對應(yīng)關(guān)系的信息輸出到上述輸出部,及

基于顯示上述對應(yīng)關(guān)系的信息,從由使用者輸入的關(guān)于上述期望的平均核苷酸長的信息,還推定得到有上述期望的平均核苷酸長的核酸片段的加熱處理條件。

17.核酸片段化系統(tǒng),

其是將核酸片段化為期望的平均核苷酸長的系統(tǒng),

其具備:

權(quán)利要求1~16之任一項所述的加熱處理條件的推定裝置,及

基于上述推定裝置中推定的加熱處理條件的信息,對含上述核酸的樣品加熱的加熱裝置。

18.加熱處理條件的推定方法,

其是推定用于由加熱處理將含核酸和緩沖劑的樣品中的上述核酸片段化為期望的平均核苷酸長的加熱處理條件的方法,

其包括基于選自加熱時間、加熱溫度、上述緩沖劑的種類及上述樣品的鹽濃度的1~3個加熱處理條件的信息,及上述期望的平均核苷酸長的信息,推定上述選自加熱時間、上述加熱溫度、上述緩沖劑的種類及上述樣品的鹽濃度的加熱處理條件的工序。

19.權(quán)利要求18所述的方法,其中在推定上述加熱處理條件時,還使用規(guī)定上述加熱時間、上述加熱溫度、上述緩沖劑的種類及上述樣品的鹽濃度的相互間的對應(yīng)關(guān)系的對應(yīng)關(guān)系信息。

20.核酸片段化方法,

其是由加熱處理將含核酸和緩沖劑的樣品中的上述核酸片段化為期望的平均核苷酸長的方法,

其基于由權(quán)利要求18或19所述的方法推定的加熱處理條件,加熱上述樣品而片段化為期望的平均核苷酸長。

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