1.一種治療個體的抑郁癥和/或MDD的方法,其包括對經鑒定為(i)COL26A1 rs4045陽性,(ii)CACNA1C變體陽性,(iii)CSMD1變體陽性,(iv)ZSCAN4變體陽性,(v)ZNF551變體陽性,(vi)COL26A1 rs4045陽性和CACNA1C變體陽性,(vii)COL26A1 rs4045、CACNA1C和CSMD1變體陽性,(viii)COL26A1 rs4045、CACNA1C、CSMD1和ZSCAN4變體陽性,(ix)COL26A1 rs4045、CACNA1C、CSMD1、ZSCAN4和ZNF551變體陽性,(x)COL26A1 rs4045、CACNA1C、CSMD1、ZSCAN4、DYM和基因間變體陽性,或(xi)COL26A1 rs4045、CACNA1C、CSMD1、ZSCAN4、DYM、LINC00348、FOXL2NB和基因間變體陽性的個體施用沃替西汀。
2.根據(jù)權利要求1所述的方法,其中所述個體罹患重性抑郁障礙(MDD)。
3.根據(jù)權利要求1所述的方法,其包括確定所述個體為COL26A1 rs4045純合的。
4.根據(jù)權利要求1所述的方法,其中所述個體為CACNA1C變體和/或所述CSMD1變體和/或所述ZSCAN4變體和/或所述ZNF551變體和/或所述DYM變體和/或所述LINC00348變體和/或所述FOXL2NB變體和/或所述基因間變體雜合的。
5.根據(jù)權利要求1所述的方法,其中所述個體為所述CACNA1C變體和/或所述CSMD1變體和/或所述ZSCAN4變體和/或所述ZNF551變體和/或所述DYM變體和/或所述LINC00348變體和/或所述FOXL2NB變體和/或所述基因間變體純合的。
6.根據(jù)權利要求1所述的方法,其中所述個體為COL26A1 rs4045、CACNA1C和CSMD1變體陽性的。
7.根據(jù)權利要求6所述的方法,其中所述CACN41C變體選自:rs7297992、rs7297582、rs2239042、rs3819532、rs2239079、rs2239080、kgp5074525、rs4765961、kgp1052923、kgp1390211、rs7311147、rs12312322、rs2108636、rs2238043、rs7295089、kgp3964892、rs10848664、kgp2586442、rs4765700、rs2238095、rs12312322、rs7972947、rs10848664、rs2370602及其組合。
8.根據(jù)權利要求6所述的方法,其中所述CACNA1C變體選自:rs7297582、rs2239042、rs7311147及其組合。
9.根據(jù)權利要求1所述的方法,其中所述個體具有rs4045、rs59420002、rs7297582、rs2239042和rs7311147變體。
10.根據(jù)權利要求1所述的方法,其中所述個體具有rs4045、rs59420002、rs7297582、rs2239042、rs7311147、rs12983596和rs9749513變體。
11.根據(jù)權利要求1所述的方法,其中所述個體具有rs4045、rs59420002、rs7297582、rs2239042、rs7311147、rs9304796、rs73064580、rs12983596、rs12984275、rs9749513、rs12609579、rs4239480、rs9676604和rs12162232變體。
12.根據(jù)權利要求9所述的方法,其中所述個體具有下列一者或多者:rs9304796、rs73064580、rs12983596、rs12984275、rs9749513、rs12609579、rs4239480、rs9676604、rs12162232、rs10417057、rs10403851、rs56066537、rs112783430、rs9749360和rs12162230。
13.根據(jù)權利要求1所述的方法,其中所述CSMD1變體為rs59420002。
14.根據(jù)權利要求1所述的方法,其中所述ZSCAN4變體選自:rs9304796、rs73064580、rs12983596、rs12984275、rs9749513、rs12609579、rs4239480、rs9676604、rs12162232、rs10417057、rs10403851、rs56066537、rs112783430、rs9749360及其組合。
15.根據(jù)權利要求14所述的方法,其中所述ZSCAN4變體為rs12983596和/或rs9749513。
16.根據(jù)權利要求1所述的方法,其中所述ZNF551變體為rs12162230。
17.一種確定罹患抑郁癥和/或MDD的個體在接受沃替西汀治療時將經歷增強的治療效果的可能性的方法,其包括:分析來自所述個體的生物樣品,以確定來自所述個體的核酸中是否存在COL26A1 rs4045和/或CACNA1C變體和/或CSMD1變體和/或ZSCAN4變體和/或ZNF551變體和/或DYM變體和/或LINC00348變體和/或FOXL2NB變體和/或基因間變體;以及當在所述樣品中檢測到所述COL26A1 rs4045和/或所述CACNA1C變體和/或所述CSMD1變體和/或所述ZSCAN4變體和/或所述ZNF551變體和/或所述DYM變體和/或所述LINC00348變體和/或所述FOXL2NB變體和/或所述基因間變體時,確定所述個體在接受沃替西汀治療時是否可能經歷增強的治療效果。
18.根據(jù)權利要求17所述的方法,其中所述個體具有重性抑郁障礙(MDD)的臨床診斷。
19.根據(jù)權利要求17所述的方法,其中所述CACNA1C序列變體選自:rs7297992、rs7297582、rs2239042、rs3819532、rs2239079、rs2239080、kgp5074525、rs4765961、kgp1052923、kgp1390211、rs7311147、rs12312322、rs2108636、rs2238043、rs7295089、kgp3964892、rs10848664、kgp2586442、rs4765700、rs2238095、rs12312322、rs7972947、rs10848664、rs2370602及其組合。
20.根據(jù)權利要求17所述的方法,其中所述CACNA1C序列變體選自:rs7297582、rs2239042、rs7311147及其組合。
21.根據(jù)權利要求17所述的方法,其中所述樣品選自:體液樣品、組織樣品、細胞和分離的核酸。
22.根據(jù)權利要求21所述的方法,其中所述分離的核酸包含DNA。
23.根據(jù)權利要求21所述的方法,其中所述分離的核酸包含RNA。
24.根據(jù)權利要求17所述的方法,其中所述分析包括將RNA逆轉錄產生cDNA。
25.根據(jù)權利要求17所述的方法,其包括檢測來自所述個體的核酸中COL26A1 rs4045和/或CACNA1C變體和/或CSMD1變體和/或ZSCAN4變體和/或ZNF551變體和/或DYM變體和/或LINC00348變體和/或FOXL2NB變體和/或基因間變體的存在。
26.根據(jù)權利要求17所述的方法,其包括確定所述個體為COL26A1 rs4045純合的。
27.根據(jù)權利要求26所述的方法,其包括確定所述個體為所述CACNA1C變體和/或所述CSMD1變體和/或所述ZSCAN4變體和/或所述ZNF551變體和/或所述DYM變體和/或所述LINC00348變體和/或所述FOXL2NB變體和/或所述基因間變體雜合的。
28.根據(jù)權利要求26所述的方法,其包括確定所述個體為所述CACNA1C變體和/或所述CSMD1變體和/或所述ZSCAN4變體和/或所述ZNF551變體和/或所述DYM變體和/或所述LINC00348變體和/或所述FOXL2NB變體和/或所述基因間變體純合的。
29.根據(jù)權利要求17所述的方法,其中所述CSMD1變體為rs59420002。
30.根據(jù)權利要求17所述的方法,其中所述ZSCAN4變體選自:rs9304796、rs73064580、rs12983596、rs12984275、rs9749513、rs12609579、rs4239480、rs9676604、rs12162232、rs10417057、rs10403851、rs56066537、rs112783430、rs9749360及其組合。
31.根據(jù)權利要求30所述的方法,其中所述ZSCAN4變體為rs12983596和/或rs9749513。
32.根據(jù)權利要求17所述的方法,其中所述ZNF551變體為rs12162230。
33.一種確定罹患抑郁癥和/或MDD的個體對沃替西汀的治療將產生有利反應的可能性的方法,其包括:分析來自所述個體的生物樣品,以確定來自所述個體的核酸中COL26A1 rs4045和/或CACNA1C變體和/或CSMD1變體和/或ZSCAN4變體和/或ZNF551變體和/或DYM變體和/或LINC00348變體和/或FOXL2NB變體和/或基因間變體的存在;以及當所述個體為COL26A1 rs4045純合的和/或具有CACNA1C變體和/或CSMD1變體和/或ZSCAN4變體和/或ZNF551變體和/或DYM變體和/或LINC00348變體和/或FOXL2NB變體和/或基因間變體時,則確定所述個體可能對沃替西汀的治療產生有利反應。
34.根據(jù)權利要求33所述的方法,其中所述個體具有重性抑郁障礙(MDD)的臨床診斷。
35.根據(jù)權利要求33所述的方法,其中所述CACNA1C序列變體選自:rs7297992、rs7297582、rs2239042、rs3819532、rs2239079、rs2239080、kgp5074525、rs4765961、kgp1052923、kgp1390211、rs7311147、rs12312322、rs2108636、rs2238043、rs7295089、kgp3964892、rs10848664、kgp2586442、rs4765700、rs2238095、rs12312322、rs7972947、rs10848664、rs2370602及其組合。
36.根據(jù)權利要求33所述的方法,其中所述CACNA1C序列變體選自:rs7297582、rs2239042、rs7311147及其組合。
37.根據(jù)權利要求33所述的方法,其中所述生物樣品選自:體液樣品、組織樣品、細胞和分離的核酸。
38.根據(jù)權利要求37所述的方法,其中所述分離的核酸包含DNA。
39.根據(jù)權利要求37所述的方法,其中所述分離的核酸包含RNA。
40.根據(jù)權利要求39所述的方法,其中所述分析包括將RNA逆轉錄產生cDNA。
41.根據(jù)權利要求33所述的方法,其中所述分析包括核酸測序。
42.根據(jù)權利要求33所述的方法,其包括確定所述個體為COL26A1 rs4045純合的。
43.根據(jù)權利要求42所述的方法,其包括確定所述個體為所述CACNA1C變體和/或所述CSMD1變體和/或所述ZSCAN4變體和/或所述ZNF551變體和/或所述DYM變體和/或所述LINC00348變體和/或所述FOXL2NB變體和/或所述基因間變體雜合的。
44.根據(jù)權利要求42所述的方法,其包括確定所述個體為所述CACNA1C變體和/或所述CSMD1變體和/或所述ZSCAN4變體和/或所述ZNF551變體和/或所述DYM變體和/或所述LINC00348變體和/或所述FOXL2NB變體和/或所述基因間變體純合的。
45.根據(jù)權利要求33所述的方法,其中所述CSMD1變體為rs59420002。
46.根據(jù)權利要求33所述的方法,其中所述ZSCAN4變體選自:rs9304796、rs73064580、rs12983596、rs12984275、rs9749513、rs12609579、rs4239480、rs9676604、rs12162232、rs10417057、rs10403851、rs56066537、rs112783430、rs9749360及其組合。
47.根據(jù)權利要求46所述的方法,其中所述ZSCAN4變體為rs12983596和/或rs9749513。
48.根據(jù)權利要求33所述的方法,其中所述ZNF551變體為rs12162230。
49.一種治療罹患抑郁癥和/或MDD的個體的認知損害的方法,其包括對經鑒定為(i)COL26A1 rs4045陽性,(ii)CACNA1C變體陽性,(iii)CSMD1變體陽性,(iv)ZSCAN4變體陽性,(v)ZNF551變體陽性,(vi)COL26A1 rs4045陽性和CACNA1C變體陽性,(vii)COL26A1 rs4045、CACNA1C和CSMD1變體陽性,(viii)COL26A1 rs4045、CACNA1C、CSMD1和ZSCAN4變體陽性,(ix)COL26A1 rs4045、CACNA1C、CSMD1、ZSCAN4和ZNF551變體陽性,(x)COL26A1rs4045、CACNA1C、CSMD1、ZSCAN4、DYM和基因間變體陽性,或(xi)COL26A1 rs4045、CACNA1C、CSMD1、ZSCAN4、DYM、LINC00348、FOXL2NB和基因間變體陽性的個體施用沃替西汀。
50.根據(jù)權利要求49所述的方法,其中所述個體還罹患重性抑郁障礙(MDD)。
51.根據(jù)權利要求49所述的方法,其中所述個體為COL26A1 rs4045純合的。
52.根據(jù)權利要求49所述的方法,其中所述個體為所述CACNA1C變體和/或所述CSMD1變體和/或所述ZSCAN4變體和/或所述ZNF551變體和/或所述DYM變體和/或所述LINC00348變體和/或所述FOXL2NB變體和/或所述基因間變體雜合的。
53.根據(jù)權利要求49所述的方法,其中所述個體為所述CACNA1C變體和/或所述CSMD1變體和/或所述ZSCAN4變體和/或所述ZNF551變體和/或所述DYM變體和/或所述LINC00348變體和/或所述FOXL2NB變體和/或所述基因間變體純合的。
54.根據(jù)權利要求49所述的方法,其中所述個體具有所述rs4045變體和/或CACNA1C變體和/或所述CSMD1變體和/或所述ZSCAN4變體和/或所述ZNF551變體。
55.根據(jù)權利要求49所述的方法,其中所述CACNA1C變體選自:rs7297992、rs7297582、rs2239042、rs3819532、rs2239079、rs2239080、kgp5074525、rs4765961、kgp1052923、kgp1390211、rs7311147、rs12312322、rs2108636、rs2238043、rs7295089、kgp3964892、rs10848664、kgp2586442、rs4765700、rs2238095、rs12312322、rs7972947、rs10848664、rs2370602及其組合。
56.根據(jù)權利要求49所述的方法,其中所述CSMD1變體為rs59420002。
57.根據(jù)權利要求49所述的方法,其中所述ZSCAN4變體選自:rs9304796、rs73064580、rs12983596、rs12984275、rs9749513、rs12609579、rs4239480、rs9676604、rs12162232、rs10417057、rs10403851、rs56066537、rs112783430、rs9749360及其組合。
58.根據(jù)權利要求57所述的方法,其中所述ZSCAN4變體為rs12983596和/或rs9749513。
59.根據(jù)權利要求49所述的方法,其中所述ZNF551變體為rs12162230。
60.一種確定罹患(a)認知損害和(b)抑郁癥和/或MDD的個體在接受沃替西汀治療時將經歷增強的治療效果的可能性的方法,其包括:分析來自所述個體的生物樣品,以確定來自所述個體的核酸中是否存在COL26A1 rs4045和/或CACNA1C變體和/或CSMD1變體和/或ZSCAN4變體和/或ZNF551變體和/或DYM變體和/或LINC00348變體和/或FOXL2NB變體和/或基因間變體;以及當在所述樣品中檢測到(i)COL26A1 rs4045,(ii)CACNA1C變體,(iii)CSMD1變體,(iv)ZSCAN4變體,(v)ZNF551變體,(vi)COL26A1 rs4045和CACNA1C變體,(vii)COL26A1 rs4045、CACNA1C和CSMD1變體,(viii)COL26A1 rs4045、CACNA1C、CSMD1和ZSCAN4變體,(ix)COL26A1 rs4045、CACNA1C、CSMD1、ZSCAN4和ZNF551變體,(x)COL26A1 rs4045、CACNA1C、CSMD1、ZSCAN4、DYM和基因間變體,或(xi)COL26A1 rs4045、CACNA1C、CSMD1、ZSCAN4、DYM、LINC00348、FOXL2NB和基因間變體時,則確定所述個體在接受沃替西汀治療時可能經歷增強的治療效果。
61.根據(jù)權利要求60所述的方法,其中所述個體具有重性抑郁障礙(MDD)的臨床診斷。
62.根據(jù)權利要求60所述的方法,其中所述CACNA1C序列變體選自:rs7297992、rs7297582、rs2239042、rs3819532、rs2239079、rs2239080、kgp5074525、rs4765961、kgp1052923、kgp1390211、rs7311147、rs12312322、rs2108636、rs2238043、rs7295089、kgp3964892、rs10848664、kgp2586442、rs4765700、rs2238095、rs12312322、rs7972947、rs10848664、rs2370602及其組合。
63.根據(jù)權利要求60所述的方法,其中所述CSMD1變體為rs59420002。
64.根據(jù)權利要求60所述的方法,其中所述ZSCAN4變體選自:rs9304796、rs73064580、rs12983596、rs12984275、rs9749513、rs12609579、rs4239480、rs9676604、rs12162232、rs10417057、rs10403851、rs56066537、rs112783430、rs9749360及其組合。
65.根據(jù)權利要求64所述的方法,其中所述ZSCAN4變體為rs12983596和/或rs9749513。
66.根據(jù)權利要求60所述的方法,其中所述ZNF551變體為rs12162230。
67.一種確定罹患(a)認知損害和(b)抑郁癥和/或MDD的個體對沃替西汀的治療將產生有利反應的可能性的方法,其包括:分析來自所述個體的生物樣品,以確定來自所述個體的核酸中COL26A1 rs4045和/或CACNA1C變體和/或CSMD1變體和/或ZSCAN4變體和/或ZNF551變體和/或DYM變體和/或LINC00348變體和/或FOXL2NB變體和/或基因間變體的存在;以及當所述個體為(i)COL26A1 rs4045陽性,(ii)CACNA1C變體陽性,(iii)CSMD1變體陽性,(iv)ZSCAN4變體陽性,(v)ZNF551變體陽性,(vi)COL26A1rs4045陽性和CACNA1C變體陽性,(vii)COL26A1rs4045、CACNA1C和CSMD1變體陽性,(viii)COL26A1rs4045、CACNA1C、CSMD1和ZSCAN4變體陽性,(ix)COL26A1rs4045、CACNA1C、CSMD1、ZSCAN4和ZNF551變體陽性,(x)COL26A1rs4045、CACNA1C、CSMD1、ZSCAN4、DYM和基因間變體陽性,或(xi)COL26A1rs4045、CACNA1C、CSMD1、ZSCAN4、DYM、LINC00348、FOXL2NB和基因間變體陽性時,則確定所述個體可能對沃替西汀的治療產生有利反應。
68.根據(jù)權利要求67所述的方法,其中所述個體具有重性抑郁障礙(MDD)的臨床診斷。
69.根據(jù)權利要求67所述的方法,其中所述CACNA1C序列變體選自:rs7297992、rs7297582、rs2239042、rs3819532、rs2239079、rs2239080、kgp5074525、rs4765961、kgp1052923、kgp1390211、rs7311147、rs12312322、rs2108636、rs2238043、rs7295089、kgp3964892、rs10848664、kgp2586442、rs4765700、rs2238095、rs12312322、rs7972947、rs10848664、rs2370602及其組合。
70.根據(jù)權利要求67所述的方法,還包括確定所述個體為所述CACNA1C變體和/或所述CSMD1變體和/或所述ZSCAN4變體和/或所述ZNF551變體和/或所述DYM變體和/或所述LINC00348變體和/或所述FOXL2NB變體和/或所述基因間變體雜合的。
71.根據(jù)權利要求67所述的方法,還包括確定所述個體為所述CACNA1C變體和/或所述CSMD1變體和/或所述ZSCAN4變體和/或所述ZNF551變體和/或所述DYM變體和/或所述LINC00348變體和/或所述FOXL2NB變體和/或所述基因間變體純合的。
72.根據(jù)權利要求67所述的方法,其中所述CSMD1變體為rs59420002。
73.根據(jù)權利要求67所述的方法,其中所述ZSCAN4變體選自:rs9304796、rs73064580、rs12983596、rs12984275、rs9749513、rs12609579、rs4239480、rs9676604、rs12162232、rs10417057、rs10403851、rs56066537、rs112783430、rs9749360及其組合。
74.根據(jù)權利要求73所述的方法,其中所述ZSCAN4變體為rs12983596和/或rs9749513。
75.根據(jù)權利要求67所述的方法,其中所述ZNF551變體為rs12162230。
76.根據(jù)權利要求50、61和68中任一項所述的方法,其中所述個體為COL26A1rs4045、CACNA1C、CSMD1和ZSCAN4變體陽性的。
77.根據(jù)權利要求1、17、33、49、60和67中任一項所述的方法,其中所述DYM變體為rs62104612。
78.根據(jù)權利要求1、17、33、49、60和67中任一項所述的方法,其中所述LINC00348變體為rs145136593。
79.根據(jù)權利要求1、17、33、49、60和67中任一項所述的方法,其中所述FOXL2NB變體為rs116191388。
80.根據(jù)權利要求1、17、33、49、60和67中任一項所述的方法,其中所述基因間變體選自:rs1998609、rs4142192及其組合。
81.一種試劑盒,其包含:(i)與獨立選自下列各者的遺傳變體特異性雜交的至少一對引物:rs4045、rs59420002、rs7297582、rs2239042和rs7311147,以及(ii)與所述遺傳變體雜交的以可檢測的方式標記的探針。
82.根據(jù)權利要求81所述的試劑盒,其中所述試劑盒包含:與rs4045特異性雜交的一對引物;與rs59420002特異性雜交的一對引物;與rs7297582特異性雜交的一對引物;與rs2239042特異性雜交的一對引物;以及與rs7311147特異性雜交的一對引物。
83.根據(jù)權利要求81所述的試劑盒,其中所述試劑盒還包含與獨立選自下列各者的遺傳變體特異性雜交的至少一對引物:rs7297992、rs7297582、rs2239042、rs3819532、rs2239079、rs2239080、kgp5074525、rs4765961、kgp1052923、kgp1390211、rs7311147、rs12312322、rs2108636、rs2238043、rs7295089、kgp3964892、rs10848664、kgp2586442、rs4765700、rs2238095、rs12312322、rs7972947、rs10848664和rs2370602。
84.根據(jù)權利要求81所述的試劑盒,其中所述試劑盒還包含與rs59420002特異性雜交的一對引物。
85.根據(jù)權利要求81所述的試劑盒,其中所述試劑盒還包含與獨立選自下列各者的遺傳變體特異性雜交的至少一對引物:rs9304796、rs73064580、rs12983596、rs12984275、rs9749513、rs12609579、rs4239480、rs9676604、rs12162232、rs10417057、rs10403851、rs56066537、rs112783430和rs9749360。
86.根據(jù)權利要求81所述的試劑盒,其中所述試劑盒還包含與rs12162230特異性雜交的一對引物。
87.根據(jù)權利要求81所述的試劑盒,其中所述試劑盒還包含與rs62104612特異性雜交的一對引物。
88.根據(jù)權利要求81所述的試劑盒,其中所述試劑盒還包含與rs145136593特異性雜交的一對引物。
89.根據(jù)權利要求81所述的試劑盒,其中所述試劑盒還包含與rs116191388特異性雜交的一對引物。
90.根據(jù)權利要求81所述的試劑盒,其中所述試劑盒還包含與獨立選自rs1998609和rs4142192的遺傳變體特異性雜交的至少一對引物。
91.根據(jù)權利要求81所述的試劑盒,其中所述試劑盒包含:與rs4045特異性雜交的一對引物;與rs59420002特異性雜交的一對引物;與rs7297582特異性雜交的一對引物;與rs2239042特異性雜交的一對引物;與rs7311147特異性雜交的一對引物;與rs12983596特異性雜交的一對引物;以及與rs9749513特異性雜交的一對引物。
92.根據(jù)權利要求81所述的試劑盒,其中所述試劑盒包含:與rs4045特異性雜交的一對引物;與rs59420002特異性雜交的一對引物;與rs7297582特異性雜交的一對引物;與rs2239042特異性雜交的一對引物;與rs7311147特異性雜交的一對引物;與rs12983596特異性雜交的一對引物;與rs9749513特異性雜交的一對引物;與rs62104612特異性雜交的一對引物;與rs1998609特異性雜交的一對引物;以及與rs4142192特異性雜交的一對引物。
93.根據(jù)權利要求81所述的試劑盒,其中所述試劑盒包含:與rs4045特異性雜交的一對引物;與rs59420002特異性雜交的一對引物;與rs7297582特異性雜交的一對引物;與rs2239042特異性雜交的一對引物;與rs7311147特異性雜交的一對引物;與rs12983596特異性雜交的一對引物;與rs9749513特異性雜交的一對引物;與rs62104612特異性雜交的一對引物;與rs1998609特異性雜交的一對引物;與rs145136593特異性雜交的一對引物;以及與rs116191388特異性雜交的一對引物。
94.根據(jù)權利要求81所述的試劑盒,其中所述試劑盒包含:與rs4045特異性雜交的一對引物;與rs59420002特異性雜交的一對引物;與rs7297582特異性雜交的一對引物;與rs2239042特異性雜交的一對引物;與rs7311147特異性雜交的一對引物;與rs9304796特異性雜交的一對引物;與73064580特異性雜交的一對引物;與rs12983596特異性雜交的一對引物;與rs12984275特異性雜交的一對引物;與rs9749513特異性雜交的一對引物;與rs12609579特異性雜交的一對引物;與rs4239480特異性雜交的一對引物;與rs9676604特異性雜交的一對引物;以及與rs12162232特異性雜交的一對引物。