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用于處理封閉容器中的樣品的系統(tǒng)和方法以及相關(guān)裝置的制作方法

文檔序號(hào):2332852閱讀:300來(lái)源:國(guó)知局

專利名稱::用于處理封閉容器中的樣品的系統(tǒng)和方法以及相關(guān)裝置的制作方法
技術(shù)領(lǐng)域
:本發(fā)明涉及樣品和材料的自動(dòng)處理,并且可以特別適用于在封閉環(huán)境中處理核酸。
背景技術(shù)
:基于核酸的擴(kuò)增反應(yīng)被廣泛用于研究和臨床試驗(yàn)室,以有助于疾病的診斷和/或測(cè)試樣品中致病生物的識(shí)別。這種擴(kuò)增反應(yīng)也可以用于疫苗的研發(fā),這樣的疫苗包括例如從病人自身的腫瘤細(xì)胞獲取的自體疫苗。從腫瘤組織隔離的核酸的擴(kuò)增甚至允許從小的腫瘤產(chǎn)生自體疫苗,并因此提供以最小腫瘤負(fù)擔(dān)處理病人的機(jī)會(huì)。才艮4居是否通過(guò)變'1"生溫度(denaturationtemperature)、引物退火溫度(primerannealingtemperature)和擴(kuò)增子(4亥酸的酵擴(kuò)增產(chǎn)物)合成溫度之間溫度的連續(xù)循環(huán)而驅(qū)動(dòng)酶的擴(kuò)增反應(yīng),或者是否溫度在整個(gè)酶的擴(kuò)增過(guò)程(等溫?cái)U(kuò)增)中保持恒定,通常聲明的,當(dāng)前已知的擴(kuò)增方案可被廣泛地分組為兩類。典型的循環(huán)核酸擴(kuò)增技術(shù)(熱循環(huán))是聚合酶鏈反應(yīng)(PCR),以及連接酶鏈反應(yīng)(LCR)。例如在ShortProtocolsinMiology,第2版,爿6b/ff/e/o^.W7zofJ/et/0(^s/>\9歷Cz/rre/t尸rotocoJ511/7i/o2ecw2arAWc^,(Eds.Ausubel等人,JohnWiley&Son,NewYork,1992)第15章中討論了用于這種反應(yīng)的具體協(xié)議。等溫反應(yīng)包括轉(zhuǎn)錄介導(dǎo)擴(kuò)增(TMA),基于核酸序列的擴(kuò)增(NASBA),以及鏈置換擴(kuò)增(SDA)。例如在美國(guó)專利4,683,195;4,683,202;5,130,238;4,876,187;5,030,557;5,399,491;5,409,818;5,485,184;5,409,818;5,554,517;5,437,990和5,554,516中討-論了核酸擴(kuò)增。熟知的是比如在這些專利中描述的那些方法允許不需要無(wú)性繁殖(cloning)的核酸的擴(kuò)增和檢測(cè),并且負(fù)責(zé)用于核酸序列的敏感試^r。然而,同樣認(rèn)識(shí)到,與核酸擴(kuò)增可能的檢測(cè)敏感度一起,小量的不想要的外生核酸序列的污染風(fēng)險(xiǎn)是極其大的。通過(guò)用以控制不想要的外生核酸和其它污染的引入的方法可以提高擴(kuò)增反應(yīng)的效用。具體地,對(duì)于生物樣品的處理,包括例如治療藥物(therapeuticagent)(如用于自體治療的疫苗)的制造,當(dāng)前的優(yōu)良制造標(biāo)準(zhǔn)(GMP)典型地需要在無(wú)菌環(huán)境制造。因此,在本領(lǐng)域中存在用以提供用于處理核酸和其它樣品的自動(dòng)化系統(tǒng)和方法的需要。
發(fā)明內(nèi)容本發(fā)明的實(shí)施例涉及一種用于一個(gè)或多個(gè)樣品的自動(dòng)處理的系統(tǒng),設(shè)備和方法。該系統(tǒng)可以用于操縱封閉環(huán)境中的項(xiàng)目,并且可以特別有用于藥物、診斷、生物工藝學(xué)、電子和納米工藝領(lǐng)域。本發(fā)明的實(shí)施例可以特別相關(guān)用于處理生物樣品,包括但不局限于組織、血液、血液制品、核酸(例如RNA,DNA)、蛋白質(zhì)、細(xì)胞培養(yǎng)等等。本發(fā)明的實(shí)施例提供用于操縱封閉容器中的一個(gè)或多個(gè)項(xiàng)目的設(shè)備。于此也被稱作"隔離容器"的容器包括限定內(nèi)部腔室的盤,其被布置成保持被操縱的任何數(shù)量的項(xiàng)目,以及柔性隔離物,被布置和尺寸化為覆蓋內(nèi)部區(qū)域和密封容器盤。用于操縱內(nèi)部區(qū)域中的項(xiàng)目的工具被附著至柔性隔離物,或與柔性隔離物集成,或^皮集成在柔性隔離物內(nèi)。該工具可以具有從被布置成附著至機(jī)器人裝置的隔離物的外側(cè)可訪問(wèn)的第一接口。該工具也包括可以從隔離物的相對(duì)側(cè)延伸的第二接口,以使用容器密封柔性隔離物時(shí)其被布置在內(nèi)部區(qū)域中。該工具可被布置成當(dāng)機(jī)器人裝置被附著至第一接口時(shí)操縱容器中的項(xiàng)目。在一些實(shí)施例中,封閉容器中的一個(gè)或多個(gè)項(xiàng)目例如包括核酸、其它樣品、試劑、清洗流體、吸管尖端、器皿、其它消耗品的任何一個(gè)和/或其組合。其它工具或裝置也可被布置在容器中,例如用于處理、操縱,測(cè)量,分析,采樣和/或存儲(chǔ)容器中的樣品或其它項(xiàng)目的工具或裝置。在一些實(shí)施例中,用于自動(dòng)處理核酸和其它樣品的系統(tǒng)和方法包括一次性使用的隔離容器組件,其具有盤和被布置成用盤密封的柔性隔離物,從而提供密封盤中的封閉工作區(qū)域。該封閉工作區(qū)域可以是無(wú)菌的。吸管頭和/或其它樣品操縱裝置可凈支附著至隔離物的內(nèi)部,并且該隔離物可以包括用于機(jī)器人臂或其它裝置的接口,該機(jī)器人臂或其它裝置被用于操縱密封工作區(qū)域中的項(xiàng)目。當(dāng)在盤上密封隔離物時(shí),該隔離物將盤的內(nèi)容與機(jī)器人或其它操縱裝置分開(kāi)。該隔離物是柔性的,并且允許機(jī)器人臂在盤的所有工作區(qū)域移動(dòng)吸管頭或其它樣品操縱裝置。在處理過(guò)程中,全部樣品、試劑、吸管尖端、其它消耗品和用于處理核酸樣品的工具或裝置可以保持在由隔離容器提供的封閉隔間中。在另一實(shí)施例中,處理核酸(例如RNA和/或DNA)的方法采用可任意處置(一次性使用)的隔離容器以減小對(duì)象材料被不期望的生物物質(zhì)(例如來(lái)自操作者、另一對(duì)象或外部環(huán)境)污染的風(fēng)險(xiǎn)。在一些實(shí)施例中,為了生物樣品的RNA分離而設(shè)計(jì)隔離容器,包括但不局限于下面的一個(gè)或多個(gè)腫瘤組織,血液,血液制品,細(xì)胞,病原體等等。在具體實(shí)施例中,生物樣品包括腫瘤勻漿,并且該系統(tǒng)提供用以轉(zhuǎn)換澄清的腫瘤勻漿成體外轉(zhuǎn)錄(IVT)RNA的全部特征和功能性。典型地,僅隔離容器的內(nèi)部被暴露至對(duì)象材料,從而避免處理系統(tǒng)的可能污染,并且減小由系統(tǒng)處理的連續(xù)對(duì)象樣品之間的清潔需要。在一些實(shí)施例中,處理系統(tǒng)一次處理一個(gè)隔離容器中的樣品。在其它實(shí)施例中,該系統(tǒng)可被布置成基本上同步地處理兩個(gè)或多個(gè)隔離容器中的樣口口o在一些實(shí)施例中,本發(fā)明提供一種用于流體轉(zhuǎn)移的設(shè)備,該用于流體轉(zhuǎn)移的設(shè)備包括工作流體和通過(guò)隔膜被從樣品裝置分開(kāi)的工作流體泵。在使用中,例如在工作流體泵改變工作流體的壓力時(shí)通過(guò)隔膜的運(yùn)動(dòng),通過(guò)越過(guò)隔膜被傳輸?shù)膲毫Φ母淖?,樣品或其它流體可被吸入樣品裝置,或從樣品裝置排出。在一個(gè)實(shí)施例中,樣品裝置是吸管尖端或用于吸取、分配和/或混合流動(dòng)樣品和/或用于從一個(gè)位置至另一個(gè)位置轉(zhuǎn)移樣品、試劑或其它流體的其它管。該吸管尖端或管可以是任何合適的形狀和尺寸。在又一另一實(shí)施例中,本發(fā)明提供用于測(cè)量流體的體積的設(shè)備,包括至少一個(gè)光源或發(fā)射器,以及至少一個(gè)接收器;布置有光路的試管,通過(guò)該光路,接收器可以檢測(cè)與試管是包含流體或是空的相關(guān)的光路的變化;以及與接收器相聯(lián)系的流體轉(zhuǎn)移裝置,以便確定已從試管被移走的流體的體積。其它實(shí)施例涉及生物樣品處理容器。該容器包括一次性使用的盤,該盤具有基本上剛性的主體,其具有第一工作站,該第一工作站被布置成保持用于在熱塊(例如單個(gè)管,多井板或條,PCR板等)中保溫的器皿,第二工作站,該第二工作站被布置成保持試劑,以及被布置成保持吸管的第三工作站。一些實(shí)施例涉及具有外部邊緣部分的柔性隔離物,其被布置成密封至盤,以便限定密封封閉的內(nèi)部腔室。該柔性隔離物包括彈性體,并且被密封附著至隔離物的中間部分處的機(jī)器人臂接口。又一另一實(shí)施例涉及自動(dòng)吸管尖端脫離系統(tǒng)。該系統(tǒng)包括(a)具有側(cè)壁的盤;以及(b)并入操縱工具的機(jī)器人臂,該操縱工具具有向外延伸的桿,該桿被布置成接觸盤側(cè)壁,從而與側(cè)壁的接觸使桿樞軸轉(zhuǎn)動(dòng),并且釋放通過(guò)操縱工具保持的各個(gè)使用的吸管尖端。在一些實(shí)施例中,該盤具有接觸操縱工具桿的有角度的側(cè)壁。一些實(shí)施例涉及用于處理液體的系統(tǒng)。該系統(tǒng)包括(a)機(jī)器人臂;以及(b)與機(jī)器人臂合作的操縱工具,該工具被布置成可松脫地接合吸管尖端,并且自動(dòng)平移,以在通過(guò)蓋中的刺穿開(kāi)口的一個(gè)從器皿取出流體之前在間隔開(kāi)的不同位置多次刺穿器皿上的蓋,。其它實(shí)施例涉及洗脫盤。該盤是無(wú)菌生物相容洗脫盤,其具有多個(gè)間隔開(kāi)的接收器,在向上延伸的隔離物的笫一側(cè)面上的多個(gè),以及在隔離物的相對(duì)側(cè)上的多個(gè)。接收器具有在主要管部的方向上向下逐漸變細(xì)的每一側(cè)上延伸的通道。還有其它實(shí)施例涉及一種用于自動(dòng)處理系統(tǒng)的成套工具。該成套工具包括(a)—次性使用的容器,包括盤和被布置成密封附著至該盤的柔性隔離物;(b)—次性使用的試劑架,被布置成居于第一工作站處的容器中;(c)一次性使用的結(jié)合柱歧管,被布置成居于容器中;以及(d)—次性使用的吸管架,被布置成居于容器中。一些實(shí)施例涉及轉(zhuǎn)移液體的方法。該方法包括(a)可編程地導(dǎo)引機(jī)器人臂移動(dòng)可松脫地保持吸管尖端的接口工具;(b)利用吸管尖端多次自動(dòng)刺穿保持目標(biāo)液體的器皿上的密封劑;然后(c)利用吸管尖端,利用被刺穿的密封材料,從器皿自動(dòng)吸取液體。一些實(shí)施例涉及從吸管釋放液體的方法。該方法包括(a)可編程地導(dǎo)引機(jī)器人臂移動(dòng)可松脫地保持吸管的接口工具,以便在按一定角度向下延伸的方向上定向吸管,尖端靠近封閉容器中的接收表面;(b)沿著平面并基本上沿著直線,自動(dòng)移動(dòng)向下定向成角度的吸管,同時(shí)從吸管釋放可流動(dòng)的物質(zhì)。又一另一實(shí)施例涉及抽吸液體進(jìn)入吸管的方法。該方法包括(a)可編程地導(dǎo)引機(jī)器人臂移動(dòng)可松脫地保持吸管的接口工具,以便接合保持保持封閉容器中的目標(biāo)流體的器皿;然后(b)自動(dòng)移動(dòng)器皿內(nèi)部的吸管,以便混合器皿中的液體;然后(c)抽吸混合液體進(jìn)入吸管。在一些實(shí)施例中,該方法包括抽吸和分配液體以混合液體(一次或多次)。還有其它實(shí)施例涉及處理封閉系統(tǒng)中的樣品的自動(dòng)方法。該方法包括(a)在具有柔性隔離物的密封封閉容器中提供樣品;以及(b)可編程地導(dǎo)引機(jī)器人臂,以與柔性隔離物合作,從而通過(guò)一系列操作移動(dòng)封閉容器內(nèi)部的接口工具,同時(shí)封閉容器保持密封,以便處理樣品。該方法也可以任意包括下面的一個(gè)或多個(gè)(a)在擴(kuò)增過(guò)程中多次電和自動(dòng)測(cè)量樣品的體積和濃度;(b)在使用之前,之后和/或過(guò)程中,電和自動(dòng)監(jiān)控封閉容器的密封完整性;以及(e)捕獲等份試樣器皿中的至少一個(gè)擴(kuò)增RNA樣品,而不破壞封閉系統(tǒng)的密封狀態(tài)。還有其它實(shí)施例涉及用于操縱封閉容器中的項(xiàng)目的設(shè)備。該設(shè)備包括(a)具有內(nèi)部區(qū)域的容器,其被布置成保持要被操縱的多個(gè)項(xiàng)目;以及(b)再循環(huán)真空系統(tǒng),被布置成在封閉回路中循環(huán)在容器的內(nèi)部區(qū)域中密封的空氣。盡管關(guān)于本發(fā)明的方法方面于此描述了一些實(shí)施例??梢岳斫猓景l(fā)明也可被具體化系統(tǒng)和計(jì)算機(jī)程序產(chǎn)品。此外需要指出,關(guān)于一種類型的權(quán)利要求所權(quán)利要求的任何特征,比如系統(tǒng),設(shè)備,方法或計(jì)算機(jī)基于下面的附圖和詳細(xì)的說(shuō)明書(shū)的回顧,依據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例的其它系統(tǒng),方法,系統(tǒng)元件和/或計(jì)算機(jī)程序產(chǎn)品對(duì)本領(lǐng)域熟練技術(shù)人員將清楚或變得清楚。試圖全部這種附加的系統(tǒng),方法和/或計(jì)算機(jī)程序產(chǎn)品被包括在這些描述中,在本發(fā)明的范圍中,并且被附加權(quán)利要求所保護(hù)。當(dāng)結(jié)合附圖閱讀時(shí),從其示范性實(shí)施例的下面的詳細(xì)描述可以更容易地理解本發(fā)明的其它特征,其中類似的參考數(shù)字表示類似的元件。該附圖僅是示范性的,用于描述可被單獨(dú)使用或結(jié)合其它特征的某些特征,并且本發(fā)明試圖不局限于示出的實(shí)施例。關(guān)于一個(gè)實(shí)施例或附圖示出的特征可以用于其它實(shí)施例獲特征。圖l是依據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例的處理系統(tǒng)的透視圖2是圖1的系統(tǒng)的上部的側(cè)視圖,包括工作表面上的隔離容器;圖3是圖1的系統(tǒng)的工作表面的實(shí)施例的透視圖,沒(méi)有示出隔離容器;圖4是具有還沒(méi)有依據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例附著柔性隔離物的隔離容器組件的透—見(jiàn)圖5是依據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例的隔離容器組件的切開(kāi)透視描述;圖6是圖5的隔離容器組件的切開(kāi)透視圖;圖7A和7B是依據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例的注射泵系統(tǒng)的側(cè)視圖;圖8A和8B是依據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例適于與流體泵系統(tǒng)合作的吸管頭的橫截面?zhèn)纫晥D8C是依據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例,用于圖8A的吸管頭的柔性隔離隔膜的頂視圖8D是在圖8C中示出的柔性隔離隔膜的橫截面圖;圖9A和9B分別是依據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例的柔性隔離物的透視和橫截面圖9C和9D分別是柔性隔離物的其它實(shí)施例的透視和橫截面圖9E是依據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例,具有集成的耦合器的柔性隔離物的透視圖,以部分截面圖示出隔離物中的耦合器;圖9F是依據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例,具有耦合器的機(jī)器人臂的部分的透視圖,該耦合器被布置成接合在圖9E中示出的隔離物耦合器;圖9G是在圖9E和9F中示出的元件的裝配(沒(méi)有柔性隔離物)的透視圖,并且具有在以透明和虛線示出的內(nèi)部元件上的外殼;圖9H是依據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例,附著有柔性隔離物的圖9G中示出的組件的透^L圖10是依據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例的PCR板和熱循環(huán)控制器蓋組件的透視圖11是依據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例具有熱循環(huán)控制器蓋驅(qū)動(dòng)系統(tǒng)的熱循環(huán)控制器組件的透視圖12是依據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例用于容器的柔性熱循環(huán)控制器蓋密封的圖ll的熱循環(huán)控制器蓋驅(qū)動(dòng)系統(tǒng)的透視圖13A和13B是依據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例在熱蓋進(jìn)入容器的工作空間和從容器的工作空間出來(lái)的運(yùn)動(dòng)過(guò)程中圖12的蓋密封的橫截面圖13C是在圖13A和13B中示出的蓋密封和容器的部分切開(kāi)側(cè)面透視圖14是依據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例裝DNA和RNA結(jié)合柱的歧管的透視圖15是依據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例在與吸管頭的接合以便在站之間移動(dòng)歧管的過(guò)程中圖14的歧管的透視圖16是依據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例描述了在使用隔離容器之前的封閉真空系統(tǒng)的示意性側(cè)視圖17是依據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例在使用隔離容器過(guò)程中圖16的真空系統(tǒng)的示意性側(cè);魄圖18是具有切開(kāi)的隔離盤的處理系統(tǒng)工作表面的透視圖,示出了依據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例用于控制濕度和蒸汽濃度的冷卻單元;圖19A是依據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例附著至隔離盤的試管的截面透視圖19B是依據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例的分光光度計(jì)試管測(cè)量系統(tǒng)的協(xié)同操作元件的側(cè)面透一見(jiàn)圖20A-20D是依據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例用于測(cè)量容積試管中的體積的系統(tǒng)的操作的例子,每一幅圖是容積試管測(cè)量系統(tǒng)的截面圖20E是依據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例可以如關(guān)于圖20A-20D所述地工作的多個(gè)試管容積測(cè)量系統(tǒng)的頂部、側(cè)面透^L圖20F是依據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例描述了在容器的邊界之下延伸的試管的在圖4和5中示出的容器的底部透視圖21A是依據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例的試劑架的透視圖21B是依據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例描述了刺穿技術(shù)的在圖21A中示出的試劑架的示意性頂部透—見(jiàn)圖22是依據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例示出了等份試樣管機(jī)構(gòu)的操作的一系列示意性圖示;圖23A是依據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例示出可被載入隔離容器的元件的圖圖23B是依據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例,利用在圖23A中示出的成套工具元件部分裝配的容器的頂部透視圖23C是在圖23B中示出的部分裝配的成套工具的底視圖;圖23D是依據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例在成套工具元件在使用位置處被附著之前在圖23A中示出的成套工具中容器的頂視圖24是依據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例描述了具有柔性隔離物的盤的密封的圖23A的隔離容器盤的分解圖25是依據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例可被實(shí)施的操作的流程圖26A和26B是依據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例具有桿的吸管頭的放大的側(cè)面透視圖26C是依據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例示出與容器的內(nèi)部表面接合以便釋放吸管尖端的在圖26A和26B中示出的桿的側(cè)面透視的頂部透一見(jiàn)圖28A是依據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例,具有可以使容器成與機(jī)器人臂對(duì)準(zhǔn)的偏置組件結(jié)構(gòu)的工作表面的放大的側(cè)面透視圖28B是依據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例,描述了用于在期望的方向上給容器施加力的彈簧的圖28A中示出的工作表面的一部分的底部透^L圖29A是依據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例的洗脫盤的頂視圖29B是在圖29A中示出的盤的底部透^f見(jiàn)圖29C是在圖29A中示出的盤的頂部透視圖30A是廢料盤蓋的頂部透視圖30B是在圖30A中示出的盤蓋的底部透視圖31是用于通過(guò)本發(fā)明構(gòu)思的自動(dòng)系統(tǒng)的電路的方塊圖;以及圖32是依據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例的數(shù)據(jù)處理系統(tǒng)的方塊圖。具體實(shí)施例方式在可以以修改和替代形式獲得本發(fā)明的同時(shí),通過(guò)附圖中的例子示出其具體實(shí)施例,并且將^皮詳細(xì)描述。然而可以理解,其不試圖將本發(fā)明限制為公開(kāi)的具體實(shí)施例,而是相反,本發(fā)明將覆蓋落入本發(fā)明的精神和范圍的全部修改、等價(jià)和替代。類似的參考數(shù)字表示貫穿的類似元件。在附圖中,為了清楚可以夸大附圖的某些線的厚度、層、部件、元件。虛線描述了任意特征或操作或隱藏元件,除非另外指明。在權(quán)利要求書(shū)中,權(quán)利要求的方法不局限于敘述的任何步驟的次序,除非在那里聲明。于此使用的術(shù)語(yǔ)僅用于描述具體實(shí)施例,并且不試圖限制本發(fā)明。如于此使用的,單數(shù)形式"一"、"一個(gè),,和"一種"也試圖包括復(fù)數(shù)形式,除非上下文另外清楚地指出。進(jìn)一步可以理解,當(dāng)用于該說(shuō)明書(shū)時(shí),術(shù)語(yǔ)"包括"和/或"包含"指定了陳述的特征、整數(shù)、步驟、操作、元件和/或部件的存在,而不是排除一個(gè)或多個(gè)其它特征、整數(shù)、步驟、操作、元件、部件和/或它們的組的存在或附加。如于此使用的,術(shù)語(yǔ)"和/或"包括相關(guān)的列出術(shù)語(yǔ)的一個(gè)或多個(gè)的任何和全部組合。如于此4吏用的,比如"在X和Y之間,,和"在大約X和Y之間,,的短語(yǔ)-故解釋為包括X和Y。如于此使用的,比如"在大約X和Y之間"的短語(yǔ)意味著"在大約X和大約Y之間,,。如于此使用的,比如"從大約X至Y"的短語(yǔ)意味著"從大約X至大約Y,,。除非另外定義,于此使用的全部術(shù)語(yǔ)(包括技術(shù)和科學(xué)術(shù)語(yǔ))具有如本發(fā)明屬于的本領(lǐng)域的熟練技術(shù)人員通常理解的相同意思。可以進(jìn)一步理解,比如在通常使用的字典中定義的那些術(shù)語(yǔ)被解釋為具有與它們?cè)谡f(shuō)明書(shū)上下文中和相關(guān)領(lǐng)域的意思一致的意思,并且不以理想化或極端形式的被解釋,除非于此特意如此定義。為了簡(jiǎn)短和/或清楚可以不詳細(xì)描述熟知的功能或結(jié)構(gòu)??梢岳斫?,盡管可以于此使用的術(shù)語(yǔ)第一、第二等用以表述各種元件、部件、區(qū)域、層和/或部分,但這些元件、部件、區(qū)域、層和/或部分將不被這些術(shù)語(yǔ)所限制。這些術(shù)語(yǔ)僅用于區(qū)別一個(gè)元件、部件、區(qū)域、層或部分與另一個(gè)區(qū)域、層或部分。因此,在下面討論的第一元件、部件、區(qū)域、層或部分可被稱作第二元件、部件、區(qū)域、層或部分,不會(huì)脫離本發(fā)明教導(dǎo)。操作的次序(或步驟)不局限于在權(quán)利要求或附圖中給出的順序,除非另外具體示出。術(shù)語(yǔ)"封閉系統(tǒng)"或"封閉容器"分別涉及被密封的系統(tǒng)和容器,并且如果不是完全地,基本上以封閉方式操作,以便抑制或阻止處理過(guò)程中外生的或外部材料進(jìn)入(或離開(kāi))系統(tǒng)或容器。封閉系統(tǒng)可被布置成抑制或避免污染。在一些實(shí)施例中,封閉系統(tǒng)或容器的部件在使用之前可在制造位置處被預(yù)先消毒,在使用點(diǎn)處被消毒,和/或在裝配各個(gè)封閉系統(tǒng)之后被消毒,并且在使用前被封閉。該封閉系統(tǒng)或容器在某些大氣條件處可一皮壓力或真空密封至某一目標(biāo)或預(yù)定義的漏率。利用真空或壓力傳感器測(cè)試或其它泄漏檢查系統(tǒng)等,通過(guò)內(nèi)部和/或外部傳感器可以檢測(cè)漏率。從海平面至較高的海拔高度,典型的大氣條件可以隨著設(shè)備的位置而改變。然而,通過(guò)本發(fā)明的實(shí)施例構(gòu)思的封閉系統(tǒng)也可以用于海洋(水面下,深海),飛行和/或空間環(huán)境,它的密封足以在那些大氣條件下基本上保持目標(biāo)漏率。該封閉系統(tǒng)或容器可被采用用于它們的各自預(yù)定用途,而不破壞封閉系統(tǒng)的完整性。該封閉系統(tǒng)或容器可以適用于進(jìn)或出的目標(biāo)流體樣品的流體轉(zhuǎn)移,同時(shí)保持無(wú)菌,和/或可連接至其它封閉系統(tǒng),同時(shí)保持封閉系統(tǒng)的完整性。過(guò)濾器可以任意用于流動(dòng)路徑,在工藝工程中該流動(dòng)路徑可以是對(duì)大氣或其它成分開(kāi)放的。過(guò)濾器可被布置成過(guò)濾成期望的清潔水平或等級(jí),以便有助于封閉狀態(tài),比如等級(jí)100,000,等級(jí)10,000,等級(jí)1000的過(guò)濾器或甚至等級(jí)100的過(guò)濾器。術(shù)語(yǔ)"隔離容器"指的是被布置成相對(duì)于存在于外部環(huán)境中的外部病原體、微生物等和/或其它材料,保持、封裝和/或隔離內(nèi)部元件和其中保持的一個(gè)或多個(gè)項(xiàng)目或樣品的處理的容器。隔離容器可以是一次性使用的容器。在一些實(shí)施例中,隔離容器中的樣品是核酸或包括核酸,例如用于處理組織(例如澄清的腫瘤勻漿)中的核酸成IVTRNA。術(shù)語(yǔ)"一次性使用"指的是不重復(fù)使用的元件。也就是在完成它的預(yù)期用途之后,即目標(biāo)樣品的處理或生成后,它被處理掉。隔離容器可以是一次性使用的(以及可以被標(biāo)記為這樣),以使隔離容器保持為封閉系統(tǒng),該封閉系統(tǒng)以它的內(nèi)部元件保持于其中的封閉密封狀態(tài)被處理掉,以便在目標(biāo)產(chǎn)品的處理/生成之后抑制它的內(nèi)部?jī)?nèi)容的任何不利的向外釋放或暴露。術(shù)語(yǔ)"等分試樣"(aliquot)指的是期望量的目標(biāo)流體;流體的量可以是預(yù)定和/或指定的范圍。術(shù)語(yǔ)"等分試樣管"指的是允許流體等分試樣從容器移走的管。典型地,術(shù)語(yǔ)"等分試樣管"指的是與隔離容器的內(nèi)部聯(lián)系、以便不破壞隔離容器的封閉狀態(tài)或密封完整性而接收至少一個(gè)(并且典型地多個(gè))流體等分試樣的管。等分試樣管可以是柔性和無(wú)菌的,并且可以包括比如PVC等的彈性體。術(shù)語(yǔ)"試管"(cuvette)指的是被布置成允許器皿中包含的物質(zhì)(典型地流體)的機(jī)械、電或光學(xué)測(cè)量(典型地濃度或體積測(cè)量)的器皿。該試管可纟皮尺寸化為保持相對(duì)小量的流體,典型地在大約0.001mL至大約5.0mL之間的范圍。術(shù)語(yǔ)"吸管尖端,,(pipettetip)指的是在兩端開(kāi)放的管,以能夠吸入和/或排放流體,典型地小體積的液體,并且典型地以在大約0.1yL至大約lOOOiul之間的量。該管可以具有不規(guī)則或恒定的周邊形狀或尺寸,典型地從頭部在下部尖端處向下逐漸變細(xì)。通過(guò)多個(gè)瑪塔(matable)元件可以限定"吸管"。也就是,吸管可以包括尖端部和頭部。頭部可被限定在附著(間接)至機(jī)器人裝置的操縱工具上,在處理過(guò)程中該機(jī)器人裝置可松脫地(releasably)附著至不同的吸管尖端。不同體積尺寸的吸管可以用于單個(gè)的容器/處理系統(tǒng)。術(shù)語(yǔ)"人機(jī)接口(HMI)"對(duì)本領(lǐng)域技術(shù)人員是熟知的,指的是允許操作者輸入、導(dǎo)引、交互或加工的接口,并且典型地包括具有可編程地提供信息至操作者并且接受來(lái)自操作者的控制指令的"圖形用戶界面(GUI)"的電子顯示器。術(shù)語(yǔ)"無(wú)菌的,,指的是抑制或避免容器的內(nèi)部處理空間中目標(biāo)樣品被外部病原微生物和/或不期望的外生材料污染的處理?xiàng)l件,和/或抑制或避免附近的外部環(huán)境被容器所含內(nèi)容污染的處理?xiàng)l件。術(shù)語(yǔ)"結(jié)合柱,,(bindingcolumn)指的是可以用于分離樣品的成分或其衍生物的過(guò)濾/洗脫柱。在一些實(shí)施例中,結(jié)合柱可以用于核酸(例如DNA和/或RNA)分離或提純。在一些實(shí)施例中,結(jié)合柱可以包括硅膜。術(shù)語(yǔ)"盤,,指的是具有用以保持一個(gè)或多個(gè)元件的足夠剛度的基板。該盤可以基本上是平坦的,或者可以具有碗狀形狀。該盤也可以具有其它形狀或結(jié)構(gòu)。該盤可以布置成限定完整的井或保持區(qū)域,或者可被布置成可密封地緊密配合和/或保持裝置或容器,典型地與至少一個(gè)處理工作站相關(guān)的那些元件。術(shù)語(yǔ)"用戶"是用于操作者、程序員和/或維修工的通常術(shù)語(yǔ)。術(shù)語(yǔ)"機(jī)器人"指的是可被可編程地導(dǎo)引,以便在期望的方向上平移,從而實(shí)施定義的處理步驟或操作的自動(dòng)裝置。術(shù)語(yǔ)"機(jī)器人"被廣泛地使用,并且包括具有多軸平移的固定裝配的機(jī)器人臂,以及完全活動(dòng)的機(jī)器人和其它合適的機(jī)器人裝置。本發(fā)明可被具體化為系統(tǒng),方法和/或計(jì)算機(jī)程序產(chǎn)品。因此,可以以硬件和/或以軟件(包括固件,駐留軟件,微代碼等)具體化本發(fā)明。此外,本發(fā)明可以采取基于計(jì)算機(jī)可使用或計(jì)算機(jī)可讀的存儲(chǔ)介質(zhì)的計(jì)算機(jī)程序產(chǎn)品的形式,該存儲(chǔ)介質(zhì)具有在介質(zhì)中具體化的計(jì)算機(jī)可使用或計(jì)算機(jī)可讀程序代碼,以用于被指令執(zhí)行系統(tǒng)使用或與指令執(zhí)行系統(tǒng)相聯(lián)系。在本文獻(xiàn)的上下文中,計(jì)算機(jī)可使用或計(jì)算機(jī)可讀介質(zhì)可以是可以容納、存儲(chǔ)、通信、傳播或傳輸被指令執(zhí)行系統(tǒng)、設(shè)備或裝置使用或與指令執(zhí)行系統(tǒng)、設(shè)備或裝置相聯(lián)系的程序的任何介質(zhì)。計(jì)算機(jī)可使用或計(jì)算機(jī)可讀介質(zhì)可以例如是但不局限于電、磁、光、電磁、紅外線或半導(dǎo)體系統(tǒng),設(shè)備,裝置或傳播介質(zhì)。計(jì)算機(jī)可讀介質(zhì)的更具體的例子(不窮舉)包括具有一個(gè)或多個(gè)導(dǎo)線的電連接,便攜式計(jì)算機(jī)磁盤,隨機(jī)存取存儲(chǔ)器(RAM),只讀存儲(chǔ)器(ROM),可擦除可編程只讀存儲(chǔ)器(EPROM或閃存),或光纖,以及便攜式光盤只讀存儲(chǔ)器(CD-ROM)。需要指出,計(jì)算機(jī)可使用或計(jì)算機(jī)可讀介質(zhì)可以甚至是紙或其它合適的介質(zhì),其上印刷有程序,當(dāng)程序被電捕獲時(shí),經(jīng)由例如紙或其它介質(zhì)的光學(xué)掃描,然后被編譯,解釋,或以合適的方式被另外處理,如果必須,還可以存儲(chǔ)于計(jì)算機(jī)(電)存儲(chǔ)器中。下面討論用于在封閉環(huán)境中的自動(dòng)處理的設(shè)備和方法。該系統(tǒng)可以例如用于處理、制備、裝配或操縱封閉環(huán)境中的任何事物,并且特別有用于藥學(xué)、法醫(yī)、治療、診斷、生物工藝學(xué)、電子和納米
技術(shù)領(lǐng)域
。為了方便描述,在用于處理核酸的系統(tǒng)的上下文中描述本發(fā)明的各個(gè)特征和方法。然而本領(lǐng)域的熟練技術(shù)人員可以理解,下面的說(shuō)明書(shū)4又試圖描述本發(fā)明,并且不是限制性的。各個(gè)其它用途試圖在本發(fā)明的范圍中,包括例如用于制備、裝配、處理或另外操縱封閉容器中的任何項(xiàng)目的系統(tǒng)牙p方法。示范性自動(dòng)系統(tǒng)的綜述概括地講,參照?qǐng)D1,系統(tǒng)10可被布置具有機(jī)器人臂20,該機(jī)器人臂操縱具有內(nèi)部腔室(也被描述為內(nèi)部工作區(qū)或區(qū)域,其中詞語(yǔ)"區(qū),,被廣泛使用,并且不是以兩維數(shù)學(xué)方式)的封閉容器組件12中的一個(gè)或多個(gè)項(xiàng)目。在一些實(shí)施例中,容器組件12具有被布置成保持要被處理和/或操縱的多個(gè)項(xiàng)目的內(nèi)部區(qū)域18。柔性隔離物(barrier)16可被布置或尺寸化為覆蓋容器盤14的內(nèi)部并被容器盤14密封。用于操縱腔室中的項(xiàng)目的工具附著至柔性隔離物16或在柔性隔離物16中被集成,并且它在隔離物16附著至盤14時(shí)能夠延伸進(jìn)入內(nèi)部區(qū)域。該工具可以具有從隔離物的外側(cè)可訪問(wèn)的適配器或其它接口,以使當(dāng)利用容器盤密封隔離物或隔離物附著至容器盤時(shí),通過(guò)來(lái)自容器的外面的機(jī)器人裝置可以操縱該工具。盤14可被布置成包括一個(gè)或多個(gè)工作空間、區(qū)、站、架、固定器、容器、井或用于保持封閉容器中的一個(gè)或多個(gè)項(xiàng)目或過(guò)程成分或流體的其它裝置。也可以在容器中設(shè)置其它工具或裝置,或者可以從容器中訪問(wèn)其它工具或裝置;例如用于處理、操作、測(cè)量、分析、采樣和/或存儲(chǔ)樣品或其它項(xiàng)目的工具或裝置可以存在于容器的腔室中?,F(xiàn)在回到附圖,圖1示出了示范性的自動(dòng)化的核酸處理系統(tǒng)10。系統(tǒng)IO可以包括容器組件12。容器組件12可以是隔離容器12。系統(tǒng)IO也包括機(jī)器人20(典型地機(jī)器人臂),或用于操作容器組件12中的項(xiàng)目和/或與容器組件12相關(guān)的項(xiàng)目的其它自動(dòng)或人工可導(dǎo)引裝置。容器組件12包括盤14和柔性隔離物16。柔性隔離物16被布置成被盤14密封或附著至盤14。隔離物16的外周邊緣部分16p可以密封地接合容器盤14,提供容器組件12中封閉、無(wú)菌的工作區(qū)18。在一些實(shí)施例中,容器組件12或其任何部分是一次性使用的。在具體實(shí)施例中,可以不打開(kāi)密封容器,在容器之外排放、收集或捕獲樣品,并且密封容器12可;f皮處置,而剩余的內(nèi)部?jī)?nèi)容完好。盤14可以基本上是剛性的,并且可以是模制體。在一些實(shí)施例中,盤14包括醫(yī)用等級(jí)(比如USPClassVI或其它合適的等級(jí))模制聚合體。盤14的主體可以包括用于提供內(nèi)部觀察能力的視覺(jué)能見(jiàn)度的一個(gè)或多個(gè)基本上清楚、半透明或透明的磨光區(qū)域。可以在空間清潔的模具中和空間清潔的模制設(shè)備中鑄造盤14,以便抑制和/或最小化生物負(fù)荷(bioburden)和微粒。在密封柔性隔離物16之前或之后,盤14可被消毒,通過(guò)利用傳統(tǒng)的消毒技術(shù),比如利用VHP(汽化的過(guò)氧化氫)、Y輻射或環(huán)氧乙烷蒸汽過(guò)氧化氫的表面凈化。為了裝運(yùn),可以以雙彈性無(wú)菌包裝材料(比如密封的雙塑料包裝/袋)封裝盤14。隔離物16可被布置成允許機(jī)器人20,垂直地大約4-24英寸之間,水平地至少大約盤14的寬度和長(zhǎng)度,移動(dòng)密封的容器組件12的工作區(qū)18內(nèi)部的工具,并且不破壞容器組件12的密封完整性。在一些實(shí)施例中,機(jī)器人20可以引導(dǎo)內(nèi)部接口進(jìn)行密封的容器組件12內(nèi)6-12英寸之間的垂直運(yùn)動(dòng),不破壞密封的密封完整性。可以相對(duì)于盤14尺寸化和布置隔離物16,以便提供足夠量的空氣,從而允許機(jī)器人20在期望范圍內(nèi)運(yùn)動(dòng),而不過(guò)度壓縮或減壓容器12的內(nèi)部體積。在一些實(shí)施例中,系統(tǒng)10用于處理生物樣品,包括但不局限于容器組件12內(nèi)部的組織、血液、血液制品、核酸、蛋白質(zhì)、細(xì)月包培養(yǎng)等。在這種實(shí)施例中,容器12可以包括例如生物樣品,試劑,洗滌液,吸管,吸管尖端,器皿,其它消耗品或其任意組合的項(xiàng)目。如示出的,系統(tǒng)10可以是自固定(selfstanding)、自主式單元。系統(tǒng)10可以包括用于支持隔離容器組件12和自動(dòng)系統(tǒng)10的其它元件的外殼或機(jī)架70,自動(dòng)系統(tǒng)10的其它元件的例子包括機(jī)器人20,熱塊30(例如加熱塊和/或冷卻塊等),等分試樣取回組件40和用于收集4皮處理樣品的相關(guān)機(jī)構(gòu),用戶接口60,以及如在下面的部分中描述的各種其它元件和才幾構(gòu)。如示出的,熱塊30可以與熱塊組^牛IOOO合作,例如在圖10,11中。在處理系統(tǒng)10的一些實(shí)施例中,操作者或維修工為了正常的操作可以^l需要訪問(wèn)系統(tǒng)10的前面。如圖1中所示,可以打開(kāi)一個(gè)或多個(gè)通道門110,例如通過(guò)基本上垂直地升起,或向一側(cè)或在另一個(gè)方向上打開(kāi),以便在安裝或移動(dòng)隔離容器12的同時(shí)提供可訪問(wèn)性。在一些實(shí)施例中,由于系統(tǒng)10的自動(dòng)特性,門110可以在工作過(guò)程中保護(hù)操作者不受系統(tǒng)的移動(dòng)部件的影響。系統(tǒng)IO可以包括電控制的互鎖(interlock)或其它機(jī)構(gòu),以便當(dāng)系統(tǒng)在工作中時(shí)抑制或避免操作者打開(kāi)門110??梢蕴峁┦謩?dòng)超越控制(override),以允許互鎖防護(hù)的打開(kāi),并且,如果例如沒(méi)有功率供應(yīng)時(shí),可以采用這種超越控制。用戶接口60,也被稱作HMI(人機(jī)接口)可被布置成允許操作者啟動(dòng)處理操作或控制系統(tǒng)10,并且可被裝配在靠近通道門110的機(jī)架70的前面。在一個(gè)實(shí)施例中,可以定位顯示屏61和HMI的控制(觸摸屏,鍵盤或其它輸入)成當(dāng)閑置時(shí)允許用戶觀察和操作它們。在一些實(shí)施例中,系統(tǒng)10的后面和側(cè)面不需要被操作者例行訪問(wèn)。因此可以相對(duì)于墻壁或另一個(gè)系統(tǒng)定位該系統(tǒng)。在一些實(shí)施例中,4幾架70的下部可以容納電控制系統(tǒng),電源和其它元件,其可以不需要操作者交互。這些元件可被裝在專用外殼中,該專用外殼保護(hù)元件不受偶然流體侵入的損壞和保護(hù)操作者不受可能的電危險(xiǎn)的損害??砂梢苿?dòng)面板120,130,140,以便提供對(duì)外殼內(nèi)部的電子元件和其它元件的訪問(wèn)。在一些實(shí)施例中,僅受過(guò)訓(xùn)練的服務(wù)人員被允許或需要訪問(wèn)這些外殼的內(nèi)部。該服務(wù)訪問(wèn)面板可以或不可以是互鎖的,例如用以允許或禁止在面板被移動(dòng)時(shí)系統(tǒng)繼續(xù)工作。圖2示出了系統(tǒng)10的上部的放大側(cè)視圖,包括工作表面200上的隔離容器12。吸管頭220和/或其它操縱裝置可以附著至隔離物16,或者可以與隔離物16集成,或者可以在隔離物16中被集成,以使當(dāng)隔離物附著至盤14時(shí)(如圖所示),吸管頭220的至少一部分延伸進(jìn)入容器12的內(nèi)部工作區(qū)18。吸管頭220可以包括隔離物16的相對(duì)側(cè)上的接口,其被布置成與機(jī)器人裝置20的臂230的端部上的適配器210可松脫地連接。在一些實(shí)施例中,吸管頭220或其它操縱裝置沒(méi)有物理地穿過(guò)隔離物16,并且可以不必通過(guò)適配器耦合至機(jī)器人或其它裝置。此外,這種吸管頭可以附著至隔離物的內(nèi)部,或者與隔離物的內(nèi)部集成,并且可以從隔離物16的相對(duì)側(cè)被操作或操縱,例如利用附著至隔離物的相對(duì)側(cè)的機(jī)器人臂230。在其它實(shí)施例中,通過(guò)隔離物16由^茲體或者由支持操縱裝置和/或與操縱裝置聯(lián)系的其它裝置可以操作吸管頭或與隔離物16(其基本上是不滲透的)集成的其它樣品操縱裝置。當(dāng)在盤14上密封隔離物16時(shí),隔離物16將盤14的內(nèi)容與機(jī)器人20或操縱吸管頭220的其它裝置分開(kāi)。隔離物16和盤14之間的密封可以是氣密的,從而提供容器12中的封閉環(huán)境。在一些實(shí)施例中,隔離物16是柔性的,并允許機(jī)器人臂230遍及盤14中的工作區(qū)18移動(dòng)吸管頭220。在處理過(guò)程中,在處理核酸樣品中包括的全部項(xiàng)目或材料,包括例如生物樣品、試劑、吸管尖端或其它消耗品,以及用于處理樣品的其它工具或裝置可以保持在封閉的工作區(qū)18中。盤14可以包括多個(gè)特征或站242,該多個(gè)特征或站242可被;漢制、形成、附著或與盤14的基座240集成、或是盤14的另一部分,以便適應(yīng)于這些項(xiàng)目。如圖所示,機(jī)器人裝置20可被附著至機(jī)架70的壁。在一些實(shí)施例中,機(jī)器人裝置20可以包附著至工作表面200或另一支持結(jié)構(gòu)的連鎖(linkage)系統(tǒng)、臂或架(gantry)。合適的機(jī)器人裝置是本領(lǐng)域已知的。不受限制的例子包括StaubliTX90機(jī)器人,EpsonE2LScara機(jī)器人,KawasakiFSeries機(jī)器人,YamahaYKIScara機(jī)器人,ST機(jī)器人,STRoboticsR17機(jī)器人等。在一些實(shí)施例中,機(jī)器人裝置20是FANUCLRMATE2001b5C,6軸機(jī)器人或其它合適的多軸機(jī)器人裝置,并且用于自動(dòng)執(zhí)行封閉容器12內(nèi)部的期望操作,例如,在樣品的處理過(guò)程中,利用吸管尖端抽吸和轉(zhuǎn)移流體,以及滑動(dòng)或提升結(jié)合柱歧管(manifold)。多軸機(jī)器人臂可以用于移動(dòng)可松脫地保持吸管的接口工具,以便在多個(gè)不同方向上定向吸管,從而基于抽吸或分配幫助混合液體。例如,可以在按一定角度向下延伸的方向上定向吸管,尖端鄰近封閉容器中接收器皿中的接收表面,然后自動(dòng)地,沿著平面并基本上沿著直線移動(dòng)按一定角度向下定向的吸管(類似于芥末(mustard)的典型成層或分配),同時(shí)從吸管釋放可流動(dòng)的物質(zhì)。在其它實(shí)施例中,機(jī)器人臂可以自動(dòng)移動(dòng)吸管,以便在抽吸之前混合器皿中的液體,然后抽吸混合液體進(jìn)入吸管??商娲蚋郊拥?,在一些實(shí)施例中,液體可被抽吸和分配至少一次,以便混合液體。在一些實(shí)施例中,接收或分配器皿具有唇緣,并且機(jī)器人臂被布置成引導(dǎo)吸管尖端圍繞唇緣的周圍移動(dòng)。如圖3中示出的,例如可被定位在前通道門110內(nèi)部的水平工作表面200,支持與隔離容器12交互的各個(gè)元件和機(jī)構(gòu)。工作表面200可以包括一個(gè)或多個(gè)導(dǎo)向裝置390,其可以包括導(dǎo)向槽390s,該導(dǎo)向槽接合組件支持臺(tái)車399上的元件(圖27),以便對(duì)準(zhǔn)容器12,或其它位置特征,從而在處理過(guò)程中定向和可松脫地夾緊至隔離容器12(例如圖2的基座240)。如圖27中示出的,在可以??肯到y(tǒng)10的臺(tái)車399上準(zhǔn)備容器組件12。臺(tái)車399可以包括槽399s,槽399s與由系統(tǒng)10的支持表面上的導(dǎo)向裝置390限定的槽390s對(duì)準(zhǔn)。為了轉(zhuǎn)移容器組件12至系統(tǒng)10,操作者可以滾動(dòng)鄰近系統(tǒng)10的臺(tái)車,從而使臺(tái)車399與系統(tǒng)10的導(dǎo)向裝置390對(duì)準(zhǔn)。容器組件12可以滑動(dòng)進(jìn)入系統(tǒng)10的槽390s進(jìn)入合適的操作位置,不需要操作者提升容器組件12。如圖28A和28B中示出的,工作表面200可以包括滾軸導(dǎo)向裝置381,382,當(dāng)在合適的位置時(shí),該滾軸導(dǎo)向裝置接觸容器12的下部。滾軸導(dǎo)向裝置382可以與彈簧383聯(lián)系,該彈簧可以向內(nèi)偏置容器12,從而相對(duì)于最內(nèi)部的槽壁390密合適配,以與機(jī)器人臂期望的對(duì)準(zhǔn),從而用于工作站位置的套準(zhǔn)。再次參照?qǐng)D3,工作站200可以支持溫度控制裝置,比如用于加熱和/或冷卻容器中的區(qū)域、器亞或目的目標(biāo)或位置的保溫裝置。這種裝置對(duì)本領(lǐng)域熟練技術(shù)人員是已知的。在一個(gè)實(shí)施例中,系統(tǒng)10包括熱循環(huán)控制裝置30,該熱循環(huán)控制裝置例如用于在一些核酸擴(kuò)增反應(yīng)或其它反應(yīng)或加工過(guò)程中控制PCR板610(圖6)或其它器亞或元件的溫度,以及用于在這種反應(yīng)過(guò)程中選擇性地覆蓋熱循環(huán)控制裝置30的熱循環(huán)控制裝置蓋機(jī)構(gòu)310。在一個(gè)實(shí)施例中,真空泵組件320和節(jié)流閥組件330在處理過(guò)程中提供隔離容器12中空氣的循環(huán)和真空的控制。真空泵組件320可以可+〉脫地接合一次性4吏用的真空頭1602和相關(guān)的管1650(圖23B)。工作表面200可以保持容器組件12,從而允許分光光度計(jì)1900s與由容器組件12保持的元件相聯(lián)系,如于此進(jìn)一步討論的。一個(gè)或多個(gè)注射泵350(例如示出了兩個(gè)泵)可以用于驅(qū)動(dòng)吸管頭220的抽吸和分配(圖2)。在一些實(shí)施例中,注射泵350可以用于例如從儲(chǔ)存器340,通過(guò)在圖2中示出的吸管頭適配器210,抽取工作流體,以便提供用于吸管頭220的操作的真空和壓力。工作流體可以基本上是不可壓縮的,并且可以例如包括大約50%乙醇的水溶液。可以-使用其它流體,甚至空氣。結(jié)合圖7和8在下面更詳細(xì)地描述泵機(jī)構(gòu)和吸管頭220的示范性實(shí)施例的附加細(xì)節(jié)。返回圖3,試管固定裝置360(也見(jiàn)圖19A中的分光光度計(jì)試管)可以與典型地居于機(jī)架70的下部中的分光光度計(jì)1900s耦合,以便在處理過(guò)程中以期望的操作提供自動(dòng)濃度測(cè)量。任意地,工作表面200可以包括一個(gè)或多個(gè)冷卻特征,例如熱交換器,比如被定位成接合隔離容器12的某些部分的冷卻器或Peltier冷卻板370和372,并且?guī)椭刂泼芊馊萜?2中的濕度和蒸氣濃度。桿380或其它機(jī)構(gòu)或裝置可以用于固定隔離容器進(jìn)入工作表面200上的位置。在一些實(shí)施例中,RNA處理系統(tǒng)可以以與4交大的生產(chǎn)系統(tǒng)和任何數(shù)據(jù)管理工具或系統(tǒng)隔離的獨(dú)立方式工作。內(nèi)部或外部計(jì)算機(jī)系統(tǒng)可以控制和/或監(jiān)控子系統(tǒng)的自動(dòng)化元件。使用者可以與接口60交互,例如用以操作系統(tǒng)和監(jiān)控狀態(tài)。在其它實(shí)施例中,系統(tǒng)10可以與其它系統(tǒng)或者監(jiān)控站聯(lián)系(其可以在不同的房間中或者甚至在不同的設(shè)備中)。在下面的部分中描述各個(gè)元件和裝置,以及使用的示范性方法的附力口細(xì)節(jié)。示范性的隔離容器參照隔離容器組件12,更詳細(xì)地描述盤14和柔性隔離物16。盤14包括內(nèi)部工作區(qū)18,并且可以包括多個(gè)插入物,凹槽,架或架裝配特^正和/或用于保持容器中的項(xiàng)目的站242,例如包括一個(gè)或多個(gè)架,歧管或用于保持器、吸管尖端、結(jié)合柱、其它物質(zhì)和/或其它消耗品的其它固定裝置,或者用于期望的實(shí)驗(yàn)或工藝的裝置。用以處理材料成期望完成狀態(tài)或產(chǎn)品的全部項(xiàng)目可被保持于容器中,也就是在處理過(guò)程中用于系統(tǒng)的消耗品可以是自主式和密封的,以便最小化污染容器的內(nèi)部的風(fēng)險(xiǎn),或者避免樣品受到環(huán)境或使用者的污染。隔離物16可以具有最外部的周邊部分16p(圖5),該最外部的周邊部分可^f皮布置成可;^脫或永久地密封盤14,例如圍繞在如圖5中示出的盤14的環(huán)狀邊緣452。當(dāng)隔離物16密封盤14時(shí),吸管頭220和/或另一樣品操縱工具或裝置的至少一部分從隔離物16延伸進(jìn)入工作區(qū)18。在一些實(shí)施例中,隔離物16沿著剛性頂部邊緣452接合盤14(圖.5)。隔離物16的最外部周邊部分16p可以抵靠頂部邊緣452(圖5)。頂部邊緣452可被布置為具有間隙空間的直立唇緣,該間隙空間接收相對(duì)于隔離物16夾緊的0-環(huán)(未示出),以便相對(duì)于盤14密封隔離物。為了產(chǎn)生封閉系統(tǒng)或環(huán)境,隔離容器盤14和隔離物16可被布置成在容器12中的項(xiàng)目和外部裝置、機(jī)構(gòu)和用于處理容器中的項(xiàng)目的一件件設(shè)備之間形成物理隔離。例如如圖4中所示,柔性熱循環(huán)控制裝置蓋密封430可被集成在盤14的壁450中。這種密封430可以封裝和限定接收蓋1010的套管或封閉通道(圖11),并且可以用于允許熱循環(huán)控制裝置蓋機(jī)構(gòu)310延伸蓋進(jìn)入盤14的側(cè)壁中的孔14a(圖5),以便通過(guò)熱循環(huán)控制裝置塊30在加熱過(guò)程中覆蓋樣品,同時(shí)在蓋機(jī)構(gòu)310和容器12的內(nèi)部區(qū)18中的項(xiàng)目之間提供物理隔離。而且,冷卻板370,372可以接合盤14的外部表面的部分,以便影響容器12中溫度的變化,同時(shí)不接觸隔離工作區(qū)中的任何項(xiàng)目。在一些實(shí)施例中,冷卻板可以接合容器12和/或盤14的外部表面的部分,以便控制保持在隔離工作區(qū)/空間內(nèi)部的項(xiàng)目(比如試劑)的溫度。類似地,如圖3中示出的,試管固定裝置360可以選擇性地接合從盤14的基座240延伸的試管660(圖6),以便執(zhí)行濃度和/或體積的測(cè)量,但是固定裝置360可以不接觸容器12中的任何項(xiàng)目。因此,在一些實(shí)施例中,僅僅被需要用以直接接觸樣品的試劑、消耗品和工具或裝置被容納在隔離容器中。這種結(jié)構(gòu)可以具有幾個(gè)優(yōu)點(diǎn)。例如可以在它的自身隔離環(huán)境中處理樣品和/或居于容器之外的處理設(shè)備將不接觸樣品,并因此被保護(hù)不會(huì)受到可能的污染。在處理的結(jié)束時(shí),在等分試樣管440(圖4)中可以收集期望數(shù)量的等分試樣,并從容器12被移走,例如不損害收集的樣品或隔離容器的完整性,如下將進(jìn)一步討論。在一些實(shí)施例中,例如在處理周期之后可以與被樣品材料污染的元件一起丟棄密封的隔離容器12。圖5和6示出了示范性的隔離容器12的一些元件的附加細(xì)節(jié),包括隔離盤14和柔性隔離物16。內(nèi)部工作區(qū)18可^L例如基座240和一個(gè)或多個(gè)壁450包圍,。隔離物16可以包括吸管頭220或其它裝置或工具,在下面單獨(dú)的部分中更詳細(xì)地對(duì)其進(jìn)行描述。隔離物16可浮皮布置成覆蓋或密封盤,例如在沿著盤14的環(huán)形邊緣452的密封510處,以使當(dāng)隔離物16密封盤14時(shí),工作區(qū)18是封閉的,典型地氣密的隔室。盤14可以基本上是剛性的,并且包括多個(gè)特征和/或站242。該多個(gè)特征和/或站可被模制、形成、連接或與盤集成,以便調(diào)節(jié)。下面元件的一些或者全部是可被集成進(jìn)入盤14的特征的例子*洗脫630和廢4牛630站;真空進(jìn)口和出口;分光光度計(jì)(濃度)試管660(圖WA);其它器亞或試管,例如體積測(cè)量試管2060(圖20A-E);*熱循環(huán)控制裝置PCR板610和/或利用溫度控制裝置可#1加熱和/或冷卻的其它基板或器^;架620中的試劑器皿622;架650中的吸管尖端651;*一個(gè)或多個(gè)附加尖端架650或其它設(shè)置的容器,例如用于使用的吸管尖端653;,結(jié)合柱岐管50,例如其可以包括用于核酸處理的一個(gè)或多個(gè)結(jié)合柱;以及*用于處理輸出的一個(gè)或多個(gè)等分試樣管440:例如核酸,比如(例如DNA,RNA,腫瘤總RNA和/或擴(kuò)增的腫瘤體外轉(zhuǎn)錄RNA等)孩i生物,細(xì)胞,藥劑等。在一些實(shí)施例中,柔性隔離物16密封和支持操縱工具,該操縱工具與隔離物的一側(cè)上的機(jī)器人裝置20接口,并且與隔離物16的內(nèi)部上的內(nèi)部元件接口。該工具可以包括吸管頭220和附加的操作特征,比如手柄520或用于接合內(nèi)部元件的其它特征或機(jī)構(gòu),比如用于分別在廢料和洗脫站632,630之間轉(zhuǎn)移歧管的結(jié)合柱歧管50上的手柄50h(圖5)。柔性隔離物16可以允許吸管頭220充分移動(dòng),以訪問(wèn)盤14中的全部所需的內(nèi)部元件。該頭220也可以接合結(jié)合柱歧管50,以能夠轉(zhuǎn)移結(jié)合柱歧管至廢料632和洗脫630站和/或從廢料632和洗脫630站轉(zhuǎn)移結(jié)合柱歧管。盡管未示出,內(nèi)部接口可以是多個(gè)串聯(lián)附著的接口。也就是說(shuō),對(duì)于封閉容器內(nèi)部的另一個(gè)操縱工具,該吸管頭或第一接口可以可松脫地被保持和交換。通過(guò)盤14和/或內(nèi)部操縱工具架(未示出)可以保持操縱工具的選擇?;旌掀骱?或離心機(jī)可以與盤協(xié)作,或者可被集成進(jìn)入盤,以便混合、均勻化、分離或混合或處理流體或樣品,比如生物樣品或期望的其它材料(未示出)。在其它實(shí)施例中,可以預(yù)先混合起始材料,并且然后被放置在架620中或另一位置處。該混合器可以是旋轉(zhuǎn)頭混合器,磁混合器或可以混合期望材料的均化器。示范性的吸管系統(tǒng)參照?qǐng)D7A和7B,包括吸管頭220和適配器210組件的吸管系統(tǒng)700可以用于在隔離容器12內(nèi)部執(zhí)行流體轉(zhuǎn)移。在保持封閉隔離容器設(shè)計(jì)中,吸管頭220可被布置成在被轉(zhuǎn)移的流體和吸管泵機(jī)構(gòu)之間保持阻隔。過(guò)濾器和/或柔性隔膜710可以在隔離容器12的內(nèi)部和外部之間提供抗污染的物理阻隔。在一些實(shí)施例中,為了提供高容積精確度(volumetricaccuracy),吸管系統(tǒng)700可以4吏用兩個(gè)正位移注射泵350-1,350-2,例如一個(gè)用于低體積轉(zhuǎn)移(例如在大約1m1和大約50ju1之間)和一個(gè)用于較高體積轉(zhuǎn)移(例如在大約51ju1和大約1000ju1之間)。在其它實(shí)施例中,可以采用具有不同儲(chǔ)存器的單獨(dú)泵腔室或具有計(jì)量工作流體的裝置的單獨(dú)儲(chǔ)存器。該泵腔室可被經(jīng)由(基本上剛性的)管和緩沖溶液(工作流體)而液壓連接至柔性隔膜710。該緩沖溶液可以基本上或全部是不可壓縮的液壓流體,該液壓流體可以減小或最小化吸管系統(tǒng)700的彈性。機(jī)器人臂230用于在工作空間中的期望位置處定位吸管頭220。為了減小吸管轉(zhuǎn)移過(guò)程中試劑帶出的可能,用完即可丟棄的尖端651可以用于流體處理。也就是說(shuō)在每一次轉(zhuǎn)移之后,使用的尖端可被扔進(jìn)"廢料"接收器,典型地進(jìn)入使用的架,并且來(lái)自無(wú)菌架或供給站的新的無(wú)菌的不同的尖端可以用于下一次轉(zhuǎn)移。在圖7A和7B中示出吸管系統(tǒng)700的示范性實(shí)施例的其它元件。在一些實(shí)施例中,吸管系統(tǒng)700被預(yù)先準(zhǔn)備好,以便在初始使用之前從吸管管線輸入液體并移走空氣,并且可以每次在不同的吸管頭220連接至吸管頭適配器210之前被預(yù)先準(zhǔn)備好,比如在新的封閉容器12的處理開(kāi)始時(shí)。例如,經(jīng)由電磁閥741,排出管線連接吸管頭中的排出端口至工作流體儲(chǔ)存器。在預(yù)先準(zhǔn)備好順序過(guò)程中可以打開(kāi)閥741,以便允許空氣從泵350通過(guò)流體管線222,223(圖8A)和吸管頭220祐:排出,并且反回至工作流體儲(chǔ)存器340。機(jī)器人臂230可被導(dǎo)引,以便定向吸管頭220中的流體管線,從而在準(zhǔn)備過(guò)程中使它們是有角度的。一旦系統(tǒng)700被準(zhǔn)備好,排出閥可被關(guān)閉,并且吸管頭220準(zhǔn)備執(zhí)行流體轉(zhuǎn)移。在RM處理結(jié)束時(shí),排出閥741可以用于排干流體管線222,223和吸管頭220。將流體管線填滿空氣可以在吸管頭的斷開(kāi)過(guò)程中避免流體溢出的可能性。圖8A和8B示出了用于通過(guò)吸管頭220轉(zhuǎn)移壓力至吸管尖端651,653的壓力轉(zhuǎn)移機(jī)構(gòu)800的操作的截面圖。在一些實(shí)施例中,例如來(lái)自儲(chǔ)存器340的液壓工作流體激勵(lì)柔性隔離隔膜710(也見(jiàn)圖8C和8D),并驅(qū)動(dòng)吸管動(dòng)作,同時(shí)保持工作流體和要被吸管抽吸的流體之間的物理分離。工作流體的儲(chǔ)存器可以位于隔膜710的一側(cè)上,其從另一側(cè)上相對(duì)于工作空氣被密封。柔性隔膜710位于工作流體340和內(nèi)部吸管尖端適配器220a(也就是吸管頭)和抽吸流體之間的頭部220中。圖15描述了沒(méi)有隔膜和上部組件的適配器220a。再次參照?qǐng)D8A和8B,隔膜710的位移影響隔膜710之下和吸管尖端適配器220中的工作流體體積700a,從而引起吸管尖端吸入或排放(典型地派給)一定量的液體。吸管系統(tǒng)700的總彈性可以直接涉及分配精確度。在一些實(shí)施例中,減小空氣體積700a可以提高吸管精密度和精確度。在一些實(shí)施例中,為了有助于試劑器皿,分光光度計(jì)試管660和PCR井中流體的徹底混合,可以采用重復(fù)的抽吸/分配周期和/或可以導(dǎo)引機(jī)器人臂230以多軸平移移動(dòng)吸管的尖端。在一些實(shí)施例中,盤14和/或吸管頭220可以包括用以允許^f吏用的尖端653從吸管尖端適配器220a(圖8B)被移走的一個(gè)或多個(gè)特征。如圖26A-26C中示出的,吸管頭220可以包括基于與靠近使用的吸管架650的容器的部分接觸而樞軸運(yùn)動(dòng)的桿221。如圖26C中示出的,容器側(cè)壁14w或保持于其上的部件可以是有角度的,以使基于與桿221的外端的接觸,桿221樞軸運(yùn)動(dòng),并且推動(dòng)使用的吸管尖端653離開(kāi)適配器220a,并進(jìn)入架650中的接收空間。也就是說(shuō),當(dāng)吸管頭220朝向使用的架650向下移動(dòng)時(shí),桿221接觸壁14w,其對(duì)桿的一端向上用力并對(duì)吸管尖端653上的末端向下用力,以便推動(dòng)使用的尖端進(jìn)入架650。也可以使用其它釋放結(jié)構(gòu)。例如,使用的架650可#:布置成限制吸管尖端653的向上運(yùn)動(dòng),以便從適配器220a拉動(dòng)、推動(dòng)或另外施加力或奪走尖端。吸管頭220和/或適配器210可以附著至流體管線和可^:升高的測(cè)壓元件導(dǎo)線,以便跳過(guò)(clear)柔性隔離物16以及柔性管道返回機(jī)架70。測(cè)壓元件導(dǎo)線與負(fù)載傳感器聯(lián)系,負(fù)載傳感器與無(wú)菌或新的吸管尖端聯(lián)系。測(cè)壓元件提供用于控制適配器220a上新的吸管的負(fù)載的數(shù)據(jù)。例如機(jī)器人臂可以以大約5N至大約50N之間的力4吏吸管頭220向下前進(jìn),以便表示吸管尖端651被合適地附著。適配器210也可以包括用于鎖定和解鎖至吸管頭220的適配器210的套圏,例如作為對(duì)接合/釋放手柄機(jī)構(gòu)的不受限制的替代。示范性的柔性隔離物圖9A-9E描述了依據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例的示范性的柔性隔離物16。任何合適的材料可以用于隔離物。隔離物16可以基本上對(duì)于空氣、濕氣和乙醇蒸汽不能滲透。隔離物16可被不損失充分的柔性或不影響滲透性地被模制。在一些實(shí)施例中,隔離物16包括低密度聚乙烯,但另外的替代可以包括氨基曱酸乙酯(urethane)材料的范圍。在具體實(shí)施例中,柔性材料是或包括"ARMORFLEX,,材料,從位于Frederica,Delaware的ILCDoverCompany可得到。柔性隔離物16的形狀可以允許充分的機(jī)器人運(yùn)動(dòng),并且吸管頭(或其它內(nèi)部接口)對(duì)隔離容器12的內(nèi)部進(jìn)行訪問(wèn)時(shí)不會(huì)限制或擠壓或碰到柔性隔離物。模制的柔性隔離物16的形狀可以基本上是自支持的(例如它將不陷落進(jìn)入隔離容器),一旦柔性隔離物16被密封至盤14就形成隔離容器12。在一些實(shí)施例中,隔離物16的部分910可以適于與用于操《從容器中的樣品的裝置集成,接收、保持該裝置,附著該裝置,與該裝置匹配,密封該裝置,支持該裝置或與該裝置交互,該裝置的例子包括吸管頭、另外的流體轉(zhuǎn)移裝置和/或其它操縱工具。部分910可以基本上是金屬部分。隔離物16可以包括被描述為"皺褶結(jié)構(gòu)"920的一個(gè)或多個(gè)折皺、褶狀物或起伏,其一些可以基本上彼此同心。圖9B描述了部分910可以包括至少一個(gè)階梯形部分17,如一系列基本上垂直定向的階梯形部分171517"173。在一系列實(shí)施例中,如例如在圖9C和9D中示出的,隔離物16可以包括一個(gè)或多個(gè)徑向皺褶結(jié)構(gòu)930。徑向和/或同心皺褶結(jié)構(gòu)可以有助于吸管頭(或者其它內(nèi)部操縱工具接口)的全部范圍的運(yùn)動(dòng),并且在吸管頭的運(yùn)動(dòng)過(guò)程中幫助控制隔離物形狀。輪緣"0,凸緣或其它特征可以用于夾緊、密封、固定、粘合或附著隔離物16至盤14。如在圖9C和9D中示出的,柔性隔離物16可以包括單一板材料,該單一板材料伸展或形成可以允許頭220的期望運(yùn)動(dòng)的一系列基本上同心的折皺、褶狀物或皺褶結(jié)構(gòu)。隔離板16t的外部周邊區(qū)域可以具有與中心區(qū)域16c不同的厚度。在一些具體實(shí)施例中,在制備過(guò)程中,在真空成形過(guò)程中較厚的材料可被向下?tīng)恳林行?,?dǎo)致隔離板16具有較薄的中心區(qū)域和較厚的周邊區(qū)域。中心區(qū)域16c可以包括一系列柱支(colimmated)梯級(jí)17「173,隨隔離物16遠(yuǎn)離工作空間18移動(dòng),/人4支小至較大布置。在其它實(shí)施例中,不是單一板材料,柔性隔離物16可以包括相同或不同的合適材料的多個(gè)共同結(jié)合(co-joined)密封部分(未示出)。圖9E描述了可密封地附著至吸管頭220的下部、以用于隨后與機(jī)器人臂20接合的柔性隔離物16。機(jī)器人臂耦合器910c居于隔離物16之外。圖9F描述了被布置成接合耦合器910c的協(xié)作耦合器210c。如圖9G中示出的,指狀物211;故布置成進(jìn)入耦合器主體910a中的孔,以便可松脫地接合隔離物16。在圖9H中示出該組件(沒(méi)有下部容器盤14)。示范性的熱塊裝置如圖10中所示,核酸處理系統(tǒng)可以結(jié)合熱塊組件1000或任4可其它溫度控制裝置。例如,核酸處理系統(tǒng)可以結(jié)合用于合成和擴(kuò)增核酸的熱循環(huán)控制裝置。熱塊組件1000可以包括例如熱(加熱器)塊30,其可被布置成接收多井的條或板,比如PCR板610,以及熱循環(huán)控制裝置加熱的蓋IOIO,其可^L蓋機(jī)構(gòu)310激勵(lì)以覆蓋PCR板610。例如在一些實(shí)施例中,熱循環(huán)控制裝置用于cDNA合成,cDNA擴(kuò)增,IVTRNA合成和工藝的DNA移走步驟。各種類型的熱塊和/或熱循環(huán)控制裝置是可利用的。如圖IO中所示,PCR板610可被結(jié)合進(jìn)入隔離容器盤14。在一些實(shí)施例中,PCR板610的周邊可被密封至形成于盤14的基座中的開(kāi)放(基本上矩形的)區(qū)域。板610的下部從盤的基座向下延伸,以便接合熱循環(huán)控制裝置加熱器塊30(典型地居于其中),同時(shí)板610中井611的開(kāi)口從密封容器12的內(nèi)部可訪問(wèn)。該P(yáng)CR板610可^:密封至隔離容器盤14,從而^f吏井611的向下延伸的部分可以直接接觸熱循環(huán)控制裝置或溫度控制裝置。在一些實(shí)施例中,合適的墊圈,O-環(huán)或其它合適的密封機(jī)構(gòu)可以用于附著PCR板610至隔離容器盤14。利用熱陷型(heatswaged)夾緊特征可以附著該合適的墊圈。在一些實(shí)施例中,超模制熱塑彈性體(TPE)密封1030用于附著和密封PCR板610至隔離容器盤14,如圖10中示出的。在其它實(shí)施例中,PCR板特征可以形成(比如才莫制和/或加工)為隔離容器盤基板。在其它實(shí)施例中,膠水,帶和/或粘合劑可以用于附著PCR板610至盤14。蓋(比如被加熱的熱循環(huán)控制裝置蓋1010)可以用于減小經(jīng)由蒸發(fā)反應(yīng)流體的損耗。蓋1010可以例如沿著柔性密封430排列,以便抑制蒸發(fā)流體從一些或每一個(gè)PCR井611逸出和/或用于保持容器12的內(nèi)部的隔離。蓋1010可被加熱,以便抑制蓋或除反應(yīng)混合物外的任何表面上的蒸汽冷凝。為了提供對(duì)全部PCR井的訪問(wèn),熱循環(huán)控制裝置蓋IOIO可被垂直提升,以便釋放密封壓力,然后帶上柔性蓋密封430基本上水平地縮回。用于控制蓋1010的自動(dòng)運(yùn)動(dòng)的驅(qū)動(dòng)系統(tǒng)310可浮皮裝配至處理系統(tǒng)10的工作表面200,如圖3中示出的。在其它實(shí)施例中,蓋驅(qū)動(dòng)系統(tǒng)310可被裝配在工作表面200之上或之下的其它位置處?,F(xiàn)在參照?qǐng)D11,示范性的蓋驅(qū)動(dòng)系統(tǒng)310被示出具有縮回位置中的蓋1010。臂1122被連接至蓋1010,并且與電動(dòng)機(jī)1150相聯(lián)系;這提供了蓋1010進(jìn)入容器12和從容器12出來(lái)的運(yùn)動(dòng),例如通過(guò)盤14的壁中的側(cè)面進(jìn)/出孔14a,其中在蓋1010和容器的內(nèi)部之間布置蓋密封(其可被描述為套管),如圖12中示出的。機(jī)器人工具或人工輸入也可以經(jīng)由密封430。圖13A描述了當(dāng)延伸時(shí)容器12中和蓋密封430的腔室430c內(nèi)部的蓋1010的示范性結(jié)構(gòu)。圖13B描述了縮回結(jié)構(gòu)中容器12外部的蓋1010。臂1122可被布置成垂直以及水平地導(dǎo)引蓋1010。在圖11和圖12中示出的實(shí)施例中,驅(qū)動(dòng)系統(tǒng)310包括提供蓋1010的垂直運(yùn)動(dòng)的垂直運(yùn)動(dòng)機(jī)構(gòu)1124,例如當(dāng)在容器12中的PCR板610上定位蓋1010時(shí)。垂直運(yùn)動(dòng)機(jī)構(gòu)1124可以提供足以用板610和/或塊30(圖IO)密封蓋1010的向下的力,例如利用一個(gè)或多個(gè)偏置元件。一個(gè)或多個(gè)電動(dòng)機(jī)1150,致動(dòng)器,齒輪,連鎖或其它電機(jī)械裝置可以用于驅(qū)動(dòng)水平和/或垂直運(yùn)動(dòng)。如圖12中示出的,驅(qū)動(dòng)系統(tǒng)310包括具有槽1123s的上板11"。臂1122包括在槽1123s中滑動(dòng)的龍骨1122k。驅(qū)動(dòng)系統(tǒng)310也包括經(jīng)由樞軸1127附著至上板1123的下板1126和偏置元件1152。垂直驅(qū)動(dòng)1124附著至上和下板1123,1126,并且被布置成向下拉動(dòng)上板以便當(dāng)蓋IOIO在容器內(nèi)部的延伸結(jié)構(gòu)中時(shí)向下給蓋1010施加力。驅(qū)動(dòng)系統(tǒng)310的一部分可^f皮物理附著至套管或蓋密封430的內(nèi)表面,以便有助于密封430隨著蓋1010合適地移動(dòng)。如示出的,在圖11中,在一些實(shí)施例中,真空杯1140可被結(jié)合在蓋1010上,以便接合柔性蓋密封430,并且在熱循環(huán)控制裝置蓋1010的垂直和水平運(yùn)動(dòng)過(guò)程中使密封430保持在合適的位置。在其它實(shí)施例中,可以其它方式附著蓋密封430,或者蓋密封430可以是充分柔性的,以便與蓋1010—致,并且隨其協(xié)調(diào)運(yùn)動(dòng)。在一些實(shí)施例中,為了有助于隔離容器12和柔性蓋密封430之間的可靠密封,夾緊板或其它夾緊元件可以用于相對(duì)于密封430的邊緣部分壓縮,比如經(jīng)由相對(duì)于盤14的外側(cè)壁的蓋密封上的一個(gè)或多個(gè)密封肋(未示出)。在其它實(shí)施例中,可以超模制(over-mold)蓋密封4!30至盤14,例如利用如上面關(guān)于PCR板610討論的TPE。O-環(huán),墊圏,粘合劑,帶和裝配或密封元件可以用于提供蓋密封430和盤l4之間的密封連接。圖13A示出了具有蓋1010的蓋機(jī)構(gòu)310和延伸進(jìn)入接合位置中的盤18的內(nèi)部區(qū)域的密封430,同時(shí)圖13B示出了蓋1010,并且通過(guò)容器14的壁縮出來(lái)。圖13A描述了在熱循環(huán)控制器和96-井板上的合適位置中的蓋1010。圖13C描述了具有延伸進(jìn)入容器18的內(nèi)部區(qū)域的蓋1010的蓋機(jī)構(gòu)310的部分側(cè)面透視切開(kāi)示意圖。示范性的廢料和洗脫系統(tǒng)各種提純裝置可以用于處理樣品,比如核酸,蛋白質(zhì),細(xì)胞,組織等等。這種提純裝置包括但不局限于磁珠(magneticbead),尺寸排除膜,結(jié)合板,過(guò)濾器和結(jié)合柱。這種裝置對(duì)本領(lǐng)域熟練技術(shù)人員是已知的。在一個(gè)實(shí)施例中,處理系統(tǒng)10利用從結(jié)合柱洗脫的技術(shù),以用于腫瘤總RNA分離,cDNA提純和IVTRNA提純。結(jié)合柱1410(圖14)可以包括硅膜。真空洗脫協(xié)議可^L集成進(jìn)入隔離容器設(shè)計(jì)。在其它實(shí)施例中,^茲洗脫協(xié)議可^皮集成進(jìn)入容器。可以使用一個(gè)或多個(gè)類型/尺寸的結(jié)合柱。例如在一些實(shí)施例中,使用結(jié)合柱(例如QiagenRneasyT"柱),因?yàn)樗鼈兙哂羞m用于被處理的RNA、cDNA和IVTRNA的定量的結(jié)合能力。附力口,較小的Qiagen"Mini"柱可被包括,以便提供用以濃縮RNA的能力。為了抑制廢料流體污染洗脫器皿,廢料和洗脫站632、630可#1分別分離,例如如圖6中示出的。在一些實(shí)施例中,岐管50用于保持結(jié)合柱(見(jiàn)圖14和15)。岐管50可被布置成保持各種尺寸/類型的一個(gè)或多個(gè)結(jié)合柱,例如Qiagen特大、中等和/或小型結(jié)合柱1410。岐管50可以包括用于每一個(gè)結(jié)合柱的井50w,形成用于吸管頭220的提升部件50h以便提升它的臂或提升部件,以及可以用于關(guān)閉不使用的結(jié)合柱的一個(gè)或多個(gè)可滑動(dòng)移動(dòng)的蓋1430。蓋1430可以包括允許頭220在期望方向上滑動(dòng)蓋1430的手柄1430h。在其它實(shí)施例中,岐管50可^:布置成保持在期望的處理過(guò)程中使用的其它類型的基板或裝置。提升部件50h可被布置為任何合適的提升,包括一個(gè)或多個(gè)手柄(如所述的),翼,凸緣或有助于站之間岐管50的運(yùn)動(dòng)的其它特征。圖15分別示出了用于在容器12的兩個(gè)或多個(gè)站或區(qū)之間(例如在廢^l"和洗脫站632,630之間)移動(dòng)岐管50的才幾構(gòu)和方法的例子。吸管頭220和機(jī)器人20可以用于在兩個(gè)站之間來(lái)回移動(dòng)結(jié)合柱岐管50和柱1410。在示出的實(shí)施例中,岐管50可以包括手柄50h,翼或與吸管頭220上的對(duì)應(yīng)特征520接口的其它特征,并且用于簡(jiǎn)化機(jī)器人和結(jié)合岐管50之間的接合。每一個(gè)隔離和提純過(guò)程可以使用不同組的柱;吸管頭機(jī)器人可以用于重新定位蓋1430,以便靠近合適組的不使用的柱。這減小或最小化了通過(guò)岐管50的氣流,允許在隔離和/或提純工藝步驟過(guò)程中泵產(chǎn)生充分高的真空。為了在消毒之后減小結(jié)合柱1410的操作者處理,柱1410可被載入在岐管50中,并且組件被密封進(jìn)入合適的包裝,并且在岐管50中被伽馬消毒。在使用和/或裝配設(shè)施(比如在合適的清潔房間中)處裝載隔離容器時(shí),操作者可以從岐管50移走包裝,并將它放置進(jìn)入廢料站632,甚至不需要直接處理結(jié)合柱。廢料和洗脫站結(jié)構(gòu)可以是柔性和/或可稱的。岐管50設(shè)計(jì)可以足夠大,以允許修改或使用來(lái)配合96井格式,或任何其它類型的板,井或柱,或者特大、中等和小型柱1410的組合的改變?,F(xiàn)在參照?qǐng)D16和17,洗脫站630可以包4舌洗脫盤1610,該洗脫盤被布置成捕獲結(jié)合柱的最后輸出(例如包括DNA、RNA等的流體)。為了抑制和/或避免DNA和RNA之間可能的交叉污染,在洗脫盤1610中每一個(gè)結(jié)合柱1410可以具有它自己的接收器1612,接收器1612低于結(jié)合柱1410。在一些實(shí)施例中,洗脫工藝可以采用高真空,其可以產(chǎn)生通過(guò)結(jié)合柱1410的顯著的氣流。該洗脫接收器1612可纟皮成形為允許飛濺流體(如果有的話)也流掉和匯聚進(jìn)入收集器皿中,同時(shí)使氣流偏離匯聚的流體。附加特征可以減小或最小化從另一個(gè)上的接收器通過(guò)的氣流。圖29A-29C提供盤1610的進(jìn)一步的討論。廢料站632可以包括廢料盤1630和廢料盤罩1640。廢料盤罩1640可被結(jié)合進(jìn)入廢料盤1630,以便最小化容納在廢料站632中廢料流體的蒸汽。該廢料盤罩1640可被成形為導(dǎo)引全部廢料流體向下流進(jìn)一個(gè)或多個(gè)(示出為中心)排出孔1641,其中它被保護(hù)不受廢料站632內(nèi)部罩1640之下主要?dú)饬鞯挠绊?。圖30A和30B描述了采用多個(gè)廢料排出孔1641的廢料盤罩1640的另一實(shí)施例,利用了基本上類似于洗脫盤1610成形的盤罩。在廢料盤罩1640之下的屏蔽環(huán)境中,直接在廢料流體之上的空氣可以保持高濕度,因此減小了進(jìn)一步的蒸發(fā)作用。關(guān)于圖30A和30B提供盤罩1640的進(jìn)一步討論。在一些實(shí)施例中,真空系統(tǒng)1600循環(huán)通過(guò)容器12的空氣。在一些實(shí)施例中,隔離容器真空系統(tǒng)1600被布置成消除了對(duì)于過(guò)濾器的需要。該真空系統(tǒng)可以包括管1650,典型地柔性管,經(jīng)由例如節(jié)流閥330(圖17)從泵頭1602;故連接至廢料632和洗脫630站。泵頭的出口將抽吸的空氣返回進(jìn)入隔離容器12。圖17示出了依據(jù)真空系統(tǒng)1600的實(shí)施例的循環(huán)路徑。在該實(shí)施例中,在制造過(guò)程中,管1650和可任意處置的泵頭1602可被連接至隔離容器盤14。這些可被消毒,并且作為與隔離容器盤14相聯(lián)系的組件的一部分被裝運(yùn)。一旦裝載和密封隔離容器12,真空系統(tǒng)1600在所有其余處理中都可以保持封閉。在隔離容器安裝進(jìn)入處理系統(tǒng)10的過(guò)程中,真空管1650可被插進(jìn)節(jié)流閥330,并且可任意處置的泵頭1602連接至真空泵320。在一些實(shí)施例中,當(dāng)需要真空時(shí),僅泵320工作。節(jié)流閥330可以用于導(dǎo)引真空至合適的站。當(dāng)完成處理時(shí),從閥330可以取出管1650,并從泵320斷開(kāi)泵頭1602。連同隔離容器12的剩余部分,管1605和泵頭1602可以是一次性^f吏用的。圖18示出了處理系統(tǒng)10的工作表面上適當(dāng)位置處盤14的切開(kāi)示意圖,示出了節(jié)流閥330和可任意處置的泵頭1602的示范性位置。Peltier板370和372可以分別提供用于盤14的后壁14p的部分和用于盤14的基座中廢料站集水的冷卻。該壁部分14p可以基本上是平面的(典型地基本上垂直的,但可以是有角度的),并且向內(nèi)凸出,以便限定用于板372的接收空間。該壁14p可被布置成與板372協(xié)作,以便限定冷凝壁。在圖18中需要指出,熱循環(huán)控制裝置蓋驅(qū)動(dòng)系統(tǒng)310被示出具有延伸進(jìn)入容器的蓋,沒(méi)有示出合適位置處的密封430和可任意處置的泵頭1602,沒(méi)有合適位置處的柔性真空泵管1650。示范性的過(guò)程控制和/或產(chǎn)物測(cè)量系統(tǒng)在一些實(shí)施例中,可以使用可任意處置的試管660,2060,例如如在圖19A和圖20F中示出的。一個(gè)或多個(gè)試管660,2060可被固定或可松脫地裝配至隔離容器盤14,例如以使試管660,2060從盤14的底部向下垂直延伸。在一些實(shí)施例中,利用分光光度計(jì)1900s(圖3,19B)和試管660(圖19A,20F)可以測(cè)量例如核酸或蛋白質(zhì)等樣品的濃度和/或純度,或者例如熒光計(jì)等用于濃度測(cè)量的其它光學(xué)方法可被類似地結(jié)合進(jìn)系統(tǒng)中。在一些實(shí)施例中,如圖19A中示出的,經(jīng)由比如墊圈或O-環(huán)等柔性密封元件1918,—個(gè)或多個(gè)可任意處置的濃度試管660被密封裝配至盤14。該盤14包括接合夾具1920以相對(duì)于密封元件1918緊密保持試管660的裝配元件14m,因此密封試管660至盤14,并保持隔離容器內(nèi)部的密封處理環(huán)境。如示出的,試管660可以包括形成為剛性上緣661的外部邊緣。夾具1920包括相對(duì)于緣1901存在的內(nèi)部直立臂1921和接合裝配元件14m以相對(duì)于盤14給試管660施加力的外部臂1922。試管660典型地在其下部處包括試管測(cè)量窗660w??商娲?,試管660(或試管2060)可被模制進(jìn)入盤,超模制,機(jī)械夾緊,溶劑結(jié)合,粘附等。分光光度計(jì)1900s(圖3)可被裝配在處理系統(tǒng)10上,例如在隔離容器12之下。分光光度計(jì)1900s可被布置成通過(guò)試管660(圖20F)進(jìn)行吸收率測(cè)量,同時(shí)保持在隔離容器之外。在一些實(shí)施例中,存在用于每一個(gè)測(cè)量的試管660,2060,以使沒(méi)有試管需要被重新使用。處理系統(tǒng)10可被布置成對(duì)于如需要的每一次測(cè)量從試管660至660移動(dòng)分光光度計(jì)試管固定裝置360(例如見(jiàn)圖3,19B)。在一些實(shí)施例中,可以從盤14移走試管660和/或2060,在隨后的盤14中清洗和重新使用。在其它實(shí)施例中,可移動(dòng)的試管660,2060僅是一次使用的(也就是一次性使用的)。各種類型的分光光度計(jì)是已知的,并且可被采用用于核酸濃度和純度測(cè)量。該分光光度計(jì)1900s能夠與和處理系統(tǒng)10聯(lián)系的控制器相聯(lián)系,并凈皮和處理系統(tǒng)IO聯(lián)系的控制器控制。例如,處理系統(tǒng)10可以命令分光光度計(jì)1900s進(jìn)行測(cè)量,并且分光光度計(jì)1900s能夠返回吸收率測(cè)量,典型地在紫外波長(zhǎng)處,比如在大約260和/或280nm處,或者在任何其它感興趣的波長(zhǎng)處。此外,分光光度計(jì)1900s的幾何形狀,并且特別是試管固定裝置360的幾何形狀可與整個(gè)系統(tǒng)的其它部件集成。圖19B描述了用于在多個(gè)試管660之間移動(dòng)單個(gè)檢測(cè)器頭的分光光度計(jì)頭部機(jī)構(gòu),在圖20F中示出為(4)試管660。機(jī)器人操作平臺(tái)可以用于定位分光光度計(jì)試管固定裝置360,例如以便升高,降低和在試管660之間^爭(zhēng)越。分光光度計(jì)1900s和光源可^皮裝配在系統(tǒng)的電拒中,例如在系統(tǒng)的左側(cè)或右側(cè)上。光纖可以用于允許試管固定裝置360移動(dòng),同時(shí)分光光度計(jì)1900s和光源保持靜止。也就是說(shuō),如在圖19B中示出的,分光光度計(jì)驅(qū)動(dòng)機(jī)構(gòu)可以用于移動(dòng)單個(gè)檢測(cè)器頭1900h,以便連續(xù)保持不同試管660的每一個(gè)。經(jīng)由多個(gè)(典型地兩個(gè))光纖,檢測(cè)器頭1900h中的檢測(cè)器可被耦合至分光光度計(jì)1900s。在其它實(shí)施例中,每一個(gè)試管660可被定位在單獨(dú)的試管固定裝置360中,并且光源在連接光源至多個(gè)試管固定裝置(未示出)的光纖之間被開(kāi)關(guān),以與用于測(cè)量的分光光度計(jì)相聯(lián)系。樣品的體積測(cè)量可以用于與濃度測(cè)量結(jié)合,以便確定產(chǎn)物。在一些實(shí)施例中,體積測(cè)量單元2000利用專用器亞中的流體傳感器和吸管系統(tǒng),例如如在圖20A-20E中示出的。例如圖20A示出了檢測(cè)器頭2002中空的試管2060,其中來(lái)自兩個(gè)IR發(fā)射器2010的光不通過(guò)試管2060,并且通過(guò)用于反射光的兩個(gè)IR接收器2020被接收。*當(dāng)要被測(cè)量流體2040被存儲(chǔ)于測(cè)定體積的試管中時(shí),例如如圖20B中示出的,來(lái)自兩個(gè)IR接收器2020的光被傳輸通過(guò)試管2060和流體2040,并且不被用于反射光的兩個(gè)IR接收器2020接收。在控制系統(tǒng)監(jiān)控在測(cè)量器亞2060的底部處由系統(tǒng)2000檢測(cè)的流體的存在時(shí),吸管頭220用于抽吸樣品2040進(jìn)入吸管尖端651,如圖20C中示出的。*如圖20D中示出的,當(dāng)傳感器系統(tǒng)2000報(bào)告流體不存在時(shí),注射泵350(圖3)可—皮停止,并且可以電子確定和記錄抽吸體積。因此,試管2060具有底部中的棱鏡設(shè)計(jì)。利用光源,使用檢測(cè)器,設(shè)備可以根據(jù)反射確定試管2060中流體的存在或不存在。因此,結(jié)合吸管裝置,通過(guò)測(cè)量液體確定體積,直至接收沒(méi)有流體存在的信號(hào)它才被移走。圖20E描述了系統(tǒng)2000,其可以采用多個(gè)隔開(kāi)的沖全測(cè)器塊2002,每一個(gè)具有它自身的一對(duì)發(fā)射器2010。每一個(gè)塊2002可被布置成保持各個(gè)試管并與各個(gè)試管協(xié)作,以用于利用體積測(cè)量系統(tǒng)2000獲得體積測(cè)量。如圖20F中示出的,盤14可以包括多個(gè)體積試管2060(例如體積測(cè)量試管)和多個(gè)分光光度計(jì)試管660(試管660可以用于濃度測(cè)量)。該分光光度計(jì)試管660可以是標(biāo)準(zhǔn)的UV可視塑料,其可任意處置,比如BioRad"trUViewcuvettes",該裝置10可以包括用于測(cè)量的分光光度計(jì)元件。可以從OceanOptics獲得合適的分光光度計(jì)元件,商業(yè)位置在Dunedin,F(xiàn)lorida^示范性的工藝成分存儲(chǔ)系統(tǒng)在一些實(shí)施例中,試劑器皿用于容納試劑、樣品和隔離容器12中流體組合的混合體積。具有各個(gè)不同容積的試劑器皿可被用于容納工藝過(guò)程中使用的流體體積范圍。為了減小試劑污染,蒸發(fā)或溢出的風(fēng)險(xiǎn),容納試劑的每一個(gè)器皿在裝載進(jìn)入盤14之前,可被密封,典型地在上表面上,比如利用內(nèi)襯聚丙烯箔。該密封可被布置成被吸管尖端651刺破。該密封允許試劑被裝載和密封進(jìn)入合適的試劑器皿,并且被沒(méi)有污染、溢出或蒸發(fā)地存儲(chǔ)。在圖21A中示出試劑架620的例子。架620可以具有任何期望的布置,可以容納任何試劑器皿尺寸,并且可以適用于任何工藝。在示出的例子中,試劑盤或架620包括用來(lái)裝不同尺寸的多個(gè)器皿2110、2112、2114(典型的,管),以及混合器皿的基座,器皿2110、2112、2114可以容納例如樣品或試劑。每一個(gè)器皿可被支持在基座2100中,并且罩2120可被夾住或附著在架620之上,以便確保器皿保持在合適位置。該罩2120包括孔,以允許吸管尖端訪問(wèn)保持在其下的器皿。在一些實(shí)施例中,試劑、樣品或其它流體可被作為子組件裝載進(jìn)入架620,并且架620然后浮皮裝載進(jìn)入盤14。在一些實(shí)施例中,試劑架620的設(shè)計(jì)是這樣的它僅被在一個(gè)方向上放置進(jìn)入隔離容器中??商娲?,試劑架620可被模制或制成隔離容器盤14的集成部分。試劑可被直接裝載進(jìn)入容納可被放置在試劑盤中的試劑的集成試劑盤或管或其它器皿。限定的架位置(地址)處器皿2110,2112,2114的放置允許機(jī)器人接口在過(guò)程中在正確的時(shí)間處自動(dòng)接合正確的器皿(試劑)。在一些實(shí)施例中,盤布置允許對(duì)全部器皿的訪問(wèn),不需要吸管尖端不得不在其它不同的試劑上通過(guò),并因此減小試劑交叉污染的機(jī)會(huì)。當(dāng)然,可以使用其它結(jié)構(gòu),例如根據(jù)將被執(zhí)行的期望工藝。圖21B描述了可以用于分別打開(kāi)器皿2110,2112,2114上的密封的多點(diǎn)(示出為三點(diǎn))刺穿次序,在收回(試劑)流體之前。也就是說(shuō),在移動(dòng)至實(shí)際的收回刺穿(典型地在中心位置處)之前,吸管651可祐二導(dǎo)引刺穿在兩個(gè)外部位置處覆蓋的密封,以便有助于刺穿精確度。示范性的等分試樣移走系統(tǒng)在系統(tǒng)10的自動(dòng)處理過(guò)程中,樣品和/或產(chǎn)品的一個(gè)或多個(gè)等分試樣可以用于處理評(píng)估,控制,質(zhì)量測(cè)試和/或存儲(chǔ),以用于進(jìn)一步的處理(例如見(jiàn)圖4和5中的等分試樣管)。在一些實(shí)施例中,隔離容器12和處理系統(tǒng)IO允許在處理過(guò)程中移走等分試樣,而不損害隔離容器12的密封特征。多個(gè)柔性管可以與容器12的內(nèi)部樣品捕獲區(qū)域流體聯(lián)系,并且從系統(tǒng)10延伸,以使操作者可在外部訪問(wèn)。每一個(gè)柔性管被預(yù)先密封或具有封閉的端部。每一個(gè)等分試樣可被吸進(jìn)各個(gè)標(biāo)記的容器440,例如管,同時(shí)容器12保持封閉。操作者或自動(dòng)的密封器可以將等分試樣密封進(jìn)入管440,例如流體的捕獲等分試樣的上游,比如通過(guò)利用RF管密封器,或其它密封封閉機(jī)構(gòu)。一旦被密封,從隔離容器可以分開(kāi)等分試樣管,并且被拿走,以用于存儲(chǔ),測(cè)試或進(jìn)一步的處理。在一些實(shí)施例中,等分試樣裝置40用于抽吸等分試樣流體進(jìn)入管440,并采用夾緊元件和等分試樣管440的彈性,以便從容器12內(nèi)部將流體吸入管。該機(jī)構(gòu)可被自動(dòng)化,以便有助于管被夾緊短的時(shí)間,從而減小通過(guò)夾緊變形引起的管的彈性的任何改變的可能性。圖22描述了利用等分試樣裝置40的示范性方法2200,并且示出了可以用于使等分試樣管440裝載等分試樣流體445的一系列步驟(從左至右和從上到下)。如示出的,具有封閉端441的等分試樣管440密封附著至井14w下的盤14。在該例子中,相對(duì)于一個(gè)或多個(gè)等分試樣管440擠壓夾緊元件(管擠壓器)2210,以便從管(如通過(guò)第二和第三圖示出的)排出空氣。響應(yīng)管被夾子2210完全壓縮,從而排出空氣(利用相對(duì)于管和其它夾緊表面對(duì)上夾緊元件向下用力)在此同時(shí)或之后,等分試樣物質(zhì)445被放置或分配在與管440相聯(lián)系的井14w中?;趭A緊力的隨后松脫,通過(guò)彈性管中的負(fù)壓,等分試樣流體445被吸入管"0。管密封器(比如RF焊機(jī))可以用于密封(在"2處),并且任意切斷密封的等分試樣管上游,以便隔離管中的樣品445。也可以使用其它密封劑機(jī)構(gòu)。裝配容器的示范性方法圖23A是成套工具2500的分解表示,提供該成套工具以允許操作者制備用于處理的封閉系統(tǒng)。成套工具2500可以包括盤14,結(jié)合歧管50,吸管尖端架650(以及吸管尖端651)和試管2060、660。具有附著的等分試樣管440和/或附著的相關(guān)管和真空頭的盤14可被封裝和裝運(yùn)至使用位置。該元件可被消毒并包裝在用于裝運(yùn)和處理的無(wú)菌包裝中(或包裝,然后消毒)。該元件可在使用處一皮表面消毒,并且元件的裝配可以在等級(jí)10000,1000或甚至100的清潔房間中。也可以單獨(dú)提供該元件,或以其它組合預(yù)先裝載。圖23B是圖23A中示出的成套工具的部分裝配圖。圖23C是在圖23B中示出的部分裝配的成套工具的底視圖。圖23D是在利用容器或盤14裝運(yùn)的離散元件的裝配或與容器或盤14分離的離散元件的裝配之前在圖23A中示出的容器14的頂^L圖。圖24描述了依據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例(例如對(duì)于無(wú)菌處理來(lái)自一個(gè)或多個(gè)生物樣品的核酸)分別密封隔離容器12的示范性方法。對(duì)于這種無(wú)菌處理,隔離容器組件12的隔離物16和盤14部分可被單獨(dú)預(yù)先包裝和消毒。當(dāng)隔離容器14被需要用于處理時(shí),盤14和隔離物16可被轉(zhuǎn)移至生物安全拒或用于裝載的類似清潔、受控區(qū)域。如圖23A中示出的,隔離容器12的盤14可以裝載包括被用于期望的處理的樣品和試劑的一個(gè)或多個(gè)試劑盤620。如上面討論的,利用臺(tái)車399(圖27)上的盤14可以進(jìn)行盤14的裝配和/或裝載。一個(gè)或多個(gè)吸管尖端架650和組合柱歧管50也可以被裝載進(jìn)入盤14的工作區(qū)18。在一些實(shí)施例中,一個(gè)或多個(gè)試管660,206(M皮附著至盤的基座,例如如圖20F中示出的。根據(jù)被執(zhí)行的期望試驗(yàn)或處理,其它樣品,分析物,試劑,器皿,其它消耗品,裝置,工具和/或其它項(xiàng)目可被裝載進(jìn)入盤14。在一些實(shí)施例中,在全部期望項(xiàng)目被放置進(jìn)入盤14或附著至盤14之后,隔離物16可被附著至盤14,以便密封裝配的隔離容器12,例如如圖24中示出的。在一些實(shí)施例中,0-環(huán)2400可以用于密封柔性隔離物16至盤14。在隔離物16上可以適當(dāng)?shù)貙?duì)O-環(huán)用力,并且O-環(huán)可被適當(dāng)?shù)貕哼M(jìn)盤14上的周邊槽。在其它實(shí)施例中,可以使用一個(gè)或多個(gè)墊圈,夾子,緊固件,粘合劑和/或其它連接裝置。如圖27中示出的,在運(yùn)輸過(guò)程中盤14可被鎖定至臺(tái)車上的固定表面。在盤14被裝載隔離物16或用隔離物16密封盤14之后,隔離容器12可被轉(zhuǎn)移至處理系統(tǒng)10的工作表面??商娲兀綦x容器可被裝配和消毒。然后,利用標(biāo)準(zhǔn)的無(wú)菌轉(zhuǎn)移方法或通過(guò)其它封閉裝置,試劑和樣品可被引入密封的隔離容器。臺(tái)車也可以用于在裝配過(guò)程中保持盤14??商娲?,當(dāng)裝配隔離容器12(未示出)時(shí),可以使用單獨(dú)的隔離裝置臺(tái)車裝配車。這種隔離裝置臺(tái)車可被結(jié)合進(jìn)入隔離裝置自身,并且可以如上面討論地匹配運(yùn)輸臺(tái)車。隔離容器組件12可被安裝進(jìn)入系統(tǒng)10,并且連接至用于處理樣品的每一塊設(shè)備。為了確保正確的對(duì)準(zhǔn),剛性盤14在工作表面200上可被夾緊。柔性隔離物16和吸管頭220可以連接至機(jī)器人吸管頭適配器210(例如見(jiàn)圖2)。例如如示出的,在圖12中,熱循環(huán)控制裝置蒸發(fā)密封430可以連接至熱循環(huán)控制裝置蓋1010,例如利用真空杯1140或其它固定或附著裝置,并且用于廢料和洗脫站的可任意處置的泵頭和真空管被適配至對(duì)應(yīng)的閥和泵。為了移走隔離容器,可以使用相反的程序。圖25是依據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例可以在制造位置處實(shí)施的操作的流程圖。如示出的,提供輸入樣品3000(典型地從病人采集位置或?qū)ο髽颖敬鎯?chǔ)位置)。當(dāng)時(shí)間敏感時(shí),為了12-48小時(shí)(比如整夜)之內(nèi)制造位置處的接收,可以裝運(yùn)樣本。在制造位置處,在隔離裝置(塊3010)中準(zhǔn)備隔離容器12,并且在放置在容器(例如均勻化,混合和/或離心的)之前,也可以準(zhǔn)備(塊3000p)樣品。隔離容器元件的外部包裝,例如盤14,隔離物16和容器內(nèi)容可被消毒(塊3002)。裝配和密封的隔離容器可以裝配(塊3004)和完整性測(cè)試(塊3006),以便確認(rèn)密封狀態(tài)。封閉裝配的隔離容器可被移動(dòng)至用于處理的設(shè)備(塊3020)。如示出的,利用硅隔膜柱和合適的RNA結(jié)合和洗脫試劑可以分離(塊3022)來(lái)自病人樣品的RNA。為了計(jì)算產(chǎn)出,執(zhí)行濃度和體積確定,并且標(biāo)準(zhǔn)化濃度(塊3024)。cDNA通過(guò)反轉(zhuǎn)錄(RT)反應(yīng)被合成,通過(guò)PCR被擴(kuò)增,以及利用硅膜柱和合適的RM結(jié)合和洗脫試劑被提純(塊3026)。執(zhí)行濃度和體積確定,以便計(jì)算產(chǎn)出,并且標(biāo)準(zhǔn)化濃度(塊3028)。從得到的cDNA產(chǎn)生IVTRM,利用DNase進(jìn)行處理,并且利用硅膜柱和合適的RNA結(jié)合和洗脫試劑提純(塊3030)。執(zhí)行濃度和體積確定,以便計(jì)算產(chǎn)出,并且標(biāo)準(zhǔn)化濃度(塊3032),產(chǎn)生最后擴(kuò)增的RNA(塊3034)。對(duì)可任意處置的RNA進(jìn)行完整性檢查(塊3036),以便確認(rèn)該系統(tǒng)仍是被密封的,并且從環(huán)境隔離,從而確保在處理過(guò)程中不存在污染。中間和/或最后產(chǎn)品可被作為一個(gè)或多個(gè)等分試樣量輸出(塊3050)。圖29A-29C示出了示范性的洗脫盤1610。如示出的,接收器1612被間隔開(kāi)并具有角度,以便在各個(gè)接收器1612的使用過(guò)程中抑制濺出。兩個(gè)或多個(gè)接收器1612位于向上延伸的隔離物1614的每一側(cè)上,并且主要管狀接收部分1615合并為淺的通道1616,當(dāng)它朝向管狀體部分1615移動(dòng)時(shí),該淺的通道向下逐漸變細(xì),并越來(lái)越深和狹窄。通道1616的向前部分也向內(nèi)和向下逐漸變細(xì),以便捕獲飛'賊和導(dǎo)引流體流至主要管部1615。圖30A-30B描述了用于廢料盤罩1640的類似結(jié)構(gòu),但是接收器的尖端1632是開(kāi)放的,或者具有用于排出廢料進(jìn)入廢料站(圖16)的孔。圖31是與傳感器4010,4020,4030聯(lián)系的控制電3各4000的示意性描述,該傳感器可以用于監(jiān)控容器的內(nèi)部的狀態(tài),或提供期望的反饋,以便允許元件(加熱器,冷卻器,機(jī)器人臂運(yùn)動(dòng)等)的自動(dòng)控制。如示出的,控制電路4000可以與用戶接口61(圖1)聯(lián)系。傳感器可以包括負(fù)載檢測(cè)器4010,溫度傳感器4020和壓力傳感器4030。負(fù)載檢測(cè)器4010可以與新的吸管架聯(lián)系,以便提供用于控制通過(guò)機(jī)器人臂施加的用來(lái)接合新吸管的接合力的負(fù)載力數(shù)據(jù)。溫度傳感器4020可以提供關(guān)于封閉容器環(huán)境中的內(nèi)部環(huán)境或具體位置(例如一個(gè)或多個(gè)工作站)的溫度數(shù)據(jù)。壓力傳感器4030可以用于監(jiān)控隔離或提純程序過(guò)程中封閉環(huán)境和/或真空的密封完整性狀態(tài)??梢允褂脗鞲衅鞯拿恳粋€(gè)或一些的多個(gè)傳感器,并且也可以使用其它傳感器??刂齐娐?000可以整個(gè)或部分居于系統(tǒng)10中,或者整體或部分在容器12上。如本領(lǐng)域熟練技術(shù)人員可以理解的,本發(fā)明的實(shí)施例可^^皮具體化為方法,系統(tǒng),數(shù)據(jù)處理系統(tǒng)或計(jì)算機(jī)程序產(chǎn)品。因此,本發(fā)明可以采用整個(gè)軟件實(shí)施方式或組合軟件和硬件方面的實(shí)施方式的形式,通常于此全部被稱作"電路"或"模塊"。進(jìn)一步地,本發(fā)明可以采用基于具有在介質(zhì)中被具體化的計(jì)算機(jī)可用程序代碼的計(jì)算機(jī)可用存儲(chǔ)介質(zhì)使用計(jì)算機(jī)程序產(chǎn)品的形式??梢圆捎萌魏魏线m的計(jì)算機(jī)可讀介質(zhì),包括硬盤,CD-ROMs,光學(xué)存儲(chǔ)裝置,比如支持因特網(wǎng)或內(nèi)部網(wǎng)的那些的傳輸介質(zhì),或磁或其它電存儲(chǔ)裝置。用于實(shí)施本發(fā)明的操作的計(jì)算機(jī)程序代碼可寫入PLC碼,比如Graph,Ladder或SCL。然而,計(jì)算機(jī)代碼可祐:替代或附加地寫入目標(biāo)定向編程語(yǔ)言,比如Java,Smalltalk或0++和/或傳統(tǒng)的程序編程語(yǔ)言,比如"C"編程語(yǔ)言或在一見(jiàn)覺(jué)定向編程環(huán)境中,比如VisualBasic。程序代碼的某些部分(或全部)可以全部在一個(gè)或多個(gè)該系統(tǒng)的計(jì)算機(jī)上執(zhí)行你,作為獨(dú)立的軟件包,部分在系統(tǒng)計(jì)算機(jī)上執(zhí)行,部分在系統(tǒng)計(jì)算機(jī)和部分在遠(yuǎn)程計(jì)算機(jī)上執(zhí)行,或整個(gè)在遠(yuǎn)程計(jì)算機(jī)上執(zhí)行。在后者情況中,通過(guò)局域網(wǎng)(LAN)或廣域網(wǎng)(WAN),遠(yuǎn)程計(jì)算機(jī)可被連接至系統(tǒng)計(jì)算機(jī),或者可以進(jìn)行至外部計(jì)算機(jī)的連接(例如通過(guò)利用因特網(wǎng)服務(wù)供應(yīng)商的因特網(wǎng))。在一些實(shí)施例中,可以在本地計(jì)算機(jī)上執(zhí)行一些程序代碼,并且可以在一個(gè)或多個(gè)本地和/或遠(yuǎn)程服務(wù)器上執(zhí)行一些程序代碼。利用從成像形態(tài)提供的體積數(shù)據(jù)集,可以實(shí)時(shí)或接近實(shí)時(shí)或離線進(jìn)行通信。參照依據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例的方法,系統(tǒng),計(jì)算機(jī)程序產(chǎn)品和數(shù)據(jù)和/或系統(tǒng)體系結(jié)構(gòu)的流程圖和/或方塊圖部分描述本發(fā)明??梢岳斫?,通過(guò)計(jì)算機(jī)程序指令可以執(zhí)行描述的每一塊和/或塊的組合。這些計(jì)算機(jī)程序指令可被供給至通用計(jì)算機(jī)、專用計(jì)算機(jī)或其它可編程數(shù)據(jù)處理設(shè)備的處理器,以便制造機(jī)器,從而使經(jīng)由計(jì)算機(jī)處理器或其它可編程數(shù)據(jù)處理設(shè)備執(zhí)行的指令產(chǎn)生用于實(shí)施在一個(gè)塊或多個(gè)塊中指定的功能/動(dòng)作的手段。這些計(jì)算機(jī)程序指令也可被存儲(chǔ)進(jìn)計(jì)算機(jī)可讀存儲(chǔ)器或可以使計(jì)存儲(chǔ)^計(jì)算;可讀^"儲(chǔ)器或存儲(chǔ)裝置中^指令產(chǎn)生包:指令手段的制造品。該指令手段可以執(zhí)行在一個(gè)塊或多個(gè)塊中指定的功能/動(dòng)作。計(jì)算機(jī)程序指令也可被載入計(jì)算機(jī)或其它可編程數(shù)據(jù)處理設(shè)備,以在計(jì)算機(jī)或其它可編程設(shè)備上執(zhí)行的一系列操作步驟,從而產(chǎn)生計(jì)算機(jī)實(shí)施的處理,使在計(jì)算機(jī)或其它可編程設(shè)備上執(zhí)行的指令提供用于執(zhí)行在一個(gè)塊或多個(gè)塊中指定的功能/動(dòng)作的步驟。如圖32中所述的,本發(fā)明的實(shí)施例可^L布置為數(shù)據(jù)處理系統(tǒng)4116,其可以用于實(shí)施或指導(dǎo)繪制(rendering)的操作,并且可以包括處理器電路4100,存儲(chǔ)器4136和輸入/輸出電路4146。該數(shù)據(jù)處理系統(tǒng)可被結(jié)合進(jìn)例如可編程邏輯控制器(PLC),個(gè)人計(jì)算機(jī),工作站,服務(wù)器,路由器等的一個(gè)或多個(gè)中。系統(tǒng)4116可以居于一個(gè)機(jī)器上,或居于多個(gè)機(jī)器之間。處理器4100經(jīng)由地址/數(shù)據(jù)總線4148與存儲(chǔ)器4136通信,并且經(jīng)由地址/數(shù)據(jù)總線4149與輸入/輸出電路4146通信。輸入/輸出電路4146可以利用例如因特網(wǎng)協(xié)議(IP)連接,在存儲(chǔ)器(存儲(chǔ)器和/或存儲(chǔ)介質(zhì))4136和另一個(gè)計(jì)算機(jī)系統(tǒng)或網(wǎng)絡(luò)之間傳輸信息。這些元件可以是傳統(tǒng)的元件,比如用于多種傳統(tǒng)的數(shù)據(jù)處理系統(tǒng)中的那些,其可被布置成如于此所述地工作。具體地,處理器4100可以是市場(chǎng)上可買到的,或是定制微處理器,微控制器,數(shù)字信號(hào)處理器等。存儲(chǔ)器4136可以包括包含軟件和數(shù)據(jù)的任何存儲(chǔ)裝置和/或存儲(chǔ)介質(zhì),該軟件和數(shù)據(jù)用于實(shí)施依據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例使用的功能電路或模塊。該存儲(chǔ)器4136可以包括但不局限于下面類型的裝置ROM,PROM,EPR0M,EEPR0M,閃存,SRAM,DRAM和磁盤。在本發(fā)明的一些實(shí)施例中,存儲(chǔ)器4136可以是內(nèi)容可尋址存儲(chǔ)器(CAM)。如圖32中進(jìn)一步所述的,存儲(chǔ)器(和/或存儲(chǔ)介質(zhì))4136可以包括用于數(shù)據(jù)處理系統(tǒng)的幾類軟件和數(shù)據(jù)操作系統(tǒng)4152;應(yīng)用程序4154;輸入/輸出裝置驅(qū)動(dòng)器4158;以及數(shù)據(jù)1456。如本領(lǐng)域熟練技術(shù)人員可以理解的,操作系統(tǒng)4152可以是適用于數(shù)據(jù)處理系統(tǒng)的任何操作系統(tǒng),比如IBM,OS/2,A賜,或zOS⑧操作系統(tǒng)或MicrosoftWindows95,Windows98,Windows2000,WindowsXP或WindowsCE操作系統(tǒng),Unix或LinuxTM。IBM,OS/2,AIX和Zos是國(guó)際商業(yè)機(jī)器公司在美國(guó)或其它國(guó)家的商標(biāo),同時(shí)Linux是的LinusTorvalds在美國(guó)或其它國(guó)家的商標(biāo),Microsoft或Windows是微軟公司在美國(guó)或其它國(guó)家的商標(biāo)。輸入/輸出裝置驅(qū)動(dòng)器4158典型地包括應(yīng)用程序4154通過(guò)操作系統(tǒng)4152訪問(wèn)的軟件程序,以與例如輸入/輸出電路4146和某些存儲(chǔ)器4136元件等通信。應(yīng)用程序4154是依據(jù)本發(fā)明的一些實(shí)施例實(shí)施電路和模塊的各種特征的程序的說(shuō)明。最后,數(shù)據(jù)4156表示由應(yīng)用程序4154、操作系統(tǒng)4152、輸入/輸出裝置驅(qū)動(dòng)器4158和可以居于存儲(chǔ)器4136中的其它軟件程序使用的靜態(tài)和動(dòng)態(tài)數(shù)據(jù)。數(shù)據(jù)4156可以包括(基本上實(shí)時(shí)存檔或存儲(chǔ))工藝序列數(shù)據(jù)集4126和/或封閉環(huán)境傳感器反饋數(shù)據(jù)4127。如圖32中進(jìn)一步所述的,依據(jù)本發(fā)明的一些實(shí)施例,應(yīng)用程序4154包括自動(dòng)工藝序列和監(jiān)控模塊4125。應(yīng)用程序4154可被定位在本地服務(wù)器(或處理器)和/或數(shù)據(jù)庫(kù)或遠(yuǎn)程服務(wù)器(或處理器)和/或數(shù)據(jù)庫(kù),或者本地和遠(yuǎn)程數(shù)據(jù)庫(kù)和/或服務(wù)器的組合。在參照?qǐng)D32中的應(yīng)用程序4154描述本發(fā)明的同時(shí),如本領(lǐng)域熟練技術(shù)人員可以理解的,其它結(jié)構(gòu)落入本發(fā)明的范圍中。例如,除了應(yīng)用程序4154,這些電路和模塊也可被結(jié)合進(jìn)操作系統(tǒng)4152或數(shù)據(jù)處理系統(tǒng)的其它這種邏輯區(qū)中。此外,在單獨(dú)的數(shù)據(jù)處理系統(tǒng)中描述應(yīng)用程序4154的同時(shí),如本領(lǐng)域熟練技術(shù)人員可以理解的,可以一黃越一個(gè)或多個(gè)數(shù)據(jù)處理系統(tǒng)地分布這種功能,例如以上面所述類型的客戶/服務(wù)器布置中。因此,本發(fā)明不被解釋為局限于圖32中所述的結(jié)構(gòu),因?yàn)樗赏ㄟ^(guò)數(shù)據(jù)處理系統(tǒng)之間的其它布置和/或功能區(qū)提供。例如,盡管圖32被描述為具有各種電路和模塊,這些電路或模塊的一個(gè)或多個(gè)可^f皮不脫離本發(fā)明的范圍地組合或分離。其它實(shí)施例提供前面的示范性系統(tǒng)10,以描述本發(fā)明的各個(gè)方面和特征,并且不試圖限制本發(fā)明的范圍至用于核酸處理的系統(tǒng),裝置和方法。相反,本領(lǐng)域的熟練技術(shù)人員可以理解,各種其它應(yīng)用落入本發(fā)明的范圍中,包括例如用于制備、裝配,處理或另外操縱典型地在封閉容器中的任何項(xiàng)目的系統(tǒng)和方法。下面的部分提供了可以采用本發(fā)明的設(shè)備的方法的應(yīng)用的附加例子。其它生物和/或藥物應(yīng)用的例子在其它方面中,本發(fā)明提供轉(zhuǎn)移材料的方法,例如流體,從源至封閉環(huán)境中的目標(biāo),其中封閉環(huán)境被定義為如本申請(qǐng)中描述的設(shè)備的容器中的內(nèi)部區(qū)域或腔室。^R轉(zhuǎn)移的流體可以包括例如生物;藥物;毒素;隔離群;放射性同位素;病毒;細(xì)菌;真核細(xì)胞;提取物;分析物;比如血液,血漿,唾液等的生物樣本;疫苗;核酸;蛋白質(zhì);食品等,包括其懸浮液,混合物等等。可以發(fā)現(xiàn)用于即時(shí)系統(tǒng)和方法的應(yīng)用,例如避免封閉環(huán)境內(nèi)部要4皮轉(zhuǎn)移材料被容器之外環(huán)境中潛在的物質(zhì)污染。在某些實(shí)施例中,該系統(tǒng)和方法可以致力于材料的制備,或用于在診斷試驗(yàn)中處理材料,比如(不受限制的例子),無(wú)菌性試驗(yàn),法醫(yī)分析或品質(zhì)控制試驗(yàn),用以測(cè)試被用于臨床應(yīng)用的生物制劑的純度。在其它實(shí)施例中,即時(shí)方法可以用于藥物或生物制劑(比如疫苗)的制備或制造,以及用于實(shí)驗(yàn)和/或臨床應(yīng)用的核酸。可以適用于本發(fā)明的系統(tǒng)和方法的各種試|全和方法如所述對(duì)本領(lǐng)域熟練技術(shù)人員是已知的,例如在美國(guó)藥典中,to〃Wi7Wes尸力ar/7aco/7e/sa/2dyVa^7o/a/尸onz^/a/y廣〃^尸2夕一A77(2006),U.S.DepartmentofHeathandHumanServices,"w油/ce/orWe"7e尸roo^c"尸rc^ced67Ae;7〃c/Voce^s^'/^—Cz//"/^"/<7oc^他/7"/3"〃"'/^戶/""〃<^(2004年9月),其每一個(gè)于此4皮整體參照結(jié)合。本領(lǐng)域熟練技術(shù)人員可以理解,流體一皮轉(zhuǎn)移至的目標(biāo)可以是任何接收器,比如管,小瓶,器皿等,其試圖保持被轉(zhuǎn)移流體。在一些實(shí)施例中,目標(biāo)是基板,比如結(jié)合柱,尺寸排除柱,色譜法介質(zhì)或過(guò)濾器等。然而,根據(jù)提供的方法中的具體應(yīng)用,可以使用任何流過(guò)裝置,即試圖捕獲和/或分離和/或濃縮從流體的另一成分轉(zhuǎn)移的流體的一個(gè)或多個(gè)成分的任何裝置。圖14提供了示范性設(shè)備的結(jié)構(gòu)的例子,其中位于封閉環(huán)境中的結(jié)合柱1410是用于轉(zhuǎn)移例如包含核酸的流體目標(biāo)。在其它實(shí)施例中,在圖14中描述的歧管可以適于適配上面討論的過(guò)濾器或其它裝置。在一些實(shí)施例中,通過(guò)本發(fā)明提供的系統(tǒng)和方法允許擴(kuò)增的核酸產(chǎn)品的無(wú)菌制備,包括從細(xì)胞提取物離析RNA和從來(lái)自分離的RNA的至少一個(gè)RNA分子擴(kuò)增核酸產(chǎn)品的步驟,其中在被定義為如本發(fā)明所述的設(shè)備的容器中的內(nèi)部區(qū)域或腔室的封閉環(huán)境中執(zhí)行離析和擴(kuò)增步驟,從而無(wú)菌制備擴(kuò)增的核酸產(chǎn)品。在用于擴(kuò)增的核酸產(chǎn)品的無(wú)菌制備的某些實(shí)施例中,從病原體獲得擴(kuò)增的核酸產(chǎn)品,比如從病毒性的病原體。在某些實(shí)施例中,從人腫瘤RNA獲得擴(kuò)增的核酸產(chǎn)品。例如在疫苗或免疫療法的制備中可以使用來(lái)自人腫瘤RNA的擴(kuò)增的核酸產(chǎn)品。即時(shí)方法可以用于在無(wú)菌條件下材料的消毒,例如在UnitedStatedCodeofFederalRegulation的Title21下^皮定義的生物,核酸和/或蛋白質(zhì)等等。例如在U.S.DepartmentofHealthandH廳nServices,6W(ia/2ce/or//^/i^r/.'57er//e"r〃g尸roa^"5"尸/Wwced6/Ae/〃c/Voce^/"--""!"/food#s,/a"i/r//2《尸ra"/ce(2004年9月)中描述了關(guān)于用于臨床應(yīng)用的這種材料的制備的準(zhǔn)則。因此,在某些實(shí)施例中,方法被提供用于材料的消毒,包括轉(zhuǎn)移包括來(lái)自源的材料的流體至過(guò)濾器,并收集通過(guò)過(guò)濾器的之后的材料進(jìn)入接收器,其中源、過(guò)濾器和接收器被容納在作為本申請(qǐng)中所述的設(shè)備的容器中的內(nèi)部腔室或區(qū)域的封閉環(huán)境中。用于消毒的過(guò)濾器是市場(chǎng)上可買到的,例如/人WhatmanInc(FlorhamPark,NJ)。也可以認(rèn)識(shí)到,如果材料包括病原體,比如是HIV病毒,或其它某些微生物,或者包括生物毒素或放射性物質(zhì),那么轉(zhuǎn)移材料會(huì)是危險(xiǎn)的,例如分配材料進(jìn)入小瓶。在比如在本申請(qǐng)的實(shí)施例中定義的封閉環(huán)境中轉(zhuǎn)移這種材料進(jìn)入接收器可以減小危險(xiǎn)材料對(duì)承擔(dān)該轉(zhuǎn)移的個(gè)體的潛在暴露。因此在某些實(shí)施例中,提供方法,其中在本申請(qǐng)中所述的設(shè)備的容器中的封閉環(huán)境中,將危險(xiǎn)材料從源轉(zhuǎn)移至目標(biāo)。這些方法可被應(yīng)用于多種程序和試驗(yàn),其中危險(xiǎn)材料在源和目標(biāo)之間被轉(zhuǎn)移,如對(duì)本領(lǐng)域熟練技術(shù)人員已知的。本發(fā)明的設(shè)備可以用于其它應(yīng)用,典型的蛋白質(zhì)提純,核酸提純和其它分子生物學(xué)工藝。這種應(yīng)用包括但不局限于細(xì)胞溶解(例如細(xì)胞的機(jī)械的、促溶(chaotropic)、熱或酶溶解),高分子提純(例如離子交換,起泡(bead),分子重量截去),以及恢復(fù)(硅洗脫,珠洗脫,膜洗脫)。示范性的光刻術(shù),微制備和相關(guān)應(yīng)用本發(fā)明的實(shí)施例可以用于其中使用清潔的空間環(huán)境或希望隔離的的任何情形,例如光刻或組裝工藝。在一些實(shí)施例中,本發(fā)明的設(shè)備滿足等級(jí)l,等級(jí)10,等級(jí)100,等級(jí)1000,等級(jí)10G00或等級(jí)100000的清潔空間的條件,該清潔空間如用于清潔空間分類的U.S.FederalStandard209b闡明的,見(jiàn)FederalStandardNo.209B1992,"CleanRoomandWorkStationRequirement,ControlledEnvironment,,,曰期為1973年4月24日,因此其凈皮整體參照結(jié)合。如此,本發(fā)明的實(shí)施例可以用于利用清潔空間環(huán)境的工藝的廣泛的范圍。這種工藝包括光刻工藝,包括但不局限于晶片圖案化(也稱為光掩模,掩模,光刻,微光刻),摻雜(例如熱擴(kuò)散,離子注入),熱處理(例如熱,輻射)。在本發(fā)明的設(shè)備中可被實(shí)施的具體圖案化工藝包括但不局限于(i)抗蝕劑應(yīng)用(正或負(fù));(ii)對(duì)高壓汞,X-射線或E-射束的曝光(例如通過(guò)接觸,接近,掃描投影和步進(jìn)器);(iii)成像(例mi11ing如單層抗蝕劑,多層抗蝕劑,抗反射層的應(yīng)用,離軸照明,平面化,對(duì)比度增強(qiáng));以及(iv)蝕刻(例如濕化學(xué)液體/蒸汽,干的,等離子,剝離,離子研磨,反應(yīng)離子蝕刻)。具體的熱處理工藝包括但不局限于熱板,對(duì)流,十夾速^:處J里(RTP)和纟工夕卜。在Za//1,〃/cros力/p尸a6r/caf/oz7,尸o〃/^力iV//〃o",C力a;,er《i卯《#cCraYew中描述了這些光刻工藝的更多說(shuō)明,因此于此將其整體參照結(jié)合。除了傳統(tǒng)的光刻技術(shù)之外,本發(fā)明的設(shè)備可以用于下一代光刻,比如才及紫外,X-射線光刻(例如LIGA),帶電粒子束光刻(例如電子束,離子束),掃描探針光刻(例如掃描隧道顯微鏡光刻,原子力顯微鏡光刻,掃描電化學(xué)顯微鏡光刻),軟光刻(例如復(fù)制才莫型,微接觸印刷,毛細(xì)管微模制,微傳遞模制,與溶劑相關(guān)的微模制,利用彈性相移掩膜的近場(chǎng)共形光刻),以及三維光刻(例如全息光刻,非平面襯底上的光刻)。在Madou,尸〃/7G^歷e/7/^/o/JZ/cro/a^r/ca"o/7,SeondEdition,2002CRCPressLICBocaRaton,Florida,pp.48-68中描述了這種才支術(shù),因此于此將其整體參考結(jié)合。本發(fā)明的實(shí)施例可以用于蛋白質(zhì)構(gòu)圖微光刻技術(shù),該蛋白質(zhì)構(gòu)圖微光刻技術(shù)涉及例如竟?fàn)幟庖吒惺芷髦械臋z測(cè)位置的具體蛋白質(zhì)吸收的問(wèn)題。例如見(jiàn)Clementi等人i7r〃"〃re德〃肌'#e/26rsce,A^z;c/e/c,a/dZ^rCe//2,AdeninePress,Schenectady,NewYork,1985,因此于此將其整體參考結(jié)合。本發(fā)明的裝置,系統(tǒng),設(shè)備和方法可以用于執(zhí)行干蝕刻技術(shù),比如物理蝕刻(例如離子蝕刻,'踐射,離子束研磨),等離子體蝕刻(例如自由基蝕刻),物理/化學(xué)蝕刻,深反應(yīng)離子蝕刻,沒(méi)有等離子體的氣相蝕刻,干蝕刻以及單晶反應(yīng)蝕刻金屬化(SCREAM),如MadouFundamentalofMicrofabrication,SecondEdition,2002,CRCPressLICBocaRaton,Florida的Chapter2中公開(kāi)的,因此于此將其整體參考結(jié)合。本發(fā)明的設(shè)備可以用于結(jié)合其它技術(shù)而執(zhí)行圖案轉(zhuǎn)移,該其它技術(shù)比如硅生長(zhǎng),硅摻雜,硅的氧化,物理汽相擴(kuò)散(例如熱蒸發(fā),濺射,分子束外延附生,激光濺射沉積,燒蝕沉積,離子鍍,團(tuán)束技術(shù)),化學(xué)氣相沉積,絲印制(絲網(wǎng)印刷),溶膠凝膠沉積,等離子噴涂,噴涂熱解,以及離子束沉積,如MadouFundamentalofMicrofabrication,SecondEdition,2002,CRCPressLICBocaRaton,Florida的Chapter3中公開(kāi)的,因此于此將其整體參考結(jié)合。本發(fā)明的實(shí)施例可以特別有用于BI0MEMS領(lǐng)域中的沉積和布陣方法,其包括用于為化學(xué)和生物傳感器沉積有機(jī)材料的技術(shù),常常被布置在一些類型的陣列結(jié)構(gòu)中。這種結(jié)構(gòu)可以用于例如獲得有機(jī)氣體可滲透的膜,離子選擇膜,水凝膠,需用于室溫氣體傳感器的有機(jī)單層,離子選擇電極,酶?jìng)鞲衅?,免疫傳感器以及DNA和蛋白質(zhì)陣列??梢曰诒景l(fā)明的設(shè)備而被實(shí)施的BIOMEMS領(lǐng)域中的具體技術(shù)是旋涂,浸涂,塑料噴涂,鑄造,模式鑄造,輝光放電(等離子體)聚合,Langmuri-Blogett工藝,噴墨,微定點(diǎn),以及機(jī)械微微定點(diǎn),如MadouFundamentalofMicrofabrication,SecondEdition,pp.159-167,2002,CRCPressUCBocaRaton,F(xiàn)lorida中公開(kāi)的,因此于此將其整體參考結(jié)合。本發(fā)明的實(shí)施例可以用于其它清潔空間應(yīng)用,比如小裝置(例如集成電路)的封裝。利用本發(fā)明的設(shè)備可被實(shí)施的具體封裝技術(shù)包括但不局限于集成電路的包封裝,切割,空腔密封和結(jié)合,多芯片封裝,以及劃分,如MadouFundamentalofMicrofabrication,SecondEdition,pp.478—508,2002,CRCPressUCBocaRaton,Florida中公開(kāi)的,因此于此將其整體參考結(jié)合。本發(fā)明的實(shí)施例可以用于光刻工藝中的光致抗蝕劑的應(yīng)用。例如,本發(fā)明的設(shè)備可以用于在清潔的空間環(huán)境中施加正或負(fù)光致抗蝕劑于襯底。如此,在本發(fā)明的設(shè)備中可以實(shí)施比如抗蝕旋涂,軟烘,硬烘,顯影,曝光后烘焙和多層抗蝕劑工藝,如在Levinson,,/7/c///e^//^c^rap力/,SPIEPress,Bel1ingham,Washington,2001,Chapter3中所述的,因此于此將其整體參考結(jié)合。本發(fā)明的設(shè)備可以用于光刻工藝,比如光學(xué)光刻,電子束光刻,x-射線光刻,深UV抗蝕劑應(yīng)用,光掩膜制備,以及光學(xué)光刻中的度量4衧方法,如Microlithography,Microitiachining,andMicrofabrication,ed.Rai-Choudhury,SPIEPress,Bellinggham,Washington,2001,Chapter卜6中所述的,因此于此將其整體參考結(jié)合。本發(fā)明的系統(tǒng),裝置,設(shè)備和方法可以進(jìn)一步用于制備光電池,包括但不局限于磷擴(kuò)散,邊緣隔離,ARC沉積,前接觸印刷,反向接觸印刷,共點(diǎn)火,測(cè)試和存4諸,如0/尸力0/0F0/fa/c5We/cei/7^7/eer//7《,LuqueandGegedueds.,JohnWiley&Sons,WestSussex,Englang,2003,pp.271-279中所述的,因此于此將其整體參考結(jié)合。于此引用的全部參考在這里被整體參考結(jié)合至相同的程度,好像每一個(gè)單獨(dú)的公開(kāi)出版物或?qū)@驅(qū)@暾?qǐng)被具體和分別示出被整體參照結(jié)合。然而,通過(guò)參考文獻(xiàn)的結(jié)合不用于變窄未決申請(qǐng)的權(quán)利要求元素的闡明或基于其的任何專利公布。在前面的說(shuō)明書(shū)和附圖表示本發(fā)明的實(shí)施例的同時(shí),可以理解,可以在此進(jìn)行各種附加,修改和替代,只要不脫離如在附加權(quán)利要求中限定的本發(fā)明的精神和范圍。具體地,對(duì)本領(lǐng)域熟練技術(shù)人員顯而易見(jiàn)地,本發(fā)明可被具體化為其它具體的方面,結(jié)構(gòu),布置,比例,以及其它元件,材料和部件,只要不脫離其精神或基本特征。目前公開(kāi)的實(shí)施例因此被認(rèn)為在全部方面中的,因?yàn)槭敲枋鲂远窍拗菩缘?,通過(guò)附加權(quán)利要求表示本發(fā)明的范圍,不試圖是前面的說(shuō)明書(shū)。權(quán)利要求1.一種用于操縱封閉容器中的項(xiàng)目的設(shè)備,包括具有內(nèi)部區(qū)域的容器,該內(nèi)部區(qū)域被布置成保持要被操縱的多個(gè)項(xiàng)目;柔性隔離物,其被布置成密封附著至容器;以及與柔性隔離物集成或被集成于柔性隔離物中的工具,該工具具有第一接口和第二接口,其中第一接口被布置成附著至容器的內(nèi)部區(qū)域之外的隔離物的第一側(cè)面上的機(jī)器人裝置,并且第二接口被設(shè)置在柔性隔離物之下的容器的內(nèi)部區(qū)域中,并被布置成當(dāng)柔性隔離物密封附著至容器時(shí)操縱內(nèi)部區(qū)域中的項(xiàng)目。2、權(quán)利要求l的設(shè)備,其中多個(gè)項(xiàng)目包括核酸樣品。3、權(quán)利要求l的設(shè)備,其中工具包括吸管裝置的元件。4、權(quán)利要求2的設(shè)備,其中容器進(jìn)一步包括用于處理核酸樣品的多個(gè)站。5、權(quán)利要求4的設(shè)備,進(jìn)一步包括被布置成保持至少一個(gè)核酸結(jié)合柱的歧管,該歧管被布置成在所述多個(gè)站中的至少兩個(gè)之間移動(dòng)。6、權(quán)利要求5的設(shè)備,其中歧管包括手柄,并且其中第二接口4皮布置成接合手柄,以便移動(dòng)歧管至至少兩個(gè)站和從至少兩個(gè)站移動(dòng)歧管。7、權(quán)利要求6的設(shè)備,其中至少兩個(gè)站包括洗脫站和廢料站。8、權(quán)利要求4的設(shè)備,其中多個(gè)站的至少一個(gè)包括試劑站。9、權(quán)利要求8的設(shè)備,進(jìn)一步包括在試劑站中被設(shè)置的試劑架,試劑架保持多個(gè)試劑,以用于處理核酸樣品。10、權(quán)利要求l的設(shè)備,進(jìn)一步包括被密封至所述容器的基座并且被設(shè)計(jì)成適合于熱塊的單井或多井器皿,其中從容器的內(nèi)部區(qū)域可訪問(wèn)器皿。11、權(quán)利要求10的設(shè)備,其中容器進(jìn)一步包括柔性密封,該柔性密封密封耦合至容器的側(cè)壁,并在限定封閉的柔性側(cè)面入口通道的側(cè)壁中的孔上延伸,柔性側(cè)面入口通道被尺寸化為允許蓋反復(fù)進(jìn)出柔性密封內(nèi)部的側(cè)壁中的孔,并且垂直行進(jìn)以封蓋和覆蓋器亞,從而柔性密封允許蓋進(jìn)出容器的內(nèi)部區(qū)域,同時(shí)保持容器中的封閉環(huán)境。12、權(quán)利要求11的設(shè)備,進(jìn)一步包括具有自動(dòng)驅(qū)動(dòng)系統(tǒng)的驅(qū)動(dòng)部件,用于自動(dòng)移動(dòng)蓋進(jìn)出容器的側(cè)壁孔,同時(shí)保持在柔性密封中。13、權(quán)利要求l的設(shè)備,進(jìn)一步包括從容器向外延伸并且與容器的內(nèi)部區(qū)域流體聯(lián)系的多個(gè)等分試樣管,該多個(gè)等分試樣管被布置成接收;故處理的流體樣品。14、權(quán)利要求13的設(shè)備,進(jìn)一步包括將多個(gè)被處理樣品吸入多個(gè)等分試樣管的等分試樣管擠壓器。15、權(quán)利要求14的設(shè)備,等分試樣管擠壓器包括用以密封多個(gè)等分試樣管中的一個(gè)或多個(gè)的管密封器。16、權(quán)利要求3的設(shè)備,其中吸管裝置包括吸管尖端適配器,用于可松脫地接合存儲(chǔ)于容器中的吸管尖端;工作流體腔室,用于與容器之外的流體泵聯(lián)系;以及隔膜或過(guò)濾器,用于隔離工作流體腔室與吸管尖端適配器,以及用于從流體泵向吸管尖端適配器傳輸壓力。17、權(quán)利要求l的設(shè)備,進(jìn)一步包括用于定量樣品的分光光度計(jì),其中容器包括用于密封試管至容器基座的連接器,所述試管被布置成保持被分光光度計(jì)定量的樣品。18、權(quán)利要求l的設(shè)備,進(jìn)一步包括再循環(huán)真空系統(tǒng),其被布置成當(dāng)柔性隔離物被密封至容器時(shí),在封閉回路中循環(huán)在容器的內(nèi)部區(qū)域中密封的空氣。19、權(quán)利要求l的設(shè)備,其中真空系統(tǒng)包括一次性使用的真空頭和柔性管。20、權(quán)利要求19的設(shè)備,進(jìn)一步包括至少一個(gè)熱交換裝置,該至少一個(gè)熱交換裝置用于控制密封容器中的濕度和/或蒸汽濃度。21、權(quán)利要求l的設(shè)備,其中容器和隔離物是一次性使用的。22、權(quán)利要求13的設(shè)備,其中從容器排放被處理的流體,同時(shí)容器保持密封,而不影響封閉系統(tǒng)的封閉狀態(tài),并且其中在用來(lái)限定可任意處置的封閉系統(tǒng)的過(guò)程中和之后,容器和隔離物保持密封。23、權(quán)利要求l的設(shè)備,進(jìn)一步包括與封閉容器相聯(lián)系的壓力傳感器以及和壓力傳感器相聯(lián)系的控制電路,該壓力傳感器被布置成監(jiān)控封閉容器中的壓力,以便檢驗(yàn)密封完整性。24、權(quán)利要求l的設(shè)備,進(jìn)一步包括具有工作表面的外殼,該工作表面具有容器位置導(dǎo)向裝置,該設(shè)備進(jìn)一步包括臺(tái)車,該臺(tái)車被布置成保持具有柔性隔離物的容器,然后允許操作者對(duì)準(zhǔn)臺(tái)車與外殼,以便利用容器位置導(dǎo)向裝置滑動(dòng)轉(zhuǎn)移封閉容器至工作表面上合適的操作位置。25、權(quán)利要求24的設(shè)備,其中工作表面容器位置導(dǎo)向裝置包括隔開(kāi)的槽,并且其中臺(tái)車包括與工作表面上的槽對(duì)準(zhǔn)的對(duì)應(yīng)的槽,從而使封閉容器可以從臺(tái)車滑動(dòng)轉(zhuǎn)移至工作表面,進(jìn)入合適的操作位置。26、權(quán)利要求24的設(shè)備,進(jìn)一步包括彈簧偏置元件,該彈簧偏置元件推壓工作表面上的封閉容器,以便使封閉容器至機(jī)器人臂下的期望操作位置。27、一種處理樣品的方法,包括提供具有內(nèi)部的一次性使用的容器,該內(nèi)部包括多個(gè)處理站;裝載至少一個(gè)試劑和至少一個(gè)樣品到容器中;用柔性隔離物密封容器,該柔性隔離物包括與柔性隔離物集成或集成在柔性隔離物中的吸管頭,并且該吸管頭具有從隔離物的一側(cè)延伸的吸管尖端適配器以用于接合容器內(nèi)部的吸管尖端和用于接收機(jī)器人臂的吸管頭適配器的隔離物的相對(duì)側(cè)上的接收器;將機(jī)器人臂的吸管頭適配器附著至吸管頭,以使機(jī)器人臂居于密封容器之外;從容器外使用機(jī)器人臂操縱吸管頭,以便在容器中的一個(gè)或多個(gè)處理站之間轉(zhuǎn)移樣品和試劑;以及在一個(gè)或多個(gè)處理站處理至少一個(gè)樣品。28、權(quán)利要求27的方法,其中多個(gè)處理站包括PCR板、洗脫站和廢料站。29、權(quán)利要求28的方法,進(jìn)一步包括在密封容器之前裝載保持結(jié)合柱的至少一個(gè)歧管到容器中,該歧管被布置成適合于在洗脫站和廢料站中。30、權(quán)利要求29的方法,其中處理步驟包括在洗脫站和廢料站4立置之間移動(dòng)歧管。31、權(quán)利要求27的方法,進(jìn)一步包括在處理過(guò)程中保持容器中的封閉體積。32、權(quán)利要求31的方法,其中保持封閉體積包括再循環(huán)容器中的空氣。33、權(quán)利要求32的方法,其中保持封閉體積進(jìn)一步包括控制容器中的濕度和/或蒸汽濃度。34、一種用于轉(zhuǎn)移流體的設(shè)備,包括用于抽取工作流體的泵;通過(guò)工作流體與泵聯(lián)系的隔膜,隔膜被布置成將工作流體和工作流體泵與流體樣品隔離;以及與隔膜和樣品聯(lián)系的管,該管具有與隔膜聯(lián)系的腔;其中隔膜被布置成傳輸工作流體中壓力的改變至管的腔,以使壓力的變化將流體吸入腔或從腔排出流體。35、權(quán)利要求34的設(shè)備,其中管包括可松脫的吸管尖端。36、一種用于測(cè)量流體體積的設(shè)備,包括至少一個(gè)發(fā)射器,被布置成朝向樣品容器的預(yù)定位置投射信號(hào);至少一個(gè)接收器,被布置成在信號(hào)與樣品容器交互之后接收信號(hào),其中由接收器接收的信號(hào)中的改變表示流體已下降低于所述預(yù)定位置的時(shí)間;以及與接收器和樣品容器聯(lián)系的流體轉(zhuǎn)移裝置,其中當(dāng)接收器檢測(cè)到流體已經(jīng)下降低于所述預(yù)定位置時(shí),流體轉(zhuǎn)移裝置確定已從樣品容器移走的流體的體積。37、權(quán)利要求36的設(shè)備,其中發(fā)射器是光發(fā)射器,并且信號(hào)包括光。38、權(quán)利要求36的設(shè)備,其中流體轉(zhuǎn)移裝置包括吸管的至少一部分。39、權(quán)利要求36的設(shè)備,其中樣品容器包括試管。40、權(quán)利要求39的設(shè)備,進(jìn)一步包括與發(fā)射器串聯(lián)聯(lián)系的多個(gè)樣口六突41、一種用于測(cè)量流體體積的設(shè)備,包括用于發(fā)射光的至少一個(gè)光源;用于接收來(lái)自光源的光的至少一個(gè)接收器;試管,通過(guò)該試管,根據(jù)試管包含流體或是空的,可以檢測(cè)光路的改變;以及與接收器聯(lián)系的流體轉(zhuǎn)移裝置,以當(dāng)接收器檢觀'J到試管是空的時(shí)侯,確定已經(jīng)從試管移走的流體的體積。42、權(quán)利要求41的設(shè)備,其中流體轉(zhuǎn)移裝置包括吸管的至少一部43、一種處理容器,包括具有基本上剛性主體的第一元件,其具有限定間隔開(kāi)的工作站的多個(gè)區(qū);或;以及柔性隔離物元件,其密封附著至第一元件,以在多個(gè)工作站上限定封閉腔室,其中柔性隔離物基本上是不可滲透的,并且其中柔性隔離物元件包括密封附著至隔離物的操縱工具,該工具具有居于柔性隔離物下的封閉腔室中的第一內(nèi)部接口和居于封閉腔室之外的第二外部接口。44、權(quán)利要求43的容器,其中隔離物和第一元件是一次性使用的。45、權(quán)利要求43的容器,其中第一元件具有壁部分,該壁部分^皮布置成密合地接收外部冷卻元件,其中在操作中,該壁部分與冷卻元件協(xié)作,以便限定容器內(nèi)部的冷凝壁。46、權(quán)利要求43的容器,其中第一元件包括具有側(cè)面入口接收孔的側(cè)壁,并且其中側(cè)面入口接收孔被基本上橫向延伸的套管密封覆蓋,該基本上橫向延伸的套管被布置成允許至少一個(gè)項(xiàng)目進(jìn)入容器的內(nèi)部區(qū)域和從容器的內(nèi)部區(qū)域離開(kāi)。47、權(quán)利要求43的容器,其中工作站區(qū)域的一個(gè)被布置成保持PCR板,工作站區(qū)域的另一個(gè)被布置成保持具有吸管尖端的吸管架,以及工作站區(qū)域的又一個(gè)被布置成保持密封試劑器皿的盤。48、一種生物樣品處理容器,包括具有基本上剛性的主體的一次性使用的無(wú)菌盤,其具有被布置成保持PCR板的第一工作站,被布置成保持試劑的第二工作站,以及被布置成保持無(wú)菌吸管的第三工作站。49、一種具有外部邊緣部分的柔性隔離物,其被布置成密封至盤,以便限定密封封閉的內(nèi)部腔室,其中該柔性隔離物包括彈性體,并被密封附著至隔離物的中間部分處的機(jī)器人臂接口。50、權(quán)利要求49的隔離物,其中柔性隔離物基本上是不可滲透的。51、權(quán)利要求49的隔離物,其中柔性隔離物包括多個(gè)徑向褶狀物。52、權(quán)利要求49的隔離物,其中柔性隔離物的中間部分包括多個(gè)基本上垂直定向的階梯狀部分。53、一種自動(dòng)吸管尖端脫離系統(tǒng),包括具有側(cè)壁的盤;以及并入操縱工具的機(jī)器人臂,該操縱工具具有被布置成接觸盤側(cè)壁的向外延伸的桿,從而與側(cè)壁的接觸使桿樞軸運(yùn)動(dòng),并釋放由操縱工具保持的各個(gè)使用的吸管尖端。54、權(quán)利要求53的系統(tǒng),其中盤側(cè)壁向下朝著保持吸管尖端架的盤的基座成角度,該吸管尖端架基本上水平低于并鄰近有角度的側(cè)壁。55、權(quán)利要求53的系統(tǒng),進(jìn)一步包括與吸管尖端架聯(lián)系的負(fù)載傳感器,其中操縱工具被布置成向前移動(dòng),以相對(duì)于目標(biāo)吸管尖端施加大約5N-50N之間的負(fù)載,從而接合由吸管尖端架保持的各個(gè)吸管尖端。56、一種用于處理流體的系統(tǒng)機(jī)器人臂;以及與機(jī)器人臂協(xié)作的操縱工具,該工具被布置成可松脫地接合吸管尖端,并自動(dòng)平移,以在通過(guò)蓋中的刺穿開(kāi)口的一個(gè)從器皿取出流體之前在隔開(kāi)的不同位置多次刺穿器皿上的蓋。57、一種洗脫盤,包括無(wú)菌生物相容洗脫盤,其具有多個(gè)間隔開(kāi)的接收器,接收器的一些位于向上延伸的隔離物的第一側(cè)面上,并且其它接收器位于隔離物的相對(duì)側(cè)上,其中接收器的每一個(gè)具有在主要管部的方向上向下逐漸變細(xì)的每一側(cè)上延伸的通道。58、一種用于自動(dòng)處理系統(tǒng)的成套工具,包括一次性使用的容器,其包括盤和被布置成密封地附著該盤的柔性隔離物;一次性使用的試劑架,其被布置成居于第一工作站處的容器中;一次性使用的結(jié)合柱歧管,被布置成居于容器中;以及一次性使用的吸管架,被布置成居于容器中。59、權(quán)利要求58的成套工具,進(jìn)一步包括被布置成居于容器中以保持用過(guò)的吸管的笫二吸管架。60、權(quán)利要求58的成套工具,進(jìn)一步包括具有管的一次性使用的真空泵頭,其附著至盤并被布置成在操作過(guò)程中再循環(huán)容器中的空氣。61、權(quán)利要求58的成套工具,進(jìn)一步包括具有手柄的歧管,其被布置成居于容器中,并在工作站之間移動(dòng)。62、一種用于從吸管釋放流體的方法,包括可編程地導(dǎo)引機(jī)器人臂來(lái)移動(dòng)可松脫地保持吸管的接口工具,以便在按一定角度向下延伸的方向上定向吸管,其中尖端靠近封閉容器中的接收表面;沿著平面并基本上沿著直線自動(dòng)移動(dòng)向下定向有角度的吸管,同時(shí)從吸管釋放可流動(dòng)的物質(zhì)。63、一種處理封閉系統(tǒng)中的樣品的方法,包括在具有柔性隔離物的密封封閉容器中提供樣品;以及可編程地導(dǎo)引機(jī)器人臂與柔性隔離物協(xié)作,以便通過(guò)一系列的操作移動(dòng)封閉容器內(nèi)部的接口工具,同時(shí)封閉容器保持密封,以處理樣品。64、權(quán)利要求63的方法,進(jìn)一步包括在擴(kuò)增過(guò)程中在多個(gè)時(shí)間處電自動(dòng)測(cè)量樣品的體積和濃度;以及65、權(quán)利要求63的方法,進(jìn)一步包括捕獲等份試樣器皿中的至少一個(gè)被處理樣品,而不破壞封閉系統(tǒng)的密封狀態(tài)。66、權(quán)利要求63的方法,進(jìn)一步包括電自動(dòng)監(jiān)控封閉容器的密封完整性。67、一種用于操縱封閉容器中的項(xiàng)目的設(shè)備,包括具有內(nèi)部區(qū)域的容器,其被布置成保持要被操縱的多個(gè)項(xiàng)目;以及再循環(huán)真空系統(tǒng),其被布置成在封閉回路中循環(huán)在容器的內(nèi)部區(qū)域中密封的空氣。全文摘要一種用于核酸和其它樣品的自動(dòng)處理的系統(tǒng)和方法,包括可任意處置的容器,該可任意處置的容器包括盤和柔性隔離物。該隔離物被布置成密封盤的上部邊緣,在密封的盤中提供封閉,無(wú)菌的工作區(qū)。吸管頭和/或其它樣品操縱裝置可被連接至隔離物的內(nèi)部,并且隔離物可以包括用于機(jī)器人臂或其它裝置的接口。當(dāng)在盤上密封隔離物時(shí),該隔離物分離盤的內(nèi)容與機(jī)器人或其它操縱裝置。該隔離物可以是柔性的,并允許機(jī)器人臂貫穿盤的工作區(qū)地移動(dòng)吸管頭。在處理過(guò)程中,用于處理核酸樣品的全部樣品,試劑,吸管頭和其它工具或裝置可以保持在通過(guò)容器提供的封閉隔室中。文檔編號(hào)B25J3/00GK101370622SQ200780002497公開(kāi)日2009年2月18日申請(qǐng)日期2007年1月17日優(yōu)先權(quán)日2006年1月18日發(fā)明者A·F·阿布德莫特勒布,D·T·克尼恩,R·A·奈爾,R·A·格蘭特,S·J·斯潘斯,S·哈里斯,T·D·皮爾,W·S·亨特申請(qǐng)人:阿戈斯治療公司;麒麟醫(yī)藥株式會(huì)社
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