Miller-Dieker綜合征檢測芯片的制作方法
【專利摘要】本發(fā)明提供了一種檢測Miller-Dieker綜合征的基因芯片，該芯片包括片基以及固定在片基上的探針，其中探針為SEQ?ID?No.1-50所示的核苷酸序列。本發(fā)明的診斷芯片操作步驟簡單，檢測特異性高，穩(wěn)定性好，從樣本抽提到得到掃描結(jié)果可在一個工作日內(nèi)完成，成本低，適用于臨床患者基因突變檢測、產(chǎn)前診斷和正常人雜合子攜帶者檢測。
【專利說明】Mil Ier-Dieker綜合征檢測芯片
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001]本發(fā)明涉及一種生物【技術(shù)領(lǐng)域】的基因芯片，更具體的，本發(fā)明是一種檢測Miller-Dieker綜合征的基因芯片。
【背景技術(shù)】
[0002]Miller-Dieker綜合征(敏-迪綜合癥，MDS)是一種以無腦回和特殊面容為特征的復(fù)雜綜合癥。本病是由于17pl3.3處多個基因微缺失或點(diǎn)突變引起神經(jīng)原遷移障礙、導(dǎo)致大腦皮層發(fā)育異常造成的。本病發(fā)病率約為1.2/10萬。主要臨床表現(xiàn)為先天性無腦回、嚴(yán)重智力障礙；特殊的短頭畸形、前額突出、雙顳凹陷、鼻孔朝前的矮鼻子、面部扁平、寬厚的上嘴唇和薄唇緣、小頜等。
[0003]MDS絕大多數(shù)為散發(fā)，少數(shù)為家族性遺傳，約90%的患者發(fā)現(xiàn)染色體17pl3.3區(qū)域發(fā)生約350kb大小的微小缺失，其父母為17pl3.3平衡易位攜帶者的可能性為20%，平衡易位攜帶者生育患者的可能性為33%。
[0004]目前常見的檢測手段為FISH，必要的輔助檢查包括頭顱CT或MR1、智商測定等。FISH可作為臨床診斷依據(jù)，檢出率約為90%。然而尚無一種快速、低成本、大通量和自動化檢測Miller-Dieker綜合征基因突變的方法。
[0005]比較基因組雜交(CGH)芯片分析技術(shù)是一種突破性技術(shù)，能夠支持研究人員通過微陣列準(zhǔn)確研究與疾病有關(guān)的染色體的變化。比較基因組雜交(CGH)芯片分析的原理是在一張芯片上用兩份標(biāo)記不同熒光素的樣品(檢測樣品和對照樣品)同時進(jìn)行雜交，從而快速而又直觀地檢測實(shí)驗(yàn)樣品和對照樣 品之間基因組DNA的拷貝數(shù)量的差異。CGH應(yīng)用于疾病遺傳學(xué)的研究，可以提供一個全基因組的掃描圖，提示樣本DNA在整個染色體組的哪個特定位置存在擴(kuò)增或缺失，那些發(fā)生擴(kuò)增的區(qū)域，極有可能存在致病基因，而缺失區(qū)域即可能包含一些抑制基因。

【發(fā)明內(nèi)容】

[0006]本發(fā)明的目的在于克服現(xiàn)有技術(shù)的不足，提供一種檢測Miller-Dieker綜合征的基因芯片。本發(fā)明的診斷芯片操作步驟簡單，檢測特異性高，穩(wěn)定性好，時間短，成本低。
[0007]本發(fā)明是通過以下技術(shù)方案實(shí)現(xiàn)的,本發(fā)明涉及一種檢測Miller-Dieker綜合征的基因芯片，包括片基以及固定在片基上的探針，其中探針為SEQ ID N0.1-50所示的核苷酸序列。
[0008]所述片基為載玻片、硅片、膜、高分子材料中的一種。
[0009]本發(fā)明具有如下的有益效果:本發(fā)明的診斷芯片操作步驟簡單，檢測特異性高，穩(wěn)定性好，該芯片多次試驗(yàn)重復(fù)性高；時間短，從樣本抽提到得到掃描結(jié)果可在一個工作日內(nèi)完成。
【具體實(shí)施方式】[0010]下面結(jié)合具體實(shí)施例，進(jìn)一步闡述本發(fā)明。應(yīng)理解為:這些實(shí)施例僅用于說明本發(fā)明而不用于限制本發(fā)明的范圍。下列實(shí)施例中未注明具體條件的實(shí)驗(yàn)方法，通常按照常規(guī)條件，例如Sambrook等分子克隆:實(shí)驗(yàn)室手冊見New York Cold Spring HarborLaboratory出版社1989年版中所述的條件,或按照制造廠商所建議的條件。
[0011]步驟一，樣品準(zhǔn)備
[0012]將水浴鍋溫度調(diào)到37°C和65°C，溶化IOX Buffer C，短暫渦旋震蕩后離心數(shù)秒。
[0013]對每個反應(yīng)來說，將gDNA加入到適當(dāng)?shù)臒o核酸酶的PCR管中，并加入無核酸酶的水使反應(yīng)體積達(dá)到10.1 μ Lo
[0014]在冰上準(zhǔn)備酶切混合母液(Digestion Master Mix),按順序加入以下試劑:[0015]
【權(quán)利要求】
1.一種檢測Miller-Dieker綜合征的基因芯片，包括片基以及固定在片基上的探針，其特征在于，所述探針為SEQ ID N0.1-50所示的核苷酸序列。
2.根據(jù)權(quán)利I所述的檢測Miller-Dieker綜合征的基因芯片，其特征在于，所述片基為載玻片、娃片、膜、高分子材 料中的一種。
【文檔編號】C12Q1/68GK103525934SQ201310489007
【公開日】2014年1月22日 申請日期:2013年10月12日 優(yōu)先權(quán)日:2013年10月12日
【發(fā)明者】徐沁, 梅艷巧, 陳培華 申請人:上海佰臻生物科技有限公司