專利名稱：：與主要大豆植物成熟期和生長習(xí)性基因組區(qū)域相關(guān)的snp標(biāo)記的效用的制作方法
技術(shù)領(lǐng)域：
：本發(fā)明包括與大豆植物成熟期和生長習(xí)性相關(guān)的用于篩選且選擇來自大豆(G(y"'"e)屬的植物和種子的基因組區(qū)域的方法和組合物。本發(fā)明還包括用于用與基因組區(qū)域相關(guān)的標(biāo)記篩選來自大豆屬的植物和種子的方法和組合物，所述基因組區(qū)域與大豆屬植物的植物成熟期和植物生長習(xí)性相關(guān)。
背景技術(shù)：
：大豆(G""e/wax)(L.)Merril是全世界主要的經(jīng)濟(jì)作物，并且是植物油和蛋白質(zhì)的主要來源(Sinclair和Backman，Ccw/ew力'i/mo/Soy6e""D/'MosM,第3版APSPress,St.Paul,,，第106頁.(1989))。關(guān)于低膽固醇和高纖維飲食增長中的需要也已增加了大豆作為健康食物的重要性。在美國生長的大豆品種具有狹窄的遺傳基礎(chǔ)。6個(gè)引種'Mandarin，、'Manchu，、'Mandarin'(Ottawa)、'Richland，、'AK，(Harrow)和'Mukden，，遺傳基礎(chǔ)可以通過使用外來種拓寬。此外，外來種可以具有此種關(guān)鍵性狀如疾病和應(yīng)激抗性。目前，許多外來種的性狀是難接近的，部分是由于使來自極端不同成熟期組的大豆植物雜交的局限性。大多數(shù)大豆品種開發(fā)雜交在彼此在10個(gè)成熟日內(nèi)的親本之間進(jìn)行。如果親本在成熟期中極大地不同，那么后代植物對于成熟期廣泛分離。為了使育種者獲得且選擇所需成熟期組的大豆植物，他們必須產(chǎn)生且維持大量后代植物，其的實(shí)踐是成本高得驚人的。植物成熟期和產(chǎn)量在大豆中緊密相關(guān)。成熟期中1天的增加可以等價(jià)于產(chǎn)量中~0.7bu/A的增加。因此，成熟期中的減少通常由產(chǎn)量中~0.7bu/A的減少處罰。植物成熟期和產(chǎn)量的關(guān)聯(lián)使與產(chǎn)量相關(guān)的潛在數(shù)量性狀基因座(QTLs)和候選基因的評估混淆。在大豆植物內(nèi)遺傳上固定成熟期的能力將是有用的，并且?guī)椭U明與產(chǎn)量相關(guān)的性狀。大豆植物是短曰照植物，因此通過由于光周期中的減少的短日照開始開花(Garner&Allard,J.to.18,553-606(1920))。因此，大豆植物的光周期(晝長)和溫度響應(yīng)決定植物適應(yīng)區(qū)域。由于光周期敏感性，大豆基因型經(jīng)常在狹窄的綷度地帶中生長以最優(yōu)化產(chǎn)量。與南方品種形成對照，北方大豆品種隨著較長的日照開始開花。種植在其適應(yīng)地帶南方的北方品種顯示出加速的開花，限制的植物生長和減少的產(chǎn)量。種植在其適應(yīng)地帶北方的南方大豆品種將具有延遲的開花，具有關(guān)于可能減少產(chǎn)量的霜凍害的可能性。大豆植物品種基于由煒度和晝長決定的適應(yīng)帶進(jìn)行分類。在北美洲，大豆分類成命名從成熟期組000、00、0和I到X的13個(gè)成熟期組。最早的成熟期組000大豆適應(yīng)北方(45。綿度)，而最晚的成熟期組X大豆適應(yīng)接近赤道的地區(qū)。成熟期組000至IV中的大豆植物具有無限的植物結(jié)構(gòu)，而在成熟期組V到X中的大豆植物具有有限的植物結(jié)構(gòu)。有限品種在主莖在成熟莢果簇中終止后停止?fàn)I養(yǎng)生長。無限品種在其生殖期部分自始至終同時(shí)發(fā)育葉和花，在終端頂點(diǎn)(terminalapex)處具有l(wèi)-3個(gè)莢果。早成熟期品種(000至III)適應(yīng)北方綿度，其中成熟期命名在南方緯度中逐漸增加。成熟期組由成熟日期決定。當(dāng)95%莢果已達(dá)到其成熟顏色時(shí)，植物視為成熟的。成熟日期一般描迷為在北半球中8月31日后天數(shù)的測量。觀.區(qū)域。目前，大豆育種者局限于使相似成熟期組內(nèi)的植物雜交。此外，許多性狀如油水平受綿度和成熟期生長區(qū)影響。因此，需要快速、成本有效的方法以預(yù)先選擇大豆植物的成熟期組。本發(fā)明包括使用單核普酸'法。附圖簡述圖1:在商業(yè)大豆中成熟期組對油百分比的影響。圖2:關(guān)于成熟大豆種子的十八碳四烯酸(SDA)水平和GLA亞麻酸)與煒度的關(guān)聯(lián)。大豆植物是轉(zhuǎn)基因的，并且進(jìn)行工程改造以產(chǎn)生SDA和GLA。圖3:關(guān)于成熟大豆種子的十八碳四烯酸(SDA)水平與緯度在3個(gè)實(shí)驗(yàn)上的關(guān)聯(lián)。大豆植物是轉(zhuǎn)基因的，并且進(jìn)行工程改造以產(chǎn)生SDA。發(fā)明概述豆植物或大豆種子應(yīng)在何處生長的方法，這通過下迷實(shí)現(xiàn)，獲得來自大豆植物或大豆種子的DNA;測定在成熟期基因組區(qū)域1內(nèi)的基因座處的等位基因是純合還是雜合的；測定在成熟期基因組區(qū)域2內(nèi)的基因座處的等位基因是純合還是雜合的；測定在成熟期基因組區(qū)域3內(nèi)的基因座處的等位基因是純合還是雜合的；測定在成熟期基因組區(qū)域1、2和3內(nèi)等位基因的等位基因組合；并且對大豆植物或大豆種子指定成熟期組值。在另一個(gè)方面，本發(fā)明包括通過測定大豆植物或大豆種子的等位基因組合確定大豆植物或大豆種子應(yīng)在何處生長的方法，這通過下述實(shí)現(xiàn)，獲得來自大豆植物或大豆種子的DNA;測定在成熟期基因組區(qū)域l內(nèi)的基因座處的等位基因是純合還是雜合的；測定在成熟期基因組區(qū)域2內(nèi)的基因座處的等位基因是純合還是雜合的；測定在成熟期基因組區(qū)域3內(nèi)的基因座處的等位基因是純合還是雜合的；測定在成熟期基因組區(qū)域2內(nèi)的基因座處的等位基因是純合還是雜合的；測定在成熟期基因組區(qū)域l、2、3和4內(nèi)等位基因的等位基因組合；并且對大豆植物或大豆種子指定成熟期組值。本發(fā)明還包括提供關(guān)于大豆植物或大豆種子的成熟期的信息的方法，這通過獲得來自大豆種子或大豆植物的DNA,并且測定在基因組區(qū)域4的基因座處的等位基因概況來實(shí)現(xiàn)。大豆植物或大豆種子應(yīng)在^^處生長的:^法，這通過下述實(shí)T見:k得來自大豆植物或大豆種子的DNA;測定在成熟期基因組區(qū)域1內(nèi)的等位基因是純合還是雜合的；測定在成熟期基因組區(qū)域2內(nèi)的等位基因是純合還是雜合的；測定在成熟期基因組區(qū)域3內(nèi)的等位基因是純合還是雜合的；并且測定在成熟期基因組區(qū)域1、2和3內(nèi)等位基因的等位基因組合。本發(fā)明的一個(gè)方面包括通過測定大豆植物的等位基因組合確定大豆植物或大豆種子應(yīng)在何處生長的方法，這通過下迷實(shí)現(xiàn)，獲得來自大豆植物或大豆種子的DNA;測定在成熟期基因組區(qū)域1內(nèi)的等位基因是純合還是雜合的；測定在成熟期基因組區(qū)域2內(nèi)的等位基因是純合還是雜合的；測定在成熟期基因組區(qū)域1和2內(nèi)等位基因的等位基因組合；并且對大豆植物或大豆種子指定成熟期生長值。在本發(fā)明的另一個(gè)方面，大豆植物育種方法包括使至少2種不同的親本大豆植物雜交；獲得來自雜交的后代大豆植物；用表征成熟期基因子；并且選擇具有關(guān)于所需成熟期組的基因型的大豆植物。本發(fā)明的一個(gè)方面包括通過測定成熟期組就種質(zhì)改良選擇大豆植物的方法，這通過下述實(shí)現(xiàn)，使至少2種不同的親本大豆植物雜交；獲得來自雜交的后代大豆植物；用表征成熟期基因組區(qū)域的遺傳標(biāo)記非破壞性基因型分型雜交的后代大豆植物或大豆種子；并且選擇具有關(guān)于所需成熟期組的基因型的大豆植物；并且將所選擇的大豆植物并入選自下迷任何的用途使用大豆植物用于育種、通過自體受精改進(jìn)大豆植物、性狀整合、大豆植物或其部分用于轉(zhuǎn)化的用途、和大豆植物或其部分用于誘變的用途。本發(fā)明的另一個(gè)方面包括就非成熟期表型性狀和成熟期性狀的表達(dá)共選擇大豆植物的方法，這通過下迷實(shí)現(xiàn)，使至少2種不同的親本大豆植物雜交；獲得來自雜交的后代大豆植物；用表征成熟期基因組區(qū)域的遺傳標(biāo)記非破壞性基因型分型雜交的后代大豆植物或大豆種子；并且選擇具有關(guān)于所需成熟期組的基因型的大豆植物；并且確定關(guān)于后代大豆植物生長的所需地理，和用于測定非成熟期表型的方法。在一個(gè)方面，本發(fā)明包括大豆植物育種方法，這通過就選自SEQIDNO:143到SEQIDNO:213的標(biāo)記序列的存在測定大豆植物；并且使大豆植物與成熟期組關(guān)聯(lián)來實(shí)現(xiàn)。在另一個(gè)方面，本發(fā)明包括大豆植物育種方法，其包括使具有所需性狀的親本大豆植物與第二種親本大豆植物雜交，其中親本大豆植物在大豆植物成熟期方面相差超過5天、超過10天、10天-20天、或10天-30天，這通過下述實(shí)現(xiàn)，使包含所需性狀的親本大豆植物與第二種親本大豆植物雜交；獲得來自雜交的后代大豆種子；就性狀篩選后代大豆種子；使用選自SEQIDNO:143到SEQIDNO:213的標(biāo)記就所需成熟期組篩選后代大豆種子，以測定所需地理生長區(qū)；并且選擇包含所需性狀和所需大豆植物成熟期的后代大豆種子。本發(fā)明的一個(gè)方面包括大豆植物育種方法，這通過下述實(shí)現(xiàn)，使至少2種不同的親本大豆植物雜交，其中親本大豆植物在大豆植物成熟期方面相差超過5天、超過10天、10天-20天、或10天-30天；獲得來自雜交的后代大豆種子；用遺傳標(biāo)記基因型分型雜交的后代大豆種子；并且選擇具有關(guān)于優(yōu)選成熟期的基因型的大豆種子。本發(fā)明的另一個(gè)方面包括基于大豆植物成熟期組篩選大豆種子的方法，這通過下述實(shí)現(xiàn)，獲得來自大豆種子的DNA;測定在成熟期基因組區(qū)域l內(nèi)的等位基因是純合還是雜合的；測定在成熟期基因組區(qū)域2內(nèi)的等位基因是純合還是雜合的；測定在成熟期基因組區(qū)域3內(nèi)的等位基因是純合還是雜合的；并且對大豆種子指定成熟期生長值。本發(fā)明的一個(gè)方面包括基于無限或有限生長習(xí)性選擇大豆種子的方法，其包括測定成熟期基因組區(qū)域3是純合還是雜合的。本發(fā)明的另一個(gè)方面包括基于成熟期組分配大豆植物的方法，這通過下述實(shí)現(xiàn)，獲得來自大豆植物的DNA;測定在成熟期基因組區(qū)域1內(nèi)的等位基因是純合還是雜合的；測定在成熟期基因組區(qū)域2內(nèi)的等位基因是純合還是雜合的；測定在成熟期基因組區(qū)域3內(nèi)的等位基因是純合還是雜合的；并且對大豆植物指定成熟期生長值；并且將大豆植物運(yùn)送至優(yōu)選地理區(qū)。本發(fā)明的另一個(gè)方面包括分離無限的早成熟期大豆種子的方法，這通過下述實(shí)現(xiàn)，使用非破壞性方法獲得來自大豆種子的DNA;測定在成熟期基因組區(qū)域l內(nèi)的等位基因是純合還是雜合的；并且測定在成熟期基因組區(qū)域2內(nèi)的等位基因是純合還是雜合的。本發(fā)明的一個(gè)方面包括測定大豆種子是否將成長為具有III-VI成熟期組的大豆植物的方法，這通過使用具有SEQIDNO:151的核酸序列的標(biāo)記測定大豆種子內(nèi)的純合或雜合標(biāo)記來實(shí)現(xiàn)。本發(fā)明的另一個(gè)方面包括測定大豆種子是否將成長為具有0.0-III.O成熟期組的大豆植物的方法，其包括測定在SEQIDNO:149核酸序列內(nèi)的11堿基對插入是否存在于大豆種子中。本發(fā)明的一個(gè)方面包括測定大豆植物是否具有0.0-III.9成熟期組的方法，這通過下迷實(shí)現(xiàn)，測定在成熟期基因組區(qū)域1內(nèi)的等位基因是純合還是雜合的；測定在成熟期基因組區(qū)域2內(nèi)的等位基因是純合還是雜合的；并且對大豆植物指定0.0-111.9的成熟期組值。本發(fā)明的一個(gè)方面是將等位基因漸滲入大豆植物內(nèi)的方法，這通過下迷實(shí)現(xiàn)，使至少2種不同的親本大豆植物雜交；獲得來自雜交的后代大豆植物；就等位基因篩選雜交的后代大豆植物；使用非破壞性方法獲得來自后代大豆植物的大豆種子的DNA;并且選擇大豆種子，其中大豆種子包含等位基因和選自SEQIDNOs:143-213的核酸序列。本發(fā)明的另一個(gè)方面包括將所需性狀引入大豆植物內(nèi)的方法，這通過下迷實(shí)現(xiàn)，使至少2種不同的親本大豆植物雜交，其中至少一種親本大豆植物具有所需性狀；獲得來自雜交的后代大豆種子；使用非破壞性方法獲得來自后代大豆植物的大豆種子的DNA;就所需性狀的證據(jù)測定雜交的后代大豆種子；并且選擇具有所需性狀和所需成熟期組的大豆種子在優(yōu)選方面，所需性狀是轉(zhuǎn)基因的。本發(fā)明的進(jìn)一步方面包括將等位基因漸滲入大豆植物內(nèi)的方法，這通過下迷實(shí)現(xiàn)，使至少2種不同的親本大豆植物雜交；獲得來自雜交的后代大豆植物；使用非破壞性方法獲得來自后代大豆植物的大豆種子的DNA;并且選擇具有等位基因和選自SEQIDNOs:143-174的核酸序列的大豆種子。通過使至少2種不同的親本大豆植物雜交的大豆植物育種方法，其中親本大豆植物在大豆植物成熟期方面相差超過10天；獲得來自雜交的后代大豆種子；用選自SEQIDNOs:143-213的遺傳標(biāo)記基因型分型雜交的后代大豆種子；并且選擇具有所需成熟期組的大豆種子。本發(fā)明的一個(gè)方面包括通過使用選自SEQIDNO:175-180中任何一種的標(biāo)記檢測等位基因而檢測成熟期基因組區(qū)域4的方法。本發(fā)明的另一個(gè)方面包括通過使用選自SEQIDNO:181-189中任何一種的標(biāo)記檢測等位基因而檢測成熟期基因組區(qū)域5的方法。本發(fā)明的另一個(gè)方面包括通過使用選自SEQIDNO:190-196中任何一種的標(biāo)記檢測等位基因而檢測成熟期基因組區(qū)域6的方法。本發(fā)明的另一個(gè)方面包括通過使用選自SEQIDNO:197-203中任何一種的標(biāo)記檢測等位基因而檢測成熟期基因組區(qū)域7的方法。本發(fā)明的另一個(gè)方面包括通過使用選自SEQIDNO:204-213中任何一種的標(biāo)記檢測等位基因而檢測成熟期基因組區(qū)域8的方法。本發(fā)明的進(jìn)一步方面包括在其基因組內(nèi)包含與成熟期相關(guān)的漸滲的單元型的大豆植物，其中漸滲通過來自SEQIDNO:143-213的至少一種標(biāo)記得到促進(jìn)。核酸序列簡述SEQIDNOSEQIDNOSEQIDNOSEQIDNOSEQIDNOSEQIDNOSEQIDNOSEQIDNOSEQIDNOSEQIDNOSEQIDNOSEGIDNOSEGIDNOSEQIDNOSEGIDNOSE(5IDNOSEQIDNOSEQIDNO1是用于擴(kuò)增SEQIDNO2是用于擴(kuò)增SEQIDNO3是用于擴(kuò)增SEQIDNO4是用于擴(kuò)增SEQIDNO5是用于擴(kuò)增SEQIDNO6是用于擴(kuò)增SEQIDNO7是用于擴(kuò)增SEQIDNO8是用于擴(kuò)增SEQIDNO9是用于擴(kuò)增SEQIDNOIO是用于擴(kuò)增SEQIDNO11是用于擴(kuò)增SEQIDNO12是用于擴(kuò)增SEQIDNO13是用于擴(kuò)增SEQIDNO14是用于擴(kuò)增SEQIDNO15是用于擴(kuò)增SEQIDNO16是用于擴(kuò)增SEQIDNO17是用于擴(kuò)增SEQIDNO18是用于擴(kuò)增SEQIDNO143143144144145145146146147147148148149149150150151151的正向的反向的正向的反向的正向的反向的正向的反向的正向的反向的正向的&向的正向的反向的正向的反向的正向的反向PCRPCRPCRPCRPCRPCRPCRPCRPCR引物。引物。引物。引物。引物。引物。引物。引物。引物。PCR引物,PCR引物,PCR引物,PCR引物,PCR引物,PCR引物,PCR引物,PCR引物'PCR引物,SEGIDNOSEQIDNOSEQIDNOSEQIDNOSEQIDNOSE(5IDNOSEQIDNOSEQIDNOSEQIDNOSEGIDNOSEQIDNO:SEQIDNO:SEQIDNO:SEQIDNO:SEQIDNO:SEGIDNO:SEQIDNO:SEQIDNO:SEQIDNO:SEQIDNO:SEQIDNO:SEQIDNO:SEQIDNO:SEQIDNO:SEQIDNO:SEQIDNO:SEQIDNO:SEQIDNO:SEQIDNO:SEQIDNO:SEQIDNO:SEQIDNO:19是用于擴(kuò)增SEQIDNO20是用于擴(kuò)增SEQIDNO21是用于擴(kuò)增SEQIDNO22是用于擴(kuò)增SEQIDNO23是用于擴(kuò)增SEQIDNO24是用于擴(kuò)增SEQIDNO25是用于擴(kuò)增SEQIDNO26是用于擴(kuò)增SEQIDNO27是用于擴(kuò)增SEQIDNO28是用于擴(kuò)增SEQIDNO29是用于擴(kuò)增SEQIDNO:30是用于擴(kuò)增SEQIDNO:31是用于擴(kuò)增SEQIDNO:32是用于擴(kuò)增SEQIDNO:33是用于擴(kuò)增SEQIDNO:34是用于擴(kuò)增SEQIDNO:35是用于擴(kuò)增SEQIDNO:36是用于擴(kuò)增SEQIDNO:37是用于擴(kuò)增SEQIDNO:38是用于擴(kuò)增SEQIDNO:39是用于擴(kuò)增SEQIDNO:40是用于擴(kuò)增SEQIDNO:41是用于擴(kuò)增SEQIDNO:42是用于擴(kuò)增SEQIDNO:43是用于擴(kuò)增SEQIDNO:44是用于擴(kuò)增SEQIDNO:45是用于擴(kuò)增SEQIDNO:46是用于擴(kuò)增SEQIDNO:47是用于擴(kuò)增SEQIDNO:48是用于擴(kuò)增SEQIDNO:49是用于擴(kuò)增SEQIDNO:50是用于擴(kuò)增SEQIDNO:52的正向PCR5物。52的反向PCR《物。53的正向PCR《物。53的反向PCR《物。54的正向PCR《物。54的反向PCR物。55的正向PCR物。55的反向PCR《物。56的正向PCR《物。56的反向PCR《物。57的正向PCR引物。57的反向PCR引物。58的正向PCR引物。58的反向PCR引物。59的正向PCR引物。59的反向PCR引物。60的正向PCR引物。60的反向PCR引物。61的正向PCR引物。61的反向PCR引物。62的正向PCR引物。62的反向PCR引物。63的正向PCR引物。63的反向PCR引物。64的正向PCR引物。64的反向PCR引物。65的正向PCR引物。65的反向PCR引物。66的正向PCR引物。66的反向PCR引物。67的正向PCR引物。67的反向PCR引物。12SEQIDNO:51是用于擴(kuò)增SEQIDNOSEQIDNO:52是用于擴(kuò)增SEQIDNOSEQIDNO:53是用于擴(kuò)增SEQIDNOSEQIDNO:54是用于擴(kuò)增SEQIDNOSEQIDNO:55是用于擴(kuò)增SEQIDNOSEQIDNO:56是用于擴(kuò)增SEQIDNOSEQIDNO:57是用于擴(kuò)增SEQIDNOSEQIDNO:58是用于擴(kuò)增SEQIDNOSEQIDNO:59是用于擴(kuò)增SEQIDNOSEQIDNO:60是用于擴(kuò)增SEQIDNO:SEQIDNO:61是用于擴(kuò)增SEQIDNOSEQIDNO:62是用于擴(kuò)增SEQIDNO:SEQIDNO:63是用于擴(kuò)增SEQIDNO:SEQIDNO:64是用于擴(kuò)增SEQIDNO:SEQIDNO:65是用于擴(kuò)增SEQIDNO:SEQIDNO:66是用于擴(kuò)增SEQIDNO:SEQIDNO:67是用于擴(kuò)增SEQIDNO:SEQIDNO:68是用于擴(kuò)增SEQIDNO:SEQIDNO:69是用于擴(kuò)增SEQIDNO:SEQIDNO:70是用于擴(kuò)增SEQIDNO:SEQIDNO:71是用于擴(kuò)增SEQIDNO:SEQIDNO:72是用于擴(kuò)增SEQIDNO:SEQIDNO:73是用于擴(kuò)增SEQIDNO:SEQIDNO:74是用于擴(kuò)增SEQIDNO:SEQIDNO:75是用于擴(kuò)增SEQIDNO:SEQIDNO:76是用于擴(kuò)增SEQIDNO:SEQIDNO:77是用于擴(kuò)增SEQIDNO:SEQIDNO:78是用于擴(kuò)增SEQIDNO:SEQIDNO:79是用于擴(kuò)增SEQIDNO:SEQIDNO:80是用于擴(kuò)增SEQIDNO:SEQIDNO:81是用于擴(kuò)增SEQIDNO:SEQIDNO:82是用于擴(kuò)增SEQIDNO:68的正向PCR5物。68的反向PCR物。69的正向PCR《物。69的反向PCR《物。70的正向PCR《物。70的反向PCR弓物。71的正向PCR《物。71的反向PCR《物。72的正向PCR《物。72的反向PCR《物。73的正向PCR引物。73的反向PCR引物。74的正向PCR引物。74的反向PCR引物。75的正向PCR引物。75的反向PCR引物。76的正向PCR引物。76的反向PCR引物。77的正向PCR引物。77的反向PCR引物。78的正向PCR引物。78的反向PCR引物。79的正向PCR引物。79的反向PCR引物。80的正向PCR引物。80的反向PCR引物。81的正向PCR引物。81的反向PCR引物。82的正向PCR引物。82的反向PCR引物。83的正向PCR引物。83的反向PCR引物。13SEQIDNO:SEQIDNO:SEQIDNO:SEQIDNO:SEQIDNO:SEQIDNO:SEQIDNO:SEQIDNO:SEQIDNO:SEQIDNO:SE(5IDNO:SEQIDNO:SEQIDNO:SEqIDNO:SEQIDNO:S已QIDNO:SEQIDNO:SEQIDNO:SEGIDNO:SEQIDNO:SEQIDNO:SEQIDNO:SEGIDNO:SEQIDNO:SEQIDNO:SEQIDNO:SEQIDNO:SEQIDNO:SEQIDNO:SEQIDNO:SEQIDNO:SEQIDNO:83是用于擴(kuò)增SEQIDNO84是用于擴(kuò)增SEQIDNO85是用于擴(kuò)增SEQIDNO86是用于擴(kuò)增SEQIDNO87是用于擴(kuò)增SEQIDNO88是用于擴(kuò)增SEQIDNO89是用于擴(kuò)增SEQIDNO90是用于擴(kuò)增SEQIDNO91是用于擴(kuò)增SEQIDNO92是用于擴(kuò)增SEQIDNO93是用于擴(kuò)增SEQIDNO94是用于擴(kuò)增SEQIDNO95是用于擴(kuò)增SEQIDNO96是用于擴(kuò)增SEQIDNO97是用于擴(kuò)增SEQIDNO98是用于擴(kuò)增SEQIDNO99是用于擴(kuò)增SEQIDNO100是用于擴(kuò)增SEQIDNO101是用于擴(kuò)增SEQIDNO102是用于擴(kuò)增SEQIDNO103是用于擴(kuò)增SEQIDNO104是用于擴(kuò)增SEQIDNO105是用于擴(kuò)增SEQIDNO106是用于擴(kuò)增SEQIDNO107是用于擴(kuò)增SEQIDNO108是用于擴(kuò)增SEQIDNO109是用于擴(kuò)增SEQIDNOIIO是用于擴(kuò)增SEQIDNO111是用于擴(kuò)增SEQIDNO112是用于擴(kuò)增SEQIDNO113是用于擴(kuò)增SEQIDNOH4是用于擴(kuò)增SEQIDNO184184185185186186187187188188189189190190191191192192193193194194195195196196197197198198199199的正向的反向的正向的反向的正向的反向的正向的反向的正向的反向的正向的反向的正向的反向的正向的反向的正向的反向的正向的反向的正向的反向的正向的反向的正向的反向的正向的反向的正向的反向的正向的反向PCRPCRPCRPCRPCRPCRPCRPCRPCRPCRPCRPCRPCRPCRPCRPCRPCR物。物。物。物。物。物。物。物。物。物。物。物。物。物。物。物。物。PCR引物,PCR引物,PCR引物,PCR引物,PCR引物,PCR引物,PCR引物,PCR引物,PCR引物,PCR引物,PCR引物,PCR引物,PCR引物,PCR引物,PCR引物,SEGIDNOSEQIDNOSEQIDNOSEQIDNOSEqIDNOSEQIDNOSEQIDNOSEQIDNOSEQIDNOSEQIDNOSEQIDNOSEQIDNOSEQIDNOSEQIDNOSEQIDNOSEQIDNOSEQIDNOSEQIDNOSEQIDNOSEGIDNOSEQIDNOSEQIDNOSEQIDNOSEQIDNOSEQIDNOSEQIDNOSEQIDNOSEQIDNOSEQIDNO:U5是用于擴(kuò)增SEQIDNO:116是用于擴(kuò)增SEQIDNO:117是用于擴(kuò)增SEQIDNO:118是用于擴(kuò)增SEQIDNO:119是用于擴(kuò)增SEQIDNO:120是用于擴(kuò)增SEQIDNO:121是用于擴(kuò)增SEQIDNO:122是用于擴(kuò)增SEQIDNO:123是用于擴(kuò)增SEQIDNO:124是用于擴(kuò)增SEQIDNO:125是用于擴(kuò)增SEQIDNO:126是用于擴(kuò)增SEQIDNO:127是用于擴(kuò)增SEQIDNO:128是用于擴(kuò)增SEQIDNO:129是用于擴(kuò)增SEQIDNO:130是用于擴(kuò)增SEQIDNO:131是用于擴(kuò)增SEQIDNO:132是用于擴(kuò)增SEQIDNO:133是用于擴(kuò)增SEQIDNO:134是用于擴(kuò)增SEQIDNO:135是用于擴(kuò)增SEQIDNO:136是用于擴(kuò)增SEQIDNO:137是用于擴(kuò)增SEQIDNO:B8是用于擴(kuò)增SEQIDNO:139是用于擴(kuò)增SEQIDNO:140是用于擴(kuò)增SEQIDNO:141是用于擴(kuò)增SEQIDNO:142是用于擴(kuò)增SEQIDNO:143是對應(yīng)于成熟期基因座200的正向PCR虧物。200的反向PCR虧物。201的正向PCRS物。201的反向PCR虧物。202的正向PCR虧物。202的反向PCIU物。203的正向PCR《物。203的反向PCRS物。204的正向PCR引物。204的反向PCR引物。205的正向PCR引物。205的反向PCR引物。206的正向PCR引物。206的反向PCR引物。207的正向PCR引物。207的反向PCR引物。208的正向PCR引物。208的反向PCR引物。209的正向PCR引物。209的反向PCR引物。210的正向PCR引物。210的反向PCR引物。211的正向PCR引物。211的反向PCR引物。212的正向PCR引物。212的反向PCR引物。213的正向PCR引物。23的反向PCR引物。1衍生自大豆的基因組序列列SEQIDNO:144是對應(yīng)于成熟期基因座1衍生自大豆的基因組序SEQIDNO:145是對應(yīng)于成熟期基因座1衍生自大豆的基因組序列。SEQIDNO:46是對應(yīng)于成熟期基因座1衍生自大豆的基因組序列。SEQIDNO:147是對應(yīng)于成熟期基因座1衍生自大豆的基因組序列。SEQIDNO:148是對應(yīng)于成熟期基因座l衍生自大豆的基因組序列。SEQIDNO:149是對應(yīng)于成熟期基因座1衍生自大豆的基因組序列。SEQIDNO:150是對應(yīng)于成熟期基因座l衍生自大豆的基因組序列。SEQIDNO:151是對應(yīng)于成熟期基因座1衍生自大豆的基因組序列。SEQIDNO:152是對應(yīng)于成熟期基因座1衍生自大豆的基因組序列。SEQIDNO:153是對應(yīng)于成熟期基因座1衍生自大豆的基因組序列。SEQIDNO:154是對應(yīng)于成熟期基因座1衍生自大豆的基因組序列。SEQIDNO:155是對應(yīng)于成熟期基因座1衍生自大豆的基因組序列。SEQIDNO:156是對應(yīng)于成熟期基因座2衍生自大豆的基因組序列。SEQIDNO:157是對應(yīng)于成熟期基因座2衍生自大豆的基因組序列。IDNO:158是對應(yīng)于成熟期基因座2衍生自大豆的基因組序列。SEQIDNO:159是對應(yīng)于成熟期基因座2衍生自大豆的基因組序列。SEQIDNO:160是對應(yīng)于成熟期基因座2衍生自大豆的基因組序列。列列列列列列列列列。列列列。列列。列》列SEQSEQSEQSEQSEQSEQSEQSEQSEQSEQSEQSEQSEQSEQSEQSEQIDNO:IDNO:IDNO:IDNO:IDNO:IDNO:IDNO:IDNO:IDNO:IDNO:IDNO:IDNO:IDNO:IDNO:IDNO:IDNO:61是對應(yīng)于成熟期基因座2衍生自大豆的基因組序62是對應(yīng)于成熟期基因座3衍生自大豆的基因組序63是對應(yīng)于成熟期基因座3衍生自大豆的基因組序64是對應(yīng)于成熟期基因座3衍生自大豆的基因組序65是對應(yīng)于成熟期基因座3衍生自大豆的基因組序66是對應(yīng)于成熟期基因座3衍生自大豆的基因組序67是對應(yīng)于成熟期基因座3衍生自大豆的基因組序68是對應(yīng)于成熟期基因座3衍生自大豆的基因組序69是對應(yīng)于成熟期基因座3衍生自大豆的基因組序70是對應(yīng)于成熟期基因座3衍生自大豆的基因組序71是對應(yīng)于成熟期基因座3衍生自大豆的基因組序72是對應(yīng)于成熟期基因座3衍生自大豆的基因組序73是對應(yīng)于成熟期基因座3衍生自大豆的基因組序74是對應(yīng)于成熟期基因座3衍生自大豆的基因組序75是對應(yīng)于成熟期基因座4衍生自大豆的基因組序76是對應(yīng)于成熟期基因座4衍生自大豆的基因組序列列。列列列。列列列列列。列》列列。列。列列SEQSEQSEQSEQSEQSEQSEQSEQSEQSEQSEQSEQSEQSEQSEQSEQIDIDIDIDIDIDIDIDIDIDIDIDIDIDIDIDNO:NO-NO:NO:NO:NO:NO:NO:NO:NO-NO:NO:NO:NO:NO:NO:77是對應(yīng)于成熟期基因座4衍生自大豆的基因組序78是對應(yīng)于成熟期基因座4衍生自大豆的基因組序79是對應(yīng)于成熟期基因座4衍生自大豆的基因組序80是對應(yīng)于成熟期基因座4衍生自大豆的基因組序81是對應(yīng)于成熟期基因座5衍生自大豆的基因組序82是對應(yīng)于成熟期基因座5衍生自大豆的基因組序83是對應(yīng)于成熟期基因座5衍生自大豆的基因組序84是對應(yīng)于成熟期基因座5衍生自大豆的基因組序85是對應(yīng)于成熟期基因座5衍生自大豆的基因組序86是對應(yīng)于成熟期基因座5衍生自大豆的基因組序87是對應(yīng)于成熟期基因座5衍生自大豆的基因組序88是對應(yīng)于成熟期基因座5衍生自大豆的基因組序89是對應(yīng)于成熟期基因座5衍生自大豆的基因組序90是對應(yīng)于成熟期基因座6衍生自大豆的基因組序91是對應(yīng)于成熟期基因座6衍生自大豆的基因組序92是對應(yīng)于成熟期基因座6衍生自大豆的基因組序SEQIDNO:193是對應(yīng)于成熟期基因座6衍生自大豆的基因組序列。SEQIDNO:194是對應(yīng)于成熟期基因座6衍生自大豆的基因組序列。SEQIDNO:195是對應(yīng)于成熟期基因座6衍生自大豆的基因組序列。SEQIDNO:196是對應(yīng)于成熟期基因座6衍生自大豆的基因組序列。SEQIDNO:197是對應(yīng)于成熟期基因座7衍生自大豆的基因組序列。SEQIDNO:198是對應(yīng)于成熟期基因座7衍生自大豆的基因組序列。SEQIDNO:199是對應(yīng)于成熟期基因座7衍生自大豆的基因組序列。SEQIDNO:200是對應(yīng)于成熟期基因座7衍生自大豆的基因組序列。SEQIDNO:201是對應(yīng)于成熟期基因座7衍生自大豆的基因組序列。SEQIDNO:202是對應(yīng)于成熟期基因座7衍生自大豆的基因組序列。SEQIDNO:203是對應(yīng)于成熟期基因座7衍生自大豆的基因組序列。SEQIDNO:204是對應(yīng)于成熟期基因座8衍生自大豆的基因組序列。SEQIDNO:205是對應(yīng)于成熟期基因座8衍生自大豆的基因組序列。SEQIDNO:206是對應(yīng)于成熟期基因座8衍生自大豆的基因組序列uSEQIDNO:207是對應(yīng)于成熟期基因座8衍生自大豆的基因組序列。SEQIDNO:208是對應(yīng)于成熟期基因座8衍生自大豆的基因組序列。SEQIDNO:209是對應(yīng)于成熟期基因座8衍生自大豆的基因組序列。SEQIDNO:210是對應(yīng)于成熟期基因座8衍生自大豆的基因組序列。SEQIDNO:211是對應(yīng)于成熟期基因座8衍生自大豆的基因組序列。SEQIDNO:212是對應(yīng)于成熟期基因座8衍生自大豆的基因組序列。SEQIDNO:213是對應(yīng)于成熟期基因座8衍生自大豆的基因組序列。SEQIDNO214是用于檢測SEQIDNO143的SNP的探針。SEQIDNO215是用于檢測SEQIDNO143的SNP的探針。SEQIDNO216是用于檢測SEQIDNO144的SNP的探針。SEGIDNO217是用于檢測SEQIDNO144的SNP的探針。SEQIDNO218是用于檢測SEQIDNO145的SNP的探針SEQIDNO219是用于檢測SEQIDNO145的SNP的探針。SEQIDNO220是用于檢測SEQIDNO146的SNP的探針。SEQIDNO221是用于檢測SEQIDNO146的SNP的探針。SEQIDNO222是用于檢測SEQIDNO147的SNP的探針。SEQIDNO223是用于檢測SEQIDNO147的SNP的探針。SEQIDNO224是用于檢測SEQIDNO148的SNP的探針。SEQIDNO225是用于檢測SEQIDNO148的SNP的探針。SEQIDNO226是用于檢測SEQIDNO149的SNP的探針。SEQIDNO227是用于檢測SEQIDNO149的SNP的探針。SEQIDNO228是用于檢測SEQIDNO150的SNP的探針。SEQIDNO229是用于檢測SEQIDNO150的SNP的探針。SEQIDNO230是用于檢測SEQIDNO151的SNP的探針。SEQIDNO231是用于檢測SEQIDNO151的SNP的探針。SEGIDNO232是用于檢測SEQIDNO152的SNP的探針。SEQIDNO233是用于檢測SEQIDNO152的SNP的探針。SEQIDNO234是用于檢測SEQIDNO153的SNP的探針。SEQIDNO235是用于檢測SEQIDNO153的SNP的探針。SEQIDNO:236是用于檢測SEQIDNOSEQIDNO:237是用于檢測SEQIDNOSEQIDNO:238是用于檢測SEQIDNOSEQIDNO:239是用于檢測SEQIDNOSEQIDNO:240是用于檢測SEQIDNOSEQIDNO:241是用于檢測SEQIDNOSEQIDNO:242是用于檢測SEQIDNOSEQIDNO:243是用于檢測SEQIDNOSEQIDNO:244是用于檢測SEQIDNOSEQIDNO:245是用于檢測SEQIDNOSEQIDNO:246是用于檢測SEQIDNOSEQIDNO:247是用于檢測SEQIDNOSEQIDNO:248是用于檢測SEQIDNOSEQIDNO:249是用于檢測SEQIDNO:SEQIDNO:250是用于檢測SEQIDNO:SEQIDNO:251是用于檢測SEQIDNO:SEQIDNO:252是用于檢測SEQIDNO:SEQIDNO:253是用于檢測SEQIDNO:SEQIDNO:254是用于檢測SEQIDNO:SEQIDNO:255是用于檢測SEQIDNO:SEQIDNO:256是用于檢測SEQIDNO:SEQIDNO:257是用于檢測SEQIDNO:SEQIDNO:258是用于檢測SEQIDNO:SEQIDNO:259是用于檢測SEQIDNO:SEQIDNO:260是用于檢測SEQIDNO:SEQIDNO:261是用于檢測SEQIDNO:SEQIDNO:262是用于檢測SEQIDNO:SEQIDNO:263是用于檢測SEQIDNO:SEQIDNO:264是用于檢測SEQIDNO:SEQIDNO:265是用于檢測SEQIDNO:SEQIDNO:266是用于檢測SEQIDNO:SEQIDNO:267是用于檢測SEQIDNO:54的SNP的探針。54的SNP的探針。55的SNP的探針。55的SNP的探針。56的SNP的探針。56的SNP的探針。57的SNP的探針。57的SNP的探針。58的SNP的探針。58的SNP的探針。59的SNP的探針。59的SNP的探針。60的SNP的探針。60的SNP的探針。61的SNP的探針。61的SNP的探針。62的SNP的探針。62的SNP的探針。63的SNP的探針。63的SNP的探針。64的SNP的探針。64的SNP的探針。65的SNP的探針。65的SNP的探針。66的SNP的探針。66的SNP的探針。67的SNP的探針。67的SNP的探針。68的SNP的探針。68的SNP的探針。69的SNP的探針。69的SNP的探針。SEOIDNO:268是用于檢測SEQIDNO:170的SNP的探針。SEQIDNO:269是用于檢測SEQIDNO'170的SNP的探針。SEQIDNO:270是用于檢測SEQIDNO:171的SNP的探針。SEQIDNO:271是用于檢測SEQIDNO:171的SNP的探針。SEQIDNO:272是用于檢測SEQIDNO172的SNP的探針。SEQIDNO:273是用于檢測SEQIDNO172的SNP的探針。SEGIDNO:274是用于檢測SEQIDNO173的SNP的探針。SEQIDNO:275是用于檢測SEQIDNO173的SNP的探針。SEQIDNO:276是用于檢測SEQIDNO174的SNP的探針。SEQIDNO:277是用于檢測SEQIDNO174的SNP的探針。SEQIDNO:278是用于檢測SEQIDNO175的SNP的探針。SEQIDNO:279是用于檢測SEQIDNO175的SNP的探針。SEQIDNO:280是用于檢測SEQIDNO176的SNP的探針。SEGIDNO:281是用于檢測SEQIDNO176的SNP的探針。SEQIDNO:282是用于檢測SEQIDNO'177的SNP的探針。SEQIDNO:283是用于檢測SEQIDNO:177的SNP的探針。SEQIDNO:284是用于檢測SEQIDNO:178的SNP的探針。SEQIDNO:285是用于檢測SEQIDNO.178的SNP的探針。SEQIDNO:286是用于檢測SEQIDNO:179的SNP的探針。SEQIDNO:287是用于檢測SEQIDNO179的SNP的探針。SEQIDNO:288是用于檢測SEQIDNO.180的SNP的探針。SEQIDNO:289是用于檢測SEQIDNO180的SNP的探針。SEQIDNO:290是用于檢測SEQIDNO181的SNP的探針。SEQIDNO:291是用于檢測SEQIDNO181的SNP的探針。SEQIDNO:292是用于檢測SEQIDNO182的SNP的探針。SEQIDNO:293是用于檢測SEQIDNO182的SNP的探針。SEQIDNO:294是用于檢測SEQIDNO183的SNP的探針。SEQIDNO:295是用于檢測SEQIDNO183的SNP的探針。SEQIDNO:296是用于檢測SEQIDNO184的SNP的探針。SEQIDNO:297是用于檢測SEQIDNO184的SNP的探針。SEQIDNO:298是用于檢測SEQIDNO185的SNP的探針。SEQIDNO:299是用于檢測SEQIDNO'185的SNP的探針。22SEQIDNO:300是用于檢測SEQIDNOSEQIDNO:301是用于檢測SEQIDNOSEQIDNO:302是用于檢測SEQIDNOSEQIDNO:303是用于檢測SEQIDNOSEQIDNO:304是用于檢測SEQIDNOSEQIDNO:305是用于檢測SEQIDNOSEQIDNO:306是用于檢測SEQIDNOSEQIDNO:307是用于檢測SEQIDNOSEQIDNO:308是用于檢測SEQIDNOSEQIDNO:309是用于檢測SEQIDNOSEQIDNO:310是用于檢測SEQIDNO:SEQIDNO:311是用于檢測SEQIDNO:SEQIDNO:312是用于檢測SEQIDNOSEQIDNO:313是用于檢測SEQIDNO:SEQIDNO:314是用于檢測SEQIDNO:SEQIDNO:315是用于檢測SEQIDNO:SEQIDNO:316是用于檢測SEQIDNO:SEQIDNO:317是用于檢測SEQIDNO:SEQIDNO:318是用于檢測SEQIDNO:SEQIDNO:319是用于檢測SEQIDNO:SEQIDNO:320是用于檢測SEQIDNO:SEQIDNO:321是用于檢測SEQIDNO:SEQIDNO:322是用于檢測SEQIDNO:SEQIDNO:323是用于檢測SEQIDNO:SEQIDNO:324是用于檢測SEQIDNOSEQIDNO:325是用于檢測SEQIDNO:SEQIDNO:326是用于檢測SEQIDNO:SEQIDNO:327是用于檢測SEQIDNO:S已QIDNO:328是用于檢測SEQIDNO:SEQIDNO:329是用于檢測SEQIDNO:SEQIDNO:330是用于檢測SEQIDNO:SEQIDNO:331是用于檢測SEQIDNO:186的SNP的探針。186的SNP的探針。187的SNP的探針。187的SNP的探針。188的SNP的探針。188的SNP的探針。189的SNP的探針。189的SNP的探針。190的SNP的探針。190的SNP的探針。191的SNP的探針。191的SNP的探針。192的SNP的探針。192的SNP的探針。193的SNP的探針。193的SNP的探針。194的SNP的探針。194的SNP的探針。195的SNP的探針。195的SNP的探針。196的SNP的探針。196的SNP的探針。197的SNP的探針。197的SNP的探針。198的SNP的探針。198的SNP的探針。199的SNP的探針。199的SNP的探針。200的SNP的探針。200的SNP的探針。201的SNP的探針。201的SNP的探針。SE(5IDNO332是用于檢測SEQIDNO:202的SNP的探針。SEQIDNO:333是用于檢測SEQIDNO:202的SNP的探針。SE(5IDNO:334是用于檢測SEQIDNO:203的SNP的探針。SEGIDNO,335是用于檢測SEQIDNO:203的SNP的探針。SEQIDNO336是用于檢測SEQIDNO:204的SNP的探針。SEQIDNO337是用于檢測SEQIDNO:204的SNP的探針。SEQIDNO338是用于檢測SEQIDNO:205的SNP的探針。SEQIDNO339是用于檢測SEQIDNO:205的SNP的探針。SEGIDNO340是用于檢測SEQIDNO:206的SNP的探針。SEQIDNO341是用于檢測SEQIDNO:206的SNP的探針。SEQIDNO342是用于檢測SEQIDNO:207的SNP的探針。SEQIDNO343是用于檢測SEQIDNO:207的SNP的探針。SEQIDNO344是用于檢測SEQIDNO:208的SNP的探針。SEQIDNO345是用于檢測SEQIDNO:208的SNP的探針。SEQIDNO346是用于檢測SEQIDNO:209的SNP的探針。SEQIDNO347是用于檢測SEQIDNO:209的SNP的探針。SEQIDNO'348是用于檢測SEQIDNO:210的SNP的探針。SEQIDNO349是用于檢測SEQIDNO:210的SNP的探針。SEQIDNO350是用于檢測SEQIDNO:211的SNP的探針。SEQIDNO351是用于檢測SEQIDNO:211的SNP的探針。SEQIDNO352是用于檢測SEQIDNO:212的SNP的探針。SEQIDNO353是用于檢測SEQIDNO:212的SNP的探針。SEQIDNO354是用于檢測SEQIDNO:213的SNP的探針。SEQIDNO355是用于檢測SEQIDNO:213的SNP的探針。定義"成熟期組值"可以是提供植物將何時(shí)成熟的指示的任何指示數(shù)字、符號或2者的組合。"顯性成熟期等位基因"是當(dāng)以單拷貝(雜合的)或2個(gè)拷貝(純合的)存在時(shí)，影響植物成熟期的等位基因。"隱性成熟期等位基因"是當(dāng)以單拷貝(雜合的)存在時(shí)，不影響植物成熟期的等位基因。如本文所使用的，有限生長習(xí)性指在主莖在成熟莢果簇中終止后200880017206.8說明書第21/74頁停止?fàn)I養(yǎng)生長如本文所使用的，無限生長習(xí)性指在其生殖期部分自始至終同時(shí)發(fā)育葉和花，在終端頂點(diǎn)處具有1-3個(gè)莢果。如本文所使用的，等位基因組合是在超過一個(gè)表征的位置或基因座處存在的等位基因組合。等位基因組合的例子是等位基因組合10，其在成熟期基因組區(qū)域l處是純合顯性的；在成熟期基因組區(qū)域2處是純合隱性的；并且在成熟期基因組區(qū)域3處是純合顯性的。如本文所使用的，"系"指來自具有相似性狀的相似家系的個(gè)別植物組。"原種系"是已由就優(yōu)良農(nóng)業(yè)性能育種和選擇產(chǎn)生的任何系。此外，原種系是充分同質(zhì)且純合的以用于商業(yè)生產(chǎn)。原種系可以在進(jìn)一步的育種努力中用于開發(fā)新原種系。原種植物是來自原種系的任何植物。如本文所使用的，"性狀"指生物可觀察和/或可測量的特征，例如植物的性狀，例如對除草劑、昆蟲和微生物的耐受性。性狀可以是常規(guī)和轉(zhuǎn)基因的。性狀的非限制性例子包括除草劑耐受性、增加的產(chǎn)量、昆蟲控制、真菌病抗性、病毒抗性、線蟲抗性、細(xì)菌病抗性、支原體病抗性、改變的油生產(chǎn)、高油生產(chǎn)、高蛋白質(zhì)生產(chǎn)、萌發(fā)和幼苗生長控制、增強(qiáng)的動(dòng)物和人營養(yǎng)、低棉子糖、環(huán)境應(yīng)激抗性、增加的可消化性、工業(yè)酶、藥物蛋白質(zhì)、肽和小分子、改善的處理性狀、改善的風(fēng)味、固氮作用、雜種種子生產(chǎn)、減少的變應(yīng)原性、生物聚合物和生物燃料。如本文所使用的，"轉(zhuǎn)基因"指通過植物轉(zhuǎn)化方法放置到生物內(nèi)的外來基因。在某些方面，由本發(fā)明提供的大豆植物可以包含一種或多種轉(zhuǎn)基因。如本文所使用的，"改變的，，意指在成熟期方面增加或減少。在這個(gè)方面，成熟種子定義為在田地中收獲的用于商業(yè)農(nóng)業(yè)實(shí)踐的種子，例如用于飼料銷售。在一個(gè)方面，就優(yōu)選的地理選擇大豆植物用于表達(dá)至少一種表型性狀。表型性狀包括改變的物質(zhì)或分子水平，例如蛋白質(zhì)、油或y亞麻酸。"改變的"可以包括目的基因產(chǎn)物的功能或生產(chǎn)的任何相對增加或減少，在一個(gè)方面直至并且包括那種基因產(chǎn)物的功能或生產(chǎn)的完全消除。當(dāng)比較基因產(chǎn)物水平時(shí)，此種比較優(yōu)選在具有相似遺傳背景的生物之間進(jìn)行。優(yōu)選地，相似的遺傳背景是其中被比較的生物共享核遺25傳材料的50%或更多、更優(yōu)選75%或更多、并且甚至更加優(yōu)選90%或更多的序列同一性的背景。在另一個(gè)方面，相似的遺傳背景是其中除本發(fā)明的一種或多種標(biāo)記外，植物是等基因的背景。如本文所使用的，"栽培品種"是有意制備或選擇并且通過栽培維持的植物的種或品種。如本文所使用的，術(shù)語"組織培養(yǎng)"指示包含相同或不同類型的分離細(xì)胞的組成或組織為植物部分的此種細(xì)胞集合。發(fā)明詳述長中是重要的。本發(fā)明的一個(gè)方面提供確定植物或種子應(yīng)在何處生長的方法?？梢源_定大豆植物或種子的合適區(qū)域。區(qū)域的確定可以包括選擇合適的成熟期帶區(qū)域。成熟期帶在美國范圍為從美國極北方的OOO到南方GulfCoast州中的VIII。本發(fā)明還可以用于測定包括IX和X的其他成熟期帶。本發(fā)明可以進(jìn)一步用于測定植物是否適合于一個(gè)、兩個(gè)或更多個(gè)成熟期帶或區(qū)域。合適的地理區(qū)可以使用本發(fā)明的方法進(jìn)行選擇。除成熟期帶外，可以選擇的其他地理區(qū)包括成熟期組0區(qū)域，例如且不限于，WesternMaine、NorthDakota、CentralMontana、NorthwesternOregon;成熟期組1區(qū)域，例如且不限于，northernWisconsin、SouthDakota;成熟期組2區(qū)域，例如且不卩艮于，Vermont、SouthernMassachusetts、NorthernConnecticut、NewYork、CentralFlorida、Michigan、NorthernIllinois、SouthernWisconsin、Iowa、Nebraska、Colorado、CentralCalifornia;成熟期組3區(qū)域，例如且不P艮于，WesternNewHampshire、Pennsylvania、Ohio、Indiana、SouthernIllinois、NorthernMissouri、Kansas、SoutheastWyoming、Colorado;成熟期組4區(qū)域，例如且不限于，Maryland、NorthernVirginia、Kentucky、WesternWestVirginia、CentralMissouri、Texas、WesternOklahoma;成熟期組5區(qū)域，例如且不限于，CentralVirginia、NorthCarolina、Central和WesternNorthCarolina、Mississippi、Louisiana、Tennessee;成熟期組6區(qū)域，例如且不限于，NorthCarolina、EasternSouthCarolina;和成熟期組7區(qū)域，例如且不限于，Georgia和Alabama。在另一個(gè)方面，本發(fā)明的種子可以送到希望最優(yōu)化性狀例如產(chǎn)量的地理區(qū)定大豆植物或種子的成熟期組的方法。本發(fā)明的一個(gè)方面包括確定大豆植物應(yīng)在何處生長的方法，這通過獲得來自大豆植物的DNA;并且使用標(biāo)記SEQIDNO:151測定在成熟期基因組區(qū)域1內(nèi)的等位基因是純合還是雜合的來實(shí)現(xiàn)。本發(fā)明允許測定等位基因組合。等位基因組合可以是等位基因的任何組合。在一個(gè)方面，它可以是占據(jù)遺傳基因座的2、3、4、5、6、7或8對等位基因的組合。在另一個(gè)方面，等位基因可以位于2、3、4、5、6、7或8個(gè)或更多個(gè)成熟期基因組區(qū)域內(nèi)。此種成熟期區(qū)域可以選自成熟期基因組區(qū)域l、成熟期基因組區(qū)域2、成熟期基因組區(qū)域3、成熟期基因組區(qū)域4、成熟期基因組區(qū)域5、成熟期基因組區(qū)域6、成熟期基因組區(qū)域7、或成熟期基因組區(qū)域8等。在成熟期區(qū)域的任何組合處的等位基因可以單獨(dú)或組合測定。一個(gè)舉例說明性組合是在成熟期區(qū)域1、2和3處超過一對等位基因的組合。另一個(gè)舉例說明性組合是在成熟期區(qū)域1和2處超過一對等位基因的組合。"等位基因組合"意欲包括但不限于，在特定基因座處的任何純合顯性、純合隱性和雜合替換物(alternative)。測定在一個(gè)或多個(gè)基因座處的等位基因或等位基因組合可以通過任何合適的方法來執(zhí)行。在一個(gè)方面，可以使用各種測定，例如Taq-Man(S)測定、實(shí)時(shí)PCR、和核酸測序、和簡單序列重復(fù)作圖，以檢測基因型。在本發(fā)明的一個(gè)方面，測定包括本發(fā)明的核酸分子。核酸包括脫氧核酸(DNA)和核糖核酸(RNA)及其功能上等價(jià)的類似物。用于在本發(fā)明中使用的核酸可以得自植物，例如植物部分，所迷植物部分包括葉、維管組織、花、莢果、種子、根、莖或任何的部分。在一個(gè)方面，使用非破壞性方法從植物或植物部分獲得核酸。在一個(gè)方面，植物部分是種子。在一個(gè)方面，以保證存活種子的非破壞性方式從種子獲得核酸。例如，通過用鋒利的刀在距離'眼，最遠(yuǎn)的部分處削種子，或通過用針小心地刺穿以刺破種子，可以從種子獲得DNA。可以使用將獲得DNA用于分析或允許DNA原位分析的任何方法，前提是植物或植物部分保持生長能力。如果DNA取自種子，并且種子仍是存活的，那么方法可以視為非破壞性的。取樣種子而不影響種子的萌發(fā)生存力的示例性方法在美國專利申請公開20060042527A1中詳述，所迷專利申請?jiān)诖艘胱鳛閰⒖?。在一個(gè)方面，種子通過下述進(jìn)行取樣，將種子個(gè)別地供給取樣臺，從取樣臺中的種子取出樣品，將樣品傳送給樣品托盤中的區(qū)室，并且將種子傳送給種子托盤中的相應(yīng)區(qū)室。在一個(gè)方面，在大豆屬內(nèi)引入或選擇與本發(fā)明植物成熟期和植物生長習(xí)性相關(guān)的成熟期基因組區(qū)域。大豆屬包括野生多年生大豆，并且具有遺傳多樣性的廣泛陣列。例如，栽培的大豆(G(yc/"e/noxa.)Merr,)及其野生一年生祖先(野大豆(G/yc/"esoy")"ieb.和Zucc.))屬于Sp/"亞屬，包含2n-40個(gè)染色體，是雜交相容的，通常產(chǎn)生茂盛的能育F,雜種，并且攜帶相似基因組。在栽培的大豆屬物種和野生多年生大豆屬物種之間的雜交具有在樣本間的可變成功。本發(fā)明進(jìn)一步規(guī)定所選擇植物來自大豆屬成員，更具體而言來自G7戸力6、G7戸'we、caw^"附、彰湖大豆(G7戶'"ec/a"c/eWwe)、G7戶'wecwrv"fa、G7"'wec盧o/o6a、G7y".we,"/c"/e、G7戸'we/a爭/,"、G7戸'"eto"o6eawa、大豆(G7戸.wewax)、rw//'g/"ava、野大豆((7(y""e一")、大豆屬物種(G7戸'"es/.)、G7戶we'"e"o;/z"ar、煙豆(G7戶'"ew6""'w")和短絨野大豆(G7y"'wefoweMZe〃a)。在一個(gè)方面，本發(fā)明的植物選自原種大豆系。需植物成熟期大豆植物，所述i^擇包括就標(biāo)記分子的^在測定基因組核酸，所述標(biāo)記分子與和大豆植物中的植物成熟期相關(guān)的基因組區(qū)域在遺傳上連鎖，其中基因組區(qū)域也位于與優(yōu)選植物成熟期的大豆植物相關(guān)的連鎖群上。是否包含多態(tài)性:或在選自下述的成熟期區(qū)域上是純i還是雜i的:"成熟期基因組區(qū)域l、成熟期基因組區(qū)域2、成熟期基因組區(qū)域3、成熟期基因組區(qū)域4、成熟期基因組區(qū)域5、成熟期基因組區(qū)域6、成熟期基因組區(qū)域7、和/或成熟期基因組區(qū)域8,所述核酸分子包括選自SEQIDNOs:143-174的序列或其片段、或其互補(bǔ)體。本發(fā)明包括鑒定在8個(gè)成熟期組區(qū)域處的等位基因。這些區(qū)域稱為成熟期基因組區(qū)域1到8。測定選自下迷的1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12或13種或更多遺傳標(biāo)記的等位基因進(jìn)行監(jiān)控NS0093385、NS0093976、NS0096829、NS0097798、NS0098982、NS00995929、NS0099746、NS0103749、NS0123747、NS0124601、NS0125408、NS0128378和NS0135390。關(guān)于區(qū)域1的SNP標(biāo)記DNA序列包括呈現(xiàn)為SEQIDNO:143到SEQIDNO:155的那些，并且可以使用指示為SEQIDNO:1到SEQIDNO:26的引物與指示為SEQIDNO:214到SEQIDNO:239的探針進(jìn)行擴(kuò)增。在另一個(gè)方面，成熟期基因組區(qū)域1是與SEQIDNOs:143-149、154-155相關(guān)的區(qū)域。在另一個(gè)方面，成熟期基因組區(qū)域1是與SEQIDNO:149或SEQIDNO:151或兩者相關(guān)的區(qū)域。在一個(gè)方面，成熟期基因組區(qū)域1可以跨越SEQIDNO:149或SEQIDNO:151任一側(cè)l厘摩(cM)、5cM、10cM、15cM、20cM或30cM。本發(fā)明的一個(gè)方面包括測定大豆種子是否將成長為具有III-IV成熟期組的大豆植物的方法，這通過使用具有SEQIDNO:151的核酸序列的標(biāo)記測定在大豆種子內(nèi)的純合或雜合標(biāo)記來實(shí)現(xiàn)。在優(yōu)選方面，純合標(biāo)記可以是隱性或顯性的。在另一個(gè)優(yōu)選方面，當(dāng)標(biāo)記是純合顯性時(shí)，植物的成熟期延遲。本發(fā)明的另一個(gè)方面包括測定大豆種子是否將成長為具有O.O-III.O成熟期組的大豆植物的方法，其包括測定在SEQIDNO:149的核酸序列內(nèi)的11堿基對插入是否存在于大豆種子中。測定1、'2、;、4,、5A6種或更多i傳標(biāo)記的等位i^進(jìn)行2;空,、所迷遺傳標(biāo)記包括選自NS0118907、NS0122182、NS0126989、NS097952、NSO123506和NS0095677的那些。關(guān)于區(qū)域2的SNP標(biāo)記DNA序列包括呈現(xiàn)為SEQIDNO:156到SEQIDNO:161的那些，并且可以使用指示為SEQIDNO:27到SEQIDNO:38的引物與指示為SEQIDNO:240到SEQIDNO:251的探針進(jìn)行擴(kuò)增。在另一個(gè)方面，成熟期基因組區(qū)域2是與SEQIDNO:158相關(guān)的區(qū)域。在另一個(gè)方面，成熟期基因組區(qū)域2是與SEQIDNOs:156-161相關(guān)的區(qū)域。在一個(gè)方面，成熟期基因組區(qū)域2可以跨越SEQIDNO:158任一側(cè)lcM、5cM、10cM、15cM、20cM或30cM。29成熟期基因組區(qū)域3的純合性或雜合性和顯性或隱性狀態(tài)可以通過測定1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12或13種或更多遺傳標(biāo)記的等位基因進(jìn)行監(jiān)控，所迷遺傳標(biāo)記包括選自NS0098853、NS0092561、NS0093197、NS0094891、NS0096225、NS0103853、NS0H3929、固115535、NS01215U、NS0136544、NS0119569、NS0123708和NS0114317的那些。關(guān)于區(qū)域3的SNP標(biāo)記DNA序列包括呈現(xiàn)為SEQIDNO:162到SEQIDNO:174的那些，并且可以使用指示為SEQIDNO:39到SEQIDNO:64的引物與指示為SEQIDNO:252到SEQIDNO:277的探針進(jìn)行擴(kuò)增。在另一個(gè)方面，成熟期基因組區(qū)域3是與SEQIDNOs:164、167、171-174相關(guān)的區(qū)域。在另一個(gè)方面，成熟期基因組區(qū)域3是與SEQIDNO:169相關(guān)的區(qū)域。在一個(gè)方面，成熟期基因組區(qū)域3可以跨越SEQIDNO:169任一側(cè)1cM、5cM、10cM、15cM、20cM或30cM。測定l、2、3、4、5或6種或更多遺傳標(biāo)記的等位基因進(jìn)行監(jiān)控，所迷遺傳標(biāo)記包括選自NS0092743、NS0098176、NS0畫078、NS0137415、NS0095530和NSO〗29004的那些。關(guān)于區(qū)域4的SNP標(biāo)記DNA序列呈現(xiàn)為SEQIDNO:175到SEQIDNO:180,并且可以使用指示為SEQ1DNO:65到SEQIDNO:76的引物與指示為SEQIDNO:278-289的探針進(jìn)行擴(kuò)增。在另一個(gè)方面，成熟期基因組區(qū)域4是與SEQIDNO:^8相關(guān)的區(qū)域。在一個(gè)方面，成熟期基因組區(qū)域4可以跨越SEQIDNO:178任一側(cè)lcM、5cM、10cM、15cM、20cM或30cM。本發(fā)明的一個(gè)方面包括通過使用選自SEQIDNO:175-180中任何一種的標(biāo)記檢測等位基因而檢測成熟期基因組區(qū)域4的方法。成熟期基因組區(qū)域5的純合性或雜合性和顯性或隱性狀態(tài)可以通過測定1、2、3、4、5、6、7、8或9種或更多遺傳標(biāo)記的等位基因進(jìn)行監(jiān)控，所迷遺傳標(biāo)記包括選自NS0120015、NS0U3878、NS0101863、NS0115066、NS0123168、NS0119165、NS0123724、NS0103446和NS0099024的那些。關(guān)于區(qū)域5的SNP標(biāo)記DNA序列包括呈現(xiàn)為SEQ1DNO:181到SEQ1DN0:189的那些，并且可以使用指示為SEQIDNO:77到SEQIDNO:94的引物與指示為SEQIDNO:290到SEQIDNO:307的探針進(jìn)行擴(kuò)增。在另一個(gè)方面，成熟期基因組區(qū)域5是與SEQIDNO:187相關(guān)的區(qū)域。在一個(gè)方面，成熟期基因組區(qū)域5可以跨越SEQIDNO:187任一側(cè)1cM、5cM、10cM、15cM、20cM或30cM。本發(fā)明的一個(gè)方面包括通過使用選自SEQIDNO:181-189中任何一種的標(biāo)記^f企測等位基因而檢測成熟期基因組區(qū)域5的方法。測定1、2、3、4、5、6或7種或更多遺傳標(biāo)記的等位基因進(jìn)行監(jiān)控，所迷遺傳標(biāo)記包括選自NS0116125、NS0125770、NS0103755、NS0125713、NS0124590、NS0119281和NS0102717的那些。關(guān)于區(qū)域6的SNP標(biāo)記DNA序列包括呈現(xiàn)為SEQIDNO:190到SEQIDNO:196的那些，并且可以使用指示為SEQIDNO:95到SEQIDNO:108的引物與指示為SEQIDNO:308到SEQIDNO:321的探針進(jìn)行擴(kuò)增。在另一個(gè)方面，成熟期基因組區(qū)域6是與SEQIDNO:192相關(guān)的區(qū)域。在一個(gè)方面，成熟期基因組區(qū)域6可以跨越SEQIDNO:192任一側(cè)1cM、5cM、10cM、15cM、20cM或30cM。本發(fā)明的一個(gè)方面包括通過使用選自SEQIDNO:190-196中任何一種的標(biāo)記檢測等位基因而檢測成熟期基因組區(qū)域6的方法。測定i、'、2、i:、5、、或7種或i多遺傳標(biāo)記的^^基因;;亍監(jiān)控:所述遺傳標(biāo)記包括選自NS0095211、NS0099531、NS0099417、NS0097307、NS0103004、NS0102630和NS0102915的那些。關(guān)于區(qū)域7的SNPDNA序列包括呈現(xiàn)為SEQIDNO:197到SEQIDNO:203的那些，并且可以使用指示為SEQIDNO:109到SEQIDNO:122的引物與指示為SEQIDNO:322到SEQIDNO:335的探針進(jìn)行擴(kuò)增。在另一個(gè)方面，成熟期基因組區(qū)域7是與SEQIDNO:202相關(guān)的區(qū)域。在一個(gè)方面，成熟期基因組區(qū)域7可以;凈越SEQIDNO:202任一側(cè)1cM、5cM、10cM、15cM、20cM或30cM。本發(fā)明的一個(gè)方面包括通過使用選自SEQIDNO:197-203中任何一種的標(biāo)記檢測等位基因而檢測成熟期基因組區(qū)域7的方法。成熟期基因組區(qū)域8的純合性或雜合性和顯性或隱性狀態(tài)可以通過測定1、2、3、4、5、6、7、8、9或10種或更多遺傳標(biāo)記的等位基因進(jìn)行監(jiān)控，所述遺傳標(biāo)記包括選自N0102362、NS0100652、NS0117716、NS0119574、NS0127728、NS0099639、NS0103255、NS0119106、31NS0101020和NS0101779的那些。關(guān)于區(qū)域8的SNPDNA序列包括呈現(xiàn)為SEQIDNO:204到SEQIDNO:213的那些，并且可以使用指示為SEQIDNO:123到SEQIDNO:142的引物與指示為SEQIDNO:336到SEQIDNO:355的探針進(jìn)行擴(kuò)增。在另一個(gè)方面，成熟期基因組區(qū)域8是與SEQIDNO:204相關(guān)的區(qū)域。在一個(gè)方面，成熟期基因組區(qū)域8可以跨越SEQIDNO:204任一側(cè)1cM、5cM、10cM、15cM、20cM或30cM。本發(fā)明的一個(gè)方面包括通過使用選自SEQIDNO:204-213中任何一種的標(biāo)記檢測等位基因而檢測成熟期基因組區(qū)域8的方法。本發(fā)明的核酸分子或其片段能夠與其他核酸分子特異性雜交，在某些情況下也包括在本發(fā)明中。在一個(gè)方面，本發(fā)明的核酸分子包含SEQIDNO:143-213中的任何一種、其互補(bǔ)體和任何一種的片段。在另一個(gè)方面，本發(fā)明的核酸分子包括例如在高或低嚴(yán)格性下與基本上同源的序列雜交的核酸分子，或在兩種情況下與這些分子雜交的核酸分子。如本文所使用的，如果2種分子能夠形成反向平行、雙鏈核酸結(jié)構(gòu)，那么2種核酸分子能夠彼此特異性雜交。核酸分子是另一種核酸分子的"互補(bǔ)體"，如果它們顯示出完全互補(bǔ)性的話。如本文所使用的，當(dāng)分子之一的每一個(gè)核苷酸與另一種的核苷酸互補(bǔ)時(shí)，分子顯示出"完全互補(bǔ)性"。2種分子是"最低限度互補(bǔ)的"，如果它們以足夠的穩(wěn)定性彼此雜交，以允許它們在至少常規(guī)"低嚴(yán)格性"條件下保持對彼此退火。相似地，分子是"互補(bǔ)的，，，如果它們可以以足夠的穩(wěn)定性彼此雜交，以允許它們在常規(guī)"高嚴(yán)格性"條件下保持對彼此退火。常規(guī)嚴(yán)格性條件由Sambrook等人在yV/o/ec'w/a/"C7ow/"g,>4厶a6on^o^yA^mwfl/,岸2成，Co/c///a^wr/Ve^，ColdSpringHarbor,NewYork(1989)中描述，并且由Haymes等人在iVwc/e/cy4c/d//_y6r/c//》a0ow,爿尸m"/ca/^4//roac/z,IRLPress,Washington,DC(1985)中描迷。偏離完全互補(bǔ)性因此是允許的，只要此種偏離不完全排除分子形成雙鏈結(jié)構(gòu)的能力。為了使核酸分子充當(dāng)引物或探針，它僅需要在序列中充分互補(bǔ)，以能夠在采用的具體溶刑和鹽濃度下形成穂定的雙鏈結(jié)構(gòu)。如本文所使用的，基本上同源的序列是將在高嚴(yán)格性條件下與和它相比較的核酸序列的互補(bǔ)體特異性雜交的核酸序列。本發(fā)明的核酸探針和引物可以在嚴(yán)格條件下與靶DNA序列雜交。術(shù)語"嚴(yán)格雜交條件，，定32義為在其下探針或引物與一種或多種靶序列并且不與非靶序列特異性雜交的條件，如可以憑經(jīng)驗(yàn)確定的。術(shù)語"嚴(yán)格條件"就核酸探針與靶核酸(即，與目的具體核酸序列)雜交而言進(jìn)行功能上定義，所述雜交通過Sambrook等人，1989在9.52-9.55中討論的具體雜交程序。還參見，Sambrook等人,1989在9.47-9.52，9.56-9.58處;Kanehisa，腸/.爿"A尺w.12:203-213,1984;以及Wetmur和Davidson,,JWb/.S/o/,31:349-370,1968。促進(jìn)DNA雜交的合適嚴(yán)格性條件是例如在約45。C下6.0x氯化鈉/檸檬酸鈉(SSC),隨后為在50'C下2.0xSSC的洗涂，是本領(lǐng)域技術(shù)人員已知的，或可以在CurrentProtocolsinMolecularBiology,JohnWiley&Sons,RY.,1989,6.3.1-6.3.6中發(fā)現(xiàn)。例如，洗涂步驟中的鹽濃度可以選自在5(TC下約2.0xSSC的低嚴(yán)格性到在50。C下約0.2xSSC的高嚴(yán)格性。此外，在洗滌步驟中的溫度可以從在室溫約22'C下的低嚴(yán)格性條件增至在約65t下的高嚴(yán)格性條件。溫度和鹽都可以改變，或者溫度或鹽濃度可以保持恒定而另一個(gè)變量改變。例如，對于高嚴(yán)格性，使用DNA或RNA探針或引物的雜交可以在65。C下在6xSSC、0.5%SDS、5xDenhardt，s、100pg/mL非特異性DNA(例如，超聲處理的鮭精DNA)中伴隨在65。C下以0.5xSSC、0.5%SDS的洗涂進(jìn)行。預(yù)期如果保留探針或引物與一種或多種靶序列結(jié)合的特異性，那么較低嚴(yán)格性的雜交條件例如較低的雜交和/或洗滌溫度可以用于鑒定具有較低序列同一性程度的相關(guān)序列。因此，本發(fā)明的核苷酸序列可以就其與DNA、RNA或cDNA片段的互補(bǔ)序列段選擇性形成雙鏈體分子的能力使用。DNA區(qū)段經(jīng)由雜交的檢測是本領(lǐng)域技術(shù)人員眾所周知的，并且因此依賴于設(shè)想的應(yīng)用，人們將希望采用不同的雜交條件以達(dá)到探針對于靶序列各種程度的選擇性，并且選擇方法將依賴于所需結(jié)果。如本文所使用的，試刑是天然存在的分子，或若需要?jiǎng)t另外可以是"基本上純化的"，指與它在其天然狀態(tài)中通常與之結(jié)合的基本上所有其他分子分開的分子。更優(yōu)選地，基本上純化的分子是制劑中存在的占優(yōu)勢種類?；旧霞兓姆肿涌梢猿^60%不含、優(yōu)選75%不含、更優(yōu)選90%不含、并且最優(yōu)選95%不含在天然混合物中存在的其他分子(排除溶劑)。術(shù)語"基本上純化的"不意欲包含以其天然狀態(tài)存在的分子。就結(jié)構(gòu)屬性例如核酸與另一種核酸分子雜交的能力，或蛋白質(zhì)由抗體結(jié)合(或與另一種分子竟?fàn)幋朔N結(jié)合)的能力而言，本發(fā)明的試劑將優(yōu)選是"生物學(xué)活性的"?？商娲?，此種屬性可以是催化的，并且因此涉及試劑介導(dǎo)化學(xué)反應(yīng)或應(yīng)答的能力。本發(fā)明的試劑還可以是重組的。如本文所使用的，術(shù)語重組意指任何試劑(例如DNA、肽等)，其是核酸分子的人為處理或由核酸分子的人為處理產(chǎn)生，盡管是間接的。本發(fā)明的試劑可以用這樣的試劑進(jìn)行標(biāo)記，所述試劑促進(jìn)試劑的檢測(例如熒光標(biāo)記(Prober等人，5We"ce238:336-340(1987);歐洲專利號144914)、化學(xué)標(biāo)記(美國專利號4,582,789;美國專利號4,563,417)、修飾堿基(歐洲專利號119448),所有專利都整體引入本文作為參考)。在一個(gè)方面，本發(fā)明的試劑將與SEQIDNO:143到SEQIDNO:213中所示的一種或多種核酸分子或其互補(bǔ)體或任一的片段在中等嚴(yán)格條件下特異性雜交，所述中等嚴(yán)格條件例如在約2.0xSSC和約65'C下。在一個(gè)方面，本發(fā)明的核酸將與SEQIDNO:143到SEQIDNO:213中所示的一種或多種核酸分子或任一的互補(bǔ)體或片段在高嚴(yán)格條件下特異性雜交。本發(fā)明的試劑包括遺傳標(biāo)記。此種標(biāo)記的例子包括核酸分子，所述核酸分子包含選自SEQIDNOs:143-213的核酸序列。/>共標(biāo)記數(shù)椐庫的例子包4舌例如Soybase,農(nóng)業(yè)研究局(AgriculturalResearchService)，和美國農(nóng)業(yè)部(UnitedStatesDepartmentofAgriculture)。其他遺傳標(biāo)記在其中公開。本發(fā)明的試劑包括本發(fā)明的片段核酸分子。片段可以包含SEQIDNOs:143-213的相當(dāng)大部分，或事實(shí)上大部分SEQIDNOs:143-213。在一個(gè)方面，片段是本發(fā)明核酸分子的100-200個(gè)連續(xù)殘基、150-300個(gè)連續(xù)殘基、50-150個(gè)連續(xù)殘基、或20-50個(gè)連續(xù)殘基長。在另一個(gè)方面，片段包含SEQIDNOs:143-213的至少50、100、200、300、400或500個(gè)連續(xù)殘基。在一個(gè)方面，片段核酸分子能夠與SEQIDNOs:143-213選擇性雜交。在本發(fā)明的一個(gè)方面，本發(fā)明優(yōu)選的標(biāo)記核酸分子具有SEQIDNO:143到SEQIDNO:213中所示的核酸序列或其互補(bǔ)體或任一的片段。在本發(fā)明的另一個(gè)方面，本發(fā)明優(yōu)選的標(biāo)記核酸分子與SEQIDNO:143到SEQIDNO:213中所示的核酸序列或其互補(bǔ)體或任一的片段共享80%-100%或90%-100%序列同一性。在本發(fā)明的進(jìn)一步方面，本發(fā)明優(yōu)選的標(biāo)記核酸分子與SEQIDNO:143到SEQIDNO:213中所示的序列或其互補(bǔ)體或任一的片段共享95°/。-100%序列同一性。在本發(fā)明的一個(gè)方面，本發(fā)明優(yōu)逸的標(biāo)記核酸分子與SEQIDNO:M3到SEQIDNO:213中所示的核酸序列或其互補(bǔ)體或任一的片段共享98%-100%序列同一性。序列同一性優(yōu)選4吏用S叫uenceAnalysisSoftwarePackageTM(版本10;GeneticsComputerGroup,Inc.,UniversityofWisconsinBiotechnologyCenter,Madison,WI)的"BestFit"或"Gap"程序進(jìn)行測定。"Gap"利用Needleman和Wvmsch的算法以發(fā)現(xiàn)2個(gè)序列的比對，其使匹配數(shù)目達(dá)到最大并且使缺口數(shù)目降到最低。"BestFit"使用Smith和Waterman的局部同源性算法執(zhí)行2個(gè)序列之間的相似性的最佳區(qū)段的最佳比對，并且插入缺口以使匹配數(shù)目達(dá)到最大。百分比同一性計(jì)算還可以使用LASERGENE生物信息學(xué)計(jì)算套件(缺省參數(shù)，DNASTARInc.,Madison,Wisconsin)的Megalign程序來執(zhí)行。百分比同一性最優(yōu)選使用"BestFit"程序使用缺省參數(shù)進(jìn)行測定。本發(fā)明進(jìn)一步提供了一種或多種單核苷酸多態(tài)性(SNP)標(biāo)記。在DNA、RNA或cDNA樣品中多態(tài)位點(diǎn)的檢測可以通過使用核酸擴(kuò)增方法得到促進(jìn)。此種方法包括特異性增加多核苷酸濃度的那些，所述多核香酸跨越多態(tài)位點(diǎn)，或包括那個(gè)位點(diǎn)和定位在它遠(yuǎn)側(cè)或近側(cè)的序列。此種擴(kuò)增的分子可以通過凝膠電泳或其他方法容易地檢測。達(dá)到此種擴(kuò)增的方法采用聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)(Mullis等人1986ColdSpringHarborSymp.Quant.Biol.51:263-273;歐洲專利號50,424;歐洲專利號84,796;歐洲專利號258,017;歐洲專利號237,362;歐洲專利號201,184;美國專利號4,683,202;美國專利號4，582，788;和美國專利號4,683,194)，其中使用能夠與以其雙鏈形式限定多態(tài)性的近側(cè)序列雜交的引物對。的連鎖分析測定。大豆屬的許多分子遺傳學(xué)圖已得到報(bào)告(Mansur等人，Oo"S".36,1327-1336(1996);Shoemaker等人，Ge"e"a329-338(19%);Shoemaker等人，Oo戶S"e"ce32,.1091-1098(1992),Shoemaker等人，Crop35,436-446(1995);Tinley和Rafalsk"/.CW/Aoc/^/w.Sw///.291(1990);Cregan等人，OopSc/ewce39,"<54-"90H999))。大豆、野大豆和大豆x野大豆雜種(G"'"ewaxxG(y""esoya)共享連鎖群(Shoemaker等人，Gewe""329-338(1996))。連鎖群(LG)是趨向于世世代代一起遺傳的一組基因。如本文所使用的，提及連鎖群(LG),大豆的Dlb;C2;O;L;和I指對應(yīng)于來自大豆的遺傳學(xué)圖的連鎖群Dlb,C2,0,L;和I的連鎖群(Mansur等人，Oo;3(5,1327-1336(1996));Cregan等人，Oo/SO""39:1464-1490(1999)，和Soybase，農(nóng)業(yè)研究局，美國農(nóng)業(yè)部。全基因組研究揭示與成熟期基因組區(qū)域l相關(guān)的SNP標(biāo)記位于連鎖群(LG)C2上，成熟期基因組區(qū)域2位于LGO上，成熟期基因組區(qū)域3位于LGL上，成熟期基因組區(qū)域4位于LGI上，成熟期基因組區(qū)域5位于LGL上，成熟期基因組區(qū)域6位于LGDlb+W上，成熟期基因組區(qū)域7位于LGG上，并且成熟期基因組區(qū)域8位于LGM上。在一個(gè)方面，本發(fā)明可以用于鑒定與成熟期基因組區(qū)域1-8相關(guān)的另外標(biāo)記。本發(fā)明包括在SEQIDNO:143-213的1cM、5cM、10cM、15cM或30cM內(nèi)的成熟期標(biāo)記。相似地，在距離本發(fā)明的標(biāo)記分子1、5、10、20和30cM或更少內(nèi)作圖的一種或多種標(biāo)記可以用于選擇或漸滲與成熟期和/或植物生長習(xí)性相關(guān)的區(qū)域。本發(fā)明包括與SEQIDNO:143-213連鎖且延遲成熟期的成熟期標(biāo)記。本發(fā)明包括基本上純化的核酸分子，其包含在選自SEQIDNO:143-213的標(biāo)記的5千堿基、10千堿基、20千堿基、30千堿基、100千堿基、500千堿基、1,000千堿基、10,000千堿基、25,000千堿基或50,000千堿基內(nèi)的成熟期標(biāo)記。本發(fā)明包括在SEQIDNO:143-213中任何一種的5千堿基、10千堿基、20千堿基、30千堿基、100千堿基、500千堿基、1,000千堿基、10，000千堿基、25,000千堿基或50,000千堿基內(nèi)的成熟期標(biāo)記，其與SEQIDNO:143-213中的任何一種共分離。相似地，在距離本發(fā)明的標(biāo)記分子5千堿基、10千堿基、20千堿基、30千堿基、100千堿基、500千堿基、1，000千堿基、10,000千堿基、25,000千堿基或50,000千堿基或更少內(nèi)作圖的一種或多種標(biāo)記可以用于選擇或漸滲與成熟期和/或植物生長習(xí)性相關(guān)的區(qū)域。成熟期基因組區(qū)域是已與決定植物的成熟日期相關(guān)的植物染色體的物理區(qū)域當(dāng)它95%的莢果已達(dá)到其成熟顏色時(shí)，植物視為成熟的。在本發(fā)明的一個(gè)方面，植物的成熟日期是在北半球中8月31日后的天數(shù)。成熟期基因組區(qū)域1-8的等位基因可以影響植物的成熟日期。在一個(gè)方面，植物的成熟日期可以決定植物的成熟期組。此處，相對成熟期指使成熟期組再分成十分之一例如III.5的大豆植物成熟期組。相對成熟期提供植物成熟期的更確切描述。小數(shù)點(diǎn)后的數(shù)字指關(guān)于成熟期組的相對早或晚，例如IV.2是早期組IV品種，并且IV.9是晚期組IV。在另一個(gè)方面，成熟期組可以通過參考關(guān)于成熟期組的商業(yè)化品種進(jìn)行測定。例如，具有已知成熟期組的商業(yè)化品種在具有新大豆系的實(shí)驗(yàn)中生長，并且新大豆系的相對成熟期通過計(jì)數(shù)8月31日后的天數(shù)，并且與商業(yè)化品種相比較進(jìn)行確定。成熟期組指品種組基于植物最佳適應(yīng)且最有生產(chǎn)力的綿度范圍的工業(yè)劃分。大豆品種分類為13個(gè)公認(rèn)成熟期組，其中命名為成熟期組OOO、00、0和I到X,其中000代表最早成熟的品種，并且X代表最晚成熟的品種。成熟期組具有相應(yīng)的成熟期帶。成熟期組000到IV中的大豆植物具有無限植物習(xí)性，而成熟期組V到X中的大豆植物具有有限植物習(xí)性。早成熟期品種(OOO到III)適應(yīng)具有更長晝長的北緯度，而成熟期命名在具有更短晝長的南瑋度中漸增。.成熟期中的增加可以與產(chǎn)量或其他性狀例如油濃度中的增加關(guān)聯(lián)。植物成熟期與其他性狀的關(guān)聯(lián)使與其他性狀例如產(chǎn)量相關(guān)的潛在標(biāo)記和候選基因的評估混淆。與植物成熟期相關(guān)但不與另一種性狀相關(guān)的基因組區(qū)域的鑒定可以允許育種者使植物成熟期遺傳上固定在大豆植物內(nèi)，并且單獨(dú)闡明其他性狀，例如與產(chǎn)量相關(guān)的那些。豆植物或大豆種子應(yīng)在何處生長的^法，這通過下'迷實(shí)T見，、，獲得來:大豆植物或大豆種子的DNA;測定在成熟期基因組區(qū)域1內(nèi)的基因座處的等位基因是純合還是雜合的；測定在成熟期基因組區(qū)域2內(nèi)的基因座處的等位基因是純合還是雜合的；測定在成熟期基因組區(qū)域3內(nèi)的基因座處的等位基因是純合還是雜合的；測定在成熟期基因組區(qū)域1、2和3內(nèi)等位基因的等位基因組合；并且對大豆植物或大豆種子指定成熟期組值。在優(yōu)選方面，測定在基因座處的等位基因是純合還是雜合的包括用核酸分子檢測多態(tài)性，所述核酸分子具有SEQIDNOs:143-174中任何一種的序列、或其互補(bǔ)體。在另一個(gè)方面，本發(fā)明包括通過測定大豆植物或大豆種子的等位基因組合確定大豆植物或大豆種子應(yīng)在何處生長的方法，這通過下迷實(shí)現(xiàn)，獲得來自大豆植物或大豆種子的DNA;測定在成熟期基因組區(qū)域l內(nèi)的基因座處的等位基因是純合還是雜合的；測定在成熟期基因組區(qū)域2內(nèi)的基因座處的等位基因是純合還是雜合的；測定在成熟期基因組區(qū)域3內(nèi)的基因座處的等位基因是純合還是雜合的；測定在成熟期基因組區(qū)域2內(nèi)的基因座處的等位基因是純合還是雜合的；測定在成熟期基因組區(qū)域l、2、3和4內(nèi)等位基因的等位基因組合；并且對大豆植物或大豆種子指定成熟期組值。本發(fā)明還包括提供關(guān)于大豆植物或大豆種子的成熟期的信息的方法，這通過獲得來自大豆種子或大豆植物的DNA，并且測定在基因組區(qū)域4的基因座處的等位基因概況來實(shí)現(xiàn)。本發(fā)明還包括通過測定大豆植物或大豆種子的等位基因組合確定大豆植物或大豆種子應(yīng)在何處生長的方法，這通過下述實(shí)現(xiàn)，獲得來自大豆植物或大豆種子的DNA;測定在成熟期基因組區(qū)域1內(nèi)的等位基因是純合還是雜合的；測定在成熟期基因組區(qū)域2內(nèi)的等位基因是純合還是雜合的；測定在成熟期基因組區(qū)域3內(nèi)的等位基因是純合還是雜合的；并且測定在成熟期基因組區(qū)域1、2和3內(nèi)等位基因的等位基因組合。在優(yōu)選方面，大豆植物或大豆種子對于在成熟期基因組區(qū)域1、2和3內(nèi)的等位基因是純合的。在優(yōu)選方面，純合等位基因是顯性或隱性的。在另一個(gè)方面，大豆植物或大豆種子對于在成熟期基因組區(qū)域1和2內(nèi)的等位基因是純合的。在優(yōu)選方面，純合等位基因是顯性或隱性的。在另一個(gè)方面，大豆植物或大豆種子對于在成熟期基因組區(qū)域2和3內(nèi)的等位基因是純合的。在優(yōu)選方面，純合等位基因是顯性或隱性的。在另一個(gè)方面，大豆植物或大豆種子對于在成熟期基因組區(qū)域1、2和3內(nèi)的等位基因是雜合的。在另一個(gè)方面，大豆植物或大豆種子對于在成熟期基因組區(qū)域1和2內(nèi)的等位基因是雜合的。在另一個(gè)方面，大豆植物或大豆種子對于在成熟期基因組區(qū)域2和3內(nèi)的等位基因是雜合的。在優(yōu)選方面，等位基因組合是等位基因組合10、等位基因組合11、等14、等位基因組合15、等位基因組合16、等位基因組合n、等位基因組合18和等位基因組合19。本發(fā)明的一個(gè)方面包括通過測定大豆植物的等位基因組合確定大豆植物或大豆種子應(yīng)在何處生長的方法，這通過下述實(shí)現(xiàn)，獲得來自大豆植物或大豆種子的DNA;測定在成熟期基因組區(qū)域1內(nèi)的等位基因是純合還是雜合的；測定在成熟期基因組區(qū)域2內(nèi)的等位基因是純合還是雜合的；測定在成熟期基因組區(qū)域1和2內(nèi)等位基因的等位基因組合；并且對大豆植物或大豆種子指定成熟期生長值。在優(yōu)選方面，測定等位基因是純合還是雜合的包括檢測來自SEQIDNOs:143-161中任何一種的多態(tài)性。在優(yōu)選方面，等位基因組合是等位基因組合1、等位基因組合2、等位基因組合3、等位基因組合4、等位基因組合5、等位基因組合6、等位基因組合7、等位基因組合8和等位基因組合9。在優(yōu)選方面，大丄植物-雜:。在優(yōu)選方面，早:熟期組親'本大豆植物是oo:o.i.i)，并且中等成熟期親本大豆植物是III.O-IV.9。本發(fā)明的一個(gè)方面包括測定大豆植物是否具有0.0-111.9的成熟期組的方法，這通過下迷實(shí)現(xiàn)，測定在成熟期基因組區(qū)域1內(nèi)的等位基因是純合還是雜合的；測定在成熟期基因組區(qū)域2內(nèi)的等位基因是純合還是雜合的；并且對大豆植物指定0,0-lII.9的成熟期組值。在優(yōu)選方面，大豆植物中的成熟期在這樣的大豆植物前至少5天達(dá)到，所述這樣的大豆植物在成熟期基因組區(qū)域1內(nèi)是純合顯性的，在成熟期基因組區(qū)域2內(nèi)是純合顯性的，并且在相同的環(huán)境條件下生長。本發(fā)明的另一個(gè)方面包括測定大豆植物的成熟期是否在OO.O-III.O成熟期組中的方法，這通過下迷實(shí)現(xiàn)，測定在成熟期基囚組區(qū)域1內(nèi)的等位基因是純合還是雜合的；測定在成熟期基因組區(qū)域2內(nèi)的等位基因是純合還是雜合的；并且對大豆植物指定OO.O-III.O的成熟期組值。在優(yōu)選方面，所選擇的大豆種子在成熟期基因組區(qū)域l處是純合隱性的，并且在成熟期基因組區(qū)域2處是純合隱性的，并且具有0.5-11.0的成熟期組。在優(yōu)選方面，選擇這樣的大豆種子，其在成熟期基因組區(qū)域l處是純合隱性的，并且在成熟期基因組區(qū)域2處是雜合顯性的，并且具有1.5-11.9的成熟期組。本發(fā)明包括其中這樣預(yù)測后代植物的成熟期組的方法，所迷預(yù)測通過下述實(shí)現(xiàn)，成熟期基因組區(qū)域1中的等位基因是純合顯性、純合隱性還是雜合的，以及成熟期基因組區(qū)域2中的等位基因是純合顯性、純合隱性還是雜合的。在一個(gè)方面，如果植物的成熟期組是0-11,那么成熟期組可以通過測定植物或種子中的成熟期基因組區(qū)域1和2的等位基因組合進(jìn)行鑒定。參見例如，表9。在可替代方面，如果植物的成熟期組是ni-v，那么成熟期組可以通過測定植物或種子中的成熟期基因組區(qū)域1、2和3的等位基因組合進(jìn)行鑒定。參見例如，表9。在一個(gè)方面，如果植物的成熟期組是IV-V,的等位Z因組:進(jìn)行鑒定。參見^)如，表9。'、、^在另一個(gè)方面，親本植物的成熟期組是已知的。在一個(gè)方面，親本植物的成熟期組相差超過10天、10天-20天、10天-30天、超過2個(gè)成熟期組、小于2個(gè)成熟期組、在成熟期組000-VI之間。在一個(gè)方面，由與具有O-II成熟期組的至少一個(gè)親本的雜交產(chǎn)生的后代植物的成熟期組通過測定成熟期基因組區(qū)域1和2的等位基因組合進(jìn)行鑒定。在另一個(gè)方面，由與具有in、iv、v或m-v成熟期組的親本植物的雜交產(chǎn)生的后代植物的成熟期組通過測定成熟期基因組區(qū)域1、2和3的等位基因組合進(jìn)行鑒定。在一個(gè)方面，在成熟期組區(qū)域中的基因座處的更多顯性等位基因與成熟期中的延遲關(guān)聯(lián)。在另一個(gè)方面，顯性等位基因數(shù)目中的增加與成熟期中的延遲關(guān)聯(lián)。在一個(gè)方面，在成熟期組中具有超過1.5、2、2.5、3、3.5的差異的親本植物進(jìn)行雜交，并且它們的成熟期組通過測定等位基因組合進(jìn)行鑒定。在一個(gè)方面，在成熟期組中具有1-3、1-4、2-3、2-5、2-6、2-7的差異的親本植物進(jìn)行雜交，并且它們的成熟期組通過測定后代的等位基因組合進(jìn)行鑒定。在一個(gè)方面，在成熟期組中具有超過1.5、2、2.5、3、3.5的差異的親本植物進(jìn)行雜交，并且它們的成熟期組通過測定等位基因組合進(jìn)行鑒定。在一個(gè)方面，后代植物具有比一個(gè)親本早5、10或15天的成熟期組。在另一個(gè)方面，后代植物具有比一個(gè)親本晚5、10或15天的成熟期組。在一個(gè)方面，后代植物具有比兩個(gè)親本早5、10或15天的成熟期組。在另一個(gè)方面，后代植物具有比兩個(gè)親本晚5、10或15天的成熟期組。在一個(gè)方面，成熟期組O.l的早親本與1.9的較晚成熟期親本植物雜交，并且具有等位基因組合1的后代植物是O.l-0.5成熟期。在另一個(gè)方面，具有0.9成熟期的早親本與具有3.5成熟期的植物雜交，并且具有等位基因組合1的植物是成熟期組1.0-1.5。在一個(gè)方面，后代種子的成熟期組通過在非常早成熟期親本植物與較晚成熟期親本植物之間的雜交進(jìn)行測定。在一個(gè)方面，非常早成熟期親本植物是成熟期組00.0-0.9，并且較晚成熟期親本植物是成熟期組III.5-IV.5。在一個(gè)方面，非常早成熟期親本植物是成熟期組00,并且較晚成熟期親本植物是成熟期組III或IV。在一個(gè)方面，DNA可以得自諸如在F"F2、F3、F4或更后群體中的種子的植物或植物部分。在一個(gè)方面，一種或多種植物或植物部分就基因組區(qū)域1和2中的等位基因進(jìn)行基因型分型。在一個(gè)方面，等位基因使用SNP標(biāo)記NS0128378(基因組成熟期區(qū)域l)和NS0118907(基因組成熟期區(qū)域2)進(jìn)行測定。在一個(gè)方面，通過計(jì)數(shù)在8月31日后直至植物成熟的天數(shù)，植物就成熟期進(jìn)行表型分析。在一個(gè)方面，當(dāng)95%的莢果是褐色時(shí)，植物視為成熟的。在一個(gè)方面，當(dāng)來自與成熟期基因組區(qū)域1和2相關(guān)的標(biāo)記的等位基因是純合隱性時(shí)，后代植物將比如果來自與成熟期基因組區(qū)域I和2相關(guān)的標(biāo)記的等位基因是純合顯性的成熟期組早15、14、12、11、10、9或8天達(dá)到成熟期。在一個(gè)方面，如果來自與成熟期基因組區(qū)域1相關(guān)的標(biāo)記的等位基因是純合顯性的，并且來自與成熟期基因組區(qū)域2相關(guān)的標(biāo)記的等位基因是雜合的，那么后代植物將比如果來自與成熟期基因組區(qū)域l和2相關(guān)的標(biāo)記的等位基因是純合顯性的早1天、1-2天、2-3天、2-4天或3-5天達(dá)到成熟期。在本發(fā)明的另一個(gè)方面，可以選擇或堆積(bulk)多粒種子。多粒種子可以包括大于或等于2、3、4、5、6、10、50、100、500、1000、5,000、10,000粒或更多粒種子。一?；蚨嗔７N子可以分配至適合于一個(gè)或多個(gè)植物生長的地理區(qū)。在這個(gè)方面，所選擇的種子可以分配或運(yùn)送至合適區(qū)域。本發(fā)明還提供了其中超過50%、60%、70%、80%、90%、95%或99%的種子將成長為這樣的植物的多粒大豆種子，在所述植物中成熟期組中的變異在一個(gè)成熟期組內(nèi)、不超過2個(gè)組或8月31日后20天、不超過1個(gè)組或8月31日后10天、不超過0.9個(gè)組或8月31日后9天、不超過8月31日后5天或0.5個(gè)組、或具有在O.O-II.O、000.0-111.9之間的成熟期組。多粒大豆種子可以成長為具有無限大豆植物習(xí)性或具有有限大豆植物習(xí)性的大豆植物。本發(fā)明的一個(gè)方面包括基于無限或有限生長習(xí)性選擇大豆種子的方法，其包括測定成熟期基因組區(qū)域3是純合還是雜合的u在一個(gè)方面，85%的多粒大豆種子可以達(dá)到在彼此IO天、5天、3天內(nèi)的成熟期。在另一個(gè)方面，95%的多粒大豆種子可以達(dá)到彼此10天、5天、3天內(nèi)的成熟期。本發(fā)明的另一個(gè)方面包括分離無限的早成熟期大豆種子的方法，這通過下迷實(shí)現(xiàn)，使用非破壞性方法獲得來自大豆種子的DNA;測定在成熟期基因組區(qū)域l內(nèi)的等位基因是純合還是雜合的；并且測定在成熟期基因組區(qū)域2內(nèi)的等位基因是純合還是雜合的。此種多粒種子可以在容器中。大豆種子的容器可以包含任何數(shù)目、重量或體積的種子。例如，容器可以包含至少或超過約10、25、50、100、200、300、400、500、600、700、80、90、1000、1500、2000、2500、3000、3500、4000、5000、7500或10,000粒或更多粒種子。在另一個(gè)方面，容器可以包含約、或超過約1克、5克、10克、15克、20克、25克、50克、100克、250克、500克或1000克種子?？商娲?，容器可以包含至少、或超過約O盎司、1盎司、5盎司、10盎司、1磅、2磅、3磅、4磅、5磅、IO磅、15磅、20磅、25磅、30磅、40磅、50磅、60磅、70磅、80磅、IOO磅、200磅、300磅、500磅或1000磅或更多種子。大豆種子的容器可以是本領(lǐng)域可獲得的任何容器。例如，容器可以是盒、袋、罐、包、小袋、帶巻筒(taperoll)、桶或管。在另一個(gè)方面，大豆種子的容器中包含的種子可以是處理或未處理的大豆種子。在一個(gè)方面，種子可以進(jìn)行處理以改善萌發(fā)，例如通過預(yù)處理種子，或通過消毒以保護(hù)不受種子傳播病原體。在另一個(gè)方面，種子可以用任何可用的包衣進(jìn)行包被，以改善例如可種植性、種子出苗(emergence)和保護(hù)不受種子傳播病原體。種子包衣可以是任何形式的種子包衣，包括但不限于造粒(pelleting)、薄膜包衣和結(jié)殼。本發(fā)明的一個(gè)方面包括基于成熟期組分配大豆植物的方法，這通過42的；測定在成熟期基因組區(qū)域2內(nèi)的等位基因是純合還是雜合的；測定在成熟期基因組區(qū)域3內(nèi)的等位基因是純合還是雜合的；并且對大豆植物指定成熟期生長值；并且將大豆植物運(yùn)送至優(yōu)選地理區(qū)。本發(fā)明的植物還可以包含賦予對于昆蟲、害蟲、病毒或細(xì)菌攻擊的抗性的基因。此種基因可以是轉(zhuǎn)基因。例如，賦予對于害蟲例如大豆胞嚢線蟲的抗性的基因在美國專利號7,154,021中描迷，所述專利引入本文作為參考。轉(zhuǎn)基因還可以用于改變蛋白質(zhì)代謝。例如，引入本文作為參考的美國專利號5,545,545描述賴氨酸不敏感性玉蜀黍二氫吡啶二羧酸合酶(DHPS)，其對L-賴氨酸濃度基本上有抵抗力，所述L，賴氨酸否則抑制天然DHPS的活性。相似地，引入本文作為參考的EP0640141描述編碼能夠引起高于正常的蘇氨酸生產(chǎn)的賴氨酸不敏感性天冬氨酸激酶(AK)的序列，以及編碼反義賴氨酸酮戊二酸還原酶用于增加賴氨酸的亞片段。在另一個(gè)方面，可以采用改變植物碳水化合物代謝的轉(zhuǎn)基因。例如，代謝工J改造(使用(參見引:本文作為參考"美國專利號(031,154)?？梢允褂玫霓D(zhuǎn)基因的進(jìn)一步例子是改變谷粒產(chǎn)量的基因。例如，引入本文作為參考的美國專利號6，486，383描述具有腺苷二磷酸葡糖焦磷酸化酶("ADPGPPase，，)的亞單位蛋白質(zhì)的植物中淀粉含量的修飾。在引入本文作為參考的EP0797673中，討論了轉(zhuǎn)基因植物，其中特定DNA分子的引入和表達(dá)導(dǎo)致在液泡外形成容易動(dòng)員的磷酸鹽庫和增強(qiáng)的生物量生產(chǎn)和/或改變的開花行為。再進(jìn)一步已知的是用于改變植物成熟期的基因。引入本文作為參考的美國專利號6,774,284描述編碼植物脂肪酶的DNA，及其用于控制植物中的衰老的方法。引入本文作為參考的美國專利號6,140,085討論用于改變開花特征特別是開花時(shí)間選擇的FCA基因。引入本文作為參考的美國專利號5,637,785討論基因修飾植物，其具有調(diào)節(jié)的花發(fā)育例如具有早期花分生組織發(fā)育，并且在其基因組中包含編碼LEAFY蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)基因。在另一個(gè)方面，本發(fā)明提供了用于與脂肪酸合成和油含量相關(guān)的常規(guī)和轉(zhuǎn)基因性狀的優(yōu)選安排的方法和組合物。使用本發(fā)明，育種者可以使性狀整合適合用于優(yōu)選性狀表達(dá)的地理，無論性狀是常規(guī)(例如，突變)還是轉(zhuǎn)基因的。例如，可以采用改變植物油生物合成和油組成的轉(zhuǎn)基因。特別地，亞油酸(LA)(18:2，A9,12)通過厶12-去飽和酶(由FAD2編碼)由油酸(8:1，厶9)產(chǎn)生，而a亞麻酸(ALA)(18:3,△9,12，15)通過A15-去飽和酶(由FAD3編碼)由LA產(chǎn)生。此外，十八碳四烯酸(SDA)(18:4，厶6,9,12，15)和y亞麻酸(GLA)(18:3,A6，9,12)是通過厶6-去飽和酶由LA和ALA產(chǎn)生的多不飽和脂肪酸(PUFAs)。編碼去飽和酶的各種基因已得到描述。例如，引入本文作為參考的美國專利號5,952,544描述從歐洲油菜(Bmswc"中分離且克隆的核酸片段，其編碼脂肪酸去飽和酶。'544專利的歐洲油菜A15-去飽和酶的表達(dá)導(dǎo)致ALA的積聚。引入本文作為參考的美國專利公開20060156435描迷真菌厶15-去飽和酶的表達(dá)，以增加植物中的co-3脂肪酸概況。引入本文作為參考的PCT公開WO05/021761討論基因工程改造的植物，其由于表達(dá)A6-去飽和酶和厶15-去飽和酶而產(chǎn)生SDA和GLA。長鏈PUFAs例如EPA和DHA可以在植物中產(chǎn)生，如引入本文作為參考的美國專利公開20040172682中公開的。通過使用抑制FAD2表達(dá)的轉(zhuǎn)基因抑制內(nèi)源大豆FAD2基因已顯示賦予所需中-油酸(18:1)表型(即包含約50重量％-75重量％油酸的大豆種子)。保證抑制內(nèi)源FAD2基因表達(dá)和中-油酸表型的轉(zhuǎn)基因和轉(zhuǎn)基因植物公開于美國專利7,067,722中，所述專利引入本文作為參考。相比而言，缺乏FAD2抑制轉(zhuǎn)基因的野生型大豆植物一般產(chǎn)生具有小于20%油酸組成的種子。通過使用抑制FAD3表達(dá)的轉(zhuǎn)基因抑制內(nèi)源FAD3基因已顯示賦予所需亞麻酸(18:3)表型。"/WW或"棕櫚酰-ACP硫酯酶"基因編碼能夠催化棕櫚酰-ACP的泛酸(panthothene)輔基中碳-硫硫酯鍵的水解切割作為其優(yōu)選反應(yīng)的酶(FATB)。其他脂肪酸-ACP硫酯的水解也可以通過這種酶催化。代表性尺47^-/序列包括但不限于美國專利公開20040006792以及美國專利號5,955,329;5'723，761;5,955,650;和6,331,664中所示的那些，所述文獻(xiàn)引入本文作為參考。當(dāng)FATB的量在植物細(xì)胞中減少時(shí)，可以提供減少量的飽和脂肪酸例如棕櫚酸和硬脂酸。因此，F(xiàn)ATB表達(dá)中的減少可導(dǎo)致增加比例的不飽和脂肪酸例如油酸(18:1)。/WD2、/MD3和f^715表達(dá)的同時(shí)抑制由44此導(dǎo)致驅(qū)動(dòng)FAS途徑朝向18碳長度的單不飽和脂肪酸例如油酸(C18:l)中的總體增加。參見，引入本文作為參考的美國專利號5,955,650。在一個(gè)方面，本發(fā)明提供了用于與脂肪酸合成和油含量相關(guān)的常規(guī)和轉(zhuǎn)基因性狀的優(yōu)選安排的方法和組合物。大豆種子油水平受環(huán)境高度影響。油濃度隨著煒度減少而增加，因此，成熟期組00-I中的大豆一般具有比較晚成熟的大豆更低的油水平(Yaklich等人2002.Oop42:1504-1515)。油濃度中的減少歸因于較低的溫度和較短的生長季節(jié)(Piper和Boote1999J.Am.OilChem.Soc.76:1233-124)。此外，在干旱脅迫下栽培的大豆趨向于產(chǎn)生具有減少的蛋白質(zhì)和增加的油的種子(Specht等人2001CropSci41:493-509)。使用本發(fā)明，育種者可以使性狀整合適合用于優(yōu)選性狀表達(dá)的地理，無論性狀是常規(guī)(例如，突變)還是轉(zhuǎn)基因的。用于改變植物形態(tài)特征的基因也是已知的，并且可以依照本發(fā)明使用。引入本文作為參考的美國專利號6,184，440討論基因工程改造的植物，其由于表達(dá)細(xì)胞壁調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)基因而展示改變的結(jié)構(gòu)或形態(tài)學(xué)。細(xì)胞壁調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)基因的例子包括纖維素結(jié)合結(jié)構(gòu)域，纖維素結(jié)合蛋白質(zhì)，或細(xì)胞壁修飾蛋白質(zhì)或酶，例如內(nèi)切木葡聚糖轉(zhuǎn)移酶、木葡聚糖內(nèi)切轉(zhuǎn)糖基酶、擴(kuò)展蛋白、纖維素合酶、或新分離的內(nèi)切-l，4-P-葡聚糖酶。用于將轉(zhuǎn)基因引入例如大豆的方法是本領(lǐng)域眾所周知的，并且包括生物和物理植物轉(zhuǎn)化規(guī)程。參見例如，Miki等人H9卯)，Clemente等人fClemente等人，Oo;，40:797-803,2000)和美國專利7,002,058,全部引入本文作為參考。本發(fā)明的進(jìn)一步方面涉及本發(fā)明的大豆品種的組織培養(yǎng)。示例性組織培養(yǎng)類型是在植物或植物部分中完整的原生質(zhì)體、愈傷組織以及植物細(xì)胞。植物部分包括但不限于，胚、花粉、花、葉、4艮、根尖、花藥、維管組織、莢果、莖、種子或其部分、或從植物中分離的細(xì)胞。在一個(gè)方面，組織培養(yǎng)包括植物部分，例如胚、原生質(zhì)體、分生細(xì)胞、花粉、葉或花藥。以這些方式，本發(fā)明的植物或其部分在培養(yǎng)中生長且再生。用于制備可再生大豆細(xì)胞的組織培養(yǎng)且由其再生大豆植物的示例性程序公開于美國專利號4,992,375;美國專利號5，015,580;美國專利號5,024,944和美國專利號5,416，011中，所述專利的公開內(nèi)容各自特別整體引入本文作為參考。組織培養(yǎng)的重要能力是再生能育植物的能力。為了轉(zhuǎn)化有效且成功，必須將DNA引入產(chǎn)生植物或種系組織的細(xì)胞內(nèi)。特別地，用于由各種組織類型再生大豆植物的方法和用于大豆的組織培養(yǎng)的方法是本領(lǐng)域已知的(參見例如，Widholm等人，K，oiSWec"'ow朋c/Cw/,wre-zWwcet/KanV^/o"/"So;^ecwz,InSoybean:Genetics，MolecularBiologyandBiotechnology,編輯Verma和Shoemaker,CABInternational,Wallingford,Oxon，England(19%)。用于植物例如大豆的再生技術(shù)可以用作多種組織或細(xì)胞類型的原材料。特別對于大豆，從特定分化的組織類型開始的再生方法已得到開發(fā)，所述組織類型例如分生組織，Cartha等人，Om.Sof.59.'/(57/-/<579廣1981)，下胚軸切片，Cameya等人，尸/a"fS"'e"ceLe"e"2/,289-294(1981),和莖節(jié)區(qū)段，Saka等人，尸/朋fSc/e"ce厶e〃ery,/久'193-201(1980);Cheng等人，尸/a"〖Sc/e"ceLe〃e",19:91-99(1980)。由體細(xì)胞胚再生完整性成熟的大豆植物已得到報(bào)告，所迷體細(xì)胞胚由未成熟大豆胚的外植體產(chǎn)生(Ranch等人，/"K"roCe〃w/or&Deve/o;w7e"^/5zo/og^2/.'653-658(1985))。通過器官發(fā)生和胚胎發(fā)生由組織培養(yǎng)再生成熟的大豆植物也已得到報(bào)告(Barwale等人，尸/a"f"/<57.'473-481(1986);Wright等人,尸/謝Ce〃^,"J,150-154(1986))。一旦轉(zhuǎn)基因引入品種內(nèi)，它就可以通過雜交容易地轉(zhuǎn)移。通過使用回交，回收品種基本上所有所需形態(tài)學(xué)和生理特征，加上經(jīng)由回交技術(shù)轉(zhuǎn)移到品種內(nèi)的基因座。回交方法可以與本發(fā)明一起用于改善特征或?qū)⑻?正引入才直物內(nèi)(Poehlman和Sleper,In:Sreec/,'"gF/e/dOo/w,/ovvaStateUniversityPress,Ames,1995;Fehr，尸n'腦^/eso/Cw/〃varZ)eve/o戸ewf第1巻，第2-3頁(1987),引入本文作為參考)。本發(fā)明包括大豆植物育種方法，這通過下迷實(shí)現(xiàn)，使至少2種不同的親本大豆植物雜交，其中親本大豆植物在植物成熟期方面相差超過10天、10天-20天、10天-30天；獲得來自雜交的后代種子；用遺傳標(biāo)記基因型分型雜交的后代種子；并且選擇具有關(guān)于優(yōu)選成熟期的基因型的大豆種子。本發(fā)明還包括大豆植物育種方法，這通過下迷實(shí)現(xiàn)，就選自SEQIDNO:143到SEQIDNO:213的標(biāo)記序列的存在測定大豆植物；并且使大豆植物與成熟期組關(guān)聯(lián)。本發(fā)明還包括大豆植物育種方法，其包括使具有所需性狀的親本大豆植物與第二種親本大豆植物雜交，其中親本大豆植物在大豆植物成熟期方面相差超過io天、10天-20天、10天-30天，這通過使包含所需性狀的親本大豆植物與第二種親本大豆植物雜交；獲得來自雜交的后代大豆種子；就性狀篩選后代大豆種子；使用選自SEQIDNO:143到SEQIDNO:213的標(biāo)記就所需成熟期組篩選后代大豆種子，以測定所需地理生長區(qū)；并且選擇包含所需性狀和所需大豆植物成熟期的后代大豆種子。在本發(fā)明的一個(gè)方面，大豆植物育種方法包括使至少2種不同的親本大豆植物雜交；獲得來自雜交的后代大豆植物；用表征成熟期基因組區(qū)域的遺傳標(biāo)記非破壞性基因型分型雜交的后代大豆植物或大豆種子；并且選擇具有關(guān)于所需成熟期組的基因型的大豆植物。在優(yōu)選方面，后代大豆植物或大豆種子的成熟期表型是未知的。在另一個(gè)優(yōu)選方面，后代在不適合于測定大豆植物的成熟期的條件下生長。在另一個(gè)優(yōu)選方面，親本大豆植物在大豆植物成熟期方面相差超過5天、超過10天、10天-20天、10天-30天。此處，2種不同的親本大豆植物中至少一種的成熟期表型是未知的。在優(yōu)選方面，2種不同的親本大豆植物中兩種的成熟期表型是未知的。在優(yōu)選方面，后代大豆植物不是光周期敏感的。在另一個(gè)優(yōu)選方面，至少一種親本大豆植物不是光周期敏感的。在優(yōu)選方面，至少2種親本大豆植物不是光周期敏感的。在優(yōu)選方面，成熟期基因組區(qū)域的特征在于在表6中鑒定的顯性等位基因。在優(yōu)選方面，成熟期基因組區(qū)域的特征在于在表6中鑒定的隱性等位基因。在本發(fā)明的一個(gè)方面，至少一種或兩種親本大豆植物是原種品種。在本發(fā)明的一個(gè)方面，后代大豆植物是外來大豆植物，或者一種或兩種親本大豆植物是外來大豆植物。本發(fā)明的一個(gè)方面包括通過測定成熟期組就種質(zhì)改良選擇大豆植物的方法，這通過下迷實(shí)現(xiàn)，使至少2種不同的親本大豆植物雜交；獲得來自雜交的后代大豆植物；用表征成熟期基因組區(qū)域的遺傳標(biāo)記非破壞性基因型分型雜交的后代大豆植物或大豆種子；并且選擇具有關(guān)于所需成熟期組的基因型的大豆植物；并且將所選擇的大豆植物并入選自下述的用途使用大豆植物用于育種、通過自體受精改進(jìn)大豆植物、性狀整合、大豆植物或其部分用于轉(zhuǎn)化的用途、和大豆植物或其部分用于誘變的用途。本發(fā)明的另一個(gè)方面包括就非成熟期表型性狀和成熟期性狀的表達(dá)共選擇大豆植物的方法，這通過下述實(shí)現(xiàn)，使至少2種不同的親本大豆植物雜交；獲得來自雜交的后代大豆植物；用表征成熟期基因組區(qū)域選擇具有關(guān)于所需成熟期組的基因型的大豆植物；并且確定關(guān)于后代大豆植物生長的所需地理，和用于測定非成熟期表型的方法。在優(yōu)選方面，用于檢測非成熟期表型的方法是基因型或表型方法。在優(yōu)選方面，非成熟期表型性狀是除草劑耐受性、增加的產(chǎn)量、昆蟲控制、真菌病抗性、病毒抗性、線蟲抗性、細(xì)菌病抗性、支原體病抗性、改變的油生產(chǎn)、高油生產(chǎn)、高蛋白質(zhì)生產(chǎn)、萌發(fā)和幼苗生長控制、增強(qiáng)的動(dòng)物和人營養(yǎng)、低棉子糖、環(huán)境應(yīng)激抗性、增加的可消化性、工業(yè)酶、藥物蛋白質(zhì)、肽和小分子、改善的處理性狀、改善的風(fēng)味、固氮作用、雜種大豆種子生產(chǎn)、減少的變應(yīng)原性、生物聚合物和生物燃料中的任何一種。在另一個(gè)優(yōu)選方面，表型性狀是改變的蛋白質(zhì)和油組成，選自下迷的分子改變的水平中的任何一種蛋白質(zhì)、油、亞麻酸、硬脂酸、棕櫚酸、油酸、亞油酸、十八碳四烯酸、a亞麻酸、y亞麻酸、二十二碳六烯酸、二十碳五烯酸、二十二碳五烯酸及其組合。在一個(gè)方面，本發(fā)明的植物可以在與種質(zhì)改良相關(guān)的活動(dòng)中使用，其的非限制性例子包括使用植物用于育種、通過自體受精改進(jìn)植物、性狀整合、植物或其部分用于轉(zhuǎn)化的用途、和植物或其部分用于誘變的用途。育種決定的非限制性例子包括后代選擇、親本選擇、和關(guān)于至少一種單元型的輪回選擇。在另一個(gè)方面，與用于商業(yè)發(fā)布的植物開發(fā)相關(guān)的育種決定包括促進(jìn)植物用于測試、促進(jìn)植物用于純化、在發(fā)育過程中亞系的純化、品種發(fā)育和雜種發(fā)育。在另外一個(gè)方面，育種決定和種質(zhì)改良活動(dòng)包括轉(zhuǎn)基因事件選擇、形成育種雜交、測試且通過自體受精改進(jìn)植物、使用植物或植物部分用于轉(zhuǎn)化、使用植物或其部分用于候選物用于表達(dá)構(gòu)建體、并且使用植物或其部分用于誘變。育種方法的選擇依賴于植物繁殖方式、待改良的一種或多種性狀的遺傳率、和商業(yè)使用的栽培品種的類型(例如，F(xiàn),雜種栽培品種、純系栽培品種等)。通常用于大豆的育種方法的描述可以在幾本參考書之一中發(fā)現(xiàn)(例如Fehr,尸n'w"々/eso/Cw/"'var/)eve/o戸ew,第1巻，第2-3頁(1987))。在一個(gè)方面，本發(fā)明包括大豆植物育種方法，這通過就選自SEQIDNO:143到SEQIDNO:213的標(biāo)記序列的存在測定大豆植物；并且使48大豆植物與成熟期組關(guān)聯(lián)來實(shí)現(xiàn)。在另一個(gè)方面，本發(fā)明包括大豆植物育種方法，其包括使具有所需性狀的親本大豆植物與第二種親本大豆植物雜交，其中親本大豆植物在大豆植物成熟期方面相差超過5天、超過10天、10天-20天、或10天-30天，這通過使包含所需性狀的親本大豆植物與第二種親本大豆植物雜交；獲得來自雜交的后代大豆種子；就性狀篩選后代大豆種子；使用選自SEQIDNO:143到SEQIDNO:213的標(biāo)記就所需成熟期組篩選后代大豆種子，以測定所需地理生長區(qū)；并且選擇包含所需性狀和所需大豆植物成熟期的后代大豆種子。在優(yōu)選方面，所需性狀是轉(zhuǎn)基因的。本發(fā)明的一個(gè)方面包括大豆植物育種方法，這通過下述實(shí)現(xiàn)，使至少2種不同的親本大豆植物雜交，其中親本大豆植物在大豆植物成熟期方面相差超過5天、超過10天、10天-20天、或10天-30天；獲得來自雜交的后代大豆種子；用遺傳標(biāo)記基因型分型雜交的后代大豆種子；并且選摔具有關(guān)于優(yōu)選成熟期的基因型的大豆種子。本發(fā)明的另一個(gè)方面包括基于大豆植物成熟期組篩選大豆種子的方法，這通過下迷實(shí)現(xiàn)，獲得來自大豆種子的DNA;測定在成熟期基因組區(qū)域l內(nèi)的等位基因是純合還是雜合的；測定在成熟期基因組區(qū)域2內(nèi)的等位基因是純合還是雜合的；測定在成熟期基因組區(qū)域3內(nèi)的等位基因是純合還是雜合的；并且對大豆種子指定成熟期生長值。本發(fā)明的一個(gè)方面是將等位基因漸滲入大豆植物內(nèi)的方法，這通過下述實(shí)現(xiàn)，使至少2種不同的親本大豆植物雜交；獲得來自雜交的后代大豆植物；就等位基因篩選雜交的后代大豆植物；使用非破壞性方法獲得來自后代大豆植物的大豆種子的DNA;并且選擇大豆種子，其中大豆種子包含等位基因和選自SEQIDNOs:143-213的核酸序列。在優(yōu)選方面，所選擇的大豆種子進(jìn)一步具有選自SEQIDNOs:143-213的第二種序列。在另一個(gè)優(yōu)選方面，等位基因選自SCN抗性和根腐病抗性中的任何一種或兩者。本發(fā)明的另一個(gè)方面包括將所需性狀引入大豆植物內(nèi)的方法，這通過下迷實(shí)現(xiàn)，使至少2種不同的親本大豆植物雜交，其中至少一種親本大豆植物具有所需性狀；獲得來自雜交的后代大豆種子；使用非破壞性方法獲得來自后代大豆植物的大豆種子的DNA;就所需性狀的證椐測定雜交的后代大豆種子；并且選擇具有所需性狀和所需成熟期組的大豆種子。在優(yōu)選方面，所需性狀是轉(zhuǎn)基因的。本發(fā)明的進(jìn)一步方面包括將等位基因漸滲入大豆植物內(nèi)的方法，這通過下述實(shí)現(xiàn)，使至少2種不同的親本大豆植物雜交；獲得來自雜交的后代大豆植物；使用非破壞性方法獲得來自后代大豆植物的大豆種子的DNA;并且選擇具有等位基因和選自SEQIDNOs:143-174的核酸序列的大豆種子。本發(fā)明的另一個(gè)方面包括大豆植物育種方法，這通過下述實(shí)現(xiàn)，使至少2種不同的親本大豆植物雜交，其中親本大豆植物在大豆植物成熟期方面相差超過10天；獲得來自雜交的后代大豆種子；用選自SEQIDNOs:143-213的遺傳標(biāo)記基因型分型雜交的后代大豆種子；并且選擇具有所需成熟期組的大豆種子。本發(fā)明的進(jìn)一步方面包括在其基因組內(nèi)包含與成熟期相關(guān)的漸滲的單元型的大豆植物，其中漸滲通過來自SEQIDNO:143-213的標(biāo)記或標(biāo)記143-62中的至少一種得到促進(jìn)。目前已一般描述了本發(fā)明，通過參考下述實(shí)施例將更容易地理解本發(fā)明，所迷實(shí)施例提供用于舉例說明，并且不意欲限制本發(fā)明，除非明確說明。實(shí)施例實(shí)施例1:與影響植物成熟期的基因組區(qū)域相關(guān)的分子標(biāo)記的發(fā)現(xiàn)大豆是短日照植物，因此通過由于光周期中的減少的短日照幵始開花(Garner&Allard,J.一c./^.18,553-606(1920))。因此，大豆植物的光周期(晝長)和溫度響應(yīng)決定植物適應(yīng)區(qū)域。由于光周期敏感性，大豆基因型在狹窄的煒度地帶中生長以最優(yōu)化產(chǎn)量。與南方品種形成對照，北方大豆品種隨著較長的日照幵始開花。種植在其適應(yīng)地帶南方的北方品種顯示出加速的開花，限制的植物生長和減少的產(chǎn)量。種植在其適應(yīng)地帶北方的南方大豆品種將具有延遲的開花，具有關(guān)于可能減少產(chǎn)量的霜凍害的可能性。大多數(shù)大豆品種開發(fā)雜交在彼此在10個(gè)成熟日內(nèi)的親本之間進(jìn)行如果親本在成熟期中極大地不同，那么后代植物對于成熟期廣泛分離。為了使育種者獲得且選擇所需成熟期組的大豆植物，他們必須產(chǎn)生且維持大量后代植物，其的實(shí)踐是成本高得驚人的。與植物成熟期相關(guān)的基因組區(qū)域的鑒定促進(jìn)在彼此在10個(gè)成熟曰外的親本之間雜交，無需維持大量后代植物。為了鑒定與植物成熟期相關(guān)的基因組區(qū)域，用在大豆遺傳連鎖圖的20個(gè)連鎖群中分布的1400種單核苷酸多態(tài)性(SNP)標(biāo)記基因型分型258種大豆系(129對不同成熟期組)。此外，258種大豆系就產(chǎn)量和植物成熟期進(jìn)行表型分析。隨后評估SNP標(biāo)記基因型和植物成熟期表型之間的關(guān)聯(lián)。這在多種環(huán)境中進(jìn)行(表2-3)。表1:成熟期基因組區(qū)域經(jīng)由標(biāo)記輔助的育種的最初鑒定SEQID作用區(qū)域NO:(厶d)P-值1NS0125408148-0,050710,0090681NS00989821551.2422810.010812NS0123506156-0.576380.0218633NS00931971641.2748681.92E-093NS01365441711.1623521.33E-103NS0119569172-1.870633.79E-153NS01143171741,4196753.01E.085NS01231681880.217040.0254986NS010375590-0.025720.0117017NS0095211199-0.091762.99E-077NS0097307200-0.090236.66E-077NS0讓30202-0.084072.26E-067NS0102915203-0.082265.19E-068NS0隨52'2061.758243.92E-068NS01195742070.4467570.0452128NS010,2120,8297840細(xì)4621NS012棚1431NS00968291451NS00997461461NS01237471471NS01254081481NS01283781491NS00939761541NS00989821552NS01235061562NS00979521572NSO1189071582NS01269891602NS00956771613NS00931971643NS01038531673NSO136544m3固l195691723NS01237081733NS01143171744NS00981761764NS0畫781774NS00955301794固1290041805NS00990241815腦10錦182NS0扉461835NS01231681886NS0103755l卯6NS0U61251914,70.3096360.1568834,80.4446890.0229324.70.3151420.1914924.90.7143940.0115684.80.5385690.0158464,90,7570690.016995.10.9897920,0610195.21.2422810細(xì)814.0.9117630.0073075.64.0696685.06E-306.35.4779991.01E-334.61.9945850.0001913.80.4730530.101365.21.2748681.92E-0962.9379383.78E-096.43.7654933.23E-115.82.4095131.72E-2162,8765053.44E.265.92.627卯81.69E-224.31.0686846.45E-1240.4799550.0738394.51.3649942.50E-094.51.484248.04E-083.40.7324550.U21933.30.4349120.078卯63.10.1818090.0582993.20.2170410.0254981.20.6090710.1408570.90.4560860.152892表2:成熟期基因組區(qū)域在天數(shù)中的估計(jì)作用SEQID區(qū)域標(biāo)記NO:值p用S作s的的用成估6NS01257131921,10.5660840.0363356NS01257701930.80.4142120.00卯996NS01192811941.60.7978850.0380776NS01245901951,40.7063750.0008896NS01027171961.50.7495480,0002467NS00995311971.30.6365750.000701NS00訓(xùn)71982.41.1815230.015954NS00952111991.70.8357360.099501NS00973072000.20.0902326.66E-07"7NS0畫302022.11.0297610.046938"7NS01029152032.51.2313874.37E-098NS01023622044.82.238311.23E-098NS01177162054.31.1715039.09E-068NSO1006522064.61.758243.92E-068NS0U95742074,31.1955944.79E-058NS01277282084,51.630卯43.33E-078NS00996392094.21.0378910.0156568NSOI032552104.20.9751150.0010378NS0II91062114,31.182980.0239098NS010隨2124.10.8297840.0004628NS01017792134.21扁8860.000563基于在258種大豆系的實(shí)驗(yàn)對象組中的多態(tài)性調(diào)查(表3和4),測定指示基因組區(qū)域l、2、3、4、5、6、7和8的顯性或隱性狀態(tài)的信息標(biāo)記的大約位置。選擇這些信息標(biāo)記中的一種因素基于何種標(biāo)記具有最大作用或與成熟期中的最大延遲相關(guān)，從而使得它指示成熟期表型。選擇這些信息標(biāo)記中的另一種因素基于最小P值，從而使得標(biāo)記在重組事件中不丟失。具有較小P值的標(biāo)記更可能與在不同大豆群體(不同親本、不同系譜)中的成熟期表型一致地相關(guān)。具有強(qiáng)關(guān)聯(lián)且預(yù)測基因組區(qū)域的漸滲的標(biāo)記在表5中列出。對于NS0128378，SNP事實(shí)上是U-bp插入/缺失(indel),其中"D"代表缺失(***********),并且'T，代表插入(TTCGAAGATTT)。53表3:與區(qū)域l、2、3、4、5、6、7和8相關(guān)的SNP標(biāo)記的位置。<table>tableseeoriginaldocumentpage54</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage55</column></row><table>在實(shí)時(shí)PCR測定中使用等位基因特異性熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET)探針。使用具有不同熒光報(bào)道染料的2種FRET探針，其中將獨(dú)特的染料摻入可以以高特異性與2種等位基因中的僅僅一種退火的寡核苷酸內(nèi)。報(bào)道染料是2，-氯-7，-苯基-1,4-二氯-6-羧基熒光素(VIC)和6-羧基熒光素亞磷酰胺(FAM)。<table>tableseeoriginaldocumentpage57</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage58</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage59</column></row><table>表5:關(guān)于與大豆植物的植物成熟期和/或生長習(xí)性相關(guān)的基因組區(qū)域的大多數(shù)預(yù)測標(biāo)記區(qū)域標(biāo)記SEQIDNO:隱性等位基因顯性等位基因1NS0099529151AT1NS0128378149TTCGAAGATTT2■118907158AC3固l15535169TG4NS037415178CTNS0120015187CG6NS0125713192AG7廳廳30202CA8NS0102362204CT與區(qū)域1相關(guān)的SNP標(biāo)記包括SEQIDNO:143到SEQIDNO:155。關(guān)于區(qū)域1的所有這些SNP標(biāo)記作圖到連鎖群C2上的區(qū)域。表4歹'j出了指示為SEQIDNO:1到SEQIDNO:26的PCR擴(kuò)增引物，和指示為SEQIDNO:214到SEQIDNO:239的探針的序列。與區(qū)域2相關(guān)的SNP標(biāo)記包括SEQIDNO:156到SEQIDNO:161。關(guān)于區(qū)域2的所有這些SNP標(biāo)記作圖到連鎖群O上的區(qū)域。表4列出了指示為SEQIDNO:27到SEQIDNO:38的PCR擴(kuò)增引物，和指示為SEQIDNO:240到SEQIDNO:251的探針的序列。與區(qū)域3相關(guān)的SNP標(biāo)記包括SEQIDNO:162到SEQIDNO:174。關(guān)于區(qū)域3的所有這些SNP標(biāo)記作圖到連鎖群L上的區(qū)域。表4列出了指示為SEQIDNO:39到SEQIDNO:64的PCR擴(kuò)增引物，和指示為SEQIDNO:252到SEQIDNO:277的探針的序列。與區(qū)域4相關(guān)的SNP標(biāo)記包括SEQIDNO:175到SEQIDNO:180。關(guān)于區(qū)域4的所有這些SNP標(biāo)記作圖到連鎖群I上的區(qū)域。表4列出了指示為SEQIDNO:65到SEQIDNO:76的PCR擴(kuò)增引物，和指示為SEQIDNO:278到SEQIDNO:289的探針的序列。與區(qū)域5相關(guān)的SNP標(biāo)記包括SEQIDNO:181到SEQIDNO:189。關(guān)于區(qū)域5的所有這些SNP標(biāo)記作圖到連鎖群L上的區(qū)域。表4列出了指示為SEQIDNO:77到SEQIDNO:94的PCR擴(kuò)增引物，和指示為SEQIDNO:290到SEQIDNO:307的探針的序列。與區(qū)域6相關(guān)的SNP標(biāo)記包括SEQIDNO:190到SEQIDNO:196。關(guān)于區(qū)域6的所有這些SNP標(biāo)記作圖到連鎖群Dlb上的區(qū)域。表4列出了指示為SEQIDNO:95到SEQIDNO:108的PCR擴(kuò)增引物，和指示為SEQIDNO:308到SEQIDNO:321的探針的序列。與區(qū)域7相關(guān)的SNP標(biāo)記包括SEQIDNO:197到SEQIDNO:203。表4列出了指示為SEQIDNO:109到SEQIDNO:122的PCR擴(kuò)增引物，和指示為SEQIDNO:322到SEQIDNO:333的探針的序列。與區(qū)域8相關(guān)的SNP標(biāo)記包括這些SNP標(biāo)記圖的SEQIDNO:204到SEQIDNO:213。表4列出了指示為SEQIDNO:123到SEQIDNO:142的PCR擴(kuò)增引物，和指示為SEQIDNO:336到SEQIDNO:355的探針的序列。實(shí)施例2:鑒定在早成熟期組大豆中與植物成熟期相關(guān)的基因組區(qū)域的等位基因組合基因組區(qū)域1和2用于預(yù)測由早成熟期和中等成熟期親本(III-V)之間的雜交產(chǎn)生的后代植物的植物成熟期。特別地，基因組區(qū)域1和2的等位基因組合與植物成熟期中的延遲關(guān)聯(lián)。為了測定區(qū)域1和2的等位基因組合與植物成熟期中的延遲之間的關(guān)聯(lián)，由早成熟期親本(成熟期組oo)與中等成熟期親本(成熟期組ni或iv)的雜交發(fā)展3個(gè)群體(表6)。群體1-3用于測定基因組區(qū)域1和2的組成與植物成熟期中的延遲的關(guān)聯(lián)。表6:大豆群體中的親本的成熟期組表型<table>tableseeoriginaldocumentpage62</column></row><table>3個(gè)群體對于成熟期廣泛分離，并且在基因組區(qū)域1和2處是多態(tài)性的。通過選擇1個(gè)莢果/F2植物(修飾的單粒種子世代)獲得F3種子。將F3群體種植在Guelph，ON,并且用SNP標(biāo)記NS0128378(基因組區(qū)域1)和NS0118907(基因組區(qū)域2)就基因組區(qū)域1和2表型分析來自所有3個(gè)群體的1,214個(gè)F3個(gè)體。通過計(jì)數(shù)在8月31日后直至植物成熟的天數(shù)，F(xiàn)3群體中的個(gè)別植物也就成熟期進(jìn)行基因型分型；當(dāng)95%的莢果是褐色時(shí)，植物視為成熟的。用1055林個(gè)別植物重復(fù)該程序，其中每個(gè)植物行在智利生長，并且通過計(jì)數(shù)在3月1日后直至植物成熟的天數(shù)，就成熟期進(jìn)行表型分析；當(dāng)95%的莢果是褐色時(shí)，植物視為成熟的。用從1055抹個(gè)別植物中的88林發(fā)展的實(shí)驗(yàn)育種系重復(fù)該程序。表8比較了所有3個(gè)群體中的個(gè)別植物的成熟天數(shù)(daystomaturity)和個(gè)體在基因組區(qū)域1和2處的基因型。與1和2相關(guān)的標(biāo)記解釋了在第1年中植物成熟期中64%的變異，和在第2年中植物成熟期中94%的變異。表7:成熟天數(shù)與區(qū)域1和2的組成的關(guān)聯(lián)。指出了顯性等位基因的存在(1)或不存在(0)。純合等位基因狀態(tài)是0，0和1,1。雜合等位基因狀態(tài)是O，l。成熟天數(shù)(8月31日后的D)等位基因組合區(qū)域1區(qū)域2第l年第2年10,00,019.29.520,00,125.713.530'01,133.615.540,10,026.216.45o,i0,140.3ND60,11,149.119.571,1o，o34.217.118u0,149.322.791,1l,l53.523,9關(guān)聯(lián)640/094。/0實(shí)施例3:鑒定在晚成熟期組大豆中與植物成熟期相關(guān)的基因組區(qū)域的等位基因組合基因組區(qū)域1、2和3用于預(yù)測由晚成熟期和中等成熟期親本之間的雜交產(chǎn)生的后代植物的植物成熟期。特別地，基因組區(qū)域1、2和3的一些等位基因組合與植物成熟期中的延遲關(guān)聯(lián)(表8和9)。為了測定區(qū)域1、2和3的等位基因組合與植物成熟期中的延遲之間的關(guān)聯(lián)，由晚成熟期組V與晚成熟期組IV雜交發(fā)展3個(gè)F3群體。雜交后的群體4-6用于測定基因組區(qū)域1、2和3的組成與植物成熟期中的延遲的關(guān)聯(lián)。3個(gè)群體對于成熟期廣泛分離，并且在基因組區(qū)域l、2和3處是多態(tài)性的。通過選擇1個(gè)莢果/F2植物(單粒種子世代)獲得F3種子。用SNP標(biāo)記NS0099529(基因組區(qū)域1)、NS0118907(基因組區(qū)域2)和NS0115535(基因組區(qū)域3)基因型分型來自所有3個(gè)群體的5，984個(gè)F3個(gè)體，并且將具有相同標(biāo)記單元型的種子堆積。種植F3種子。表8:包含關(guān)于植物成熟期的基因組區(qū)域1、2和3的各種組成的大豆系開花天數(shù)(daystoflowering)概括。指出了顯性等位基因的存在(1)或不存在(0)。純合等位基因狀態(tài)是0，0和l，l。雜合等位基因狀態(tài)是0,1。ND=無數(shù)據(jù)。等位基因組合區(qū)域1區(qū)域區(qū)域群體4開花天數(shù)群體s(DAF)群體610U0,01,1575757111,11,0u585758121,11,10,058595514U0,00,0NDND54150,1o，i0,1595756160,01,11,1433641170,00,01,1443845180,01,10,0443944190,00,00,0443843通過計(jì)數(shù)在8月31日后直至植物成熟的天數(shù)，個(gè)體也就成熟期進(jìn)行表型分析；當(dāng)95%的莢果是褐色時(shí)，植物視為成熟的?；蚪M區(qū)域3影響成熟時(shí)間(表8和9)。表9:包含關(guān)于植物成熟期的基因組區(qū)域1、2和3的各種組成的大豆系植物成熟天數(shù)概括。ND-無數(shù)據(jù)。成熟天數(shù)(8月后D)等位基因組合群體4群體S群體610595858115458581259575914NDND581554545316413537173735381844444319384243實(shí)施例4:與影響植物生長習(xí)性的基因組區(qū)域相關(guān)的分子標(biāo)記的發(fā)現(xiàn)植物生長習(xí)性是關(guān)于晚成熟期組生長區(qū)的重要特征。為了鑒定與植物生長習(xí)性相關(guān)的基因組區(qū)域，由晚成熟期組V(有限生長習(xí)性)與晚成熟期組IV(無限生長習(xí)性)雜交發(fā)展3個(gè)F3群體。群體4-6用于測定基因組區(qū)域3與植物習(xí)性的關(guān)聯(lián)(表6)。用與基因組區(qū)域3相關(guān)的標(biāo)記篩選774種大豆系。3個(gè)群體對于成熟期廣泛分離，并且在基因組區(qū)域3處是多態(tài)性的。通過選擇l個(gè)莢果/F2植物(單粒種子世代)獲得F3種子。用SNPNS0115535(基因組區(qū)域3)表型分析來自所有3個(gè)群體的5,984個(gè)F3個(gè)體，并且將具有相同標(biāo)記單元型的種子堆積。種植F3種子。單個(gè)標(biāo)記NS00115535測定為最有預(yù)測性的，并且能夠使有限組V品種與無限組IV和較早品種分開。實(shí)施例5:不依賴于產(chǎn)量的與生長習(xí)性和成熟期相關(guān)的基因組區(qū)域植物成熟期和產(chǎn)量在大豆中緊密相關(guān)。成熟期中l(wèi)天的增加可以等價(jià)于產(chǎn)量中-0.7bu/A的增加。植物成熟期和產(chǎn)量的關(guān)聯(lián)使與產(chǎn)量相關(guān)的潛在QTLs和候選基因的評估混淆與植物成熟期相關(guān)的基因組區(qū)域的鑒定允許育種者遺傳上固定在大豆植物內(nèi)的植物成熟期，并且闡明與產(chǎn)量相關(guān)的性狀。由成熟期組0與成熟期組III或IV雜交產(chǎn)生3個(gè)大豆群體。使用群體7-9(表5)。將后代種子種植在智利，然后在智利選擇由這些后代植物收獲的種子，并且在2006年使植物在Ontario生長。用與成熟期區(qū)域1和2相關(guān)的標(biāo)記篩選84個(gè)后代，并且就成熟天數(shù)和產(chǎn)量進(jìn)行評估(表10-12)。與區(qū)域1和2相關(guān)的標(biāo)記選擇成熟期并且不依賴于產(chǎn)量。例如，后代0430具有明顯高于后代0083的產(chǎn)量(表11)。由于相似的成熟天數(shù)以及成熟期基因組區(qū)域1和2的等位基因狀態(tài)，后代0430的較高產(chǎn)量不歸因于植物成熟期中的差異。<table>tableseeoriginaldocumentpage66</column></row><table>群體800(5937.6810.002群體8027438.9010.002群體8016543.0310.002群體8021939.6712.502群體8037349.2213.00群體8008950.4117.002群體808643.7418.00群體8039543.209.50群體804264U210.003群體8025643.8310.00群體8021645.4710,503群體8036747.9411.503群體8026642.8614.003群體8028542.0416.00群體8027750.4716.00群體8018845.6217.503群體8014344.4713.504群體8010141.2214.504群體8036641.7916.504群體8034047.4111.507群體8035946.1014.507群體8018446.2414.50群體8015843.0816,00群體8040!50.9516.00群體8025547.2617.007總體平均值42.7812.00化檢查平均值42.6012.38檢查平均值44.089.25弁Locs32#Reps32CV9.97815.094LSD(.05)6.9893.640F-統(tǒng)計(jì)量4.5257.670P-值0.0000.000可重復(fù)性0.7810.870均方根誤差4,2691.811表11:產(chǎn)量、成熟期以及關(guān)于成熟期區(qū)域1和2的等位基因組合的概括。系譜后代IDNo.最佳估計(jì)產(chǎn)量(Bu/A)成熟期(D)等位』組<群體9(B8138.4611.001群體9047340.8912.501群體9037136.869.002群體903803.8610.002群體9026343,0111.002群體9039638.9712.002群體8008329.0115.002群體8043042.6515.002群體9029939.9616.002群體8007642,9522.002群體9014232,31U.503群體9048727.8614.003群體8024043.6615.503群體9031746.7416.503群體8039238.2118.503群體9020645,7719.003群體9025444.0619.503群體8028048.2226.503群體9026241.4117.504群體9017343.1723.504群體9003233.6513.506群體9016640.7211,507<table>tableseeoriginaldocumentpage69</column></row><table>表12:產(chǎn)量、成熟期以及關(guān)于成熟期區(qū)域1和2的等位基因組合的<table>tableseeoriginaldocumentpage69</column></row><table>群體7群體7群體7群體7群體7群體7群體7群體70216031202980205013903650004036142.2636,1541.4039.4138.5938.1439.7947.7510.5018,0019.0013.0014,5013,0012.5024,002234總體平均值39.3712.55非檢查平均值檢查平均值#Locs#R印sCVLSD(,05)F-統(tǒng)計(jì)量P-值可重復(fù)性均方根誤差37.7944.103316.51810.7493.0740.0020.6756,50313.579.502211.3432.97916.4910細(xì)0.9391.423實(shí)施例6:利用與植物成熟期相關(guān)的分子標(biāo)記以逸擇用于種植種子的地理區(qū)由于光周期敏感性，大豆基因型在狹窄的煒度地帶中生長以最優(yōu)化產(chǎn)量。與南方品種形成對照，北方大豆品種隨著較長的日照幵始開花。種植在其適應(yīng)地帶南方的北方品種顯示出加速的開花，限制的植物生長和減少的產(chǎn)量。種植在其適應(yīng)地帶北方的南方大豆品種將具有延遲的開花，具有關(guān)于可能減少產(chǎn)量的霜凍害的可能性。當(dāng)親本在植物成熟期方面相差超過10天時(shí)，雜交后代對于植物成熟期廣泛分離。與植物成熟期基因組區(qū)域相關(guān)的分子標(biāo)記允許育種者雜交在成熟期方面相差超過10天的親本，選擇雜交的種子以在合適的成熟期地帶中生長。通過使MGIII.5與MGOOO雜交產(chǎn)生BC2F,大豆群體，并且使用與用106種SNP標(biāo)記篩選93林BC2F,植物，以評估與輪回MGIII.5親本的遺傳相似性(表13)。此外，SNP標(biāo)記包括與成熟期基因組區(qū)域1、2、3、4和5相關(guān)的標(biāo)記。每個(gè)個(gè)體對于至少一個(gè)成熟期基因組區(qū)域是雜合的。個(gè)別后代0107對于1、2、3、4和5是雜合的，并且可以用于選擇適應(yīng)每個(gè)成熟期組地帶的個(gè)別品種。使用關(guān)于基因組成熟期區(qū)域的等位基因組合，基于對特定成熟期組區(qū)域的適應(yīng)選擇個(gè)體以前進(jìn)至下一代。表13:就MGIII.5親本/(MGIII.5親本*2觸000親本)的Fz代而言關(guān)于成熟期基因組區(qū)域的雜合性概括。用與成熟期基因組區(qū)域相關(guān)的SNP標(biāo)記就地理成熟期組區(qū)域選擇在群體內(nèi)的個(gè)體。對于基因組成熟期區(qū)域雜合的:植物與MGIII.5親本的相似性(%)14MGI1L5親本98.7MG000親本2.6后代:005086,2XX后代:010785.8XX后代:005084.9XX后代垂384.9XX后代:005082.8XXXX后代:009682.8XX后代:010782.3X后代:009681.9XX后代:010781.5XXXXX后代:006660.8X后代，684.1XXX后代:009382.8XX后代:005081.9XXX后代:005081.9XX后代駕681.0XXX后代:004680.6XXXX后代:005080.2XXX后代:010780,2XXX后代:009380.2XX后代:009680,2X后代:009379.7XX72后代006379.7XX后代009379.3XX后代009678.9XX后代:001278.9XX后代008578.4XXX后代009678.0X后代:010777.6XX后代006374.6XXX后代006374.1XX后代001261.2X后代003661,2x:XX后代001261.2x:后代009361.2XXX后代001261.2XX后代005061.2XX后代003661.2XX后代006361.2XX后代005061.2XX后代001261.2XX后代010761.2X后代001261.2X后代001260,8XXX后代001260.8XXX后代001260.8XXX后代005060.8XX后代001260.8XX后代003660.8XX后代001260,8X后代001260.8X后代003660.8XXX后代001260.8XX后代001260.3XX后代009359.9XXXX后代:009659.9XXX后代:001259.9XX后代:005059,9XX后代:008559.9XX后代:005059.5XX后代:009659,5XXX后代扁659.5XXX后代:009659.5XXX后代:006359.5XX后代:003659.5XX后代:009659.5X后代:009358.6XX后代:005058.6X后代:005058.6X后代:009358.6XXX后代:009358.2XX后代:001258.2XXX后代:001258.2XXX后代.005058.2XXX后代細(xì)258.2XXX后代細(xì)258.2XX后代:014358.2XX后代儒658.2XX后代:005058.2XX后代細(xì)257.8XXX后代:005057,8XXX后代:001257.8XX后代儒357.8XX后代細(xì)357.8X后代:001257.8XX后代細(xì)257.8XX后代001257.8XX后代009657.3XXX<table>tableseeoriginaldocumentpage75</column></row><table>目前，許多外來種的性狀是難接近的，部分是由于使來自極端不同成熟期組的大豆植物雜交的局限性。傳統(tǒng)地，育種者必須產(chǎn)生且維持來自外來和育種種質(zhì)之間雜交的大量后代植物，以使育種者選擇所需成熟期組的小量大豆植物。維持需要的大量植物通常是成本高得驚人的。與植物成熟期相關(guān)的分子標(biāo)記促進(jìn)外來種質(zhì)的使用。育種者產(chǎn)生外來和栽培的種質(zhì)之間的雜交。無需消耗種植并且生長大量后代所需的資源，后代種子就植物成熟期進(jìn)行測定。實(shí)施例9:利用與植物成熟期相關(guān)的分子標(biāo)記以促進(jìn)轉(zhuǎn)基因的漸滲轉(zhuǎn)基因引入品種內(nèi)后，它可以通過雜交容易地轉(zhuǎn)移至其他品種。大多數(shù)大豆品種開發(fā)雜交在彼此在10個(gè)成熟日內(nèi)的親本之間進(jìn)行。當(dāng)親本在植物成熟期方面相差超過10天時(shí)，雜交后代對于植物成熟期廣泛分離。為了使育種者獲得且選擇所需成熟期組的大豆植物，他們必須產(chǎn)生且維持大量后代植物，其的實(shí)踐是成本高得驚人的。如果轉(zhuǎn)基因存在于成熟期組III中品種，需要轉(zhuǎn)移至成熟期組0，那么一般不執(zhí)行成熟期組III品種和成熟期組0品種之間的直接雜交。相反，通過在植物成熟期方面接近的品種之間的一系列中間雜交轉(zhuǎn)移轉(zhuǎn)基因。與植物成熟期基因組區(qū)域相關(guān)的分子標(biāo)記允許育種者雜交在成熟期方面相差超過10天的親本，隨后基于轉(zhuǎn)基因的存在和植物成熟期表型選擇雜交的種子。實(shí)施例10:利用與植物成熟期相關(guān)的分子標(biāo)記以促進(jìn)性狀的漸滲如果品種具有所需性狀，那么它可以通過雜交容易地轉(zhuǎn)移至其他品種。大多數(shù)大豆品種開發(fā)雜交在彼此在IO個(gè)成熟日內(nèi)的親本之間進(jìn)行。當(dāng)親本在植物成熟期方面相差超過10天時(shí)，雜交后代對于植物成熟期廣泛分離。為了使育種者獲得且選擇所需成熟期組的大豆植物，他們必須產(chǎn)生且維持大量后代植物，其的實(shí)踐是成本高得驚人的。如果性狀存在于成熟期組III品種中，需要轉(zhuǎn)移至成熟期組O,那么一般不執(zhí)行成熟期組III品種和成熟期組0品種之間的直接雜交。相反，通過在植物成熟期方面接近的品種之間的一系列中間雜交轉(zhuǎn)移性狀。與植物成熟期基因組區(qū)域相關(guān)的分子標(biāo)記允許育種者雜交在成熟期方面相差超過io天的親本，隨后基于性狀的存在和植物成熟期表型選擇雜交的種子。實(shí)施例11:利用與植物成熟期相關(guān)的分子標(biāo)記以選擇最優(yōu)化性狀表達(dá)的環(huán)境在不同環(huán)境中栽培的大豆經(jīng)常表現(xiàn)不同。例如，大豆品種在一種環(huán)76境中可產(chǎn)生具有特定脂肪酸概況的種子，并且在另一種環(huán)境中產(chǎn)生具有不同脂肪酸概況的種子。許多環(huán)境因素可以影響性狀的表達(dá)，包括土壌類型、土壤條件、溫度、光周期、地理和培養(yǎng)實(shí)踐?；蛐驮诓煌h(huán)境中的表現(xiàn)中的變異經(jīng)常指的是基因型X環(huán)境相互作用。大豆種子油水平受環(huán)境高度影響。油濃度隨著煒度減少而增加，因此，成熟期組OO-I中的大豆一般具有比較晚成熟的大豆更低的油水平(圖1)。與植物成熟期相關(guān)的分子標(biāo)記幫助育種者選摔大豆基因型，并且產(chǎn)生更好地適應(yīng)成熟期組區(qū)域以產(chǎn)生更高的油的植物。大豆種子脂肪酸組成受栽培緯度高度影響。本發(fā)明提供了與植物成熟期相關(guān)的分子標(biāo)記，其對于幫助育種者選擇有利的大豆成熟期基因型有用，以最優(yōu)化具體性狀在特定地理中的表達(dá)，例如脂肪酸合成，其中性狀是常規(guī)或轉(zhuǎn)基因的。如本文所使用的，常規(guī)性狀包括通過誘變獲得的那些。例如，為產(chǎn)生十八碳四烯酸(SDA)而工程改造的脂肪轉(zhuǎn)基因大豆植物的概況對于SDA生產(chǎn)具有與煒度的正相關(guān)，并且對于油酸、硬脂酸、棕櫚酸和a-亞麻酸生產(chǎn)具有與綿度的負(fù)相關(guān)(表15)。SDA的百分比隨著增加的瑋度而增加(圖2-3)。<table>tableseeoriginaldocumentpage77</column></row><table>*在0.05水平下顯著緯度與成熟期組和生長區(qū)緊密相關(guān)。根據(jù)其中植物適應(yīng)且最有生產(chǎn)力的緯度范圍，將大豆分類為13個(gè)成熟期組(000、00、0、I-X)。組ooo是最早成熟的且在較高緯度下栽培，并且組x是最晚成熟的且在較低綿度中栽培。與植物成熟期相關(guān)的分子標(biāo)記將幫助育種者選擇大豆基因型，所述大豆基因型適應(yīng)已知與植物中的優(yōu)選SDA生產(chǎn)相關(guān)的緯度。因此，大豆育種者更有效地產(chǎn)生更好地適應(yīng)環(huán)境且產(chǎn)生更高水平的SDA或其他相似性狀的植物。利用關(guān)于任何性狀的優(yōu)選性狀整合的方法和組合物在本發(fā)明的范圍內(nèi)，所述性狀是常規(guī)或轉(zhuǎn)基因的、受煒度影響或被其改變。本發(fā)明人預(yù)期本發(fā)明將用于受瑋度影響的一種或多種表型性狀的性狀整合，從而使得本文提供的方法和組合物將促進(jìn)一種或多種性狀基于成熟期安排到優(yōu)選種質(zhì)內(nèi)，其中性狀可以是常規(guī)或轉(zhuǎn)基因的。已舉例說明且描述了本發(fā)明的原理，對于本領(lǐng)域技術(shù)人員應(yīng)顯而易見的是，本發(fā)明可以在不背離此種原理的情況下在安排和細(xì)節(jié)中進(jìn)行修飾。我們請求保護(hù)在附加權(quán)利要求的精神、范圍和概念內(nèi)的所有修飾。78權(quán)利要求1.一種通過測定大豆植物或大豆種子的等位基因組合確定大豆植物或大豆種子應(yīng)在何處生長的方法，其包括a.獲得來自大豆植物或大豆種子的DNA；b.測定在成熟期基因組區(qū)域1內(nèi)的基因座處的等位基因是純合還是雜合的；c.測定在成熟期基因組區(qū)域2內(nèi)的基因座處的等位基因是純合還是雜合的；d.測定在成熟期基因組區(qū)域3內(nèi)的基因座處的等位基因是純合還是雜合的；e.測定在成熟期基因組區(qū)域1、2和3內(nèi)所述等位基因的等位基因組合；和f.對所述大豆植物或大豆種子指定成熟期組值。2.權(quán)利要求1的方法，其中所述測定在基因座處的等位基因是純合還是雜合的包括用核酸分子檢測多態(tài)性，所述核酸分子包含選自SEQIDNOs:143-174的序列、或其互補(bǔ)體。3.權(quán)利要求1的方法，其進(jìn)一步包括選擇多粒大豆種子。4.權(quán)利要求3的方法，其中所述多粒大豆種子成長為具有無限大豆植物習(xí)性的大豆植物。5.權(quán)利要求1的方法，其中在成熟期基因組區(qū)域1內(nèi)的基因座處的所述等位基因包含選自SEQIDNOs:143-149、154-155的核酸序列。6—種通過測定大豆植物的等位基因組合確定大豆植物或大豆種子應(yīng)在何處生長的方法，其包括a.獲得來自大豆植物或大豆種子的DNA;b.測定在成熟期基因組區(qū)域1內(nèi)的基因座處的等位基因是純合還是雜合的；c.測定在成熟期基因組區(qū)域2內(nèi)的基因座處的等位基因是純合還是雜合的；d.測定在成熟期基因組區(qū)域1和2內(nèi)所迷等位基因的等位基因組合；和e.對所迷大豆植物或大豆種子指定成熟期生長值。7.權(quán)利要求6的方法，其中所述測定等位基因是純合還是雜合的包括檢測選自SEQIDNOs:143-161的多態(tài)性。8.權(quán)利要求6的方法，其中所述大豆植物或大豆種子得自早成熟期組親本大豆植物和中等成熟期親本大豆植物的雜交。9.權(quán)利要求6的方法，其中所述早成熟期組親本大豆植物是OO.O-1.0,并且所述中等成熟期親本大豆植物是III.O-IV.9。10.—種大豆植物育種方法，其包括a.就選自SEQIDNO:M3到SEQIDNO:213的標(biāo)記序列的存在測定大豆植物；和b.使所迷大豆植物與成熟期組關(guān)聯(lián)。11.—種大豆植物育種方法，其包括使具有所需性狀的親本大豆植物與第二種親本大豆植物雜交，其中所述親本大豆植物在大豆植物成熟期方面相差超過o天，其包括a.使包含所需性狀的親本大豆植物與第二種親本大豆植物雜交；b.獲得來自所述雜交的后代大豆種子；c.就所述性狀篩選后代大豆種子；d.使用選自SEQIDNO:143到SEQIDNO:213的標(biāo)記就所需成熟期組篩選后代大豆種子，以測定所需地理生長區(qū)；和e.選擇包含所需性狀和所需大豆植物成熟期的后代大豆種子。12.權(quán)利要求1I的方法，其中所述所需性狀是轉(zhuǎn)基因的。13.—種大豆植物育種方法，其包括a.使至少2種不同的親本大豆植物雜交，其中所迷親本大豆植物在大豆植物成熟期方面相差超過10天；b.獲得來自所述雜交的后代大豆種子；c.用遺傳標(biāo)記基因型分型所述雜交的后代大豆種子；和d.選擇具有關(guān)于優(yōu)選成熟期的基因型的大豆種子。14.一種基于無限或有限生長習(xí)性選擇大豆種子的方法，其包括測定成熟期基因組區(qū)域3是純合還是雜合的。15.權(quán)利要求14的方法，其中所迷成熟期基因組區(qū)域3的特征在于在標(biāo)記SEQIDNO:169中的位置433處的G。16.—種基于成熟期組分配大豆植物的方法，其包括a.獲得來自大豆植物的DNA;b.測定在成熟期基因組區(qū)域l內(nèi)的等位基因是純合還是雜合的；c.測定在成熟期基因組區(qū)域2內(nèi)的等位基因是純合還是雜合的；d.測定在成熟期基因組區(qū)域3內(nèi)的等位基因是純合還是雜合的；和e.對所述大豆植物指定成熟期生長值；和f.將所述大豆植物運(yùn)送至優(yōu)選地理區(qū)。17.—種分離無限的早成熟期大豆種子的方法，其包括a.使用非破壞性方法獲得來自所述大豆種子的DNA;b.測定在成熟期基因組區(qū)域l內(nèi)的等位基因是純合還是雜合的；和c.測定在成熟期基因組區(qū)域2內(nèi)的等位基因是純合還是雜合的。18.—種測定大豆植物是否具有0.0-III.9成熟期組的方法，其包括a.使用非破壞性方法獲得來自所述大豆種子的DNA;b.測定在成熟期基因組區(qū)域l內(nèi)的等位基因是純合還是雜合的；c.測定在成熟期基因組區(qū)域2內(nèi)的等位基因是純合還是雜合的；和d.對所述大豆植物指定0.0-III.9的成熟期組值。19.權(quán)利要求18的方法，其中所述大豆植物中的成熟期在這樣的大豆植物前至少5天達(dá)到，所述這樣的大豆植物在成熟期基因組區(qū)域1內(nèi)是純合顯性的，在成熟期基因組區(qū)域2內(nèi)是純合顯性的，并且在相同的環(huán)境條件下生長。20.—種測定大豆植物的成熟期是否在00.0-III.O成熟期組中的方法，其包括a.測定在成熟期基因組區(qū)域l內(nèi)的等位基因是純合還是雜合的；b.測定在成熟期基因組區(qū)域2內(nèi)的等位基因是純合還是雜合的；和c.對所述大豆植物指定00.0-III.O的成熟期組值。21.權(quán)利要求20的方法，其進(jìn)一步包括選擇這樣的大豆種子，其在成熟期基因組區(qū)域l處是純合隱性的，并且在成熟期基因組區(qū)域2處是純合隱性的，并且具有0.5-II.O的成熟期組。22.權(quán)利要求20的方法，其進(jìn)一步包括選擇這樣的大豆種子，其在成熟期基因組區(qū)域1處是純合隱性的，并且在成熟期基因組區(qū)域2處是雜合顯性的，并且具有I.5-II.9的成熟期組。全文摘要本發(fā)明包括與大豆植物成熟期和生長習(xí)性相關(guān)的用于篩選且選擇來自大豆屬的植物和種子的基因組區(qū)域的方法和組合物。本發(fā)明還包括用于用與基因組區(qū)域相關(guān)的標(biāo)記篩選來自大豆屬的植物和種子的方法和組合物，所述基因組區(qū)域與大豆屬植物的植物成熟期和植物生長習(xí)性相關(guān)。文檔編號C12Q1/68GK101680035SQ200880017206公開日2010年3月24日申請日期2008年3月27日優(yōu)先權(quán)日2007年3月28日發(fā)明者H·E·瓦倫丁,J·塔穆羅尼斯,J·納維爾,J·詹金森,K·赫勒伊斯申請人:孟山都技術(shù)有限公司